Result of FASTA (ccds) for pF1KB7910
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB7910, 330 aa
  1>>>pF1KB7910 330 - 330 aa - 330 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.1352+/-0.000907; mu= 9.4197+/- 0.054
 mean_var=197.8019+/-39.367, 0's: 0 Z-trim(113.0): 929  B-trim: 0 in 0/53
 Lambda= 0.091192
 statistics sampled from 12713 (13727) to 12713 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.759), E-opt: 0.2 (0.422), width:  16
 Scan time:  2.750

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS6957.1 GFI1B gene_id:8328|Hs108|chr9           ( 330) 2348 321.0 8.1e-88
CCDS48049.1 GFI1B gene_id:8328|Hs108|chr9          ( 284) 1200 169.9 2.1e-42
CCDS30773.1 GFI1 gene_id:2672|Hs108|chr1           ( 422) 1126 160.4 2.4e-39
CCDS55157.1 FEZF1 gene_id:389549|Hs108|chr7        ( 425)  619 93.7 2.9e-19
CCDS34741.2 FEZF1 gene_id:389549|Hs108|chr7        ( 475)  619 93.7 3.1e-19
CCDS2897.1 FEZF2 gene_id:55079|Hs108|chr3          ( 459)  606 92.0 9.8e-19
CCDS33138.1 ZNF324B gene_id:388569|Hs108|chr19     ( 544)  602 91.6 1.6e-18
CCDS46162.1 ZNF836 gene_id:162962|Hs108|chr19      ( 936)  605 92.2 1.7e-18
CCDS4440.1 ZFP2 gene_id:80108|Hs108|chr5           ( 461)  594 90.4 2.9e-18
CCDS12981.1 ZNF324 gene_id:25799|Hs108|chr19       ( 553)  595 90.7   3e-18
CCDS56092.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19      ( 580)  595 90.7 3.1e-18
CCDS42558.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19      ( 644)  595 90.7 3.3e-18
CCDS46102.1 ZNF226 gene_id:7769|Hs108|chr19        ( 803)  595 90.9 3.8e-18
CCDS12974.1 ZNF8 gene_id:7554|Hs108|chr19          ( 575)  592 90.3 4.1e-18
CCDS5951.2 ZNF596 gene_id:169270|Hs108|chr8        ( 504)  591 90.1 4.1e-18
CCDS31418.1 ZNF214 gene_id:7761|Hs108|chr11        ( 606)  591 90.2 4.6e-18
CCDS47592.1 ZNF679 gene_id:168417|Hs108|chr7       ( 411)  587 89.5 5.2e-18
CCDS4645.1 ZKSCAN8 gene_id:7745|Hs108|chr6         ( 578)  589 89.9 5.4e-18
CCDS13812.1 ZNF70 gene_id:7621|Hs108|chr22         ( 446)  587 89.5 5.4e-18
CCDS42183.1 ZFP90 gene_id:146198|Hs108|chr16       ( 636)  588 89.8 6.3e-18
CCDS35075.1 ZNF782 gene_id:158431|Hs108|chr9       ( 699)  588 89.9 6.7e-18
CCDS46101.1 ZNF234 gene_id:10780|Hs108|chr19       ( 700)  588 89.9 6.7e-18
CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19        ( 616)  587 89.7 6.7e-18
CCDS233.1 ZNF436 gene_id:80818|Hs108|chr1          ( 470)  585 89.3 6.8e-18
CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19        ( 658)  587 89.7   7e-18
CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19        ( 670)  587 89.7 7.1e-18
CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19        ( 682)  587 89.7 7.2e-18
CCDS42538.1 ZNF100 gene_id:163227|Hs108|chr19      ( 542)  584 89.2 8.1e-18
CCDS12946.1 ZFP28 gene_id:140612|Hs108|chr19       ( 868)  587 89.8 8.4e-18
CCDS33121.1 ZNF582 gene_id:147948|Hs108|chr19      ( 517)  583 89.1 8.6e-18
CCDS32973.1 ZNF93 gene_id:81931|Hs108|chr19        ( 620)  584 89.3 8.9e-18
CCDS12412.1 ZNF493 gene_id:284443|Hs108|chr19      ( 646)  584 89.3 9.1e-18
CCDS32979.1 ZNF431 gene_id:170959|Hs108|chr19      ( 576)  583 89.1 9.3e-18
CCDS47944.1 ZNF251 gene_id:90987|Hs108|chr8        ( 671)  583 89.2   1e-17
CCDS42536.1 ZNF493 gene_id:284443|Hs108|chr19      ( 774)  584 89.4   1e-17
CCDS42535.1 ZNF626 gene_id:199777|Hs108|chr19      ( 528)  581 88.8 1.1e-17
CCDS12414.2 ZNF681 gene_id:148213|Hs108|chr19      ( 645)  582 89.0 1.1e-17
CCDS12959.2 ZNF551 gene_id:90233|Hs108|chr19       ( 670)  582 89.1 1.1e-17
CCDS82413.1 ZNF544 gene_id:27300|Hs108|chr19       ( 687)  582 89.1 1.1e-17
CCDS82341.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19      ( 527)  580 88.7 1.1e-17
CCDS12973.1 ZNF544 gene_id:27300|Hs108|chr19       ( 715)  582 89.1 1.2e-17
CCDS43429.1 ZNF391 gene_id:346157|Hs108|chr6       ( 358)  577 88.1 1.2e-17
CCDS9257.1 ZNF664 gene_id:144348|Hs108|chr12       ( 261)  574 87.5 1.3e-17
CCDS59367.1 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19         ( 803)  582 89.1 1.3e-17
CCDS12413.2 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19         ( 809)  582 89.1 1.3e-17
CCDS74321.1 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19         ( 818)  582 89.2 1.3e-17
CCDS12503.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19      ( 686)  580 88.8 1.4e-17
CCDS12211.1 ZNF559 gene_id:84527|Hs108|chr19       ( 538)  578 88.4 1.4e-17
CCDS74346.1 ZNF566 gene_id:84924|Hs108|chr19       ( 314)  574 87.6 1.4e-17
CCDS62531.1 ZNF559 gene_id:84527|Hs108|chr19       ( 602)  578 88.5 1.5e-17


