FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB7840, 615 aa 1>>>pF1KB7840 615 - 615 aa - 615 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.5876+/-0.00037; mu= -3.4901+/- 0.023 mean_var=331.8691+/-68.135, 0's: 0 Z-trim(124.3): 274 B-trim: 2560 in 1/55 Lambda= 0.070403 statistics sampled from 45551 (45839) to 45551 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.818), E-opt: 0.2 (0.537), width: 16 Scan time: 10.460 The best scores are: opt bits E(85289) NP_006141 (OMIM: 300111) prickle-like protein 3 is ( 615) 4510 471.8 3.1e-132 NP_001294908 (OMIM: 300111) prickle-like protein 3 ( 547) 3987 418.6 2.8e-116 XP_011531737 (OMIM: 608501,613832) PREDICTED: pric ( 900) 2170 234.3 1.4e-60 XP_011531736 (OMIM: 608501,613832) PREDICTED: pric ( 930) 2170 234.3 1.5e-60 XP_011531742 (OMIM: 608501,613832) PREDICTED: pric ( 679) 2133 230.4 1.6e-59 XP_011531735 (OMIM: 608501,613832) PREDICTED: pric ( 936) 2133 230.5 2e-59 XP_011531734 (OMIM: 608501,613832) PREDICTED: pric ( 966) 2133 230.5 2e-59 NP_942559 (OMIM: 608501,613832) prickle-like prote ( 844) 1891 205.9 4.6e-52 XP_016861287 (OMIM: 608501,613832) PREDICTED: pric ( 844) 1891 205.9 4.6e-52 XP_011531739 (OMIM: 608501,613832) PREDICTED: pric ( 874) 1891 205.9 4.8e-52 XP_011531738 (OMIM: 608501,613832) PREDICTED: pric ( 874) 1891 205.9 4.8e-52 XP_011536248 (OMIM: 608500,612437) PREDICTED: pric ( 831) 1649 181.3 1.2e-44 NP_001138355 (OMIM: 608500,612437) prickle-like pr ( 831) 1649 181.3 1.2e-44 NP_001138354 (OMIM: 608500,612437) prickle-like pr ( 831) 1649 181.3 1.2e-44 XP_011536249 (OMIM: 608500,612437) PREDICTED: pric ( 831) 1649 181.3 1.2e-44 NP_001138353 (OMIM: 608500,612437) prickle-like pr ( 831) 1649 181.3 1.2e-44 XP_016874327 (OMIM: 608500,612437) PREDICTED: pric ( 831) 1649 181.3 1.2e-44 XP_016874328 (OMIM: 608500,612437) PREDICTED: pric ( 831) 1649 181.3 1.2e-44 NP_694571 (OMIM: 608500,612437) prickle-like prote ( 831) 1649 181.3 1.2e-44 XP_016874329 (OMIM: 608500,612437) PREDICTED: pric ( 831) 1649 181.3 1.2e-44 XP_011531740 (OMIM: 608501,613832) PREDICTED: pric ( 757) 1242 139.9 3e-32 XP_016861288 (OMIM: 608501,613832) PREDICTED: pric ( 720) 1232 138.9 5.8e-32 NP_037529 (OMIM: 611389) prickle-like protein 4 [H ( 384) 757 90.4 1.2e-17 XP_005250315 (OMIM: 606085) PREDICTED: testin isof ( 336) 717 86.3 1.8e-16 NP_690042 (OMIM: 606085) testin isoform 2 [Homo sa ( 412) 717 86.4 2.1e-16 NP_056456 (OMIM: 606085) testin isoform 1 [Homo sa ( 421) 717 86.4 2.2e-16 NP_001265163 (OMIM: 604859) LIM and cysteine-rich ( 253) 415 55.5 2.5e-07 NP_001265162 (OMIM: 604859) LIM and cysteine-rich ( 292) 415 55.6 2.8e-07 NP_055398 (OMIM: 604859) LIM and cysteine-rich dom ( 365) 415 55.7 3.3e-07 XP_011531951 (OMIM: 604859) PREDICTED: LIM and cys ( 371) 415 55.7 3.4e-07 NP_001161291 (OMIM: 300163,300695,300696,300717,30 ( 280) 387 52.7 2e-06 XP_016884846 (OMIM: 300163,300695,300696,300717,30 ( 280) 387 52.7 2e-06 NP_001153172 (OMIM: 300163,300695,300696,300717,30 ( 280) 387 52.7 2e-06 NP_001153176 (OMIM: 300163,300695,300696,300717,30 ( 280) 387 52.7 2e-06 NP_004459 (OMIM: 602790) four and a half LIM domai ( 280) 387 52.7 2e-06 XP_006724810 (OMIM: 300163,300695,300696,300717,30 ( 280) 387 52.7 2e-06 NP_001440 (OMIM: 300163,300695,300696,300717,30071 ( 280) 387 52.7 2e-06 NP_001153171 (OMIM: 300163,300695,300696,300717,30 ( 296) 387 52.7 2.1e-06 NP_001153173 (OMIM: 300163,300695,300696,300717,30 ( 309) 387 52.8 2.1e-06 NP_001230807 (OMIM: 602790) four and a half LIM do ( 172) 374 51.2 3.4e-06 NP_057011 (OMIM: 602353) transforming growth facto ( 444) 361 50.3 1.7e-05 NP_001158191 (OMIM: 602353) transforming growth fa ( 444) 361 50.3 1.7e-05 NP_001441 (OMIM: 602633) four and a half LIM domai ( 279) 350 49.0 2.7e-05 NP_963851 (OMIM: 602633) four and a half LIM domai ( 279) 350 49.0 2.7e-05 NP_001305823 (OMIM: 602633) four and a half LIM do ( 279) 350 49.0 2.7e-05 NP_963849 (OMIM: 602633) four and a half LIM domai ( 279) 350 49.0 2.7e-05 XP_011509100 (OMIM: 602633) PREDICTED: four and a ( 279) 350 49.0 2.7e-05 NP_001305825 (OMIM: 602633) four and a half LIM do ( 279) 350 49.0 2.7e-05 NP_001305824 (OMIM: 602633) four and a half LIM do ( 279) 350 49.0 2.7e-05 NP_001034581 (OMIM: 602633) four and a half LIM do ( 279) 350 49.0 2.7e-05 >>NP_006141 (OMIM: 300111) prickle-like protein 3 isofor (615 aa) initn: 4510 init1: 4510 opt: 4510 Z-score: 2495.1 bits: 471.8 E(85289): 3.1e-132 Smith-Waterman score: 4510; 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