Result of FASTA (ccds) for
pF1KB7782
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7782, 510 aa
1>>>pF1KB7782 510 - 510 aa - 510 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.6260+/-0.000784; mu= 9.0672+/- 0.048
mean_var=147.7272+/-28.766, 0's: 0 Z-trim(113.8): 14 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.105522
statistics sampled from 14362 (14373) to 14362 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.766), E-opt: 0.2 (0.442), width: 16
Scan time: 3.590
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS12118.1 PIAS4 gene_id:51588|Hs108|chr19 ( 510) 3464 538.7 5.7e-153
CCDS72866.1 PIAS3 gene_id:10401|Hs108|chr1 ( 628) 1455 232.9 7.8e-61
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CCDS81902.1 PIAS1 gene_id:8554|Hs108|chr15 ( 653) 1217 196.7 6.5e-50
CCDS32825.1 PIAS2 gene_id:9063|Hs108|chr18 ( 572) 1178 190.7 3.6e-48
CCDS32824.1 PIAS2 gene_id:9063|Hs108|chr18 ( 621) 1178 190.8 3.8e-48
>>CCDS12118.1 PIAS4 gene_id:51588|Hs108|chr19 (510 aa)
initn: 3464 init1: 3464 opt: 3464 Z-score: 2859.8 bits: 538.7 E(32554): 5.7e-153
Smith-Waterman score: 3464; 100.0% identity (100.0% similar) in 510 aa overlap (1-510:1-510)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MAAELVEAKNMVMSFRVSDLQMLLGFVGRSKSGLKHELVTRALQLVQFDCSPELFKKIKE
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CCDS12 MAAELVEAKNMVMSFRVSDLQMLLGFVGRSKSGLKHELVTRALQLVQFDCSPELFKKIKE
10 20 30 40 50 60
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pF1KB7 LYETRYAKKNSEPAPQPHRPLDPLTMHSTYDRAGAVPRTPLAGPNIDYPVLYGKYLNGLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LYETRYAKKNSEPAPQPHRPLDPLTMHSTYDRAGAVPRTPLAGPNIDYPVLYGKYLNGLG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 RLPAKTLKPEVRLVKLPFFNMLDELLKPTELVPQNNEKLQESPCIFALTPRQVELIRNSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 RLPAKTLKPEVRLVKLPFFNMLDELLKPTELVPQNNEKLQESPCIFALTPRQVELIRNSR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 ELQPGVKAVQVVLRICYSDTSCPQEDQYPPNIAVKVNHSYCSVPGYYPSNKPGVEPKRPC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 ELQPGVKAVQVVLRICYSDTSCPQEDQYPPNIAVKVNHSYCSVPGYYPSNKPGVEPKRPC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
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CCDS12 RPINLTHLMYLSSATNRITVTWGNYGKSYSVALYLVRQLTSSELLQRLKTIGVKHPELCK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 ALVKEKLRLDPDSEIATTGVRVSLICPLVKMRLSVPCRAETCAHLQCFDAVFYLQMNEKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 ALVKEKLRLDPDSEIATTGVRVSLICPLVKMRLSVPCRAETCAHLQCFDAVFYLQMNEKK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 PTWMCPVCDKPAPYDQLIIDGLLSKILSECEDADEIEYLVDGSWCPIRAEKERSCSPQGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 PTWMCPVCDKPAPYDQLIIDGLLSKILSECEDADEIEYLVDGSWCPIRAEKERSCSPQGA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 ILVLGPSDANGLLPAPSVNGSGALGSTGGGGPVGSMENGKPGADVVDLTLDSSSSSEDEE
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CCDS12 ILVLGPSDANGLLPAPSVNGSGALGSTGGGGPVGSMENGKPGADVVDLTLDSSSSSEDEE
430 440 450 460 470 480
490 500 510
pF1KB7 EEEEEEEDEDEEGPRPKRRCPFQKGLVPAC
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CCDS12 EEEEEEEDEDEEGPRPKRRCPFQKGLVPAC
490 500 510
>>CCDS72866.1 PIAS3 gene_id:10401|Hs108|chr1 (628 aa)
initn: 1424 init1: 712 opt: 1455 Z-score: 1205.6 bits: 232.9 E(32554): 7.8e-61
Smith-Waterman score: 1492; 48.0% identity (70.4% similar) in 517 aa overlap (3-509:2-477)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MAAELVEAKNMVMSFRVSDLQMLLGFVGRSKSGLKHELVTRALQLVQFDCSPELFKKIKE
::: : :.::::::::.::.::::.::.::: ::::...::.:.. .:.: . ::::
CCDS72 MAELGELKHMVMSFRVSELQVLLGFAGRNKSGRKHELLAKALHLLKSSCAPSVQMKIKE
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KB7 LYETRYAKKNSEPAPQPHRPLDPLTMHSTYDRAGAVPRTPLAGPNIDYP-VLYG--KYLN
::. :. .:. :. : : : : : : .:. :.. : .: : . ..