>>CCDS6957.1 GFI1B gene_id:8328|Hs108|chr9                (330 aa)
 initn: 2348 init1: 2348 opt: 2348  Z-score: 1690.1  bits: 321.0 E(32554): 8.1e-88
Smith-Waterman score: 2348; 100.0% identity (100.0% similar) in 330 aa overlap (1-330:1-330)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MPRSFLVKSKKAHTYHQPRVQEDEPLWPPALTPVPRDQAPSNSPVLSTLFPNQCLDWTNL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 MPRSFLVKSKKAHTYHQPRVQEDEPLWPPALTPVPRDQAPSNSPVLSTLFPNQCLDWTNL
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB7 KREPELEQDQNLARMAPAPEGPIVLSRPQDGDSPLSDSPPFYKPSFSWDTLATTYGHSYR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 KREPELEQDQNLARMAPAPEGPIVLSRPQDGDSPLSDSPPFYKPSFSWDTLATTYGHSYR
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB7 QAPSTMQSAFLEHSVSLYGSPLVPSTEPALDFSLRYSPGMDAYHCVKCNKVFSTPHGLEV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 QAPSTMQSAFLEHSVSLYGSPLVPSTEPALDFSLRYSPGMDAYHCVKCNKVFSTPHGLEV
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB7 HVRRSHSGTRPFACDICGKTFGHAVSLEQHTHVHSQERSFECRMCGKAFKRSSTLSTHLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 HVRRSHSGTRPFACDICGKTFGHAVSLEQHTHVHSQERSFECRMCGKAFKRSSTLSTHLL
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB7 IHSDTRPYPCQFCGKRFHQKSDMKKHTYIHTGEKPHKCQVCGKAFSQSSNLITHSRKHTG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 IHSDTRPYPCQFCGKRFHQKSDMKKHTYIHTGEKPHKCQVCGKAFSQSSNLITHSRKHTG
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330
pF1KB7 FKPFSCELCTKGFQRKVDLRRHRESQHNLK
       ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 FKPFSCELCTKGFQRKVDLRRHRESQHNLK
              310       320       330

