FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7828, 605 aa
1>>>pF1KB7828 605 - 605 aa - 605 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.8521+/-0.000953; mu= 8.1701+/- 0.058
mean_var=149.4474+/-29.591, 0's: 0 Z-trim(110.9): 22 B-trim: 188 in 1/51
Lambda= 0.104913
statistics sampled from 11949 (11960) to 11949 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.717), E-opt: 0.2 (0.367), width: 16
Scan time: 3.450
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS42782.1 NFE2L2 gene_id:4780|Hs108|chr2 ( 605) 3982 614.6 1.1e-175
CCDS46457.1 NFE2L2 gene_id:4780|Hs108|chr2 ( 589) 3864 596.7 2.7e-170
CCDS46458.1 NFE2L2 gene_id:4780|Hs108|chr2 ( 582) 3800 587.1 2.2e-167
CCDS11524.1 NFE2L1 gene_id:4779|Hs108|chr17 ( 772) 859 142.0 2.7e-33
CCDS82151.1 NFE2L1 gene_id:4779|Hs108|chr17 ( 761) 778 129.7 1.3e-29
CCDS82150.1 NFE2L1 gene_id:4779|Hs108|chr17 ( 742) 668 113.1 1.3e-24
CCDS8876.1 NFE2 gene_id:4778|Hs108|chr12 ( 373) 637 108.2 2e-23
CCDS5396.1 NFE2L3 gene_id:9603|Hs108|chr7 ( 694) 604 103.4 1e-21
>>CCDS42782.1 NFE2L2 gene_id:4780|Hs108|chr2 (605 aa)
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Smith-Waterman score: 3982; 100.0% identity (100.0% similar) in 605 aa overlap (1-605:1-605)
10 20 30 40 50 60
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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10 20 30 40 50 60
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 QLQKEQEKAFFAQLQLDEETGEFLPIQPAQHIQSETSGSANYSQVAHIPKSDALYFDDCM
70 80 90 100 110 120
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 QLLAQTFPFVDDNEVSSATFQSLVPDIPGHIESPVFIATNQAQSPETSVAQVAPVDLDGM
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 QQDIEQVWEELLSIPELQCLNIENDKLVETTMVPSPEAKLTEVDNYHFYSSIPSMEKEVG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 NCSPHFLNAFEDSFSSILSTEDPNQLTVNSLNSDATVNTDFGDEFYSAFIAEPSISNSMP
250 260 270 280 290 300
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 SPATLSHSLSELLNGPIDVSDLSLCKAFNQNHPESTAEFNDSDSGISLNTSPSVASPEHS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 VESSSYGDTLLGLSDSEVEELDSAPGSVKQNGPKTPVHSSGDMVQPLSPSQGQSTHVHDA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 QCENTPEKELPVSPGHRKTPFTKDKHSSRLEAHLTRDELRAKALHIPFPVEKIINLPVVD
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 FNEMMSKEQFNEAQLALIRDIRRRGKNKVAAQNCRKRKLENIVELEQDLDHLKDEKEKLL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB7 KEKGENDKSLHLLKKQLSTLYLEVFSMLRDEDGKPYSPSEYSLQQTRDGNVFLVPKSKKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 KEKGENDKSLHLLKKQLSTLYLEVFSMLRDEDGKPYSPSEYSLQQTRDGNVFLVPKSKKP
550 560 570 580 590 600
pF1KB7 DVKKN
:::::
CCDS42 DVKKN
>>CCDS46457.1 NFE2L2 gene_id:4780|Hs108|chr2 (589 aa)
initn: 3864 init1: 3864 opt: 3864 Z-score: 3170.9 bits: 596.7 E(32554): 2.7e-170
Smith-Waterman score: 3864; 100.0% identity (100.0% similar) in 589 aa overlap (17-605:1-589)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MMDLELPPPGLPSQQDMDLIDILWRQDIDLGVSREVFDFSQRRKEYELEKQKKLEKERQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MDLIDILWRQDIDLGVSREVFDFSQRRKEYELEKQKKLEKERQE
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 QLQKEQEKAFFAQLQLDEETGEFLPIQPAQHIQSETSGSANYSQVAHIPKSDALYFDDCM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 QLQKEQEKAFFAQLQLDEETGEFLPIQPAQHIQSETSGSANYSQVAHIPKSDALYFDDCM
