FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB7828, 605 aa 1>>>pF1KB7828 605 - 605 aa - 605 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.8521+/-0.000953; mu= 8.1701+/- 0.058 mean_var=149.4474+/-29.591, 0's: 0 Z-trim(110.9): 22 B-trim: 188 in 1/51 Lambda= 0.104913 statistics sampled from 11949 (11960) to 11949 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.717), E-opt: 0.2 (0.367), width: 16 Scan time: 3.450 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS42782.1 NFE2L2 gene_id:4780|Hs108|chr2 ( 605) 3982 614.6 1.1e-175 CCDS46457.1 NFE2L2 gene_id:4780|Hs108|chr2 ( 589) 3864 596.7 2.7e-170 CCDS46458.1 NFE2L2 gene_id:4780|Hs108|chr2 ( 582) 3800 587.1 2.2e-167 CCDS11524.1 NFE2L1 gene_id:4779|Hs108|chr17 ( 772) 859 142.0 2.7e-33 CCDS82151.1 NFE2L1 gene_id:4779|Hs108|chr17 ( 761) 778 129.7 1.3e-29 CCDS82150.1 NFE2L1 gene_id:4779|Hs108|chr17 ( 742) 668 113.1 1.3e-24 CCDS8876.1 NFE2 gene_id:4778|Hs108|chr12 ( 373) 637 108.2 2e-23 CCDS5396.1 NFE2L3 gene_id:9603|Hs108|chr7 ( 694) 604 103.4 1e-21 >>CCDS42782.1 NFE2L2 gene_id:4780|Hs108|chr2 (605 aa) initn: 3982 init1: 3982 opt: 3982 Z-score: 3267.3 bits: 614.6 E(32554): 1.1e-175 Smith-Waterman score: 3982; 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CCDS11 VFDYSHRQKEQDVEKELR-DGGEQDTWAGEGAEALARNLLVDGETGESFPAQVPSGEDQT 200 210 220 230 240 100 110 120 130 140 150 pF1KB7 ETSGSANYSQVAHIPKSDALYFDDCMQLLAQTFPFVDDNEVSSATFQSLVPDIPGHIESP :: ...:..:: : :: .. : : ..:.. .:.. : : CCDS11 ------------------ALSLEECLRLLEATCPFGENAEFP-ADISSITEAVPSESEPP 250 260 270 280 290 160 170 180 190 200 210 pF1KB7 VFIATNQAQSPETSVAQVAPVDLDGMQQDIEQVWEELLSIPELQCLNIENDKLVETTMVP .. :. :: . .. .: :: :: :..:.:: :.: ... : . : . CCDS11 AL--QNNLLSPLLTGTE-SPFDL-------EQQWQDLMSIMEMQAMEV-NTSASEILYSA 300 310 320 330 220 230 240 250 260 pF1KB7 SPEAKLTEVDNYHFYSSIP-----SMEKE-VGNCSPHFLNAFEDSFSSILSTEDPNQLTV : :. :: . . : :... .:.:: :: : :. . . . : . 