FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7992, 435 aa
1>>>pF1KB7992 435 - 435 aa - 435 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.7613+/-0.000933; mu= 7.3365+/- 0.055
mean_var=207.1348+/-41.229, 0's: 0 Z-trim(113.3): 938 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.089114
statistics sampled from 12907 (13930) to 12907 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.753), E-opt: 0.2 (0.428), width: 16
Scan time: 3.530
The best scores are: opt bits E(32554)
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CCDS11172.1 ZNF286A gene_id:57335|Hs108|chr17 ( 521) 736 107.3 3.7e-23
CCDS12494.1 ZNF566 gene_id:84924|Hs108|chr19 ( 418) 733 106.8 4.2e-23
CCDS46061.1 ZNF566 gene_id:84924|Hs108|chr19 ( 419) 733 106.8 4.2e-23
CCDS33122.1 ZNF470 gene_id:388566|Hs108|chr19 ( 717) 736 107.4 4.7e-23
CCDS12975.1 ZSCAN22 gene_id:342945|Hs108|chr19 ( 491) 731 106.6 5.6e-23
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CCDS2719.1 ZNF502 gene_id:91392|Hs108|chr3 ( 544) 729 106.4 7.2e-23
CCDS47352.1 ZNF879 gene_id:345462|Hs108|chr5 ( 563) 728 106.3 8e-23
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CCDS46211.1 ZNF419 gene_id:79744|Hs108|chr19 ( 464) 723 105.6 1.1e-22
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CCDS42637.1 ZNF419 gene_id:79744|Hs108|chr19 ( 478) 723 105.6 1.1e-22
CCDS42557.1 ZNF829 gene_id:374899|Hs108|chr19 ( 432) 722 105.4 1.1e-22
CCDS54328.1 ZNF419 gene_id:79744|Hs108|chr19 ( 497) 723 105.6 1.1e-22
CCDS54327.1 ZNF419 gene_id:79744|Hs108|chr19 ( 498) 723 105.6 1.2e-22
CCDS4645.1 ZKSCAN8 gene_id:7745|Hs108|chr6 ( 578) 724 105.8 1.2e-22
CCDS54326.1 ZNF419 gene_id:79744|Hs108|chr19 ( 510) 723 105.6 1.2e-22
CCDS54325.1 ZNF419 gene_id:79744|Hs108|chr19 ( 511) 723 105.6 1.2e-22
CCDS74355.1 ZNF570 gene_id:148268|Hs108|chr19 ( 592) 724 105.8 1.2e-22
CCDS59380.1 ZNF829 gene_id:374899|Hs108|chr19 ( 513) 722 105.5 1.3e-22
CCDS4440.1 ZFP2 gene_id:80108|Hs108|chr5 ( 461) 720 105.2 1.4e-22
CCDS75904.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 364) 717 104.7 1.6e-22
CCDS12945.1 ZNF471 gene_id:57573|Hs108|chr19 ( 626) 721 105.4 1.6e-22
CCDS12943.1 ZNF583 gene_id:147949|Hs108|chr19 ( 569) 720 105.3 1.6e-22
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CCDS12497.1 ZNF345 gene_id:25850|Hs108|chr19 ( 488) 718 104.9 1.8e-22
CCDS69664.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 474) 717 104.8 1.9e-22
CCDS6871.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 498) 717 104.8 2e-22
CCDS12959.2 ZNF551 gene_id:90233|Hs108|chr19 ( 670) 719 105.2 2e-22
CCDS10901.1 ZNF19 gene_id:7567|Hs108|chr16 ( 458) 716 104.7 2e-22
>>CCDS82043.1 ZNF232 gene_id:7775|Hs108|chr17 (435 aa)
initn: 3035 init1: 3035 opt: 3035 Z-score: 2127.5 bits: 402.8 E(32554): 3.5e-112
Smith-Waterman score: 3035; 100.0% identity (100.0% similar) in 435 aa overlap (1-435:1-435)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MEPPGPVRGPLQDSSWYEPSAELVQTRMAVSLTAAETLALQGTQGQEKMMMMGPKEEEQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 MEPPGPVRGPLQDSSWYEPSAELVQTRMAVSLTAAETLALQGTQGQEKMMMMGPKEEEQS
10 20 30 40 50 60
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pF1KB7 CEYETRLPGNHSTSQEIFRQRFRHLRYQETPGPREALSQLRVLCCEWLRPEKHTKEQILE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 CEYETRLPGNHSTSQEIFRQRFRHLRYQETPGPREALSQLRVLCCEWLRPEKHTKEQILE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 FLVLEQFLTILPEELQSWVRGHHPKSGEEAVTVLEDLEKGLEPEPQVPGPAHGPAQEEPW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 FLVLEQFLTILPEELQSWVRGHHPKSGEEAVTVLEDLEKGLEPEPQVPGPAHGPAQEEPW
