Result of FASTA (ccds) for
pF1KB7873
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7873, 570 aa
1>>>pF1KB7873 570 - 570 aa - 570 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.0110+/-0.00124; mu= 6.2955+/- 0.073
mean_var=256.8295+/-56.774, 0's: 0 Z-trim(109.5): 836 B-trim: 559 in 1/52
Lambda= 0.080030
statistics sampled from 9946 (10913) to 9946 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.676), E-opt: 0.2 (0.335), width: 16
Scan time: 2.660
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS4801.1 ZNF76 gene_id:7629|Hs108|chr6 ( 570) 3782 450.8 2.1e-126
CCDS75435.1 ZNF76 gene_id:7629|Hs108|chr6 ( 515) 3040 365.1 1.2e-100
CCDS60721.1 ZNF143 gene_id:7702|Hs108|chr11 ( 607) 1913 235.0 2e-61
CCDS60720.1 ZNF143 gene_id:7702|Hs108|chr11 ( 637) 1913 235.1 2.1e-61
CCDS7799.2 ZNF143 gene_id:7702|Hs108|chr11 ( 638) 1913 235.1 2.1e-61
CCDS32915.1 ZNF700 gene_id:90592|Hs108|chr19 ( 742) 651 89.4 1.7e-17
CCDS74289.1 ZNF700 gene_id:90592|Hs108|chr19 ( 745) 651 89.4 1.7e-17
CCDS43307.1 PRDM9 gene_id:56979|Hs108|chr5 ( 894) 632 87.3 8.6e-17
CCDS55929.1 ZNF410 gene_id:57862|Hs108|chr14 ( 516) 606 84.0 4.8e-16
CCDS75904.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 364) 602 83.4 5.3e-16
CCDS69664.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 474) 602 83.5 6.3e-16
CCDS6871.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 498) 602 83.6 6.5e-16
CCDS55931.1 ZNF410 gene_id:57862|Hs108|chr14 ( 405) 599 83.1 7.2e-16
CCDS9821.1 ZNF410 gene_id:57862|Hs108|chr14 ( 478) 599 83.2 8e-16
CCDS35106.1 ZNF483 gene_id:158399|Hs108|chr9 ( 744) 599 83.4 1.1e-15
CCDS6437.1 ZNF16 gene_id:7564|Hs108|chr8 ( 682) 591 82.5 1.9e-15
CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 616) 590 82.3 1.9e-15
CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 658) 590 82.3 2e-15
CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 670) 590 82.3 2e-15
CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 682) 590 82.3 2.1e-15
CCDS62707.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 665) 586 81.9 2.8e-15
CCDS62708.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 667) 586 81.9 2.8e-15
CCDS12639.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 692) 586 81.9 2.9e-15
CCDS55930.1 ZNF410 gene_id:57862|Hs108|chr14 ( 431) 580 80.9 3.4e-15
CCDS45460.1 ZNF771 gene_id:51333|Hs108|chr16 ( 317) 577 80.4 3.6e-15
CCDS46101.1 ZNF234 gene_id:10780|Hs108|chr19 ( 700) 581 81.3 4.3e-15
CCDS30676.1 MTF1 gene_id:4520|Hs108|chr1 ( 753) 581 81.3 4.5e-15
CCDS55282.1 ZNF250 gene_id:58500|Hs108|chr8 ( 555) 578 80.8 4.7e-15
CCDS6787.1 ZFP37 gene_id:7539|Hs108|chr9 ( 630) 579 81.0 4.8e-15
CCDS65109.1 ZFP37 gene_id:7539|Hs108|chr9 ( 631) 579 81.0 4.8e-15
CCDS34972.1 ZNF250 gene_id:58500|Hs108|chr8 ( 560) 578 80.8 4.8e-15
CCDS65110.1 ZFP37 gene_id:7539|Hs108|chr9 ( 645) 579 81.0 4.8e-15
