FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7836, 612 aa
1>>>pF1KB7836 612 - 612 aa - 612 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.2641+/-0.00181; mu= 12.1632+/- 0.108
mean_var=305.4693+/-61.841, 0's: 0 Z-trim(105.1): 965 B-trim: 35 in 1/52
Lambda= 0.073382
statistics sampled from 7142 (8222) to 7142 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.573), E-opt: 0.2 (0.253), width: 16
Scan time: 3.230
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS4439.1 ZNF354B gene_id:117608|Hs108|chr5 ( 612) 4211 460.9 2.2e-129
CCDS4438.1 ZNF354A gene_id:6940|Hs108|chr5 ( 605) 3548 390.7 2.9e-108
CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 658) 1990 225.8 1.4e-58
CCDS32977.1 ZNF85 gene_id:7639|Hs108|chr19 ( 595) 1891 215.3 1.8e-55
CCDS12945.1 ZNF471 gene_id:57573|Hs108|chr19 ( 626) 1871 213.2 8.2e-55
CCDS42558.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19 ( 644) 1868 212.9 1e-54
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CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 616) 1853 211.3 3.1e-54
CCDS11179.2 ZNF287 gene_id:57336|Hs108|chr17 ( 761) 1833 209.3 1.5e-53
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CCDS42541.1 ZNF91 gene_id:7644|Hs108|chr19 (1191) 1776 203.6 1.2e-51
CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 670) 1769 202.5 1.5e-51
CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 682) 1769 202.5 1.5e-51
CCDS46172.1 ZNF813 gene_id:126017|Hs108|chr19 ( 617) 1766 202.1 1.8e-51
CCDS4624.1 ZNF184 gene_id:7738|Hs108|chr6 ( 751) 1752 200.7 5.6e-51
CCDS82391.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19 ( 782) 1749 200.4 7.2e-51
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CCDS47352.1 ZNF879 gene_id:345462|Hs108|chr5 ( 563) 1745 199.8 8.1e-51
CCDS46169.1 ZNF665 gene_id:79788|Hs108|chr19 ( 678) 1744 199.8 9.6e-51
CCDS35235.1 ZNF182 gene_id:7569|Hs108|chrX ( 620) 1741 199.4 1.1e-50
CCDS46028.1 ZNF90 gene_id:7643|Hs108|chr19 ( 601) 1740 199.3 1.2e-50
CCDS35236.1 ZNF182 gene_id:7569|Hs108|chrX ( 639) 1737 199.0 1.5e-50
CCDS42539.1 ZNF676 gene_id:163223|Hs108|chr19 ( 588) 1731 198.3 2.3e-50
CCDS59367.1 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 ( 803) 1729 198.3 3.1e-50
CCDS12413.2 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 ( 809) 1729 198.3 3.2e-50
CCDS74321.1 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 ( 818) 1729 198.4 3.2e-50
CCDS82341.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19 ( 527) 1724 197.5 3.6e-50
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CCDS12498.1 ZNF420 gene_id:147923|Hs108|chr19 ( 688) 1718 197.1 6.5e-50
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CCDS32973.1 ZNF93 gene_id:81931|Hs108|chr19 ( 620) 1704 195.5 1.7e-49
CCDS59379.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1090) 1708 196.3 1.7e-49
CCDS33090.1 ZNF616 gene_id:90317|Hs108|chr19 ( 781) 1701 195.4 2.4e-49
CCDS4443.1 ZNF354C gene_id:30832|Hs108|chr5 ( 554) 1698 194.8 2.5e-49
CCDS42537.1 ZNF429 gene_id:353088|Hs108|chr19 ( 674) 1699 195.0 2.6e-49
CCDS33097.1 ZNF347 gene_id:84671|Hs108|chr19 ( 839) 1689 194.1 6.1e-49
CCDS54314.1 ZNF347 gene_id:84671|Hs108|chr19 ( 840) 1689 194.1 6.1e-49
CCDS46162.1 ZNF836 gene_id:162962|Hs108|chr19 ( 936) 1684 193.7 9.3e-49
CCDS75846.1 ZNF658 gene_id:26149|Hs108|chr9 (1059) 1683 193.7 1.1e-48
CCDS46170.1 ZNF845 gene_id:91664|Hs108|chr19 ( 970) 1682 193.5 1.1e-48
CCDS76895.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16 ( 585) 1671 192.0 1.9e-48
CCDS10900.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16 ( 643) 1671 192.0 2e-48
CCDS11180.1 ZNF624 gene_id:57547|Hs108|chr17 ( 865) 1671 192.2 2.3e-48
