FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7805, 522 aa
1>>>pF1KB7805 522 - 522 aa - 522 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.3528+/-0.00181; mu= 9.5627+/- 0.108
mean_var=263.5769+/-51.705, 0's: 0 Z-trim(104.9): 989 B-trim: 33 in 1/49
Lambda= 0.078999
statistics sampled from 7046 (8123) to 7046 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.578), E-opt: 0.2 (0.25), width: 16
Scan time: 3.040
The best scores are: opt bits E(32554)
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CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 658) 1534 189.5 9.9e-48
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CCDS12859.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19 ( 818) 1490 184.6 3.6e-46
CCDS32981.1 ZNF675 gene_id:171392|Hs108|chr19 ( 568) 1487 184.1 3.7e-46
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CCDS74351.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19 ( 635) 1471 182.3 1.4e-45
CCDS12854.1 ZNF83 gene_id:55769|Hs108|chr19 ( 516) 1457 180.6 3.8e-45
CCDS11179.2 ZNF287 gene_id:57336|Hs108|chr17 ( 761) 1459 181.1 4e-45
CCDS6437.1 ZNF16 gene_id:7564|Hs108|chr8 ( 682) 1457 180.8 4.4e-45
CCDS42537.1 ZNF429 gene_id:353088|Hs108|chr19 ( 674) 1456 180.7 4.7e-45
CCDS32973.1 ZNF93 gene_id:81931|Hs108|chr19 ( 620) 1455 180.5 4.9e-45
>>CCDS4441.1 ZNF454 gene_id:285676|Hs108|chr5 (522 aa)
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Smith-Waterman score: 3676; 99.8% identity (99.8% similar) in 522 aa overlap (1-522:1-522)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MAVSHLPTMVQESVTFKDVAILFTQEEWGQLSPAQRALYRDVMLENYSNLVSLGLLGPKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MAVSHLPTMVQESVTFKDVAILFTQEEWGQLSPAQRALYRDVMLENYSNLVSLGLLGPKP
10 20 30 40 50 60
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pF1KB7 DTFSQLEKREVWMPEDTPGGFCLDWMTMPASKKSTVKAEIPEEELDQWTIKERFSSSSHW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 DTFSQLEKREVWMPEDTPGGFCLDWMTMPASKKSTVKAEIPEEELDQWTIKERFSSSSHW
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
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::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 KCASLLEWQCGGQEISLQRVVLTHPNTPSQECDESGSTMSSSLHSDQSQGFQPSKNAFEC
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SECGKVFSKSSTLNKHQKIHNEKNANQKIHIKEKRYECRECGKAFHQSTHLIHHQRIHTG
190 200 210 220 230 240
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 EKPYECKECGKAFSVSSSLTYHQKIHTGEKPFECNLCGKAFIRNIHLAHHHRIHTGEKPF
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pF1KB7 KCNICEKAFVCRAHLTKHQNIHSGEKPYKCNECGKAFNQSTSFLQHQRIHTGEKPFECNE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 KCNICEKAFVCRAHLTKHQNIHSGEKPYKCNECGKAFNQSTSFLQHQRIHTGEKPFECNE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 CGKAFRVNSSLTEHQRIHTGEKPYKCNECGKAFRDNSSFARHRKIHTGEKPYRCGLCEKA
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pF1KB7 FRDQSALAQHQRIHTGEKPYTCNICEKAFSDHSALTQHKRIHTREKPYKCKICEKAFIRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 FRDQSALAQHQRIHTGEKPYTCNICEKAFSDHSALTQHKRIHTREKPYKCKICEKAFIRS
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pF1KB7 THLTQHQRIHTGEKPYKCNKCGKAFNQTANLIQHQRHHIGEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 THLTQHQRIHTGEKPYKCNKCGKAFNQTANLIQHQRHHIGEK
490 500 510 520
>>CCDS12504.1 ZNF570 gene_id:148268|Hs108|chr19 (536 aa)
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10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MAVSHLPTMVQESVTFKDVAILFTQEEWGQLSPAQRALYRDVMLENYSNLVSLGLLGPKP
:::. : .: :: :::.:::. :.:::: :. .:: :: .:::::: :::::: ::
CCDS12 MAVGLLKAMYQELVTFRDVAVDFSQEEWDCLDSSQRHLYSNVMLENYRILVSLGLCFSKP
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70 80 90 100 110
pF1KB7 DTFSQLEK-REVWM-PEDTPGGFCLDWMTMPASKKSTVKAEIPEEELDQWTIK-------
... ::. . :: .. :.: : . ... : : .. ::. .: :.