CCDS43590.1 ZNF479 gene_id:90827|Hs108|chr7 ( 524) 577 80.7 5e-15
CCDS10701.1 ZNF668 gene_id:79759|Hs108|chr16 ( 619) 578 80.9 5.1e-15
CCDS54003.1 ZNF668 gene_id:79759|Hs108|chr16 ( 642) 578 80.9 5.2e-15
CCDS7194.1 ZNF248 gene_id:57209|Hs108|chr10 ( 579) 575 80.5 6.2e-15
CCDS42639.1 ZNF154 gene_id:7710|Hs108|chr19 ( 437) 572 80.0 6.6e-15
CCDS31418.1 ZNF214 gene_id:7761|Hs108|chr11 ( 606) 571 80.1 8.8e-15
CCDS46102.1 ZNF226 gene_id:7769|Hs108|chr19 ( 803) 573 80.5 9e-15
CCDS12974.1 ZNF8 gene_id:7554|Hs108|chr19 ( 575) 570 79.9 9.2e-15
CCDS42496.1 ZNF846 gene_id:162993|Hs108|chr19 ( 533) 569 79.8 9.5e-15
CCDS35075.1 ZNF782 gene_id:158431|Hs108|chr9 ( 699) 571 80.2 9.6e-15
CCDS14279.1 ZNF41 gene_id:7592|Hs108|chrX ( 779) 571 80.2 1e-14
CCDS47352.1 ZNF879 gene_id:345462|Hs108|chr5 ( 563) 567 79.6 1.2e-14
CCDS45463.1 ZNF629 gene_id:23361|Hs108|chr16 ( 869) 570 80.2 1.2e-14
CCDS12099.1 ZNF77 gene_id:58492|Hs108|chr19 ( 545) 566 79.4 1.2e-14
CCDS9257.1 ZNF664 gene_id:144348|Hs108|chr12 ( 261) 560 78.4 1.2e-14
CCDS11180.1 ZNF624 gene_id:57547|Hs108|chr17 ( 865) 569 80.0 1.3e-14
CCDS59367.1 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 ( 803) 568 79.9 1.3e-14
CCDS12413.2 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 ( 809) 568 79.9 1.3e-14
>>CCDS4801.1 ZNF76 gene_id:7629|Hs108|chr6 (570 aa)
initn: 3782 init1: 3782 opt: 3782 Z-score: 2382.8 bits: 450.8 E(32554): 2.1e-126
Smith-Waterman score: 3782; 100.0% identity (100.0% similar) in 570 aa overlap (1-570:1-570)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MESLGLHTVTLSDGTTAYVQQAVKGEKLLEGQVIQLEDGTTAYIHQVTVQKEALSFEDGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 MESLGLHTVTLSDGTTAYVQQAVKGEKLLEGQVIQLEDGTTAYIHQVTVQKEALSFEDGQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 PVQLEDGSMAYIHRTPREGYDPSTLEAVQLEDGSTAYIHHPVAVPSESTILAVQTEVGLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 PVQLEDGSMAYIHRTPREGYDPSTLEAVQLEDGSTAYIHHPVAVPSESTILAVQTEVGLE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 DLAAEDDEGFSADAVVALEQYASKVLHDSQIPRNGKGQQVGDRAFRCGYKGCGRLYTTAH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 DLAAEDDEGFSADAVVALEQYASKVLHDSQIPRNGKGQQVGDRAFRCGYKGCGRLYTTAH
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 HLKVHERAHTGDRPYRCDFPSCGKAFATGYGLKSHVRTHTGEKPYKCPEELCSKAFKTSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 HLKVHERAHTGDRPYRCDFPSCGKAFATGYGLKSHVRTHTGEKPYKCPEELCSKAFKTSG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 DLQKHVRTHTGERPFQCPFEGCGRSFTTSNIRKVHVRTHTGERPYTCPEPHCGRGFTSAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 DLQKHVRTHTGERPFQCPFEGCGRSFTTSNIRKVHVRTHTGERPYTCPEPHCGRGFTSAT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 NYKNHVRIHTGEKPYVCTVPGCGKRFTEYSSLYKHHVVHTHCKPYTCSTCGKTYRQTSTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 NYKNHVRIHTGEKPYVCTVPGCGKRFTEYSSLYKHHVVHTHCKPYTCSTCGKTYRQTSTL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 AMHKRSAHGELEATEESEQALYEQQQLEAASAAEESPPPKRPRIAYLSEVKEERDDIPAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 AMHKRSAHGELEATEESEQALYEQQQLEAASAAEESPPPKRPRIAYLSEVKEERDDIPAQ
