Result of FASTA (ccds) for pF1KB7996
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB7996, 470 aa
  1>>>pF1KB7996 470 - 470 aa - 470 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.3477+/-0.00108; mu= -5.2594+/- 0.064
 mean_var=309.0144+/-64.668, 0's: 0 Z-trim(111.8): 126  B-trim: 93 in 1/51
 Lambda= 0.072960
 statistics sampled from 12575 (12699) to 12575 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.724), E-opt: 0.2 (0.39), width:  16
 Scan time:  3.650

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS8783.1 PRPH gene_id:5630|Hs108|chr12           ( 470) 2958 325.2 9.5e-89
CCDS33383.1 DES gene_id:1674|Hs108|chr2            ( 470) 1664 188.9 9.5e-48
CCDS7120.1 VIM gene_id:7431|Hs108|chr10            ( 466) 1613 183.6 3.9e-46
CCDS11491.1 GFAP gene_id:2670|Hs108|chr17          ( 432) 1438 165.1 1.3e-40
CCDS45708.1 GFAP gene_id:2670|Hs108|chr17          ( 431) 1350 155.9 7.9e-38
CCDS59296.1 GFAP gene_id:2670|Hs108|chr17          ( 438) 1341 154.9 1.5e-37
CCDS7545.1 INA gene_id:9118|Hs108|chr10            ( 499) 1237 144.0 3.4e-34
CCDS75712.1 NEFL gene_id:4747|Hs108|chr8           ( 543) 1124 132.2 1.4e-30
CCDS6046.1 NEFM gene_id:4741|Hs108|chr8            ( 916) 1065 126.1 1.5e-28
CCDS8841.1 KRT8 gene_id:3856|Hs108|chr12           ( 483)  864 104.7 2.2e-22
CCDS58234.1 KRT8 gene_id:3856|Hs108|chr12          ( 511)  864 104.8 2.3e-22
CCDS13858.1 NEFH gene_id:4744|Hs108|chr22          (1020)  863 104.9 4.1e-22
CCDS8830.1 KRT5 gene_id:3852|Hs108|chr12           ( 590)  767 94.6   3e-19
CCDS8827.1 KRT75 gene_id:9119|Hs108|chr12          ( 551)  760 93.8 4.7e-19
CCDS8822.1 KRT7 gene_id:3855|Hs108|chr12           ( 469)  745 92.2 1.3e-18
CCDS41786.1 KRT6A gene_id:3853|Hs108|chr12         ( 564)  734 91.1 3.2e-18
CCDS8829.1 KRT6C gene_id:286887|Hs108|chr12        ( 564)  732 90.9 3.7e-18
CCDS8828.1 KRT6B gene_id:3854|Hs108|chr12          ( 564)  729 90.6 4.6e-18
CCDS41787.2 KRT4 gene_id:3851|Hs108|chr12          ( 520)  728 90.5 4.7e-18
CCDS8834.1 KRT73 gene_id:319101|Hs108|chr12        ( 540)  727 90.4 5.2e-18
CCDS8825.1 KRT84 gene_id:3890|Hs108|chr12          ( 600)  728 90.5 5.2e-18
CCDS44895.1 KRT3 gene_id:3850|Hs108|chr12          ( 628)  725 90.2 6.7e-18
CCDS8831.1 KRT71 gene_id:112802|Hs108|chr12        ( 523)  712 88.8 1.5e-17
CCDS8835.1 KRT2 gene_id:3849|Hs108|chr12           ( 639)  707 88.3 2.5e-17
CCDS41785.1 KRT86 gene_id:3892|Hs108|chr12         ( 486)  702 87.7   3e-17
CCDS8823.1 KRT83 gene_id:3889|Hs108|chr12          ( 493)  700 87.5 3.5e-17
CCDS8838.1 KRT76 gene_id:51350|Hs108|chr12         ( 638)  702 87.8 3.6e-17
CCDS8839.1 KRT79 gene_id:338785|Hs108|chr12        ( 535)  698 87.3 4.3e-17
CCDS31805.1 KRT81 gene_id:3887|Hs108|chr12         ( 505)  690 86.5 7.3e-17
CCDS8832.1 KRT74 gene_id:121391|Hs108|chr12        ( 529)  689 86.4 8.1e-17
CCDS8837.1 KRT77 gene_id:374454|Hs108|chr12        ( 578)  688 86.3 9.4e-17
CCDS8824.1 KRT85 gene_id:3891|Hs108|chr12          ( 507)  682 85.6 1.3e-16
CCDS8836.1 KRT1 gene_id:3848|Hs108|chr12           ( 644)  673 84.7   3e-16
CCDS8840.1 KRT78 gene_id:196374|Hs108|chr12        ( 520)  669 84.3 3.5e-16
CCDS41784.1 KRT80 gene_id:144501|Hs108|chr12       ( 422)  661 83.3 5.3e-16
CCDS8821.2 KRT80 gene_id:144501|Hs108|chr12        ( 452)  661 83.4 5.6e-16
CCDS8826.1 KRT82 gene_id:3888|Hs108|chr12          ( 513)  655 82.8 9.5e-16
CCDS8833.1 KRT72 gene_id:140807|Hs108|chr12        ( 511)  644 81.6 2.1e-15
CCDS11396.1 KRT13 gene_id:3860|Hs108|chr17         ( 458)  586 75.5 1.3e-13
CCDS11397.1 KRT13 gene_id:3860|Hs108|chr17         ( 420)  584 75.2 1.5e-13
CCDS11402.1 KRT17 gene_id:3872|Hs108|chr17         ( 432)  580 74.8   2e-13
CCDS11378.1 KRT12 gene_id:3859|Hs108|chr17         ( 494)  578 74.7 2.5e-13
CCDS11400.1 KRT14 gene_id:3861|Hs108|chr17         ( 472)  577 74.5 2.6e-13
CCDS31809.1 KRT18 gene_id:3875|Hs108|chr12         ( 430)  575 74.3 2.9e-13
CCDS73473.1 KRT78 gene_id:196374|Hs108|chr12       ( 410)  573 74.1 3.2e-13
CCDS11377.1 KRT10 gene_id:3858|Hs108|chr17         ( 584)  572 74.1 4.5e-13
CCDS11394.2 KRT35 gene_id:3886|Hs108|chr17         ( 455)  562 72.9 7.7e-13
CCDS11398.1 KRT15 gene_id:3866|Hs108|chr17         ( 456)  553 72.0 1.5e-12
CCDS11379.1 KRT20 gene_id:54474|Hs108|chr17        ( 424)  550 71.7 1.7e-12
CCDS11401.1 KRT16 gene_id:3868|Hs108|chr17         ( 473)  547 71.4 2.4e-12


