Result of FASTA (ccds) for
pF1KB7869
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7869, 561 aa
1>>>pF1KB7869 561 - 561 aa - 561 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.5740+/-0.00122; mu= 14.8940+/- 0.073
mean_var=217.3658+/-41.993, 0's: 0 Z-trim(110.6): 937 B-trim: 25 in 2/48
Lambda= 0.086992
statistics sampled from 10719 (11744) to 10719 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.702), E-opt: 0.2 (0.361), width: 16
Scan time: 2.650
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS5666.1 ZNF394 gene_id:84124|Hs108|chr7 ( 561) 3906 503.7 2.4e-142
CCDS34698.1 ZKSCAN1 gene_id:7586|Hs108|chr7 ( 563) 1126 154.8 2.6e-37
CCDS69349.1 ZKSCAN1 gene_id:7586|Hs108|chr7 ( 527) 1096 151.0 3.4e-36
CCDS14649.1 ZNF449 gene_id:203523|Hs108|chrX ( 518) 1094 150.7 4e-36
CCDS4647.1 ZKSCAN4 gene_id:387032|Hs108|chr6 ( 545) 1061 146.6 7.3e-35
CCDS2717.1 ZNF197 gene_id:10168|Hs108|chr3 (1029) 1015 141.2 5.7e-33
CCDS54327.1 ZNF419 gene_id:79744|Hs108|chr19 ( 498) 971 135.3 1.7e-31
CCDS7205.2 ZNF485 gene_id:220992|Hs108|chr10 ( 441) 966 134.6 2.5e-31
CCDS54328.1 ZNF419 gene_id:79744|Hs108|chr19 ( 497) 965 134.5 2.9e-31
CCDS54325.1 ZNF419 gene_id:79744|Hs108|chr19 ( 511) 964 134.4 3.2e-31
CCDS233.1 ZNF436 gene_id:80818|Hs108|chr1 ( 470) 960 133.8 4.4e-31
CCDS54326.1 ZNF419 gene_id:79744|Hs108|chr19 ( 510) 959 133.8 5e-31
CCDS32977.1 ZNF85 gene_id:7639|Hs108|chr19 ( 595) 953 133.1 9.2e-31
CCDS6871.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 498) 944 131.9 1.8e-30
CCDS73997.1 ZNF286A gene_id:57335|Hs108|chr17 ( 511) 943 131.8 2e-30
CCDS11172.1 ZNF286A gene_id:57335|Hs108|chr17 ( 521) 943 131.8 2e-30
CCDS4440.1 ZFP2 gene_id:80108|Hs108|chr5 ( 461) 941 131.5 2.3e-30
CCDS69562.1 ZNF34 gene_id:80778|Hs108|chr8 ( 539) 942 131.7 2.3e-30
CCDS47945.1 ZNF34 gene_id:80778|Hs108|chr8 ( 560) 942 131.7 2.3e-30
CCDS43619.1 ZNF3 gene_id:7551|Hs108|chr7 ( 446) 936 130.8 3.4e-30
CCDS69664.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 474) 935 130.7 3.9e-30
CCDS2715.1 ZKSCAN7 gene_id:55888|Hs108|chr3 ( 754) 934 130.9 5.5e-30
CCDS2719.1 ZNF502 gene_id:91392|Hs108|chr3 ( 544) 931 130.3 5.9e-30
CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 616) 923 129.4 1.3e-29
CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 658) 923 129.4 1.3e-29
CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 670) 923 129.4 1.3e-29
CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 682) 923 129.4 1.4e-29
CCDS58688.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19 ( 503) 919 128.7 1.6e-29
CCDS58687.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19 ( 555) 919 128.8 1.7e-29
CCDS12956.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19 ( 577) 919 128.8 1.7e-29
CCDS45852.1 ZNF397 gene_id:84307|Hs108|chr18 ( 534) 918 128.7 1.8e-29
CCDS58686.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19 ( 629) 919 128.9 1.8e-29
CCDS12504.1 ZNF570 gene_id:148268|Hs108|chr19 ( 536) 915 128.3 2.4e-29
CCDS75077.1 ZNF595 gene_id:152687|Hs108|chr4 ( 465) 914 128.1 2.4e-29
CCDS74355.1 ZNF570 gene_id:148268|Hs108|chr19 ( 592) 915 128.3 2.5e-29
CCDS32330.1 ZNF774 gene_id:342132|Hs108|chr15 ( 483) 913 128.0 2.7e-29
CCDS47931.1 ZNF623 gene_id:9831|Hs108|chr8 ( 496) 912 127.9 2.9e-29
CCDS34957.1 ZNF623 gene_id:9831|Hs108|chr8 ( 536) 912 127.9 3.1e-29
CCDS43590.1 ZNF479 gene_id:90827|Hs108|chr7 ( 524) 908 127.4 4.3e-29
CCDS10329.2 ZSCAN2 gene_id:54993|Hs108|chr15 ( 614) 909 127.6 4.3e-29