CCDS72 LYRRRFPRKTLGPSDLSLLSLPPGT--SPVGSPG--PLAPIP-PTLLAPGTLLGPKREVD
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 GLGRLPAKTLKPEVRLVKLPFFNMLDELLKPTELVPQNNEKLQESPCIFALTPRQVELIR
:: . ..:.: . :::... ::..:: :. ......:. :::::.::. :
CCDS72 MHPPLP-QPVHPDVTMKPLPFYEVYGELIRPTTLASTSSQRFEEAHFTFALTPQQVQQIL
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 NSRELQPGVK---AVQVVLRICYSDTSCPQEDQYPPNIAVKVNHSYCSVPGYYPSNKPGV
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CCDS72 TSREVLPGAKCDYTIQVQLRFCLCETSCPQEDYFPPNLFVKVNGKLCPLPGYLPPTKNGA
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 EPKRPCRPINLTHLMYLSSAT-NRITVTWGN-YGKSYSVALYLVRQLTSSELLQRLKTIG
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CCDS72 EPKRPSRPINITPLARLSATVPNTIVVNWSSEFGRNYSLSVYLVRQLTAGTLLQKLRAKG
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 VKHPELCKALVKEKLRLDPDSEIATTGVRVSLICPLVKMRLSVPCRAETCAHLQCFDAVF
...:. .::.:::: :::::.:::..::::.::: ::::.::::: :::::: :::..
CCDS72 IRNPDHSRALIKEKLTADPDSEVATTSLRVSLMCPLGKMRLTVPCRALTCAHLQSFDAAL
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB7 YLQMNEKKPTWMCPVCDKPAPYDQLIIDGLLSKILSECEDADEIEYLVDGSWCPIRAEKE
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CCDS72 YLQMNEKKPTWTCPVCDKKAPYESLIIDGLFMEILSSCSDCDEIQFMEDGSWCPMKPKKE
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB7 RS--CSPQGAILVLGPSDANGLLPAPSVNGSGALGSTGGGGPVGSMENGKPGADVVDLTL
: : : : : .:: .: . :: : :: : ..:.:::.
CCDS72 ASEVCPPPGYGL-------DGLQYSP----------VQGGDPS---ENKKK-VEVIDLTI
420 430 440 450
480 490 500 510
pF1KB7 DSSSSSEDEEEEEEEEEDEDEEGPRPKRRCPFQKGLVPAC
.:::. :: : :..: .. .::
CCDS72 ESSSDEEDL--------------PPTKKHCSVTSAAIPALPGSKGVLTSGHQPSSVLRSP
460 470 480 490
CCDS72 AMGTLGGDFLSSLPLHEYPPAFPLGADIQGLDLFSFLQTESQHYGPSVITSLDEQDALGH
500 510 520 530 540 550
>>CCDS45290.1 PIAS1 gene_id:8554|Hs108|chr15 (651 aa)
initn: 1478 init1: 713 opt: 1217 Z-score: 1009.6 bits: 196.7 E(32554): 6.5e-50
Smith-Waterman score: 1487; 48.4% identity (72.3% similar) in 512 aa overlap (3-501:2-482)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MAAELVEAKNMVMSFRVSDLQMLLGFVGRSKSGLKHELVTRALQLVQFDCSPELFKKIKE
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CCDS45 MADSAELKQMVMSLRVSELQVLLGYAGRNKHGRKHELLTKALHLLKAGCSPAVQMKIKE
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KB7 LYETRYAKKNSEPA----PQPHRPLDPLTMHSTYDRAGAVPRTPLAGPNIDYPVLYGKYL
::. :. .: :: :. : : :. . . : ..: . .: :.
