FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB7996, 470 aa 1>>>pF1KB7996 470 - 470 aa - 470 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.3477+/-0.00108; mu= -5.2594+/- 0.064 mean_var=309.0144+/-64.668, 0's: 0 Z-trim(111.8): 126 B-trim: 93 in 1/51 Lambda= 0.072960 statistics sampled from 12575 (12699) to 12575 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.724), E-opt: 0.2 (0.39), width: 16 Scan time: 3.650 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS8783.1 PRPH gene_id:5630|Hs108|chr12 ( 470) 2958 325.2 9.5e-89 CCDS33383.1 DES gene_id:1674|Hs108|chr2 ( 470) 1664 188.9 9.5e-48 CCDS7120.1 VIM gene_id:7431|Hs108|chr10 ( 466) 1613 183.6 3.9e-46 CCDS11491.1 GFAP gene_id:2670|Hs108|chr17 ( 432) 1438 165.1 1.3e-40 CCDS45708.1 GFAP gene_id:2670|Hs108|chr17 ( 431) 1350 155.9 7.9e-38 CCDS59296.1 GFAP gene_id:2670|Hs108|chr17 ( 438) 1341 154.9 1.5e-37 CCDS7545.1 INA gene_id:9118|Hs108|chr10 ( 499) 1237 144.0 3.4e-34 CCDS75712.1 NEFL gene_id:4747|Hs108|chr8 ( 543) 1124 132.2 1.4e-30 CCDS6046.1 NEFM gene_id:4741|Hs108|chr8 ( 916) 1065 126.1 1.5e-28 CCDS8841.1 KRT8 gene_id:3856|Hs108|chr12 ( 483) 864 104.7 2.2e-22 CCDS58234.1 KRT8 gene_id:3856|Hs108|chr12 ( 511) 864 104.8 2.3e-22 CCDS13858.1 NEFH gene_id:4744|Hs108|chr22 (1020) 863 104.9 4.1e-22 CCDS8830.1 KRT5 gene_id:3852|Hs108|chr12 ( 590) 767 94.6 3e-19 CCDS8827.1 KRT75 gene_id:9119|Hs108|chr12 ( 551) 760 93.8 4.7e-19 CCDS8822.1 KRT7 gene_id:3855|Hs108|chr12 ( 469) 745 92.2 1.3e-18 CCDS41786.1 KRT6A gene_id:3853|Hs108|chr12 ( 564) 734 91.1 3.2e-18 CCDS8829.1 KRT6C gene_id:286887|Hs108|chr12 ( 564) 732 90.9 3.7e-18 CCDS8828.1 KRT6B gene_id:3854|Hs108|chr12 ( 564) 729 90.6 4.6e-18 CCDS41787.2 KRT4 gene_id:3851|Hs108|chr12 ( 520) 728 90.5 4.7e-18 CCDS8834.1 KRT73 gene_id:319101|Hs108|chr12 ( 540) 727 90.4 5.2e-18 CCDS8825.1 KRT84 gene_id:3890|Hs108|chr12 ( 600) 728 90.5 5.2e-18 CCDS44895.1 KRT3 gene_id:3850|Hs108|chr12 ( 628) 725 90.2 6.7e-18 CCDS8831.1 KRT71 gene_id:112802|Hs108|chr12 ( 523) 712 88.8 1.5e-17 CCDS8835.1 KRT2 gene_id:3849|Hs108|chr12 ( 639) 707 88.3 2.5e-17 CCDS41785.1 KRT86 gene_id:3892|Hs108|chr12 ( 486) 702 87.7 3e-17 CCDS8823.1 KRT83 gene_id:3889|Hs108|chr12 ( 493) 700 87.5 3.5e-17 CCDS8838.1 KRT76 gene_id:51350|Hs108|chr12 ( 638) 702 87.8 3.6e-17 CCDS8839.1 KRT79 gene_id:338785|Hs108|chr12 ( 535) 698 87.3 4.3e-17 CCDS31805.1 KRT81 gene_id:3887|Hs108|chr12 ( 505) 690 86.5 7.3e-17 CCDS8832.1 KRT74 gene_id:121391|Hs108|chr12 ( 529) 689 86.4 8.1e-17 CCDS8837.1 KRT77 gene_id:374454|Hs108|chr12 ( 578) 688 86.3 9.4e-17 CCDS8824.1 KRT85 gene_id:3891|Hs108|chr12 ( 507) 682 85.6 1.3e-16 CCDS8836.1 KRT1 gene_id:3848|Hs108|chr12 ( 644) 673 84.7 3e-16 CCDS8840.1 KRT78 gene_id:196374|Hs108|chr12 ( 520) 669 84.3 3.5e-16 CCDS41784.1 KRT80 gene_id:144501|Hs108|chr12 ( 422) 661 83.3 5.3e-16 CCDS8821.2 KRT80 gene_id:144501|Hs108|chr12 ( 452) 661 83.4 5.6e-16 CCDS8826.1 KRT82 gene_id:3888|Hs108|chr12 ( 513) 655 82.8 9.5e-16 CCDS8833.1 KRT72 gene_id:140807|Hs108|chr12 ( 511) 644 81.6 2.1e-15 CCDS11396.1 KRT13 gene_id:3860|Hs108|chr17 ( 458) 586 75.5 1.3e-13 CCDS11397.1 KRT13 gene_id:3860|Hs108|chr17 ( 420) 584 75.2 1.5e-13 CCDS11402.1 KRT17 gene_id:3872|Hs108|chr17 ( 432) 580 74.8 2e-13 CCDS11378.1 KRT12 gene_id:3859|Hs108|chr17 ( 494) 578 74.7 2.5e-13 CCDS11400.1 KRT14 gene_id:3861|Hs108|chr17 ( 472) 577 74.5 2.6e-13 CCDS31809.1 KRT18 gene_id:3875|Hs108|chr12 ( 430) 575 74.3 2.9e-13 CCDS73473.1 KRT78 gene_id:196374|Hs108|chr12 ( 410) 573 74.1 3.2e-13 CCDS11377.1 KRT10 gene_id:3858|Hs108|chr17 ( 584) 572 74.1 4.5e-13 CCDS11394.2 KRT35 gene_id:3886|Hs108|chr17 ( 455) 562 72.9 7.7e-13 CCDS11398.1 KRT15 gene_id:3866|Hs108|chr17 ( 456) 553 72.0 1.5e-12 CCDS11379.1 KRT20 gene_id:54474|Hs108|chr17 ( 424) 550 71.7 1.7e-12 CCDS11401.1 KRT16 gene_id:3868|Hs108|chr17 ( 473) 547 71.4 2.4e-12 >>CCDS8783.1 PRPH gene_id:5630|Hs108|chr12 (470 aa) initn: 2958 init1: 2958 opt: 2958 Z-score: 1706.8 bits: 325.2 E(32554): 9.5e-89 Smith-Waterman score: 2958; 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CCDS33 LEGEESRINLPIQTYSALNFRETSPE-QRGSEVHTKKTVMIKTIETRDGEVVSEATQQQH 410 420 430 440 450 460 460 470 pF1KB7 SELDKSSAHSY : CCDS33 EVL 470 >>CCDS7120.1 VIM gene_id:7431|Hs108|chr10 (466 aa) initn: 1600 init1: 924 opt: 1613 Z-score: 941.7 bits: 183.6 E(32554): 3.9e-46 Smith-Waterman score: 1650; 58.1% identity (82.5% similar) in 458 aa overlap (13-458:7-462) 10 20 30 40 50 pF1KB7 MSHHPSGLRAGFSSTSYRRTFGPPPSLSPGAFSYSSSSRFSSSRLLGSA-SPSSSVRL-- ::.:::: :: : . : . : : . . . :::: ::.: : CCDS71 MSTRSVSSSSYRRMFGGPGTASRPSSSRSYVTTSTRTYSLGSALRPSTSRSLYA 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 pF1KB7 ---GSFRSPRAGAGAL------LRLPSERLDFSMAEALNQEFLATRSNEKQELQELNDRF :. . :..: : .:: .. .:::.:.:.: :: ::.::: ::::::::: CCDS71 SSPGGVYATRSSAVRLRSSVPGVRLLQDSVDFSLADAINTEFKNTRTNEKVELQELNDRF 60 70 80 90 100 110 110 120 130 140 150 160 pF1KB7 ANFIEKVRFLEQQNAALRGELSQARGQEPARADQLCQQELRELRRELELLGRERDRVQVE ::.:.::::::::: : .:: : .:: .: .: ..:.:::::... : .. ::.:: CCDS71 ANYIDKVRFLEQQNKILLAELEQLKGQGKSRLGDLYEEEMRELRRQVDQLTNDKARVEVE 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 pF1KB7 RDGLAEDLAALKQRLEEETRKREDAEHNLVLFRKDVDDATLSRLELERKIESLMDEIEFL ::.::::. :...:.:: .::.::..: ::.:::.:.:.::.::::.:::..:: :: CCDS71 RDNLAEDIMRLREKLQEEMLQREEAENTLQSFRQDVDNASLARLDLERKVESLQEEIAFL 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KB7 KKLHEEELRDLQVSVESQQVQQVEVEATVKPELTAALRDIRAQYESIAAKNLQEAEEWYK :::::::...::.... :.:: ..:... ::.:::::::.: ::::.::::::::::::: CCDS71 KKLHEEEIQELQAQIQEQHVQ-IDVDVS-KPDLTAALRDVRQQYESVAAKNLQEAEEWYK 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KB7 SKYADLSDAANRNHEALRQAKQEMNESRRQIQSLTCEVDGLRGTNEALLRQLRELEEQFA ::.::::.:::::..:::::::: .: :::.::::::::.:.::::.: ::.::.::.:: CCDS71 SKFADLSEAANRNNDALRQAKQESTEYRRQVQSLTCEVDALKGTNESLERQMREMEENFA 300 310 320 330 340 350 350 360 370 380 390 400 pF1KB7 LEAGGYQAGAARLEEELRQLKEEMARHLREYQELLNVKMALDIEIATYRKLLEGEESRIS .::..:: .::..:....::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::: CCDS71 VEAANYQDTIGRLQDEIQNMKEEMARHLREYQDLLNVKMALDIEIATYRKLLEGEESRIS 360 370 380 390 400 410 410 420 430 440 450 460 pF1KB7 VPVHSFASLNIKTTVPEVEPPQDSHSRKTVLIKTIETRNGEVVTESQKEQRSELDKSSAH .:. .:.:::.. : . : :.::..:.::::.:::.:.:..:..... CCDS71 LPLPNFSSLNLRETNLDSLPLVDTHSKRTLLIKTVETRDGQVINETSQHHDDLE 420 430 440 450 460 470 pF1KB7 SY >>CCDS11491.1 GFAP gene_id:2670|Hs108|chr17 (432 aa) initn: 1497 init1: 823 opt: 1438 Z-score: 842.6 bits: 165.1 E(32554): 1.3e-40 Smith-Waterman score: 1438; 56.2% identity (85.1% similar) in 402 aa overlap (64-459:30-429) 40 50 60 70 80 pF1KB7 YSSSSRFSSSRLLGSASPSSSVRLGSFRSPRAGAG---ALLRLPSE---RLDFSMAEALN : : : .: :.: :.:::.: ::: CCDS11 MERRRITSAARRSYVSSGEMMVGGLAPGRRLGPGTRLSLARMPPPLPTRVDFSLAGALN 10 20 30 40 50 90 100 110 120 130 140 pF1KB7 QEFLATRSNEKQELQELNDRFANFIEKVRFLEQQNAALRGELSQARGQEPARADQLCQQE : ::..:. :..:::::::..::::::::::: :: .::.: :..::.. .. : : CCDS11 AGFKETRASERAEMMELNDRFASYIEKVRFLEQQNKALAAELNQLRAKEPTKLADVYQAE 60 70 80 90 100 110 150 160 170 180 190 200 pF1KB7 LRELRRELELLGRERDRVQVERDGLAEDLAALKQRLEEETRKREDAEHNLVLFRKDVDDA ::::: .:. : . :..::::.::.:::...:.:..:: : .::.::. .:...:.: CCDS11 LRELRLRLDQLTANSARLEVERDNLAQDLATVRQKLQDETNLRLEAENNLAAYRQEADEA 120 130 140 150 160 170 210 220 230 240 250 260 pF1KB7 TLSRLELERKIESLMDEIEFLKKLHEEELRDLQVSVESQQVQQVEVEATVKPELTAALRD ::.::.:::::::: .::.::.:.::::.:.:: .. :::. ::.... ::.:::::.. CCDS11 