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 VAMVTEEDGAPQVALITQDGAQQVSLSPEDLQALGSAISMVTQHGSTTLTIPSPDADLAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 VAMVTEEDGAPQVALITQDGAQQVSLSPEDLQALGSAISMVTQHGSTTLTIPSPDADLAT
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB7 SGTHTVTMVSADGTQTQPVTIITSGAVVAEDSSVASLRHQQVALLATANGTHIAVQLEEQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 SGTHTVTMVSADGTQTQPVTIITSGAVVAEDSSVASLRHQQVALLATANGTHIAVQLEEQ
490 500 510 520 530 540
550 560 570
pF1KB7 QTLEEAINVATAAMQQGAVTLETTVSESGC
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 QTLEEAINVATAAMQQGAVTLETTVSESGC
550 560 570
>>CCDS75435.1 ZNF76 gene_id:7629|Hs108|chr6 (515 aa)
initn: 4054 init1: 3027 opt: 3040 Z-score: 1920.3 bits: 365.1 E(32554): 1.2e-100
Smith-Waterman score: 3320; 90.4% identity (90.4% similar) in 570 aa overlap (1-570:1-515)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MESLGLHTVTLSDGTTAYVQQAVKGEKLLEGQVIQLEDGTTAYIHQVTVQKEALSFEDGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 MESLGLHTVTLSDGTTAYVQQAVKGEKLLEGQVIQLEDGTTAYIHQVTVQKEALSFEDGQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 PVQLEDGSMAYIHRTPREGYDPSTLEAVQLEDGSTAYIHHPVAVPSESTILAVQTEVGLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 PVQLEDGSMAYIHRTPREGYDPSTLEAVQLEDGSTAYIHHPVAVPSESTILAVQTEVGLE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 DLAAEDDEGFSADAVVALEQYASKVLHDSQIPRNGKGQQVGDRAFRCGYKGCGRLYTTAH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 DLAAEDDEGFSADAVVALEQYASKVLHDSQIPRNGKGQQVGDRAFRCGYKGCGRLYTTAH
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 HLKVHERAHTGDRPYRCDFPSCGKAFATGYGLKSHVRTHTGEKPYKCPEELCSKAFKTSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 HLKVHERAHTGDRPYRCDFPSCGKAFATGYGLKSHVRTHTGEKPYKCPEELCSKAFKTSG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 DLQKHVRTHTGERPFQCPFEGCGRSFTTSNIRKVHVRTHTGERPYTCPEPHCGRGFTSAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 DLQKHVRTHTGERPFQCPFEGCGRSFTTSNIRKVHVRTHTGERPYTCPEPHCGRGFTSAT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 NYKNHVRIHTGEKPYVCTVPGCGKRFTEYSSLYKHHVVHTHCKPYTCSTCGKTYRQTSTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 NYKNHVRIHTGEKPYVCTVPGCGKRFTEYSSLYKHHVVHTHCKPYTCSTCGKTYRQTSTL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 AMHKRSAHGELEATEESEQALYEQQQLEAASAAEESPPPKRPRIAYLSEVKEERDDIPAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 AMHKRSAHGELEATEESEQALYEQQQLEAASAAEESPPPKRPRIAYLSEVKEERDDIPAQ
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 VAMVTEEDGAPQVALITQDGAQQVSLSPEDLQALGSAISMVTQHGSTTLTIPSPDADLAT