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190 200 210 220 230 240
pF1KB7 EKKESLGAAQEALSIQLQPKETQPFPKSVVTEDGPEPKDKGSLPQPPITEVESQVFSEKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 EKKESLGAAQEALSIQLQPKETQPFPKSVVTEDGPEPKDKGSLPQPPITEVESQVFSEKL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 ATDTSTFEATSEGTLELQQRNPKAERLRWSPAQEESFRQMVVIHKEIPTGKKDHECSECG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 ATDTSTFEATSEGTLELQQRNPKAERLRWSPAQEESFRQMVVIHKEIPTGKKDHECSECG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 KTFIYNSHLVVHQRVHSGEKPYKCSDCGKTFKQSSNLGQHQRIHTGEKPFECNECGKAFR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 KTFIYNSHLVVHQRVHSGEKPYKCSDCGKTFKQSSNLGQHQRIHTGEKPFECNECGKAFR
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 WGAHLVQHQRIHSGEKPYECNECGKAFSQSSYLSQHRRIHSGEKPFICKECGKAYGWCSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 WGAHLVQHQRIHSGEKPYECNECGKAFSQSSYLSQHRRIHSGEKPFICKECGKAYGWCSE
370 380 390 400 410 420
430
pF1KB7 LIRHRRVHARKEPSH
:::::::::::::::
CCDS82 LIRHRRVHARKEPSH
430
>>CCDS11068.1 ZNF232 gene_id:7775|Hs108|chr17 (444 aa)
initn: 2651 init1: 1616 opt: 1634 Z-score: 1154.0 bits: 222.7 E(32554): 5.9e-58
Smith-Waterman score: 3007; 98.0% identity (98.0% similar) in 444 aa overlap (1-435:1-444)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MEPPGPVRGPLQDSSWYEPSAELVQTRMAVSLTAAETLALQGTQGQEKMMMMGPKEEEQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MEPPGPVRGPLQDSSWYEPSAELVQTRMAVSLTAAETLALQGTQGQEKMMMMGPKEEEQS
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pF1KB7 CEYETRLPGNHSTSQEIFRQRFRHLRYQETPGPREALSQLRVLCCEWLRPEKHTKEQILE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 CEYETRLPGNHSTSQEIFRQRFRHLRYQETPGPREALSQLRVLCCEWLRPEKHTKEQILE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 FLVLEQFLTILPEELQSWVRGHHPKSGEEAVTVLEDLEKGLEPEPQVPGPAHGPAQEEPW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 FLVLEQFLTILPEELQSWVRGHHPKSGEEAVTVLEDLEKGLEPEPQVPGPAHGPAQEEPW
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230
pF1KB7 EKKESLGAAQEALSIQLQPKETQPFPKS---------VVTEDGPEPKDKGSLPQPPITEV
:::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::
CCDS11 EKKESLGAAQEALSIQLQPKETQPFPKSEQVYLHFLSVVTEDGPEPKDKGSLPQPPITEV
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 ESQVFSEKLATDTSTFEATSEGTLELQQRNPKAERLRWSPAQEESFRQMVVIHKEIPTGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 ESQVFSEKLATDTSTFEATSEGTLELQQRNPKAERLRWSPAQEESFRQMVVIHKEIPTGK
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 KDHECSECGKTFIYNSHLVVHQRVHSGEKPYKCSDCGKTFKQSSNLGQHQRIHTGEKPFE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 KDHECSECGKTFIYNSHLVVHQRVHSGEKPYKCSDCGKTFKQSSNLGQHQRIHTGEKPFE
310 320 330 340 350 360
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pF1KB7 CNECGKAFRWGAHLVQHQRIHSGEKPYECNECGKAFSQSSYLSQHRRIHSGEKPFICKEC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 CNECGKAFRWGAHLVQHQRIHSGEKPYECNECGKAFSQSSYLSQHRRIHSGEKPFICKEC
370 380 390 400 410 420
420 430
pF1KB7 GKAYGWCSELIRHRRVHARKEPSH
::::::::::::::::::::::::
CCDS11 GKAYGWCSELIRHRRVHARKEPSH
430 440
>>CCDS55503.1 ZNF75D gene_id:7626|Hs108|chrX (415 aa)
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Smith-Waterman score: 882; 36.7% identity (66.9% similar) in 387 aa overlap (59-432:32-408)
30 40 50 60 70 80
pF1KB7 AVSLTAAETLALQGTQGQEKMMMMGPKEEEQSCEYETRLPGNHSTSQEIFRQRFRHLRYQ
:: .: :.. .. . : ..: .::.