CCDS45 LYRRRFPQKIMTPADLSIPNVHSSPMPATLSPSTIPQLTYDGHPASSPLLPVSLLGPKHE
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 NGLGRLPA--KTLKPEVRLVKLPFFNMLDELLKPTELVPQNNEKLQESPCIFALTPRQVE
: .: . . ..:...: ::::...::::.::: :. .:.....:. :::::.::.
CCDS45 LELPHLTSALHPVHPDIKLQKLPFYDLLDELIKPTSLASDNSQRFRETCFAFALTPQQVQ
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 LIRNSRELQPGVK---AVQVVLRICYSDTSCPQEDQYPPNIAVKVNHSYCSVPGYYPSNK
: .: ... :.: .::: ::.: :.:::::::..:::. :::: . ::.::: : .:
CCDS45 QISSSMDIS-GTKCDFTVQVQLRFCLSETSCPQEDHFPPNLCVKVNTKPCSLPGYLPPTK
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280
pF1KB7 PGVEPKRPCRPINLTHLMYLSSAT-NRITVTW-GNYGKSYSVALYLVRQLTSSELLQRLK
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CCDS45 NGVEPKRPSRPINITSLVRLSTTVPNTIVVSWTAEIGRNYSMAVYLVKQLSSTVLLQRLR
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB7 TIGVKHPELCKALVKEKLRLDPDSEIATTGVRVSLICPLVKMRLSVPCRAETCAHLQCFD
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CCDS45 AKGIRNPDHSRALIKEKLTADPDSEIATTSLRVSLLCPLGKMRLTIPCRALTCSHLQCFD
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KB7 AVFYLQMNEKKPTWMCPVCDKPAPYDQLIIDGLLSKILSECEDADEIEYLVDGSWCPIRA
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CCDS45 ATLYIQMNEKKPTWVCPVCDKKAPYEHLIIDGLFMEILKYCTDCDEIQFKEDGTWAPMRS
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KB7 EKERSCSPQGAILVLGPSDANGLLPAPSVNG--SGALGSTGGGGPVGSMENGKPGADVVD
.:: . .. : :: :.: :..: .. .: .: : ..:.:
CCDS45 KKE--------VQEVSAS-YNG------VDGCLSSTLEHQVASHHQSSNKNKK--VEVID
420 430 440 450 460
470 480 490 500 510
pF1KB7 LTLDSSSSSEDEEEEEEEEEDEDEEGPRPKRRCPFQKGLVPAC
::.:::: :::::: : :: ::
CCDS45 LTIDSSS---DEEEEE----------PSAKRTCPSLSPTSPLNNKGILSLPHQASPVSRT
470 480 490 500
CCDS45 PSLPAVDTSYINTSLIQDYRHPFHMTPMPYDLQGLDFFPFLSGDNQHYNTSLLAAAAAAV
510 520 530 540 550 560
>>CCDS81902.1 PIAS1 gene_id:8554|Hs108|chr15 (653 aa)
initn: 1470 init1: 713 opt: 1217 Z-score: 1009.5 bits: 196.7 E(32554): 6.5e-50
Smith-Waterman score: 1479; 48.6% identity (72.3% similar) in 506 aa overlap (9-501:10-484)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MAAELVEAKNMVMSFRVSDLQMLLGFVGRSKSGLKHELVTRALQLVQFDCSPELFKKIK
:.::::.:::.::.:::..::.: : ::::.:.::.:.. ::: . :::
CCDS81 MFTLQDSYVKQMVMSLRVSELQVLLGYAGRNKHGRKHELLTKALHLLKAGCSPAVQMKIK
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 ELYETRYAKKNSEPA----PQPHRPLDPLTMHSTYDRAGAVPRTPLAGPNIDYPVLYGKY
:::. :. .: :: :. : : :. . . : ..: . .: :.
