Result of FASTA (ccds) for
pF1KB7833
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7833, 538 aa
1>>>pF1KB7833 538 - 538 aa - 538 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.2115+/-0.00213; mu= 10.5705+/- 0.127
mean_var=298.8071+/-54.371, 0's: 0 Z-trim(104.4): 975 B-trim: 0 in 0/49
Lambda= 0.074196
statistics sampled from 6837 (7904) to 6837 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.559), E-opt: 0.2 (0.243), width: 16
Scan time: 2.880
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS12211.1 ZNF559 gene_id:84527|Hs108|chr19 ( 538) 3802 422.0 8.7e-118
CCDS62531.1 ZNF559 gene_id:84527|Hs108|chr19 ( 602) 3802 422.1 9.2e-118
CCDS46031.1 ZNF98 gene_id:148198|Hs108|chr19 ( 572) 1456 170.9 3.5e-42
CCDS42505.1 ZNF564 gene_id:163050|Hs108|chr19 ( 553) 1441 169.3 1.1e-41
CCDS54238.1 ZNF737 gene_id:100129842|Hs108|chr19 ( 536) 1436 168.7 1.5e-41
CCDS32440.1 ZNF267 gene_id:10308|Hs108|chr16 ( 743) 1438 169.2 1.5e-41
CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 616) 1436 168.8 1.6e-41
CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 658) 1436 168.9 1.7e-41
CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 670) 1436 168.9 1.7e-41
CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 682) 1436 168.9 1.7e-41
CCDS75608.1 ZNF92 gene_id:168374|Hs108|chr7 ( 554) 1426 167.7 3.2e-41
CCDS12498.1 ZNF420 gene_id:147923|Hs108|chr19 ( 688) 1406 165.7 1.6e-40
CCDS42495.1 ZNF699 gene_id:374879|Hs108|chr19 ( 642) 1400 165.0 2.4e-40
CCDS42535.1 ZNF626 gene_id:199777|Hs108|chr19 ( 528) 1381 162.8 8.8e-40
CCDS33002.1 ZFP14 gene_id:57677|Hs108|chr19 ( 533) 1378 162.5 1.1e-39
CCDS46045.1 ZNF30 gene_id:90075|Hs108|chr19 ( 623) 1377 162.5 1.3e-39
CCDS46044.1 ZNF30 gene_id:90075|Hs108|chr19 ( 624) 1377 162.5 1.3e-39
CCDS82341.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19 ( 527) 1374 162.1 1.5e-39
CCDS32973.1 ZNF93 gene_id:81931|Hs108|chr19 ( 620) 1374 162.2 1.6e-39
CCDS12503.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19 ( 686) 1374 162.3 1.7e-39
CCDS5528.2 ZNF273 gene_id:10793|Hs108|chr7 ( 569) 1367 161.4 2.6e-39
CCDS43590.1 ZNF479 gene_id:90827|Hs108|chr7 ( 524) 1365 161.1 2.9e-39
CCDS74322.1 ZNF91 gene_id:7644|Hs108|chr19 (1159) 1370 162.2 3e-39
CCDS42541.1 ZNF91 gene_id:7644|Hs108|chr19 (1191) 1370 162.2 3.1e-39
CCDS32979.1 ZNF431 gene_id:170959|Hs108|chr19 ( 576) 1363 161.0 3.5e-39
CCDS56092.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19 ( 580) 1361 160.8 4.1e-39
CCDS42558.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19 ( 644) 1361 160.8 4.3e-39
CCDS12273.1 ZNF791 gene_id:163049|Hs108|chr19 ( 576) 1357 160.3 5.5e-39
CCDS74350.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1058) 1359 161.0 6.5e-39
CCDS59379.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1090) 1359 161.0 6.6e-39