>>CCDS8783.1 PRPH gene_id:5630|Hs108|chr12                (470 aa)
 initn: 2958 init1: 2958 opt: 2958  Z-score: 1706.8  bits: 325.2 E(32554): 9.5e-89
Smith-Waterman score: 2958; 100.0% identity (100.0% similar) in 470 aa overlap (1-470:1-470)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MSHHPSGLRAGFSSTSYRRTFGPPPSLSPGAFSYSSSSRFSSSRLLGSASPSSSVRLGSF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 MSHHPSGLRAGFSSTSYRRTFGPPPSLSPGAFSYSSSSRFSSSRLLGSASPSSSVRLGSF
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB7 RSPRAGAGALLRLPSERLDFSMAEALNQEFLATRSNEKQELQELNDRFANFIEKVRFLEQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 RSPRAGAGALLRLPSERLDFSMAEALNQEFLATRSNEKQELQELNDRFANFIEKVRFLEQ
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB7 QNAALRGELSQARGQEPARADQLCQQELRELRRELELLGRERDRVQVERDGLAEDLAALK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 QNAALRGELSQARGQEPARADQLCQQELRELRRELELLGRERDRVQVERDGLAEDLAALK
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB7 QRLEEETRKREDAEHNLVLFRKDVDDATLSRLELERKIESLMDEIEFLKKLHEEELRDLQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 QRLEEETRKREDAEHNLVLFRKDVDDATLSRLELERKIESLMDEIEFLKKLHEEELRDLQ
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB7 VSVESQQVQQVEVEATVKPELTAALRDIRAQYESIAAKNLQEAEEWYKSKYADLSDAANR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 VSVESQQVQQVEVEATVKPELTAALRDIRAQYESIAAKNLQEAEEWYKSKYADLSDAANR
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB7 NHEALRQAKQEMNESRRQIQSLTCEVDGLRGTNEALLRQLRELEEQFALEAGGYQAGAAR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 NHEALRQAKQEMNESRRQIQSLTCEVDGLRGTNEALLRQLRELEEQFALEAGGYQAGAAR
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB7 LEEELRQLKEEMARHLREYQELLNVKMALDIEIATYRKLLEGEESRISVPVHSFASLNIK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 LEEELRQLKEEMARHLREYQELLNVKMALDIEIATYRKLLEGEESRISVPVHSFASLNIK
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470
pF1KB7 TTVPEVEPPQDSHSRKTVLIKTIETRNGEVVTESQKEQRSELDKSSAHSY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 TTVPEVEPPQDSHSRKTVLIKTIETRNGEVVTESQKEQRSELDKSSAHSY
              430       440       450       460       470

>>CCDS33383.1 DES gene_id:1674|Hs108|chr2                 (470 aa)
 initn: 1683 init1: 821 opt: 1664  Z-score: 970.7  bits: 188.9 E(32554): 9.5e-48
Smith-Waterman score: 1687; 59.9% identity (82.7% similar) in 469 aa overlap (15-462:12-470)

               10        20                    30        40        
pF1KB7 MSHHPSGLRAGFSSTSYRRTFGPPPSL---SP---------GAFSYSSSSRFSS-----S
                     .:::::::  :..   ::         :  : .:::  .:     :
CCDS33    MSQAYSSSQRVSSYRRTFGGAPGFPLGSPLSSPVFPRAGFGSKGSSSSVTSRVYQVS
                  10        20        30        40        50       

            50           60         70        80        90         
pF1KB7 RLLGSASPSSSVR---LGSFRSPRA-GAGALLRLPSERLDFSMAEALNQEFLATRSNEKQ
       :  :.:.  .:.:   ::. :.: . ::: :       ::::.:.:.:::::.::.::: 
CCDS33 RTSGGAGGLGSLRASRLGTTRTPSSYGAGEL-------LDFSLADAVNQEFLTTRTNEKV
        60        70        80               90       100       110

