Result of FASTA (ccds) for
pF1KB7968
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7968, 407 aa
1>>>pF1KB7968 407 - 407 aa - 407 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.9951+/-0.000999; mu= 6.2635+/- 0.059
mean_var=226.5218+/-46.221, 0's: 0 Z-trim(113.3): 894 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.085216
statistics sampled from 12975 (13975) to 12975 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.769), E-opt: 0.2 (0.429), width: 16
Scan time: 3.370
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS10504.1 ZNF174 gene_id:7727|Hs108|chr16 ( 407) 2854 363.6 1.9e-100
CCDS32380.1 ZNF174 gene_id:7727|Hs108|chr16 ( 234) 1429 188.1 7.2e-48
CCDS76814.1 ZNF500 gene_id:26048|Hs108|chr16 ( 441) 819 113.4 4.2e-25
CCDS32383.1 ZNF500 gene_id:26048|Hs108|chr16 ( 480) 819 113.5 4.4e-25
CCDS42427.1 ZSCAN30 gene_id:100101467|Hs108|chr18 ( 494) 756 105.7 9.6e-23
CCDS12975.1 ZSCAN22 gene_id:342945|Hs108|chr19 ( 491) 744 104.3 2.7e-22
CCDS4649.1 ZSCAN31 gene_id:64288|Hs108|chr6 ( 406) 730 102.5 7.7e-22
CCDS11068.1 ZNF232 gene_id:7775|Hs108|chr17 ( 444) 702 99.1 8.9e-21
CCDS56407.1 ZSCAN9 gene_id:7746|Hs108|chr6 ( 445) 681 96.5 5.3e-20
CCDS12988.1 MZF1 gene_id:7593|Hs108|chr19 ( 734) 672 95.6 1.6e-19
CCDS4646.1 ZSCAN9 gene_id:7746|Hs108|chr6 ( 394) 624 89.4 6.3e-18
CCDS47393.1 ZSCAN23 gene_id:222696|Hs108|chr6 ( 389) 608 87.4 2.5e-17
CCDS4644.1 ZSCAN16 gene_id:80345|Hs108|chr6 ( 348) 554 80.8 2.3e-15
CCDS5671.2 ZSCAN25 gene_id:221785|Hs108|chr7 ( 544) 525 77.4 3.6e-14
CCDS11912.1 ZNF24 gene_id:7572|Hs108|chr18 ( 368) 509 75.2 1.1e-13
CCDS59427.1 MZF1 gene_id:7593|Hs108|chr19 ( 290) 495 73.4 3.1e-13
CCDS8443.1 ZNF202 gene_id:7753|Hs108|chr11 ( 648) 496 73.9 4.8e-13
CCDS12969.1 ZSCAN1 gene_id:284312|Hs108|chr19 ( 408) 479 71.6 1.5e-12
CCDS10095.2 ZSCAN29 gene_id:146050|Hs108|chr15 ( 852) 476 71.6 3.2e-12
CCDS32410.1 ZKSCAN2 gene_id:342357|Hs108|chr16 ( 967) 466 70.4 8.2e-12
CCDS43619.1 ZNF3 gene_id:7551|Hs108|chr7 ( 446) 455 68.7 1.2e-11
CCDS34355.1 ZBED9 gene_id:114821|Hs108|chr6 (1325) 463 70.2 1.3e-11
CCDS76957.1 ZNF18 gene_id:7566|Hs108|chr17 ( 548) 455 68.8 1.4e-11
CCDS32568.1 ZNF18 gene_id:7566|Hs108|chr17 ( 549) 455 68.8 1.4e-11
CCDS233.1 ZNF436 gene_id:80818|Hs108|chr1 ( 470) 451 68.2 1.8e-11
CCDS41502.1 ZNF239 gene_id:8187|Hs108|chr10 ( 458) 448 67.8 2.3e-11
CCDS54310.1 ZNF578 gene_id:147660|Hs108|chr19 ( 590) 447 67.8 3e-11
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CCDS43590.1 ZNF479 gene_id:90827|Hs108|chr7 ( 524) 444 67.4 3.5e-11
CCDS74389.1 ZNF285 gene_id:26974|Hs108|chr19 ( 597) 445 67.6 3.5e-11
CCDS14278.1 ZNF157 gene_id:7712|Hs108|chrX ( 506) 443 67.3 3.7e-11
CCDS12637.1 ZNF112 gene_id:7771|Hs108|chr19 ( 907) 447 68.0 4e-11