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 QLLAQTFPFVDDNEVSSATFQSLVPDIPGHIESPVFIATNQAQSPETSVAQVAPVDLDGM
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 QQDIEQVWEELLSIPELQCLNIENDKLVETTMVPSPEAKLTEVDNYHFYSSIPSMEKEVG
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250 260 270 280 290 300
pF1KB7 NCSPHFLNAFEDSFSSILSTEDPNQLTVNSLNSDATVNTDFGDEFYSAFIAEPSISNSMP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 NCSPHFLNAFEDSFSSILSTEDPNQLTVNSLNSDATVNTDFGDEFYSAFIAEPSISNSMP
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 SPATLSHSLSELLNGPIDVSDLSLCKAFNQNHPESTAEFNDSDSGISLNTSPSVASPEHS
290 300 310 320 330 340
370 380 390 400 410 420
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 VESSSYGDTLLGLSDSEVEELDSAPGSVKQNGPKTPVHSSGDMVQPLSPSQGQSTHVHDA
350 360 370 380 390 400
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 QCENTPEKELPVSPGHRKTPFTKDKHSSRLEAHLTRDELRAKALHIPFPVEKIINLPVVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 QCENTPEKELPVSPGHRKTPFTKDKHSSRLEAHLTRDELRAKALHIPFPVEKIINLPVVD
410 420 430 440 450 460
490 500 510 520 530 540
pF1KB7 FNEMMSKEQFNEAQLALIRDIRRRGKNKVAAQNCRKRKLENIVELEQDLDHLKDEKEKLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 FNEMMSKEQFNEAQLALIRDIRRRGKNKVAAQNCRKRKLENIVELEQDLDHLKDEKEKLL
470 480 490 500 510 520
550 560 570 580 590 600
pF1KB7 KEKGENDKSLHLLKKQLSTLYLEVFSMLRDEDGKPYSPSEYSLQQTRDGNVFLVPKSKKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 KEKGENDKSLHLLKKQLSTLYLEVFSMLRDEDGKPYSPSEYSLQQTRDGNVFLVPKSKKP
530 540 550 560 570 580
pF1KB7 DVKKN
:::::
CCDS46 DVKKN
>>CCDS46458.1 NFE2L2 gene_id:4780|Hs108|chr2 (582 aa)
initn: 3043 init1: 3043 opt: 3800 Z-score: 3118.7 bits: 587.1 E(32554): 2.2e-167
Smith-Waterman score: 3800; 98.8% identity (98.8% similar) in 589 aa overlap (17-605:1-582)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MMDLELPPPGLPSQQDMDLIDILWRQDIDLGVSREVFDFSQRRKEYELEKQKKLEKERQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MDLIDILWRQDIDLGVSREVFDFSQRRKEYELEKQKKLEKERQE
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 QLQKEQEKAFFAQLQLDEETGEFLPIQPAQHIQSETSGSANYSQVAHIPKSDALYFDDCM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 QLQKEQEKAFFAQLQLDEETGEFLPIQPAQHIQSETSGSANYSQVAHIPKSDALYFDDCM
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 QLLAQTFPFVDDNEVSSATFQSLVPDIPGHIESPVFIATNQAQSPETSVAQVAPVDLDGM
:::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 QLLAQTFPFVDDNE-------SLVPDIPGHIESPVFIATNQAQSPETSVAQVAPVDLDGM
110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 QQDIEQVWEELLSIPELQCLNIENDKLVETTMVPSPEAKLTEVDNYHFYSSIPSMEKEVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 QQDIEQVWEELLSIPELQCLNIENDKLVETTMVPSPEAKLTEVDNYHFYSSIPSMEKEVG
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 NCSPHFLNAFEDSFSSILSTEDPNQLTVNSLNSDATVNTDFGDEFYSAFIAEPSISNSMP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 NCSPHFLNAFEDSFSSILSTEDPNQLTVNSLNSDATVNTDFGDEFYSAFIAEPSISNSMP
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 SPATLSHSLSELLNGPIDVSDLSLCKAFNQNHPESTAEFNDSDSGISLNTSPSVASPEHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 SPATLSHSLSELLNGPIDVSDLSLCKAFNQNHPESTAEFNDSDSGISLNTSPSVASPEHS