TLARLDLERKIESLEEEIRFLRKIHEEEVRELQEQLARQQVH-VELDVA-KPDLTAALKE 180 190 200 210 220 230 270 280 290 300 310 320 pF1KB7 IRAQYESIAAKNLQEAEEWYKSKYADLSDAANRNHEALRQAKQEMNESRRQIQSLTCEVD ::.:::..:..:..::::::.::.:::.::: :: : :::::.: :. :::.:::::... CCDS11 IRTQYEAMASSNMHEAEEWYRSKFADLTDAAARNAELLRQAKHEANDYRRQLQSLTCDLE 240 250 260 270 280 290 330 340 350 360 370 380 pF1KB7 GLRGTNEALLRQLRELEEQFALEAGGYQAGAARLEEELRQLKEEMARHLREYQELLNVKM .::::::.: ::.:: ::. . ::..:: . :::::: ..::.::::::.:::.:::::. CCDS11 SLRGTNESLERQMREQEERHVREAASYQEALARLEEEGQSLKDEMARHLQEYQDLLNVKL 300 310 320 330 340 350 390 400 410 420 430 440 pF1KB7 ALDIEIATYRKLLEGEESRISVPVHSFASLNIKTTVPEVEPPQDSHSRKTVLIKTIETRN :::::::::::::::::.::..::..:..:.:. : ... ...: ......::.: :. CCDS11 ALDIEIATYRKLLEGEENRITIPVQTFSNLQIRETSLDTKSVSEGHLKRNIVVKTVEMRD 360 370 380 390 400 410 450 460 470 pF1KB7 GEVVTESQKEQRSELDKSSAHSY :::. ::..:.. CCDS11 GEVIKESKQEHKDVM 420 430 >>CCDS45708.1 GFAP gene_id:2670|Hs108|chr17 (431 aa) initn: 1400 init1: 726 opt: 1350 Z-score: 792.6 bits: 155.9 E(32554): 7.9e-38 Smith-Waterman score: 1350; 55.3% identity (83.1% similar) in 396 aa overlap (64-451:30-423) 40 50 60 70 80 pF1KB7 YSSSSRFSSSRLLGSASPSSSVRLGSFRSPRAGAG---ALLRLPSE---RLDFSMAEALN : : : .: :.: :.:::.: ::: CCDS45 MERRRITSAARRSYVSSGEMMVGGLAPGRRLGPGTRLSLARMPPPLPTRVDFSLAGALN 10 20 30 40 50 90 100 110 120 130 140 pF1KB7 QEFLATRSNEKQELQELNDRFANFIEKVRFLEQQNAALRGELSQARGQEPARADQLCQQE : ::..:. :..:::::::..::::::::::: :: .::.: :..::.. .. : : CCDS45 AGFKETRASERAEMMELNDRFASYIEKVRFLEQQNKALAAELNQLRAKEPTKLADVYQAE 60 70 80 90 100 110 150 160 170 180 190 200 pF1KB7 LRELRRELELLGRERDRVQVERDGLAEDLAALKQRLEEETRKREDAEHNLVLFRKDVDDA ::::: .:. : . :..::::.::.:::...:.:..:: : .::.::. .:...:.: CCDS45 LRELRLRLDQLTANSARLEVERDNLAQDLATVRQKLQDETNLRLEAENNLAAYRQEADEA 120 130 140 150 160 170 210 220 230 240 250 260 pF1KB7 TLSRLELERKIESLMDEIEFLKKLHEEELRDLQVSVESQQVQQVEVEATVKPELTAALRD ::.::.:::::::: .::.::.:.::::.:.:: .. :::. ::.... ::.:::::.. CCDS45 TLARLDLERKIESLEEEIRFLRKIHEEEVRELQEQLARQQVH-VELDVA-KPDLTAALKE 180 190 200 210 220 230 270 280 290 300 310 320 pF1KB7 IRAQYESIAAKNLQEAEEWYKSKYADLSDAANRNHEALRQAKQEMNESRRQIQSLTCEVD ::.:::..:..:..::::::.::.:::.::: :: : :::::.: :. :::.:::::... CCDS45 IRTQYEAMASSNMHEAEEWYRSKFADLTDAAARNAELLRQAKHEANDYRRQLQSLTCDLE 240 250 260 270 280 290 330 340 350 360 370 380 pF1KB7 GLRGTNEALLRQLRELEEQFALEAGGYQAGAARLEEELRQLKEEMARHLREYQELLNVKM .::::::.: ::.:: ::. . ::..:: . :::::: ..::.::::::.:::.:::::. CCDS45 