Result of FASTA (ccds) for
pF1KB7853
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7853, 549 aa
1>>>pF1KB7853 549 - 549 aa - 549 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.5550+/-0.00136; mu= 14.3987+/- 0.081
mean_var=227.9243+/-44.236, 0's: 0 Z-trim(109.8): 918 B-trim: 141 in 1/50
Lambda= 0.084953
statistics sampled from 10143 (11156) to 10143 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.703), E-opt: 0.2 (0.343), width: 16
Scan time: 3.690
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS32568.1 ZNF18 gene_id:7566|Hs108|chr17 ( 549) 3783 477.4 1.9e-134
CCDS76957.1 ZNF18 gene_id:7566|Hs108|chr17 ( 548) 3766 475.3 8.1e-134
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CCDS4441.1 ZNF454 gene_id:285676|Hs108|chr5 ( 522) 713 101.1 3.4e-21
CCDS12982.1 ZNF446 gene_id:55663|Hs108|chr19 ( 450) 702 99.7 8e-21
CCDS1631.1 ZNF496 gene_id:84838|Hs108|chr1 ( 587) 701 99.7 1e-20
CCDS4624.1 ZNF184 gene_id:7738|Hs108|chr6 ( 751) 695 99.1 1.9e-20
CCDS74355.1 ZNF570 gene_id:148268|Hs108|chr19 ( 592) 672 96.2 1.2e-19
CCDS77434.1 ZNF2 gene_id:7549|Hs108|chr2 ( 438) 667 95.4 1.5e-19
CCDS7205.2 ZNF485 gene_id:220992|Hs108|chr10 ( 441) 665 95.1 1.8e-19
CCDS14278.1 ZNF157 gene_id:7712|Hs108|chrX ( 506) 663 95.0 2.4e-19
CCDS33931.1 ZNF141 gene_id:7700|Hs108|chr4 ( 474) 662 94.8 2.5e-19
CCDS12504.1 ZNF570 gene_id:148268|Hs108|chr19 ( 536) 661 94.7 2.9e-19
CCDS46061.1 ZNF566 gene_id:84924|Hs108|chr19 ( 419) 659 94.3 3e-19
CCDS35500.2 ZNF550 gene_id:162972|Hs108|chr19 ( 422) 659 94.3 3e-19
CCDS54330.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 390) 655 93.8 4e-19
CCDS6755.1 ZNF189 gene_id:7743|Hs108|chr9 ( 584) 653 93.8 6e-19
CCDS65096.1 ZNF189 gene_id:7743|Hs108|chr9 ( 612) 653 93.8 6.1e-19
CCDS6754.1 ZNF189 gene_id:7743|Hs108|chr9 ( 626) 653 93.9 6.2e-19
CCDS12494.1 ZNF566 gene_id:84924|Hs108|chr19 ( 418) 648 93.0 7.6e-19
CCDS6437.1 ZNF16 gene_id:7564|Hs108|chr8 ( 682) 650 93.6 8.4e-19
CCDS33089.1 ZNF613 gene_id:79898|Hs108|chr19 ( 617) 645 92.9 1.2e-18
CCDS12637.1 ZNF112 gene_id:7771|Hs108|chr19 ( 907) 642 92.8 1.9e-18
CCDS54276.1 ZNF112 gene_id:7771|Hs108|chr19 ( 913) 642 92.8 2e-18
CCDS58523.1 ZNF286B gene_id:729288|Hs108|chr17 ( 522) 637 91.8 2.2e-18
CCDS35075.1 ZNF782 gene_id:158431|Hs108|chr9 ( 699) 635 91.7 3e-18
CCDS12845.1 ZNF350 gene_id:59348|Hs108|chr19 ( 532) 633 91.3 3.1e-18
CCDS11179.2 ZNF287 gene_id:57336|Hs108|chr17 ( 761) 635 91.8 3.2e-18
CCDS82043.1 ZNF232 gene_id:7775|Hs108|chr17 ( 435) 631 90.9 3.3e-18
CCDS31183.1 ZNF37A gene_id:7587|Hs108|chr10 ( 561) 632 91.2 3.5e-18
CCDS56092.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19 ( 580) 632 91.2 3.5e-18
CCDS73997.1 ZNF286A gene_id:57335|Hs108|chr17 ( 511) 631 91.0 3.6e-18