>>CCDS48049.1 GFI1B gene_id:8328|Hs108|chr9               (284 aa)
 initn: 1697 init1: 1200 opt: 1200  Z-score: 874.6  bits: 169.9 E(32554): 2.1e-42
Smith-Waterman score: 1918; 86.1% identity (86.1% similar) in 330 aa overlap (1-330:1-284)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MPRSFLVKSKKAHTYHQPRVQEDEPLWPPALTPVPRDQAPSNSPVLSTLFPNQCLDWTNL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 MPRSFLVKSKKAHTYHQPRVQEDEPLWPPALTPVPRDQAPSNSPVLSTLFPNQCLDWTNL
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB7 KREPELEQDQNLARMAPAPEGPIVLSRPQDGDSPLSDSPPFYKPSFSWDTLATTYGHSYR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 KREPELEQDQNLARMAPAPEGPIVLSRPQDGDSPLSDSPPFYKPSFSWDTLATTYGHSYR
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB7 QAPSTMQSAFLEHSVSLYGSPLVPSTEPALDFSLRYSPGMDAYHCVKCNKVFSTPHGLEV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::          
CCDS48 QAPSTMQSAFLEHSVSLYGSPLVPSTEPALDFSLRYSPGMDAYHCVKCNK----------
              130       140       150       160       170          

              190       200       210       220       230       240
pF1KB7 HVRRSHSGTRPFACDICGKTFGHAVSLEQHTHVHSQERSFECRMCGKAFKRSSTLSTHLL
                                           ::::::::::::::::::::::::
CCDS48 ------------------------------------ERSFECRMCGKAFKRSSTLSTHLL
                                                  180       190    

              250       260       270       280       290       300
pF1KB7 IHSDTRPYPCQFCGKRFHQKSDMKKHTYIHTGEKPHKCQVCGKAFSQSSNLITHSRKHTG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 IHSDTRPYPCQFCGKRFHQKSDMKKHTYIHTGEKPHKCQVCGKAFSQSSNLITHSRKHTG
          200       210       220       230       240       250    

              310       320       330
pF1KB7 FKPFSCELCTKGFQRKVDLRRHRESQHNLK
       ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 FKPFSCELCTKGFQRKVDLRRHRESQHNLK
          260       270       280    

>>CCDS30773.1 GFI1 gene_id:2672|Hs108|chr1                (422 aa)
 initn: 1241 init1: 1126 opt: 1126  Z-score: 820.0  bits: 160.4 E(32554): 2.4e-39
Smith-Waterman score: 1127; 52.5% identity (71.6% similar) in 341 aa overlap (19-330:82-422)

                           10        20         30           40    
pF1KB7             MPRSFLVKSKKAHTYHQPRVQEDEPLW-PPALTPVP---RDQAPSNSP
                                     : .: : .: ::. .  :   ... :: . 
CCDS30 RDRLSPESQLTEAPDRASASPDSCEGSVCERSSEFEDFWRPPSPSASPASEKSMCPSLDE
              60        70        80        90       100       110 

           50        60                    70           80         
pF1KB7 VLSTLFPNQCLDWTNL----------KREP--ELEQDQNLARM---APAPEGPIVLSRPQ
       .    .: .  .:..:          . .:   ::.  .:. .   :: :  : .:  :.
CCDS30 AQPFPLPFKPYSWSGLAGSDLRHLVQSYRPCGALERGAGLGLFCEPAPEPGHPAALYGPK
             120       130       140       150       160       170 

      90       100                 110       120       130         
pF1KB7 DGDSPLSDSPP---------FYKPSFS-WDTLATTYGHSYRQAPSTMQSAFLEHSVSLYG
        . .  . . :            :... .  .... .  :..  ..    . :.. .:..
CCDS30 RAAGGAGAGAPGSCSAGAGATAGPGLGLYGDFGSAAAGLYERPTAAAGLLYPERGHGLHA
             180       190       200       210       220       230 

     140       150       160       170       180       190         
pF1KB7 SPLVPSTEPALDFSLRYSPGMDAYHCVKCNKVFSTPHGLEVHVRRSHSGTRPFACDICGK
       .  .     .  .  :   :  .:.:.::.:::::::::::::::::::::::::..:::
CCDS30 DKGAGVKVESELLCTRLLLGGGSYKCIKCSKVFSTPHGLEVHVRRSHSGTRPFACEMCGK
             240       250       260       270       280       290 