     100       110       120       130       140       150         
pF1KB7 ELQELNDRFANFIEKVRFLEQQNAALRGELSQARGQEPARADQLCQQELRELRRELELLG
       :::::::::::.:::::::::::::: .:... .:.::.:. .: ..:::::::..:.: 
CCDS33 ELQELNDRFANYIEKVRFLEQQNAALAAEVNRLKGREPTRVAELYEEELRELRRQVEVLT
              120       130       140       150       160       170

     160       170       180       190       200       210         
pF1KB7 RERDRVQVERDGLAEDLAALKQRLEEETRKREDAEHNLVLFRKDVDDATLSRLELERKIE
        .: ::.::::.: .::  :: .:.:: . .:.::.::. :: ::: :::.:..:::.::
CCDS33 NQRARVDVERDNLLDDLQRLKAKLQEEIQLKEEAENNLAAFRADVDAATLARIDLERRIE
              180       190       200       210       220       230

     220       230       240       250       260       270         
pF1KB7 SLMDEIEFLKKLHEEELRDLQVSVESQQVQQVEVEATVKPELTAALRDIRAQYESIAAKN
       :: .:: ::::.::::.:.::.... :::: ::.. . ::.:::::::::::::.:::::
CCDS33 SLNEEIAFLKKVHEEEIRELQAQLQEQQVQ-VEMDMS-KPDLTAALRDIRAQYETIAAKN
              240       250       260         270       280        

     280       290       300       310       320       330         
pF1KB7 LQEAEEWYKSKYADLSDAANRNHEALRQAKQEMNESRRQIQSLTCEVDGLRGTNEALLRQ
       ..::::::::: .::..:::.:..::::::::: : :.:::: :::.:.:.:::..:.::
CCDS33 ISEAEEWYKSKVSDLTQAANKNNDALRQAKQEMMEYRHQIQSYTCEIDALKGTNDSLMRQ
      290       300       310       320       330       340        

     340       350       360       370       380       390         
pF1KB7 LRELEEQFALEAGGYQAGAARLEEELRQLKEEMARHLREYQELLNVKMALDIEIATYRKL
       .::::..:: ::.::: . ::::::.:.::.::::::::::.:::::::::.::::::::
CCDS33 MRELEDRFASEASGYQDNIARLEEEIRHLKDEMARHLREYQDLLNVKMALDVEIATYRKL
      350       360       370       380       390       400        

     400       410       420       430       440       450         
pF1KB7 LEGEESRISVPVHSFASLNIKTTVPEVEPPQDSHSRKTVLIKTIETRNGEVVTESQKEQR
       ::::::::..:......::.. : :: .  .. :..:::.:::::::.::::.:. ..:.
CCDS33 LEGEESRINLPIQTYSALNFRETSPE-QRGSEVHTKKTVMIKTIETRDGEVVSEATQQQH
      410       420       430        440       450       460       

     460       470
pF1KB7 SELDKSSAHSY
         :        
CCDS33 EVL        
       470        

>>CCDS7120.1 VIM gene_id:7431|Hs108|chr10                 (466 aa)
 initn: 1600 init1: 924 opt: 1613  Z-score: 941.7  bits: 183.6 E(32554): 3.9e-46
Smith-Waterman score: 1650; 58.1% identity (82.5% similar) in 458 aa overlap (13-458:7-462)

               10        20        30        40         50         
pF1KB7 MSHHPSGLRAGFSSTSYRRTFGPPPSLSPGAFSYSSSSRFSSSRLLGSA-SPSSSVRL--
                   ::.:::: :: : . :  . : :  .  . .  ::::  ::.:  :  
CCDS71       MSTRSVSSSSYRRMFGGPGTASRPSSSRSYVTTSTRTYSLGSALRPSTSRSLYA
                     10        20        30        40        50    

           60        70              80        90       100        
pF1KB7 ---GSFRSPRAGAGAL------LRLPSERLDFSMAEALNQEFLATRSNEKQELQELNDRF
          :.  . :..:  :      .:: .. .:::.:.:.: ::  ::.::: :::::::::
CCDS71 SSPGGVYATRSSAVRLRSSVPGVRLLQDSVDFSLADAINTEFKNTRTNEKVELQELNDRF
           60        70        80        90       100       110    

      110       120       130       140       150       160        
pF1KB7 ANFIEKVRFLEQQNAALRGELSQARGQEPARADQLCQQELRELRRELELLGRERDRVQVE
       ::.:.:::::::::  : .:: : .::  .:  .: ..:.:::::... :  .. ::.::
CCDS71 ANYIDKVRFLEQQNKILLAELEQLKGQGKSRLGDLYEEEMRELRRQVDQLTNDKARVEVE
          120       130       140       150       160       170    

      170       180       190       200       210       220        
pF1KB7 RDGLAEDLAALKQRLEEETRKREDAEHNLVLFRKDVDDATLSRLELERKIESLMDEIEFL
       ::.::::.  :...:.::  .::.::..:  ::.:::.:.:.::.::::.:::..:: ::
CCDS71 RDNLAEDIMRLREKLQEEMLQREEAENTLQSFRQDVDNASLARLDLERKVESLQEEIAFL
          180       190       200       210       220       230    

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pF1KB7 KKLHEEELRDLQVSVESQQVQQVEVEATVKPELTAALRDIRAQYESIAAKNLQEAEEWYK
       :::::::...::.... :.:: ..:... ::.:::::::.: ::::.:::::::::::::
CCDS71 KKLHEEEIQELQAQIQEQHVQ-IDVDVS-KPDLTAALRDVRQQYESVAAKNLQEAEEWYK
          240       250        260        270       280       290  