CCDS81 ELYRRRFPQKIMTPADLSIPNVHSSPMPATLSPSTIPQLTYDGHPASSPLLPVSLLGPKH
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 LNGLGRLPA--KTLKPEVRLVKLPFFNMLDELLKPTELVPQNNEKLQESPCIFALTPRQV
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CCDS81 ELELPHLTSALHPVHPDIKLQKLPFYDLLDELIKPTSLASDNSQRFRETCFAFALTPQQV
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 ELIRNSRELQPGVK---AVQVVLRICYSDTSCPQEDQYPPNIAVKVNHSYCSVPGYYPSN
. : .: ... :.: .::: ::.: :.:::::::..:::. :::: . ::.::: : .
CCDS81 QQISSSMDIS-GTKCDFTVQVQLRFCLSETSCPQEDHFPPNLCVKVNTKPCSLPGYLPPT
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280
pF1KB7 KPGVEPKRPCRPINLTHLMYLSSAT-NRITVTW-GNYGKSYSVALYLVRQLTSSELLQRL
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CCDS81 KNGVEPKRPSRPINITSLVRLSTTVPNTIVVSWTAEIGRNYSMAVYLVKQLSSTVLLQRL
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB7 KTIGVKHPELCKALVKEKLRLDPDSEIATTGVRVSLICPLVKMRLSVPCRAETCAHLQCF
.. :...:. .::.:::: :::::::::..::::.::: ::::..:::: ::.:::::
CCDS81 RAKGIRNPDHSRALIKEKLTADPDSEIATTSLRVSLLCPLGKMRLTIPCRALTCSHLQCF
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KB7 DAVFYLQMNEKKPTWMCPVCDKPAPYDQLIIDGLLSKILSECEDADEIEYLVDGSWCPIR
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CCDS81 DATLYIQMNEKKPTWVCPVCDKKAPYEHLIIDGLFMEILKYCTDCDEIQFKEDGTWAPMR
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KB7 AEKERSCSPQGAILVLGPSDANGLLPAPSVNG--SGALGSTGGGGPVGSMENGKPGADVV
..:: . .. : :: :.: :..: .. .: .: : ..:.
CCDS81 SKKE--------VQEVSAS-YNG------VDGCLSSTLEHQVASHHQSSNKNKK--VEVI
420 430 440 450 460
470 480 490 500 510
pF1KB7 DLTLDSSSSSEDEEEEEEEEEDEDEEGPRPKRRCPFQKGLVPAC
:::.:::: :::::: : :: ::
CCDS81 DLTIDSSS---DEEEEE----------PSAKRTCPSLSPTSPLNNKGILSLPHQASPVSR
470 480 490 500
CCDS81 TPSLPAVDTSYINTSLIQDYRHPFHMTPMPYDLQGLDFFPFLSGDNQHYNTSLLAAAAAA
510 520 530 540 550 560
>>CCDS32825.1 PIAS2 gene_id:9063|Hs108|chr18 (572 aa)
initn: 1463 init1: 730 opt: 1178 Z-score: 978.3 bits: 190.7 E(32554): 3.6e-48
Smith-Waterman score: 1413; 46.7% identity (70.2% similar) in 523 aa overlap (3-502:2-492)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MAAELVEAKNMVMSFRVSDLQMLLGFVGRSKSGLKHELVTRALQLVQFDCSPELFKKIKE
:.. : .::: :::::.::.::::.::.::: ::.:. :::.:.. ::: . ::.:
CCDS32 MADFEELRNMVSSFRVSELQVLLGFAGRNKSGRKHDLLMRALHLLKSGCSPAVQIKIRE
10 20 30 40 50
70 80 90 100
pF1KB7 LYETRYAK-----------KNS----EPAPQPHRP-LDPLTMHSTYDRAGAVPRTPLAGP
::. :: . :.: . . .: .: : .:: ....:..: ..:
CCDS32 LYRRRYPRTLEGLSDLSTIKSSVFSLDGGSSPVEPDLAVAGIHSL-PSTSVTPHSP-SSP
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KB7 --NIDYPVLYGKYLNGLGRLPAKTLKPEVRLVKLPFFNMLDELLKPTELVPQNNEKLQES
.. . : ..:.:.: .:::...:: :.::: :: .. ...::.