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CCDS11 SSFSEEGAVGYSSDSETLDLEEAEGAVGYQPEYSKFCRMSYQDPAQLSCLPYLEHVGHN- 520 530 540 550 560 570 420 430 440 450 460 470 pF1KB7 HVHDAQCENTPEKELPVSPGHRKTPFTKDKHSSRLEAHLTRDELRAKALHIPFPVEKIIN :... .:: . .: .:.:... :. ...::: ::.:..::: .:::: CCDS11 HTYNMAPSALDSADLPPPSALKKG--SKEKQADFLDKQMSRDEHRARAMKIPFTNDKIIN 580 590 600 610 620 630 480 490 500 510 520 530 pF1KB7 LPVVDFNEMMSKEQFNEAQLALIRDIRRRGKNKVAAQNCRKRKLENIVELEQDLDHLKDE ::: .:::..:: :..::::.::::::::::::.::::::::::..:..::.:.. :. . CCDS11 LPVEEFNELLSKYQLSEAQLSLIRDIRRRGKNKMAAQNCRKRKLDTILNLERDVEDLQRD 640 650 660 670 680 690 540 550 560 570 580 590 pF1KB7 KEKLLKEKGENDKSLHLLKKQLSTLYLEVFSMLRDEDGKPYSPSEYSLQQTRDGNVFLVP : .::.:: : .::. .:.....:: :::. ::::.:.:::::.:.:: . ::.:.:.: CCDS11 KARLLREKVEFLRSLRQMKQKVQSLYQEVFGRLRDENGRPYSPSQYALQYAGDGSVLLIP 700 710 720 730 740 750 600 pF1KB7 KSKKPDVKKN .. CCDS11 RTMADQQARRQERKPKDRRK 760 770 >>CCDS82151.1 NFE2L1 gene_id:4779|Hs108|chr17 (761 aa) initn: 862 init1: 582 opt: 778 Z-score: 644.9 bits: 129.7 E(32554): 1.3e-29 Smith-Waterman score: 967; 35.0% identity (61.3% similar) in 615 aa overlap (23-597:167-743) 10 20 30 40 50 pF1KB7 MMDLELPPPGLPSQQDMDLIDILWRQDIDLGVSREVFDFSQRRKEYELEKQK : ..:::::..:::::.:.:.:: ..::. CCDS82 DNGVRESETEQGFGEDLEDLGAVAPPVSGDLTKEDIDLGAGREVFDYSHRQKEQDVEKEL 140 150 160 170 180 190 60 70 80 90 100 110 pF1KB7 KLEKERQEQLQKEQEKAFFAQLQLDEETGEFLPIQ-PAQHIQSETSGSANYSQVAHIPKS . : :. : .:. .: .: :::: .: : :. . :. CCDS82 RDGGE-QDTWAGEGAEALARNLLVDGETGESFPAQVPSGEDQT----------------- 200 210 220 230 120 130 140 150 160 170 pF1KB7 DALYFDDCMQLLAQTFPFVDDNEVSSATFQSLVPDIPGHIESPVFIATNQAQSPETSVAQ :: ...:..:: : :: .. : : ..:.. .:.. : :.. :. :: . .. CCDS82 -ALSLEECLRLLEATCPFGENAEFP-ADISSITEAVPSESEPPAL--QNNLLSPLLTGTE 240 250 260 270 280 290 180 190 200 210 220 230 pF1KB7 VAPVDLDGMQQDIEQVWEELLSIPELQCLNIENDKLVETTMVPSPEAKLTEVDNYHFYSS .: :: :: :..:.:: :.: ... : . : . : :. :: . . CCDS82 -SPFDL-------EQQWQDLMSIMEMQAMEV-NTSASEILYSAPPGDPLS--TNYSLAPN 300 310 320 330 340 240 250 260 270 280 pF1KB7 IP-----SMEKE-VGNCSPHFLNAFEDSFSSILSTEDPNQLTVNSLNSDATVNTDFGDEF : :... .:.:: :: : :. . . . : . :: ...:. ::. CCDS82 TPINQNVSLHQASLGGCSQDFL-LFSPEVESLPVASSSTLLPLAPSNS-TSLNSTFGSTN 350 360 370 380 390 400 290 300 310 320 330 pF1KB7 YSAFIAEPSISNSM-----PS-PATLSHSLSELLNGPIDVSDLSLCKAFNQNHPESTAEF .... :..... : : :. :.: . :.. ::.. ..:: . . : CCDS82 LTGLFFPPQLNGTANDTAGPELPDPLGGLLDEAMLDEISLMDLAIEEGFNPVQASQLEEE 410 420 430 440 450 460 340 350 360 370 pF1KB7 NDSDSGISLNTS--PS-VASPEHSVESSSYGDT-----------------LLGLS-DSEV :::::.::..: :: ..: : : ::: ... .: : :::. CCDS82 FDSDSGLSLDSSHSPSSLSSSEGSSSSSSSSSSSSSSASSSASSSFSEEGAVGYSSDSET 470 480 490 500 510 520 380 390 400 410 420 430 pF1KB7 EELDSAPGSV--KQNGPKTPVHSSGDMVQ----PLSPSQGQSTHVHDAQCENTPEKELPV .:. : :.: . . : : : .: : :.. :... .:: CCDS82 LDLEEAEGAVGYQPEYSKFCRMSYQDPAQLSCLPYLEHVGHN-HTYNMAPSALDSADLPP 530 540 550 560 570 580 440 450 460 470 480 490 pF1KB7 SPGHRKTPFTKDKHSSRLEAHLTRDELRAKALHIPFPVEKIINLPVVDFNEMMSKEQFNE . .: .:.:... :. ...::: ::.:..::: .::::::: .:::..:: :..: CCDS82 PSALKKG--SKEKQADFLDKQMSRDEHRARAMKIPFTNDKIINLPVEEFNELLSKYQLSE 590 600 610 620 630 500 510 520 530 540 550 pF1KB7 AQLALIRDIRRRGKNKVAAQNCRKRKLENIVELEQDLDHLKDEKEKLLKEKGENDKSLHL :::.::::::::::::.::::::::::..:..::.:.. :. .: .::.:: : .::. CCDS82 AQLSLIRDIRRRGKNKMAAQNCRKRKLDTILNLERDVEDLQRDKARLLREKVEFLRSLRQ 640 650 660 670 680 690 560 570 580 590 600 pF1KB7 LKKQLSTLYLEVFSMLRDEDGKPYSPSEYSLQQTRDGNVFLVPKSKKPDVKKN .:.....:: :::. ::::.:.:::::.:.:: . ::.:.:.:.. CCDS82 MKQKVQSLYQEVFGRLRDENGRPYSPSQYALQYAGDGSVLLIPRTMADQQARRQERKPKD 700 710 720 730 740 750 CCDS82 RRK 760 >>CCDS82150.1 NFE2L1 gene_id:4779|Hs108|chr17 (742 aa) initn: 871 init1: 582 opt: 668 Z-score: 555.1 bits: 113.1 E(32554): 1.3e-24 Smith-Waterman score: 944; 34.4% identity (59.1% similar) in 631 aa overlap (7-597:161-724) 10 20 30 pF1KB7 MMDLELPP-PGLPSQQDMDLIDILWRQDIDLGVSRE :: : ...:.::::::::::::::..:: CCDS82 QDVTGPDNGVRESETEQGFGEDLEDLGAVAPPVSGDLTKEDIDLIDILWRQDIDLGAGRE 140 150 160 170 180 190 40 50 60 70 80 90 pF1KB7 VFDFSQRRKEYELEKQKKLEKERQEQLQKEQEKAFFAQLQLDEETGEFLPIQPAQHIQSE :::.:.:.:: ..::. . . .:. : .:. .: .: :::: .: : CCDS82 VFDYSHRQKEQDVEKELR-DGGEQDTWAGEGAEALARNLLVDGETGESFPAQ-------- 200 210 220 230 240 100 110 120 130 140 150 pF1KB7 TSGSANYSQVAHIPKSDALYFDDCMQLLAQTFPFVDDNEVSSATFQSLVPDIPGHIESPV :: : ..:.. .:.. : :. CCDS82 -------------------------------FP---------ADISSITEAVPSESEPPA 250 260 160 170 180 190 200 210 pF1KB7 FIATNQAQSPETSVAQVAPVDLDGMQQDIEQVWEELLSIPELQCLNIENDKLVETTMVPS . :. :: . .. .: :: :: :..:.:: :.: ... : . : . CCDS82 L--QNNLLSPLLTGTE-SPFDL-------EQQWQDLMSIMEMQAMEV-NTSASEILYSAP 270 280 290 300 310 220 230 240 250 260 pF1KB7 PEAKLTEVDNYHFYSSIP-----SMEKE-VGNCSPHFLNAFEDSFSSILSTEDPNQLTVN : :. :: . . : :... .:.:: :: : :. . . . : . CCDS82 