CCDS75077.1 ZNF595 gene_id:152687|Hs108|chr4 ( 465) 1666 191.3 2.4e-48
CCDS46102.1 ZNF226 gene_id:7769|Hs108|chr19 ( 803) 1669 192.0 2.6e-48
CCDS6437.1 ZNF16 gene_id:7564|Hs108|chr8 ( 682) 1667 191.7 2.7e-48
CCDS75076.1 ZNF595 gene_id:152687|Hs108|chr4 ( 616) 1666 191.5 2.8e-48
CCDS75075.1 ZNF595 gene_id:152687|Hs108|chr4 ( 648) 1666 191.5 2.9e-48
CCDS65110.1 ZFP37 gene_id:7539|Hs108|chr9 ( 645) 1663 191.2 3.6e-48
>>CCDS4439.1 ZNF354B gene_id:117608|Hs108|chr5 (612 aa)
initn: 4211 init1: 4211 opt: 4211 Z-score: 2436.5 bits: 460.9 E(32554): 2.2e-129
Smith-Waterman score: 4211; 100.0% identity (100.0% similar) in 612 aa overlap (1-612:1-612)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MAAGQREARPQVSLTFEDVAVLFTWDEWRKLAPSQRNLYRDVMLENYRNLVSLGLSFTKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MAAGQREARPQVSLTFEDVAVLFTWDEWRKLAPSQRNLYRDVMLENYRNLVSLGLSFTKP
10 20 30 40 50 60
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pF1KB7 KVISLLQQGEDPWEVEKDSSGVSSLGCKSTPKMTKSTQTQDSFQEQIRKRLKRDEPWNFI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 KVISLLQQGEDPWEVEKDSSGVSSLGCKSTPKMTKSTQTQDSFQEQIRKRLKRDEPWNFI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SERSCIYEEKLKKQQDKNENLQIISVAHTKILTVDRSHKNVEFGQNFYLKSVFIKQQRFA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 KEKTPSKCEIQRNSFKQNSNLLNQSKIKTAEKRYKCSTCEKAFIHNSSLRKHQKNHTGEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 KEKTPSKCEIQRNSFKQNSNLLNQSKIKTAEKRYKCSTCEKAFIHNSSLRKHQKNHTGEK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 LFKCKECLKAFSQSSALIQHQRTHTGEKPYICKECGKAFSHSASLCKHLRTHTVEKCYRC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 LFKCKECLKAFSQSSALIQHQRTHTGEKPYICKECGKAFSHSASLCKHLRTHTVEKCYRC
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 KECGKSFSRRSGLFIHQKIHAQENPHKYNPGRKASSYSTSLSGSQKIHLRKKSYLCNECG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 KECGKSFSRRSGLFIHQKIHAQENPHKYNPGRKASSYSTSLSGSQKIHLRKKSYLCNECG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 NTFKSSSSLRYHQRIHTGEKPFKCSECGRAFSQSASLIQHERIHTGEKPYRCNECGKGFT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 NTFKSSSSLRYHQRIHTGEKPFKCSECGRAFSQSASLIQHERIHTGEKPYRCNECGKGFT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 SISRLNRHRIIHTGEKLYNCNECGKALSSHSTLIIHERIHTGEKPCKCKVCGKAFRQSSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SISRLNRHRIIHTGEKLYNCNECGKALSSHSTLIIHERIHTGEKPCKCKVCGKAFRQSSA
430 440 450 460 470 480
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pF1KB7 LIQHQRMHTGERPYKCNECDKTFRCNSSLSNHQRIHTGEKPYRCLECGMSFGQSAALIQH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 LIQHQRMHTGERPYKCNECDKTFRCNSSLSNHQRIHTGEKPYRCLECGMSFGQSAALIQH
490 500 510 520 530 540
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pF1KB7 QRIHTGEKPFKCNTCGKTFRQSSSLIAHQRIHTGEKPYECNACGKLFSQRSSLTNHYKIH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 QRIHTGEKPFKCNTCGKTFRQSSSLIAHQRIHTGEKPYECNACGKLFSQRSSLTNHYKIH
550 560 570 580 590 600
610
pF1KB7 IEEDSLKADLHV
::::::::::::
CCDS44 IEEDSLKADLHV
610
>>CCDS4438.1 ZNF354A gene_id:6940|Hs108|chr5 (605 aa)
initn: 3104 init1: 3104 opt: 3548 Z-score: 2057.2 bits: 390.7 E(32554): 2.9e-108
Smith-Waterman score: 3548; 86.1% identity (93.4% similar) in 605 aa overlap (1-604:1-604)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MAAGQREARPQVSLTFEDVAVLFTWDEWRKLAPSQRNLYRDVMLENYRNLVSLGLSFTKP
:::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::: ::::
CCDS44 MAAGQREARPQVSLTFEDVAVLFTRDEWRKLAPSQRNLYRDVMLENYRNLVSLGLPFTKP
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pF1KB7 KVISLLQQGEDPWEVEKDSSGVSSLGCKSTPKMTKSTQTQDS-FQEQIRKRLKRDEPWNF
::::::::::::::::::.::::::: ::. : ::::::::: :: : :: .:. ::..