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 VESSSYGDTLLGLSDSEVEELDSAPGSVKQNGPKTPVHSSGDMVQPLSPSQGQSTHVHDA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 VESSSYGDTLLGLSDSEVEELDSAPGSVKQNGPKTPVHSSGDMVQPLSPSQGQSTHVHDA
340 350 360 370 380 390
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 QCENTPEKELPVSPGHRKTPFTKDKHSSRLEAHLTRDELRAKALHIPFPVEKIINLPVVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 QCENTPEKELPVSPGHRKTPFTKDKHSSRLEAHLTRDELRAKALHIPFPVEKIINLPVVD
400 410 420 430 440 450
490 500 510 520 530 540
pF1KB7 FNEMMSKEQFNEAQLALIRDIRRRGKNKVAAQNCRKRKLENIVELEQDLDHLKDEKEKLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 FNEMMSKEQFNEAQLALIRDIRRRGKNKVAAQNCRKRKLENIVELEQDLDHLKDEKEKLL
460 470 480 490 500 510
550 560 570 580 590 600
pF1KB7 KEKGENDKSLHLLKKQLSTLYLEVFSMLRDEDGKPYSPSEYSLQQTRDGNVFLVPKSKKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 KEKGENDKSLHLLKKQLSTLYLEVFSMLRDEDGKPYSPSEYSLQQTRDGNVFLVPKSKKP
520 530 540 550 560 570
pF1KB7 DVKKN
:::::
CCDS46 DVKKN
580
>>CCDS11524.1 NFE2L1 gene_id:4779|Hs108|chr17 (772 aa)
initn: 943 init1: 582 opt: 859 Z-score: 711.1 bits: 142.0 E(32554): 2.7e-33
Smith-Waterman score: 1048; 35.8% identity (62.0% similar) in 632 aa overlap (7-597:161-754)
10 20 30
pF1KB7 MMDLELPP-PGLPSQQDMDLIDILWRQDIDLGVSRE
:: : ...:.::::::::::::::..::
CCDS11 QDVTGPDNGVRESETEQGFGEDLEDLGAVAPPVSGDLTKEDIDLIDILWRQDIDLGAGRE
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40 50 60 70 80 90
pF1KB7 VFDFSQRRKEYELEKQKKLEKERQEQLQKEQEKAFFAQLQLDEETGEFLPIQ-PAQHIQS
:::.:.:.:: ..::. . . .:. : .:. .: .: :::: .: : :. . :.
CCDS11 VFDYSHRQKEQDVEKELR-DGGEQDTWAGEGAEALARNLLVDGETGESFPAQVPSGEDQT
200 210 220 230 240
100 110 120 130 140 150
pF1KB7 ETSGSANYSQVAHIPKSDALYFDDCMQLLAQTFPFVDDNEVSSATFQSLVPDIPGHIESP
:: ...:..:: : :: .. : : ..:.. .:.. : :
CCDS11 ------------------ALSLEECLRLLEATCPFGENAEFP-ADISSITEAVPSESEPP
250 260 270 280 290
160 170 180 190 200 210
pF1KB7 VFIATNQAQSPETSVAQVAPVDLDGMQQDIEQVWEELLSIPELQCLNIENDKLVETTMVP
.. :. :: . .. .: :: :: :..:.:: :.: ... : . : .
CCDS11 AL--QNNLLSPLLTGTE-SPFDL-------EQQWQDLMSIMEMQAMEV-NTSASEILYSA
300 310 320 330
220 230 240 250 260
pF1KB7 SPEAKLTEVDNYHFYSSIP-----SMEKE-VGNCSPHFLNAFEDSFSSILSTEDPNQLTV
: :. :: . . : :... .:.:: :: : :. . . . : .
CCDS11 PPGDPLST--NYSLAPNTPINQNVSLHQASLGGCSQDFL-LFSPEVESLPVASSSTLLPL
340 350 360 370 380 390
270 280 290 300 310 320
pF1KB7 NSLNSDATVNTDFGDEFYSAFIAEPSISNSM-----PS-PATLSHSLSELLNGPIDVSDL
:: ...:. ::. .... :..... : : :. :.: . :.. ::
CCDS11 APSNS-TSLNSTFGSTNLTGLFFPPQLNGTANDTAGPELPDPLGGLLDEAMLDEISLMDL
400 410 420 430 440 450
330 340 350 360
pF1KB7 SLCKAFNQNHPESTAEFNDSDSGISLNTS--PS-VASPEHSVESSSYGDT----------
.. ..:: . . : :::::.::..: :: ..: : : ::: ...
CCDS11 AIEEGFNPVQASQLEEEFDSDSGLSLDSSHSPSSLSSSEGSSSSSSSSSSSSSSASSSAS
460 470 480 490 500 510
370 380 390 400 410
pF1KB7 -------LLGLS-DSEVEELDSAPGSV--KQNGPKTPVHSSGDMVQ----PLSPSQGQST
.: : :::. .:. : :.: . . : : : .: : :..
CCDS11 SSFSEEGAVGYSSDSETLDLEEAEGAVGYQPEYSKFCRMSYQDPAQLSCLPYLEHVGHN-
520 530 540 550 560 570
420 430 440 450 460 470
pF1KB7 HVHDAQCENTPEKELPVSPGHRKTPFTKDKHSSRLEAHLTRDELRAKALHIPFPVEKIIN
:... .:: . .: .:.:... :. ...::: ::.:..::: .::::
CCDS11 HTYNMAPSALDSADLPPPSALKKG--SKEKQADFLDKQMSRDEHRARAMKIPFTNDKIIN
580 590 600 610 620 630
480 490 500 510 520 530
pF1KB7 LPVVDFNEMMSKEQFNEAQLALIRDIRRRGKNKVAAQNCRKRKLENIVELEQDLDHLKDE
::: .:::..:: :..::::.::::::::::::.::::::::::..:..::.:.. :. .