SLRGTNESLERQMREQEERHVREAASYQEALARLEEEGQSLKDEMARHLQEYQDLLNVKL 300 310 320 330 340 350 390 400 410 420 430 440 pF1KB7 ALDIEIATYRKLLEGEESRISVPVHSFASLNIK--TTVPEVEPPQDSHSRKTVLIKTIET :::::::::::::::::.::..::..:..:.:. .. . : . .. :.. :..: CCDS45 ALDIEIATYRKLLEGEENRITIPVQTFSNLQIRGGKSTKDGENHKVTRYLKSLTIRVIPI 360 370 380 390 400 410 450 460 470 pF1KB7 RNGEVVTESQKEQRSELDKSSAHSY . ..: CCDS45 QAHQIVNGTPPARG 420 430 >>CCDS59296.1 GFAP gene_id:2670|Hs108|chr17 (438 aa) initn: 1400 init1: 726 opt: 1341 Z-score: 787.4 bits: 154.9 E(32554): 1.5e-37 Smith-Waterman score: 1341; 59.0% identity (85.7% similar) in 363 aa overlap (64-420:30-390) 40 50 60 70 80 pF1KB7 YSSSSRFSSSRLLGSASPSSSVRLGSFRSPRAGAG---ALLRLPSE---RLDFSMAEALN : : : .: :.: :.:::.: ::: CCDS59 MERRRITSAARRSYVSSGEMMVGGLAPGRRLGPGTRLSLARMPPPLPTRVDFSLAGALN 10 20 30 40 50 90 100 110 120 130 140 pF1KB7 QEFLATRSNEKQELQELNDRFANFIEKVRFLEQQNAALRGELSQARGQEPARADQLCQQE : ::..:. :..:::::::..::::::::::: :: .::.: :..::.. .. : : CCDS59 AGFKETRASERAEMMELNDRFASYIEKVRFLEQQNKALAAELNQLRAKEPTKLADVYQAE 60 70 80 90 100 110 150 160 170 180 190 200 pF1KB7 LRELRRELELLGRERDRVQVERDGLAEDLAALKQRLEEETRKREDAEHNLVLFRKDVDDA ::::: .:. : . :..::::.::.:::...:.:..:: : .::.::. .:...:.: CCDS59 LRELRLRLDQLTANSARLEVERDNLAQDLATVRQKLQDETNLRLEAENNLAAYRQEADEA 120 130 140 150 160 170 210 220 230 240 250 260 pF1KB7 TLSRLELERKIESLMDEIEFLKKLHEEELRDLQVSVESQQVQQVEVEATVKPELTAALRD ::.::.:::::::: .::.::.:.::::.:.:: .. :::. ::.... ::.:::::.. CCDS59 TLARLDLERKIESLEEEIRFLRKIHEEEVRELQEQLARQQVH-VELDVA-KPDLTAALKE 180 190 200 210 220 230 270 280 290 300 310 320 pF1KB7 IRAQYESIAAKNLQEAEEWYKSKYADLSDAANRNHEALRQAKQEMNESRRQIQSLTCEVD ::.:::..:..:..::::::.::.:::.::: :: : :::::.: :. :::.:::::... CCDS59 IRTQYEAMASSNMHEAEEWYRSKFADLTDAAARNAELLRQAKHEANDYRRQLQSLTCDLE 240 250 260 270 280 290 330 340 350 360 370 380 pF1KB7 GLRGTNEALLRQLRELEEQFALEAGGYQAGAARLEEELRQLKEEMARHLREYQELLNVKM .::::::.: ::.:: ::. . ::..:: . :::::: ..::.::::::.:::.:::::. CCDS59 SLRGTNESLERQMREQEERHVREAASYQEALARLEEEGQSLKDEMARHLQEYQDLLNVKL 300 310 320 330 340 350 390 400 410 420 430 440 pF1KB7 ALDIEIATYRKLLEGEESRISVPVHSFASLNIKTTVPEVEPPQDSHSRKTVLIKTIETRN :::::::::::::::::.::..::..:..:.:. CCDS59 ALDIEIATYRKLLEGEENRITIPVQTFSNLQIRGQYSRASWEGHWSPAPSSRACRLLQTG 360 370 380 390 400 410 450 460 470 pF1KB7 GEVVTESQKEQRSELDKSSAHSY CCDS59 TEDQGKGIQLSLGAFVTLQRS 420 430 >>CCDS7545.1 INA gene_id:9118|Hs108|chr10 (499 aa) initn: 1226 init1: 659 opt: 1237 Z-score: 727.4 bits: 144.0 