CCDS12497.1 ZNF345 gene_id:25850|Hs108|chr19 ( 488) 1353 159.8 6.7e-39
CCDS55282.1 ZNF250 gene_id:58500|Hs108|chr8 ( 555) 1352 159.8 7.8e-39
CCDS34972.1 ZNF250 gene_id:58500|Hs108|chr8 ( 560) 1352 159.8 7.8e-39
CCDS34644.1 ZNF680 gene_id:340252|Hs108|chr7 ( 530) 1349 159.4 9.5e-39
CCDS62707.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 665) 1349 159.6 1.1e-38
CCDS62708.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 667) 1349 159.6 1.1e-38
CCDS12639.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 692) 1349 159.6 1.1e-38
CCDS42537.1 ZNF429 gene_id:353088|Hs108|chr19 ( 674) 1348 159.5 1.2e-38
CCDS45550.1 ZNF778 gene_id:197320|Hs108|chr16 ( 729) 1346 159.3 1.4e-38
CCDS32980.1 ZNF708 gene_id:7562|Hs108|chr19 ( 563) 1344 158.9 1.4e-38
CCDS73928.1 ZNF778 gene_id:197320|Hs108|chr16 ( 757) 1346 159.3 1.4e-38
CCDS10900.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16 ( 643) 1344 159.0 1.5e-38
CCDS42496.1 ZNF846 gene_id:162993|Hs108|chr19 ( 533) 1340 158.5 1.9e-38
CCDS59367.1 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 ( 803) 1341 158.8 2.1e-38
CCDS12413.2 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 ( 809) 1341 158.8 2.2e-38
CCDS74321.1 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 ( 818) 1341 158.9 2.2e-38
CCDS32977.1 ZNF85 gene_id:7639|Hs108|chr19 ( 595) 1337 158.2 2.5e-38
CCDS73089.1 ZNF33A gene_id:7581|Hs108|chr10 ( 699) 1338 158.4 2.5e-38
CCDS75077.1 ZNF595 gene_id:152687|Hs108|chr4 ( 465) 1335 157.8 2.5e-38
CCDS31182.1 ZNF33A gene_id:7581|Hs108|chr10 ( 810) 1338 158.5 2.7e-38
>>CCDS12211.1 ZNF559 gene_id:84527|Hs108|chr19 (538 aa)
initn: 3802 init1: 3802 opt: 3802 Z-score: 2228.2 bits: 422.0 E(32554): 8.7e-118
Smith-Waterman score: 3802; 100.0% identity (100.0% similar) in 538 aa overlap (1-538:1-538)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MVAGWLTNYSQDSVTFEDVAVDFTQEEWTLLDQTQRNLYRDVMLENYKNLVAVDWESHIN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MVAGWLTNYSQDSVTFEDVAVDFTQEEWTLLDQTQRNLYRDVMLENYKNLVAVDWESHIN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 TKWSAPQQNFLQGKTSSVVEMERNHFGEELFDFNQCEKALSEHSCLKTHRRTYFRKKTCE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 TKWSAPQQNFLQGKTSSVVEMERNHFGEELFDFNQCEKALSEHSCLKTHRRTYFRKKTCE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 CNQCEKAFRKPSIFTLHKKTDIGEELPNCNQCETAFSQHLHLVCKKTSQNLHLVCKKTHT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 CNQCEKAFRKPSIFTLHKKTDIGEELPNCNQCETAFSQHLHLVCKKTSQNLHLVCKKTHT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 QEKPYKCSDCEKGLPSSSHLRECVRIYGGERPYTHKEYVETFSHSTALFVHMQTQDGEKF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 QEKPYKCSDCEKGLPSSSHLRECVRIYGGERPYTHKEYVETFSHSTALFVHMQTQDGEKF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 YECKACGKPFTESSYLTQHLRTHSRVLPIEHKKFGKAFAFSPDLAKHIRLRTRGKHYVCN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 YECKACGKPFTESSYLTQHLRTHSRVLPIEHKKFGKAFAFSPDLAKHIRLRTRGKHYVCN