     200       210       220       230       240       250         
pF1KB7 TFGHAVSLEQHTHVHSQERSFECRMCGKAFKRSSTLSTHLLIHSDTRPYPCQFCGKRFHQ
       :::::::::::  ::::::::.:..:::.:::::::::::::::::::::::.:::::::
CCDS30 TFGHAVSLEQHKAVHSQERSFDCKICGKSFKRSSTLSTHLLIHSDTRPYPCQYCGKRFHQ
             300       310       320       330       340       350 

     260       270       280       290       300       310         
pF1KB7 KSDMKKHTYIHTGEKPHKCQVCGKAFSQSSNLITHSRKHTGFKPFSCELCTKGFQRKVDL
       ::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:.:: :::::::::
CCDS30 KSDMKKHTFIHTGEKPHKCQVCGKAFSQSSNLITHSRKHTGFKPFGCDLCGKGFQRKVDL
             360       370       380       390       400       410 

     320       330
pF1KB7 RRHRESQHNLK
       :::::.::.::
CCDS30 RRHRETQHGLK
             420  

>>CCDS55157.1 FEZF1 gene_id:389549|Hs108|chr7             (425 aa)
 initn: 1576 init1: 557 opt: 619  Z-score: 459.5  bits: 93.7 E(32554): 2.9e-19
Smith-Waterman score: 619; 40.9% identity (69.8% similar) in 215 aa overlap (116-328:165-374)

          90       100       110       120       130       140     
pF1KB7 SRPQDGDSPLSDSPPFYKPSFSWDTLATTYGHSYRQAPSTMQSAFLEHSVSLYGSPLVPS
                                     : ....  ... . ....:..: .  .. .
CCDS55 ALPLQQYKLPKTYLAERNKLVVPAVEKYPSGVAFKDLSQAQLQHYMKESAQLLSEKIAFK
          140       150       160       170       180       190    

         150       160         170       180       190       200   
pF1KB7 TEPALDFSLRYSPGMD--AYHCVKCNKVFSTPHGLEVHVRRSHSGTRPFACDICGKTFGH
       :    ::: : ::.    .. :  :.:::.. ..:  :.   :.:.:::.: .::: : .
CCDS55 TS---DFS-RGSPNAKPKVFTCEVCGKVFNAHYNLTRHMP-VHTGARPFVCKVCGKGFRQ
              200       210       220       230        240         

           210       220       230       240       250       260   
pF1KB7 AVSLEQHTHVHSQERSFECRMCGKAFKRSSTLSTHLLIHSDTRPYPCQFCGKRFHQKSDM
       : .: .:  .:.::.  .: .:::::.:::::.::  ::.  .:. :.:::: ::::...
CCDS55 ASTLCRHKIIHTQEKPHKCNQCGKAFNRSSTLNTHTRIHAGYKPFVCEFCGKGFHQKGNY
     250       260       270       280       290       300         

           270       280       290       300       310       320   
pF1KB7 KKHTYIHTGEKPHKCQVCGKAFSQSSNLITHSRKHTGFKPFSCELCTKGFQRKVDLRRHR
       :.:   :.:::  ::..:.::: :  ::  : . :.  :::.:  : ::: :. ::..: 
CCDS55 KNHKLTHSGEKQFKCNICNKAFHQVYNLTFHMHTHNDKKPFTCPTCGKGFCRNFDLKKHV
     310       320       330       340       350       360         

           330                                                 
pF1KB7 ESQHNLK                                                 
       .. :.                                                   
CCDS55 RKLHDSSLGLARTPAGEPGTEPPPPLPQQPPMTLPPLQPPLPTPGPLQPGLHQGHQ
     370       380       390       400       410       420     

>>CCDS34741.2 FEZF1 gene_id:389549|Hs108|chr7             (475 aa)
 initn: 1576 init1: 557 opt: 619  Z-score: 458.9  bits: 93.7 E(32554): 3.1e-19
Smith-Waterman score: 619; 40.9% identity (69.8% similar) in 215 aa overlap (116-328:215-424)

          90       100       110       120       130       140     
pF1KB7 SRPQDGDSPLSDSPPFYKPSFSWDTLATTYGHSYRQAPSTMQSAFLEHSVSLYGSPLVPS
                                     : ....  ... . ....:..: .  .. .
CCDS34 FLSSPLHPQPKTYLAERNKLVVPAVEKYPSGVAFKDLSQAQLQHYMKESAQLLSEKIAFK
          190       200       210       220       230       240    