E(32554): 3.4e-34 Smith-Waterman score: 1237; 50.5% identity (76.3% similar) in 430 aa overlap (13-430:11-430) 10 20 30 40 50 pF1KB7 MSHHPSGLRAGFSSTSYRRTFGPPPSLSP------GAFSYSSSSRFSSSRLLGSASPSSS ::.:::..:: :: :: .. :.: .: : . .::. ::. CCDS75 MSFGSEHYLCSSSSYRKVFGDGSRLSARLSGAGGAGGFRSQS-LSRSNVASSAACSSA 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KB7 VRLG---SFRSPRAGAGALLRLPSERLDFSMAEALNQEFLATRSNEKQELQELNDRFANF :: ..: : :. : ::.:.: : ..:. :.:::..:: :::::: : CCDS75 SSLGLGLAYRRPPASDG---------LDLSQAAARTNEYKIIRTNEKEQLQGLNDRFAVF 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 pF1KB7 IEKVRFLEQQNAALRGELS--QARGQEPARADQLCQQELRELRRELELLGRERDRVQVER ::::. :: :: ::..::. . : ::.:. .: :.:::.:: .:: . :... .:: CCDS75 IEKVHQLETQNRALEAELAALRQRHAEPSRVGELFQRELRDLRAQLEEASSARSQALLER 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 pF1KB7 DGLAEDLAALKQRLEEETRKREDAEHNLVLFRKDVDDATLSRLELERKIESLMDEIEFLK :::::.. :. : :::.: :: ::. : ..::: :::.::.::.:.:::.::. :.. CCDS75 DGLAEEVQRLRARCEEESRGREGAERALKAQQRDVDGATLARLDLEKKVESLLDELAFVR 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 pF1KB7 KLHEEELRDLQVSVESQQVQQVEVEATV-KPELTAALRDIRAQYESIAAKNLQEAEEWYK ..:.::. .: ....... .::..:: ::.::.:::.:::::::.:::::: :::::: CCDS75 QVHDEEVAELLATLQASSQAAAEVDVTVAKPDLTSALREIRAQYESLAAKNLQSAEEWYK 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 pF1KB7 SKYADLSDAANRNHEALRQAKQEMNESRRQIQSLTCEVDGLRGTNEALLRQLRELEEQFA ::.:.:.. : :. ::.: ...:..: :::.:. : :..::::.::.: ::. ::::. . CCDS75 SKFANLNEQAARSTEAIRASREEIHEYRRQLQARTIEIEGLRGANESLERQILELEERHS 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 pF1KB7 LEAGGYQAGAARLEEELRQLKEEMARHLREYQELLNVKMALDIEIATYRKLLEGEESRIS :..::: . ..::..::. : ::::::::::.:::::::::::::.:::::::::.:.: CCDS75 AEVAGYQDSIGQLENDLRNTKSEMARHLREYQDLLNVKMALDIEIAAYRKLLEGEETRFS 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 pF1KB7 VPVHSFASLNIKTTVPEVEPPQDSHSRKTVLIKTIETRNGEVVTESQKEQRSELDKSSAH . :...:: . . ::. CCDS75 TSGLSISGLNPLPNPSYLLPPRILSATTSKVSSTGLSLKKEEEEEEASKVASKKTSQIGE 410 420 430 440 450 460 >>CCDS75712.1 NEFL gene_id:4747|Hs108|chr8 (543 aa) initn: 645 init1: 645 opt: 1124 Z-score: 662.7 bits: 132.2 E(32554): 1.4e-30 Smith-Waterman score: 1124; 49.1% identity (76.3% similar) in 401 aa overlap (12-408:9-401) 10 20 30 40 50 pF1KB7 MSHHPSGLRAGFSSTSYRRTFGPPPSLSPGAF-SYSSSSRFSSSRLLGSASPSSSVRLGS . ::::.: . : . .. : :..: . : . .: : ::: CCDS75 MSSFSYEPYYSTSYKRRYVETPRVHISSVRSGYSTARSAYSSYSAPVSSSLSVR--- 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KB7 