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 ECGKEFTCFSKLNIHIRVHTGEKPYECNKCGKAFTDSSGLIKHRRTHTGEKPYECKECGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 ECGKEFTCFSKLNIHIRVHTGEKPYECNKCGKAFTDSSGLIKHRRTHTGEKPYECKECGK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 AFANSSHLTVHMRTHTGEKPYQCKECGKAFINSSSFKSHMQTHPGVKPYDCQQCGKAFIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 AFANSSHLTVHMRTHTGEKPYQCKECGKAFINSSSFKSHMQTHPGVKPYDCQQCGKAFIR
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 SSFLIRHLRSHSAERPFECEECGKAFRYSSHLSQHKRIHTGERPYKCQKCGQAFSISSGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 SSFLIRHLRSHSAERPFECEECGKAFRYSSHLSQHKRIHTGERPYKCQKCGQAFSISSGL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530
pF1KB7 TVHMRTHTGERPFECQECGKAFTRSTYLIRHLRSHSVEKPYKECGQTFSNSSCLTECV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 TVHMRTHTGERPFECQECGKAFTRSTYLIRHLRSHSVEKPYKECGQTFSNSSCLTECV
490 500 510 520 530
>>CCDS62531.1 ZNF559 gene_id:84527|Hs108|chr19 (602 aa)
initn: 3802 init1: 3802 opt: 3802 Z-score: 2227.7 bits: 422.1 E(32554): 9.2e-118
Smith-Waterman score: 3802; 100.0% identity (100.0% similar) in 538 aa overlap (1-538:65-602)
10 20 30
pF1KB7 MVAGWLTNYSQDSVTFEDVAVDFTQEEWTL
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 GLSNLTILSCPDHLSQDVFCLHESKFEEERMVAGWLTNYSQDSVTFEDVAVDFTQEEWTL
40 50 60 70 80 90
40 50 60 70 80 90
pF1KB7 LDQTQRNLYRDVMLENYKNLVAVDWESHINTKWSAPQQNFLQGKTSSVVEMERNHFGEEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 LDQTQRNLYRDVMLENYKNLVAVDWESHINTKWSAPQQNFLQGKTSSVVEMERNHFGEEL
100 110 120 130 140 150
100 110 120 130 140 150
pF1KB7 FDFNQCEKALSEHSCLKTHRRTYFRKKTCECNQCEKAFRKPSIFTLHKKTDIGEELPNCN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 FDFNQCEKALSEHSCLKTHRRTYFRKKTCECNQCEKAFRKPSIFTLHKKTDIGEELPNCN
160 170 180 190 200 210
160 170 180 190 200 210
pF1KB7 QCETAFSQHLHLVCKKTSQNLHLVCKKTHTQEKPYKCSDCEKGLPSSSHLRECVRIYGGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 QCETAFSQHLHLVCKKTSQNLHLVCKKTHTQEKPYKCSDCEKGLPSSSHLRECVRIYGGE
220 230 240 250 260 270
220 230 240 250 260 270
pF1KB7 RPYTHKEYVETFSHSTALFVHMQTQDGEKFYECKACGKPFTESSYLTQHLRTHSRVLPIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 RPYTHKEYVETFSHSTALFVHMQTQDGEKFYECKACGKPFTESSYLTQHLRTHSRVLPIE
280 290 300 310 320 330
280 290 300 310 320 330
pF1KB7 HKKFGKAFAFSPDLAKHIRLRTRGKHYVCNECGKEFTCFSKLNIHIRVHTGEKPYECNKC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 HKKFGKAFAFSPDLAKHIRLRTRGKHYVCNECGKEFTCFSKLNIHIRVHTGEKPYECNKC
340 350 360 370 380 390
340 350 360 370 380 390