CCDS55 AMRELNADSCSSPQMGAMWETSGSVKENSSQSKKYSTKI---ENLGPESACRHFWSFRYH
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pF1KB7 ETPGPREALSQLRVLCCEWLRPEKHTKEQILEFLVLEQFLTILPEELQSWVRGHHPKSGE
:. :: :..:::. :: .::::: :.::::::.:::::::.:::.: :.::. :::.. .
CCDS55 EATGPLETISQLQKLCHQWLRPEIHSKEQILEMLVLEQFLSILPKETQNWVQKHHPQNVK
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pF1KB7 EAVTVLEDLEK---GLEPEPQVPGPAHGPA-QEEPWEKKESLGAAQEALSIQLQPKETQP
.:....: :.. : . : . . .:: : . :. ...: ... :
CCDS55 QALVLVEFLQREPDGTKNESLLTFEDVAVYFSEEEW---QLLNPLEKTLYNDVM----QD
120 130 140 150 160 170
210 220 230 240 250
pF1KB7 FPKSVVTEDGPEPKDKGSLPQPPITEVESQVFSEKLATDT------STFEATSEGTLELQ
. ..:.. .: :. .. : :. . ... : .:. . : .
CCDS55 IYETVISLGLKLKNDTGNDHPISVSTSEIQTSGCEVSKKTRMKIAQKTMGRENPGDTHSV
180 190 200 210 220 230
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pF1KB7 QRNPKA--ERLRWSPAQ-EESFRQMVVIHKEIPTGKKDHECSECGKTFIYNSHLVVHQRV
:. .: .. : .:: .. . ... .: . :::.: .:.::::.: .: :. :.:.
CCDS55 QKWHRAFPRKKRKKPATCKQELPKLMDLHGKGPTGEKPFKCQECGKSFRVSSDLIKHHRI
240 250 260 270 280 290
320 330 340 350 360 370
pF1KB7 HSGEKPYKCSDCGKTFKQSSNLGQHQRIHTGEKPFECNECGKAFRWGAHLVQHQRIHSGE
:.:::::::..: . :. ::.:..: : : ::..:. :::.: ...: :::::.::
CCDS55 HTGEKPYKCQQCDRRFRWSSDLNKHFMTHQGIKPYRCSWCGKSFSHNTNLHTHQRIHTGE
300 310 320 330 340 350
380 390 400 410 420 430
pF1KB7 KPYECNECGKAFSQSSYLSQHRRIHSGEKPFICKECGKAYGWCSELIRHRRVHARKEPSH
::..:.:::: : :.:.: .:.: :.::.:. :. : . .. : :.::...: :.:
CCDS55 KPFKCDECGKRFIQNSHLIKHQRTHTGEQPYTCSLCKRNFSRRSSLLRHQKLHRRREACL
360 370 380 390 400 410
CCDS55 VSPN
>>CCDS43619.1 ZNF3 gene_id:7551|Hs108|chr7 (446 aa)
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Smith-Waterman score: 789; 47.1% identity (70.8% similar) in 257 aa overlap (186-433:113-367)
160 170 180 190 200 210
pF1KB7 DLEKGLEPEPQVPGPAHGPAQEEPWEKKESLGAAQEALSIQLQPKETQPFPKSVVTEDGP
:: :. .: :. ::. :. :
CCDS43 NYGNVFSLDRETRTENDQEISEDTRSHGVLLGRFQKDISQGLKFKEAYEREVSLKRPLGN
90 100 110 120 130 140
220 230 240 250 260
pF1KB7 EPKDKGSLPQPPITEV--ESQVF-----SEKLATDTSTFEATSEGTLELQQRNPKAERLR
: .. . .: . .: : .. ::: ..: ..:. : .:: : ..: .
