Result of FASTA (omim) for
pF1KB7812
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7812, 595 aa
1>>>pF1KB7812 595 - 595 aa - 595 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.5322+/-0.00117; mu= 11.0127+/- 0.072
mean_var=380.8342+/-74.791, 0's: 0 Z-trim(107.5): 2107 B-trim: 73 in 1/50
Lambda= 0.065721
statistics sampled from 13182 (15525) to 13182 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.445), E-opt: 0.2 (0.182), width: 16
Scan time: 6.360
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_003420 (OMIM: 603899) zinc finger protein 85 is ( 595) 4165 411.0 5.6e-114
NP_001243102 (OMIM: 603899) zinc finger protein 85 ( 531) 3732 369.9 1.2e-101
NP_001243100 (OMIM: 603899) zinc finger protein 85 ( 625) 3659 363.1 1.6e-99
XP_011526565 (OMIM: 603899) PREDICTED: zinc finger ( 640) 3659 363.1 1.6e-99
XP_011526566 (OMIM: 603899) PREDICTED: zinc finger ( 536) 3655 362.6 1.9e-99
XP_016882723 (OMIM: 603899) PREDICTED: zinc finger ( 518) 3648 361.9 3e-99
NP_112495 (OMIM: 603975) zinc finger protein 93 [H ( 620) 3103 310.4 1.2e-83
NP_001269288 (OMIM: 603989) zinc finger protein 10 ( 852) 3095 309.8 2.3e-83
NP_003414 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 is ( 809) 3021 302.8 2.9e-81
NP_001243582 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 ( 818) 3021 302.8 3e-81
NP_975011 (OMIM: 604768) zinc finger protein 254 i ( 659) 3010 301.6 5.5e-81
XP_016882705 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2980 298.9 4.3e-80
NP_001243577 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 ( 803) 2980 298.9 4.3e-80
XP_011526561 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2980 298.9 4.3e-80
XP_016882703 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2980 298.9 4.3e-80
NP_001243579 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 ( 803) 2980 298.9 4.3e-80
XP_016882702 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2980 298.9 4.3e-80
XP_016882701 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2980 298.9 4.3e-80
NP_001243578 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 ( 803) 2980 298.9 4.3e-80
XP_016882699 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2980 298.9 4.3e-80
XP_016882698 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2980 298.9 4.3e-80
XP_016882697 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2980 298.9 4.3e-80
XP_016882700 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2980 298.9 4.3e-80
XP_016882696 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2980 298.9 4.3e-80
XP_016882704 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2980 298.9 4.3e-80
XP_011526559 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2980 298.9 4.3e-80
NP_689839 (OMIM: 603974) zinc finger protein 92 is ( 586) 2974 298.1 5.5e-80
NP_001073878 (OMIM: 603981) zinc finger protein 99 ( 864) 2932 294.4 1.1e-78
NP_009069 (OMIM: 603973) zinc finger protein 90 [H ( 601) 2913 292.3 3.1e-78
NP_003421 (OMIM: 603971) zinc finger protein 91 is (1191) 2896 291.2 1.3e-77
NP_001152765 (OMIM: 603984) zinc finger protein 73 ( 536) 2880 289.1 2.5e-77
NP_258429 (OMIM: 606957) zinc finger protein 257 i ( 563) 2857 287.0 1.2e-76
XP_006722660 (OMIM: 603984) PREDICTED: zinc finger ( 550) 2846 285.9 2.4e-76
XP_011525901 (OMIM: 603984) PREDICTED: zinc finger ( 550) 2846 285.9 2.4e-76
XP_011525900 (OMIM: 603984) PREDICTED: zinc finger ( 551) 2846 285.9 2.4e-76
XP_005259754 (OMIM: 603984) PREDICTED: zinc finger ( 551) 2846 285.9 2.4e-76
XP_011526745 (OMIM: 604768) PREDICTED: zinc finger ( 618) 2837 285.1 4.6e-76
XP_016883005 (OMIM: 604768) PREDICTED: zinc finger ( 618) 2837 285.1 4.6e-76
NP_001265591 (OMIM: 604768) zinc finger protein 25 ( 618) 2837 285.1 4.6e-76
XP_011526746 (OMIM: 604768) PREDICTED: zinc finger ( 618) 2837 285.1 4.6e-76
XP_016883004 (OMIM: 604768) PREDICTED: zinc finger ( 618) 2837 285.1 4.6e-76
XP_016883003 (OMIM: 604768) PREDICTED: zinc finger ( 618) 2837 285.1 4.6e-76
NP_001265606 (OMIM: 604768) zinc finger protein 25 ( 618) 2837 285.1 4.6e-76
NP_001265590 (OMIM: 604768) zinc finger protein 25 ( 618) 2837 285.1 4.6e-76
NP_001092096 (OMIM: 603980) zinc finger protein 98 ( 572) 2821 283.6 1.3e-75
NP_066971 (OMIM: 604756) zinc finger protein 273 [ ( 569) 2722 274.2 8.4e-73
XP_016867177 (OMIM: 604756) PREDICTED: zinc finger ( 569) 2722 274.2 8.4e-73
XP_016867773 (OMIM: 603989) PREDICTED: zinc finger ( 783) 2708 273.1 2.5e-72
NP_057304 (OMIM: 603989) zinc finger protein 107 i ( 783) 2708 273.1 2.5e-72
XP_016867775 (OMIM: 603989) PREDICTED: zinc finger ( 783) 2708 273.1 2.5e-72
>>NP_003420 (OMIM: 603899) zinc finger protein 85 isofor (595 aa)
initn: 4165 init1: 4165 opt: 4165 Z-score: 2167.2 bits: 411.0 E(85289): 5.6e-114