CCDS2716.1 ZNF660 gene_id:285349|Hs108|chr3 ( 331) 903 126.5 5.1e-29
CCDS12497.1 ZNF345 gene_id:25850|Hs108|chr19 ( 488) 905 127.0 5.3e-29
CCDS83401.1 ZNF883 gene_id:169834|Hs108|chr9 ( 379) 903 126.6 5.5e-29
CCDS46211.1 ZNF419 gene_id:79744|Hs108|chr19 ( 464) 903 126.7 6.2e-29
CCDS42637.1 ZNF419 gene_id:79744|Hs108|chr19 ( 478) 903 126.7 6.3e-29
CCDS5528.2 ZNF273 gene_id:10793|Hs108|chr7 ( 569) 904 126.9 6.4e-29
CCDS32980.1 ZNF708 gene_id:7562|Hs108|chr19 ( 563) 902 126.7 7.5e-29
CCDS55282.1 ZNF250 gene_id:58500|Hs108|chr8 ( 555) 901 126.5 8.2e-29
CCDS34972.1 ZNF250 gene_id:58500|Hs108|chr8 ( 560) 901 126.6 8.2e-29
CCDS42538.1 ZNF100 gene_id:163227|Hs108|chr19 ( 542) 900 126.4 8.8e-29
>>CCDS5666.1 ZNF394 gene_id:84124|Hs108|chr7 (561 aa)
initn: 3906 init1: 3906 opt: 3906 Z-score: 2669.0 bits: 503.7 E(32554): 2.4e-142
Smith-Waterman score: 3906; 100.0% identity (100.0% similar) in 561 aa overlap (1-561:1-561)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MNSSLTAQRRGSDAELGPWVMAARSKDAAPSQRDGLLPVKVEEDSPGSWEPNYPAASPDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 MNSSLTAQRRGSDAELGPWVMAARSKDAAPSQRDGLLPVKVEEDSPGSWEPNYPAASPDP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 ETSRLHFRQLRYQEVAGPEEALSRLRELCRRWLRPELLSKEQILELLVLEQFLTILPEEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 ETSRLHFRQLRYQEVAGPEEALSRLRELCRRWLRPELLSKEQILELLVLEQFLTILPEEL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 QAWVREHCPESGEEAVAVVRALQRALDGTSSQGMVTFEDTAVSLTWEEWERLDPARRDFC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 QAWVREHCPESGEEAVAVVRALQRALDGTSSQGMVTFEDTAVSLTWEEWERLDPARRDFC
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 RESAQKDSGSTVPPSLESRVENKELIPMQQILEEAEPQGQLQEAFQGKRPLFSKCGSTHE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 RESAQKDSGSTVPPSLESRVENKELIPMQQILEEAEPQGQLQEAFQGKRPLFSKCGSTHE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 DRVEKQSGDPLPLKLENSPEAEGLNSISDVNKNGSIEGEDSKNNELQNSARCSNLVLCQH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 DRVEKQSGDPLPLKLENSPEAEGLNSISDVNKNGSIEGEDSKNNELQNSARCSNLVLCQH
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 IPKAERPTDSEEHGNKCKQSFHMVTWHVLKPHKSDSGDSFHHSSLFETQRQLHEERPYKC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 IPKAERPTDSEEHGNKCKQSFHMVTWHVLKPHKSDSGDSFHHSSLFETQRQLHEERPYKC
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 GNCGKSFKQRSDLFRHQRIHTGEKPYGCQECGKSFSQSAALTKHQRTHTGEKPYTCLKCG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 GNCGKSFKQRSDLFRHQRIHTGEKPYGCQECGKSFSQSAALTKHQRTHTGEKPYTCLKCG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 ERFRQNSHLNRHQSTHSRDKHFKCEECGETCHISNLFRHQRLHKGERPYKCEECEKSFKQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 ERFRQNSHLNRHQSTHSRDKHFKCEECGETCHISNLFRHQRLHKGERPYKCEECEKSFKQ
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB7 RSDLFKHHRIHTGEKPYGCSVCGKRFNQSATLIKHQRIHTGEKPYKCLECGERFRQSTHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 RSDLFKHHRIHTGEKPYGCSVCGKRFNQSATLIKHQRIHTGEKPYKCLECGERFRQSTHL
490 500 510 520 530 540
550 560
pF1KB7 IRHQRIHQNKVLSAGRGGSRL
:::::::::::::::::::::
CCDS56 IRHQRIHQNKVLSAGRGGSRL
550 560
>>CCDS34698.1 ZKSCAN1 gene_id:7586|Hs108|chr7 (563 aa)
initn: 556 init1: 556 opt: 1126 Z-score: 783.3 bits: 154.8 E(32554): 2.6e-37
Smith-Waterman score: 1132; 37.9% identity (64.4% similar) in 554 aa overlap (20-547:1-539)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MNSSLTAQRRGSDAELGPWVMAARSKDA------APSQRDGLLPVKVEEDSPGS--WEPN
.:.:.:..: : ...::.. :::::.. . : .