CCDS43 SPGERLNRKMPDFGQVTVEEKLTPRGERSEKYNDFGNSFTVNSN--LISHQRLPVGDRPH
150 160 170 180 190 200
270 280 290 300 310 320
pF1KB7 WSPAQEESFRQM--VVIHKEIPTGKKDHECSECGKTFIYNSHLVVHQRVHSGEKPYKCSD
.:: . .. :..: ::.: .::.::::.: .:::. :::.:.:::::.:::
CCDS43 KCDECSKSFNRTSDLIQHQRIHTGEKPYECNECGKAFSQSSHLIQHQRIHTGEKPYECSD
210 220 230 240 250 260
330 340 350 360 370 380
pF1KB7 CGKTFKQSSNLGQHQRIHTGEKPFECNECGKAFRWGAHLVQHQRIHSGEKPYECNECGKA
:::::. :: : :.::::::::.:::::::.: :.. :..:::::.::::: :::::::
CCDS43 CGKTFSCSSALILHRRIHTGEKPYECNECGKTFSWSSTLTHHQRIHTGEKPYACNECGKA
270 280 290 300 310 320
390 400 410 420 430
pF1KB7 FSQSSYLSQHRRIHSGEKPFICKECGKAYGWCSELIRHRRVHARKEPSH
::.:: : .:.:::.::::. :.:::::.. :.: .:.:.:. ..:
CCDS43 FSRSSTLIHHQRIHTGEKPYECNECGKAFSQSSHLYQHQRIHTGEKPYECMECGGKFTYS
330 340 350 360 370 380
CCDS43 SGLIQHQRIHTGENPYECSECGKAFRYSSALVRHQRIHTGEKPLNGIGMSKSSLRVTTEL
390 400 410 420 430 440
>>CCDS45852.1 ZNF397 gene_id:84307|Hs108|chr18 (534 aa)
initn: 3318 init1: 748 opt: 757 Z-score: 543.6 bits: 110.0 E(32554): 5.8e-24
Smith-Waterman score: 1245; 47.7% identity (68.9% similar) in 438 aa overlap (47-433:18-452)
20 30 40 50 60 70
pF1KB7 YEPSAELVQTRMAVSLTAAETLALQGTQGQEKMMMMGPKEEEQSCEYETRLPGNHSTSQE
:. ... :.. : . . . :. .. ::
CCDS45 MAVESGVISTLIPQDPPEQELILVKVEDNFSWDEKFKQNGSTQSCQE
10 20 30 40
80 90 100 110 120 130
pF1KB7 IFRQRFRHLRYQETPGPREALSQLRVLCCEWLRPEKHTKEQILEFLVLEQFLTILPEELQ
.:::.::.. ::::::::::::.:. :: .:: :: ::::::::.:::::::.:::::::
CCDS45 LFRQQFRKFCYQETPGPREALSRLQELCYQWLMPELHTKEQILELLVLEQFLSILPEELQ
50 60 70 80 90 100
140 150 160 170 180 190
pF1KB7 SWVRGHHPKSGEEAVTVLEDLEKGLE-PEPQVPGPAHGPAQEEPWEKKESLGAAQEALSI
::. :.:.:::::::.:::::. .. : :::. .::: ::. : :.::. .:
CCDS45 IWVQQHNPESGEEAVTLLEDLEREFDDPGQQVPASPQGPAV--PWKDLTCLRASQESTDI
110 120 130 140 150 160
200 210 220 230
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.::: .:: : ::: ..:..: : :..: ::: : :.: ::..