         150       160         170       180       190       200   
pF1KB7 TEPALDFSLRYSPGMD--AYHCVKCNKVFSTPHGLEVHVRRSHSGTRPFACDICGKTFGH
       :    ::: : ::.    .. :  :.:::.. ..:  :.   :.:.:::.: .::: : .
CCDS34 TS---DFS-RGSPNAKPKVFTCEVCGKVFNAHYNLTRHMP-VHTGARPFVCKVCGKGFRQ
              250       260       270       280        290         

           210       220       230       240       250       260   
pF1KB7 AVSLEQHTHVHSQERSFECRMCGKAFKRSSTLSTHLLIHSDTRPYPCQFCGKRFHQKSDM
       : .: .:  .:.::.  .: .:::::.:::::.::  ::.  .:. :.:::: ::::...
CCDS34 ASTLCRHKIIHTQEKPHKCNQCGKAFNRSSTLNTHTRIHAGYKPFVCEFCGKGFHQKGNY
     300       310       320       330       340       350         

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pF1KB7 KKHTYIHTGEKPHKCQVCGKAFSQSSNLITHSRKHTGFKPFSCELCTKGFQRKVDLRRHR
       :.:   :.:::  ::..:.::: :  ::  : . :.  :::.:  : ::: :. ::..: 
CCDS34 KNHKLTHSGEKQFKCNICNKAFHQVYNLTFHMHTHNDKKPFTCPTCGKGFCRNFDLKKHV
     360       370       380       390       400       410         

           330                                                 
pF1KB7 ESQHNLK                                                 
       .. :.                                                   
CCDS34 RKLHDSSLGLARTPAGEPGTEPPPPLPQQPPMTLPPLQPPLPTPGPLQPGLHQGHQ
     420       430       440       450       460       470     

>>CCDS2897.1 FEZF2 gene_id:55079|Hs108|chr3               (459 aa)
 initn: 1545 init1: 542 opt: 606  Z-score: 449.8  bits: 92.0 E(32554): 9.8e-19
Smith-Waterman score: 606; 47.0% identity (72.9% similar) in 166 aa overlap (163-328:277-441)

            140       150       160       170       180       190  
pF1KB7 HSVSLYGSPLVPSTEPALDFSLRYSPGMDAYHCVKCNKVFSTPHGLEVHVRRSHSGTRPF
                                     . :  :.:::.. ..:  :.   :.:.:::
CCDS28 KENSALTAERGGVKGHSKLPGGSADGKPKNFTCEVCGKVFNAHYNLTRHMP-VHTGARPF
        250       260       270       280       290        300     

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pF1KB7 ACDICGKTFGHAVSLEQHTHVHSQERSFECRMCGKAFKRSSTLSTHLLIHSDTRPYPCQF
       .: .::: : .: .: .:  .:.::.  .: .:::::.:::::.::. ::.  .:. :.:
CCDS28 VCKVCGKGFRQASTLCRHKIIHTQEKPHKCNQCGKAFNRSSTLNTHIRIHAGYKPFVCEF
         310       320       330       340       350       360     

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pF1KB7 CGKRFHQKSDMKKHTYIHTGEKPHKCQVCGKAFSQSSNLITHSRKHTGFKPFSCELCTKG
       ::: ::::...:.:   :.::: .:: .:.::: :  ::  : . :.  :::.:  : ::
CCDS28 CGKGFHQKGNYKNHKLTHSGEKQYKCTICNKAFHQVYNLTFHMHTHNDKKPFTCATCGKG
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pF1KB7 FQRKVDLRRHRESQHNLK                
       : :. ::..: .. :.                  
CCDS28 FCRNFDLKKHVRKLHDSVGPAAPSAKDLTRTVQS
         430       440       450         

>>CCDS33138.1 ZNF324B gene_id:388569|Hs108|chr19          (544 aa)
 initn: 958 init1: 537 opt: 602  Z-score: 446.1  bits: 91.6 E(32554): 1.6e-18
Smith-Waterman score: 602; 47.6% identity (70.6% similar) in 170 aa overlap (154-323:276-444)

           130       140       150       160       170       180   
pF1KB7 STMQSAFLEHSVSLYGSPLVPSTEPALDFSLRYSPGMDAYHCVKCNKVFSTPHGLEVHVR
                                     ::   :   :.:..:.:.::    :  : .
CCDS33 LGEALHAGEKSFECRACSKVFVKSSDLLKHLRTHTGERPYECTQCGKAFSQTSHLTQH-Q
         250       260       270       280       290       300     