CCDS34 MMTAESREATGLSPQAAQEKDGIVIVKVEEEDEEDHMWGQD
10 20 30 40
60 70 80 90 100
pF1KB7 ---YPAASPDPETSRLHFRQLRYQEVAGPEEALSRLRELCRRWLRPELLSKEQILELLVL
. :::: : .::.. ::.. ::.::::::.:::..:::::. .::::::::::
CCDS34 STLQDTPPPDPEIFRQRFRRFCYQNTFGPREALSRLKELCHQWLRPEINTKEQILELLVL
50 60 70 80 90 100
110 120 130 140 150 160
pF1KB7 EQFLTILPEELQAWVREHCPESGEEAVAVVRALQRALDGTSSQGMVTFEDTAVSLTWEEW
::::.:::.:::.:..:. :.::::::.... :. :.: . :.: . . .
CCDS34 EQFLSILPKELQVWLQEYRPDSGEEAVTLLEDLELDLSGQQVPGQVHGPE----MLARGM
110 120 130 140 150
170 180 190 200 210 220
pF1KB7 ERLDPARR----DFCRESAQKD--SGSTVPPSLESRVENKELIPMQQILEEAEPQGQLQE
:::... :. .:..:. .: : :.::. :: .:. :. : .
CCDS34 VPLDPVQESSSFDLHHEATQSHFKHSSRKPRLLQSRALPAAHIPAPP--HEGSPRDQAMA
160 170 180 190 200 210
230 240 250 260 270 280
pF1KB7 A--FQGKRPLFSKCGSTHEDRVEKQSGDPLPLKLENSPEAEGLNSISDVNKNGSIEGED-
. : . . : . . . .. : . . : . . : : ..: ..:.
CCDS34 SALFTADSQAMVKIEDMAVSLILEEWGCQNLARRNLSRDNRQENYGSAFPQGGENRNENE
220 230 240 250 260 270
290 300 310 320 330
pF1KB7 ---SKNNELQNSARCSNLVLCQHIPKAERPTDSEEHGNKCKQSFHMVTWHVLKPHKSDSG
:: . ..:: .. . .. .:. . . :.. ... . : . .: :::
CCDS34 ESTSKAETSEDSASRGETTGRSQKEFGEKRDQEGKTGERQQKNPEEKT----RKEKRDSG
280 290 300 310 320 330
340 350 360 370 380 390
pF1KB7 DSFHHSSLFETQRQLHEER-PYKCGN-CGKSFKQRSDLFRHQRIHTGEKPYGCQECGKSF
.. .. .. . :: : . :. :.::. :.. ... :: : . :.:::: :
CCDS34 PAIGKD-----KKTITGERGPREKGKGLGRSFSLSSNFTTPEEVPTGTKSHRCDECGKCF
340 350 360 370 380
400 410 420 430 440 450
pF1KB7 SQSAALTKHQRTHTGEKPYTCLKCGERFRQNSHLNRHQSTHSRDKHFKCEECGET-CHIS
..:..: .:. ::::::: : .::. : ::.: :: :. .: .:.:::.. : :
CCDS34 TRSSSLIRHKIIHTGEKPYECSECGKAFSLNSNLVLHQRIHTGEKPHECNECGKAFSHSS
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pF1KB7 NLFRHQRLHKGERPYKCEECEKSFKQRSDLFKHHRIHTGEKPYGCSVCGKRFNQSATLIK
::. :::.:.::.::.:.:: :.:.: ::: ::.::::::::: :: ::: ::... ::
