FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB7842, 617 aa 1>>>pF1KB7842 617 - 617 aa - 617 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.3687+/-0.00225; mu= 11.3666+/- 0.134 mean_var=341.4181+/-63.062, 0's: 0 Z-trim(105.1): 956 B-trim: 0 in 0/52 Lambda= 0.069411 statistics sampled from 7193 (8236) to 7193 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.571), E-opt: 0.2 (0.253), width: 16 Scan time: 3.230 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS12633.1 ZNF221 gene_id:7638|Hs108|chr19 ( 617) 4432 459.3 6.8e-129 CCDS33046.1 ZNF224 gene_id:7767|Hs108|chr19 ( 707) 3381 354.1 3.5e-97 CCDS46100.1 ZNF225 gene_id:7768|Hs108|chr19 ( 706) 2995 315.5 1.5e-85 CCDS12634.1 ZNF155 gene_id:7711|Hs108|chr19 ( 538) 2909 306.7 5.2e-83 CCDS58668.1 ZNF155 gene_id:7711|Hs108|chr19 ( 549) 2879 303.7 4.2e-82 CCDS46099.1 ZNF284 gene_id:342909|Hs108|chr19 ( 593) 2815 297.3 3.7e-80 CCDS46101.1 ZNF234 gene_id:10780|Hs108|chr19 ( 700) 2563 272.2 1.6e-72 CCDS46098.1 ZNF222 gene_id:7673|Hs108|chr19 ( 491) 2176 233.2 6.1e-61 CCDS12635.1 ZNF223 gene_id:7766|Hs108|chr19 ( 482) 2168 232.4 1.1e-60 CCDS33044.1 ZNF230 gene_id:7773|Hs108|chr19 ( 474) 2040 219.6 7.6e-57 CCDS46102.1 ZNF226 gene_id:7769|Hs108|chr19 ( 803) 1825 198.4 3e-50 CCDS46169.1 ZNF665 gene_id:79788|Hs108|chr19 ( 678) 1774 193.2 9.5e-49 CCDS32977.1 ZNF85 gene_id:7639|Hs108|chr19 ( 595) 1768 192.5 1.4e-48 CCDS33048.1 ZNF235 gene_id:9310|Hs108|chr19 ( 738) 1768 192.6 1.5e-48 CCDS82391.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19 ( 782) 1759 191.8 2.9e-48 CCDS32973.1 ZNF93 gene_id:81931|Hs108|chr19 ( 620) 1757 191.4 3e-48 CCDS12859.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19 ( 818) 1759 191.8 3e-48 CCDS33045.1 ZNF222 gene_id:7673|Hs108|chr19 ( 451) 1748 190.3 4.7e-48 CCDS74322.1 ZNF91 gene_id:7644|Hs108|chr19 (1159) 1752 191.4 5.8e-48 CCDS42541.1 ZNF91 gene_id:7644|Hs108|chr19 (1191) 1752 191.4 5.8e-48 CCDS12498.1 ZNF420 gene_id:147923|Hs108|chr19 ( 688) 1747 190.5 6.2e-48 CCDS74388.1 ZNF227 gene_id:7770|Hs108|chr19 ( 748) 1744 190.3 8e-48 CCDS12636.1 ZNF227 gene_id:7770|Hs108|chr19 ( 799) 1744 190.3 8.3e-48 CCDS59368.1 ZNF729 gene_id:100287226|Hs108|chr19 (1252) 1746 190.8 9.1e-48 CCDS59372.1 ZNF726 gene_id:730087|Hs108|chr19 ( 616) 1739 189.6 1e-47 CCDS33097.1 ZNF347 gene_id:84671|Hs108|chr19 ( 839) 1741 190.0 1e-47 CCDS54314.1 ZNF347 gene_id:84671|Hs108|chr19 ( 840) 1741 190.0 1e-47 CCDS74350.