FRSPRAGAGALLRLPS-ERLDFSMAEALNQEFLATRSNEKQELQELNDRFANFIEKVRFL :: ...:.: .:: : ::.:.. :..... . :..:: .::.::::::.:::.:. : CCDS75 -RSYSSSSGSL--MPSLENLDLSQVAAISNDLKSIRTQEKAQLQDLNDRFASFIERVHEL 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KB7 EQQNAALRGELSQARGQ--EPARADQLCQQELRELRRELELLGRERDRVQVERDGLAEDL :::: .:..:: : . ::.: : .::.:.:: : :.. .: ::.:: : : CCDS75 EQQNKVLEAELLVLRQKHSEPSRFRALYEQEIRDLRLAAEDATNEKQALQGEREGLEETL 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KB7 AALKQRLEEETRKREDAEHNLVLFRKDVDDATLSRLELERKIESLMDEIEFLKKLHEEEL :. : :::. .::::: :. :: .:.:.:.: :::..:.:::::: ::::.::::. CCDS75 RNLQARYEEEVLSREDAEGRLMEARKGADEAALARAELEKRIDSLMDEISFLKKVHEEEI 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KB7 RDLQVSVESQQVQQVEVEATVKPELTAALRDIRAQYESIAAKNLQEAEEWYKSKYADLSD .::.... :.. ::...: ::.:.:::.:::::::..::::.:.::::.::... :.. CCDS75 AELQAQIQYAQIS-VEMDVT-KPDLSAALKDIRAQYEKLAAKNMQNAEEWFKSRFTVLTE 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 pF1KB7 AANRNHEALRQAKQEMNESRRQIQSLTCEVDGLRGTNEALLRQLRELEEQFALEAGGYQA .: .: .:.: ::.:..:::: ... : :... :: :::: .::.:::.. . ...: CCDS75 SAAKNTDAVRAAKDEVSESRRLLKAKTLEIEACRGMNEALEKQLQELEDKQNADISAMQD 290 300 310 320 330 340 360 370 380 390 400 410 pF1KB7 GAARLEEELRQLKEEMARHLREYQELLNVKMALDIEIATYRKLLEGEESRISVPVHSFAS .::.::: : ::::.:.:::.:::::::::::::.:::::::::.:.: CCDS75 TINKLENELRTTKSEMARYLKEYQDLLNVKMALDIEIAAYRKLLEGEETRLSFTSVGSIT 350 360 370 380 390 400 420 430 440 450 460 470 pF1KB7 LNIKTTVPEVEPPQDSHSRKTVLIKTIETRNGEVVTESQKEQRSELDKSSAHSY CCDS75 SGYSQSSQVFGRSAYGGLQTSSYLMSTRSFPSYYTSHVQEEQIEVEETIEAAKAEEAKDE 410 420 430 440 450 460 >>CCDS6046.1 NEFM gene_id:4741|Hs108|chr8 (916 aa) initn: 1121 init1: 554 opt: 1065 Z-score: 626.0 bits: 126.1 E(32554): 1.5e-28 Smith-Waterman score: 1085; 42.7% identity (71.5% similar) in 473 aa overlap (15-465:12-472) 10 20 30 40 50 60 pF1KB7 MSHHPSGLRAGFSSTSYRRTFGPPPSLSPGAFSYSSSSRFSSSRLLGSASPSSSVRLGSF ..:::. :.: . : ::. : :.: :: : :: :. CCDS60 MSYTLDSLGNPSAYRRVTETRSSFSRVSGSPSSGFR-SQSWSRGSPSTVSSSYKRSM 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 pF1KB7 RSPR-AGAGALLRLPSERLDFSMAEAL-------NQEFLATRSNEKQELQELNDRFANFI .:: : ..:.: ::::.. .: . .. .:::::..:: ::::::..: CCDS60 LAPRLAYSSAMLSSAESSLDFSQSSSLLNGGSGPGGDYKLSRSNEKEQLQGLNDRFAGYI 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 pF1KB7 EKVRFLEQQNAALRGELSQARGQEPARADQLCQ---QELRELRRELELLGRERDRVQVER :::..::::: ...:. :: :. : :: . ::.:::: ::....:. .::.. CCDS60 