      290       300       310       320       330       340        
pF1KB7 SKYADLSDAANRNHEALRQAKQEMNESRRQIQSLTCEVDGLRGTNEALLRQLRELEEQFA
       ::.::::.:::::..:::::::: .: :::.::::::::.:.::::.: ::.::.::.::
CCDS71 SKFADLSEAANRNNDALRQAKQESTEYRRQVQSLTCEVDALKGTNESLERQMREMEENFA
            300       310       320       330       340       350  

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pF1KB7 LEAGGYQAGAARLEEELRQLKEEMARHLREYQELLNVKMALDIEIATYRKLLEGEESRIS
       .::..::   .::..:....::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 VEAANYQDTIGRLQDEIQNMKEEMARHLREYQDLLNVKMALDIEIATYRKLLEGEESRIS
            360       370       380       390       400       410  

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pF1KB7 VPVHSFASLNIKTTVPEVEPPQDSHSRKTVLIKTIETRNGEVVTESQKEQRSELDKSSAH
       .:. .:.:::.. :  .  :  :.::..:.::::.:::.:.:..:.....          
CCDS71 LPLPNFSSLNLRETNLDSLPLVDTHSKRTLLIKTVETRDGQVINETSQHHDDLE      
            420       430       440       450       460            

      470
pF1KB7 SY

>>CCDS11491.1 GFAP gene_id:2670|Hs108|chr17               (432 aa)
 initn: 1497 init1: 823 opt: 1438  Z-score: 842.6  bits: 165.1 E(32554): 1.3e-40
Smith-Waterman score: 1438; 56.2% identity (85.1% similar) in 402 aa overlap (64-459:30-429)

            40        50        60           70           80       
pF1KB7 YSSSSRFSSSRLLGSASPSSSVRLGSFRSPRAGAG---ALLRLPSE---RLDFSMAEALN
                                     : : :   .: :.:     :.:::.: :::
CCDS11  MERRRITSAARRSYVSSGEMMVGGLAPGRRLGPGTRLSLARMPPPLPTRVDFSLAGALN
                10        20        30        40        50         

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pF1KB7 QEFLATRSNEKQELQELNDRFANFIEKVRFLEQQNAALRGELSQARGQEPARADQLCQQE
         :  ::..:. :..:::::::..::::::::::: :: .::.: :..::..  .. : :
CCDS11 AGFKETRASERAEMMELNDRFASYIEKVRFLEQQNKALAAELNQLRAKEPTKLADVYQAE
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pF1KB7 LRELRRELELLGRERDRVQVERDGLAEDLAALKQRLEEETRKREDAEHNLVLFRKDVDDA
       ::::: .:. :  .  :..::::.::.:::...:.:..::  : .::.::. .:...:.:
CCDS11 LRELRLRLDQLTANSARLEVERDNLAQDLATVRQKLQDETNLRLEAENNLAAYRQEADEA
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pF1KB7 TLSRLELERKIESLMDEIEFLKKLHEEELRDLQVSVESQQVQQVEVEATVKPELTAALRD
       ::.::.:::::::: .::.::.:.::::.:.:: ..  :::. ::.... ::.:::::..
CCDS11 TLARLDLERKIESLEEEIRFLRKIHEEEVRELQEQLARQQVH-VELDVA-KPDLTAALKE
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pF1KB7 IRAQYESIAAKNLQEAEEWYKSKYADLSDAANRNHEALRQAKQEMNESRRQIQSLTCEVD
       ::.:::..:..:..::::::.::.:::.::: :: : :::::.: :. :::.:::::...
CCDS11 IRTQYEAMASSNMHEAEEWYRSKFADLTDAAARNAELLRQAKHEANDYRRQLQSLTCDLE
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pF1KB7 GLRGTNEALLRQLRELEEQFALEAGGYQAGAARLEEELRQLKEEMARHLREYQELLNVKM
       .::::::.: ::.:: ::. . ::..:: . :::::: ..::.::::::.:::.:::::.
CCDS11 SLRGTNESLERQMREQEERHVREAASYQEALARLEEEGQSLKDEMARHLQEYQDLLNVKL
       300       310       320       330       340       350       

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pF1KB7 ALDIEIATYRKLLEGEESRISVPVHSFASLNIKTTVPEVEPPQDSHSRKTVLIKTIETRN
       :::::::::::::::::.::..::..:..:.:. :  ...  ...: ......::.: :.
CCDS11 ALDIEIATYRKLLEGEENRITIPVQTFSNLQIRETSLDTKSVSEGHLKRNIVVKTVEMRD
       360       370       380       390       400       410       

       450       460       470
pF1KB7 GEVVTESQKEQRSELDKSSAHSY
       :::. ::..:..           
CCDS11 GEVIKESKQEHKDVM        
       420       430          

>>CCDS45708.1 GFAP gene_id:2670|Hs108|chr17               (431 aa)
 initn: 1400 init1: 726 opt: 1350  Z-score: 792.6  bits: 155.9 E(32554): 7.9e-38
Smith-Waterman score: 1350; 55.3% identity (83.1% similar) in 396 aa overlap (64-451:30-423)