CCDS11172.1 ZNF286A gene_id:57335|Hs108|chr17 ( 521) 631 91.0 3.6e-18
CCDS10329.2 ZSCAN2 gene_id:54993|Hs108|chr15 ( 614) 632 91.3 3.7e-18
CCDS46044.1 ZNF30 gene_id:90075|Hs108|chr19 ( 624) 632 91.3 3.7e-18
CCDS42558.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19 ( 644) 632 91.3 3.8e-18
CCDS32977.1 ZNF85 gene_id:7639|Hs108|chr19 ( 595) 630 91.0 4.3e-18
CCDS12498.1 ZNF420 gene_id:147923|Hs108|chr19 ( 688) 630 91.1 4.6e-18
CCDS69562.1 ZNF34 gene_id:80778|Hs108|chr8 ( 539) 626 90.5 5.7e-18
CCDS33131.1 ZNF547 gene_id:284306|Hs108|chr19 ( 402) 624 90.0 5.7e-18
CCDS47945.1 ZNF34 gene_id:80778|Hs108|chr8 ( 560) 626 90.5 5.8e-18
CCDS7198.1 ZNF33B gene_id:7582|Hs108|chr10 ( 778) 628 90.9 5.9e-18
CCDS62706.1 ZNF229 gene_id:7772|Hs108|chr19 ( 819) 625 90.6 7.8e-18
CCDS42574.1 ZNF229 gene_id:7772|Hs108|chr19 ( 825) 625 90.6 7.8e-18
CCDS10681.2 ZNF768 gene_id:79724|Hs108|chr16 ( 540) 622 90.0 8e-18
CCDS12632.1 ZNF45 gene_id:7596|Hs108|chr19 ( 682) 622 90.1 9.1e-18
CCDS46045.1 ZNF30 gene_id:90075|Hs108|chr19 ( 623) 621 89.9 9.4e-18
CCDS31940.1 ZNF84 gene_id:7637|Hs108|chr12 ( 738) 621 90.0 1e-17
CCDS43429.1 ZNF391 gene_id:346157|Hs108|chr6 ( 358) 616 89.0 1.1e-17
CCDS12505.1 ZNF571 gene_id:51276|Hs108|chr19 ( 609) 619 89.7 1.1e-17
>>CCDS32568.1 ZNF18 gene_id:7566|Hs108|chr17 (549 aa)
initn: 3783 init1: 3783 opt: 3783 Z-score: 2527.2 bits: 477.4 E(32554): 1.9e-134
Smith-Waterman score: 3783; 100.0% identity (100.0% similar) in 549 aa overlap (1-549:1-549)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MPVDLGQALGLLPSLAKAEDSQFSESDAALQEELSSPETARQLFRQFRYQVMSGPHETLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MPVDLGQALGLLPSLAKAEDSQFSESDAALQEELSSPETARQLFRQFRYQVMSGPHETLK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 QLRKLCFQWLQPEVHTKEQILEILMLEQFLTILPGEIQMWVRKQCPGSGEEAVTLVESLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 QLRKLCFQWLQPEVHTKEQILEILMLEQFLTILPGEIQMWVRKQCPGSGEEAVTLVESLK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 GDPQRLWQWISIQVLGQDILSEKMESPSCQVGEVEPHLEVVPQELGLENSSSGPGELLSH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 GDPQRLWQWISIQVLGQDILSEKMESPSCQVGEVEPHLEVVPQELGLENSSSGPGELLSH
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 IVKEESDTEAELALAASQPARLEERLIRDQDLGASLLPAAPQEQWRQLDSTQKEQYWDLM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 IVKEESDTEAELALAASQPARLEERLIRDQDLGASLLPAAPQEQWRQLDSTQKEQYWDLM
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 LETYGKMVSGAGISHPKSDLTNSIEFGEELAGIYLHVNEKIPRPTCIGDRQENDKENLNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LETYGKMVSGAGISHPKSDLTNSIEFGEELAGIYLHVNEKIPRPTCIGDRQENDKENLNL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 ENHRDQELLHASCQASGEVPSQASLRGFFTEDEPGCFGEGENLPEALQNIQDEGTGEQLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 ENHRDQELLHASCQASGEVPSQASLRGFFTEDEPGCFGEGENLPEALQNIQDEGTGEQLS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 PQERISEKQLGQHLPNPHSGEMSTMWLEEKRETSQKGQPRAPMAQKLPTCRECGKTFYRN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 PQERISEKQLGQHLPNPHSGEMSTMWLEEKRETSQKGQPRAPMAQKLPTCRECGKTFYRN