CCDS34 NLILHQRIHSGEKPYECNECGKAFSQSSDLTKHQRIHTGEKPYECSECGKAFNRNSYLIL
450 460 470 480 490 500
520 530 540 550 560
pF1KB7 HQRIHTGEKPYKCLECGERFRQSTHLIRHQRIHQNKVLSAGRGGSRL
:.:::: :::::: .::. : .:. : :.:::
CCDS34 HRRIHTREKPYKCTKCGKAFTRSSTLTLHHRIHARERASEYSPASLDAFGAFLKSCV
510 520 530 540 550 560
>>CCDS69349.1 ZKSCAN1 gene_id:7586|Hs108|chr7 (527 aa)
initn: 556 init1: 556 opt: 1096 Z-score: 763.3 bits: 151.0 E(32554): 3.4e-36
Smith-Waterman score: 1096; 39.0% identity (65.0% similar) in 505 aa overlap (58-547:14-503)
30 40 50 60 70 80
pF1KB7 AAPSQRDGLLPVKVEEDSPGSWEPNYPAASPDPETSRLHFRQLRYQEVAGPEEALSRLRE
:::: : .::.. ::.. ::.::::::.:
CCDS69 MWGQDSTLQDTPPPDPEIFRQRFRRFCYQNTFGPREALSRLKE
10 20 30 40
90 100 110 120 130 140
pF1KB7 LCRRWLRPELLSKEQILELLVLEQFLTILPEELQAWVREHCPESGEEAVAVVRALQRALD
::..:::::. .::::::::::::::.:::.:::.:..:. :.::::::.... :. :.
CCDS69 LCHQWLRPEINTKEQILELLVLEQFLSILPKELQVWLQEYRPDSGEEAVTLLEDLELDLS
50 60 70 80 90 100
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pF1KB7 GTSSQGMVTFEDTAVSLTWEEWERLDPARR----DFCRESAQKD--SGSTVPPSLESRVE
: . :.: . . . :::... :. .:..:. .: : :.::.
CCDS69 GQQVPGQVHGPE----MLARGMVPLDPVQESSSFDLHHEATQSHFKHSSRKPRLLQSRAL
110 120 130 140 150
210 220 230 240 250
pF1KB7 NKELIPMQQILEEAEPQGQLQEA--FQGKRPLFSKCGSTHEDRVEKQSGDPLPLKLENSP
:: .:. :. : . . : . . : . . . .. : . . :
CCDS69 PAAHIPAPP--HEGSPRDQAMASALFTADSQAMVKIEDMAVSLILEEWGCQNLARRNLSR
160 170 180 190 200 210
260 270 280 290 300 310
pF1KB7 EAEGLNSISDVNKNGSIEGED----SKNNELQNSARCSNLVLCQHIPKAERPTDSEEHGN
. . : : ..: ..:. :: . ..:: .. . .. .:. . . :.
CCDS69 DNRQENYGSAFPQGGENRNENEESTSKAETSEDSASRGETTGRSQKEFGEKRDQEGKTGE
220 230 240 250 260 270
320 330 340 350 360 370
pF1KB7 KCKQSFHMVTWHVLKPHKSDSGDSFHHSSLFETQRQLHEER-PYKCGN-CGKSFKQRSDL
. ... . : . .: ::: .. . .. . :: : . :. :.::. :..