            40        50        60           70           80       
pF1KB7 YSSSSRFSSSRLLGSASPSSSVRLGSFRSPRAGAG---ALLRLPSE---RLDFSMAEALN
                                     : : :   .: :.:     :.:::.: :::
CCDS45  MERRRITSAARRSYVSSGEMMVGGLAPGRRLGPGTRLSLARMPPPLPTRVDFSLAGALN
                10        20        30        40        50         

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pF1KB7 QEFLATRSNEKQELQELNDRFANFIEKVRFLEQQNAALRGELSQARGQEPARADQLCQQE
         :  ::..:. :..:::::::..::::::::::: :: .::.: :..::..  .. : :
CCDS45 AGFKETRASERAEMMELNDRFASYIEKVRFLEQQNKALAAELNQLRAKEPTKLADVYQAE
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pF1KB7 LRELRRELELLGRERDRVQVERDGLAEDLAALKQRLEEETRKREDAEHNLVLFRKDVDDA
       ::::: .:. :  .  :..::::.::.:::...:.:..::  : .::.::. .:...:.:
CCDS45 LRELRLRLDQLTANSARLEVERDNLAQDLATVRQKLQDETNLRLEAENNLAAYRQEADEA
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pF1KB7 TLSRLELERKIESLMDEIEFLKKLHEEELRDLQVSVESQQVQQVEVEATVKPELTAALRD
       ::.::.:::::::: .::.::.:.::::.:.:: ..  :::. ::.... ::.:::::..
CCDS45 TLARLDLERKIESLEEEIRFLRKIHEEEVRELQEQLARQQVH-VELDVA-KPDLTAALKE
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pF1KB7 IRAQYESIAAKNLQEAEEWYKSKYADLSDAANRNHEALRQAKQEMNESRRQIQSLTCEVD
       ::.:::..:..:..::::::.::.:::.::: :: : :::::.: :. :::.:::::...
CCDS45 IRTQYEAMASSNMHEAEEWYRSKFADLTDAAARNAELLRQAKHEANDYRRQLQSLTCDLE
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pF1KB7 GLRGTNEALLRQLRELEEQFALEAGGYQAGAARLEEELRQLKEEMARHLREYQELLNVKM
       .::::::.: ::.:: ::. . ::..:: . :::::: ..::.::::::.:::.:::::.
CCDS45 SLRGTNESLERQMREQEERHVREAASYQEALARLEEEGQSLKDEMARHLQEYQDLLNVKL
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pF1KB7 ALDIEIATYRKLLEGEESRISVPVHSFASLNIK--TTVPEVEPPQDSHSRKTVLIKTIET
       :::::::::::::::::.::..::..:..:.:.   .. . :  . ..  :.. :..:  
CCDS45 ALDIEIATYRKLLEGEENRITIPVQTFSNLQIRGGKSTKDGENHKVTRYLKSLTIRVIPI
       360       370       380       390       400       410       

         450       460       470
pF1KB7 RNGEVVTESQKEQRSELDKSSAHSY
       .  ..:                   
CCDS45 QAHQIVNGTPPARG           
       420       430            

>>CCDS59296.1 GFAP gene_id:2670|Hs108|chr17               (438 aa)
 initn: 1400 init1: 726 opt: 1341  Z-score: 787.4  bits: 154.9 E(32554): 1.5e-37
Smith-Waterman score: 1341; 59.0% identity (85.7% similar) in 363 aa overlap (64-420:30-390)

            40        50        60           70           80       
pF1KB7 YSSSSRFSSSRLLGSASPSSSVRLGSFRSPRAGAG---ALLRLPSE---RLDFSMAEALN
                                     : : :   .: :.:     :.:::.: :::
CCDS59  MERRRITSAARRSYVSSGEMMVGGLAPGRRLGPGTRLSLARMPPPLPTRVDFSLAGALN
                10        20        30        40        50         

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pF1KB7 QEFLATRSNEKQELQELNDRFANFIEKVRFLEQQNAALRGELSQARGQEPARADQLCQQE
         :  ::..:. :..:::::::..::::::::::: :: .::.: :..::..  .. : :
CCDS59 AGFKETRASERAEMMELNDRFASYIEKVRFLEQQNKALAAELNQLRAKEPTKLADVYQAE
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pF1KB7 LRELRRELELLGRERDRVQVERDGLAEDLAALKQRLEEETRKREDAEHNLVLFRKDVDDA
       ::::: .:. :  .  :..::::.::.:::...:.:..::  : .::.::. .:...:.:
CCDS59 LRELRLRLDQLTANSARLEVERDNLAQDLATVRQKLQDETNLRLEAENNLAAYRQEADEA
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pF1KB7 TLSRLELERKIESLMDEIEFLKKLHEEELRDLQVSVESQQVQQVEVEATVKPELTAALRD
       ::.::.:::::::: .::.::.:.::::.:.:: ..  :::. ::.... ::.:::::..
CCDS59 TLARLDLERKIESLEEEIRFLRKIHEEEVRELQEQLARQQVH-VELDVA-KPDLTAALKE
     180       190       200       210       220         230       

       270       280       290       300       310       320       
pF1KB7 IRAQYESIAAKNLQEAEEWYKSKYADLSDAANRNHEALRQAKQEMNESRRQIQSLTCEVD
       ::.:::..:..:..::::::.::.:::.::: :: : :::::.: :. :::.:::::...
CCDS59 IRTQYEAMASSNMHEAEEWYRSKFADLTDAAARNAELLRQAKHEANDYRRQLQSLTCDLE
       240       250       260       270       280       290       

