Result of FASTA (ccds) for
pF1KB7956
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7956, 395 aa
1>>>pF1KB7956 395 - 395 aa - 395 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.6881+/-0.000684; mu= 11.7175+/- 0.041
mean_var=112.1537+/-21.400, 0's: 0 Z-trim(113.7): 43 B-trim: 0 in 0/55
Lambda= 0.121106
statistics sampled from 14275 (14318) to 14275 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.783), E-opt: 0.2 (0.44), width: 16
Scan time: 3.330
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS1056.1 CREB3L4 gene_id:148327|Hs108|chr1 ( 395) 2638 471.1 7.5e-133
CCDS58029.1 CREB3L4 gene_id:148327|Hs108|chr1 ( 375) 2212 396.7 1.8e-110
CCDS62499.1 CREB3L3 gene_id:84699|Hs108|chr19 ( 459) 671 127.5 2.4e-29
CCDS62500.1 CREB3L3 gene_id:84699|Hs108|chr19 ( 460) 671 127.5 2.4e-29
CCDS12121.1 CREB3L3 gene_id:84699|Hs108|chr19 ( 461) 671 127.5 2.4e-29
CCDS6588.1 CREB3 gene_id:10488|Hs108|chr9 ( 371) 519 100.9 2e-21
CCDS34760.1 CREB3L2 gene_id:64764|Hs108|chr7 ( 520) 429 85.3 1.4e-16
CCDS53620.1 CREB3L1 gene_id:90993|Hs108|chr11 ( 519) 415 82.8 7.8e-16
>>CCDS1056.1 CREB3L4 gene_id:148327|Hs108|chr1 (395 aa)
initn: 2638 init1: 2638 opt: 2638 Z-score: 2498.5 bits: 471.1 E(32554): 7.5e-133
Smith-Waterman score: 2638; 99.7% identity (99.7% similar) in 395 aa overlap (1-395:1-395)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MDLGIPDLLDAWLEPPEDIFSTGSVLELGLHCPPPEVPVTRLQEQGLQGWKSGGDRGCGL
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CCDS10 MDLGIPDLLDAWLEPPEDIFSTGSVLELGLHCPPPEVPVTRLQEQGLQGWKSGGDRGCGL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 QESEPEDFLKLFIDPNEVYCSEASPGSDSGISEDSCHPDSPPAPRATSSPMLYEVVYEAG
:::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::
CCDS10 QESEPEDFLKLFIDPNEVYCSEASPGSDSGISEDPCHPDSPPAPRATSSPMLYEVVYEAG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 ALERMQGETGPNVGLISIQLDQWSPAFMVPDSCMVSELPFDAHAHILPRAGTVAPVPCTT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 ALERMQGETGPNVGLISIQLDQWSPAFMVPDSCMVSELPFDAHAHILPRAGTVAPVPCTT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 LLPCQTLFLTDEEKRLLGQEGVSLPSHLPLTKAEERVLKKVRRKIRNKQSAQDSRRRKKE
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CCDS10 LLPCQTLFLTDEEKRLLGQEGVSLPSHLPLTKAEERVLKKVRRKIRNKQSAQDSRRRKKE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 YIDGLESRVAACSAQNQELQKKVQELERHNISLVAQLRQLQTLIAQTSNKAAQTSTCVLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 YIDGLESRVAACSAQNQELQKKVQELERHNISLVAQLRQLQTLIAQTSNKAAQTSTCVLI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 LLFSLALIILPSFSPFQSRPEAGSEDYQPHGVTSRNILTHKDVTENLETQVVESRLREPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LLFSLALIILPSFSPFQSRPEAGSEDYQPHGVTSRNILTHKDVTENLETQVVESRLREPP