PGDPLST--NYSLAPNTPINQNVSLHQASLGGCSQDFL-LFSPEVESLPVASSSTLLPLA 320 330 340 350 360 270 280 290 300 310 320 pF1KB7 SLNSDATVNTDFGDEFYSAFIAEPSISNSM-----PS-PATLSHSLSELLNGPIDVSDLS :: ...:. ::. .... :..... : : :. :.: . :.. ::. CCDS82 PSNS-TSLNSTFGSTNLTGLFFPPQLNGTANDTAGPELPDPLGGLLDEAMLDEISLMDLA 370 380 390 400 410 420 330 340 350 360 pF1KB7 LCKAFNQNHPESTAEFNDSDSGISLNTS--PS-VASPEHSVESSSYGDT----------- . ..:: . . : :::::.::..: :: ..: : : ::: ... CCDS82 IEEGFNPVQASQLEEEFDSDSGLSLDSSHSPSSLSSSEGSSSSSSSSSSSSSSASSSASS 430 440 450 460 470 480 370 380 390 400 410 pF1KB7 ------LLGLS-DSEVEELDSAPGSV--KQNGPKTPVHSSGDMVQ----PLSPSQGQSTH .: : :::. .:. : :.: . . : : : .: : :.. : CCDS82 SFSEEGAVGYSSDSETLDLEEAEGAVGYQPEYSKFCRMSYQDPAQLSCLPYLEHVGHN-H 490 500 510 520 530 540 420 430 440 450 460 470 pF1KB7 VHDAQCENTPEKELPVSPGHRKTPFTKDKHSSRLEAHLTRDELRAKALHIPFPVEKIINL ... .:: . .: .:.:... :. ...::: ::.:..::: .::::: CCDS82 TYNMAPSALDSADLPPPSALKKG--SKEKQADFLDKQMSRDEHRARAMKIPFTNDKIINL 550 560 570 580 590 600 480 490 500 510 520 530 pF1KB7 PVVDFNEMMSKEQFNEAQLALIRDIRRRGKNKVAAQNCRKRKLENIVELEQDLDHLKDEK :: .:::..:: :..::::.::::::::::::.::::::::::..:..::.:.. :. .: CCDS82 PVEEFNELLSKYQLSEAQLSLIRDIRRRGKNKMAAQNCRKRKLDTILNLERDVEDLQRDK 610 620 630 640 650 660 540 550 560 570 580 590 pF1KB7 EKLLKEKGENDKSLHLLKKQLSTLYLEVFSMLRDEDGKPYSPSEYSLQQTRDGNVFLVPK .::.:: : .::. .:.....:: :::. ::::.:.:::::.:.:: . ::.:.:.:. CCDS82 ARLLREKVEFLRSLRQMKQKVQSLYQEVFGRLRDENGRPYSPSQYALQYAGDGSVLLIPR 670 680 690 700 710 720 600 pF1KB7 SKKPDVKKN . CCDS82 TMADQQARRQERKPKDRRK 730 740 >>CCDS8876.1 NFE2 gene_id:4778|Hs108|chr12 (373 aa) initn: 673 init1: 616 opt: 637 Z-score: 534.2 bits: 108.2 E(32554): 2e-23 Smith-Waterman score: 682; 35.2% identity (57.7% similar) in 437 aa overlap (163-599:7-368) 140 150 160 170 180 190 pF1KB7 NEVSSATFQSLVPDIPGHIESPVFIATNQAQSPETSVAQVAPVDLDGMQQDIEQVWEELL :. .. : :.. .: ..: .:.:.. 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CCDS88 SQLALVRDIRRRGKNKVAAQNCRKRKLETIVQLERELERLTNERERLLRARGEADRTLEV 270 280 290 300 310 320 560 570 580 590 600 pF1KB7 LKKQLSTLYLEVFSMLRDEDGKPYSPSEYSLQQTRDGNVFLVPKSKKPDVKKN ...::. :: ..:. ::::.:. ::: ::.:::. ::..::::.. : CCDS88 MRQQLTELYRDIFQHLRDESGNSYSPEEYALQQAADGTIFLVPRGTKMEATD 330 340 350 360 370 >>CCDS5396.1 