       330       340       350       360       370       380       
pF1KB7 GLRGTNEALLRQLRELEEQFALEAGGYQAGAARLEEELRQLKEEMARHLREYQELLNVKM
       .::::::.: ::.:: ::. . ::..:: . :::::: ..::.::::::.:::.:::::.
CCDS59 SLRGTNESLERQMREQEERHVREAASYQEALARLEEEGQSLKDEMARHLQEYQDLLNVKL
       300       310       320       330       340       350       

       390       400       410       420       430       440       
pF1KB7 ALDIEIATYRKLLEGEESRISVPVHSFASLNIKTTVPEVEPPQDSHSRKTVLIKTIETRN
       :::::::::::::::::.::..::..:..:.:.                           
CCDS59 ALDIEIATYRKLLEGEENRITIPVQTFSNLQIRGQYSRASWEGHWSPAPSSRACRLLQTG
       360       370       380       390       400       410       

       450       460       470
pF1KB7 GEVVTESQKEQRSELDKSSAHSY
                              
CCDS59 TEDQGKGIQLSLGAFVTLQRS  
       420       430          

>>CCDS7545.1 INA gene_id:9118|Hs108|chr10                 (499 aa)
 initn: 1226 init1: 659 opt: 1237  Z-score: 727.4  bits: 144.0 E(32554): 3.4e-34
Smith-Waterman score: 1237; 50.5% identity (76.3% similar) in 430 aa overlap (13-430:11-430)

               10        20              30        40        50    
pF1KB7 MSHHPSGLRAGFSSTSYRRTFGPPPSLSP------GAFSYSSSSRFSSSRLLGSASPSSS
                   ::.:::..::    ::       :: .. :.: .: : . .::. ::.
CCDS75   MSFGSEHYLCSSSSYRKVFGDGSRLSARLSGAGGAGGFRSQS-LSRSNVASSAACSSA
                 10        20        30        40         50       

              60        70        80        90       100       110 
pF1KB7 VRLG---SFRSPRAGAGALLRLPSERLDFSMAEALNQEFLATRSNEKQELQELNDRFANF
         ::   ..: : :. :         ::.:.: : ..:.   :.:::..:: :::::: :
CCDS75 SSLGLGLAYRRPPASDG---------LDLSQAAARTNEYKIIRTNEKEQLQGLNDRFAVF
        60        70                 80        90       100        

             120       130         140       150       160         
pF1KB7 IEKVRFLEQQNAALRGELS--QARGQEPARADQLCQQELRELRRELELLGRERDRVQVER
       ::::. :: :: ::..::.  . :  ::.:. .: :.:::.:: .::  .  :... .::
CCDS75 IEKVHQLETQNRALEAELAALRQRHAEPSRVGELFQRELRDLRAQLEEASSARSQALLER
      110       120       130       140       150       160        

     170       180       190       200       210       220         
pF1KB7 DGLAEDLAALKQRLEEETRKREDAEHNLVLFRKDVDDATLSRLELERKIESLMDEIEFLK
       :::::..  :. : :::.: :: ::. :   ..::: :::.::.::.:.:::.::. :..
CCDS75 DGLAEEVQRLRARCEEESRGREGAERALKAQQRDVDGATLARLDLEKKVESLLDELAFVR
      170       180       190       200       210       220        

     230       240       250        260       270       280        
pF1KB7 KLHEEELRDLQVSVESQQVQQVEVEATV-KPELTAALRDIRAQYESIAAKNLQEAEEWYK
       ..:.::. .: .......   .::..:: ::.::.:::.:::::::.:::::: ::::::
CCDS75 QVHDEEVAELLATLQASSQAAAEVDVTVAKPDLTSALREIRAQYESLAAKNLQSAEEWYK
      230       240       250       260       270       280        

      290       300       310       320       330       340        
pF1KB7 SKYADLSDAANRNHEALRQAKQEMNESRRQIQSLTCEVDGLRGTNEALLRQLRELEEQFA
       ::.:.:.. : :. ::.: ...:..: :::.:. : :..::::.::.: ::. ::::. .
CCDS75 SKFANLNEQAARSTEAIRASREEIHEYRRQLQARTIEIEGLRGANESLERQILELEERHS
      290       300       310       320       330       340        

      350       360       370       380       390       400        
pF1KB7 LEAGGYQAGAARLEEELRQLKEEMARHLREYQELLNVKMALDIEIATYRKLLEGEESRIS
        :..::: . ..::..::. : ::::::::::.:::::::::::::.:::::::::.:.:
CCDS75 AEVAGYQDSIGQLENDLRNTKSEMARHLREYQDLLNVKMALDIEIAAYRKLLEGEETRFS
      350       360       370       380       390       400        

      410       420       430       440       450       460        
pF1KB7 VPVHSFASLNIKTTVPEVEPPQDSHSRKTVLIKTIETRNGEVVTESQKEQRSELDKSSAH
       .   :...::   .   . ::.                                      
CCDS75 TSGLSISGLNPLPNPSYLLPPRILSATTSKVSSTGLSLKKEEEEEEASKVASKKTSQIGE
      410       420       430       440       450       460        

>>CCDS75712.1 NEFL gene_id:4747|Hs108|chr8                (543 aa)
 initn: 645 init1: 645 opt: 1124  Z-score: 662.7  bits: 132.2 E(32554): 1.4e-30
Smith-Waterman score: 1124; 49.1% identity (76.3% similar) in 401 aa overlap (12-408:9-401)