Smith-Waterman score: 4165; 99.2% identity (99.3% similar) in 595 aa overlap (1-595:1-595)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MGPLTFRDVAIEFSLKEWQCLDTAQRNLYRNVMLENYRNLVFLGITVSKPDLITCLEQGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 MGPLTFRDVAIEFSLKEWQCLDTAQRNLYRNVMLENYRNLVFLGITVSKPDLITCLEQGK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 EAWSMKRHEIMVAKPTVMCSHFARDLWPEQNIKDSFQKVTLKRYGKCRHENLPLIKGCES
:::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::: :::::
NP_003 EAWSMKRHEIMVAKPTVMCSHFAQDLWPEQNIKDSFQKVTLKRYGKCRHENLPLRKGCES
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 MDECKMHKGGCNGLNQCLTATQSKIFQCDKYVKVAHKFSNSNRHEIRHTKKKPFKCRKCG
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::
NP_003 MDECKMHKGGCNGLNQCLTATQSKIFQCDKYVKVAHKFSNSNRHEIRHTKKKPFKCTKCG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 KSFRMISCLTEHSRIHTRVNFYKCEECGKAFNWSSTLTKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFN
::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 KSFGMISCLTEHSRIHTRVNFYKCEECGKAFNWSSTLTKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 QSSNLIKHKKIHTGEKPYKCEECGKTFNRSSTLTTHKIIHTGEKPYKCKECGKAFNRSST
::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 QSSNLIKHKKIHTGEKPYKCEECGKTFNRFSTLTTHKIIHTGEKPYKCKECGKAFNRSST
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 LTTHRKIHTGEKPYKCEECGKAFKQSSNLTTHKIIHTGEKPYKCKKCGKAFNQSAHLTTH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 LTTHRKIHTGEKPYKCEECGKAFKQSSNLTTHKIIHTGEKPYKCKKCGKAFNQSAHLTTH
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 EVIHTGEKPYKCEKCGKAFNHFSHLTTHKIIHTGEKPYKCKECGKAFKHSSTLTKHKIIH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 EVIHTGEKPYKCEKCGKAFNHFSHLTTHKIIHTGEKPYKCKECGKAFKHSSTLTKHKIIH
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 TGEKPYKCKECEKAFNQSSKLTEHKKIHTGEKPYECEKCGKAFNQSSNLTRHKKSHTEEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 TGEKPYKCKECEKAFNQSSKLTEHKKIHTGEKPYECEKCGKAFNQSSNLTRHKKSHTEEK
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB7 PYKCEECGKGFKWPSTLTIHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSKLTKHKKIHTGEKPYTC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 PYKCEECGKGFKWPSTLTIHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSKLTKHKKIHTGEKPYTC
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590
pF1KB7 EECGKAFNQSSNLTKHKRIHTGEKPYKCEECDKAFKWSSVLTKHKIIHTGEKLQI
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 EECGKAFNQSSNLTKHKRIHTGEKPYKCEECDKAFKWSSVLTKHKIIHTGEKLQI
550 560 570 580 590
>>NP_001243102 (OMIM: 603899) zinc finger protein 85 iso (531 aa)
initn: 3732 init1: 3732 opt: 3732 Z-score: 1945.8 bits: 369.9 E(85289): 1.2e-101
Smith-Waterman score: 3732; 99.1% identity (99.2% similar) in 531 aa overlap (65-595:1-531)
40 50 60 70 80 90
pF1KB7 ENYRNLVFLGITVSKPDLITCLEQGKEAWSMKRHEIMVAKPTVMCSHFARDLWPEQNIKD
:::::::::::::::::::.::::::::::
NP_001 MKRHEIMVAKPTVMCSHFAQDLWPEQNIKD
10 20 30
100 110 120 130 140 150
pF1KB7 SFQKVTLKRYGKCRHENLPLIKGCESMDECKMHKGGCNGLNQCLTATQSKIFQCDKYVKV
:::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SFQKVTLKRYGKCRHENLPLRKGCESMDECKMHKGGCNGLNQCLTATQSKIFQCDKYVKV
40 50 60 70 80 90
160 170 180 190 200 210
pF1KB7 AHKFSNSNRHEIRHTKKKPFKCRKCGKSFRMISCLTEHSRIHTRVNFYKCEECGKAFNWS
:::::::::::::::::::::: :::::: ::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AHKFSNSNRHEIRHTKKKPFKCTKCGKSFGMISCLTEHSRIHTRVNFYKCEECGKAFNWS
100 110 120 130 140 150
220 230 240 250 260 270
pF1KB7 STLTKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSNLIKHKKIHTGEKPYKCEECGKTFNRSSTLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::
NP_001 STLTKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSNLIKHKKIHTGEKPYKCEECGKTFNRFSTLT
160 170 180 190 200 210
280 290 300 310 320 330
pF1KB7 THKIIHTGEKPYKCKECGKAFNRSSTLTTHRKIHTGEKPYKCEECGKAFKQSSNLTTHKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 THKIIHTGEKPYKCKECGKAFNRSSTLTTHRKIHTGEKPYKCEECGKAFKQSSNLTTHKI
220 230 240 250 260 270
340 350 360 370 380 390
pF1KB7 IHTGEKPYKCKKCGKAFNQSAHLTTHEVIHTGEKPYKCEKCGKAFNHFSHLTTHKIIHTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IHTGEKPYKCKKCGKAFNQSAHLTTHEVIHTGEKPYKCEKCGKAFNHFSHLTTHKIIHTG
280 290 300 310 320 330
400 410 420 430 440 450
pF1KB7 EKPYKCKECGKAFKHSSTLTKHKIIHTGEKPYKCKECEKAFNQSSKLTEHKKIHTGEKPY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EKPYKCKECGKAFKHSSTLTKHKIIHTGEKPYKCKECEKAFNQSSKLTEHKKIHTGEKPY
340 350 360 370 380 390
460 470 480 490 500 510
pF1KB7 ECEKCGKAFNQSSNLTRHKKSHTEEKPYKCEECGKGFKWPSTLTIHKIIHTGEKPYKCEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ECEKCGKAFNQSSNLTRHKKSHTEEKPYKCEECGKGFKWPSTLTIHKIIHTGEKPYKCEE
400 410 420 430 440 450
520 530 540 550 560 570
