Result of FASTA (omim) for
pF1KB7782
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7782, 510 aa
1>>>pF1KB7782 510 - 510 aa - 510 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.9461+/-0.000317; mu= 7.0205+/- 0.020
mean_var=153.8662+/-29.904, 0's: 0 Z-trim(121.2): 66 B-trim: 165 in 1/55
Lambda= 0.103396
statistics sampled from 37375 (37441) to 37375 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.76), E-opt: 0.2 (0.439), width: 16
Scan time: 10.650
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_056981 (OMIM: 605989) E3 SUMO-protein ligase PI ( 510) 3464 528.3 2.1e-149
XP_011526362 (OMIM: 605989) PREDICTED: E3 SUMO-pro ( 529) 3420 521.7 2e-147
XP_016882357 (OMIM: 605989) PREDICTED: E3 SUMO-pro ( 319) 2195 338.9 1.3e-92
NP_006090 (OMIM: 605987) E3 SUMO-protein ligase PI ( 628) 1455 228.7 4e-59
XP_016878179 (OMIM: 603566) PREDICTED: E3 SUMO-pro ( 642) 1217 193.2 2e-48
XP_016878180 (OMIM: 603566) PREDICTED: E3 SUMO-pro ( 642) 1217 193.2 2e-48
XP_016878178 (OMIM: 603566) PREDICTED: E3 SUMO-pro ( 644) 1217 193.2 2e-48
XP_011520429 (OMIM: 603566) PREDICTED: E3 SUMO-pro ( 645) 1217 193.2 2e-48
NP_057250 (OMIM: 603566) E3 SUMO-protein ligase PI ( 651) 1217 193.2 2e-48
XP_016878177 (OMIM: 603566) PREDICTED: E3 SUMO-pro ( 653) 1217 193.2 2e-48
NP_001307616 (OMIM: 603566) E3 SUMO-protein ligase ( 653) 1217 193.2 2e-48
XP_011520428 (OMIM: 603566) PREDICTED: E3 SUMO-pro ( 660) 1217 193.2 2e-48
NP_001310988 (OMIM: 603567) E3 SUMO-protein ligase ( 498) 1178 187.3 9.1e-47
NP_001310986 (OMIM: 603567) E3 SUMO-protein ligase ( 498) 1178 187.3 9.1e-47
NP_001310984 (OMIM: 603567) E3 SUMO-protein ligase ( 498) 1178 187.3 9.1e-47
NP_001310987 (OMIM: 603567) E3 SUMO-protein ligase ( 507) 1178 187.3 9.2e-47
NP_001310980 (OMIM: 603567) E3 SUMO-protein ligase ( 563) 1178 187.3 1e-46
NP_001310981 (OMIM: 603567) E3 SUMO-protein ligase ( 563) 1178 187.3 1e-46
NP_001310982 (OMIM: 603567) E3 SUMO-protein ligase ( 563) 1178 187.3 1e-46
XP_016881560 (OMIM: 603567) PREDICTED: E3 SUMO-pro ( 563) 1178 187.3 1e-46
XP_016881561 (OMIM: 603567) PREDICTED: E3 SUMO-pro ( 563) 1178 187.3 1e-46
NP_001310983 (OMIM: 603567) E3 SUMO-protein ligase ( 563) 1178 187.3 1e-46
NP_001310975 (OMIM: 603567) E3 SUMO-protein ligase ( 571) 1178 187.3 1e-46
NP_775298 (OMIM: 603567) E3 SUMO-protein ligase PI ( 572) 1178 187.3 1e-46
XP_006722636 (OMIM: 603567) PREDICTED: E3 SUMO-pro ( 611) 1178 187.3 1.1e-46
NP_001310977 (OMIM: 603567) E3 SUMO-protein ligase ( 612) 1178 187.3 1.1e-46
NP_001310978 (OMIM: 603567) E3 SUMO-protein ligase ( 612) 1178 187.3 1.1e-46
XP_016881558 (OMIM: 603567) PREDICTED: E3 SUMO-pro ( 612) 1178 187.3 1.1e-46
XP_016881559 (OMIM: 603567) PREDICTED: E3 SUMO-pro ( 612) 1178 187.3 1.1e-46
XP_011524561 (OMIM: 603567) PREDICTED: E3 SUMO-pro ( 613) 1178 187.3 1.1e-46
NP_001310976 (OMIM: 603567) E3 SUMO-protein ligase ( 613) 1178 187.3 1.1e-46
XP_016881557 (OMIM: 603567) PREDICTED: E3 SUMO-pro ( 613) 1178 187.3 1.1e-46
XP_011524560 (OMIM: 603567) PREDICTED: E3 SUMO-pro ( 620) 1178 187.3 1.1e-46
NP_004662 (OMIM: 603567) E3 SUMO-protein ligase PI ( 621) 1178 187.3 1.1e-46
XP_005258436 (OMIM: 603567) PREDICTED: E3 SUMO-pro ( 622) 1178 187.3 1.1e-46