pF1KB7 GKAFTDSSGLIKHRRTHTGEKPYECKECGKAFANSSHLTVHMRTHTGEKPYQCKECGKAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 GKAFTDSSGLIKHRRTHTGEKPYECKECGKAFANSSHLTVHMRTHTGEKPYQCKECGKAF
400 410 420 430 440 450
400 410 420 430 440 450
pF1KB7 INSSSFKSHMQTHPGVKPYDCQQCGKAFIRSSFLIRHLRSHSAERPFECEECGKAFRYSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 INSSSFKSHMQTHPGVKPYDCQQCGKAFIRSSFLIRHLRSHSAERPFECEECGKAFRYSS
460 470 480 490 500 510
460 470 480 490 500 510
pF1KB7 HLSQHKRIHTGERPYKCQKCGQAFSISSGLTVHMRTHTGERPFECQECGKAFTRSTYLIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 HLSQHKRIHTGERPYKCQKCGQAFSISSGLTVHMRTHTGERPFECQECGKAFTRSTYLIR
520 530 540 550 560 570
520 530
pF1KB7 HLRSHSVEKPYKECGQTFSNSSCLTECV
::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 HLRSHSVEKPYKECGQTFSNSSCLTECV
580 590 600
>>CCDS46031.1 ZNF98 gene_id:148198|Hs108|chr19 (572 aa)
initn: 1251 init1: 1251 opt: 1456 Z-score: 870.7 bits: 170.9 E(32554): 3.5e-42
Smith-Waterman score: 1456; 42.6% identity (67.0% similar) in 545 aa overlap (4-534:3-533)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MVAGWLTNYSQDSVTFEDVAVDFTQEEWTLLDQTQRNLYRDVMLENYKNLVAVDWESHIN
: : . . .::.:::..:. ::: :: .:.::::.::::::.::: : .
CCDS46 MPGPLGSLEMGVLTFRDVALEFSLEEWQCLDTAQQNLYRNVMLENYRNLVFVGIAASKP
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KB7 TKWSAPQQ-----NFLQGKTSSVVEMERNHFGEELFDFNQCEKALSEHSCLKTHRRTYFR
. .: : . . . . ..:...:. .: .: .. :.: ..
CCDS46 DLITCLEQGKEPWNVKRHEMVTEPPVVYSYFAQDLWP-KQGKKNYFQKVILRT-----YK
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160
pF1KB7 KKTCECNQCEKAFRKPSIFTLHKKTDIGEELPNCNQCETA-------FSQHLHLVCKKTS
: : : .: .. . .::. : ::: :. ....... : ..
CCDS46 KCGRENLQLRKYCKSMDECKVHKECYNG-----LNQCLTTTQNKIFQYDKYVKVFHKFSN
120 130 140 150 160
170 180 190 200 210 220
pF1KB7 QNLHLVCKKTHTQEKPYKCSDCEKGLPSSSHLRECVRIYGGERPYTHKEYVETFSHSTAL
.: : : :: .: .::..:::.. ::: . ::..::.:: :: ....... :
CCDS46 SNRH---KIGHTGKKSFKCKECEKSFCMLSHLAQHKRIHSGEKPYKCKECGKAYNEASNL
170 180 190 200 210 220
230 240 250 260 270 280
pF1KB7 FVHMQTQDGEKFYECKACGKPFTESSYLTQHLRTHSRVLPIEHKKFGKAFAFSPDLAKHI
.: . . :.: :.:. ::: :.. :.:: : :. : . .. :::: : .:. :
CCDS46 STHKRIHTGKKPYKCEECGKAFNRLSHLTTHKIIHTGKKPYKCEECGKAFNQSANLTTHK
230 240 250 260 270 280
290 300 310 320 330 340
pF1KB7 RLRTRGKHYVCNECGKEFTCFSKLNIHIRVHTGEKPYECNKCGKAFTDSSGLIKHRRTHT
:..: : : :.:::. :. : :. : .:.:::::.:..:::::..:: : :. ::
CCDS46 RIHTGEKPYKCEECGRAFSQSSTLTAHKIIHAGEKPYKCEECGKAFSQSSTLTTHKIIHT
290 300 310 320 330 340
350 360 370 380 390 400
pF1KB7 GEKPYECKECGKAFANSSHLTVHMRTHTGEKPYQCKECGKAFINSSSFKSHMQTHPGVKP
::: :.:.::::::. ::::.: : :.:::::.:.:::::: .::.. .: . : : :
CCDS46 GEKFYKCEECGKAFSRLSHLTTHKRIHSGEKPYKCEECGKAFKQSSTLTTHKRIHAGEKF
350 360 370 380 390 400
410 420 430 440 450 460
pF1KB7 YDCQQCGKAFIRSSFLIRHLRSHSAERPFECEECGKAFRYSSHLSQHKRIHTGERPYKCQ
: :. :.::: : : : : : :..:.:..:::::::: ::.:. :: :::::.::::.