pF1KB7 CGKAFNQSSKLTKHKKIHTGEKPYTCEECGKAFNQSSNLTKHKRIHTGEKPYKCEECDKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 CGKAFNQSSKLTKHKKIHTGEKPYTCEECGKAFNQSSNLTKHKRIHTGEKPYKCEECDKA
460 470 480 490 500 510
580 590
pF1KB7 FKWSSVLTKHKIIHTGEKLQI
:::::::::::::::::::::
NP_001 FKWSSVLTKHKIIHTGEKLQI
520 530
>>NP_001243100 (OMIM: 603899) zinc finger protein 85 iso (625 aa)
initn: 3659 init1: 3659 opt: 3659 Z-score: 1907.8 bits: 363.1 E(85289): 1.6e-99
Smith-Waterman score: 4094; 94.2% identity (94.6% similar) in 625 aa overlap (1-595:1-625)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MGPLTFRDVAIEFSLKEWQCLDTAQRNLYRNVMLENYRNLVFLGITVSKPDLITCLEQGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MGPLTFRDVAIEFSLKEWQCLDTAQRNLYRNVMLENYRNLVFLGITVSKPDLITCLEQGK
10 20 30 40 50 60
70 80 90
pF1KB7 EAWSMKRHEIMVAKPT------------------------------VMCSHFARDLWPEQ
:::::::::::::::: .::::::.::::::
NP_001 EAWSMKRHEIMVAKPTGCLSKRMSYELLRKVYILMLLRSVLYASVRIMCSHFAQDLWPEQ
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KB7 NIKDSFQKVTLKRYGKCRHENLPLIKGCESMDECKMHKGGCNGLNQCLTATQSKIFQCDK
:::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NIKDSFQKVTLKRYGKCRHENLPLRKGCESMDECKMHKGGCNGLNQCLTATQSKIFQCDK
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KB7 YVKVAHKFSNSNRHEIRHTKKKPFKCRKCGKSFRMISCLTEHSRIHTRVNFYKCEECGKA
:::::::::::::::::::::::::: :::::: ::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YVKVAHKFSNSNRHEIRHTKKKPFKCTKCGKSFGMISCLTEHSRIHTRVNFYKCEECGKA
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KB7 FNWSSTLTKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSNLIKHKKIHTGEKPYKCEECGKTFNRS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FNWSSTLTKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSNLIKHKKIHTGEKPYKCEECGKTFNRF
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KB7 STLTTHKIIHTGEKPYKCKECGKAFNRSSTLTTHRKIHTGEKPYKCEECGKAFKQSSNLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 STLTTHKIIHTGEKPYKCKECGKAFNRSSTLTTHRKIHTGEKPYKCEECGKAFKQSSNLT
310 320 330 340 350 360
340 350 360 370 380 390
pF1KB7 THKIIHTGEKPYKCKKCGKAFNQSAHLTTHEVIHTGEKPYKCEKCGKAFNHFSHLTTHKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 THKIIHTGEKPYKCKKCGKAFNQSAHLTTHEVIHTGEKPYKCEKCGKAFNHFSHLTTHKI
370 380 390 400 410 420
400 410 420 430 440 450
pF1KB7 IHTGEKPYKCKECGKAFKHSSTLTKHKIIHTGEKPYKCKECEKAFNQSSKLTEHKKIHTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IHTGEKPYKCKECGKAFKHSSTLTKHKIIHTGEKPYKCKECEKAFNQSSKLTEHKKIHTG
430 440 450 460 470 480
460 470 480 490 500 510
pF1KB7 EKPYECEKCGKAFNQSSNLTRHKKSHTEEKPYKCEECGKGFKWPSTLTIHKIIHTGEKPY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EKPYECEKCGKAFNQSSNLTRHKKSHTEEKPYKCEECGKGFKWPSTLTIHKIIHTGEKPY
490 500 510 520 530 540
520 530 540 550 560 570
pF1KB7 KCEECGKAFNQSSKLTKHKKIHTGEKPYTCEECGKAFNQSSNLTKHKRIHTGEKPYKCEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KCEECGKAFNQSSKLTKHKKIHTGEKPYTCEECGKAFNQSSNLTKHKRIHTGEKPYKCEE
550 560 570 580 590 600
580 590
pF1KB7 CDKAFKWSSVLTKHKIIHTGEKLQI
:::::::::::::::::::::::::
NP_001 CDKAFKWSSVLTKHKIIHTGEKLQI
610 620
>>XP_011526565 (OMIM: 603899) PREDICTED: zinc finger pro (640 aa)
initn: 3659 init1: 3659 opt: 3659 Z-score: 1907.7 bits: 363.1 E(85289): 1.6e-99
Smith-Waterman score: 3978; 92.0% identity (92.2% similar) in 627 aa overlap (14-595:14-640)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MGPLTFRDVAIEFSLKEWQCLDTAQRNLYRNVMLENYRNLVFLGITVSKPDLITCLEQGK
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MGPLTFRDVAIEFSLKEWQCLDTAQRNLYRNVMLENYRNLVFLGITVSKPDLITCLEQGK
10 20 30 40 50 60
70
pF1KB7 EAWSMKRHEIMVAKPTV-------------------------------------------
:::::::::::::::::
XP_011 EAWSMKRHEIMVAKPTVSHYVAQADLQLLVSSCLSKRMSYELLRKVYILMLLRSVLYASV
70 80 90 100 110 120
80 90 100 110 120 130
pF1KB7 --MCSHFARDLWPEQNIKDSFQKVTLKRYGKCRHENLPLIKGCESMDECKMHKGGCNGLN
::::::.:::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::
XP_011 RIMCSHFAQDLWPEQNIKDSFQKVTLKRYGKCRHENLPLRKGCESMDECKMHKGGCNGLN
130 140 150 160 170 180
140 150 160 170 180 190
pF1KB7 QCLTATQSKIFQCDKYVKVAHKFSNSNRHEIRHTKKKPFKCRKCGKSFRMISCLTEHSRI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::: :::::::::::
XP_011 QCLTATQSKIFQCDKYVKVAHKFSNSNRHEIRHTKKKPFKCTKCGKSFGMISCLTEHSRI
190 200 210 220 230 240
200 210 220 230 240 250
pF1KB7 HTRVNFYKCEECGKAFNWSSTLTKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSNLIKHKKIHTGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 HTRVNFYKCEECGKAFNWSSTLTKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSNLIKHKKIHTGE
250 260 270 280 290 300
260 270 280 290 300 310
pF1KB7 KPYKCEECGKTFNRSSTLTTHKIIHTGEKPYKCKECGKAFNRSSTLTTHRKIHTGEKPYK
:::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KPYKCEECGKTFNRFSTLTTHKIIHTGEKPYKCKECGKAFNRSSTLTTHRKIHTGEKPYK
310 320 330 340 350 360
320 330 340 350 360 370