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 SQLIFHQRTHTGETYFQCTICKKAFLRSSDFVKHQRTHTGEKPCKCDYCGKGFSDFSGLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SQLIFHQRTHTGETYFQCTICKKAFLRSSDFVKHQRTHTGEKPCKCDYCGKGFSDFSGLR
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB7 HHEKIHTGEKPYKCPICEKSFIQRSNFNRHQRVHTGEKPYKCSHCGKSFSWSSSLDKHQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 HHEKIHTGEKPYKCPICEKSFIQRSNFNRHQRVHTGEKPYKCSHCGKSFSWSSSLDKHQR
490 500 510 520 530 540
pF1KB7 SHLGKKPFQ
:::::::::
CCDS32 SHLGKKPFQ
>>CCDS76957.1 ZNF18 gene_id:7566|Hs108|chr17 (548 aa)
initn: 3764 init1: 2121 opt: 3766 Z-score: 2515.9 bits: 475.3 E(32554): 8.1e-134
Smith-Waterman score: 3766; 99.8% identity (99.8% similar) in 549 aa overlap (1-549:1-548)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MPVDLGQALGLLPSLAKAEDSQFSESDAALQEELSSPETARQLFRQFRYQVMSGPHETLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 MPVDLGQALGLLPSLAKAEDSQFSESDAALQEELSSPETARQLFRQFRYQVMSGPHETLK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 QLRKLCFQWLQPEVHTKEQILEILMLEQFLTILPGEIQMWVRKQCPGSGEEAVTLVESLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 QLRKLCFQWLQPEVHTKEQILEILMLEQFLTILPGEIQMWVRKQCPGSGEEAVTLVESLK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 GDPQRLWQWISIQVLGQDILSEKMESPSCQVGEVEPHLEVVPQELGLENSSSGPGELLSH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 GDPQRLWQWISIQVLGQDILSEKMESPSCQVGEVEPHLEVVPQELGLENSSSGPGELLSH
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 IVKEESDTEAELALAASQPARLEERLIRDQDLGASLLPAAPQEQWRQLDSTQKEQYWDLM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 IVKEESDTEAELALAASQPARLEERLIRDQDLGASLLPAAPQEQWRQLDSTQKEQYWDLM
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 LETYGKMVSGAGISHPKSDLTNSIEFGEELAGIYLHVNEKIPRPTCIGDRQENDKENLNL
:::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 LETYGKMVSG-GISHPKSDLTNSIEFGEELAGIYLHVNEKIPRPTCIGDRQENDKENLNL
250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 ENHRDQELLHASCQASGEVPSQASLRGFFTEDEPGCFGEGENLPEALQNIQDEGTGEQLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 ENHRDQELLHASCQASGEVPSQASLRGFFTEDEPGCFGEGENLPEALQNIQDEGTGEQLS
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370 380 390 400 410 420
pF1KB7 PQERISEKQLGQHLPNPHSGEMSTMWLEEKRETSQKGQPRAPMAQKLPTCRECGKTFYRN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 PQERISEKQLGQHLPNPHSGEMSTMWLEEKRETSQKGQPRAPMAQKLPTCRECGKTFYRN
