FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB7794, 519 aa 1>>>pF1KB7794 519 - 519 aa - 519 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.9424+/-0.00036; mu= -1.7034+/- 0.023 mean_var=256.2748+/-52.744, 0's: 0 Z-trim(122.6): 108 B-trim: 1653 in 1/57 Lambda= 0.080116 statistics sampled from 40862 (40979) to 40862 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.793), E-opt: 0.2 (0.48), width: 16 Scan time: 12.360 The best scores are: opt bits E(85289) NP_443086 (OMIM: 616215) cyclic AMP-responsive ele ( 519) 3488 416.1 1.3e-115 XP_006718443 (OMIM: 616215) PREDICTED: cyclic AMP- ( 363) 2271 275.3 2.1e-73 NP_919047 (OMIM: 608834) cyclic AMP-responsive ele ( 520) 984 126.7 1.7e-28 XP_016868029 (OMIM: 608834) PREDICTED: cyclic AMP- ( 457) 952 122.9 2e-27 XP_016868030 (OMIM: 608834) PREDICTED: cyclic AMP- ( 457) 952 122.9 2e-27 NP_001305175 (OMIM: 608834) cyclic AMP-responsive ( 457) 952 122.9 2e-27 XP_005250598 (OMIM: 608834) PREDICTED: cyclic AMP- ( 457) 952 122.9 2e-27 NP_001258925 (OMIM: 611998) cyclic AMP-responsive ( 459) 427 62.3 3.7e-09 NP_001258924 (OMIM: 611998) cyclic AMP-responsive ( 460) 426 62.1 4e-09 NP_115996 (OMIM: 611998) cyclic AMP-responsive ele ( 461) 426 62.1 4e-09 NP_001242908 (OMIM: 607138) cyclic AMP-responsive ( 395) 413 60.6 1e-08 NP_001242907 (OMIM: 607138) cyclic AMP-responsive ( 395) 413 60.6 1e-08 NP_570968 (OMIM: 607138) cyclic AMP-responsive ele ( 395) 413 60.6 1e-08 XP_006711235 (OMIM: 607138) PREDICTED: cyclic AMP- ( 375) 406 59.8 1.7e-08 XP_016855861 (OMIM: 607138) PREDICTED: cyclic AMP- ( 375) 406 59.8 1.7e-08 NP_001242910 (OMIM: 607138) cyclic AMP-responsive ( 375) 406 59.8 1.7e-08 NP_001242909 (OMIM: 607138) cyclic AMP-responsive ( 375) 406 59.8 1.7e-08 NP_006359 (OMIM: 606443) cyclic AMP-responsive ele ( 371) 387 57.6 7.7e-08 NP_001240704 (OMIM: 608834) cyclic AMP-responsive ( 248) 287 45.9 0.00017 >>NP_443086 (OMIM: 616215) cyclic AMP-responsive element (519 aa) initn: 3488 init1: 3488 opt: 3488 Z-score: 2196.8 bits: 416.1 E(85289): 1.3e-115 Smith-Waterman score: 3488; 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