FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7826, 604 aa
1>>>pF1KB7826 604 - 604 aa - 604 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.0604+/-0.00194; mu= 12.1917+/- 0.115
mean_var=267.9010+/-52.474, 0's: 0 Z-trim(104.0): 992 B-trim: 17 in 1/46
Lambda= 0.078359
statistics sampled from 6620 (7693) to 6620 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.553), E-opt: 0.2 (0.236), width: 16
Scan time: 3.250
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS4311.2 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5 ( 604) 4225 492.5 6.4e-139
CCDS54940.1 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5 ( 620) 4225 492.5 6.5e-139
CCDS54939.1 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5 ( 568) 3984 465.2 9.9e-131
CCDS35237.2 ZNF630 gene_id:57232|Hs108|chrX ( 657) 2482 295.5 1.4e-79
CCDS43933.1 ZNF81 gene_id:347344|Hs108|chrX ( 661) 2058 247.6 3.8e-65
CCDS75971.1 ZNF630 gene_id:57232|Hs108|chrX ( 533) 2034 244.8 2.2e-64
CCDS12848.1 ZNF432 gene_id:9668|Hs108|chr19 ( 652) 1948 235.2 2.1e-61
CCDS47538.1 ZNF12 gene_id:7559|Hs108|chr7 ( 697) 1936 233.9 5.5e-61
CCDS35235.1 ZNF182 gene_id:7569|Hs108|chrX ( 620) 1881 227.6 3.8e-59
CCDS35236.1 ZNF182 gene_id:7569|Hs108|chrX ( 639) 1881 227.6 3.9e-59
CCDS42559.1 ZNF527 gene_id:84503|Hs108|chr19 ( 609) 1844 223.4 6.9e-58
CCDS77297.1 ZNF546 gene_id:339327|Hs108|chr19 ( 810) 1845 223.7 7.5e-58
CCDS12548.1 ZNF546 gene_id:339327|Hs108|chr19 ( 836) 1845 223.7 7.6e-58
CCDS65110.1 ZFP37 gene_id:7539|Hs108|chr9 ( 645) 1843 223.3 7.7e-58
CCDS31940.1 ZNF84 gene_id:7637|Hs108|chr12 ( 738) 1822 221.0 4.3e-57
CCDS32977.1 ZNF85 gene_id:7639|Hs108|chr19 ( 595) 1819 220.5 4.8e-57
CCDS46172.1 ZNF813 gene_id:126017|Hs108|chr19 ( 617) 1808 219.3 1.2e-56
CCDS65109.1 ZFP37 gene_id:7539|Hs108|chr9 ( 631) 1799 218.3 2.4e-56
CCDS6787.1 ZFP37 gene_id:7539|Hs108|chr9 ( 630) 1798 218.2 2.6e-56
CCDS6437.1 ZNF16 gene_id:7564|Hs108|chr8 ( 682) 1782 216.4 9.4e-56
CCDS33091.1 ZNF528 gene_id:84436|Hs108|chr19 ( 628) 1775 215.6 1.6e-55
CCDS12499.1 ZNF585A gene_id:199704|Hs108|chr19 ( 714) 1773 215.4 2e-55
CCDS74353.1 ZNF585A gene_id:199704|Hs108|chr19 ( 769) 1773 215.5 2e-55
CCDS12500.1 ZNF585B gene_id:92285|Hs108|chr19 ( 769) 1772 215.4 2.2e-55
CCDS35067.1 ZNF484 gene_id:83744|Hs108|chr9 ( 816) 1760 214.1 5.8e-55
CCDS35066.1 ZNF484 gene_id:83744|Hs108|chr9 ( 852) 1760 214.1 6e-55
CCDS59136.1 ZNF484 gene_id:83744|Hs108|chr9 ( 854) 1760 214.1 6e-55
CCDS4440.1 ZFP2 gene_id:80108|Hs108|chr5 ( 461) 1743 211.8 1.6e-54
CCDS45012.1 ZNF268 gene_id:10795|Hs108|chr12 ( 947) 1738 211.7 3.6e-54
CCDS82341.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19 ( 527) 1722 209.5 9e-54
CCDS12503.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19 ( 686) 1722 209.7 1e-53
CCDS13134.1 ZNF133 gene_id:7692|Hs108|chr20 ( 653) 1721 209.5 1.1e-53
CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 616) 1719 209.2 1.2e-53
CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 658) 1719 209.3 1.3e-53
CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 670) 1719 209.3 1.3e-53
CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 682) 1719 209.3 1.3e-53
CCDS63234.1 ZNF133 gene_id:7692|Hs108|chr20 ( 654) 1718 209.2 1.4e-53
CCDS63233.1 ZNF133 gene_id:7692|Hs108|chr20 ( 657) 1718 209.2 1.4e-53
CCDS12955.1 ZNF530 gene_id:348327|Hs108|chr19 ( 599) 1714 208.7 1.8e-53
CCDS33122.1 ZNF470 gene_id:388566|Hs108|chr19 ( 717) 1715 208.9 1.9e-53
CCDS31938.1 ZNF605 gene_id:100289635|Hs108|chr12 ( 641) 1709 208.1 2.8e-53
CCDS53850.1 ZNF605 gene_id:100289635|Hs108|chr12 ( 672) 1709 208.2 2.9e-53
CCDS12498.1 ZNF420 gene_id:147923|Hs108|chr19 ( 688) 1709 208.2 2.9e-53
CCDS56092.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19 ( 580) 1704 207.5 3.9e-53
CCDS42558.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19 ( 644) 1704 207.6 4.1e-53
CCDS12947.1 ZNF71 gene_id:58491|Hs108|chr19 ( 489) 1696 206.5 6.6e-53
CCDS14279.1 ZNF41 gene_id:7592|Hs108|chrX ( 779) 1694 206.6 1e-52
CCDS74350.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1058) 1695 206.9 1.1e-52
CCDS59379.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1090) 1695 206.9 1.1e-52
CCDS12980.1 ZNF132 gene_id:7691|Hs108|chr19 ( 706) 1690 206.1 1.3e-52
>>CCDS4311.2 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5 (604 aa)
initn: 4225 init1: 4225 opt: 4225 Z-score: 2607.5 bits: 492.5 E(32554): 6.4e-139
Smith-Waterman score: 4225; 100.0% identity (100.0% similar) in 604 aa overlap (1-604:1-604)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MMKSQGLVSFKDVAVDFTQEEWQQLDPSQRTLYRDVMLENYSHLVSMGYPVSKPDVISKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MMKSQGLVSFKDVAVDFTQEEWQQLDPSQRTLYRDVMLENYSHLVSMGYPVSKPDVISKL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 EQGEEPWIIKGDISNWIYPDEYQADGRQDRKSNLHNSQSCILGTVSFHHKILKGVTRDGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 EQGEEPWIIKGDISNWIYPDEYQADGRQDRKSNLHNSQSCILGTVSFHHKILKGVTRDGS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 LCSILKVCQGDGQLQRFLENQDKLFRQVTFVNSKTVTEASGHKYNPLGKIFQECIETDIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LCSILKVCQGDGQLQRFLENQDKLFRQVTFVNSKTVTEASGHKYNPLGKIFQECIETDIS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 IQRFHKYDAFKKNLKPNIDLPSCYKSNSRKKPDQSFGGGKSSSQSEPNSNLEKIHNGVIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 IQRFHKYDAFKKNLKPNIDLPSCYKSNSRKKPDQSFGGGKSSSQSEPNSNLEKIHNGVIP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 FDDNQCGNVFRNTQSLIQYQNVETKEKSCVCVTCGKAFAKKSQLIVHQRIHTGKKPYDCG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 FDDNQCGNVFRNTQSLIQYQNVETKEKSCVCVTCGKAFAKKSQLIVHQRIHTGKKPYDCG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 ACGKAFSEKFHLVVHQRTHTGEKPYDCSECGKAFSQKSSLIIHQRVHTGEKPYECSECGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 