CCDS69 RQQKNPEEKT----RKEKRDSGPAIG-----KDKKTITGERGPREKGKGLGRSFSLSSNF
280 290 300 310 320
380 390 400 410 420 430
pF1KB7 FRHQRIHTGEKPYGCQECGKSFSQSAALTKHQRTHTGEKPYTCLKCGERFRQNSHLNRHQ
... :: : . :.:::: :..:..: .:. ::::::: : .::. : ::.: ::
CCDS69 TTPEEVPTGTKSHRCDECGKCFTRSSSLIRHKIIHTGEKPYECSECGKAFSLNSNLVLHQ
330 340 350 360 370 380
440 450 460 470 480 490
pF1KB7 STHSRDKHFKCEECGET-CHISNLFRHQRLHKGERPYKCEECEKSFKQRSDLFKHHRIHT
:. .: .:.:::.. : :::. :::.:.::.::.:.:: :.:.: ::: ::.::::
CCDS69 RIHTGEKPHECNECGKAFSHSSNLILHQRIHSGEKPYECNECGKAFSQSSDLTKHQRIHT
390 400 410 420 430 440
500 510 520 530 540 550
pF1KB7 GEKPYGCSVCGKRFNQSATLIKHQRIHTGEKPYKCLECGERFRQSTHLIRHQRIHQNKVL
::::: :: ::: ::... :: :.:::: :::::: .::. : .:. : :.:::
CCDS69 GEKPYECSECGKAFNRNSYLILHRRIHTREKPYKCTKCGKAFTRSSTLTLHHRIHARERA
450 460 470 480 490 500
560
pF1KB7 SAGRGGSRL
CCDS69 SEYSPASLDAFGAFLKSCV
510 520
>>CCDS14649.1 ZNF449 gene_id:203523|Hs108|chrX (518 aa)
initn: 1921 init1: 458 opt: 1094 Z-score: 762.0 bits: 150.7 E(32554): 4e-36
Smith-Waterman score: 1110; 37.6% identity (64.7% similar) in 518 aa overlap (59-547:25-513)
30 40 50 60 70 80
pF1KB7 APSQRDGLLPVKVEEDSPGSWEPNYPAASPDPETSRLHFRQLRYQEVAGPEEALSRLREL
: :. : .:::..:.:.:::.::...: ::
CCDS14 MAVALGCAIQASLNQGSVFQEYDTDCEVFRQRFRQFQYREAAGPHEAFNKLWEL
10 20 30 40 50
90 100 110 120 130 140
pF1KB7 CRRWLRPELLSKEQILELLVLEQFLTILPEELQAWVREHCPESGEEAVAVVRALQRALDG
: .::.:.. ::::::::::::::::::: :...::::::::. :..:.... ::: :.
CCDS14 CCQWLKPKMRSKEQILELLVLEQFLTILPTEIETWVREHCPENRERVVSLIEDLQRELEI
60 70 80 90 100 110
150 160 170 180 190 200
pF1KB7 TSSQGMVTFEDTAVSLTWEEWERLDPARRDFCRESAQKDSGSTVPPSLESRVENKELIPM
.: : ..: . :.: :. . . .::... .:. :
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:.. :. .. . ::. :. : .. :.: : . . : ::: ..::: :
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.. :.. ... .: : .::.:.. ... . . .: . . : ..
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.. :.. . .... ... .. :.. ..:.: : ... :.:..:
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. . : :.: :: :.:. :. ::: : : .:. : ::::::::::: .:.. ::: .
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CCDS14 LIMHQVTHFRGLI
510
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CCDS46 Q
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CCDS54 GEKPFKCNECGRFFRENSTLVRHQRVHTGAKPYECRECGKFFSQSSTLMQHRKVHIGEKP
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. .. :. : .: : . .:: :. . ::: ...:: .: . . . :. .
CCDS72 DVMLENYGNLVSVGLLS--SKPKLIT--QLEQGAEPWTEVREAPSGTHAVEDYWFETKMS
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CCDS72 ISHQRNHTSEKPHKCKECGIAFMNSSSLLNHHKVHAGKQPYRCIECGKFLKKHSTFINHQ
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CCDS72 RIHSREKPHKCIECGKTFRKNSILLSHQRIHTGQKPYKCNDCGKAFAQNAALTRHERIHS
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CCDS72 GEKPFKCNKCGRAFRDNSTVLEHQKIHTGEKPYQCNECGKAFRKSSTLISHQRMHTGEKP
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CCDS72 YHCSKCGKSFRYSSSFAGHQKTHSGNKPYQCRDCGKAFTKSSTLTGHQRIHTGEKPYHCK
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CCDS72 KCGKAFRHSSGLVEHQRLHTGEKPYKCNECGKAFPRSSALKQHKKIHNKERAMKCS
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CCDS54 MAAAALRDPAQGYVTFEDVAVYFSQEEWRLLDDAQRLLY
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CCDS54 RNVMLENFTLLASLGLASSKTHEITQLESWEEPFMPAWEVVTSAIPRGCWHGAEAEEAPE
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