:::::::::::::::::::::::
CCDS75 VAMVTEEDGAPQVALITQDGAQQ-------------------------------------
430 440
490 500 510 520 530 540
pF1KB7 SGTHTVTMVSADGTQTQPVTIITSGAVVAEDSSVASLRHQQVALLATANGTHIAVQLEEQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 ------------------VTIITSGAVVAEDSSVASLRHQQVALLATANGTHIAVQLEEQ
450 460 470 480
550 560 570
pF1KB7 QTLEEAINVATAAMQQGAVTLETTVSESGC
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 QTLEEAINVATAAMQQGAVTLETTVSESGC
490 500 510
>>CCDS60721.1 ZNF143 gene_id:7702|Hs108|chr11 (607 aa)
initn: 2265 init1: 1374 opt: 1913 Z-score: 1216.3 bits: 235.0 E(32554): 2e-61
Smith-Waterman score: 2088; 57.0% identity (77.1% similar) in 577 aa overlap (23-557:36-600)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MESLGLHTVTLSDGTTAYVQQAVKGEKLLEGQVIQLEDGTTAYIHQVTVQK-
: ::..:::::::::..::...: . :
CCDS60 INRDSQGMTEFPGGGMEAQHVTLCLTEAVTVADAKLIDGQVIQLEDGSAAYVQHVPIPKS
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100
pF1KB7 --EALSFEDGQPVQLEDGSMAYIHRTPREGYDPSTLEAVQLEDGSTAYIHHPVAVPSEST
..: .:::: ::::::. :.::.: ...:: :.:.:::::::.:::::: : ::. .:
CCDS60 TGDSLRLEDGQAVQLEDGTTAFIHHTSKDSYDQSALQAVQLEDGTTAYIHHAVQVPQSDT
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150
pF1KB7 ILAVQTEVGLEDLAAEDDEGFSADAVVALEQYASKVLHDS-------------------Q
:::.:.. . : . : .. :.. ::::::.:: :. :
CCDS60 ILAIQADGTVAGLHT-GDATIDPDTISALEQYAAKVSIDGSESVAGTGMIGENEQEKKMQ
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200
pF1KB7 IPRNG-------KGQQVGDRAFRCGYKGCGRLYTTAHHLKVHERAHTGDRPYRCDFPSCG
: .: :.:: :..:::: : :::.:::::::::::::.:::::::.:. .::
CCDS60 IVLQGHATRVTAKSQQSGEKAFRCEYDGCGKLYTTAHHLKVHERSHTGDRPYQCEHAGCG
190 200 210 220 230 240
210 220 230 240 250 260
pF1KB7 KAFATGYGLKSHVRTHTGEKPYKCPEELCSKAFKTSGDLQKHVRTHTGERPFQCPFEGCG
::::::::::::::::::::::.: :. :.:.::::::::::.:::::::::.:::::::
CCDS60 KAFATGYGLKSHVRTHTGEKPYRCSEDNCTKSFKTSGDLQKHIRTHTGERPFKCPFEGCG
250 260 270 280 290 300
270 280 290 300 310 320
pF1KB7 RSFTTSNIRKVHVRTHTGERPYTCPEPHCGRGFTSATNYKNHVRIHTGEKPYVCTVPGCG
:::::::::::::::::::::: : :: :::.:.:::::::::::::::::::::::::
CCDS60 RSFTTSNIRKVHVRTHTGERPYYCTEPGCGRAFASATNYKNHVRIHTGEKPYVCTVPGCD
310 320 330 340 350 360
330 340 350 360 370 380
pF1KB7 KRFTEYSSLYKHHVVHTHCKPYTCSTCGKTYRQTSTLAMHKRSAHGELEATEESEQALYE
:::::::::::::::::: :::.:. :::::.: ::::::::.::.. : :: ..:..:
CCDS60 KRFTEYSSLYKHHVVHTHSKPYNCNHCGKTYKQISTLAMHKRTAHNDTEPIEEEQEAFFE
370 380 390 400 410 420
390 400 410 420 430 440
pF1KB7 QQQLEAASAAEESPPPKRPRIAYLSEVKEERDDI-PAQVAMVTEEDGAPQVALITQDGAQ
.. .. . : .:.:.. : : ::. .::: ::. . ::.::.:::.:
CCDS60 PPPGQGEDVLKGS------QITYVTGV--EGDDVVSTQVATVTQSGLSQQVTLISQDGTQ
430 440 450 460 470
450 460 470 480 490 500
pF1KB7 QVSLSPEDLQALGSAISMVTQHGSTTLTIPSPDADLATSGTHTVTMVSADGTQTQPVTII
.:..: :.::.:..:.:::: : : .:.:. :: ....:::.:.::.:.::. . :.:.
