FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7857, 553 aa
1>>>pF1KB7857 553 - 553 aa - 553 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.4084+/-0.00129; mu= 16.3611+/- 0.078
mean_var=237.8563+/-44.377, 0's: 0 Z-trim(111.3): 970 B-trim: 0 in 0/49
Lambda= 0.083160
statistics sampled from 11168 (12239) to 11168 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.71), E-opt: 0.2 (0.376), width: 16
Scan time: 3.820
The best scores are: opt bits E(32554)
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CCDS12943.1 ZNF583 gene_id:147949|Hs108|chr19 ( 569) 1283 167.6 3.6e-41
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CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 658) 1213 159.3 1.3e-38
CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 670) 1213 159.3 1.3e-38
CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 682) 1213 159.3 1.3e-38
CCDS59370.1 ZNF728 gene_id:388523|Hs108|chr19 ( 622) 1204 158.2 2.7e-38
CCDS6709.2 ZNF169 gene_id:169841|Hs108|chr9 ( 603) 1203 158.0 2.9e-38
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CCDS75076.1 ZNF595 gene_id:152687|Hs108|chr4 ( 616) 1154 152.2 1.7e-36
CCDS2719.1 ZNF502 gene_id:91392|Hs108|chr3 ( 544) 1153 152.0 1.8e-36
CCDS47931.1 ZNF623 gene_id:9831|Hs108|chr8 ( 496) 1147 151.2 2.7e-36
CCDS73997.1 ZNF286A gene_id:57335|Hs108|chr17 ( 511) 1147 151.2 2.8e-36
CCDS11172.1 ZNF286A gene_id:57335|Hs108|chr17 ( 521) 1147 151.2 2.8e-36
CCDS34957.1 ZNF623 gene_id:9831|Hs108|chr8 ( 536) 1147 151.2 2.9e-36
CCDS2715.1 ZKSCAN7 gene_id:55888|Hs108|chr3 ( 754) 1149 151.7 2.9e-36
CCDS4438.1 ZNF354A gene_id:6940|Hs108|chr5 ( 605) 1146 151.2 3.3e-36
CCDS56105.1 ZNF835 gene_id:90485|Hs108|chr19 ( 537) 1145 151.0 3.4e-36
CCDS54939.1 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5 ( 568) 1145 151.0 3.5e-36
CCDS4311.2 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5 ( 604) 1145 151.1 3.6e-36
CCDS54940.1 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5 ( 620) 1145 151.1 3.7e-36
CCDS32797.1 ZNF519 gene_id:162655|Hs108|chr18 ( 540) 1144 150.9 3.7e-36
CCDS46211.1 ZNF419 gene_id:79744|Hs108|chr19 ( 464) 1143 150.7 3.7e-36
CCDS42637.1 ZNF419 gene_id:79744|Hs108|chr19 ( 478) 1143 150.7 3.8e-36
CCDS54328.1 ZNF419 gene_id:79744|Hs108|chr19 ( 497) 1143 150.7 3.8e-36
CCDS54327.1 ZNF419 gene_id:79744|Hs108|chr19 ( 498) 1143 150.7 3.8e-36
CCDS54326.1 ZNF419 gene_id:79744|Hs108|chr19 ( 510) 1143 150.7 3.9e-36
CCDS54325.1 ZNF419 gene_id:79744|Hs108|chr19 ( 511) 1143 150.7 3.9e-36
>>CCDS12981.1 ZNF324 gene_id:25799|Hs108|chr19 (553 aa)
initn: 3852 init1: 3852 opt: 3852 Z-score: 2518.4 bits: 475.8 E(32554): 5.9e-134