CCDS54276.1 ZNF112 gene_id:7771|Hs108|chr19 ( 913) 447 68.0 4e-11
CCDS75904.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 364) 439 66.6 4.2e-11
CCDS42532.1 ZNF253 gene_id:56242|Hs108|chr19 ( 499) 440 66.9 4.8e-11
CCDS69664.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 474) 439 66.8 5e-11
CCDS6871.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 498) 439 66.8 5.2e-11
CCDS35074.1 ZNF510 gene_id:22869|Hs108|chr9 ( 683) 441 67.2 5.5e-11
CCDS46101.1 ZNF234 gene_id:10780|Hs108|chr19 ( 700) 441 67.2 5.5e-11
CCDS82043.1 ZNF232 gene_id:7775|Hs108|chr17 ( 435) 437 66.5 5.6e-11
CCDS13812.1 ZNF70 gene_id:7621|Hs108|chr22 ( 446) 437 66.5 5.7e-11
CCDS75563.1 ZNF316 gene_id:100131017|Hs108|chr7 (1004) 443 67.6 6e-11
CCDS74346.1 ZNF566 gene_id:84924|Hs108|chr19 ( 314) 433 65.8 6.4e-11
CCDS47592.1 ZNF679 gene_id:168417|Hs108|chr7 ( 411) 435 66.2 6.4e-11
CCDS46102.1 ZNF226 gene_id:7769|Hs108|chr19 ( 803) 440 67.1 6.6e-11
CCDS32814.1 ZNF397 gene_id:84307|Hs108|chr18 ( 275) 431 65.5 6.9e-11
CCDS62707.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 665) 438 66.8 6.9e-11
CCDS62708.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 667) 438 66.8 6.9e-11
CCDS12954.1 ZNF416 gene_id:55659|Hs108|chr19 ( 594) 437 66.6 7e-11
CCDS12639.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 692) 438 66.8 7.1e-11
>>CCDS10504.1 ZNF174 gene_id:7727|Hs108|chr16 (407 aa)
initn: 2854 init1: 2854 opt: 2854 Z-score: 1916.8 bits: 363.6 E(32554): 1.9e-100
Smith-Waterman score: 2854; 100.0% identity (100.0% similar) in 407 aa overlap (1-407:1-407)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MAAKMEITLSSNTEASSKQERHIIAKLEEKRGPPLQKNCPDPELCRQSFRRFCYQEVSGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MAAKMEITLSSNTEASSKQERHIIAKLEEKRGPPLQKNCPDPELCRQSFRRFCYQEVSGP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 QEALSQLRQLCRQWLQPELHTKEQILELLVMEQFLTILPPEIQARVRHRCPMSSKEIVTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 QEALSQLRQLCRQWLQPELHTKEQILELLVMEQFLTILPPEIQARVRHRCPMSSKEIVTL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 VEDFHRASKKPKQWVAVCMQGQKVLLEKTGSQLGEQELPDFQPQTPRRDLRESSPAEPSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 VEDFHRASKKPKQWVAVCMQGQKVLLEKTGSQLGEQELPDFQPQTPRRDLRESSPAEPSQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 AGAYDRLSPHHWEKSPLLQEPTPKLAGTEAPRMRSDNKENPQQEGAKGAKPCAVSAGRSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 AGAYDRLSPHHWEKSPLLQEPTPKLAGTEAPRMRSDNKENPQQEGAKGAKPCAVSAGRSK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 GNGLQNPEPRGANMSEPRLSRRQVSSPNAQKPFAHYQRHCRVEYISSPLKSHPLRELKKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 GNGLQNPEPRGANMSEPRLSRRQVSSPNAQKPFAHYQRHCRVEYISSPLKSHPLRELKKS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 KGGKRSLSNRLQHLGHQPTRSAKKPYKCDDCGKSFTWNSELKRHKRVHTGERPYTCGECG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 KGGKRSLSNRLQHLGHQPTRSAKKPYKCDDCGKSFTWNSELKRHKRVHTGERPYTCGECG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400