XP_005258434 (OMIM: 603567) PREDICTED: E3 SUMO-pro ( 626) 1178 187.3 1.1e-46
XP_006722635 (OMIM: 603567) PREDICTED: E3 SUMO-pro ( 660) 1178 187.4 1.1e-46
XP_006722634 (OMIM: 603567) PREDICTED: E3 SUMO-pro ( 661) 1178 187.4 1.1e-46
NP_001310989 (OMIM: 603567) E3 SUMO-protein ligase ( 405) 1041 166.8 1.1e-40
XP_016871931 (OMIM: 607159) PREDICTED: zinc finger ( 943) 313 58.4 1.1e-07
XP_011538282 (OMIM: 607159) PREDICTED: zinc finger ( 943) 313 58.4 1.1e-07
XP_011538280 (OMIM: 607159) PREDICTED: zinc finger ( 949) 313 58.4 1.1e-07
XP_011538281 (OMIM: 607159) PREDICTED: zinc finger ( 949) 313 58.4 1.1e-07
XP_016871932 (OMIM: 607159) PREDICTED: zinc finger ( 949) 313 58.4 1.1e-07
XP_016871930 (OMIM: 607159) PREDICTED: zinc finger ( 949) 313 58.4 1.1e-07
XP_006717988 (OMIM: 607159) PREDICTED: zinc finger ( 986) 313 58.4 1.1e-07
XP_016871929 (OMIM: 607159) PREDICTED: zinc finger (1022) 313 58.4 1.1e-07
NP_065071 (OMIM: 607159) zinc finger MIZ domain-co (1067) 313 58.5 1.2e-07
XP_005270045 (OMIM: 607159) PREDICTED: zinc finger (1073) 313 58.5 1.2e-07
XP_005270044 (OMIM: 607159) PREDICTED: zinc finger (1073) 313 58.5 1.2e-07
>>NP_056981 (OMIM: 605989) E3 SUMO-protein ligase PIAS4 (510 aa)
initn: 3464 init1: 3464 opt: 3464 Z-score: 2803.4 bits: 528.3 E(85289): 2.1e-149
Smith-Waterman score: 3464; 100.0% identity (100.0% similar) in 510 aa overlap (1-510:1-510)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MAAELVEAKNMVMSFRVSDLQMLLGFVGRSKSGLKHELVTRALQLVQFDCSPELFKKIKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 MAAELVEAKNMVMSFRVSDLQMLLGFVGRSKSGLKHELVTRALQLVQFDCSPELFKKIKE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 LYETRYAKKNSEPAPQPHRPLDPLTMHSTYDRAGAVPRTPLAGPNIDYPVLYGKYLNGLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 LYETRYAKKNSEPAPQPHRPLDPLTMHSTYDRAGAVPRTPLAGPNIDYPVLYGKYLNGLG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 RLPAKTLKPEVRLVKLPFFNMLDELLKPTELVPQNNEKLQESPCIFALTPRQVELIRNSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 RLPAKTLKPEVRLVKLPFFNMLDELLKPTELVPQNNEKLQESPCIFALTPRQVELIRNSR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 ELQPGVKAVQVVLRICYSDTSCPQEDQYPPNIAVKVNHSYCSVPGYYPSNKPGVEPKRPC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 ELQPGVKAVQVVLRICYSDTSCPQEDQYPPNIAVKVNHSYCSVPGYYPSNKPGVEPKRPC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 RPINLTHLMYLSSATNRITVTWGNYGKSYSVALYLVRQLTSSELLQRLKTIGVKHPELCK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 RPINLTHLMYLSSATNRITVTWGNYGKSYSVALYLVRQLTSSELLQRLKTIGVKHPELCK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 ALVKEKLRLDPDSEIATTGVRVSLICPLVKMRLSVPCRAETCAHLQCFDAVFYLQMNEKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 ALVKEKLRLDPDSEIATTGVRVSLICPLVKMRLSVPCRAETCAHLQCFDAVFYLQMNEKK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 PTWMCPVCDKPAPYDQLIIDGLLSKILSECEDADEIEYLVDGSWCPIRAEKERSCSPQGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 PTWMCPVCDKPAPYDQLIIDGLLSKILSECEDADEIEYLVDGSWCPIRAEKERSCSPQGA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 ILVLGPSDANGLLPAPSVNGSGALGSTGGGGPVGSMENGKPGADVVDLTLDSSSSSEDEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 ILVLGPSDANGLLPAPSVNGSGALGSTGGGGPVGSMENGKPGADVVDLTLDSSSSSEDEE