pF1KB7 CEECGKAFKQSSNLTTHKIIHTGEKPYKCKKCGKAFNQSAHLTTHEVIHTGEKPYKCEKC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 CEECGKAFKQSSNLTTHKIIHTGEKPYKCKKCGKAFNQSAHLTTHEVIHTGEKPYKCEKC
370 380 390 400 410 420
380 390 400 410 420 430
pF1KB7 GKAFNHFSHLTTHKIIHTGEKPYKCKECGKAFKHSSTLTKHKIIHTGEKPYKCKECEKAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GKAFNHFSHLTTHKIIHTGEKPYKCKECGKAFKHSSTLTKHKIIHTGEKPYKCKECEKAF
430 440 450 460 470 480
440 450 460 470 480 490
pF1KB7 NQSSKLTEHKKIHTGEKPYECEKCGKAFNQSSNLTRHKKSHTEEKPYKCEECGKGFKWPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 NQSSKLTEHKKIHTGEKPYECEKCGKAFNQSSNLTRHKKSHTEEKPYKCEECGKGFKWPS
490 500 510 520 530 540
500 510 520 530 540 550
pF1KB7 TLTIHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSKLTKHKKIHTGEKPYTCEECGKAFNQSSNLTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TLTIHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSKLTKHKKIHTGEKPYTCEECGKAFNQSSNLTK
550 560 570 580 590 600
560 570 580 590
pF1KB7 HKRIHTGEKPYKCEECDKAFKWSSVLTKHKIIHTGEKLQI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 HKRIHTGEKPYKCEECDKAFKWSSVLTKHKIIHTGEKLQI
610 620 630 640
>>XP_011526566 (OMIM: 603899) PREDICTED: zinc finger pro (536 aa)
initn: 3653 init1: 3653 opt: 3655 Z-score: 1906.3 bits: 362.6 E(85289): 1.9e-99
Smith-Waterman score: 3655; 98.5% identity (98.9% similar) in 524 aa overlap (74-595:13-536)
50 60 70 80 90 100
pF1KB7 GITVSKPDLITCLEQGKEAWSMKRHEIMVAKPT--VMCSHFARDLWPEQNIKDSFQKVTL
::. :::::::.:::::::::::::::::
XP_011 MSLSAQPSSSFYKPVSEVMCSHFAQDLWPEQNIKDSFQKVTL
10 20 30 40
110 120 130 140 150 160
pF1KB7 KRYGKCRHENLPLIKGCESMDECKMHKGGCNGLNQCLTATQSKIFQCDKYVKVAHKFSNS
::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KRYGKCRHENLPLRKGCESMDECKMHKGGCNGLNQCLTATQSKIFQCDKYVKVAHKFSNS
50 60 70 80 90 100
170 180 190 200 210 220
pF1KB7 NRHEIRHTKKKPFKCRKCGKSFRMISCLTEHSRIHTRVNFYKCEECGKAFNWSSTLTKHK
::::::::::::::: :::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 NRHEIRHTKKKPFKCTKCGKSFGMISCLTEHSRIHTRVNFYKCEECGKAFNWSSTLTKHK
110 120 130 140 150 160
230 240 250 260 270 280
pF1KB7 RIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSNLIKHKKIHTGEKPYKCEECGKTFNRSSTLTTHKIIHT
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::
XP_011 RIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSNLIKHKKIHTGEKPYKCEECGKTFNRFSTLTTHKIIHT
170 180 190 200 210 220
290 300 310 320 330 340
pF1KB7 GEKPYKCKECGKAFNRSSTLTTHRKIHTGEKPYKCEECGKAFKQSSNLTTHKIIHTGEKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GEKPYKCKECGKAFNRSSTLTTHRKIHTGEKPYKCEECGKAFKQSSNLTTHKIIHTGEKP
230 240 250 260 270 280
350 360 370 380 390 400
pF1KB7 YKCKKCGKAFNQSAHLTTHEVIHTGEKPYKCEKCGKAFNHFSHLTTHKIIHTGEKPYKCK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 YKCKKCGKAFNQSAHLTTHEVIHTGEKPYKCEKCGKAFNHFSHLTTHKIIHTGEKPYKCK
290 300 310 320 330 340
410 420 430 440 450 460
pF1KB7 ECGKAFKHSSTLTKHKIIHTGEKPYKCKECEKAFNQSSKLTEHKKIHTGEKPYECEKCGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ECGKAFKHSSTLTKHKIIHTGEKPYKCKECEKAFNQSSKLTEHKKIHTGEKPYECEKCGK
350 360 370 380 390 400
470 480 490 500 510 520
pF1KB7 AFNQSSNLTRHKKSHTEEKPYKCEECGKGFKWPSTLTIHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 AFNQSSNLTRHKKSHTEEKPYKCEECGKGFKWPSTLTIHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQ
410 420 430 440 450 460
530 540 550 560 570 580
pF1KB7 SSKLTKHKKIHTGEKPYTCEECGKAFNQSSNLTKHKRIHTGEKPYKCEECDKAFKWSSVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SSKLTKHKKIHTGEKPYTCEECGKAFNQSSNLTKHKRIHTGEKPYKCEECDKAFKWSSVL
470 480 490 500 510 520
590
pF1KB7 TKHKIIHTGEKLQI
::::::::::::::
XP_011 TKHKIIHTGEKLQI
530
>>XP_016882723 (OMIM: 603899) PREDICTED: zinc finger pro (518 aa)
initn: 3648 init1: 3648 opt: 3648 Z-score: 1902.9 bits: 361.9 E(85289): 3e-99
Smith-Waterman score: 3648; 99.0% identity (99.2% similar) in 518 aa overlap (78-595:1-518)
50 60 70 80 90 100
pF1KB7 SKPDLITCLEQGKEAWSMKRHEIMVAKPTVMCSHFARDLWPEQNIKDSFQKVTLKRYGKC
::::::.:::::::::::::::::::::::
XP_016 MCSHFAQDLWPEQNIKDSFQKVTLKRYGKC
10 20 30
110 120 130 140 150 160
pF1KB7 RHENLPLIKGCESMDECKMHKGGCNGLNQCLTATQSKIFQCDKYVKVAHKFSNSNRHEIR
::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RHENLPLRKGCESMDECKMHKGGCNGLNQCLTATQSKIFQCDKYVKVAHKFSNSNRHEIR
40 50 60 70 80 90
170 180 190 200 210 220
pF1KB7 HTKKKPFKCRKCGKSFRMISCLTEHSRIHTRVNFYKCEECGKAFNWSSTLTKHKRIHTGE
::::::::: :::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 HTKKKPFKCTKCGKSFGMISCLTEHSRIHTRVNFYKCEECGKAFNWSSTLTKHKRIHTGE
100 110 120 130 140 150
230 240 250 260 270 280
pF1KB7 KPYKCEECGKAFNQSSNLIKHKKIHTGEKPYKCEECGKTFNRSSTLTTHKIIHTGEKPYK
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::
XP_016 KPYKCEECGKAFNQSSNLIKHKKIHTGEKPYKCEECGKTFNRFSTLTTHKIIHTGEKPYK
160 170 180 190 200 210
290 300 310 320 330 340