Smith-Waterman score: 3852; 100.0% identity (100.0% similar) in 553 aa overlap (1-553:1-553)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MAFEDVAVYFSQEEWGLLDTAQRALYRRVMLDNFALVASLGLSTSRPRVVIQLERGEEPW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MAFEDVAVYFSQEEWGLLDTAQRALYRRVMLDNFALVASLGLSTSRPRVVIQLERGEEPW
10 20 30 40 50 60
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 VPSGTDTTLSRTTYRRRNPGSWSLTEDRDVSGEWPRAFPDTPPGMTTSVFPVAGACHSVK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 SLQRQRGASPSRERKPTGVSVIYWERLLLGSGSGQASVSLRLTSPLRPPEGVRLREKTLT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 EHALLGRQPRTPERQKPCAQEVPGRTFGSAQDLEAAGGRGHHRMGAVWQEPHRLLGGQEP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 STWDELGEALHAGEKSFECRACSKVFVKSSDLLKHLRTHTGERPYECAQCGKAFSQTSHL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 TQHQRIHSGETPYACPVCGKAFRHSSSLVRHQRIHTAEKSFRCSECGKAFSHGSNLSQHR
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 KIHAGGRPYACAQCGRRFCRNSHLIQHERTHTGEKPFVCALCGAAFSQGSSLFKHQRVHT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 KIHAGGRPYACAQCGRRFCRNSHLIQHERTHTGEKPFVCALCGAAFSQGSSLFKHQRVHT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 GEKPFACPQCGRAFSHSSNLTQHQLLHTGERPFRCVDCGKAFAKGAVLLSHRRIHTGEKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 GEKPFACPQCGRAFSHSSNLTQHQLLHTGERPFRCVDCGKAFAKGAVLLSHRRIHTGEKP
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB7 FVCTQCGRAFRERPALFHHQRIHTGEKTVRRSRASLHPQARSVAGASSEGAPAKETEPTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 FVCTQCGRAFRERPALFHHQRIHTGEKTVRRSRASLHPQARSVAGASSEGAPAKETEPTP
490 500 510 520 530 540
550
pF1KB7 ASGPAAVSQPAEV
:::::::::::::
CCDS12 ASGPAAVSQPAEV
550
>>CCDS33138.1 ZNF324B gene_id:388569|Hs108|chr19 (544 aa)
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Smith-Waterman score: 3243; 85.9% identity (92.1% similar) in 547 aa overlap (1-547:1-544)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MAFEDVAVYFSQEEWGLLDTAQRALYRRVMLDNFALVASLGLSTSRPRVVIQLERGEEPW
:.:::::::::::::::::::::::::.:::.::.::.::::::::::::::::::::::
CCDS33 MTFEDVAVYFSQEEWGLLDTAQRALYRHVMLENFTLVTSLGLSTSRPRVVIQLERGEEPW
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70 80 90 100 110 120
pF1KB7 VPSGTDTTLSRTTYRRRNPGSWSLTEDRDVSGEWPRAFPDTPPGMTTSVFPVAGACHSVK
:::: : ::.:.:: : : :::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::
CCDS33 VPSGKDMTLARNTYGRLNSGSWSLTEDRDVSGEWPRAFPDTPPGMTTSVFPVADACHSVK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 SLQRQRGASPSRERKPTGVSVIYWERLLLGSGSGQASVSLRLTSPLRPPEGVRLREKTLT
::::: :::::.::::::::::::::::::: : :::.:::::::::::.. : ::::.:
CCDS33 SLQRQPGASPSQERKPTGVSVIYWERLLLGSRSDQASISLRLTSPLRPPKSSRPREKTFT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 EHALLGRQPRTPERQKPCAQEVPGRTFGSAQDLEAAGGRGHHRMGAVWQEPHRLLGGQEP
:. . ::::::::::::::::::::.::.:.::.::.: .::::.:::::::::::::