EKVHYLEQQNKEIEAEI-QALRQKQASHAQLGDAYDQEIRELRATLEMVNHEKAQVQLDS 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 pF1KB7 DGLAEDLAALKQRLEEETRKREDAEHNLVLFRKDVDDATLSRLELERKIESLMDEIEFLK : : ::. ::.:.:::.: :.:.: . .:::...:.: ..::..:..::.::. ::. CCDS60 DHLEEDIHRLKERFEEEARLRDDTEAAIRALRKDIEEASLVKVELDKKVQSLQDEVAFLR 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KB7 KLHEEELRDLQVSVESQQVQQVEVEATVKPELTAALRDIRAQYESIAAKNLQEAEEWYKS . ::::. :: ........ :: . .: ....::..::.: :: . .:...::::.: CCDS60 SNHEEEVADLLAQIQASHIT-VERKDYLKTDISTALKEIRSQLESHSDQNMHQAEEWFKC 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KB7 KYADLSDAANRNHEALRQAKQEMNESRRQIQSLTCEVDGLRGTNEALLRQLRELEEQFAL .:: :..::..:.::.:.::.:. : :::.:: . :....:::.:.: ::: ..::. CCDS60 RYAKLTEAAEQNKEAIRSAKEEIAEYRRQLQSKSIELESVRGTKESLERQLSDIEERHNH 300 310 320 330 340 350 350 360 370 380 390 400 pF1KB7 EAGGYQAGAARLEEELRQLKEEMARHLREYQELLNVKMALDIEIATYRKLLEGEESRISV . ..:: .::.::: : ::::::::::.:::::::::::::.:::::::::.:.:. CCDS60 DLSSYQDTIQQLENELRGTKWEMARHLREYQDLLNVKMALDIEIAAYRKLLEGEETRFST 360 370 380 390 400 410 410 420 430 440 450 pF1KB7 -------PVHSF---ASLNIKTTVPEVEPPQDSHSRKTVLIKTIETRNGEVVTESQKE-Q :... ... : :.:: : . : : .: :.. :.. : . 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CCDS60 KSEMEEALTAITEELAVSMKEEKKEAAEEKEEEPEAEEEEVAAKKSPVKATAPEVKEEEG 470 480 490 500 510 520 >>CCDS8841.1 KRT8 gene_id:3856|Hs108|chr12 (483 aa) initn: 813 init1: 390 opt: 864 Z-score: 515.5 bits: 104.7 E(32554): 2.2e-22 Smith-Waterman score: 866; 35.7% identity (67.6% similar) in 479 aa overlap (13-454:6-477) 10 20 30 40 50 pF1KB7 MSHHPSGLRAGFSSTSYRRTFGPPPSLSPGAFSYSSSSRFSSSRLLGSASPSSSVR--LG .. ::. . . : ..: ... . .::.::: . : ::. : :: CCDS88 MSIRVTQKSYKVSTSGPRAFSSRSYTSGPGSRISSSSF--SRVGSSNFRGGLG 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KB7 SFRSPRAGAGALLRLP-SERLDFSMAEALNQEFLATRSNEKQELQELNDRFANFIEKVRF . . .: :.. . .. : .. .. .. :.:..::.... ::..::.::.:::: CCDS88 GGYGGASGMGGITAVTVNQSLLSPLVLEVDPNIQAVRTQEKEQIKTLNNKFASFIDKVRF 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KB7 LEQQNAALRGELSQARGQEPARA--DQLCQQELRELRRELELLGRERDRVQVE---RDGL ::::: :. . : . :. ::. :.. .. . .:::.:: ::.:. ....: .:: CCDS88 LEQQNKMLETKWSLLQQQKTARSNMDNMFESYINNLRRQLETLGQEKLKLEAELGNMQGL 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KB7 AEDLAALKQRLEEETRKREDAEHNLVLFRKDVDDATLSRLELERKIESLMDEIEFLKKLH .::. :.. :.: :: . :...::..::::.: ....::: ..:.: :::.::..:. 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