pF1KB7 CKECGKAFNRSSTLTTHRKIHTGEKPYKCEECGKAFKQSSNLTTHKIIHTGEKPYKCKKC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 CKECGKAFNRSSTLTTHRKIHTGEKPYKCEECGKAFKQSSNLTTHKIIHTGEKPYKCKKC
220 230 240 250 260 270
350 360 370 380 390 400
pF1KB7 GKAFNQSAHLTTHEVIHTGEKPYKCEKCGKAFNHFSHLTTHKIIHTGEKPYKCKECGKAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GKAFNQSAHLTTHEVIHTGEKPYKCEKCGKAFNHFSHLTTHKIIHTGEKPYKCKECGKAF
280 290 300 310 320 330
410 420 430 440 450 460
pF1KB7 KHSSTLTKHKIIHTGEKPYKCKECEKAFNQSSKLTEHKKIHTGEKPYECEKCGKAFNQSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KHSSTLTKHKIIHTGEKPYKCKECEKAFNQSSKLTEHKKIHTGEKPYECEKCGKAFNQSS
340 350 360 370 380 390
470 480 490 500 510 520
pF1KB7 NLTRHKKSHTEEKPYKCEECGKGFKWPSTLTIHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSKLTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 NLTRHKKSHTEEKPYKCEECGKGFKWPSTLTIHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSKLTK
400 410 420 430 440 450
530 540 550 560 570 580
pF1KB7 HKKIHTGEKPYTCEECGKAFNQSSNLTKHKRIHTGEKPYKCEECDKAFKWSSVLTKHKII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 HKKIHTGEKPYTCEECGKAFNQSSNLTKHKRIHTGEKPYKCEECDKAFKWSSVLTKHKII
460 470 480 490 500 510
590
pF1KB7 HTGEKLQI
::::::::
XP_016 HTGEKLQI
>>NP_112495 (OMIM: 603975) zinc finger protein 93 [Homo (620 aa)
initn: 2728 init1: 2728 opt: 3103 Z-score: 1622.9 bits: 310.4 E(85289): 1.2e-83
Smith-Waterman score: 3103; 74.8% identity (87.0% similar) in 592 aa overlap (1-592:1-591)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MGPLTFRDVAIEFSLKEWQCLDTAQRNLYRNVMLENYRNLVFLGITVSKPDLITCLEQGK
:::: ::::::::::.::.:::::::::::::::::: :::::::.:::::::. :::::
NP_112 MGPLQFRDVAIEFSLEEWHCLDTAQRNLYRNVMLENYSNLVFLGIVVSKPDLIAHLEQGK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 EAWSMKRHEIMVAKPTVMCSHFARDLWPEQNIKDSFQKVTLKRYGKCRHENLPLIKGCES
. .::::: :::.:.:.:::::.::::::::::::::: :.:: : : :: ::: :::
NP_112 KPLTMKRHE-MVANPSVICSHFAQDLWPEQNIKDSFQKVILRRYEKRGHGNLQLIKRCES
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 MDECKMHKGGCNGLNQCLTATQSKIFQCDKYVKVAHKFSNSNRHEIRHTKKKPFKCRKCG
.::::.: :: :::::: :.::::.:::::: :: :::::::::.::::.:::::: .::
NP_112 VDECKVHTGGYNGLNQCSTTTQSKVFQCDKYGKVFHKFSNSNRHNIRHTEKKPFKCIECG
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 KSFRMISCLTEHSRIHTRVNFYKCEECGKAFNWSSTLTKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFN
:.: ..: : :..::: . : ::::::::..::.:. :::::::::::::..: :::
NP_112 KAFNQFSTLITHKKIHTGEKPYICEECGKAFKYSSALNTHKRIHTGEKPYKCDKCDKAFI
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 QSSNLIKHKKIHTGEKPYKCEECGKTFNRSSTLTTHKIIHTGEKPYKCKECGKAFNRSST
::.: ::. ::::.::::::::::.::.::::: :: ::::::::::.:::::::.:::
NP_112 ASSTLSKHEIIHTGKKPYKCEECGKAFNQSSTLTKHKKIHTGEKPYKCEECGKAFNQSST
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 LTTHRKIHTGEKPYKCEECGKAFKQSSNLTTHKIIHTGEKPYKCKKCGKAFNQSAHLTTH
:: :.::::::::: ::::::::: : ::::: ::::::::::.:::::: :. :. :
NP_112 LTKHKKIHTGEKPYVCEECGKAFKYSRILTTHKRIHTGEKPYKCNKCGKAFIASSTLSRH
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 EVIHTGEKPYKCEKCGKAFNHFSHLTTHKIIHTGEKPYKCKECGKAFKHSSTLTKHKIIH
: :: :.: ::::.::::: : :: :: .:::::::::.:::::::.::::..:: :
NP_112 EFIHMGKKHYKCEECGKAFIWSSVLTRHKRVHTGEKPYKCEECGKAFKYSSTLSSHKRSH
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 TGEKPYKCKECEKAFNQSSKLTEHKKIHTGEKPYECEKCGKAFNQSSNLTRHKKSHTEEK
::::::::.:: ::: :: :..:. ::::.:::.::.:::::::::.::.::: :: ::
NP_112 TGEKPYKCEECGKAFVASSTLSKHEIIHTGKKPYKCEECGKAFNQSSSLTKHKKIHTGEK
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KB7 PYKCEECGKGFKWPSTLTIHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSKLTKHKKIHTGEKPYTC
:::::::::.:. :.:: :: ::::::::::::::::::::: : ::::::: :::: :
NP_112 PYKCEECGKAFNQSSSLTKHKKIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSTLIKHKKIHTREKPYKC
480 490 500 510 520 530
550 560 570 580 590
pF1KB7 EECGKAFNQSSNLTKHKRIHTGEKPYKCEECDKAFKWSSVLTKHKIIHTGEKLQI
:::::::. :..:: :: .:::::::.:.:: :::. :..:..:: ::.:::
NP_112 EECGKAFHLSTHLTTHKILHTGEKPYRCRECGKAFNHSATLSSHKKIHSGEKPYECDKCG
540 550 560 570 580 590
NP_112 KAFISPSSLSRHEIIHTGEKP
600 610 620
>>NP_001269288 (OMIM: 603989) zinc finger protein 107 is (852 aa)
initn: 2708 init1: 2708 opt: 3095 Z-score: 1617.6 bits: 309.8 E(85289): 2.3e-83
Smith-Waterman score: 3095; 75.2% identity (87.9% similar) in 593 aa overlap (1-593:1-592)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MGPLTFRDVAIEFSLKEWQCLDTAQRNLYRNVMLENYRNLVFLGITVSKPDLITCLEQGK
: ::::.::::::::.::::::::::.:::::.::::::::::::.:::: ::::::: :
NP_001 MEPLTFKDVAIEFSLEEWQCLDTAQRDLYRNVLLENYRNLVFLGIAVSKPYLITCLEQKK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 EAWSMKRHEIMVAKPTVMCSHFARDLWPEQNIKDSFQKVTLKRYGKCRHENLPLIKGCES
: :..:::: ::::: :: :::.:::::::::::::::::.:::::..::: : :::.