pF1KB7 NCFGRQSTLKLHQRIHTGEKPYQCGQCGKSFRQSSNLHQHHRLHHGD
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 NCFGRQSTLKLHQRIHTGEKPYQCGQCGKSFRQSSNLHQHHRLHHGD
370 380 390 400
>>CCDS32380.1 ZNF174 gene_id:7727|Hs108|chr16 (234 aa)
initn: 1428 init1: 1428 opt: 1429 Z-score: 972.9 bits: 188.1 E(32554): 7.2e-48
Smith-Waterman score: 1429; 97.2% identity (98.1% similar) in 216 aa overlap (1-216:1-216)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MAAKMEITLSSNTEASSKQERHIIAKLEEKRGPPLQKNCPDPELCRQSFRRFCYQEVSGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MAAKMEITLSSNTEASSKQERHIIAKLEEKRGPPLQKNCPDPELCRQSFRRFCYQEVSGP
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70 80 90 100 110 120
pF1KB7 QEALSQLRQLCRQWLQPELHTKEQILELLVMEQFLTILPPEIQARVRHRCPMSSKEIVTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 QEALSQLRQLCRQWLQPELHTKEQILELLVMEQFLTILPPEIQARVRHRCPMSSKEIVTL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 VEDFHRASKKPKQWVAVCMQGQKVLLEKTGSQLGEQELPDFQPQTPRRDLRESSPAEPSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 VEDFHRASKKPKQWVAVCMQGQKVLLEKTGSQLGEQELPDFQPQTPRRDLRESSPAEPSQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 AGAYDRLSPHHWEKSPLLQEPTPKLAGTEAPRMRSDNKENPQQEGAKGAKPCAVSAGRSK
::::::::::::::::::::::::::::: ..:
CCDS32 AGAYDRLSPHHWEKSPLLQEPTPKLAGTELLIEKTDPNMATDELPCKLWLSFIA
190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 GNGLQNPEPRGANMSEPRLSRRQVSSPNAQKPFAHYQRHCRVEYISSPLKSHPLRELKKS
>>CCDS76814.1 ZNF500 gene_id:26048|Hs108|chr16 (441 aa)
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Smith-Waterman score: 829; 37.1% identity (62.4% similar) in 423 aa overlap (14-406:14-433)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MAAKMEITLSSNTEASSKQERHIIAKLEE----KRGPPLQKNCPDPELCRQSFRRFCYQE
: . .::. .:.:.:: .. : .. . :.:: :: :: :::::
CCDS76 MATVPGLQPLPTLEQDLEQEEILIVKVEEDFCLEEEPSVETEDPSPETFRQLFRLFCYQE
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pF1KB7 VSGPQEALSQLRQLCRQWLQPELHTKEQILELLVMEQFLTILPPEIQARVRHRCPMSSKE
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pF1KB7 IVTLVEDFHRASKKPKQWVAVCMQGQKVLLEKTGSQLGEQELPDFQPQTPRRDLRESSPA
:.::: ..: .: .: . .. ..: : :. : .: . . . ... : ::
CCDS76 AVVLVEGLQRKPRKHRQRGSELLSDDEVPLGIGGQFLKHQAEAQPEDLSLEEEARFSSQQ
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pF1KB7 EPSQAGAYDRLSPHHW-EKSPLLQEPTPKLAGTEAPRMRSDNKENPQQEGA----KGAKP
:.: . . .: : :..: : . .. .: . . .. . : . .: .:
CCDS76 PPAQLSHRPQRGPLLWPERGP--PAPRHQEMASASPFLSAWSQVPVNLEDVAVYLSGEEP
190 200 210 220 230
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pF1KB7 -CAVSAGR-----SKGNGLQNPEPRGANMSEP-RLSRRQVSSPNAQKPFAHY---QRHCR