CCDS44 KVISLLQQGEDPWEVEKDGSGVSSLGSKSSHKTTKSTQTQDSSFQGLILKRSNRNVPWDL
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120 130 140 150 160 170
pF1KB7 ISERSCIYEEKLKKQQDKNENLQIISVAHTKILTVDRSHKNVEFGQNFYLKSVFIKQQRF
:. ::: .:.:.:::. ..::.:..: :: :..:::::.:..::: :::.:.:: .
CCDS44 KLEKPYIYEGRLEKKQDKKGSFQIVSATHKKIPTIERSHKNTELSQNFSPKSVLIRQQIL
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180 190 200 210 220 230
pF1KB7 AKEKTPSKCEIQRNSFKQNSNLLNQSKIKTAEKRYKCSTCEKAFIHNSSLRKHQKNHTGE
.:::: ::::: ::.::::.:::: :: ::.:::::: :::.::..::::::.:::.::
CCDS44 PREKTPPKCEIQGNSLKQNSQLLNQPKI-TADKRYKCSLCEKTFINTSSLRKHEKNHSGE
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pF1KB7 KLFKCKECLKAFSQSSALIQHQRTHTGEKPYICKECGKAFSHSASLCKHLRTHTVEKCYR
:::::::: ::::::::::::: :::::::::::::::::. :.:: :::::::::: ::
CCDS44 KLFKCKECSKAFSQSSALIQHQITHTGEKPYICKECGKAFTLSTSLYKHLRTHTVEKSYR
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pF1KB7 CKECGKSFSRRSGLFIHQKIHAQENPHKYNPGRKASSYSTSLSGSQKIHLRKKSYLCNEC
::::::::::::::::::::::.::: :::::::::: :::::: :.:: ::::::::::
CCDS44 CKECGKSFSRRSGLFIHQKIHAEENPCKYNPGRKASSCSTSLSGCQRIHSRKKSYLCNEC
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pF1KB7 GNTFKSSSSLRYHQRIHTGEKPFKCSECGRAFSQSASLIQHERIHTGEKPYRCNECGKGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 GNTFKSSSSLRYHQRIHTGEKPFKCSECGRAFSQSASLIQHERIHTGEKPYRCNECGKGF
360 370 380 390 400 410
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pF1KB7 TSISRLNRHRIIHTGEKLYNCNECGKALSSHSTLIIHERIHTGEKPCKCKVCGKAFRQSS
:::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 TSISRLNRHRIIHTGEKFYNCNECGKALSSHSTLIIHERIHTGEKPCKCKVCGKAFRQSS
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pF1KB7 ALIQHQRMHTGERPYKCNECDKTFRCNSSLSNHQRIHTGEKPYRCLECGMSFGQSAALIQ
:::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::: :::.:::::.::::
CCDS44 ALIQHQRMHTGERPYKCNECGKTFRCNSSLSNHQRIHTGEKPYRCEECGISFGQSSALIQ
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pF1KB7 HQRIHTGEKPFKCNTCGKTFRQSSSLIAHQRIHTGEKPYECNACGKLFSQRSSLTNHYKI
:.::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::.:::::..::::::::::
CCDS44 HRRIHTGEKPFKCNTCGKTFRQSSSRIAHQRIHTGEKPYECNTCGKLFNHRSSLTNHYKI
540 550 560 570 580 590
600 610
pF1KB7 HIEEDSLKADLHV
:::::
CCDS44 HIEEDP
600
>>CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 (658 aa)
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Smith-Waterman score: 1990; 49.8% identity (73.2% similar) in 608 aa overlap (1-603:1-603)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MAAGQREARPQVSLTFEDVAVLFTWDEWRKLAPSQRNLYRDVMLENYRNLVSLGLSFTKP
:. : : . ..:::::.: :. .:: .: :.::.:::::::...: :::.: . ::
CCDS74 MTPGVRVSTDPEQVTFEDVVVGFSQEEWGQLKPAQRTLYRDVMLDTFRLLVSVGHWLPKP
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70 80 90 100 110
pF1KB7 KVISLLQQGEDPWEVE-KDSSGVSSLGCKSTPKMTKSTQTQDSFQEQIRKRLKRDEPWNF
.:::::.: . : :: . .:: .. ::. :. : ...:.: . . : . .