NP_001 EPWNIKRHE-MVAKPPVMSFHFAQDLWPEQNIKDSFQKVTLRRYGKCEYENLQLRKGCKH
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 MDECKMHKGGCNGLNQCLTATQSKIFQCDKYVKVAHKFSNSNRHEIRHTKKKPFKCRKCG
.::: :::: : .::::::: ::::::.::::: :::::::.. ::: .: :::..:.
NP_001 VDECTGHKGGHNTVNQCLTATPSKIFQCNKYVKVFDKFSNSNRYKRRHTGNKHFKCKECS
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 KSFRMISCLTEHSRIHTRVNFYKCEECGKAFNWSSTLTKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFN
::: ..: ::.: ::::::: :::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KSFCVLSQLTQHRRIHTRVNSYKCEECGKAFNWFSTLTKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFN
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 QSSNLIKHKKIHTGEKPYKCEECGKTFNRSSTLTTHKIIHTGEKPYKCKECGKAFNRSST
:::.: .:: ::: ::: :::::::.:...: :: :::::::::::: .::::.:..::
NP_001 QSSQLTRHKIIHTEEKPNKCEECGKAFKQASHLTIHKIIHTGEKPYKYEECGKVFSQSSH
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 LTTHRKIHTGEKPYKCEECGKAFKQSSNLTTHKIIHTGEKPYKCKKCGKAFNQSAHLTTH
:::.. .::::. :::.::::::. ::::.:: ::.::::::::.::.::: :..:. .
NP_001 LTTQKILHTGENLYKCKECGKAFNLFSNLTNHKRIHAGEKPYKCKECGRAFNISSNLNKQ
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 EVIHTGEKPYKCEKCGKAFNHFSHLTTHKIIHTGEKPYKCKECGKAFKHSSTLTKHKIIH
: :::: : :::.: ::::. .::.:: : ::::::.::::.:.. ::::.:::::
NP_001 EKIHTGGKLNKCEECDKAFNRSLKLTAHKKILMEEKPYKCEECGKVFNQFSTLTRHKIIH
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 TGEKPYKCKECEKAFNQSSKLTEHKKIHTGEKPYECEKCGKAFNQSSNLTRHKKSHTEEK
::::::::::: :::::::.:::::::::.:: :.::.::::::: ::: :.: .. ::
NP_001 TGEKPYKCKECGKAFNQSSNLTEHKKIHTAEKSYKCEECGKAFNQHSNLINHRKIYSGEK
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KB7 PYKCEECGKGFKWPSTLTIHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSKLTKHKKIHTGEKPYTC
:::::::::.:. :::: :: ::::::::::::: .::.:::.::.::::::::::: :
NP_001 PYKCEECGKAFNRSSTLTRHKKIHTGEKPYKCEECDRAFSQSSNLTEHKKIHTGEKPYKC
480 490 500 510 520 530
550 560 570 580 590
pF1KB7 EECGKAFNQSSNLTKHKRIHTGEKPYKCEECDKAFKWSSVLTKHKIIHTGEKLQI
::::::::. :.::::::::::::::::::: :::. : ::.:::.:: :::
NP_001 EECGKAFNRFSTLTKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNQSYQLTRHKIVHTKEKLNKCEEFG
540 550 560 570 580 590
NP_001 KAFKQSSHRTIHKIIHTGEKPYKCEEHGKVFNQSSNLTTQKIIHTGENLYKFEEHGKAFN
600 610 620 630 640 650
>--
initn: 1334 init1: 1334 opt: 1334 Z-score: 715.2 bits: 142.9 E(85289): 4.3e-33
Smith-Waterman score: 1334; 74.9% identity (88.6% similar) in 255 aa overlap (287-541:594-848)
260 270 280 290 300 310
pF1KB7 PYKCEECGKTFNRSSTLTTHKIIHTGEKPYKCKECGKAFNRSSTLTTHRKIHTGEKPYKC
::.: ::::..:: : :. ::::::::::
NP_001 PYKCEECGKAFNQSYQLTRHKIVHTKEKLNKCEEFGKAFKQSSHRTIHKIIHTGEKPYKC
570 580 590 600 610 620
320 330 340 350 360 370
pF1KB7 EECGKAFKQSSNLTTHKIIHTGEKPYKCKKCGKAFNQSAHLTTHEVIHTGEKPYKCEKCG
:: ::.:.:::::::.:::::::. :: .. ::::: ...:.:..:.:::::.:::.::
NP_001 EEHGKVFNQSSNLTTQKIIHTGENLYKFEEHGKAFNLFSNITNHKIIYTGEKPHKCEECG
630 640 650 660 670 680
380 390 400 410 420 430
pF1KB7 KAFNHFSHLTTHKIIHTGEKPYKCKECGKAFKHSSTLTKHKIIHTGEKPYKCKECEKAFN
::.:.::.:: :: ::::::::.: ::::::. ::::..:::::::::::::::: ::::
NP_001 KAYNRFSNLTIHKRIHTGEKPYQCAECGKAFNCSSTLNRHKIIHTGEKPYKCKECGKAFN
690 700 710 720 730 740
440 450 460 470 480 490
pF1KB7 QSSKLTEHKKIHTGEKPYECEKCGKAFNQSSNLTRHKKSHTEEKPYKCEECGKGFKWPST
:: :: :::::::::::.::.:::::::::::: ::: :: :::::::::::.:. :.
NP_001 LSSTLTAHKKIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSNLTTHKKIHTSEKPYKCEECGKSFNQFSS
750 760 770 780 790 800
500 510 520 530 540 550
pF1KB7 LTIHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSKLTKHKKIHTGEKPYTCEECGKAFNQSSNLTKH
:.:::::::::::::: . :.::: ::.:: ::::::::::: ::
NP_001 LNIHKIIHTGEKPYKCGDYGRAFNLSSNLTTHKKIHTGEKPYKCEYGKT
810 820 830 840 850
560 570 580 590
pF1KB7 KRIHTGEKPYKCEECDKAFKWSSVLTKHKIIHTGEKLQI
>>NP_003414 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 isofor (809 aa)
initn: 6568 init1: 3010 opt: 3021 Z-score: 1579.8 bits: 302.8 E(85289): 2.9e-81
Smith-Waterman score: 3021; 73.4% identity (85.4% similar) in 594 aa overlap (1-593:1-593)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MGPLTFRDVAIEFSLKEWQCLDTAQRNLYRNVMLENYRNLVFLGITVSKPDLITCLEQGK
:::::: :::::: :.:::::: ::.:::::::::::::::::::.:::::::::::: :
NP_003 MGPLTFMDVAIEFCLEEWQCLDIAQQNLYRNVMLENYRNLVFLGIAVSKPDLITCLEQEK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KB7 EAWS-MKRHEIMVAKPTVMCSHFARDLWPEQNIKDSFQKVTLKRYGKCRHENLPLIKGCE
: : :.::: ::::: ::::::..:.::::.::: :::.::.:: .:.:.:. : : .