: : : ..: :.: . . . : :. .: : : : .: ::
CCDS76 RCMDPAQRDAPLENEGPGIQLEDGGDGREDAPLRMEWYRVLSARCQGP-GHPLPGQRPAP
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330
pF1KB7 VEYISSPLKSH--PLRELKKSKGGKRSLS--------NRLQHLG-HQPTRSAKKPYKCDD
:. . : . . : . :.:. . . .. .:: :: :.....::::
CCDS76 VRGLVRPDQPRGGPPPGRRASHGADKPYTCPECGKGFSKTSHLTKHQRTHTGERPYKCLV
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340 350 360 370 380 390
pF1KB7 CGKSFTWNSELKRHKRVHTGERPYTCGECGNCFGRQSTLKLHQRIHTGEKPYQCGQCGKS
:::.:. :... :.::::::.:: : :::. :...:.: .:.: :.::.:: : ::::
CCDS76 CGKGFSDRSNFSTHQRVHTGEKPYPCPECGKRFSQSSSLVIHRRTHSGERPYACTQCGKR
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400
pF1KB7 FRQSSNLHQHHRLHHGD
: .::.. :.: : :
CCDS76 FNNSSHFSAHRRTHTGHILRSGCT
420 430 440
>>CCDS32383.1 ZNF500 gene_id:26048|Hs108|chr16 (480 aa)
initn: 1791 init1: 416 opt: 819 Z-score: 563.8 bits: 113.5 E(32554): 4.4e-25
Smith-Waterman score: 831; 37.0% identity (62.5% similar) in 424 aa overlap (14-407:14-434)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MAAKMEITLSSNTEASSKQERHIIAKLEE----KRGPPLQKNCPDPELCRQSFRRFCYQE
: . .::. .:.:.:: .. : .. . :.:: :: :: :::::
CCDS32 MATVPGLQPLPTLEQDLEQEEILIVKVEEDFCLEEEPSVETEDPSPETFRQLFRLFCYQE
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pF1KB7 VSGPQEALSQLRQLCRQWLQPELHTKEQILELLVMEQFLTILPPEIQARVRHRCPMSSKE
:.::.::::.: .:: .::.:::.::::::::::.:::::.:: :::::::.. : :..:
CCDS32 VAGPREALSRLWELCCRWLRPELRTKEQILELLVLEQFLTVLPGEIQARVREQQPESGEE
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 IVTLVEDFHRASKKPKQWVAVCMQGQKVLLEKTGSQLGEQELPDFQPQTPRRDLRESSPA
:.::: ..: .: .: . .. ..: : :. : .: . . . ... : ::
CCDS32 AVVLVEGLQRKPRKHRQRGSELLSDDEVPLGIGGQFLKHQAEAQPEDLSLEEEARFSSQQ
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 EPSQAGAYDRLSPHHW-EKSPLLQEPTPKLAGTEAPRMRSDNKENPQQEGA----KGAKP
:.: . . .: : :..: : . .. .: . . .. . : . .: .:
CCDS32 PPAQLSHRPQRGPLLWPERGP--PAPRHQEMASASPFLSAWSQVPVNLEDVAVYLSGEEP
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280
pF1KB7 -CAVSAGR-----SKGNGLQNPEPRGANMSEP-RLSRRQVSSPNAQKPFAHY---QRHCR
: : : ..: :.: . . . : :. .: : : : .: ::
CCDS32 RCMDPAQRDAPLENEGPGIQLEDGGDGREDAPLRMEWYRVLSARCQGP-GHPLPGQRPAP
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330
pF1KB7 VEYISSPLKSH--PLRELKKSKGGKRSLS--------NRLQHLG-HQPTRSAKKPYKCDD
:. . : . . : . :.:. . . .. .:: :: :.....::::
CCDS32 VRGLVRPDQPRGGPPPGRRASHGADKPYTCPECGKGFSKTSHLTKHQRTHTGERPYKCLV
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KB7 CGKSFTWNSELKRHKRVHTGERPYTCGECGNCFGRQSTLKLHQRIHTGEKPYQCGQCGKS
:::.:. :... :.::::::.:: : :::. :...:.: .:.: :.::.:: : ::::
CCDS32 CGKGFSDRSNFSTHQRVHTGEKPYPCPECGKRFSQSSSLVIHRRTHSGERPYACTQCGKR
360 370 380 390 400 410
400
pF1KB7 FRQSSNLHQHHRLHHGD
: .::.. :.: : :.
