Result of FASTA (omim) for
pF1KB8018
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8018, 555 aa
1>>>pF1KB8018 555 - 555 aa - 555 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.9461+/-0.000382; mu= -3.9203+/- 0.024
mean_var=214.1036+/-44.266, 0's: 0 Z-trim(120.0): 19 B-trim: 255 in 1/58
Lambda= 0.087652
statistics sampled from 34573 (34592) to 34573 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.74), E-opt: 0.2 (0.406), width: 16
Scan time: 12.030
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001162119 (OMIM: 300724) connector enhancer of ( 898) 1944 258.8 5.2e-68
NP_055742 (OMIM: 300724) connector enhancer of kin (1034) 1944 258.9 5.8e-68
NP_001317702 (OMIM: 300724) connector enhancer of ( 868) 1821 243.3 2.4e-63
XP_011543773 (OMIM: 300724) PREDICTED: connector e ( 875) 1821 243.3 2.4e-63
NP_001162118 (OMIM: 300724) connector enhancer of (1004) 1821 243.3 2.7e-63
NP_001317700 (OMIM: 300724) connector enhancer of ( 819) 1329 181.0 1.2e-44
XP_016884847 (OMIM: 300724) PREDICTED: connector e ( 826) 1329 181.0 1.2e-44
NP_001162120 (OMIM: 300724) connector enhancer of ( 849) 1329 181.1 1.3e-44
XP_011543774 (OMIM: 300724) PREDICTED: connector e ( 856) 1329 181.1 1.3e-44
NP_001317701 (OMIM: 300724) connector enhancer of ( 955) 1329 181.1 1.4e-44
NP_001317699 (OMIM: 300724) connector enhancer of ( 985) 1329 181.1 1.4e-44
NP_006305 (OMIM: 603272) connector enhancer of kin ( 713) 396 63.0 3.6e-09
NP_001284576 (OMIM: 603272) connector enhancer of ( 720) 377 60.6 1.9e-08
>>NP_001162119 (OMIM: 300724) connector enhancer of kina (898 aa)
initn: 1926 init1: 1543 opt: 1944 Z-score: 1342.1 bits: 258.8 E(85289): 5.2e-68
Smith-Waterman score: 1944; 62.7% identity (81.8% similar) in 477 aa overlap (1-470:5-477)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MEPVTKWSPKQVVDWTRGLDDCLQQYVHKFEREKINGEQLLQISHQDLEELGVTRI
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NP_001 MALIMEPVSKWSPSQVVDWMKGLDDCLQQYIKNFEREKISGDQLLRITHQELEDLGVSRI
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60 70 80 90 100 110
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pF1KB8 EDKVLTVVKVLNGICDKTIRSTTDPVMSQCACLEEVHLPNIKPGEGLGMYIKSTYDGLHV
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pF1KB8 FNFTPAPLKNLRWKP----PLVQTSPPPATTQSPESTMDTSLKKEKSAILDLYIPPPPAV
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pF1KB8 TNILPTK-MREKTPSYGKPRPLSMPADGNWMG-IVDPFARPRGHGRKGEDALCRYFSNER
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NP_001 KGRSSSQGRRESTPTYGKLRPISMPVEYNWVGDYEDPNKMKRDSRR--ENSLLRYMSNEK
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KB8 IPPIIEESSSPPYRFSRPTTERHLVRGADYIRGSRCYINSDLHSSATIPFQEEGTKKKSG
:
NP_001 IAQEEYMFQRNSKKDTGKKSKKKGDKSNSPTHYSLLPSLQMDALRQDIMGTPVPETTLYH
480 490 500 510 520 530
>>NP_055742 (OMIM: 300724) connector enhancer of kinase (1034 aa)
initn: 1926 init1: 1543 opt: 1944 Z-score: 1341.1 bits: 258.9 E(85289): 5.8e-68
Smith-Waterman score: 1944; 62.7% identity (81.8% similar) in 477 aa overlap (1-470:5-477)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MEPVTKWSPKQVVDWTRGLDDCLQQYVHKFEREKINGEQLLQISHQDLEELGVTRI
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NP_055 MALIMEPVSKWSPSQVVDWMKGLDDCLQQYIKNFEREKISGDQLLRITHQELEDLGVSRI