CCDS33 EYRVPGRQPRTPERQKPCAQEVPGRAFGNASDLKAASGGRDRRMGAAWQEPHRLLGGQEP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 STWDELGEALHAGEKSFECRACSKVFVKSSDLLKHLRTHTGERPYECAQCGKAFSQTSHL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::
CCDS33 STWDELGEALHAGEKSFECRACSKVFVKSSDLLKHLRTHTGERPYECTQCGKAFSQTSHL
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310 320 330 340 350 360
pF1KB7 TQHQRIHSGETPYACPVCGKAFRHSSSLVRHQRIHTAEKSFRCSECGKAFSHGSNLSQHR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 TQHQRIHSGETPYACPVCGKAFRHSSSLVRHQRIHTAEKSFRCSECGKAFSHGSNLSQHR
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 KIHAGGRPYACAQCGRRFCRNSHLIQHERTHTGEKPFVCALCGAAFSQGSSLFKHQRVHT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::
CCDS33 KIHAGGRPYACAQCGRRFCRNSHLIQHERTHTGEKPFVCALCGAAFSQGSSLFLHQRVHT
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pF1KB7 GEKPFACPQCGRAFSHSSNLTQHQLLHTGERPFRCVDCGKAFAKGAVLLSHRRIHTGEKP
::::::: ::::.::.::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::
CCDS33 GEKPFACAQCGRSFSRSSNLTQHQLLHTGERPFRCVDCGKGFAKGAVLLSHRRIHTGEKP
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pF1KB7 FVCTQCGRAFRERPALFHHQRIHTGEKTVRRSRASLHPQARSVAGASSEGAPAKETEPTP
::::::::::::::::.::::::: ::: . . : . : . . .:.:
CCDS33 FVCTQCGRAFRERPALLHHQRIHTTEKT-NAAAPDCTPGPGFLQGHHRK--VRRGGKPSP
490 500 510 520 530
550
pF1KB7 ASGPAAVSQPAEV
. :: :
CCDS33 VLKPAKV
540
>>CCDS12504.1 ZNF570 gene_id:148268|Hs108|chr19 (536 aa)
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Smith-Waterman score: 1314; 40.3% identity (65.4% similar) in 523 aa overlap (1-506:14-523)
10 20 30 40
pF1KB7 MAFEDVAVYFSQEEWGLLDTAQRALYRRVMLDNFALVASLGLSTSRP
..:.:::: :::::: ::..:: :: :::.:. ...:::: :.:
CCDS12 MAVGLLKAMYQELVTFRDVAVDFSQEEWDCLDSSQRHLYSNVMLENYRILVSLGLCFSKP
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pF1KB7 RVVIQLERGEEPWVPSGTDTTLSRTTYRRRNP--GSWSLTEDRDVSGE-WPRAFPDT--P
:.. ::.:. ::. . :.. .: . :: .: : . . .:
CCDS12 SVILLLEQGKAPWM---VKRELTKGLCSGWEPICETEELTPKQDFYEEHQSQKIIETLTS
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110 120 130 140 150 160
pF1KB7 PGMTTSVFPVAGACHSVKSLQRQRGASPS--RERKPTGVSVIYWERLLLGSGSGQASVSL
.. : . :.. ..:: : . . .:. : .. :: .. :.
CCDS12 YNLEYSSLREEWKCEGY--FERQPGNQKACFKEEIITHEEPLFDEREQEYKSWGSFH---
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210
pF1KB7 RLTSPLRPPEGVRLREKTLTEHALLGRQPRTPERQ----KP---CAQEVPGRTFGSAQDL
.:: . . .:. . .: : :. ... :: ::.. . . .
CCDS12 --QNPLLCTQKIIPKEEKVHKH---DTQKRSFKKNLMAIKPKSVCAEKKLLKCNDCEKVF
180 190 200 210 220
220 230 240 250 260 270
pF1KB7 EAAGGRGHHRMGAVWQEPHRLLG-GQEPSTWDEL--GEALHAGEKSFECRACSKVFVKSS
... :. . ..:.. . :. : ..: . .:.::: .::. : :.: ...
CCDS12 SQSSSLTLHQRIHTGEKPYKCIECGKAFSQRSNLVQHQRIHTGEKPYECKECRKAFSQNA
230 240 250 260 270 280
280 290 300 310 320 330
pF1KB7 DLLKHLRTHTGERPYECAQCGKAFSQTSHLTQHQRIHSGETPYACPVCGKAFRHSSSLVR
:..:::.::::.:::: : ::::: ..:.::::.:.:: :: : ::::: . ::...