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1058) 1741 190.2 1.2e-47 CCDS59379.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1090) 1741 190.2 1.2e-47 CCDS46097.1 ZNF283 gene_id:284349|Hs108|chr19 ( 679) 1732 189.0 1.8e-47 CCDS42537.1 ZNF429 gene_id:353088|Hs108|chr19 ( 674) 1730 188.8 2e-47 CCDS62623.1 ZNF254 gene_id:9534|Hs108|chr19 ( 574) 1723 188.0 3e-47 CCDS74324.1 ZNF254 gene_id:9534|Hs108|chr19 ( 586) 1723 188.0 3e-47 CCDS74323.1 ZNF254 gene_id:9534|Hs108|chr19 ( 618) 1723 188.0 3.1e-47 CCDS46031.1 ZNF98 gene_id:148198|Hs108|chr19 ( 572) 1722 187.9 3.2e-47 CCDS32983.1 ZNF254 gene_id:9534|Hs108|chr19 ( 659) 1723 188.1 3.2e-47 CCDS4624.1 ZNF184 gene_id:7738|Hs108|chr6 ( 751) 1720 187.9 4.3e-47 CCDS75077.1 ZNF595 gene_id:152687|Hs108|chr4 ( 465) 1714 186.9 5.1e-47 CCDS75076.1 ZNF595 gene_id:152687|Hs108|chr4 ( 616) 1714 187.1 5.8e-47 CCDS75075.1 ZNF595 gene_id:152687|Hs108|chr4 ( 648) 1714 187.1 6e-47 CCDS54240.1 ZNF208 gene_id:7757|Hs108|chr19 (1280) 1714 187.6 8.5e-47 CCDS11180.1 ZNF624 gene_id:57547|Hs108|chr17 ( 865) 1705 186.5 1.3e-46 CCDS75846.1 ZNF658 gene_id:26149|Hs108|chr9 (1059) 1695 185.6 2.9e-46 CCDS59381.1 ZNF573 gene_id:126231|Hs108|chr19 ( 665) 1690 184.8 3.2e-46 CCDS12632.1 ZNF45 gene_id:7596|Hs108|chr19 ( 682) 1690 184.8 3.3e-46 CCDS59367.1 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 ( 803) 1691 185.0 3.3e-46 CCDS12413.2 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 ( 809) 1691 185.0 3.3e-46 CCDS74321.1 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 ( 818) 1691 185.0 3.3e-46 CCDS33090.1 ZNF616 gene_id:90317|Hs108|chr19 ( 781) 1688 184.7 4e-46 CCDS33093.2 ZNF28 gene_id:7576|Hs108|chr19 ( 718) 1686 184.4 4.4e-46 >>CCDS12633.1 ZNF221 gene_id:7638|Hs108|chr19 (617 aa) initn: 4432 init1: 4432 opt: 4432 Z-score: 2427.5 bits: 459.3 E(32554): 6.8e-129 Smith-Waterman score: 4432; 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CCDS46 KRFTQNSQLYSHRRVHTGVKPYKCEECGKGFNSKFNLDMHQRVHTGERPYNCKECGKSFS 520 530 540 550 560 570 580 590 600 610 pF1KB7 WASCLLKHQRLHSGEKPLKSGVWEEIYSEFTASFTSVSLCGRKAI :: .:.:.:::. :::.: :: ..:: CCDS46 RASSILNHKRLHGDEKPFKC---EECGKRFTENSQLHSHQRVHTGEKPYKCEKCGKSFRW 580 590 600 610 620 630 CCDS46 ASTHLTHQRLHSREKLLQCEDCGKSIVHSSCLKDQQRDQSGEKTSKCEDCGKRYKRRLNL 640 650 660 670 680 690 >>CCDS12634.1 ZNF155 gene_id:7711|Hs108|chr19 (538 aa) initn: 4204 init1: 2909 opt: 2909 Z-score: 1603.8 bits: 306.7 E(32554): 5.2e-83 Smith-Waterman score: 2909; 76.2% identity (88.5% similar) in 529 aa overlap (23-551:1-529) 10 20 30 40 50 60 pF1KB7 MISPSLELLHSGLCKFPEVEGKMTTFKEAVTFKDVAVVFTEEELGLLDPAQRKLYRDVML :::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS12 MTTFKEAVTFKDVAVVFTEEELGLLDPAQRKLYRDVML 10 20 30 70 80 90 100 110 120 pF1KB7 ENFRNLLSVGNQPFHQDTFHFLGKEKFWKMKTTSQREGNSGGKIQIEMETVPEAGPHEEW ::::::::::.::::::: ::: .:::: : :..::::::::::: :.:.::::: :::: CCDS12 ENFRNLLSVGHQPFHQDTCHFLREEKFWMMGTATQREGNSGGKIQTELESVPEAGAHEEW 40 50 60 70 80 90 130 140 150 160 170 180 pF1KB7 SCQQIWEQIASDLTRSQNSIRNSSQFFKEGDVPCQIEARLSISHVQQKPYRCNECKQSIS ::::::::::.::::::.:: :.::::..:::: :.:: : :. ::: . ..:::::: CCDS12 SCQQIWEQIAKDLTRSQDSIINNSQFFENGDVPSQVEAGLPTIHTGQKPSQGGKCKQSIS 100 110 120 130 140 150 190 200 210 220 230 240 pF1KB7 DVSVFDLHQQSHSGEKSHTCGECGKSFCYSPALHIHQRVHMGEKCYKCDVCGKEFNQSSH :: .::: :: .: :::.:: :::::.:: :::.:::::.::: . ::::::::.:::: CCDS12 DVPIFDLPQQLYSEEKSYTCDECGKSICYISALHVHQRVHVGEKLFMCDVCGKEFSQSSH 160 170 180 190 200 210 250 260 270 280 290 300 pF1KB7 LQTHQRVHTGEKPFKRGQCGKGFHSRSALNVHCKLHTGEKPYNCEECGKAFIHDSQLQEH ::::::::::::::: :::::: ::::::: ::::::::: :: :::::::::::.:: CCDS12 LQTHQRVHTGEKPFKCEQCGKGFSRRSALNVHRKLHTGEKPYICEACGKAFIHDSQLKEH 220 230 240 250 260 270 310 320 330 340 350 360 pF1KB7 QRIHTGEKPFKCDICGKSFRVRSRLNRHSMVHTGEKPFRCDTCGKNFRQRSALNSHSMVH .::::::::::::::::.: ::::. :::::::::::::::: :.:.:::::: : ::: CCDS12 KRIHTGEKPFKCDICGKTFYFRSRLKSHSMVHTGEKPFRCDTCDKSFHQRSALNRHCMVH 280 290 300 310 320 330 370 380 390 400 410 420 pF1KB7 IEEKPYKCEQCGKGFICRRDFCKHQMVHTGEKPYNCKECGKTFRWSSCLLNHQQVHSGQK ::::.::::::::: : :: :::.:::::::::::::::.:::::::::::.::::.: CCDS12 TGEKPYRCEQCGKGFIGRLDFYKHQVVHTGEKPYNCKECGKSFRWSSCLLNHQRVHSGEK 340 350 360 370 380 390 430 440 450 460 470 480 pF1KB7 SFKCEECGKGFYTNSRRSSHQRSHNGEKPYNCEECGKDYKRRLDLEFHQRVHTGERPYNC :::::::::::::::. :::::::.:::::.:::::: : ...:..::::::::::::: CCDS12 