FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB7814, 587 aa 1>>>pF1KB7814 587 - 587 aa - 587 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.5994+/-0.000941; mu= 8.4147+/- 0.056 mean_var=128.6369+/-26.189, 0's: 0 Z-trim(109.3): 28 B-trim: 117 in 1/49 Lambda= 0.113081 statistics sampled from 10797 (10807) to 10797 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.686), E-opt: 0.2 (0.332), width: 16 Scan time: 3.650 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS4343.1 EBF1 gene_id:1879|Hs108|chr5 ( 591) 3562 592.7 4.4e-169 CCDS31314.1 EBF3 gene_id:253738|Hs108|chr10 ( 551) 3471 577.8 1.2e-164 CCDS43726.1 EBF2 gene_id:64641|Hs108|chr8 ( 575) 3039 507.3 2.1e-143 CCDS46573.1 EBF4 gene_id:57593|Hs108|chr20 ( 598) 3036 506.8 3e-143 CCDS78081.1 EBF1 gene_id:1879|Hs108|chr5 ( 560) 2447 410.7 2.4e-114 >>CCDS4343.1 EBF1 gene_id:1879|Hs108|chr5 (591 aa) initn: 3545 init1: 1629 opt: 3562 Z-score: 3149.0 bits: 592.7 E(32554): 4.4e-169 Smith-Waterman score: 3562; 88.2% identity (96.6% similar) in 595 aa overlap (1-587:1-591) 10 20 30 40 50 60 pF1KB7 MFGIQENIPRGGTTMKEEPLGSGMNPVRSWMHTAGVVDANTAAQSGVGLARAHFEKQPPS ::::::.: :.:..::::::::::: ::.::. :::.::::::::::::::::::::::: CCDS43 MFGIQESIQRSGSSMKEEPLGSGMNAVRTWMQGAGVLDANTAAQSGVGLARAHFEKQPPS 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KB7 NLRKSNFFHFVLALYDRQGQPVEIERTAFVDFVEKEKEPNNEKTNNGIHYKLQLLYSNGV :::::::::::::::::::::::::::::: ::::::: :.:::::::::.::::::::. 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