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 SQLIFHQRTHTGETYFQCTICKKAFLRSSDFVKHQRTHTGEKPCKCDYCGKGFSDFSGLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 SQLIFHQRTHTGETYFQCTICKKAFLRSSDFVKHQRTHTGEKPCKCDYCGKGFSDFSGLR
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KB7 HHEKIHTGEKPYKCPICEKSFIQRSNFNRHQRVHTGEKPYKCSHCGKSFSWSSSLDKHQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 HHEKIHTGEKPYKCPICEKSFIQRSNFNRHQRVHTGEKPYKCSHCGKSFSWSSSLDKHQR
480 490 500 510 520 530
pF1KB7 SHLGKKPFQ
:::::::::
CCDS76 SHLGKKPFQ
540
>>CCDS5671.2 ZSCAN25 gene_id:221785|Hs108|chr7 (544 aa)
initn: 1315 init1: 347 opt: 843 Z-score: 579.8 bits: 117.1 E(32554): 5.6e-26
Smith-Waterman score: 874; 33.6% identity (57.8% similar) in 569 aa overlap (13-548:6-542)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MPVDLGQALGLLPSLAKAEDSQFSESDAALQEELS--------SPETARQLFRQFRYQVM
: .:.: ..:.. . :..:: :::: : :::::::
CCDS56 MLKEHPEMAEAPQQQLGIPVVKLEKELPWGRGREDPSPETFRLRFRQFRYQEA
10 20 30 40 50
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pF1KB7 SGPHETLKQLRKLCFQWLQPEVHTKEQILEILMLEQFLTILPGEIQMWVRKQCPGSGEEA
.::.:.:..:..:: .::.::.::::::::.:.::::::::: :. :.:.. : ::.
CCDS56 AGPQEALRELQELCRRWLRPELHTKEQILELLVLEQFLTILPREFYAWIREHGPESGKAL
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160
pF1KB7 VTLVESLKGDPQRLWQWISIQVLGQD-----ILSEKMESPSCQVG--EVEPHLEVVPQEL
...::.: .: . .. : : . :. :.: ::.:. . : :
CCDS56 AAMVEDLT---ERALEAKAVPCHRQGEQEETALCRGAWEPGIQLGPVEVKPEWGMPPGE-
120 130 140 150 160
170 180 190 200 210 220
pF1KB7 GLENSSSGPGELLSHIVKEESDTEAELALAASQ--PARLEERLIRDQDLGASLLPAA---
:... . : : ::. .:. . : :: . : :. : :::...:... :.
CCDS56 GVQGPDPGTEEQLSQDPGDETRAFQEQALPVLQAGPG-LPAVNPRDQEMAAGFFTAGSQG
170 180 190 200 210 220
230 240 250 260
pF1KB7 -----------PQEQWRQLDSTQKEQYWDLMLETYGKMVSGAGISHPKSDLTNSIEFGEE
:.:.::.. .: . . . ..: :: .: :. : . :.
CCDS56 LGPFKDMALAFPEEEWRHVTPAQIDCFGE-YVEPQDCRVSPGGGSKEKEAKPPQ----ED
230 240 250 260 270 280
270 280 290 300 310 320
pF1KB7 LAGIYLHV-NEKIPRPTCIGDRQENDKENLNLENHRDQELLHASCQASGEVPSQASLRGF
: : . . .:.. . . : .: .:: . .: : : : . .
CCDS56 LKGALVALTSERFGEASLQGP---------GLGRVCEQEPGGPAGSAPGLPPPQHGAIPL
290 300 310 320 330
330 340 350 360 370 380
pF1KB7 FTEDEP-GCFGEGENLPEALQNIQDEGTGEQLSPQERISEKQLGQHLPNPHSGEMSTMWL
: . . : . . :: .... ... . :. ::. : . :. :.
CCDS56 PDEVKTHSSFWKPFQCPECGKGFSR--SSNLVRHQRTHEEKSYG----CVECGKGFTL--
340 350 360 370 380
390 400 410 420 430 440
pF1KB7 EEKRETSQKGQPRAPMAQKLPTCRECGKTFYRNSQLIFHQRTHTGETYFQCTICKKAFLR
:: .: : :. .... .: :: ::: . .: :::.:::: ..: : :.: :
CCDS56 ---REYLMKHQ-RTHLGKRPYVCSECWKTFSQRHHLEVHQRSHTGEKPYKCGDCWKSFSR
390 400 410 420 430 440
450 460 470 480 490 500
pF1KB7 SSDFVKHQRTHTGEKPCKCDYCGKGFSDFSGLRHHEKIHTGEKPYKCPICEKSFIQRSNF
. . :.:::::::: :. :::.:: ..: :.. ::::::: : .: : : . .