SFKCEECGKGFYTNSQLSSHQRSHSGEKPYKCEECGKGYVTKFNLDLHQRVHTGERPYNC 400 410 420 430 440 450 490 500 510 520 530 540 pF1KB7 KECGKSFGWASCLLKHQRLHSGEKPFKCEECGKRFTQSTQLHSHQTCHTGEKLYKCEQCE :::::.:. :: .:.:.::: .::::::.::::... : ... ..::. :::.: CCDS12 KECGKNFSRASSILNHKRLHCQKKPFKCEDCGKRLVHRTYRKDQPRDYSGENPSKCEDCG 460 470 480 490 500 510 550 560 570 580 590 600 pF1KB7 KGYNSKFNLDMHQRVHRGERPYNCKECGKSFGWASCLLKHQRLHSGEKPLKSGVWEEIYS . :. ..:::. CCDS12 RRYKRRLNLDILLSLFLNDT 520 530 >>CCDS58668.1 ZNF155 gene_id:7711|Hs108|chr19 (549 aa) initn: 4173 init1: 2878 opt: 2879 Z-score: 1587.5 bits: 303.7 E(32554): 4.2e-82 Smith-Waterman score: 2879; 75.8% identity (88.4% similar) in 525 aa overlap (27-551:16-540) 10 20 30 40 50 60 pF1KB7 MISPSLELLHSGLCKFPEVEGKMTTFKEAVTFKDVAVVFTEEELGLLDPAQRKLYRDVML .::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS58 MIKRSKVLVFCSKIMEEAVTFKDVAVVFTEEELGLLDPAQRKLYRDVML 10 20 30 40 70 80 90 100 110 120 pF1KB7 ENFRNLLSVGNQPFHQDTFHFLGKEKFWKMKTTSQREGNSGGKIQIEMETVPEAGPHEEW ::::::::::.::::::: ::: .:::: : :..::::::::::: :.:.::::: :::: CCDS58 ENFRNLLSVGHQPFHQDTCHFLREEKFWMMGTATQREGNSGGKIQTELESVPEAGAHEEW 50 60 70 80 90 100 130 140 150 160 170 180 pF1KB7 SCQQIWEQIASDLTRSQNSIRNSSQFFKEGDVPCQIEARLSISHVQQKPYRCNECKQSIS ::::::::::.::::::.:: :.::::..:::: :.:: : :. ::: . ..:::::: CCDS58 SCQQIWEQIAKDLTRSQDSIINNSQFFENGDVPSQVEAGLPTIHTGQKPSQGGKCKQSIS 110 120 130 140 150 160 190 200 210 220 230 240 pF1KB7 DVSVFDLHQQSHSGEKSHTCGECGKSFCYSPALHIHQRVHMGEKCYKCDVCGKEFNQSSH :: .::: :: .: :::.:: :::::.:: :::.:::::.::: . ::::::::.:::: CCDS58 DVPIFDLPQQLYSEEKSYTCDECGKSICYISALHVHQRVHVGEKLFMCDVCGKEFSQSSH 170 180 190 200 210 220 250 260 270 280 290 300 pF1KB7 LQTHQRVHTGEKPFKRGQCGKGFHSRSALNVHCKLHTGEKPYNCEECGKAFIHDSQLQEH ::::::::::::::: :::::: ::::::: ::::::::: :: :::::::::::.:: CCDS58 LQTHQRVHTGEKPFKCEQCGKGFSRRSALNVHRKLHTGEKPYICEACGKAFIHDSQLKEH 230 240 250 260 270 280 310 320 330 340 350 360 pF1KB7 QRIHTGEKPFKCDICGKSFRVRSRLNRHSMVHTGEKPFRCDTCGKNFRQRSALNSHSMVH .::::::::::::::::.: ::::. :::::::::::::::: :.:.:::::: : ::: CCDS58 KRIHTGEKPFKCDICGKTFYFRSRLKSHSMVHTGEKPFRCDTCDKSFHQRSALNRHCMVH 290 300 310 320 330 340 370 380 390 400 410 420 pF1KB7 IEEKPYKCEQCGKGFICRRDFCKHQMVHTGEKPYNCKECGKTFRWSSCLLNHQQVHSGQK ::::.::::::::: : :: :::.:::::::::::::::.:::::::::::.::::.: CCDS58 TGEKPYRCEQCGKGFIGRLDFYKHQVVHTGEKPYNCKECGKSFRWSSCLLNHQRVHSGEK 350 360 370 380 390 400 430 440 450 460 470 480 pF1KB7 SFKCEECGKGFYTNSRRSSHQRSHNGEKPYNCEECGKDYKRRLDLEFHQRVHTGERPYNC :::::::::::::::. :::::::.:::::.:::::: : ...:..::::::::::::: CCDS58 SFKCEECGKGFYTNSQLSSHQRSHSGEKPYKCEECGKGYVTKFNLDLHQRVHTGERPYNC 410 420 430 440 450 460 490 500 510 520 530 540 pF1KB7 KECGKSFGWASCLLKHQRLHSGEKPFKCEECGKRFTQSTQLHSHQTCHTGEKLYKCEQCE :::::.:. :: .:.:.::: .::::::.::::... : ... ..::. :::.: CCDS58 KECGKNFSRASSILNHKRLHCQKKPFKCEDCGKRLVHRTYRKDQPRDYSGENPSKCEDCG 470 480 490 500 510 520 550 560 570 580 590 600 pF1KB7 KGYNSKFNLDMHQRVHRGERPYNCKECGKSFGWASCLLKHQRLHSGEKPLKSGVWEEIYS . :. ..:::. CCDS58 RRYKRRLNLDILLSLFLNDT 530 540 >>CCDS46099.1 ZNF284 gene_id:342909|Hs108|chr19 (593 aa) initn: 2180 init1: 2180 opt: 2815 Z-score: 1552.6 bits: 297.3 E(32554): 3.7e-80 Smith-Waterman score: 2815; 68.4% identity (84.0% similar) in 569 aa overlap (23-591:1-568) 10 20 30 40 50 60 pF1KB7 MISPSLELLHSGLCKFPEVEGKMTTFKEAVTFKDVAVVFTEEELGLLDPAQRKLYRDVML :: ::::::::::::::::::::::: .:::::::::: CCDS46 MTMFKEAVTFKDVAVVFTEEELGLLDVSQRKLYRDVML 10 20 30 70 80 90 100 110 120 pF1KB7 ENFRNLLSVGNQPFHQDTFHFLGKEKFWKMKTTSQREGNSGGKIQIEMETVPEAGPHEEW ::::::::::.: :.::::: .:::: :.:..::::::::::: :.:.:::.:::::: CCDS46 ENFRNLLSVGHQLSHRDTFHFQREEKFWIMETATQREGNSGGKIQTELESVPETGPHEEW 40 50 60 70 80 90 130 140 150 160 170 180 pF1KB7 SCQQIWEQIASDLTRSQNSIRNSSQFFKEGDVPCQIEARLSISHVQQKPYRCNECKQSIS :::::::: ::.::: :.:: .:::: .:::: :..: ::: :. . : . ..::. .: CCDS46 SCQQIWEQTASELTRPQDSI-SSSQFSTQGDVPSQVDAGLSIIHIGETPSEHGKCKKFFS 100 110 120 130 140 150 190 200 210 220 230 240 pF1KB7 DVSVFDLHQQSHSGEKSHTCGECGKSFCYSPALHIHQRVHMGEKCYKCDVCGKEFNQSSH :::..::::: :::. ::::.: : :::: :: .::.:::::: ::::::.: :.:.:. CCDS46 DVSILDLHQQLHSGKISHTCNEYRKRFCYSSALCLHQKVHMGEKRYKCDVCSKAFSQNSQ 160 170 180 190 200 210 250 260 270 280 290 300 pF1KB7 LQTHQRVHTGEKPFKRGQCGKGFHSRSALNVHCKLHTGEKPYNCEECGKAFIHDSQLQEH ::::::.:::::::: ::::.: ::.. :::::::::::. ::::::::::.:::.:: CCDS46 LQTHQRIHTGEKPFKCEQCGKSFSRRSGMYVHCKLHTGEKPHICEECGKAFIHNSQLREH 220 230 240 250 260 270 310 320 330 340 350 360 pF1KB7 QRIHTGEKPFKCDICGKSFRVRSRLNRHSMVHTGEKPFRCDTCGKNFRQRSALNSHSMVH :::::::::::: ::::::. :: :::::::: :: ::::::...: :::::::: : : CCDS46 QRIHTGEKPFKCYICGKSFHSRSNLNRHSMVHMQEKSFRCDTCSNSFGQRSALNSHCMDH 280 290 300 310 320 330 370 380 390 400 410 420 pF1KB7 IEEKPYKCEQCGKGFICRRDFCKHQMVHTGEKPYNCKECGKTFRWSSCLLNHQQVHSGQK .:: ::::.::..: ::.:.::::: :::.:::::. ::: ::::::: ::.::.:. 