ACGKAFSEKFHLVVHQRTHTGEKPYDCSECGKAFSQKSSLIIHQRVHTGEKPYECSECGK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 AFSQKSPLIIHQRIHTGEKPYECRECGKAFSQKSQLIIHHRAHTGEKPYECTECGKAFCE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 AFSQKSPLIIHQRIHTGEKPYECRECGKAFSQKSQLIIHHRAHTGEKPYECTECGKAFCE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 KSHLIIHKRIHTGEKPYKCAQCEEAFSRKTELITHQLVHTGEKPYECTECGKTFSRKSQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 KSHLIIHKRIHTGEKPYKCAQCEEAFSRKTELITHQLVHTGEKPYECTECGKTFSRKSQL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB7 IIHQRTHTGEKPYKCSECGKAFCQKSHLIGHQRIHTGEKPYICTECGKAFSQKSHLPGHQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 IIHQRTHTGEKPYKCSECGKAFCQKSHLIGHQRIHTGEKPYICTECGKAFSQKSHLPGHQ
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB7 RIHTGEKPYICAECGKAFSQKSDLVLHQRIHTGERPYQCAICGKAFIQKSQLTVHQRIHT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 RIHTGEKPYICAECGKAFSQKSDLVLHQRIHTGERPYQCAICGKAFIQKSQLTVHQRIHT
550 560 570 580 590 600
pF1KB7 VVKS
::::
CCDS43 VVKS
>>CCDS54940.1 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5 (620 aa)
initn: 4225 init1: 4225 opt: 4225 Z-score: 2607.4 bits: 492.5 E(32554): 6.5e-139
Smith-Waterman score: 4225; 100.0% identity (100.0% similar) in 604 aa overlap (1-604:17-620)
10 20 30 40
pF1KB7 MMKSQGLVSFKDVAVDFTQEEWQQLDPSQRTLYRDVMLENYSHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MVPAETSSSGLLEEQKMMKSQGLVSFKDVAVDFTQEEWQQLDPSQRTLYRDVMLENYSHL
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB7 VSMGYPVSKPDVISKLEQGEEPWIIKGDISNWIYPDEYQADGRQDRKSNLHNSQSCILGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 VSMGYPVSKPDVISKLEQGEEPWIIKGDISNWIYPDEYQADGRQDRKSNLHNSQSCILGT
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB7 VSFHHKILKGVTRDGSLCSILKVCQGDGQLQRFLENQDKLFRQVTFVNSKTVTEASGHKY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 VSFHHKILKGVTRDGSLCSILKVCQGDGQLQRFLENQDKLFRQVTFVNSKTVTEASGHKY
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KB7 NPLGKIFQECIETDISIQRFHKYDAFKKNLKPNIDLPSCYKSNSRKKPDQSFGGGKSSSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 NPLGKIFQECIETDISIQRFHKYDAFKKNLKPNIDLPSCYKSNSRKKPDQSFGGGKSSSQ
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KB7 SEPNSNLEKIHNGVIPFDDNQCGNVFRNTQSLIQYQNVETKEKSCVCVTCGKAFAKKSQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SEPNSNLEKIHNGVIPFDDNQCGNVFRNTQSLIQYQNVETKEKSCVCVTCGKAFAKKSQL
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KB7 IVHQRIHTGKKPYDCGACGKAFSEKFHLVVHQRTHTGEKPYDCSECGKAFSQKSSLIIHQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 IVHQRIHTGKKPYDCGACGKAFSEKFHLVVHQRTHTGEKPYDCSECGKAFSQKSSLIIHQ
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KB7 RVHTGEKPYECSECGKAFSQKSPLIIHQRIHTGEKPYECRECGKAFSQKSQLIIHHRAHT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 RVHTGEKPYECSECGKAFSQKSPLIIHQRIHTGEKPYECRECGKAFSQKSQLIIHHRAHT
370 380 390 400 410 420
410 420 430 440 450 460