CCDS32 FNNSSHFSAHRRTHTGEKPYTCPACGRGFRRGTDLHKHQRTHMGAGSLPTLQPVAPGGPG
420 430 440 450 460 470
>>CCDS42427.1 ZSCAN30 gene_id:100101467|Hs108|chr18 (494 aa)
initn: 2143 init1: 406 opt: 756 Z-score: 521.8 bits: 105.7 E(32554): 9.6e-23
Smith-Waterman score: 759; 36.2% identity (67.0% similar) in 400 aa overlap (15-407:12-382)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MAAKMEITLSSNTEASSKQERHIIAKLEEK-----RGPPLQKNCPDPELCRQSFRRFCYQ
: .:: ...:.::. . ::.: . :. ::.::.: :.
CCDS42 MSGEATVLAYHAPEEQEGLLVVKVEEENYVLDQDFGLQENPWSQEVFRQKFRQFSYS
10 20 30 40 50
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pF1KB7 EVSGPQEALSQLRQLCRQWLQPELHTKEQILELLVMEQFLTILPPEIQARVRHRCPMSSK
. .::.::::.::.:: :::.::.:.::::::::..::::.::: :.:: .:.. : ...
CCDS42 DSTGPREALSRLRELCCQWLRPEVHSKEQILELLMLEQFLAILPEELQAWLREHRPENGE
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 EIVTLVEDFHRASKKPKQWVAVCMQGQKVLLEKTGSQLGEQELPDFQPQTPRRDLRESSP
: ::..:.... ..:.: .. .::... .. : : : ... ..: . :...
CCDS42 EAVTMLEELEKELEEPRQQDTT--HGQEMFWQEMTST-G--ALKSLSLNSPVQPLENQCK
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 AEPSQAGAYDRLSPHHWEKSPLL--QEPTPKLAGTEAPRMRSDNKENPQQEGAKGAKPCA
.: ... :... . . . :. :: . .:.. : : .: : . .. :
CCDS42 TETQESQAFQERDGRMVAGKVLMAKQEIVECVASAA---MISPGKL-PGETHSQRIAEEA
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240 250 260 270 280 290
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.. ::.: . . .: . ..: :. : . . .: ..:. .:. : :.::
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330 340 350 360 370 380
CCDS42 ECGKAFSRSSALIQHKKIHTGDKSYECIACGKAFGRSSILIEHQRIHTGEKPYECNECGK
390 400 410 420 430 440
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. :: ... :.. ... :... :.:: . : : :..: . .:
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CCDS12 CGRAFSDCSALIRHLRIHSGEKPYQCKVCPKAFAQSSSLIEHQRIHTGEKPYKCSDCGKA
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400
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CCDS11 NECGKAFSQSSYLSQHRRIHSGEKPFICKECGKAYGWCSELIRHRRVHARKEPSH
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