CCDS12 SVILLLEQGKAPWMVKRELTKGLCSGWEPICETEELTPKQDFYEEHQSQKIIETLTSYNL
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120 130 140 150 160 170
pF1KB7 ERFSSSSHWKCASLLEWQCGGQEISLQRVVLTHPNTPSQEYDESGSTMSSSLHSDQSQGF
: : .::: . .: : :.:. ... ..:: . .: .. .. .: .:
CCDS12 EYSSLREEWKCEGYFERQPGNQKACFKEEIITHEEPLFDEREQEYKSWGS-FH-------
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180 190 200 210 220
pF1KB7 QPSKNAFECSECGKVFSKSSTLNKH--QKIHNEKN----ANQKIHIKEKRYECRECGKAF
.: . :.. :.. : ..:: :: .:: ... ..: .: .: :.:
CCDS12 ---QNPLLCTQ--KIIPKEEKVHKHDTQKRSFKKNLMAIKPKSVCAEKKLLKCNDCEKVF
180 190 200 210 220
230 240 250 260 270 280
pF1KB7 HQSTHLIHHQRIHTGEKPYECKECGKAFSVSSSLTYHQKIHTGEKPFECNLCGKAFIRNI
::. : :::::::::::.: ::::::: :.:. ::.:::::::.::. : ::: .:
CCDS12 SQSSSLTLHQRIHTGEKPYKCIECGKAFSQRSNLVQHQRIHTGEKPYECKECRKAFSQNA
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290 300 310 320 330 340
pF1KB7 HLAHHHRIHTGEKPFKCNICEKAFVCRAHLTKHQNIHSGEKPYKCNECGKAFNQSTSFLQ
::..: :.::::::..:..:.::: :.:..:: .:.:::::.: ::::::.. .:. :
CCDS12 HLVQHLRVHTGEKPYECKVCRKAFSQFAYLAQHQRVHTGEKPYECIECGKAFSNRSSIAQ
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pF1KB7 HQRIHTGEKPFECNECGKAFRVNSSLTEHQRIHTGEKPYKCNECGKAFRDNSSFARHRKI
:::.::::::.::: ::::: . . :: ::::::::.::.:.:::::: .:: .:.:..:
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pF1KB7 HTGEKPYRCGLCEKAFRDQSALAQHQRIHTGEKPYTCNICEKAFSDHSALTQHKRIHTRE
:::::::.: :.::: . . ::::::.::::::: : : ::::. :.::::.:.:: :
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:::.: .: ::: :.:::::::::.::.:..: :.: : :.: .::: ::::
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CCDS12 PNPVNHQVL
530
>>CCDS74355.1 ZNF570 gene_id:148268|Hs108|chr19 (592 aa)
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10 20 30
pF1KB7 MAVSHLPTMVQESVTFKDVAILFTQEEWGQ
:::. : .: :: :::.:::. :.::::
CCDS74 SSQAICVTPVRVESSEATAISQEKSQEEERMAVGLLKAMYQELVTFRDVAVDFSQEEWDC
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40 50 60 70 80
pF1KB7 LSPAQRALYRDVMLENYSNLVSLGLLGPKPDTFSQLEK-REVWM-PEDTPGGFCLDWMTM
:. .:: :: .:::::: :::::: ::... ::. . :: .. :.: : .