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CCDS46 YWGQIWKQIASDLIKYEDSMISISRFPRQGDLSCQVRAGLYTTHTGQKFYQCDEYKKSFT 100 110 120 130 140 150 190 200 210 220 230 240 pF1KB7 DVSVFDLHQQSHSGEKSHTCGECGKSFCYSPALHIHQRVHMGEKCYKCDVCGKEFNQSSH :: :::::: ::::::::: :::::::: ::::::::::::::::::::::::.:::: CCDS46 DVFNFDLHQQLHSGEKSHTCDECGKSFCYISALHIHQRVHMGEKCYKCDVCGKEFSQSSH 160 170 180 190 200 210 250 260 270 280 290 300 pF1KB7 LQTHQRVHTGEKPFKRGQCGKGFHSRSALNVHCKLHTGEKPYNCEECGKAFIHDSQLQEH ::::::::: ::::: .::::: ::.:.::::::.:::::::::::.:::: :.:::: CCDS46 LQTHQRVHTVEKPFKCVECGKGFSRRSTLTVHCKLHSGEKPYNCEECGRAFIHASHLQEH 220 230 240 250 260 270 310 320 330 340 350 360 pF1KB7 QRIHTGEKPFKCDICGKSFRVRSRLNRHSMVHTGEKPFRCDTCGKNFRQRSALNSHSMVH ::::::::::::: :::.:: :: :: : ::::::::..:. ::: : : : :. :: CCDS46 QRIHTGEKPFKCDTCGKNFRRRSALNNHCMVHTGEKPYKCEDCGKCFTCSSNLRIHQRVH 280 290 300 310 320 330 370 380 390 pF1KB7 IEEKPYKCEQCGKGFICRRDF--------------CK--------------HQMVHTGEK :::::::.::: :: .: :: :: :::::: CCDS46 TGEKPYKCEECGKCFIQPSQFQAHRRIHTGEKPYVCKVCGKGFIYSSSFQAHQGVHTGEK 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KB7 PYNCKECGKTFRW----------------------------SSCLLNHQQVHSGQKSFKC ::.:.::::.:: :: : : ..:: :: ::: CCDS46 PYKCNECGKSFRMKIHYQVHLVVHTGEKPYKCEVCGKAFRQSSYLKIHLKAHSVQKPFKC 400 410 420 430 440 450 430 440 450 460 470 480 pF1KB7 EECGKGFYTNSRRSSHQRSHNGEKPYNCEECGKDYKRRLDLEFHQRVHTGERPYNCKECG ::::.:: .:: . :: :.:::::.:::::: ..:: ::..: :.::::.::::.::: CCDS46 EECGQGFNQSSRLQIHQLIHTGEKPYKCEECGKGFSRRADLKIHCRIHTGEKPYNCEECG 460 470 480 490 500 510 490 500 510 520 530 540 pF1KB7 KSFGWASCLLKHQRLHSGEKPFKCEECGKRFTQSTQLHSHQTCHTGEKLYKCEQCEKGYN : :. :: :: :::.:::::::::::::: :..:..:..:: ::::: ::: .: ::.. 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CCDS33 KRYKRRLNLDIILSLFLNDM 460 470 617 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sat Nov 5 18:34:14 2016 done: Sat Nov 5 18:34:15 2016 Total Scan time: 3.230 Total Display time: 0.120 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]