CCDS11 LPVEEFNELLSKYQLSEAQLSLIRDIRRRGKNKMAAQNCRKRKLDTILNLERDVEDLQRD
640 650 660 670 680 690
540 550 560 570 580 590
pF1KB7 KEKLLKEKGENDKSLHLLKKQLSTLYLEVFSMLRDEDGKPYSPSEYSLQQTRDGNVFLVP
: .::.:: : .::. .:.....:: :::. ::::.:.:::::.:.:: . ::.:.:.:
CCDS11 KARLLREKVEFLRSLRQMKQKVQSLYQEVFGRLRDENGRPYSPSQYALQYAGDGSVLLIP
700 710 720 730 740 750
600
pF1KB7 KSKKPDVKKN
..
CCDS11 RTMADQQARRQERKPKDRRK
760 770
>>CCDS82151.1 NFE2L1 gene_id:4779|Hs108|chr17 (761 aa)
initn: 862 init1: 582 opt: 778 Z-score: 644.9 bits: 129.7 E(32554): 1.3e-29
Smith-Waterman score: 967; 35.0% identity (61.3% similar) in 615 aa overlap (23-597:167-743)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MMDLELPPPGLPSQQDMDLIDILWRQDIDLGVSREVFDFSQRRKEYELEKQK
: ..:::::..:::::.:.:.:: ..::.
CCDS82 DNGVRESETEQGFGEDLEDLGAVAPPVSGDLTKEDIDLGAGREVFDYSHRQKEQDVEKEL
140 150 160 170 180 190
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 KLEKERQEQLQKEQEKAFFAQLQLDEETGEFLPIQ-PAQHIQSETSGSANYSQVAHIPKS
. : :. : .:. .: .: :::: .: : :. . :.
CCDS82 RDGGE-QDTWAGEGAEALARNLLVDGETGESFPAQVPSGEDQT-----------------
200 210 220 230
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 DALYFDDCMQLLAQTFPFVDDNEVSSATFQSLVPDIPGHIESPVFIATNQAQSPETSVAQ
:: ...:..:: : :: .. : : ..:.. .:.. : :.. :. :: . ..
CCDS82 -ALSLEECLRLLEATCPFGENAEFP-ADISSITEAVPSESEPPAL--QNNLLSPLLTGTE
240 250 260 270 280 290
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 VAPVDLDGMQQDIEQVWEELLSIPELQCLNIENDKLVETTMVPSPEAKLTEVDNYHFYSS
.: :: :: :..:.:: :.: ... : . : . : :. :: . .
CCDS82 -SPFDL-------EQQWQDLMSIMEMQAMEV-NTSASEILYSAPPGDPLS--TNYSLAPN
300 310 320 330 340
240 250 260 270 280
pF1KB7 IP-----SMEKE-VGNCSPHFLNAFEDSFSSILSTEDPNQLTVNSLNSDATVNTDFGDEF
: :... .:.:: :: : :. . . . : . :: ...:. ::.
CCDS82 TPINQNVSLHQASLGGCSQDFL-LFSPEVESLPVASSSTLLPLAPSNS-TSLNSTFGSTN
350 360 370 380 390 400
290 300 310 320 330
pF1KB7 YSAFIAEPSISNSM-----PS-PATLSHSLSELLNGPIDVSDLSLCKAFNQNHPESTAEF
.... :..... : : :. :.: . :.. ::.. ..:: . . :
CCDS82 LTGLFFPPQLNGTANDTAGPELPDPLGGLLDEAMLDEISLMDLAIEEGFNPVQASQLEEE
410 420 430 440 450 460
340 350 360 370
pF1KB7 NDSDSGISLNTS--PS-VASPEHSVESSSYGDT-----------------LLGLS-DSEV
:::::.::..: :: ..: : : ::: ... .: : :::.
CCDS82 FDSDSGLSLDSSHSPSSLSSSEGSSSSSSSSSSSSSSASSSASSSFSEEGAVGYSSDSET
470 480 490 500 510 520
380 390 400 410 420 430
pF1KB7 EELDSAPGSV--KQNGPKTPVHSSGDMVQ----PLSPSQGQSTHVHDAQCENTPEKELPV
.:. : :.: . . : : : .: : :.. :... .::
CCDS82 LDLEEAEGAVGYQPEYSKFCRMSYQDPAQLSCLPYLEHVGHN-HTYNMAPSALDSADLPP
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CCDS82 RRK
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.
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