pF1KB7 GEKPYECTECGKAFCEKSHLIIHKRIHTGEKPYKCAQCEEAFSRKTELITHQLVHTGEKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 GEKPYECTECGKAFCEKSHLIIHKRIHTGEKPYKCAQCEEAFSRKTELITHQLVHTGEKP
430 440 450 460 470 480
470 480 490 500 510 520
pF1KB7 YECTECGKTFSRKSQLIIHQRTHTGEKPYKCSECGKAFCQKSHLIGHQRIHTGEKPYICT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 YECTECGKTFSRKSQLIIHQRTHTGEKPYKCSECGKAFCQKSHLIGHQRIHTGEKPYICT
490 500 510 520 530 540
530 540 550 560 570 580
pF1KB7 ECGKAFSQKSHLPGHQRIHTGEKPYICAECGKAFSQKSDLVLHQRIHTGERPYQCAICGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 ECGKAFSQKSHLPGHQRIHTGEKPYICAECGKAFSQKSDLVLHQRIHTGERPYQCAICGK
550 560 570 580 590 600
590 600
pF1KB7 AFIQKSQLTVHQRIHTVVKS
::::::::::::::::::::
CCDS54 AFIQKSQLTVHQRIHTVVKS
610 620
>>CCDS54939.1 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5 (568 aa)
initn: 3984 init1: 3984 opt: 3984 Z-score: 2460.5 bits: 465.2 E(32554): 9.9e-131
Smith-Waterman score: 3984; 100.0% identity (100.0% similar) in 568 aa overlap (37-604:1-568)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 LVSFKDVAVDFTQEEWQQLDPSQRTLYRDVMLENYSHLVSMGYPVSKPDVISKLEQGEEP
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MLENYSHLVSMGYPVSKPDVISKLEQGEEP
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 WIIKGDISNWIYPDEYQADGRQDRKSNLHNSQSCILGTVSFHHKILKGVTRDGSLCSILK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 WIIKGDISNWIYPDEYQADGRQDRKSNLHNSQSCILGTVSFHHKILKGVTRDGSLCSILK
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 VCQGDGQLQRFLENQDKLFRQVTFVNSKTVTEASGHKYNPLGKIFQECIETDISIQRFHK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 VCQGDGQLQRFLENQDKLFRQVTFVNSKTVTEASGHKYNPLGKIFQECIETDISIQRFHK
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 YDAFKKNLKPNIDLPSCYKSNSRKKPDQSFGGGKSSSQSEPNSNLEKIHNGVIPFDDNQC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 YDAFKKNLKPNIDLPSCYKSNSRKKPDQSFGGGKSSSQSEPNSNLEKIHNGVIPFDDNQC
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 GNVFRNTQSLIQYQNVETKEKSCVCVTCGKAFAKKSQLIVHQRIHTGKKPYDCGACGKAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 GNVFRNTQSLIQYQNVETKEKSCVCVTCGKAFAKKSQLIVHQRIHTGKKPYDCGACGKAF
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 SEKFHLVVHQRTHTGEKPYDCSECGKAFSQKSSLIIHQRVHTGEKPYECSECGKAFSQKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SEKFHLVVHQRTHTGEKPYDCSECGKAFSQKSSLIIHQRVHTGEKPYECSECGKAFSQKS
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 PLIIHQRIHTGEKPYECRECGKAFSQKSQLIIHHRAHTGEKPYECTECGKAFCEKSHLII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 PLIIHQRIHTGEKPYECRECGKAFSQKSQLIIHHRAHTGEKPYECTECGKAFCEKSHLII
340 350 360 370 380 390
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 HKRIHTGEKPYKCAQCEEAFSRKTELITHQLVHTGEKPYECTECGKTFSRKSQLIIHQRT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 HKRIHTGEKPYKCAQCEEAFSRKTELITHQLVHTGEKPYECTECGKTFSRKSQLIIHQRT
400 410 420 430 440 450
490 500 510 520 530 540