           190       200       210       220       230       240   
pF1KB7 RSHSGTRPFACDICGKTFGHAVSLEQHTHVHSQERSFECRMCGKAFKRSSTLSTHLLIHS
       : :::  :.:: .:::.: :. :: .: ..:. :.::.:  :::::...:.:: :  ::.
CCDS33 RIHSGETPYACPVCGKAFRHSSSLVRHQRIHTAEKSFRCSECGKAFSHGSNLSQHRKIHA
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pF1KB7 DTRPYPCQFCGKRFHQKSDMKKHTYIHTGEKPHKCQVCGKAFSQSSNLITHSRKHTGFKP
         ::: :  ::.:: ..: . .:   ::::::  : .:: ::::.:.:. :.: ::: ::
CCDS33 GGRPYACAQCGRRFCRNSHLIQHERTHTGEKPFVCALCGAAFSQGSSLFLHQRVHTGEKP
          370       380       390       400       410       420    

           310       320       330                                 
pF1KB7 FSCELCTKGFQRKVDLRRHRESQHNLK                                 
       :.:  : ..:.:. .: .:.                                        
CCDS33 FACAQCGRSFSRSSNLTQHQLLHTGERPFRCVDCGKGFAKGAVLLSHRRIHTGEKPFVCT
          430       440       450       460       470       480    

>>CCDS46162.1 ZNF836 gene_id:162962|Hs108|chr19           (936 aa)
 initn: 2781 init1: 568 opt: 605  Z-score: 445.5  bits: 92.2 E(32554): 1.7e-18
Smith-Waterman score: 605; 47.2% identity (75.2% similar) in 161 aa overlap (163-323:274-433)

            140       150       160       170       180       190  
pF1KB7 HSVSLYGSPLVPSTEPALDFSLRYSPGMDAYHCVKCNKVFSTPHGLEVHVRRSHSGTRPF
                                     :.:  :.:.:     :  : ::::.: .:.
CCDS46 KPYKCNECGKAFHRGSLLTIHQIVHTRGKPYQCGVCGKIFRQNSDLVNH-RRSHTGEKPY
           250       260       270       280       290        300  

            200       210       220       230       240       250  
pF1KB7 ACDICGKTFGHAVSLEQHTHVHSQERSFECRMCGKAFKRSSTLSTHLLIHSDTRPYPCQF
        :. :::.:... .:  : ..:. :. ..:  :::.::..: :.:: .::.  .:: :..
CCDS46 KCNECGKSFSQSYNLAIHQRIHTGEKPYKCNECGKTFKQGSCLTTHQIIHTGEKPYQCDI
            310       320       330       340       350       360  

            260       270       280       290       300       310  
pF1KB7 CGKRFHQKSDMKKHTYIHTGEKPHKCQVCGKAFSQSSNLITHSRKHTGFKPFSCELCTKG
       ::: :.:.:.. .:  :::::::.::..:::.::::::: ::.  :.: ::..:. : : 
CCDS46 CGKVFRQNSNLVNHQRIHTGEKPYKCNICGKSFSQSSNLATHQTVHSGNKPYKCDECGKT
            370       380       390       400       410       420  

            320       330                                          
pF1KB7 FQRKVDLRRHRESQHNLK                                          
       :.:. .:  :.                                                 
CCDS46 FKRSSSLTTHQIIHTGEKPYTCDVCDKVFSQRSQLARHQRSHTGEKPYKCNECGKVFSQT
            430       440       450       460       470       480  

>--
 initn: 1715 init1: 471 opt: 539  Z-score: 398.6  bits: 83.6 E(32554): 7e-16
Smith-Waterman score: 539; 34.6% identity (58.8% similar) in 228 aa overlap (100-327:693-912)

      70        80        90       100       110       120         
pF1KB7 QNLARMAPAPEGPIVLSRPQDGDSPLSDSPPFYKPSFSWDTLATTYGHSYRQAPSTMQSA
                                     :.    :.   . ..    :.. :.  .  
CCDS46 EKPYKCNDCGKAYTQRSSLTKHLIIHTGEKPYNCNEFGGAFIQSSKLARYHRNPTGEKP-
            670       680       690       700       710       720  