CCDS60 HVNISQADMQAIGNTITMVTQDG-TPITVPAHDAVISSAGTHSVAMVTAEGTEGEQVAIV
480 490 500 510 520 530
510 520 530 540 550
pF1KB7 TSGAVVAEDSSVASLRHQQ------------VALLATANGTHIAVQLEEQQTLEEAINVA
.. ..: .. . . ::: ..:.::.:::.::::: :: .::::: .:
CCDS60 AQD-LAAFHTASSEMGHQQHSHHLVTTETRPLTLVATSNGTQIAVQLGEQPSLEEAIRIA
540 550 560 570 580 590
560 570
pF1KB7 TAAMQQGAVTLETTVSESGC
. .:::
CCDS60 SR-IQQGETPGLDD
600
>>CCDS60720.1 ZNF143 gene_id:7702|Hs108|chr11 (637 aa)
initn: 2268 init1: 1374 opt: 1913 Z-score: 1216.0 bits: 235.1 E(32554): 2.1e-61
Smith-Waterman score: 2173; 57.0% identity (77.9% similar) in 598 aa overlap (1-557:45-630)
10 20 30
pF1KB7 MESLGLHTVTLSDGTTAYVQQAVKGEKLLE
::...:..:::.::.:::.:. : ::..
CCDS60 EFPGGGMEAQHVTLCLTEAVTVADGDNLENMEGVSLQAVTLADGSTAYIQHNSKDAKLID
20 30 40 50 60 70
40 50 60 70 80
pF1KB7 GQVIQLEDGTTAYIHQVTVQK--EALSFEDGQPVQLEDGSMAYIHRTPREGYDPSTLEAV
:::::::::..::...: . : ..: .:::: ::::::. :.::.: ...:: :.:.::
CCDS60 GQVIQLEDGSAAYVQHVPIPKSRDSLRLEDGQAVQLEDGTTAFIHHTSKDSYDQSALQAV
80 90 100 110 120 130
90 100 110 120 130 140
pF1KB7 QLEDGSTAYIHHPVAVPSESTILAVQTEVGLEDLAAEDDEGFSADAVVALEQYASKVLHD
:::::.:::::: : ::. .::::.:.. . : . : .. :.. ::::::.:: :
CCDS60 QLEDGTTAYIHHAVQVPQSDTILAIQADGTVAGLHT-GDATIDPDTISALEQYAAKVSID
140 150 160 170 180 190
150 160 170 180
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. :: .: :.:: :..:::: : :::.::::::::
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190 200 210 220 230 240
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:::::.:::::::.:. .::::::::::::::::::::::::.: :. :.:.:::::::
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250 260 270 280 290 300
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:::.:::::::::.::::::::::::::::::::::::::::: : :: :::.:.:::::
CCDS60 QKHIRTHTGERPFKCPFEGCGRSFTTSNIRKVHVRTHTGERPYYCTEPGCGRAFASATNY
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310 320 330 340 350 360
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:::::::::::::::::::: :::::::::::::::::: :::.:. :::::.: :::::
CCDS60 KNHVRIHTGEKPYVCTVPGCDKRFTEYSSLYKHHVVHTHSKPYNCNHCGKTYKQISTLAM
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370 380 390 400 410 420
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:::.::.. : :: ..:..: .. .. . : .:.:.. : : ::. .::
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: ::. . ::.::.:::.:.:..: :.::.:..:.:::: : : .:.:. :: ....