pF1KB7 HTGEKPYKCSECGKAFCQKSHLIGHQRIHTGEKPYICTECGKAFSQKSHLPGHQRIHTGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 HTGEKPYKCSECGKAFCQKSHLIGHQRIHTGEKPYICTECGKAFSQKSHLPGHQRIHTGE
460 470 480 490 500 510
550 560 570 580 590 600
pF1KB7 KPYICAECGKAFSQKSDLVLHQRIHTGERPYQCAICGKAFIQKSQLTVHQRIHTVVKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 KPYICAECGKAFSQKSDLVLHQRIHTGERPYQCAICGKAFIQKSQLTVHQRIHTVVKS
520 530 540 550 560
>>CCDS35237.2 ZNF630 gene_id:57232|Hs108|chrX (657 aa)
initn: 1814 init1: 1814 opt: 2482 Z-score: 1542.2 bits: 295.5 E(32554): 1.4e-79
Smith-Waterman score: 2482; 58.2% identity (79.4% similar) in 607 aa overlap (1-604:1-598)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MMKSQGLVSFKDVAVDFTQEEWQQLDPSQRTLYRDVMLENYSHLVSMGYPVSKPDVISKL
:..:: :.:.::::::::::::::.:.:.::.::::::.:.::::.: ::::: ::
CCDS35 MIESQEPVTFEDVAVDFTQEEWQQLNPAQKTLHRDVMLETYNHLVSVGCSGIKPDVIFKL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
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:.:..::::....: ::::: : ..:..::. : : . :...::. . .:.:
CCDS35 EHGKDPWIIESELSRWIYPD---------RVKGLESSQQIISGELLFQREILERAPKDNS
70 80 90 100 110
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. :. :.:: .:. . :. .::.. ...:: :: ::::: ::::::.:::::::.:::
CCDS35 MEPYGDSQCEKVLSHKQAHVQYKKFQAREKPNVCSMCGKAFIKKSQLIIHQRIHTGEKPY
240 250 260 270 280 290
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:: : :::::: ::.:::: :::::::.:.. :.:::.:: . .::::::::::::: :
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: ::::::: ::::::.:: :::.:: :: ::: . :.:.::. .:::.::::::::::.
CCDS35 CPKAFSQKSHLIIHQRVHTREKPFECSECRKAFCEMSHLFIHQITHTGKKPYECTECGKT
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pF1KB7 FCEKSHLIIHKRIHTGEKPYKCAQCEEAFSRKTELITHQLVHTGEKPYECTECGKTFSRK
: .:..::::.: :::::::::..: ..: ....:: :: .::::::: ::.:::.::.:
CCDS35 FPRKTQLIIHQRTHTGEKPYKCGECGKTFCQQSHLIGHQRIHTGEKPYVCTDCGKAFSQK
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pF1KB7 SQLIIHQRTHTGEKPYKCSECGKAFCQKSHLIGHQRIHTGEKPYICTECGKAFSQKSHLP
:.: ::: ::::::: :.::::.: ::: :: ::::::::::: : ::::.::::: :
CCDS35 SHLTGHQRLHTGEKPYMCTECGKSFSQKSPLIIHQRIHTGEKPYQCGECGKTFSQKSLLI
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pF1KB7 GHQRIHTGEKPYICAECGKAFSQKSDLVLHQRIHTGERPYQCAICGKAFIQKSQLTVHQR
: :.::::::: :.:::.::: :: :.:::: ::::.::.:. ::::: :: : .::.
CCDS35 IHLRVHTGEKPYECTECGRAFSLKSHLILHQRGHTGEKPYECSECGKAFCGKSPLIIHQK
540 550 560 570 580 590
600
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: :.
CCDS35 THPREKTPECAESGMTFFWKSQMITYQRRHTGEKPSRCSDCGKAFCQHVYFTGHQNPYRK
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: .. ::: :: :::. :. :..: :...::. ..::.:.: .. ..:.
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.::. . . .: .: :: :.: :..: :.:: :::. :. :...: :. .:.
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CCDS43 SYSHHENTHTGVKFCERNQCGKVLSLKHSLSQNVKFPIGEKANTCTEFGKIFTQRSHFFA
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:.::: .::.. . : ..:..: : .. :.: :: : :..::::: :.: ::.:...