     130       140       150       160       170       180         
pF1KB7 FLEHSVSLYGSPLVPSTEPALDFSLRYSPGMDAYHCVKCNKVFSTPHGLEVHVRRSHSGT
          :. :  :  .  :   .: .  :   :   :.:..:..::..  .:  : :: :.: 
CCDS46 ---HKCSHCGRTF--SHITGLTYHQRRHTGEMPYKCIECGQVFNSTSNLARH-RRIHTGE
                730         740       750       760        770     

     190       200       210       220       230       240         
pF1KB7 RPFACDICGKTFGHAVSLEQHTHVHSQERSFECRMCGKAFKRSSTLSTHLLIHSDTRPYP
       .:. :. :::.: :  .: .:  .:. :. . :  :::::.  : : .:  .:.  .:: 
CCDS46 KPYKCNECGKVFRHQSTLARHRSIHTGEKPYVCNECGKAFRVRSILVNHQKMHTGDKPYK
         780       790       800       810       820       830     

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pF1KB7 CQFCGKRFHQKSDMKKHTYIHTGEKPHKCQVCGKAFSQSSNLITHSRKHTGFKPFSCELC
       :. ::: : ..: .  :   ::::::.::  :::::.. : :  :.  :.: ::..:. :
CCDS46 CNECGKAFIERSKLVYHQRNHTGEKPYKCIECGKAFGRFSCLNKHQMIHSGEKPYKCNEC
         840       850       860       870       880       890     

     310       320       330                     
pF1KB7 TKGFQRKVDLRRHRESQHNLK                     
        :.:  .  : .: ...:                        
CCDS46 GKSFISRSGLTKH-QTKHTAESLKTKFNVEKPLDVLLTSGFK
         900        910       920       930      

>--
 initn: 1714 init1: 491 opt: 538  Z-score: 397.9  bits: 83.4 E(32554): 7.7e-16
Smith-Waterman score: 538; 45.1% identity (67.1% similar) in 164 aa overlap (159-322:438-600)

      130       140       150       160       170       180        
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                                     :   : :  :.::::    :  : .:::.:
CCDS46 HSGNKPYKCDECGKTFKRSSSLTTHQIIHTGEKPYTCDVCDKVFSQRSQLARH-QRSHTG
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pF1KB7 TRPFACDICGKTFGHAVSLEQHTHVHSQERSFECRMCGKAFKRSSTLSTHLLIHSDTRPY
        .:. :. :::.:...  :  : ..:. :. ..:  ::::::..: :. : .::.  . :
CCDS46 EKPYKCNECGKVFSQTSHLVGHRRIHTGEKPYKCDKCGKAFKQGSLLTRHKIIHTREKRY
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pF1KB7 PCQFCGKRFHQKSDMKKHTYIHTGEKPHKCQVCGKAFSQSSNLITHSRKHTGFKPFSCEL
        :  ::: : ..: . .:  :::::.:.::.::::.:. :.::  :.: ::: :::.:. 
CCDS46 QCGECGKVFSENSCLVRHLRIHTGEQPYKCNVCGKVFNYSGNLSIHKRIHTGEKPFQCNE
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pF1KB7 CTKGFQRKVDLRRHRESQHNLK                                      
       :   :.    : ::                                              
CCDS46 CGTVFRNYSCLARHLRIHTGQKPYKCNVCGKVFNDSGNLSNHKRIHTGEKPFQCNECGKV
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>>CCDS4440.1 ZFP2 gene_id:80108|Hs108|chr5                (461 aa)
 initn: 1481 init1: 535 opt: 594  Z-score: 441.3  bits: 90.4 E(32554): 2.9e-18
Smith-Waterman score: 594; 44.0% identity (70.3% similar) in 182 aa overlap (145-326:280-460)