               10        20        30         40        50         
pF1KB7 MSHHPSGLRAGFSSTSYRRTFGPPPSLSPGAF-SYSSSSRFSSSRLLGSASPSSSVRLGS
                  . ::::.: .   : .  ..  :  :..: . :   . .: : :::   
CCDS75    MSSFSYEPYYSTSYKRRYVETPRVHISSVRSGYSTARSAYSSYSAPVSSSLSVR---
                  10        20        30        40        50       

      60        70         80        90       100       110        
pF1KB7 FRSPRAGAGALLRLPS-ERLDFSMAEALNQEFLATRSNEKQELQELNDRFANFIEKVRFL
        ::  ...:.:  .:: : ::.:.. :..... . :..:: .::.::::::.:::.:. :
CCDS75 -RSYSSSSGSL--MPSLENLDLSQVAAISNDLKSIRTQEKAQLQDLNDRFASFIERVHEL
            60          70        80        90       100       110 

      120       130         140       150       160       170      
pF1KB7 EQQNAALRGELSQARGQ--EPARADQLCQQELRELRRELELLGRERDRVQVERDGLAEDL
       :::: .:..::   : .  ::.:   : .::.:.::   :    :.. .: ::.:: : :
CCDS75 EQQNKVLEAELLVLRQKHSEPSRFRALYEQEIRDLRLAAEDATNEKQALQGEREGLEETL
             120       130       140       150       160       170 

        180       190       200       210       220       230      
pF1KB7 AALKQRLEEETRKREDAEHNLVLFRKDVDDATLSRLELERKIESLMDEIEFLKKLHEEEL
         :. : :::. .:::::  :.  :: .:.:.:.: :::..:.:::::: ::::.::::.
CCDS75 RNLQARYEEEVLSREDAEGRLMEARKGADEAALARAELEKRIDSLMDEISFLKKVHEEEI
             180       190       200       210       220       230 

        240       250       260       270       280       290      
pF1KB7 RDLQVSVESQQVQQVEVEATVKPELTAALRDIRAQYESIAAKNLQEAEEWYKSKYADLSD
        .::....  :.. ::...: ::.:.:::.:::::::..::::.:.::::.::... :..
CCDS75 AELQAQIQYAQIS-VEMDVT-KPDLSAALKDIRAQYEKLAAKNMQNAEEWFKSRFTVLTE
             240        250        260       270       280         

        300       310       320       330       340       350      
pF1KB7 AANRNHEALRQAKQEMNESRRQIQSLTCEVDGLRGTNEALLRQLRELEEQFALEAGGYQA
       .: .: .:.: ::.:..:::: ... : :... :: :::: .::.:::..   . ...: 
CCDS75 SAAKNTDAVRAAKDEVSESRRLLKAKTLEIEACRGMNEALEKQLQELEDKQNADISAMQD
     290       300       310       320       330       340         

        360       370       380       390       400       410      
pF1KB7 GAARLEEELRQLKEEMARHLREYQELLNVKMALDIEIATYRKLLEGEESRISVPVHSFAS
          .::.:::  : ::::.:.:::.:::::::::::::.:::::::::.:.:        
CCDS75 TINKLENELRTTKSEMARYLKEYQDLLNVKMALDIEIAAYRKLLEGEETRLSFTSVGSIT
     350       360       370       380       390       400         

        420       430       440       450       460       470      
pF1KB7 LNIKTTVPEVEPPQDSHSRKTVLIKTIETRNGEVVTESQKEQRSELDKSSAHSY      
                                                                   
CCDS75 SGYSQSSQVFGRSAYGGLQTSSYLMSTRSFPSYYTSHVQEEQIEVEETIEAAKAEEAKDE
     410       420       430       440       450       460         

>>CCDS6046.1 NEFM gene_id:4741|Hs108|chr8                 (916 aa)
 initn: 1121 init1: 554 opt: 1065  Z-score: 626.0  bits: 126.1 E(32554): 1.5e-28
Smith-Waterman score: 1085; 42.7% identity (71.5% similar) in 473 aa overlap (15-465:12-472)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MSHHPSGLRAGFSSTSYRRTFGPPPSLSPGAFSYSSSSRFSSSRLLGSASPSSSVRLGSF
                     ..:::.     :.:  . : ::. : :.:   :: :  ::    :.
CCDS60    MSYTLDSLGNPSAYRRVTETRSSFSRVSGSPSSGFR-SQSWSRGSPSTVSSSYKRSM
                  10        20        30         40        50      

                70        80               90       100       110  
pF1KB7 RSPR-AGAGALLRLPSERLDFSMAEAL-------NQEFLATRSNEKQELQELNDRFANFI
        .:: : ..:.:      ::::.. .:       . ..  .:::::..:: ::::::..:
CCDS60 LAPRLAYSSAMLSSAESSLDFSQSSSLLNGGSGPGGDYKLSRSNEKEQLQGLNDRFAGYI
         60        70        80        90       100       110      

            120       130       140          150       160         
pF1KB7 EKVRFLEQQNAALRGELSQARGQEPARADQLCQ---QELRELRRELELLGRERDRVQVER
       :::..:::::  ...:. ::  :. :   :: .   ::.::::  ::....:. .::.. 
CCDS60 EKVHYLEQQNKEIEAEI-QALRQKQASHAQLGDAYDQEIRELRATLEMVNHEKAQVQLDS
        120       130        140       150       160       170     