CCDS74 NVISLLEQEAELWAVESRLPQGVYP-DLETRPKVKLSVLKQ-GISEEISNSVILVERFLW
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 ISERSCIYEEKLKKQQDKNENLQ--IISVAHTKILT--VDRSHKNVEFGQNFYLKSVFIK
. : :. . . . :.:. . :: : . : ... ..: ::.:. :. . .
CCDS74 DGLWYCRGEDTEGHWEWSCESLESLAVPVAFTPVKTPVLEQWQRN-GFGENISLNPDLPH
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 QQRFAKEKTPSKCEIQRNSFKQNSNLLNQSKIKTAEKRYKCSTCEKAFIHNSSLRKHQKN
: ....: . . : . :.:... .: :: :::. : ::: :.:.: .:...
CCDS74 QPMTPERQSPHTWGTRGKREKPDLNVLQKTCVK--EKPYKCQECGKAFSHSSALIEHHRT
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 HTGEKLFKCKECLKAFSQSSALIQHQRTHTGEKPYICKECGKAFSHSASLCKHLRTHTVE
::::. ..:.::::.: .:::: .::: ::::::: : .::..:.. : : .: :::: :
CCDS74 HTGERPYECHECLKGFRNSSALTKHQRIHTGEKPYKCTQCGRTFNQIAPLIQHQRTHTGE
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 KCYRCKECGKSFSRRSGLFIHQKIHAQENPHKYNPGRKASSYSTSLSGSQKIHLRKKSYL
: :.:.::::::: ::.. :.. :. :.:.. . :: : :. .:: .: :
CCDS74 KPYECSECGKSFSFRSSFSQHERTHTGEKPYECSECGKAFRQSIHLTQHLRIHTGEKPYQ
300 310 320 330 340 350
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pF1KB7 CNECGNTFKSSSSLRYHQRIHTGEKPFKCSECGRAFSQSASLIQHERIHTGEKPYRCNEC
:.:::..:. :::: ::::::::::..: :::.::.: . ::::.: :::::::.:.::
CCDS74 CGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECHECGKAFTQITPLIQHQRTHTGEKPYECGEC
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pF1KB7 GKGFTSISRLNRHRIIHTGEKLYNCNECGKALSSHSTLIIHERIHTGEKPCKCKVCGKAF
::.:.. . :..:: :::::: :.::::::..: :.: ::: :::::: .:. :::::
CCDS74 GKAFSQSTLLTEHRRIHTGEKPYGCNECGKTFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECSQCGKAF
420 430 440 450 460 470
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pF1KB7 RQSSALIQHQRMHTGERPYKCNECDKTFRCNSSLSNHQRIHTGEKPYRCLECGMSFGQSA
:::. : ::::.::::.::.::.: :.: .:::..:::::::::::.: .:: .:.: :
CCDS74 RQSTHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQLA
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KB7 ALIQHQRIHTGEKPFKCNTCGKTFRQSSSLIAHQRIHTGEKPYECNACGKLFSQRSSLTN
:::::::::::::..:: ::..: ::: :: :::::: :::: :: ::: ::. :::..