CCDS32 VGSVLLQDTKPTFEMQQPSPPIPPVHPDVQLKNLPFYDVLDVLIKPTSLVQSSIQRFQEK
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210
pF1KB7 PCIFALTPRQVELIRNSRELQPGVK---AVQVVLRICYSDTSCPQEDQYPPNIAVKVNHS
::::::.::. : ::.. :: . .::: ::.: ..:::::::.:: .. .::: .
CCDS32 FFIFALTPQQVREICISRDFLPGGRRDYTVQVQLRLCLAETSCPQEDNYPNSLCIKVNGK
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KB7 YCSVPGYYPSNKPGVEPKRPCRPINLTHLMYLSSAT-NRITVTWGN-YGKSYSVALYLVR
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CCDS32 LFPLPGYAPPPKNGIEQKRPGRPLNITSLVRLSSAVPNQISISWASEIGKNYSMSVYLVR
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KB7 QLTSSELLQRLKTIGVKHPELCKALVKEKLRLDPDSEIATTGVRVSLICPLVKMRLSVPC
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CCDS32 QLTSAMLLQRLKMKGIRNPDHSRALIKEKLTADPDSEIATTSLRVSLMCPLGKMRLTIPC
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KB7 RAETCAHLQCFDAVFYLQMNEKKPTWMCPVCDKPAPYDQLIIDGLLSKILSECEDADEIE
:: ::.:::::::..:::::::::::.:::::: : :..::.:::. .::..: :.:::.
CCDS32 RAVTCTHLQCFDAALYLQMNEKKPTWICPVCDKKAAYESLILDGLFMEILNDCSDVDEIK
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430 440 450
pF1KB7 YLVDGSWCPIRAEKERSCSPQGAILVLGPSDANGLLPAPSVNGSGALGSTGGGGPVGSME
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CCDS32 FQEDGSWCPMRPKKE-------AMKVSSQ-------PCTKIESSSVL-SKPCSVTVAS-E
420 430 440 450 460
460 470 480 490 500 510
pF1KB7 NGKPGADVVDLTLDSSSSSEDEEEEEEEEEDEDEEGPRPKRRCPFQKGLVPAC
.: .::.:::..::: .:::: : ::.: :
CCDS32 ASKKKVDVIDLTIESSS---------DEEED-----PPAKRKCIFMSETQSSPTKGVLMY
470 480 490 500
CCDS32 QPSSVRVPSVTSVDPAAIPPSLTDYSVPFHHTPISSMSSDLPGEQRRNDINNELKLGTSS
510 520 530 540 550 560
>>CCDS32824.1 PIAS2 gene_id:9063|Hs108|chr18 (621 aa)
initn: 1437 init1: 730 opt: 1178 Z-score: 977.8 bits: 190.8 E(32554): 3.8e-48
Smith-Waterman score: 1413; 46.7% identity (70.2% similar) in 523 aa overlap (3-502:2-492)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MAAELVEAKNMVMSFRVSDLQMLLGFVGRSKSGLKHELVTRALQLVQFDCSPELFKKIKE
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