310 320 330 340 350 360
370 380 390
pF1KB7 GAKDANGSTRTLLEKMGGKPRPSGRIRSVLHADEM
:::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 GAKDANGSTRTLLEKMGGKPRPSGRIRSVLHADEM
370 380 390
>>CCDS58029.1 CREB3L4 gene_id:148327|Hs108|chr1 (375 aa)
initn: 2476 init1: 2212 opt: 2212 Z-score: 2096.6 bits: 396.7 E(32554): 1.8e-110
Smith-Waterman score: 2440; 94.7% identity (94.7% similar) in 395 aa overlap (1-395:1-375)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MDLGIPDLLDAWLEPPEDIFSTGSVLELGLHCPPPEVPVTRLQEQGLQGWKSGGDRGCGL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::
CCDS58 MDLGIPDLLDAWLEPPEDIFSTGSVLELGLHCPPPEVP--------------------GL
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 QESEPEDFLKLFIDPNEVYCSEASPGSDSGISEDSCHPDSPPAPRATSSPMLYEVVYEAG
:::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::
CCDS58 QESEPEDFLKLFIDPNEVYCSEASPGSDSGISEDPCHPDSPPAPRATSSPMLYEVVYEAG
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 ALERMQGETGPNVGLISIQLDQWSPAFMVPDSCMVSELPFDAHAHILPRAGTVAPVPCTT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 ALERMQGETGPNVGLISIQLDQWSPAFMVPDSCMVSELPFDAHAHILPRAGTVAPVPCTT
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 LLPCQTLFLTDEEKRLLGQEGVSLPSHLPLTKAEERVLKKVRRKIRNKQSAQDSRRRKKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LLPCQTLFLTDEEKRLLGQEGVSLPSHLPLTKAEERVLKKVRRKIRNKQSAQDSRRRKKE
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 YIDGLESRVAACSAQNQELQKKVQELERHNISLVAQLRQLQTLIAQTSNKAAQTSTCVLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 YIDGLESRVAACSAQNQELQKKVQELERHNISLVAQLRQLQTLIAQTSNKAAQTSTCVLI
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 LLFSLALIILPSFSPFQSRPEAGSEDYQPHGVTSRNILTHKDVTENLETQVVESRLREPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LLFSLALIILPSFSPFQSRPEAGSEDYQPHGVTSRNILTHKDVTENLETQVVESRLREPP
290 300 310 320 330 340
370 380 390
pF1KB7 GAKDANGSTRTLLEKMGGKPRPSGRIRSVLHADEM
:::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 GAKDANGSTRTLLEKMGGKPRPSGRIRSVLHADEM
350 360 370
>>CCDS62499.1 CREB3L3 gene_id:84699|Hs108|chr19 (459 aa)
initn: 689 init1: 640 opt: 671 Z-score: 640.2 bits: 127.5 E(32554): 2.4e-29
Smith-Waterman score: 746; 40.3% identity (64.2% similar) in 377 aa overlap (39-380:36-397)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 LDAWLEPPEDIFSTGSVLELGLHCPPPEVPVTRLQEQGLQGWKSGGDRGCGLQESEPEDF
. : : : .:: :. : . . .::
CCDS62 AAGKMASAACSMDPIDSFELLDLLFDRQDGILRHVELG-EGWGHVKDQQV-LPNPDSDDF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 LKLFIDPNEVYCSEA--SP-GSDSGISED--SCHPDSPPAPRATSSPMLYEVVY--EAGA
:. .. .. : :: ::::::::: : :.:: ..:: . . ..