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490 500 510 520
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10 20 30
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40 50 60 70 80
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:::::::::..::...: . : ..: .:::: ::::::. :.::.: ...:: :.:.:
CCDS77 GQVIQLEDGSAAYVQHVPIPKSTGDSLRLEDGQAVQLEDGTTAFIHHTSKDSYDQSALQA
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90 100 110 120 130 140
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CCDS77 VQLEDGTTAYIHHAVQVPQSDTILAIQADGTVAGLHT-GDATIDPDTISALEQYAAKVSI
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CCDS77 DGSESVAGTGMIGENEQEKKMQIVLQGHATRVTAKSQQSGEKAFRCEYDGCGKLYTTAHH
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::::::.:::::::.:. .::::::::::::::::::::::::.: :. :.:.::::::
CCDS77 LKVHERSHTGDRPYQCEHAGCGKAFATGYGLKSHVRTHTGEKPYRCSEDNCTKSFKTSGD
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::::.:::::::::.::::::::::::::::::::::::::::: : :: :::.:.::::
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::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::: :::.:. :::::.: ::::
CCDS77 YKNHVRIHTGEKPYVCTVPGCDKRFTEYSSLYKHHVVHTHSKPYNCNHCGKTYKQISTLA
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::::.::.. : :: ..:..: .. .. . : .:.:.. : : ::. .:
CCDS77 MHKRTAHNDTEPIEEEQEAFFEPPPGQGEDVLKGS------QITYVTGV--EGDDVVSTQ
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:: ::. . ::.::.:::.:.:..: :.::.:..:.:::: : : .:.:. :: ...
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490 500 510 520
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.:::.:.::.:.::. . :.:... ..: .. . . ::: ..:.::.
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pF1KB7 NGTHIAVQLEEQQTLEEAINVATAAMQQGAVTLETTVSESGC
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CCDS77 NGTQIAVQLGEQPSLEEAIRIASR-IQQGETPGLDD
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. ::.:: :.:::..::.: ::::: :. .:.: .::.:::: .:
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CCDS74 TSHLRVHGRTHTGEKPYECK--ECGKAFRYVKHLQIHERTEKHIRMPSGERPYKC--SIC
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pF1KB7 SKAFKTSGDLQKHVRTHTGERPFQCPFEGCGRSFTTSNIRKVHVRTHTGERPYTCPEPHC
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CCDS74 EKGFYSAKSFQTHEKTHTGEKPYEC--NQCGKAFRCCNSLRYHERTHTGEKPYECKQ--C
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CCDS74 GKAFRSASHLRMHERTHTGEKPYECK--QCGKAFSCASNLRKHGRTHTGEKPYECKQCGK
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..:..:.: ::.:. :: .: :.:.
CCDS74 AFRSASNLQMHERTHTGEKPYECKECEKAFCKFSSFQIHERKHRGEKPYECKHCGNGFTS
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:::::.:. : . :::.: .. : ::::::.::.: : ::::: . .: .: :
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pF1KB7 IHTGEKPYVCTVPGCGKRFTEYSSLYKHHVVHTHCKPYTCSTCGKTYRQTSTLAMHKRSA
::::::::: ::. :.. : : .:. .:: :::.: ::. .:. : : :.:.
