FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB7787, 458 aa 1>>>pF1KB7787 458 - 458 aa - 458 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.3457+/-0.000692; mu= 2.7542+/- 0.043 mean_var=286.4816+/-56.981, 0's: 0 Z-trim(113.3): 2116 B-trim: 113 in 1/51 Lambda= 0.075775 statistics sampled from 20160 (22544) to 20160 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.605), E-opt: 0.2 (0.264), width: 16 Scan time: 8.980 The best scores are: opt bits E(85289) NP_008892 (OMIM: 194525) zinc finger protein 19 [H ( 458) 3233 368.0 3e-101 NP_001273625 (OMIM: 194552) zinc finger protein 79 ( 474) 1376 165.0 4e-40 NP_001309189 (OMIM: 194552) zinc finger protein 79 ( 474) 1376 165.0 4e-40 XP_006717342 (OMIM: 194552) PREDICTED: zinc finger ( 474) 1376 165.0 4e-40 NP_001273626 (OMIM: 194552) zinc finger protein 79 ( 474) 1376 165.0 4e-40 NP_009066 (OMIM: 194552) zinc finger protein 79 is ( 498) 1376 165.0 4.1e-40 NP_001070663 (OMIM: 611703) zinc finger protein 43 ( 470) 1315 158.3 4.1e-38 NP_085137 (OMIM: 611703) zinc finger protein 436 [ ( 470) 1315 158.3 4.1e-38 NP_001078853 (OMIM: 604085) zinc finger protein 15 ( 437) 1312 157.9 4.9e-38 NP_001291422 (OMIM: 194527) zinc finger protein 23 ( 585) 1309 157.8 7.3e-38 NP_001291423 (OMIM: 194527) zinc finger protein 23 ( 585) 1309 157.8 7.3e-38 NP_001291421 (OMIM: 194527) zinc finger protein 23 ( 643) 1309 157.8 7.8e-38 NP_666016 (OMIM: 194527) zinc finger protein 23 is ( 643) 1309 157.8 7.8e-38 XP_016882427 (OMIM: 606043) PREDICTED: zinc finger ( 463) 1287 155.2 3.4e-37 NP_001073375 (OMIM: 606043) zinc finger protein 33 ( 463) 1287 155.2 3.4e-37 NP_001304048 (OMIM: 606043) zinc finger protein 33 ( 463) 1287 155.2 3.4e-37 XP_016882425 (OMIM: 606043) PREDICTED: zinc finger ( 463) 1287 155.2 3.4e-37 NP_001240730 (OMIM: 606043) zinc finger protein 33 ( 463) 1287 155.2 3.4e-37 NP_061025 (OMIM: 606043) zinc finger protein 331 [ ( 463) 1287 155.2 3.4e-37 NP_001304049 (OMIM: 606043) zinc finger protein 33 ( 463) 1287 155.2 3.4e-37 XP_016882429 (OMIM: 606043) PREDICTED: zinc finger ( 463) 1287 155.2 3.4e-37 NP_001240729 (OMIM: 606043) zinc finger protein 33 ( 463) 1287 155.2 3.4e-37 NP_001240728 (OMIM: 606043) zinc finger protein 33 ( 463) 1287 155.2 3.4e-37 NP_001304047 (OMIM: 606043) zinc finger protein 33 ( 463) 1287 155.2 3.4e-37 NP_001073376 (OMIM: 606043) zinc finger protein 33 ( 463) 1287 155.2 3.4e-37 NP_001304046 (OMIM: 606043) zinc finger protein 33 ( 463) 1287 155.2 3.4e-37 NP_001304045 (OMIM: 606043) zinc finger protein 33 ( 463) 1287 155.2 3.4e-37 NP_001304050 (OMIM: 606043) zinc finger protein 33 ( 463) 1287 155.2 3.4e-37 NP_001240727 (OMIM: 606043) zinc finger protein 33 ( 463) 1287 155.2 3.4e-37 NP_001304044 (OMIM: 606043) zinc finger protein 33 ( 463) 1287 155.2 3.4e-37 XP_011525380 (OMIM: 606043) PREDICTED: zinc finger ( 463) 1287 155.2 3.4e-37 XP_016882428 (OMIM: 606043) PREDICTED: zinc finger ( 463) 1287 155.2 3.4e-37 NP_001304043 (OMIM: 606043) zinc finger protein 33 ( 463) 1287 155.2 3.4e-37 XP_011525378 (OMIM: 606043) PREDICTED: zinc finger ( 463) 1287 155.2 3.4e-37 NP_001304042 (OMIM: 606043) zinc finger protein 33 ( 463) 1287 155.2 3.4e-37 XP_016882426 (OMIM: 606043) PREDICTED: zinc finger ( 463) 1287 155.2 3.4e-37 NP_003431 (OMIM: 604082) zinc finger protein 140 i ( 457) 1281 154.6 5.2e-37 XP_011533137 (OMIM: 604082) PREDICTED: zinc finger ( 457) 1281 154.6 5.2e-37 NP_001276331 (OMIM: 604077) zinc finger protein 13 ( 616) 1280 154.6 6.8e-37 XP_016882731 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 621) 1280 154.6 6.9e-37 XP_016882730 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 628) 1280 154.6 6.9e-37 NP_001276330 (OMIM: 604077) zinc finger protein 13 ( 658) 1280 154.7 7.1e-37 XP_016882729 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 658) 1280 154.7 7.1e-37 XP_006723426 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 1280 154.7 7.2e-37 XP_006723425 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 1280 154.7 7.2e-37 XP_005259268 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 1280 154.7 7.2e-37 NP_003427 (OMIM: 604077) zinc finger protein 135 i ( 670) 1280 154.7 7.2e-37 NP_009065 (OMIM: 604077) zinc finger protein 135 i ( 682) 1280 154.7 7.3e-37 NP_001273627 (OMIM: 194552) zinc finger protein 79 ( 364) 1267 152.9 1.3e-36 XP_011540503 (OMIM: 611703) PREDICTED: zinc finger ( 452) 1264 152.7 1.9e-36 >>NP_008892 (OMIM: 194525) zinc finger protein 19 [Homo (458 aa) initn: 3233 init1: 3233 opt: 3233 Z-score: 1938.6 bits: 368.0 E(85289): 3e-101 Smith-Waterman score: 3233; 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