NP_003 EPWEPMRRHE-MVAKPPVMCSHFTQDFWPEQHIKDPFQKATLRRYKNCEHKNVHLKKDHK
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 SMDECKMHKGGCNGLNQCLTATQSKIFQCDKYVKVAHKFSNSNRHEIRHTKKKPFKCRKC
:.::::.:.:: ::.:::: ::::::: :: ::. :::::::::.: ::.:: :::..:
NP_003 SVDECKVHRGGYNGFNQCLPATQSKIFLFDKCVKAFHKFSNSNRHKISHTEKKLFKCKEC
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 GKSFRMISCLTEHSRIHTRVNFYKCEECGKAFNWSSTLTKHKRIHTGEKPYKCEECGKAF
:::: :. :..:. ::::::: :::.:::::: : .::::::.:::::: ::::::.:
NP_003 GKSFCMLPHLAQHKIIHTRVNFCKCEKCGKAFNCPSIITKHKRINTGEKPYTCEECGKVF
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 NQSSNLIKHKKIHTGEKPYKCEECGKTFNRSSTLTTHKIIHTGEKPYKCKECGKAFNRSS
: :: : ::: .: : ::::::::.::.:: :::::::.:::: ::::::.::::.::
NP_003 NWSSRLTTHKKNYTRYKLYKCEECGKAFNKSSILTTHKIIRTGEKFYKCKECAKAFNQSS
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 TLTTHRKIHTGEKPYKCEECGKAFKQSSNLTTHKIIHTGEKPYKCKKCGKAFNQSAHLTT
.:: :.::: ::::::::::::::. :.:: :: :::::::: :..::::::: ..:::
NP_003 NLTEHKKIHPGEKPYKCEECGKAFNWPSTLTKHKRIHTGEKPYTCEECGKAFNQFSNLTT
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB7 HEVIHTGEKPYKCEKCGKAFNHFSHLTTHKIIHTGEKPYKCKECGKAFKHSSTLTKHKII
:. :::.:: ::: .::.::.. :.:: :: ::: .:::::.::::::: :: ::.::.
NP_003 HKRIHTAEKFYKCTECGEAFSRSSNLTKHKKIHTEKKPYKCEECGKAFKWSSKLTEHKLT
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB7 HTGEKPYKCKECEKAFNQSSKLTEHKKIHTGEKPYECEKCGKAFNQSSNLTRHKKSHTEE
:::::::::.:: :::: : ::.:..::::::::.:: ::::::: :::: ::. :: :
NP_003 HTGEKPYKCEECGKAFNWPSTLTKHNRIHTGEKPYKCEVCGKAFNQFSNLTTHKRIHTAE
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KB7 KPYKCEECGKGFKWPSTLTIHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSKLTKHKKIHTGEKPYT
::::::::::.:. :.:: :: :: .::::::::::::. :::::.:: :::::::
NP_003 KPYKCEECGKAFSRSSNLTKHKKIHIEKKPYKCEECGKAFKWSSKLTEHKITHTGEKPYK
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KB7 CEECGKAFNQSSNLTKHKRIHTGEKPYKCEECDKAFKWSSVLTKHKIIHTGEKLQI
:::::::::. : ::::::::::::::::::: ::: :: :: :: ::::::.
NP_003 CEECGKAFNHFSILTKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFTQSSNLTTHKKIHTGEKFYKCEEC
540 550 560 570 580 590
NP_003 GKAFTQSSNLTTHKKIHTGGKPYKCEECGKAFNQFSTLTKHKIIHTEEKPYKCEECGKAF
600 610 620 630 640 650
>--
initn: 3212 init1: 1106 opt: 1106 Z-score: 598.5 bits: 121.2 E(85289): 1.3e-26
Smith-Waterman score: 1106; 78.8% identity (89.9% similar) in 198 aa overlap (230-427:594-791)
200 210 220 230 240 250
pF1KB7 NFYKCEECGKAFNWSSTLTKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSNLIKHKKIHTGEKPYK
::::::::::.::::: ::::::: ::::
NP_003 KPYKCEECGKAFTQSSNLTTHKKIHTGEKFYKCEECGKAFTQSSNLTTHKKIHTGGKPYK
570 580 590 600 610 620
260 270 280 290 300 310
pF1KB7 CEECGKTFNRSSTLTTHKIIHTGEKPYKCKECGKAFNRSSTLTTHRKIHTGEKPYKCEEC
::::::.::. :::: :::::: ::::::.::::::. ::::: :. :::::::::::::
NP_003 CEECGKAFNQFSTLTKHKIIHTEEKPYKCEECGKAFKWSSTLTKHKIIHTGEKPYKCEEC
630 640 650 660 670 680
320 330 340 350 360 370
pF1KB7 GKAFKQSSNLTTHKIIHTGEKPYKCKKCGKAFNQSAHLTTHEVIHTGEKPYKCEKCGKAF
::::: ::.:.::::::::::::::.:::::::.:..: :. :::::.:::::.:::::
NP_003 GKAFKLSSTLSTHKIIHTGEKPYKCEKCGKAFNRSSNLIEHKKIHTGEQPYKCEECGKAF
690 700 710 720 730 740
380 390 400 410 420 430
pF1KB7 NHFSHLTTHKIIHTGEKPYKCKECGKAFKHSSTLTKHKIIHTGEKPYKCKECEKAFNQSS
:. :::.::: ::: :.:::::::::::.. :.:: :. :::::: ::
NP_003 NYSSHLNTHKRIHTKEQPYKCKECGKAFNQYSNLTTHNKIHTGEKLYKPEDVTVILTTPQ
750 760 770 780 790 800
440 450 460 470 480 490
pF1KB7 KLTEHKKIHTGEKPYECEKCGKAFNQSSNLTRHKKSHTEEKPYKCEECGKGFKWPSTLTI
NP_003 TFSNIK
>>NP_001243582 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 iso (818 aa)
initn: 6568 init1: 3010 opt: 3021 Z-score: 1579.8 bits: 302.8 E(85289): 3e-81
Smith-Waterman score: 3021; 73.4% identity (85.4% similar) in 594 aa overlap (1-593:10-602)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MGPLTFRDVAIEFSLKEWQCLDTAQRNLYRNVMLENYRNLVFLGITVSKPD
:::::: :::::: :.:::::: ::.:::::::::::::::::::.:::::
NP_001 MPGHPGSWEMGPLTFMDVAIEFCLEEWQCLDIAQQNLYRNVMLENYRNLVFLGIAVSKPD
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 LITCLEQGKEAWS-MKRHEIMVAKPTVMCSHFARDLWPEQNIKDSFQKVTLKRYGKCRHE
::::::: :: : :.::: ::::: ::::::..:.::::.::: :::.::.:: .:.:.