CCDS43 THTGEKPYVCRE--CGRGFSNKSHLLRHQRTHTGEKPYVCRECGRGFRNKSHLLRHQRTH
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pF1KB7 HGELEATEESEQALYEQQQLEAASAAEESPPPKRPRIAYLSEVKEERDDIPAQVAMVTEE
::
CCDS43 TGEKPYVCRECGRGFSDRSSLCYHQRTHTGEKPYVCREDE
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:: :: : :...: . .. :..:: .
CCDS55 KNAKTSSNGENVHLGSGDGQSKDSGPLPQVEKKLKCTVEGCDRTFVWPAHFKYHLKTHRN
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pF1KB7 ERPFQCPFEGCGRSFTTSNIRKVHVRTHTGERPYTCPEPHCGRGFTSATNYKNHVRIHTG
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CCDS55 DRSFICPAEGCGKSFYVLQRLKVHMRTHNGEKPFMCHESGCGKQFTTAGNLKNHRRIHTG
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pF1KB7 EKPYVCTVPGCGKRFTEYSSLYKHHVVHTHCKPYTCSTCGKTYRQTSTLAMHKRSAHGEL
:::..: . :::. :.::::: :: :::. ::. :..::::. :... .: :. : .:
CCDS55 EKPFLCEAQGCGRSFAEYSSLRKHLVVHSGEKPHQCQVCGKTFSQSGSRNVHMRKHHLQL
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pF1KB7 EATEESEQALYEQQQLEAASAAEESPPPKRPRIAYLSE--VKEERDDIPAQVAMVTEEDG
:. .:: . : ..: ::. :.. ... :. . : ..: ... .:
CCDS55 GAAGSQEQE-QTAEPLMGSSLLEEASVPSKNLVSMNSQPSLGGESLNLPNTNSILGVDD-
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pF1KB7 APQVALITQDGAQQVSLSPEDLQALGSAISMVTQHGSTTLTIPSPDADLATSGTHTVTMV
.... . ...: :. . : . : .. ..:: .:. .::
CCDS55 ----EVLAEGSPRSLSSVPDVTHHLVTMQSGRQSYEVSVLTAVNPQESLAPLPRLECSGA
450 460 470 480 490
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pF1KB7 SADGTQTQPVTIITSGAVVAEDSSVASLRHQQVALLATANGTHIAVQLEEQQTLEEAINV
CCDS55 FSAHCNLCLPGSSDSPASAS
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pF1KB7 GFSADAVVALEQYASKVLHDSQIPRNGKGQQVGDRAFRCGYKGCGRLYTTAHHLKVHERA
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CCDS75 RIHTGEKPYKCSECGRAFSQNANLTKHQRTHTGEKPYRCSE--CEKAFSDCSALVQHQRI
110 120 130 140 150 160
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pF1KB7 HTGDRPYRCDFPSCGKAFATGYGLKSHVRTHTGEKPYKCPEELCSKAFKTSGDLQKHVRT
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CCDS75 HTGEKPYECS--DCGKAFRHSANLTNHQRTHTGEKPYKCSE--CGKAFSYCAAFIQHQRI
170 180 190 200 210 220
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pF1KB7 HTGERPFQCPFEGCGRSFTTSNIRKVHVRTHTGERPYTCPEPHCGRGFTSATNYKNHVRI
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CCDS75 HTGEKPYRC--AACGKAFSQSANLTNHQRTHTGEKPYKCSE--CGKAFSQSTNLIIHQKT
230 240 250 260 270
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::::::: :. ::: :.: :.: .::..:: ::: :. :::.. :.:.:..:.: :
CCDS75 HTGEKPYKCNE--CGKFFSESSALIRHHIIHTGEKPYECNECGKAFNQSSSLSQHQR-IH
280 290 300 310 320 330
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.. : ::
CCDS75 TGVKPYECSECGKAFRCSSAFVRHQRLHAGE
340 350 360
570 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 21:12:58 2016 done: Fri Nov 4 21:12:59 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]