CCDS46 YKCEVCSKAFSRFSHLTTHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNLSSQLTTHKIIHTGEKPYKCE
410 420 430 440 450 460
470 480 490 500 510 520
pF1KB7 KCGQAFSISSGLTVHMRTHTGERPFECQECGKAFTRSTYLIRHLRSHSVEKPYK--ECGQ
.::.::. :: :. : ::::.:..:.::::::..:..: : :. ::::: :::.
CCDS46 ECGKAFNQSSTLSKHKVIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSHLTTHKMIHTGEKPYKCEECGK
470 480 490 500 510 520
530
pF1KB7 TFSNSSCLTECV
.:.::: :
CCDS46 AFNNSSILNRHKMIHTGEKLYKPESCNNACDNIAKISKYKRNCAGEK
530 540 550 560 570
>>CCDS42505.1 ZNF564 gene_id:163050|Hs108|chr19 (553 aa)
initn: 2324 init1: 1200 opt: 1441 Z-score: 862.2 bits: 169.3 E(32554): 1.1e-41
Smith-Waterman score: 1465; 43.0% identity (66.9% similar) in 540 aa overlap (12-532:2-518)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MVAGWLTNYSQDSVTFEDVAVDFTQEEWTLLDQTQRNLYRDVMLENYKNLVAVD--WESH
:::. :::::.:: :::.::: .:..:::::: :...::. : ::..
CCDS42 MDSVASEDVAVNFTLEEWALLDPSQKKLYRDVMRETFRNLACVGKKWEDQ
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 INTKWSAPQQNFLQGKTSSVVEMERNHFGEELFD---FNQCEKALSEHSCLKTHRRTYFR
: .: ::. . :::. : : . ..:: .:.:. :. ...
CCDS42 SIEDW---YKN--QGR------ILRNHMEEGLSESKEYDQCGEAFSQILNLNLNKKIPTI
60 70 80 90
120 130 140 150 160
pF1KB7 KKTCECNQCEKAFRKPSIFTLHKKTDIGE---------ELP-NCNQCETAFSQHLHLVCK
. :::. : :.: . : .. : .. .:. : : .:.:: :::. :.
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CCDS42 SFRRH-----ERTHTGEKPYACPECGKAFISLPSVRRHMIKHTGDGPYKCQECGKAFDRP
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CCDS42 SLFQIHERTHTGEKPYECQECAKAFISLPSFQRHMIRHTGDGPYKCQECGKAFD-RPSLF
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CCDS42 RTHTGEKPYECNKCGKTFSSSSNVRTHERTHTGEKPYECKECGKAFISLPSVRRHMIKHT
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CCDS42 PYKCQVCGKAFDCPSSVRTHERTHTGEKPYECKECGKAFNYASSIRIHERTHTGEKPYEC
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530
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CCDS42 KQCGKTFSYSSSFQRHERAHNGDKPYVKNVGKLSFITQPSNTCENE
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CCDS54 DLITCLEQGKKPLTMKKHEMVANPSVTCSHFARDLWP-EQSIKDSFQKVTLRRYENYGHD
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CCDS54 NLQF-KKGCESVDECKVHKRGYNGLNQYLTTTQSKIF----QCD----KYVKVIHKFSNS
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CCDS54 EKPYKCEECGRAFKYFSSLTTHKIIHSGEKPYKCEECGKAFNWSSHLTTHKRIHTGEKPY
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pF1KB7 FSNSSCLTECV
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