CCDS62 LSSILGSGDSLPSSPLWSPEGSDSGISEDLPSDPQDTPPRSGPATSPAGCHPAQPGKGPC
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160
pF1KB7 LERMQGET------GPNVGL----ISIQLDQWSPAFMVPDSCMVSELPFDAHAHILPR--
: :.. :: . . ..:.:..:::. . : .: : : . . ::
CCDS62 LSYHPGNSCSTTTPGPVIQVPEASVTIDLEMWSPGGRI---C--AEKPADP-VDLSPRCN
130 140 150 160 170
170 180 190 200 210
pF1KB7 -----------AGTVAPVPCTTLL-P----CQTLFLTDEEKRLLGQEGVSLPSHLPLTKA
.: . . . :: : :: : ::..::.::..::..::..:::::
CCDS62 LTVKDLLLSGSSGDLHHLGASYLLRPGAGHCQELVLTEDEKKLLAKEGITLPTQLPLTKY
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KB7 EERVLKKVRRKIRNKQSAQDSRRRKKEYIDGLESRVAACSAQNQELQKKVQELERHNISL
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CCDS62 EERVLKKIRRKIRNKQSAQESRKKKKEYIDGLETRMSACTAQNQELQRKVLHLEKQNLSL
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KB7 VAQLRQLQTLIAQTSNKAAQTSTCVLILLFSLALIILPSFSPFQSRPEAGSEDYQPHGVT
. ::..::....:...:.:::.::: .::.:.:::::::.::: . :. : :
CCDS62 LEQLKKLQAIVVQSTSKSAQTGTCVAVLLLSFALIILPSISPFGPNKTESPGDFAPVRVF
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KB7 SRNILTHKDVTENLETQVVESRLREPPGAKDANGSTRTLLEKMGGKPRPSGRIRSVLHAD
::.. :.:.. . ...: . : :: . .:: :. :.:
CCDS62 SRTL--HNDAASRVAADAVPGS--EAPGPRPEADTTR---EESPGSPGADWGFQDTANLT
360 370 380 390 400 410
pF1KB7 EM
CCDS62 NSTEELDNATLVLRNATEGLGQVALLDWVAPGPSTGSGRAGLEAAGDEL
420 430 440 450
>>CCDS62500.1 CREB3L3 gene_id:84699|Hs108|chr19 (460 aa)
initn: 689 init1: 640 opt: 671 Z-score: 640.2 bits: 127.5 E(32554): 2.4e-29
Smith-Waterman score: 734; 40.1% identity (64.1% similar) in 379 aa overlap (39-380:36-398)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 LDAWLEPPEDIFSTGSVLELGLHCPPPEVPVTRLQEQGLQGWKSGGDRGCGLQESEPEDF
. : : : .:: : . : . . .::
CCDS62 AAGKMASAACSMDPIDSFELLDLLFDRQDGILRHVELG-EGW--GHVKDQVLPNPDSDDF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 LKLFIDPNEVYCSEA--SP-GSDSGISED--SCHPDSPPAPRATSSPMLYEVVY--EAGA
:. .. .. : :: ::::::::: : :.:: ..:: . . ..
CCDS62 LSSILGSGDSLPSSPLWSPEGSDSGISEDLPSDPQDTPPRSGPATSPAGCHPAQPGKGPC
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160
pF1KB7 LERMQGET------GPNVGL----ISIQLDQWSPAFMVPDSCMVSELPFDAHAHILPR--
: :.. :: . . ..:.:..:::. . : .: : : . . ::
CCDS62 LSYHPGNSCSTTTPGPVIQVPEASVTIDLEMWSPGGRI---C--AEKPADP-VDLSPRCN
130 140 150 160 170
170 180 190 200 210
pF1KB7 --------AGTVAPVP-----CTTLL-P----CQTLFLTDEEKRLLGQEGVSLPSHLPLT
.:. . . . :: : :: : ::..::.::..::..::..::::
CCDS62 LTVKDLLLSGSSGDLQQHHLGASYLLRPGAGHCQELVLTEDEKKLLAKEGITLPTQLPLT
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KB7 KAEERVLKKVRRKIRNKQSAQDSRRRKKEYIDGLESRVAACSAQNQELQKKVQELERHNI
: :::::::.:::::::::::.::..:::::::::.:..::.:::::::.:: .::..:.