CCDS74 PLIQHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKPYGCNECGKSFSHSSSLSQ
540 550 560 570 580 590
600 610
pF1KB7 HYKIHIEEDSLKADLHV
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CCDS59 RSSALTTHKRMHTGEKPYKCEECGKAFSQSSTLTAHKIIHTGEKPYKCEECGKAFILSST
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CCDS74 MLDTFRLLVSVGHWLPKPNVISLLEQEAEL
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CCDS74 WAVESRLPQGVYP-DLETRPKVKLSVLKQ-GISEEISNSVILVERFLWDGLWYCRGEDTE
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CCDS74 GHWEWSCESLESLAVPVAFTPVKTPVLEQWQRN-GFGENISLNPDLPHQPMTPERQSPHT
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CCDS74 WGTRGKREKPDLNVLQKTCVK--EKPYKCQECGKAFSHSSALIEHHRTHTGERPYECHEC
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CCDS74 SFRSSFSQHERTHTGEKPYECSECGKAFRQSIHLTQHLRIHTGEKPYQCGECGKAFSHSS
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CCDS74 HRRIHTGEKPYGCNECGKTFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECSQCGKAFRQSTHLTQHQRI
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pF1KB7 HTGERPYKCNECDKTFRCNSSLSNHQRIHTGEKPYRCLECGMSFGQSAALIQHQRIHTGE
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CCDS74 HTGEKPYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQLAPLIQHQRIHTGE
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CCDS74 KPYECNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKPYGCNECGKSFSHSSSLSQHERTHTGEKPYE
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610
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CCDS74 CHDCGKSFRQSTHLTQHRRIHTGEKPYACRDCGKAFTHSSSLTKHQRTHTG
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CCDS11 TFSHSSSLINHQRVHTGEKPYICNECGKTFSQSTHLLQHQKIHTGKKPYKCNECWKVFSQ
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pF1KB7 SASLIQHERIHTGEKPYRCNECGKGFTSISRLNRHRIIHTGEKLYNCNECGKALSSHSTL
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CCDS11 STYLIRHQRIHSGEKCYKCNECGKAFAHSSTLIQHQTTHTGEKSYICNICGKAFSQSANL
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pF1KB7 IIHERIHTGEKPCKCKVCGKAFRQSSALIQHQRMHTGERPYKCNECDKTFRCNSSLSNHQ
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CCDS11 TQHHRTHTGEKPYKCSVCGKAFSQSVHLTQHQRIHNGEKPFKCNICGKAYRQGANLTQHQ
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pF1KB7 RIHTGEKPYRCLECGMSFGQSAALIQHQRIHTGEKPFKCNTCGKTFRQSSSLIAHQRIHT
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CCDS11 RIHTGEKPYKCNECGKAFIYSSSLNQHQRTHTGERPYKCNECDKDFSQRTCLIQHQRIHT
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pF1KB7 GEKPYECNACGKLFSQRSSLTNHYKIHIEEDSLKADLHV
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CCDS11 GEKPYACRICGKTFTQSTNLIQHQRVHTGAKHRN
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pF1KB7 MAAGQREARPQVSLTFEDVAVLFTWDEWRKLAPSQRNLYRDVMLENYRNLVSLGLSFTKP
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pF1KB7 KVISLLQQGEDPWEVEKDSSG--------VSSLGCKSTPKMTKSTQTQDS---FQEQIR-
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CCDS56 DVIFKLEQEEEPWVMEEEMFGRHCPEVWEVDEQIKKQQETLVRKVTSISKKILIKEKVIE
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pF1KB7 -KRLKRDEPW--NFISERSCIYE-EKLKKQQDKNENLQIISVAHTKILTVDRSHKNVEFG
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CCDS56 CKKVAKIFPLSSDIVTSRQSFYDCDSLDKGLEH--NLDLLRYEKGCV----REKQSNEFG
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CCDS56 KPFYHCASYVV--------TPFKCNQCGQDFSHKFDLIRHERIHAGEKPYECKECGKAFS
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CCDS56 RKENLITHQKIHTGEKPYKCNECGKAFIQMSNLIRHHRIHTGEKPYACKDCWKAFSQKSN
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CCDS56 LIEHERIHTGEKPYECKECGKSFSQKQNLIEHEKIHTGEKPYACNECGRAFSRMSSVTLH
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CCDS56 KAFSQRASLSIHKRGHTGERHQVY
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18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]