CCDS43 PQKIHTVEKPHELSKCVNVFTQKPLLSIYLRVHRDEKLYICTKCGKAFIQNSELIMHEKT
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:: ::::.:.::::.: : : :. :: ::::: .:: ::::.:: .: : ::.. ::::
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pF1KB7 CTECGKTFSRKSQLIIHQRTHTGEKPYKCSECGKAFCQKSHLIGHQRIHTGEKPYICTEC
:..:::.: :::: .:.: ::::::: :.:::::: ..:.: ::. ::::: :::.::
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CCDS43 SKKPHLKVHQRIHTGEKPYICAECGKAFTDRSNFNKHQTIHTGDKPYKCSDCGKGFTQKS
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CCDS75 YSAFGKMFNRCTDLAPLSQKFHKFDSCENSLKSNSDLLNYNRSYARKNPTKRFRCGRPPK
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CCDS75 YNASCSVPEKEGFIHTGMEPYGDSQCEKVLSHKQAHVQYKKFQAREKPNVCSMCGKAFIK
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.:::.::::::::::.: .:..::::.: :::::::::..: ..: ....:: :: .::
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: : ::::.::::: : : :.::::::: :.:::.::: :: :.:::: ::::.::.:.
CCDS75 YQCGECGKTFSQKSLLIIHLRVHTGEKPYECTECGRAFSLKSHLILHQRGHTGEKPYECS
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::::: :: : .::. : :.
CCDS75 ECGKAFCGKSPLIIHQKTHPREKTPECAESGMTFFWKSQMITYQRRHTGEKPSRCSDCGK
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:.::::: .. . . : :.. ..: . ::. : . .: . :. . . ...
CCDS12 ERGEEPWTMEDERHSRICPENNEVDDHLQDHLENQRMLKS--VEQYHEHNAFGNTASQTK
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pF1KB7 SLCSILKVCQGDGQLQRFLENQDKLFRQVTFVNSKTVTEASGH-KYNPLGKIFQECIETD
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CCDS12 SLC-LFR--ENHDTFELYIKT---LKSNLSLVNQNKSCEINNSTKFSGDGKSFLHG----
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pF1KB7 ISIQRFHKYDAFKKNLKPNIDLPSCYKSNSRKKPDQSF---GGGKSSSQSEPNSNLEKIH
. ..... :. . : : . : . .. ... ::. .. .. :..:
CCDS12 -NYEELYSAAKFSVSTKANSTKSQVSKHQRTHEIEKNHVCSECGKAFVKKSQLTDHERVH
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pF1KB7 NGVIPFDDNQCGNVFRNTQSLIQYQNVETKEKSCVCVTCGKAFAKKSQLIVHQRIHTGKK
.: :. . :..:: . : ..: .. .::: .: :::.:. ::.:: ::: :::.:
CCDS12 TGEKPYGCTLCAKVFSRKSRLNEHQRIHKREKSFICSECGKVFTMKSRLIEHQRTHTGEK
230 240 250 260 270 280
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pF1KB7 PYDCGACGKAFSEKFHLVVHQRTHTGEKPYDCSECGKAFSQKSSLIIHQRVHTGEKPYEC
:: :. :::.: : .:.::::.::::: : ::::::.:. :: ::::::.::::::: :
CCDS12 PYICNECGKGFPGKRNLIVHQRNHTGEKSYICSECGKGFTGKSMLIIHQRTHTGEKPYIC
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:::::.:. : .::::: ::::::: : ::::.:..::..: :.:.::::::: :.:::
CCDS12 SECGKGFTTKHYVIIHQRNHTGEKPYICNECGKGFTMKSRMIEHQRTHTGEKPYICSECG
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pF1KB7 KAFCEKSHLIIHKRIHTGEKPYKCAQCEEAFSRKTELITHQLVHTGEKPYECTECGKTFS
:.: .::.::.:.: :: :: : :..: ..:. :. :: :: .::::::: :.:::: :
CCDS12 KGFPRKSNLIVHQRNHTVEKSYLCSECGKGFTVKSMLIIHQRTHTGEKPYTCSECGKGFP
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pF1KB7 RKSQLIIHQRTHTGEKPYKCSECGKAFCQKSHLIGHQRIHTGEKPYICTECGKAFSQKSH
::.::.:::::::::::.::::::.: .: :. ::: :::::::::.::::.:. ::.