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pF1KB8 GHQELVLEAVDLLCALNYGLETDNMKNLVLKLRASSHNLQNYISSRRKSPAYDGNTSRKA
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NP_055 GHQELILEAVDLLCALNYGLETENLKTLSHKLNASAKNLQNFITGRRRSGHYDGRTSRKL
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pF1KB8 PNEFLTSVVELIGAAKALLAWLDRAPFTGITDFSVTKNKIIQLCLDLTTTVQKDCFVAEM
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pF1KB8 EDKVLTVVKVLNGICDKTIRSTTDPVMSQCACLEEVHLPNIKPGEGLGMYIKSTYDGLHV
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NP_055 ENKILHVCKTLSGVCDHIISLSSDPLVSQSAHLEVIQLANIKPSEGLGMYIKSTYDGLHV
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240 250 260 270 280 290
pF1KB8 ITGTTENSPADRSQKIHAGDEVIQVNQQTVVGWQLKNLVKKLRENPTGVVLLLKKRPTGS
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NP_055 ITGTTENSPADRCKKIHAGDEVIQVNHQTVVGWQLKNLVNALREDPSGVILTLKKRPQSM
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pF1KB8 FNFTPAPLKNLRWKP----PLVQTSPPPATTQSPESTMDTSLKKEKSAILDLYIPPPPAV
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NP_055 LTSAPALLKNMRWKPLALQPLIPRSPT-SSVATPSSTISTPTKRDSSALQDLYIPPPPAE
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pF1KB8 PYSPRDENGSFVYGGSSKCKQPLPGPKGSESPNSFLDQESRRRRFTIADSDQ-LPGYSVE
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NP_055 PYIPRDEKGNLPCEDLRGHMVGKPVHKGSESPNSFLDQE-YRKRFNIVEEDTVLYCYEYE
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pF1KB8 TNILPTK-MREKTPSYGKPRPLSMPADGNWMG-IVDPFARPRGHGRKGEDALCRYFSNER
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NP_055 KGRSSSQGRRESTPTYGKLRPISMPVEYNWVGDYEDPNKMKRDSRR--ENSLLRYMSNEK
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pF1KB8 IPPIIEESSSPPYRFSRPTTERHLVRGADYIRGSRCYINSDLHSSATIPFQEEGTKKKSG
:
NP_055 IAQEEYMFQRNSKKDTGKKSKKKGDKSNSPTHYSLLPSLQMDALRQDIMGTPVPETTLYH
480 490 500 510 520 530
>>NP_001317702 (OMIM: 300724) connector enhancer of kina (868 aa)
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Smith-Waterman score: 1821; 64.1% identity (83.3% similar) in 432 aa overlap (1-426:5-434)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MEPVTKWSPKQVVDWTRGLDDCLQQYVHKFEREKINGEQLLQISHQDLEELGVTRI
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NP_001 MALIMEPVSKWSPSQVVDWMKGLDDCLQQYIKNFEREKISGDQLLRITHQELEDLGVSRI
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pF1KB8 GHQELVLEAVDLLCALNYGLETDNMKNLVLKLRASSHNLQNYISSRRKSPAYDGNTSRKA
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NP_001 GHQELILEAVDLLCALNYGLETENLKTLSHKLNASAKNLQNFITGRRRSGHYDGRTSRKL
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pF1KB8 PNEFLTSVVELIGAAKALLAWLDRAPFTGITDFSVTKNKIIQLCLDLTTTVQKDCFVAEM
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NP_001 PNDFLTSVVDLIGAAKSLLAWLDRSPFAAVTDYSVTRNNVIQLCLELTTIVQQDCTVYET
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pF1KB8 EDKVLTVVKVLNGICDKTIRSTTDPVMSQCACLEEVHLPNIKPGEGLGMYIKSTYDGLHV
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240 250 260 270 280 290
pF1KB8 ITGTTENSPADRSQKIHAGDEVIQVNQQTVVGWQLKNLVKKLRENPTGVVLLLKKRPTGS
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NP_001 ITGTTENSPADRCKKIHAGDEVIQVNHQTVVGWQLKNLVNALREDPSGVILTLKKRPQSM
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pF1KB8 FNFTPAPLKNLRWKP----PLVQTSPPPATTQSPESTMDTSLKKEKSAILDLYIPPPPAV