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                                     :   .: .  :   :   :.: ::.: :: 
CCDS44 AFSQSMHLIVHQRSHTGEKPYECSQCGKAFSKSSTLTLHQRNHTGEKPYKCNKCGKSFSQ
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pF1KB7 PHGLEVHVRRSHSGTRPFACDICGKTFGHAVSLEQHTHVHSQERSFECRMCGKAFKRSST
          :  : .: :::..:: :. :::.:..  :: :: ..:. :. .:: .::: :   :.
CCDS44 STYLIEH-QRLHSGVKPFECNECGKAFSKNSSLTQHRRIHTGEKPYECMVCGKHFTGRSS
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pF1KB7 LSTHLLIHSDTRPYPCQFCGKRFHQKSDMKKHTYIHTGEKPHKCQVCGKAFSQSSNLITH
       :..: .::.  .:: :. ::: : :.. . .:  :::::::..:. ::::: ..:.: .:
CCDS44 LTVHQVIHTGEKPYECNECGKAFSQSAYLIEHQRIHTGEKPYECDQCGKAFIKNSSLTVH
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pF1KB7 SRKHTGFKPFSCELCTKGFQRKVDLRRHRESQHNLK
       .: ::: ::..:. : :.:.:...: ::....    
CCDS44 QRTHTGEKPYQCNECGKAFSRSTNLTRHQRTHT   
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>--
 initn: 2078 init1: 461 opt: 593  Z-score: 440.6  bits: 90.3 E(32554): 3.2e-18
Smith-Waterman score: 593; 37.1% identity (64.1% similar) in 248 aa overlap (92-330:26-268)

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pF1KB7 REPELEQDQNLARMAPAPEGPIVLSRPQDGDSPLSDSPPFYKPSFSWDTLATTYGHSYRQ
                                     :: ::.    .: .:.   . .  :. ...
CCDS44      MEREGIWHSTLGETWEPNNWLEGQQDSHLSQVGVTHKETFT--EMRVCGGNEFER
                    10        20        30        40          50   

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pF1KB7 APS------TMQSAFL---EHSVSLYGSPLVPSTEPALDFSLRYSPGMDAYHCVKCNKVF
         :      :.::  .    :. . .:   . ..:  :  . :.  :   :.: .:.:.:
CCDS44 CSSQDSILDTQQSIPMVKRPHNCNSHGEDATQNSE--LIKTQRMFVGKKIYECNQCSKTF
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pF1KB7 STPHGLEVHVRRSHSGTRPFACDICGKTFGHAVSLEQHTHVHSQERSFECRMCGKAFKRS
       :   .:  : .: :.: .:. :..::: : .  ::  : ..:. :. ..:  :::::..:
CCDS44 SQSSSLLKH-QRIHTGEKPYKCNVCGKHFIERSSLTVHQRIHTGEKPYKCNECGKAFSQS
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pF1KB7 STLSTHLLIHSDTRPYPCQFCGKRFHQKSDMKKHTYIHTGEKPHKCQVCGKAFSQSSNLI
        .:..:   :.  .:: :. ::: ::..:.. .:  :::::::.::. :::::.:: :: 
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       .:.: ::: ::. :. : :.:.... :  :..:. . :                      
CCDS44 VHQRTHTGEKPYECNECGKAFSQSMHLIVHQRSHTGEKPYECSQCGKAFSKSSTLTLHQR
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CCDS44 NHTGEKPYKCNKCGKSFSQSTYLIEHQRLHSGVKPFECNECGKAFSKNSSLTQHRRIHTG
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>>CCDS12981.1 ZNF324 gene_id:25799|Hs108|chr19            (553 aa)
 initn: 955 init1: 530 opt: 595  Z-score: 441.1  bits: 90.7 E(32554): 3e-18
Smith-Waterman score: 595; 47.1% identity (70.6% similar) in 170 aa overlap (154-323:276-444)

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                                     ::   :   :.:..:.:.::    :  : .
CCDS12 LGEALHAGEKSFECRACSKVFVKSSDLLKHLRTHTGERPYECAQCGKAFSQTSHLTQH-Q
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pF1KB7 RSHSGTRPFACDICGKTFGHAVSLEQHTHVHSQERSFECRMCGKAFKRSSTLSTHLLIHS
       : :::  :.:: .:::.: :. :: .: ..:. :.::.:  :::::...:.:: :  ::.
CCDS12 RIHSGETPYACPVCGKAFRHSSSLVRHQRIHTAEKSFRCSECGKAFSHGSNLSQHRKIHA
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CCDS12 GGRPYACAQCGRRFCRNSHLIQHERTHTGEKPFVCALCGAAFSQGSSLFKHQRVHTGEKP
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       :.:  : ..:... .: .:.                                        
CCDS12 FACPQCGRAFSHSSNLTQHQLLHTGERPFRCVDCGKAFAKGAVLLSHRRIHTGEKPFVCT
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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