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170 180 190 200 210 220
240 250 260
pF1KB7 ------SEKLATDTS-------TFEATSEGTLELQ----------------QRNPKAERL
.::: . .. : : : .: :. : ::
CCDS45 KQGSATGEKLRSPSQGGSFSQVIFTNKSLGKRDLYDEAERCLILTTDSIMCQKVPPEERP
230 240 250 260 270 280
270 280 290 300 310 320
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. .::.: . :..: ::.: ..:..:::.: :.:..:::.::::: :.::
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290 300 310 320 330 340
330 340 350 360 370 380
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.:::.:.::: : .:..:::::: .:::::::: ...:. :::::.::::::::::::
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390 400 410 420 430
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.::::: : .:.:::.::.:. :.:::::. :::: :.:.:. ..:
CCDS45 TFSQSSKLIRHQRIHTGERPYECNECGKAFRQSSELITHQRIHSGEKPYECSECGKAFSL
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. .. : .:... .: : . :: :..: .. . . .. :: : :
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.::::::::: .. :..:::::.:::::::.::::::...::: :::::. :::. :
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270 280 290
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. :. .:: .:. :. . . .:.::: :.:.:.:
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360 370 380 390 400 410
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CCDS69 SYLILHRRIHTREKPYKCTKCGKAFTRSSTLTLHHRIHARERASEYSPASLDAFGAFLKS
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CCDS34 APPHEGSPRDQAMASALFTADSQAMVKIEDMAVSLILEEWGCQNLARRNLSRDNRQENYG
210 220 230 240 250 260
250 260
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270 280 290
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. :. .:: .:. :. . . .:.::: :.:.:.:
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pF1KB7 FRWGAHLVQHQRIHSGEKPYECNECGKAFSQSSYLSQHRRIHSGEKPFICKECGKAYGWC
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CCDS34 SYLILHRRIHTREKPYKCTKCGKAFTRSSTLTLHHRIHARERASEYSPASLDAFGAFLKS
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pF1KB7 SH
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CCDS12 MARKLVMFRDVAIDFSQEE-WE---CLDSAQRDLYRDVMLENYSN
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CCDS12 LVSLDLPSRCASKDLSPEKNTYETELSQWEMSDRLENCDLEESNSRD--YLEA--KGKME
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pF1KB7 LQQRNPKAERLRWSPAQEES---FRQMVVI--HKEIPTGKKDHECSECGKTFIYNSHLVV
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CCDS12 KQQENQK-EYFRQGMIIYDKMSIFNQHTYLSQHSRCHSTEKPYKCKECGKAFRRASHLTQ
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CCDS12 HQSIHTGEKPYECKQCGKAFSRDSQLSLHQRLHTGEKPYACKECGKAFTQSSQLILHHRI
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pF1KB7 HSGEKPYECNECGKAFSQSSYLSQHRRIHSGEKPFICKECGKAYGWCSELIRHRRVHARK
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CCDS12 HTGEKPYKCEECGKAFIRSSQLTRHQKVHTGEKPYECKECGKAFTQNSQLTLHQRLHTGE
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CCDS12 KLYECKECRKVFTQLSQLILHKRIHTGEKPYECKECGKAFICGSQLSQHQKIHNGEKPYE
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CCDS12 TRHLKIHTGEKPFECKECGKAFSCSSYLSQHQRIHTGKKPYECKECGKAFSYCSNLIDHQ
220 230 240 250 260 270
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CCDS12 RIHTGEKPYECKVCGKAFTKSSQLFQHARIHTGEKPYECKECGKAFTQSSKLVQHQRIHT
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CCDS12 GEKPYECKECGKAFSSGSALTNHQRIHTGEKPYDCKECGKAFTQSSQLRQHQRIHAGEKP
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pF1KB7 SH
CCDS12 FECLECGKAFTQNSQLFQHQRIHTDEKPYECNECGKAFNKCSNLTRHLRIHTGEKPYNCK
400 410 420 430 440 450
435 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]