CCDS74 LDSSQRHLYSNVMLENYRILVSLGLCFSKPSVILLLEQGKAPWMVKRELTKGLCSGWEPI
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90 100 110 120 130 140
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... : : .. ::. .: :. : : .::: . .: : :.:. ... .
CCDS74 CETEELTPKQDFYEEHQSQKIIETLTSYNLEYSSLREEWKCEGYFERQPGNQKACFKEEI
150 160 170 180 190 200
150 160 170 180 190
pF1KB7 LTHPNTPSQEYDESGSTMSSSLHSDQSQGFQPSKNAFECSECGKVFSKSSTLNKH--QKI
.:: . .: .. .. .: .: .: . :.. :.. : ..:: ::
CCDS74 ITHEEPLFDEREQEYKSWGS-FH----------QNPLLCTQ--KIIPKEEKVHKHDTQKR
210 220 230 240 250
200 210 220 230 240 250
pF1KB7 HNEKN----ANQKIHIKEKRYECRECGKAFHQSTHLIHHQRIHTGEKPYECKECGKAFSV
.:: ... ..: .: .: :.: ::. : :::::::::::.: :::::::
CCDS74 SFKKNLMAIKPKSVCAEKKLLKCNDCEKVFSQSSSLTLHQRIHTGEKPYKCIECGKAFSQ
260 270 280 290 300 310
260 270 280 290 300 310
pF1KB7 SSSLTYHQKIHTGEKPFECNLCGKAFIRNIHLAHHHRIHTGEKPFKCNICEKAFVCRAHL
:.:. ::.:::::::.::. : ::: .: ::..: :.::::::..:..:.::: :.:
CCDS74 RSNLVQHQRIHTGEKPYECKECRKAFSQNAHLVQHLRVHTGEKPYECKVCRKAFSQFAYL
320 330 340 350 360 370
320 330 340 350 360 370
pF1KB7 TKHQNIHSGEKPYKCNECGKAFNQSTSFLQHQRIHTGEKPFECNECGKAFRVNSSLTEHQ
..:: .:.:::::.: ::::::.. .:. ::::.::::::.::: ::::: . . :: ::
CCDS74 AQHQRVHTGEKPYECIECGKAFSNRSSIAQHQRVHTGEKPYECNVCGKAFSLRAYLTVHQ
380 390 400 410 420 430
380 390 400 410 420 430
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::::::.::.:.:::::: .:: .:.:..::::::::.: :.::: . . ::::::.::
CCDS74 RIHTGERPYECKECGKAFSQNSHLAQHQRIHTGEKPYKCQECRKAFSQIAYLAQHQRVHT
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440 450 460 470 480 490
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::::: : : ::::. :.::::.:.:: ::::.: .: ::: :.:::::::::.:
CCDS74 GEKPYECIECGKAFSNDSSLTQHQRVHTGEKPYECTVCGKAFSYCGSLAQHQRIHTGERP
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500 510 520
pF1KB7 YKCNKCGKAFNQTANLIQHQRHHIGEK
:.:..: :.: : :.: .::: ::::
CCDS74 YECKECKKTFRQHAHLAHHQRIHIGESLSPPNPVNHQVL
560 570 580 590
>>CCDS42982.1 ZNF74 gene_id:7625|Hs108|chr22 (644 aa)
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Smith-Waterman score: 1678; 46.8% identity (69.2% similar) in 549 aa overlap (11-518:40-578)
10 20 30 40
pF1KB7 MAVSHLPTMVQESVTFKDVAILFTQEEWGQLSPAQRALYR
.:::.:::::. :::::::::. ::::::
CCDS42 KTALSSQDPALSLKENLEDISGWGLPEARSKESVSFKDVAVDFTQEEWGQLDSPQRALYR
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90
pF1KB7 DVMLENYSNLVSLGLLGPKPDTFSQLEK-REVW-MPEDTPGGFCLDWM--TMPASKKSTV
:::::::.::..:: :::..:.::. .: : : ...: : : .: ..:.....