430 440 450 460 470 480
490 500 510
pF1KB7 EEEEEEEDEDEEGPRPKRRCPFQKGLVPAC
::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 EEEEEEEDEDEEGPRPKRRCPFQKGLVPAC
490 500 510
>>XP_011526362 (OMIM: 605989) PREDICTED: E3 SUMO-protein (529 aa)
initn: 3420 init1: 3420 opt: 3420 Z-score: 2767.7 bits: 521.7 E(85289): 2e-147
Smith-Waterman score: 3420; 100.0% identity (100.0% similar) in 502 aa overlap (9-510:28-529)
10 20 30 40
pF1KB7 MAAELVEAKNMVMSFRVSDLQMLLGFVGRSKSGLKHELVTR
:::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MTSSLPAKALGHFQKKHLVCKPFCFLHKNMVMSFRVSDLQMLLGFVGRSKSGLKHELVTR
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB7 ALQLVQFDCSPELFKKIKELYETRYAKKNSEPAPQPHRPLDPLTMHSTYDRAGAVPRTPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ALQLVQFDCSPELFKKIKELYETRYAKKNSEPAPQPHRPLDPLTMHSTYDRAGAVPRTPL
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB7 AGPNIDYPVLYGKYLNGLGRLPAKTLKPEVRLVKLPFFNMLDELLKPTELVPQNNEKLQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 AGPNIDYPVLYGKYLNGLGRLPAKTLKPEVRLVKLPFFNMLDELLKPTELVPQNNEKLQE
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KB7 SPCIFALTPRQVELIRNSRELQPGVKAVQVVLRICYSDTSCPQEDQYPPNIAVKVNHSYC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SPCIFALTPRQVELIRNSRELQPGVKAVQVVLRICYSDTSCPQEDQYPPNIAVKVNHSYC
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KB7 SVPGYYPSNKPGVEPKRPCRPINLTHLMYLSSATNRITVTWGNYGKSYSVALYLVRQLTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SVPGYYPSNKPGVEPKRPCRPINLTHLMYLSSATNRITVTWGNYGKSYSVALYLVRQLTS
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KB7 SELLQRLKTIGVKHPELCKALVKEKLRLDPDSEIATTGVRVSLICPLVKMRLSVPCRAET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SELLQRLKTIGVKHPELCKALVKEKLRLDPDSEIATTGVRVSLICPLVKMRLSVPCRAET
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KB7 CAHLQCFDAVFYLQMNEKKPTWMCPVCDKPAPYDQLIIDGLLSKILSECEDADEIEYLVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 CAHLQCFDAVFYLQMNEKKPTWMCPVCDKPAPYDQLIIDGLLSKILSECEDADEIEYLVD
370 380 390 400 410 420
410 420 430 440 450 460
pF1KB7 GSWCPIRAEKERSCSPQGAILVLGPSDANGLLPAPSVNGSGALGSTGGGGPVGSMENGKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GSWCPIRAEKERSCSPQGAILVLGPSDANGLLPAPSVNGSGALGSTGGGGPVGSMENGKP
430 440 450 460 470 480
470 480 490 500 510
pF1KB7 GADVVDLTLDSSSSSEDEEEEEEEEEDEDEEGPRPKRRCPFQKGLVPAC
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GADVVDLTLDSSSSSEDEEEEEEEEEDEDEEGPRPKRRCPFQKGLVPAC
490 500 510 520
>>XP_016882357 (OMIM: 605989) PREDICTED: E3 SUMO-protein (319 aa)
initn: 2195 init1: 2195 opt: 2195 Z-score: 1783.4 bits: 338.9 E(85289): 1.3e-92
Smith-Waterman score: 2195; 100.0% identity (100.0% similar) in 317 aa overlap (194-510:3-319)
170 180 190 200 210 220
pF1KB7 CIFALTPRQVELIRNSRELQPGVKAVQVVLRICYSDTSCPQEDQYPPNIAVKVNHSYCSV
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MPRICYSDTSCPQEDQYPPNIAVKVNHSYCSV
10 20 30
230 240 250 260 270 280
pF1KB7 PGYYPSNKPGVEPKRPCRPINLTHLMYLSSATNRITVTWGNYGKSYSVALYLVRQLTSSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PGYYPSNKPGVEPKRPCRPINLTHLMYLSSATNRITVTWGNYGKSYSVALYLVRQLTSSE
40 50 60 70 80 90
290 300 310 320 330 340