CCDS56 RQHLQVHRRTHTGEKPYTCE-CGKSFSRNANLAVHRRAHTGEKPYGCQVCGKRFSKGERL
450 460 470 480 490 500
510 520 530 540
pF1KB7 NRHQRVHTGEKPYKCSHCGKSFSWSSSLDKHQRSHLGKKPFQ
::::.:::::::.: ::.::. : :..::... ..:.
CCDS56 VRHQRIHTGEKPYHCPACGRSFNQRSILNRHQKTQHRQEPLVQ
510 520 530 540
>>CCDS4441.1 ZNF454 gene_id:285676|Hs108|chr5 (522 aa)
initn: 4064 init1: 622 opt: 713 Z-score: 493.9 bits: 101.1 E(32554): 3.4e-21
Smith-Waterman score: 716; 35.5% identity (64.0% similar) in 344 aa overlap (222-549:25-357)
200 210 220 230 240 250
pF1KB7 LALAASQPARLEERLIRDQDLGASLLPAAPQEQWRQLDSTQKEQYWDLMLETYGKMVSGA
::.: ::. .:. : :.:::.:...::
CCDS44 MAVSHLPTMVQESVTFKDVAILFTQEEWGQLSPAQRALYRDVMLENYSNLVS-L
10 20 30 40 50
260 270 280 290
pF1KB7 GISHPKSDLTNSIE-----FGEELAGIYLHVNEKIP---RPTCIGDRQEND------KEN
:. :: : ...: . :. : . .: . : .. :.. ::
CCDS44 GLLGPKPDTFSQLEKREVWMPEDTPGGFCLDWMTMPASKKSTVKAEIPEEELDQWTIKER
60 70 80 90 100 110
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 LNLENH-RDQELLHASCQASGEVPSQASLRGFFTEDEPGCFGEGENLPEALQNIQDEGTG
.. .: . ::. .: .. :. : . . : : .. .:.. :..:
CCDS44 FSSSSHWKCASLLEWQC-GGQEISLQRVVLTHPNTPSQECDESGSTMSSSLHSDQSQG--
120 130 140 150 160 170
360 370 380 390 400 410
pF1KB7 EQLSPQERISE-KQLGQHLPNPHSGEMSTMWLEEKRETSQKGQPRAPMAQKLPTCRECGK
..:.. : .. :. . .. ::. ..: .. .... . . .: ::::::
CCDS44 --FQPSKNAFECSECGKVF-----SKSSTLNKHQKIHNEKNANQKIHIKEKRYECRECGK
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CCDS44 IGEK
520
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CCDS12 VIHRKGHRPEVP
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CCDS74 AVDFS------QEEWDCLDSSQRHLYSNVMLENYRILVS-LGLCFSKPSVILLLEQGK--
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CCDS74 --APWMVKRELTKGLCSGWEPICETEELTPKQDFYEEHQSQKIIETLTSYNLEYSSLREE
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CCDS74 WKCEGYF-ERQPGNQKACFKEEIITHEEPLFDEREQEYKSWGSFHQNPLLCTQKIIPKEE
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CCDS74 KVHKHDTQKRSFKKNLMAIKPKSVCAEK---------KLLKCNDCEKVFSQSSSLTLHQR
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CCDS74 EKPYECKVCRKAFSQFAYLAQHQRVHTGEKPYECIECGKAFSNRSSIAQHQRVHTGEKPY
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pF1KB7 Q
.
CCDS74 ECNVCGKAFSLRAYLTVHQRIHTGERPYECKECGKAFSQNSHLAQHQRIHTGEKPYKCQE
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CCDS74 YECIECGKAFSNRSSIAQHQRVHTGEKPYECNVCGKAFSLRAYLTVHQRIHTGERPYECK
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CCDS74 ECGKAFSQNSHLAQHQRIHTGEKPYKCQECRKAFSQIAYLAQHQRVHTGEKPYECIECGK
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