CCDS42 DVMLENYQNLLALGPPLHKPDVISHLERGEEPWSMQREVPRGPCPEWELKAVPSQQQGIC
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130
pF1KB7 KAEIPEEEL--------DQWTIKE---RFSSSSHWKCASLLEWQCGGQEISL-------Q
: : .: . . : . . :... : : . :. .:. : :
CCDS42 KEEPAQEPIMERPLGGAQAWGRQAGALQRSQAAPWAPAPAMVWDVPVEEFPLRCPLFAQQ
130 140 150 160 170 180
140 150 160 170
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300 310 320 330 340 350
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360 370 380 390 400 410
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420 430 440 450 460 470
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CCDS42 AFSSHAYLIVHRRIHTGEKPFDCSQCWKAFSCHSSLIVHQRIHTGEKPYKCSECGRAFSQ
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CCDS42 VRKVTSISKKILIKEKVIECKKVAKIFPLSSDIVTSRQSFYDCDSLDKGLEHNLDLLRYE
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CCDS42 HQRIHTGEKPYACTVCGKAFSQKSNLTEHEKIHTGEKPYHCNQCGKAFSQRQNLLEHEKI
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CCDS42 HTGEKPFKCNECGKAFSRISSLTLHVRSHTGEKPYECNKCGKAFSQCSLLIIHMRSHTGE
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CCDS42 KPFECNECGKAFSQRASLSIHKRGHTGERHQVY
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CCDS32 DIKDSFQQVILRRYGKCEHENLQLRKGSASVDEYKVHKEGYNELNQCLTTTQSKIFPCDK
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pF1KB7 SGSTMSSSLHSDQSQGFQPSKNAFECSECGKVFSKSSTLNKHQKIHNEKNANQKIHIKEK
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CCDS32 YVKVFHKFLNANRHKTRHTGKKPFKCKKCGKSFCMLLHLSQHKRIH----------IREN
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CCDS32 SYQCEECGKAFKWFSTLTRHKRIHTGEKPFKCEECGKAFKQSSTLTTHKIIHTGEKPYRC
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CCDS32 KAFNRFSYLTKHKIIHTGEKSYKCEECGKGFNWSSTLTKHKRIHTGEKPYKCEVCGKAFN
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.. : .:
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CCDS47 PELISQLEQGKELWVLNLLGAEEPDILKSCQKDSEVGTKKELSILNQKFSEEVKTPEFVS
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CCDS47 RRLLRDNAQAAEFREAW---GREGKLKERV---GNSAGQSLNKP--NIHKRVLTEATVGR
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CCDS47 ERSLGE-RTQECS-AFDRN--LNLDQNVVRL----QRNKTGERVFKCDICSKTFKYNSDL
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CCDS47 SRHQRSHTGEKPYECGRCGRAFTHSSNLVLHHHIHTGNKPFKCDECGKTFGLNSHLRLHR
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CCDS47 GEKPHECSHCGKAFSRSSSLIQHERIHTGEKPHKCNQCGKAFSQSSSLFLHHRVHTGEKP
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CCDS47 YVCNECGRAFGFNSHLTEHVRIHTGEKPYVCNECGKAFRRSSTLVQHRRVHTGEKPYQCV
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pF1KB7 ICEKAFIRSTHLTQHQRIHTGEKPYKCNKCGKAFNQTANLIQHQRHHIGEK
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CCDS47 ECGKAFSQSSQLTLHQRVHTGEKPYDCGDCGKAFSRRSTLIQHQKVHSGETRKCRKHGPA
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CCDS47 FVHGSSLTADGQIPTGEKHGRAFNHGANLILRWTVHTGEKSFGCNEYGKAFSPTSRPTED
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