NFE2L3 gene_id:9603|Hs108|chr7 (694 aa) initn: 591 init1: 549 opt: 604 Z-score: 503.2 bits: 103.4 E(32554): 1e-21 Smith-Waterman score: 604; 32.7% identity (64.3% similar) in 431 aa overlap (184-596:262-677) 160 170 180 190 200 210 pF1KB7 PVFIATNQAQSPETSVAQVAPVDLDGMQQDIEQVWEELLSIPELQCLNIENDKLVETTMV .:.... : : :: ..:. .: . . CCDS53 KIAEKPDWEAEKTTESRNERHLNGTDTSFSLEDLFQLLSSQPEN---SLEGISLGDIPLP 240 250 260 270 280 220 230 240 250 260 pF1KB7 PSPEAKLTEVDNYH--FYSSIP---SMEKEVGNCSPHFLNAFE-DSFSSILSTEDPN-QL : .. .:: : ..: .... . : :. :.:. : . ....: :: CCDS53 GSISDGMNSSAHYHVNFSQAISQDVNLHEAILLC-PN--NTFRRDPTARTSQSQEPFLQL 290 300 310 320 330 340 270 280 290 300 310 320 pF1KB7 TVNSLNSDATVNTDFGDEFYSAFIAEPSISNSMPSPATLSHSLSEL-LNGPIDVSDLSLC . .. : . :. : .. ..:.. : ..: : . : . : .: .: ... .:: CCDS53 NSHTTNPEQTLP---GTNL-TGFLS-P-VDNHMRN-LTSQDLLYDLDINIFDEINLMSLA 350 360 370 380 390 330 340 350 360 370 pF1KB7 KAFNQNHPESTAEFN--DSDSGISLNTSPSVASPEHSVESSSYGDT-LLGL-SDSEV--- : . . . :. :::::.::..: . .: .: : : : .: .: : CCDS53 TEDNFDPIDVSQLFDEPDSDSGLSLDSSHNNTSVIKSNSSHSVCDEGAIGYCTDHESSSH 400 410 420 430 440 450 380 390 400 410 420 430 pF1KB7 EELDSAPGSVKQNGPKTPVH---SSGDMVQPLSPSQGQSTHVHDAQCENTPEKELPVSPG ..:..: :. . :. : :..:. :. .. .:.. : ..::. : CCDS53 HDLEGAVGGYYPE-PSKLCHLDQSDSDFHGDLTFQHVFHNHTYHLQ-PTAPESTSEPFPW 460 470 480 490 500 510 440 450 460 470 480 490 pF1KB7 HRKTPFTKDKHSSRLEAHLTRDELRAKALHIPFPVEKIINLPVVDFNEMMSKEQFNEAQL :. .... . .:.::: ::::::::: :..:...:: .:: :.:. ... :. CCDS53 PGKSQKIRSRYLEDTDRNLSRDEQRAKALHIPFSVDEIVGMPVDSFNSMLSRYYLTDLQV 520 530 540 550 560 570 500 510 520 530 540 550 pF1KB7 ALIRDIRRRGKNKVAAQNCRKRKLENIVELEQDLDHLKDEKEKLLKEKGENDKSLHLLKK .:::::::::::::::::::::::. :..::.:. .:. .:: : .:... .:.....:. CCDS53 SLIRDIRRRGKNKVAAQNCRKRKLDIILNLEDDVCNLQAKKETLKREQAQCNKAINIMKQ 580 590 600 610 620 630 560 570 580 590 600 pF1KB7 QLSTLYLEVFSMLRDEDGKPYSPSEYSLQQTRDGNVFLVPKSKKPDVKKN .: :: ..:: :::..:.: .:..:.:: :.::....::: CCDS53 KLHDLYHDIFSRLRDDQGRPVNPNHYALQCTHDGSILIVPKELVASGHKKETQKGKRK 640 650 660 670 680 690 605 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Fri Nov 4 22:29:58 2016 done: Fri Nov 4 22:29:58 2016 Total Scan time: 3.450 Total Display time: 0.110 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]