CCDS62 KYEERVLKKIRRKIRNKQSAQESRKKKKEYIDGLETRMSACTAQNQELQRKVLHLEKQNL
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KB7 SLVAQLRQLQTLIAQTSNKAAQTSTCVLILLFSLALIILPSFSPFQSRPEAGSEDYQPHG
::. ::..::....:...:.:::.::: .::.:.:::::::.::: . :. :
CCDS62 SLLEQLKKLQAIVVQSTSKSAQTGTCVAVLLLSFALIILPSISPFGPNKTESPGDFAPVR
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KB7 VTSRNILTHKDVTENLETQVVESRLREPPGAKDANGSTRTLLEKMGGKPRPSGRIRSVLH
: ::.. :.:.. . ...: . : :: . .:: :. :.:
CCDS62 VFSRTL--HNDAASRVAADAVPGS--EAPGPRPEADTTR---EESPGSPGADWGFQDTAN
360 370 380 390 400
pF1KB7 ADEM
CCDS62 LTNSTEELDNATLVLRNATEGLGQVALLDWVAPGPSTGSGRAGLEAAGDEL
410 420 430 440 450 460
>>CCDS12121.1 CREB3L3 gene_id:84699|Hs108|chr19 (461 aa)
initn: 689 init1: 640 opt: 671 Z-score: 640.2 bits: 127.5 E(32554): 2.4e-29
Smith-Waterman score: 736; 40.1% identity (64.1% similar) in 379 aa overlap (39-380:36-399)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 LDAWLEPPEDIFSTGSVLELGLHCPPPEVPVTRLQEQGLQGWKSGGDRGCGLQESEPEDF
. : : : .:: :. : . . .::
CCDS12 AAGKMASAACSMDPIDSFELLDLLFDRQDGILRHVELG-EGWGHVKDQQV-LPNPDSDDF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 LKLFIDPNEVYCSEA--SP-GSDSGISED--SCHPDSPPAPRATSSPMLYEVVY--EAGA
:. .. .. : :: ::::::::: : :.:: ..:: . . ..
CCDS12 LSSILGSGDSLPSSPLWSPEGSDSGISEDLPSDPQDTPPRSGPATSPAGCHPAQPGKGPC
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160
pF1KB7 LERMQGET------GPNVGL----ISIQLDQWSPAFMVPDSCMVSELPFDAHAHILPR--
: :.. :: . . ..:.:..:::. . : .: : : . . ::
CCDS12 LSYHPGNSCSTTTPGPVIQVPEASVTIDLEMWSPGGRI---C--AEKPADP-VDLSPRCN
130 140 150 160 170
170 180 190 200 210
pF1KB7 --------AGTVAPVP-----CTTLL-P----CQTLFLTDEEKRLLGQEGVSLPSHLPLT
.:. . . . :: : :: : ::..::.::..::..::..::::
CCDS12 LTVKDLLLSGSSGDLQQHHLGASYLLRPGAGHCQELVLTEDEKKLLAKEGITLPTQLPLT
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KB7 KAEERVLKKVRRKIRNKQSAQDSRRRKKEYIDGLESRVAACSAQNQELQKKVQELERHNI
: :::::::.:::::::::::.::..:::::::::.:..::.:::::::.:: .::..:.
CCDS12 KYEERVLKKIRRKIRNKQSAQESRKKKKEYIDGLETRMSACTAQNQELQRKVLHLEKQNL
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KB7 SLVAQLRQLQTLIAQTSNKAAQTSTCVLILLFSLALIILPSFSPFQSRPEAGSEDYQPHG
::. ::..::....:...:.:::.::: .::.:.:::::::.::: . :. :
CCDS12 SLLEQLKKLQAIVVQSTSKSAQTGTCVAVLLLSFALIILPSISPFGPNKTESPGDFAPVR
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KB7 VTSRNILTHKDVTENLETQVVESRLREPPGAKDANGSTRTLLEKMGGKPRPSGRIRSVLH
: ::.. :.:.. . ...: . : :: . .:: :. :.:
CCDS12 VFSRTL--HNDAASRVAADAVPGS--EAPGPRPEADTTR---EESPGSPGADWGFQDTAN
360 370 380 390 400 410
pF1KB7 ADEM
CCDS12 LTNSTEELDNATLVLRNATEGLGQVALLDWVAPGPSTGSGRAGLEAAGDEL
420 430 440 450 460
>>CCDS6588.1 CREB3 gene_id:10488|Hs108|chr9 (371 aa)
initn: 535 init1: 488 opt: 519 Z-score: 498.1 bits: 100.9 E(32554): 2e-21
Smith-Waterman score: 519; 46.6% identity (72.1% similar) in 204 aa overlap (187-380:120-319)
160 170 180 190 200 210
pF1KB7 ELPFDAHAHILPRAGTVAPVPCTTLLPCQTLFLTDEEKRLLGQEGVSLPSHLPLTKAEER
: :::::: :: .::. :: :::::.::.