     170       180       190       200       210       220         
pF1KB7 DGLAEDLAALKQRLEEETRKREDAEHNLVLFRKDVDDATLSRLELERKIESLMDEIEFLK
       : : ::.  ::.:.:::.: :.:.:  .  .:::...:.: ..::..:..::.::. ::.
CCDS60 DHLEEDIHRLKERFEEEARLRDDTEAAIRALRKDIEEASLVKVELDKKVQSLQDEVAFLR
         180       190       200       210       220       230     

     230       240       250       260       270       280         
pF1KB7 KLHEEELRDLQVSVESQQVQQVEVEATVKPELTAALRDIRAQYESIAAKNLQEAEEWYKS
       . ::::. :: ........  :: .  .: ....::..::.: :: . .:...::::.: 
CCDS60 SNHEEEVADLLAQIQASHIT-VERKDYLKTDISTALKEIRSQLESHSDQNMHQAEEWFKC
         240       250        260       270       280       290    

     290       300       310       320       330       340         
pF1KB7 KYADLSDAANRNHEALRQAKQEMNESRRQIQSLTCEVDGLRGTNEALLRQLRELEEQFAL
       .:: :..::..:.::.:.::.:. : :::.:: . :....:::.:.: ::: ..::.   
CCDS60 RYAKLTEAAEQNKEAIRSAKEEIAEYRRQLQSKSIELESVRGTKESLERQLSDIEERHNH
          300       310       320       330       340       350    

     350       360       370       380       390       400         
pF1KB7 EAGGYQAGAARLEEELRQLKEEMARHLREYQELLNVKMALDIEIATYRKLLEGEESRISV
       . ..::    .::.:::  : ::::::::::.:::::::::::::.:::::::::.:.:.
CCDS60 DLSSYQDTIQQLENELRGTKWEMARHLREYQDLLNVKMALDIEIAAYRKLLEGEETRFST
          360       370       380       390       400       410    

            410          420       430       440       450         
pF1KB7 -------PVHSF---ASLNIKTTVPEVEPPQDSHSRKTVLIKTIETRNGEVVTESQKE-Q
              :...     ... :   :.:: :     .  :  : .:    :.. :.. : .
CCDS60 FAGSITGPLYTHRPPITISSKIQKPKVEAP-----KLKVQHKFVE----EIIEETKVEDE
          420       430       440            450           460     

      460       470                                                
pF1KB7 RSELDKSSAHSY                                                
       .::....                                                     
CCDS60 KSEMEEALTAITEELAVSMKEEKKEAAEEKEEEPEAEEEEVAAKKSPVKATAPEVKEEEG
         470       480       490       500       510       520     

>>CCDS8841.1 KRT8 gene_id:3856|Hs108|chr12                (483 aa)
 initn: 813 init1: 390 opt: 864  Z-score: 515.5  bits: 104.7 E(32554): 2.2e-22
Smith-Waterman score: 866; 35.7% identity (67.6% similar) in 479 aa overlap (13-454:6-477)

               10        20        30        40        50          
pF1KB7 MSHHPSGLRAGFSSTSYRRTFGPPPSLSPGAFSYSSSSRFSSSRLLGSASPSSSVR--LG
                   .. ::. . . : ..:  ... . .::.::: .  :   ::. :  ::
CCDS88        MSIRVTQKSYKVSTSGPRAFSSRSYTSGPGSRISSSSF--SRVGSSNFRGGLG
                      10        20        30          40        50 

       60        70         80        90       100       110       
pF1KB7 SFRSPRAGAGALLRLP-SERLDFSMAEALNQEFLATRSNEKQELQELNDRFANFIEKVRF
       .  .  .: :..  .  .. :   ..  .. .. :.:..::.... ::..::.::.::::
CCDS88 GGYGGASGMGGITAVTVNQSLLSPLVLEVDPNIQAVRTQEKEQIKTLNNKFASFIDKVRF
              60        70        80        90       100       110 

       120       130       140         150       160          170  
pF1KB7 LEQQNAALRGELSQARGQEPARA--DQLCQQELRELRRELELLGRERDRVQVE---RDGL
       :::::  :. . :  . :. ::.  :.. .. . .:::.:: ::.:. ....:    .::
CCDS88 LEQQNKMLETKWSLLQQQKTARSNMDNMFESYINNLRRQLETLGQEKLKLEAELGNMQGL
             120       130       140       150       160       170 

            180       190       200       210       220       230  
pF1KB7 AEDLAALKQRLEEETRKREDAEHNLVLFRKDVDDATLSRLELERKIESLMDEIEFLKKLH
       .::.   :.. :.:  :: . :...::..::::.: ....::: ..:.: :::.::..:.
CCDS88 VEDF---KNKYEDEINKRTEMENEFVLIKKDVDEAYMNKVELESRLEGLTDEINFLRQLY
                180       190       200       210       220        

            240       250       260       270       280       290  
pF1KB7 EEELRDLQVSVESQQVQQVEVEATVKPELTAALRDIRAQYESIAAKNLQEAEEWYKSKYA
       :::.:.:: .. . .:  . .. . . .. . . ...::::.:: ..  :::  :. :: 
CCDS88 EEEIRELQSQISDTSVV-LSMDNSRSLDMDSIIAEVKAQYEDIANRSRAEAESMYQIKYE
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