CCDS12 LKSRLIVHQRTHTGEKPYRCSECGKGFIVNSGLMLHQRTHTGEKPYICNECGKGFAFKSN
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pF1KB7 LPGHQRIHTGEKPYICAECGKAFSQKSDLVLHQRIHTGERPYQCAICGKAFIQKSQLTVH
: ::: ::::::..:.::::.:..: :..::.::: :. :. ::..: ....:..:
CCDS12 LVVHQRTHTGEKPFMCSECGKGFTMKRYLIVHQQIHTEEKSCICSECGRGFAKETELALH
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pF1KB7 QRIHTVVKS
...::
CCDS12 KQVHTGEKPYGCNECGKGFTMKSRLIVHQRTHTGEKPFVCSECRKAFSSKRNLIVHQRTH
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pF1KB7 MMKSQGLVSFKDVAVDFTQEEWQQLDPSQRTLYRDVMLENYSHLVSMGYPVSKPDVISKL
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CCDS47 MNKSLGPVSFKDVAVDFTQEEWQQLDPEQKITYRDVMLENYSNLVSVGYHIIKPDVISKL
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pF1KB7 EQGEEPWIIKGDISNWIYPDE-YQADG---RQDRKSNLHNSQSCILGTVSFHHKILKGVT
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CCDS47 EQGEEPWIVEGEFLLQSYPDEVWQTDDLIERIQEEENKPSRQTVFIETLIEERGNVPGKT
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pF1KB7 RD--------------GSLCSILKVC--------QGDGQLQRFLENQ-DKLFRQVTFVN-
: .:::. . : ..::. :. .. . ... ..
CCDS47 FDVETNPVPSRKIAYKNSLCDSCEKCLTSVSEYISSDGSYARMKADECSGCGKSLLHIKL
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pF1KB7 SKTVTEASGHKYNPLGKIF---QECIETDISI-QRFHKYDAFKKNLKPNIDLPSCYKSNS
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CCDS47 EKTHPGDQAYEFNQNGEPYTLNEESLYQKIRILEKPFEYIECQKAFQKD----TVFVNHM
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pF1KB7 RKKPDQSFGGGKSSSQSEPNSNLEKIHNGVIPFDDNQCGNVFRNTQSLIQYQNVETKEKS
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CCDS47 EEKPYKWNGSEIAFLQMSDLTVHQTSHMEMKPYECSECGKSFCKKSKFIIHQRTHTGEKP
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pF1KB7 CVCVTCGKAFAKKSQLIVHQRIHTGKKPYDCGACGKAFSEKFHLVVHQRTHTGEKPYDCS
: :::.: .:. : :::: :::.:::.:. ::: : .:.::. :::::.:::::.::
CCDS47 YECNQCGKSFCQKGTLTVHQRTHTGEKPYECNECGKNFYQKLHLIQHQRTHSGEKPYECS
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CCDS47 YCGKSFCQKTHLTQHQRTHSGERPYVCHDCGKTFSQKSALNDHQKIHTGVKLYKCSECGK
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pF1KB7 AFSQKSQLIIHHRAHTGEKPYECTECGKAFCEKSHLIIHKRIHTGEKPYKCAQCEEAFSR
: .:: : : :.:::::::::.:::: : . :.: .: : :.:::::.: .: ..:
CCDS47 CFCRKSTLTTHLRTHTGEKPYECNECGKFFSRLSYLTVHYRTHSGEKPYECNECGKTFYL
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pF1KB7 KTELITHQLVHTGEKPYECTECGKTFSRKSQLIIHQRTHTGEKPYKCSECGKAFCQKSHL
.. :. :: ::::::::::.:::: ::. : : ::.:::.: :::.::::::.: :.: :
CCDS47 NSALMRHQRVHTGEKPYECNECGKLFSQLSYLTIHHRTHSGVKPYECSECGKTFYQNSAL
480 490 500 510 520 530
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pF1KB7 IGHQRIHTGEKPYICTECGKAFSQKSHLPGHQRIHTGEKPYICAECGKAFSQKSDLVLHQ
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CCDS47 CRHRRIHKGEKPYECYICGKFFSQMSYLTIHHRIHSGEKPYECSECGKTFCQNSALNRHQ
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pF1KB7 RIHTGERPYQCAICGKAFIQKSQLTVHQRIHTVVKS
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CCDS47 RTHTGEKAYECYECGKCFSQMSYLTIHHRIHSGEKPFECNECGKAFSRMSYLTVHYRTHS
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]