CCDS65 MDLESESCRKEGTQMTPQHMEELAEQEIARLVLTDEEKSLLEKEGLILPETLPLTKTEEQ
90 100 110 120 130 140
220 230 240 250 260 270
pF1KB7 VLKKVRRKIRNKQSAQDSRRRKKEYIDGLESRVAACSAQNQELQKKVQELERHNISLVAQ
.::.::::::::.:::.:::.:: :. :::::: .:::.:::.::: ::..:.::. :
CCDS65 ILKRVRRKIRNKRSAQESRRKKKVYVGGLESRVLKYTAQNMELQNKVQLLEEQNLSLLDQ
150 160 170 180 190 200
280 290 300 310 320 330
pF1KB7 LRQLQTLIAQTSNKAAQTSTCVLILLFSLALIILPSFSPFQSRPEAGSEDYQPHGVTSRN
::.::... . :::....:::.:.:: :. :...:.. ..: .: ::: ::.
CCDS65 LRKLQAMVIEISNKTSSSSTCILVLLVSFCLLLVPAMYSSDTRGSLPAE----HGVLSRQ
210 220 230 240 250 260
340 350 360 370 380
pF1KB7 I--LTHKDVTE----NLETQVVESRLREPPGAKD----ANGSTRTLLEKMGGKPRPSGRI
. : .: . :...: .. .. ..: : :.: ::. : :
CCDS65 LRALPSEDPYQLELPALQSEVPKDSTHQWLDGSDCVLQAPGNTSCLLHYMPQAPSAEPPL
270 280 290 300 310 320
390
pF1KB7 RSVLHADEM
CCDS65 EWPFPDLFSEPLCRGPILPLQANLTRKGGWLPTGSPSVILQDRYSG
330 340 350 360 370
>>CCDS34760.1 CREB3L2 gene_id:64764|Hs108|chr7 (520 aa)
initn: 373 init1: 373 opt: 429 Z-score: 410.9 bits: 85.3 E(32554): 1.4e-16
Smith-Waterman score: 453; 32.1% identity (55.9% similar) in 390 aa overlap (14-382:128-469)
10 20 30 40
pF1KB7 MDLGIPDLLDAWLEPPEDIFSTGSVLELGLHCPPPEVPVTRLQ
:: : : : . : .:. . .
CCDS34 ITTSDSFNDDEVESEKWYLSTDFPSTSIKTEPVTDEPPPGLVPSVTLTITAISTPLEK-E
100 110 120 130 140 150
50 60 70 80 90 100
pF1KB7 EQGLQGWKSGGDRGCGLQESEPEDFLKLFIDPNEV-YCSEASPGSDSGISEDSCH-PDSP
: :. ..: : .: : : :. ..:.:: . :: ... . : : : .:
CCDS34 EPPLE-MNTGVDSSC--QTIIP----KIKLEPHEVDQFLNFSP-KEAPV--DHLHLPPTP
160 170 180 190 200
110 120 130 140 150
pF1KB7 PAPRATSSPMLYEVVYEAGALERMQGETGPNVGLISIQLDQW-SPAFMVPDS-CMVSELP
:. ....: .: .:: : ..: : ::. .: . .: :
CCDS34 PSSHGSDS----------------EGSLSPNPRLHPFSLPQTHSPSRAAPRAPSALSSSP
210 220 230 240 250
160 170 180 190 200 210
pF1KB7 FDAHAHILPRAGTVAPVPCTTLLPCQTLFLTDEEKRLLGQEGVSLPSHLPLTKAEERVLK
. . : : .: : : ::.:::: : :: .:..:::.:.::..::
CCDS34 LLTAPHKLQGSG---P-----------LVLTEEEKRTLIAEGYPIPTKLPLSKSEEKALK
260 270 280 290
220 230 240 250 260 270
pF1KB7 KVRRKIRNKQSAQDSRRRKKEYIDGLESRVAACSAQNQELQKKVQELERHNISLVAQLRQ
:.::::.:: :::.:::.::::.:.::..: .::..: ::.:::. :: : .:. ::..
CCDS34 KIRRKIKNKISAQESRRKKKEYMDSLEKKVESCSTENLELRKKVEVLENTNRTLLQQLQK
300 310 320 330 340 350
280 290 300 310 320
pF1KB7 LQTLIAQTSNKA-----AQTSTCVLILLFSLALII---LPSFSPFQSR-----PEAGS--
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