FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB7849, 545 aa 1>>>pF1KB7849 545 - 545 aa - 545 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.3226+/-0.000801; mu= 10.9342+/- 0.050 mean_var=347.6892+/-66.421, 0's: 0 Z-trim(112.4): 2062 B-trim: 79 in 1/53 Lambda= 0.068783 statistics sampled from 19041 (21366) to 19041 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.556), E-opt: 0.2 (0.251), width: 16 Scan time: 9.460 The best scores are: opt bits E(85289) NP_067040 (OMIM: 194551) zinc finger protein 77 [H ( 545) 3960 408.3 3.1e-113 XP_016882571 (OMIM: 194551) PREDICTED: zinc finger ( 365) 2682 281.2 3.8e-75 XP_016882570 (OMIM: 194551) PREDICTED: zinc finger ( 365) 2682 281.2 3.8e-75 NP_066358 (OMIM: 194556) zinc finger protein 14 [H ( 642) 1618 176.0 3.1e-43 XP_011525946 (OMIM: 604751) PREDICTED: zinc finger ( 616) 1613 175.5 4.2e-43 XP_006722684 (OMIM: 604751) PREDICTED: zinc finger ( 616) 1613 175.5 4.2e-43 XP_016881644 (OMIM: 604751) PREDICTED: zinc finger ( 616) 1613 175.5 4.2e-43 XP_006722685 (OMIM: 604751) PREDICTED: zinc finger ( 616) 1613 175.5 4.2e-43 XP_006722683 (OMIM: 604751) PREDICTED: zinc finger ( 616) 1613 175.5 4.2e-43 XP_006722686 (OMIM: 604751) PREDICTED: zinc finger ( 616) 1613 175.5 4.2e-43 XP_016881643 (OMIM: 604751) PREDICTED: zinc finger ( 616) 1613 175.5 4.2e-43 NP_940937 (OMIM: 609571) zinc finger protein 699 [ ( 642) 1608 175.0 6.1e-43 NP_001190179 (OMIM: 194557) zinc finger protein 20 ( 529) 1554 169.5 2.3e-41 NP_066966 (OMIM: 194557) zinc finger protein 20 is ( 532) 1554 169.5 2.3e-41 NP_001276331 (OMIM: 604077) zinc finger protein 13 ( 616) 1524 166.7 1.9e-40 XP_016882731 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 621) 1524 166.7 1.9e-40 XP_016882730 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 628) 1524 166.7 2e-40 XP_016882729 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 658) 1524 166.7 2e-40 NP_001276330 (OMIM: 604077) zinc finger protein 13 ( 658) 1524 166.7 2e-40 XP_005259268 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 1524 166.7 2e-40 NP_003427 (OMIM: 604077) zinc finger protein 135 i ( 670) 1524 166.7 2e-40 XP_006723426 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 1524 166.7 2e-40 XP_006723425 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 1524 166.7 2e-40 NP_009065 (OMIM: 604077) zinc finger protein 135 i ( 682) 1524 166.7 2e-40 XP_016881869 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 527) 1519 166.1 2.5e-40 XP_016881868 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 527) 1519 166.1 2.5e-40 NP_001317411 (OMIM: 613904) zinc finger protein 56 ( 527) 1519 166.1 2.5e-40 XP_016881871 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 527) 1519 166.1 2.5e-40 XP_016881867 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 650) 1519 166.2 2.8e-40 XP_011524841 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 686) 1519 166.2 2.9e-40 XP_016881866 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 686) 1519 166.2 2.9e-40 NP_689697 (OMIM: 613904) zinc finger protein 569 i ( 686) 1519 166.2 2.9e-40 XP_016881865 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 686) 1519 166.2 2.9e-40 XP_006723109 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 710) 1519 166.3 2.9e-40 XP_011524840 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 710) 1519 166.3 2.9e-40 XP_006723111 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 710) 1519 166.3 2.9e-40 XP_006723110 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 710) 1519 166.3 2.9e-40 NP_003399 (OMIM: 602951) zinc finger protein 37 ho ( 630) 1482 162.5 3.5e-39 NP_001269447 (OMIM: 602951) zinc finger protein 37 ( 631) 1482 162.5 3.5e-39 NP_001269444 (OMIM: 602951) zinc finger protein 37 ( 645) 1482 162.5 3.6e-39 NP_001291423 (OMIM: 194527) zinc finger protein 23 ( 585) 1476 161.9 5.1e-39 NP_001291422 (OMIM: 194527) zinc finger protein 23 ( 585) 1476 161.9 5.1e-39 XP_016881649 (OMIM: 604751) PREDICTED: zinc finger ( 549) 1475 161.7 5.3e-39 NP_006622 (OMIM: 604751) zinc finger protein 266 [ ( 549) 1475 161.7 5.3e-39 NP_001258243 (OMIM: 604751) zinc finger protein 26 ( 549) 1475 161.7 5.3e-39 XP_011525950 (OMIM: 604751) PREDICTED: zinc finger ( 549) 1475 161.7 5.3e-39 XP_016881650 (OMIM: 604751) PREDICTED: zinc finger ( 549) 1475 161.7 5.3e-39 XP_016881654 (OMIM: 604751) PREDICTED: zinc finger ( 549) 1475 161.7 5.3e-39 XP_011525949 (OMIM: 604751) PREDICTED: zinc finger ( 549) 1475 161.7 5.3e-39 XP_006722690 (OMIM: 604751) PREDICTED: zinc finger ( 549) 1475 161.7 5.3e-39 >>NP_067040 (OMIM: 194551) zinc finger protein 77 [Homo (545 aa) initn: 3960 init1: 3960 opt: 3960 Z-score: 2153.9 bits: 408.3 E(85289): 3.1e-113 Smith-Waterman score: 3960; 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NP_066 GETTSQMPNVNINKETFTGAKPHECSFCGRDFIHHSSLNRHMRSHTGQKPNEY------- 90 100 110 120 130 180 190 200 210 220 pF1KB7 LSCQSPPMKTQTVEK-PCNCQD-SRTASVTYV-----KSLSSKKSYECQKCGKAFICPSS : :: ::.:. ..: : . .. .. : :::..:::::: . 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