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pF1KB8 PYSPRDENGSFVYGGSSKCKQPLPGPKGSESPNSFLDQESRRRRFTIADSDQ-LPGYSVE
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pF1KB8 TNILPTK-MREKTPSYGKPRPLSMPADGNWMGIVDPFARPRGHGRKGEDALCRYFSNERI
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NP_001 KGRSSSQGRRESTPTYENSLLRYMSNEKIAQEEYMFQRNSKKDTGKKSKKKGDKSNSPTH
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>>XP_011543773 (OMIM: 300724) PREDICTED: connector enhan (875 aa)
initn: 1821 init1: 1543 opt: 1821 Z-score: 1258.2 bits: 243.3 E(85289): 2.4e-63
Smith-Waterman score: 1821; 64.1% identity (83.3% similar) in 432 aa overlap (1-426:5-434)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MEPVTKWSPKQVVDWTRGLDDCLQQYVHKFEREKINGEQLLQISHQDLEELGVTRI
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pF1KB8 GHQELVLEAVDLLCALNYGLETDNMKNLVLKLRASSHNLQNYISSRRKSPAYDGNTSRKA
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XP_011 GHQELILEAVDLLCALNYGLETENLKTLSHKLNASAKNLQNFITGRRRSGHYDGRTSRKL
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pF1KB8 PNEFLTSVVELIGAAKALLAWLDRAPFTGITDFSVTKNKIIQLCLDLTTTVQKDCFVAEM
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XP_011 PNDFLTSVVDLIGAAKSLLAWLDRSPFAAVTDYSVTRNNVIQLCLELTTIVQQDCTVYET
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pF1KB8 EDKVLTVVKVLNGICDKTIRSTTDPVMSQCACLEEVHLPNIKPGEGLGMYIKSTYDGLHV
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XP_011 ENKILHVCKTLSGVCDHIISLSSDPLVSQSAHLEVIQLANIKPSEGLGMYIKSTYDGLHV
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pF1KB8 ITGTTENSPADRSQKIHAGDEVIQVNQQTVVGWQLKNLVKKLRENPTGVVLLLKKRPTGS
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XP_011 ITGTTENSPADRCKKIHAGDEVIQVNHQTVVGWQLKNLVNALREDPSGVILTLKKRPQSM
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pF1KB8 FNFTPAPLKNLRWKP----PLVQTSPPPATTQSPESTMDTSLKKEKSAILDLYIPPPPAV
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XP_011 PYIPRDEKGNLPCEDLRGHMVGKPVHKGSESPNSFLDQE-YRKRFNIVEEDTVLYCYEYE
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pF1KB8 TNILPTK-MREKTPSYGKPRPLSMPADGNWMGIVDPFARPRGHGRKGEDALCRYFSNERI
. .. ::.::.:
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>>NP_001162118 (OMIM: 300724) connector enhancer of kina (1004 aa)
initn: 1821 init1: 1543 opt: 1821 Z-score: 1257.2 bits: 243.3 E(85289): 2.7e-63
Smith-Waterman score: 1821; 64.1% identity (83.3% similar) in 432 aa overlap (1-426:5-434)
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pF1KB8 MEPVTKWSPKQVVDWTRGLDDCLQQYVHKFEREKINGEQLLQISHQDLEELGVTRI
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NP_001 MALIMEPVSKWSPSQVVDWMKGLDDCLQQYIKNFEREKISGDQLLRITHQELEDLGVSRI
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pF1KB8 GHQELVLEAVDLLCALNYGLETDNMKNLVLKLRASSHNLQNYISSRRKSPAYDGNTSRKA
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NP_001 GHQELILEAVDLLCALNYGLETENLKTLSHKLNASAKNLQNFITGRRRSGHYDGRTSRKL
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120 130 140 150 160 170
pF1KB8 PNEFLTSVVELIGAAKALLAWLDRAPFTGITDFSVTKNKIIQLCLDLTTTVQKDCFVAEM
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NP_001 PNDFLTSVVDLIGAAKSLLAWLDRSPFAAVTDYSVTRNNVIQLCLELTTIVQQDCTVYET
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pF1KB8 EDKVLTVVKVLNGICDKTIRSTTDPVMSQCACLEEVHLPNIKPGEGLGMYIKSTYDGLHV
