FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB7804, 591 aa 1>>>pF1KB7804 591 - 591 aa - 591 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.7747+/-0.000974; mu= 7.2708+/- 0.058 mean_var=128.2019+/-25.283, 0's: 0 Z-trim(108.7): 29 B-trim: 8 in 1/49 Lambda= 0.113273 statistics sampled from 10361 (10370) to 10361 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.671), E-opt: 0.2 (0.319), width: 16 Scan time: 3.430 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS4343.1 EBF1 gene_id:1879|Hs108|chr5 ( 591) 3946 656.5 2.8e-188 CCDS31314.1 EBF3 gene_id:253738|Hs108|chr10 ( 551) 3170 529.6 3.9e-150 CCDS46573.1 EBF4 gene_id:57593|Hs108|chr20 ( 598) 2979 498.4 1e-140 CCDS43726.1 EBF2 gene_id:64641|Hs108|chr8 ( 575) 2912 487.5 2e-137 CCDS78081.1 EBF1 gene_id:1879|Hs108|chr5 ( 560) 2629 441.2 1.6e-123 >>CCDS4343.1 EBF1 gene_id:1879|Hs108|chr5 (591 aa) initn: 3946 init1: 3946 opt: 3946 Z-score: 3493.7 bits: 656.5 E(32554): 2.8e-188 Smith-Waterman score: 3946; 100.0% identity (100.0% similar) in 591 aa overlap (1-591:1-591) 10 20 30 40 50 60 pF1KB7 MFGIQESIQRSGSSMKEEPLGSGMNAVRTWMQGAGVLDANTAAQSGVGLARAHFEKQPPS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS43 MFGIQESIQRSGSSMKEEPLGSGMNAVRTWMQGAGVLDANTAAQSGVGLARAHFEKQPPS 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KB7 NLRKSNFFHFVLALYDRQGQPVEIERTAFVGFVEKEKEANSEKTNNGIHYRLQLLYSNGI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS43 NLRKSNFFHFVLALYDRQGQPVEIERTAFVGFVEKEKEANSEKTNNGIHYRLQLLYSNGI 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KB7 RTEQDFYVRLIDSMTKQAIVYEGQDKNPEMCRVLLTHEIMCSRCCDKKSCGNRNETPSDP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS43 RTEQDFYVRLIDSMTKQAIVYEGQDKNPEMCRVLLTHEIMCSRCCDKKSCGNRNETPSDP 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KB7 VIIDRFFLKFFLKCNQNCLKNAGNPRDMRRFQVVVSTTVNVDGHVLAVSDNMFVHNNSKH :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS43 VIIDRFFLKFFLKCNQNCLKNAGNPRDMRRFQVVVSTTVNVDGHVLAVSDNMFVHNNSKH 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KB7 GRRARRLDPSEGTPSYLEHATPCIKAISPSEGWTTGGATVIIIGDNFFDGLQVIFGTMLV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS43 GRRARRLDPSEGTPSYLEHATPCIKAISPSEGWTTGGATVIIIGDNFFDGLQVIFGTMLV 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KB7 WSELITPHAIRVQTPPRHIPGVVEVTLSYKSKQFCKGTPGRFIYTALNEPTIDYGFQRLQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS43 WSELITPHAIRVQTPPRHIPGVVEVTLSYKSKQFCKGTPGRFIYTALNEPTIDYGFQRLQ 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KB7 KVIPRHPGDPERLPKEVILKRAADLVEALYGMPHNNQEIILKRAADIAEALYSVPRNHNQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS43 KVIPRHPGDPERLPKEVILKRAADLVEALYGMPHNNQEIILKRAADIAEALYSVPRNHNQ 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KB7 LPALANTSVHAGMMGVNSFSGQLAVNVSEASQATNQGFTRNSSSVSPHGYVPSTTPQQTN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS43 LPALANTSVHAGMMGVNSFSGQLAVNVSEASQATNQGFTRNSSSVSPHGYVPSTTPQQTN 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 pF1KB7 YNSVTTSMNGYGSAAMSNLGGSPTFLNGSAANSPYAIVPSSPTMASSTSLPSNCSSSSGI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS43 YNSVTTSMNGYGSAAMSNLGGSPTFLNGSAANSPYAIVPSSPTMASSTSLPSNCSSSSGI 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 pF1KB7 FSFSPANMVSAVKQKSAFAPVVRPQTSPPPTCTSTNGNSLQAISGMIVPPM ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS43 FSFSPANMVSAVKQKSAFAPVVRPQTSPPPTCTSTNGNSLQAISGMIVPPM 550 560 570 580 590 >>CCDS31314.1 EBF3 gene_id:253738|Hs108|chr10 (551 aa) initn: 3413 init1: 1629 opt: 3170 Z-score: 2808.9 bits: 529.6 E(32554): 3.9e-150 Smith-Waterman score: 3295; 83.3% identity (91.1% similar) in 594 aa overlap (1-591:1-551) 10 20 30 40 50 60 pF1KB7 MFGIQESIQRSGSSMKEEPLGSGMNAVRTWMQGAGVLDANTAAQSGVGLARAHFEKQPPS ::::::.: :.:..::::::::::: ::.::. :::.::::::::::::::::::::::: CCDS31 MFGIQENIPRGGTTMKEEPLGSGMNPVRSWMHTAGVVDANTAAQSGVGLARAHFEKQPPS 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KB7 NLRKSNFFHFVLALYDRQGQPVEIERTAFVGFVEKEKEANSEKTNNGIHYRLQLLYSNGI :::::::::::::::::::::::::::::: ::::::: :.:::::::::.::::::::. 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