CCDS12 HLVQHLRVHTGEKPYECKVCRKAFSQFAYLAQHQRVHTGEKPYECIECGKAFSNRSSIAQ
290 300 310 320 330 340
340 350 360 370 380 390
pF1KB7 HQRIHTAEKSFRCSECGKAFSHGSNLSQHRKIHAGGRPYACAQCGRRFCRNSHLIQHERT
:::.::.:: ..:. :::::: . :. :..::.: ::: : .::. : .:::: ::.:
CCDS12 HQRVHTGEKPYECNVCGKAFSLRAYLTVHQRIHTGERPYECKECGKAFSQNSHLAQHQRI
350 360 370 380 390 400
400 410 420 430 440 450
pF1KB7 HTGEKPFVCALCGAAFSQGSSLFKHQRVHTGEKPFACPQCGRAFSHSSNLTQHQLLHTGE
::::::. : : :::: . : .::::::::::. : .::.:::..:.::::: .::::
CCDS12 HTGEKPYKCQECRKAFSQIAYLAQHQRVHTGEKPYECIECGKAFSNDSSLTQHQRVHTGE
410 420 430 440 450 460
460 470 480 490 500 510
pF1KB7 RPFRCVDCGKAFAKGAVLLSHRRIHTGEKPFVCTQCGRAFRERPALFHHQRIHTGEKTVR
.:..:. :::::. . : .:.::::::.:. : .: ..::.. : :::::: ::
CCDS12 KPYECTVCGKAFSYCGSLAQHQRIHTGERPYECKECKKTFRQHAHLAHHQRIHIGESLSP
470 480 490 500 510 520
520 530 540 550
pF1KB7 RSRASLHPQARSVAGASSEGAPAKETEPTPASGPAAVSQPAEV
CCDS12 PNPVNHQVL
530
>>CCDS74355.1 ZNF570 gene_id:148268|Hs108|chr19 (592 aa)
initn: 1147 init1: 1147 opt: 1314 Z-score: 872.5 bits: 171.3 E(32554): 2.8e-42
Smith-Waterman score: 1314; 40.3% identity (65.4% similar) in 523 aa overlap (1-506:70-579)
10 20 30
pF1KB7 MAFEDVAVYFSQEEWGLLDTAQRALYRRVM
..:.:::: :::::: ::..:: :: ::
CCDS74 SSEATAISQEKSQEEERMAVGLLKAMYQELVTFRDVAVDFSQEEWDCLDSSQRHLYSNVM
40 50 60 70 80 90
40 50 60 70 80
pF1KB7 LDNFALVASLGLSTSRPRVVIQLERGEEPWVPSGTDTTLSRTTYRRRNP--GSWSLTEDR
:.:. ...:::: :.: :.. ::.:. ::. . :.. .: . :: .
CCDS74 LENYRILVSLGLCFSKPSVILLLEQGKAPWM---VKRELTKGLCSGWEPICETEELTPKQ
100 110 120 130 140 150
90 100 110 120 130 140
pF1KB7 DVSGE-WPRAFPDT--PPGMTTSVFPVAGACHSVKSLQRQRGASPS--RERKPTGVSVIY
: : . . .: .. : . :.. ..:: : . . .:. : ..
CCDS74 DFYEEHQSQKIIETLTSYNLEYSSLREEWKCEGY--FERQPGNQKACFKEEIITHEEPLF
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CCDS92 QRTHTGDKLYTCNQCGKSFVHSSRLIRHQRTHTGEKPYECPECGKSFRQSTHLILHQRTH
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CCDS92 VRVRPYECNECGKSYSQRSHLVVHHRIHTGLKPFECKDCGKCFSRSSHLYSHQRTHTGEK
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CCDS92 PYECHDCGKSFSQSSALIVHQRIHTGEKPYECCQCGKAFIRKNDLIKHQRIHVGEETYKC
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CCDS44 IHQLQQGEDPCMVEREVPS--DTRLGFKTWLETE----ALPHRQDIFIE------ETSQG
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pF1KB7 MTT--SVFPVAGACHSVKSLQRQRGASPSRERKPTGVSVIYWERLLLGSG---SGQASVS
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CCDS44 MVKKESIKDGHWDINFEEAVEFESEIEEEQEKKPLRQMIDSHEKTISEDGNHTSLELGKS
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CCDS44 LFTNTALVTQQSVPI-ERIPNMYYTFGKDFKQNFDLMKCFQIYPG---GKPHICNECGKS
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pF1KB7 GHHRMGAVWQEPHRLLGGQEPSTWDELGEA------------LHAGEKSFECRACSKVFV
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CCDS44 FKQNLHLI--EHQRIHTGEKPYKCNECEKTFSHRSSLLSHQRIHTGEKPYKCNECEKAFS
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pF1KB7 KSSDLLKHLRTHTGERPYECAQCGKAFSQTSHLTQHQRIHSGETPYACPVCGKAFRHSSS
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