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NP_001 ENKILHVCKTLSGVCDHIISLSSDPLVSQSAHLEVIQLANIKPSEGLGMYIKSTYDGLHV
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240 250 260 270 280 290
pF1KB8 ITGTTENSPADRSQKIHAGDEVIQVNQQTVVGWQLKNLVKKLRENPTGVVLLLKKRPTGS
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NP_001 ITGTTENSPADRCKKIHAGDEVIQVNHQTVVGWQLKNLVNALREDPSGVILTLKKRPQSM
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300 310 320 330 340 350
pF1KB8 FNFTPAPLKNLRWKP----PLVQTSPPPATTQSPESTMDTSLKKEKSAILDLYIPPPPAV
.. .:: :::.:::: ::. :: ... .: ::..: :...::. :::::::::
NP_001 LTSAPALLKNMRWKPLALQPLIPRSPT-SSVATPSSTISTPTKRDSSALQDLYIPPPPAE
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pF1KB8 PYSPRDENGSFVYGGSSKCKQPLPGPKGSESPNSFLDQESRRRRFTIADSDQ-LPGYSVE
:: ::::.:.. : ::::::::::::: :.::.:.. : : : :
NP_001 PYIPRDEKGNLPCEDLRGHMVGKPVHKGSESPNSFLDQE-YRKRFNIVEEDTVLYCYEYE
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pF1KB8 TNILPTK-MREKTPSYGKPRPLSMPADGNWMGIVDPFARPRGHGRKGEDALCRYFSNERI
. .. ::.::.:
NP_001 KGRSSSQGRRESTPTYENSLLRYMSNEKIAQEEYMFQRNSKKDTGKKSKKKGDKSNSPTH
420 430 440 450 460 470
>>NP_001317700 (OMIM: 300724) connector enhancer of kina (819 aa)
initn: 1607 init1: 1329 opt: 1329 Z-score: 922.4 bits: 181.0 E(85289): 1.2e-44
Smith-Waterman score: 1525; 57.7% identity (75.0% similar) in 428 aa overlap (1-426:5-385)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MEPVTKWSPKQVVDWTRGLDDCLQQYVHKFEREKINGEQLLQISHQDLEELGVTRI
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pF1KB8 MEPVTKWSPKQVVDWTRGLDDCLQQYVHKFEREKINGEQLLQISHQDLEELGVTRI
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pF1KB8 GHQELVLEAVDLLCALNYGLETDNMKNLVLKLRASSHNLQNYISSRRKSPAYDGNTSRKA
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NP_001 GHQELILEAVDLLCALNYGLETENLKTLSHKLNASAKNLQNFITGRRRSGHYDGRTSRKL
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pF1KB8 PNEFLTSVVELIGAAKALLAWLDRAPFTGITDFSVTKNKIIQLCLDLTTTVQKDCFVAEM
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130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 EDKVLTVVKVLNGICDKTIRSTTDPVMSQCACLEEVHLPNIKPGEGLGMYIKSTYDGLHV
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NP_001 ENKILHVCKTLSGVCDHIISLSSDPLVSQSAHLEVIQLANIKPSEGLGMYIKSTYDGLHV
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
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NP_001 ITGTTENSPADRCKKIHAGDEVIQVNHQTV------------------------------
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pF1KB8 FNFTPAPLKNLRWKPPLVQTSPPPATTQSPESTMDTSLKKEKSAILDLYIPPPPAVPYSP
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NP_001 ---------------PLIPRSPT-SSVATPSSTISTPTKRDSSALQDLYIPPPPAEPYIP
280 290 300 310
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pF1KB8 RDENGSFVYGGSSKCKQPLPGPKGSESPNSFLDQESRRRRFTIADSDQ-LPGYSVETNIL
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NP_001 RDEKGNLPCEDLRGHMVGKPVHKGSESPNSFLDQE-YRKRFNIVEEDTVLYCYEYEKGRS
320 330 340 350 360 370
420 430 440 450 460 470
pF1KB8 PTK-MREKTPSYGKPRPLSMPADGNWMGIVDPFARPRGHGRKGEDALCRYFSNERIPPII
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NP_001 SSQGRRESTPTYENSLLRYMSNEKIAQEEYMFQRNSKKDTGKKSKKKGDKSNSPTHYSLL
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555 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]