pF1KB7 LLQRLKTIGVKHPELCKALVKEKLRLDPDSEIATTGVRVSLICPLVKMRLSVPCRAETCA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LLQRLKTIGVKHPELCKALVKEKLRLDPDSEIATTGVRVSLICPLVKMRLSVPCRAETCA
100 110 120 130 140 150
350 360 370 380 390 400
pF1KB7 HLQCFDAVFYLQMNEKKPTWMCPVCDKPAPYDQLIIDGLLSKILSECEDADEIEYLVDGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 HLQCFDAVFYLQMNEKKPTWMCPVCDKPAPYDQLIIDGLLSKILSECEDADEIEYLVDGS
160 170 180 190 200 210
410 420 430 440 450 460
pF1KB7 WCPIRAEKERSCSPQGAILVLGPSDANGLLPAPSVNGSGALGSTGGGGPVGSMENGKPGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 WCPIRAEKERSCSPQGAILVLGPSDANGLLPAPSVNGSGALGSTGGGGPVGSMENGKPGA
220 230 240 250 260 270
470 480 490 500 510
pF1KB7 DVVDLTLDSSSSSEDEEEEEEEEEDEDEEGPRPKRRCPFQKGLVPAC
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DVVDLTLDSSSSSEDEEEEEEEEEDEDEEGPRPKRRCPFQKGLVPAC
280 290 300 310
>>NP_006090 (OMIM: 605987) E3 SUMO-protein ligase PIAS3 (628 aa)
initn: 1424 init1: 712 opt: 1455 Z-score: 1182.5 bits: 228.7 E(85289): 4e-59
Smith-Waterman score: 1492; 48.0% identity (70.4% similar) in 517 aa overlap (3-509:2-477)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MAAELVEAKNMVMSFRVSDLQMLLGFVGRSKSGLKHELVTRALQLVQFDCSPELFKKIKE
::: : :.::::::::.::.::::.::.::: ::::...::.:.. .:.: . ::::
NP_006 MAELGELKHMVMSFRVSELQVLLGFAGRNKSGRKHELLAKALHLLKSSCAPSVQMKIKE
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KB7 LYETRYAKKNSEPAPQPHRPLDPLTMHSTYDRAGAVPRTPLAGPNIDYP-VLYG--KYLN
::. :. .:. :. : : : : : : .:. :.. : .: : . ..
NP_006 LYRRRFPRKTLGPSDLSLLSLPPGT--SPVGSPG--PLAPIP-PTLLAPGTLLGPKREVD
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 GLGRLPAKTLKPEVRLVKLPFFNMLDELLKPTELVPQNNEKLQESPCIFALTPRQVELIR
:: . ..:.: . :::... ::..:: :. ......:. :::::.::. :
NP_006 MHPPLP-QPVHPDVTMKPLPFYEVYGELIRPTTLASTSSQRFEEAHFTFALTPQQVQQIL
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 NSRELQPGVK---AVQVVLRICYSDTSCPQEDQYPPNIAVKVNHSYCSVPGYYPSNKPGV
.:::. ::.: ..:: ::.: .::::::: .:::. :::: . : .::: : .: :.
NP_006 TSREVLPGAKCDYTIQVQLRFCLCETSCPQEDYFPPNLFVKVNGKLCPLPGYLPPTKNGA
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 EPKRPCRPINLTHLMYLSSAT-NRITVTWGN-YGKSYSVALYLVRQLTSSELLQRLKTIG
::::: ::::.: : ::... : :.:.:.. .:..::...:::::::.. :::.:.. :
NP_006 EPKRPSRPINITPLARLSATVPNTIVVNWSSEFGRNYSLSVYLVRQLTAGTLLQKLRAKG
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 VKHPELCKALVKEKLRLDPDSEIATTGVRVSLICPLVKMRLSVPCRAETCAHLQCFDAVF
...:. .::.:::: :::::.:::..::::.::: ::::.::::: :::::: :::..
NP_006 IRNPDHSRALIKEKLTADPDSEVATTSLRVSLMCPLGKMRLTVPCRALTCAHLQSFDAAL
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB7 YLQMNEKKPTWMCPVCDKPAPYDQLIIDGLLSKILSECEDADEIEYLVDGSWCPIRAEKE
::::::::::: :::::: :::..::::::. .::: : : :::... ::::::.. .::
NP_006 YLQMNEKKPTWTCPVCDKKAPYESLIIDGLFMEILSSCSDCDEIQFMEDGSWCPMKPKKE
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB7 RS--CSPQGAILVLGPSDANGLLPAPSVNGSGALGSTGGGGPVGSMENGKPGADVVDLTL
: : : : : .:: .: . :: : :: : ..:.:::.
NP_006 ASEVCPPPGYGL-------DGLQYSP----------VQGGDPS---ENKKK-VEVIDLTI
420 430 440 450
480 490 500 510
pF1KB7 DSSSSSEDEEEEEEEEEDEDEEGPRPKRRCPFQKGLVPAC
.:::. :: : :..: .. .::
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