NP_001 LITCLEQEKEPWEPMRRHE-MVAKPPVMCSHFTQDFWPEQHIKDPFQKATLRRYKNCEHK
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 NLPLIKGCESMDECKMHKGGCNGLNQCLTATQSKIFQCDKYVKVAHKFSNSNRHEIRHTK
:. : : .:.::::.:.:: ::.:::: ::::::: :: ::. :::::::::.: ::.
NP_001 NVHLKKDHKSVDECKVHRGGYNGFNQCLPATQSKIFLFDKCVKAFHKFSNSNRHKISHTE
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 KKPFKCRKCGKSFRMISCLTEHSRIHTRVNFYKCEECGKAFNWSSTLTKHKRIHTGEKPY
:: :::..::::: :. :..:. ::::::: :::.:::::: : .::::::.::::::
NP_001 KKLFKCKECGKSFCMLPHLAQHKIIHTRVNFCKCEKCGKAFNCPSIITKHKRINTGEKPY
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 KCEECGKAFNQSSNLIKHKKIHTGEKPYKCEECGKTFNRSSTLTTHKIIHTGEKPYKCKE
::::::.:: :: : ::: .: : ::::::::.::.:: :::::::.:::: :::::
NP_001 TCEECGKVFNWSSRLTTHKKNYTRYKLYKCEECGKAFNKSSILTTHKIIRTGEKFYKCKE
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 CGKAFNRSSTLTTHRKIHTGEKPYKCEECGKAFKQSSNLTTHKIIHTGEKPYKCKKCGKA
:.::::.::.:: :.::: ::::::::::::::. :.:: :: :::::::: :..::::
NP_001 CAKAFNQSSNLTEHKKIHPGEKPYKCEECGKAFNWPSTLTKHKRIHTGEKPYTCEECGKA
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB7 FNQSAHLTTHEVIHTGEKPYKCEKCGKAFNHFSHLTTHKIIHTGEKPYKCKECGKAFKHS
::: ..::::. :::.:: ::: .::.::.. :.:: :: ::: .:::::.::::::: :
NP_001 FNQFSNLTTHKRIHTAEKFYKCTECGEAFSRSSNLTKHKKIHTEKKPYKCEECGKAFKWS
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB7 STLTKHKIIHTGEKPYKCKECEKAFNQSSKLTEHKKIHTGEKPYECEKCGKAFNQSSNLT
: ::.::. :::::::::.:: :::: : ::.:..::::::::.:: ::::::: ::::
NP_001 SKLTEHKLTHTGEKPYKCEECGKAFNWPSTLTKHNRIHTGEKPYKCEVCGKAFNQFSNLT
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KB7 RHKKSHTEEKPYKCEECGKGFKWPSTLTIHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSKLTKHKK
::. :: :::::::::::.:. :.:: :: :: .::::::::::::. :::::.::
NP_001 THKRIHTAEKPYKCEECGKAFSRSSNLTKHKKIHIEKKPYKCEECGKAFKWSSKLTEHKI
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KB7 IHTGEKPYTCEECGKAFNQSSNLTKHKRIHTGEKPYKCEECDKAFKWSSVLTKHKIIHTG
::::::: :::::::::. : ::::::::::::::::::: ::: :: :: :: ::::
NP_001 THTGEKPYKCEECGKAFNHFSILTKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFTQSSNLTTHKKIHTG
540 550 560 570 580 590
pF1KB7 EKLQI
::.
NP_001 EKFYKCEECGKAFTQSSNLTTHKKIHTGGKPYKCEECGKAFNQFSTLTKHKIIHTEEKPY
600 610 620 630 640 650
>--
initn: 3212 init1: 1106 opt: 1106 Z-score: 598.5 bits: 121.2 E(85289): 1.3e-26
Smith-Waterman score: 1106; 78.8% identity (89.9% similar) in 198 aa overlap (230-427:603-800)
200 210 220 230 240 250
pF1KB7 NFYKCEECGKAFNWSSTLTKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSNLIKHKKIHTGEKPYK
::::::::::.::::: ::::::: ::::
NP_001 KPYKCEECGKAFTQSSNLTTHKKIHTGEKFYKCEECGKAFTQSSNLTTHKKIHTGGKPYK
580 590 600 610 620 630
260 270 280 290 300 310
pF1KB7 CEECGKTFNRSSTLTTHKIIHTGEKPYKCKECGKAFNRSSTLTTHRKIHTGEKPYKCEEC
::::::.::. :::: :::::: ::::::.::::::. ::::: :. :::::::::::::
NP_001 CEECGKAFNQFSTLTKHKIIHTEEKPYKCEECGKAFKWSSTLTKHKIIHTGEKPYKCEEC
640 650 660 670 680 690
320 330 340 350 360 370
pF1KB7 GKAFKQSSNLTTHKIIHTGEKPYKCKKCGKAFNQSAHLTTHEVIHTGEKPYKCEKCGKAF
::::: ::.:.::::::::::::::.:::::::.:..: :. :::::.:::::.:::::
NP_001 GKAFKLSSTLSTHKIIHTGEKPYKCEKCGKAFNRSSNLIEHKKIHTGEQPYKCEECGKAF
700 710 720 730 740 750
380 390 400 410 420 430
pF1KB7 NHFSHLTTHKIIHTGEKPYKCKECGKAFKHSSTLTKHKIIHTGEKPYKCKECEKAFNQSS
:. :::.::: ::: :.:::::::::::.. :.:: :. :::::: ::
NP_001 NYSSHLNTHKRIHTKEQPYKCKECGKAFNQYSNLTTHNKIHTGEKLYKPEDVTVILTTPQ
760 770 780 790 800 810
440 450 460 470 480 490
pF1KB7 KLTEHKKIHTGEKPYECEKCGKAFNQSSNLTRHKKSHTEEKPYKCEECGKGFKWPSTLTI
NP_001 TFSNIK
595 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sat Nov 5 20:59:29 2016 done: Sat Nov 5 20:59:30 2016
Total Scan time: 6.360 Total Display time: 0.140
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]