Result of FASTA (omim) for
pF1KB8020
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8020, 690 aa
1>>>pF1KB8020 690 - 690 aa - 690 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.4403+/-0.00057; mu= 5.1277+/- 0.035
mean_var=346.4656+/-75.772, 0's: 0 Z-trim(116.1): 151 B-trim: 1211 in 1/53
Lambda= 0.068904
statistics sampled from 26818 (26987) to 26818 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.671), E-opt: 0.2 (0.316), width: 16
Scan time: 10.970
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_699202 (OMIM: 609733) ligand of Numb protein X ( 690) 4657 478.3 4.2e-134
XP_016875923 (OMIM: 609733) PREDICTED: ligand of N ( 690) 4657 478.3 4.2e-134
XP_011533297 (OMIM: 609733) PREDICTED: ligand of N ( 567) 1965 210.6 1.4e-53
NP_116011 (OMIM: 609732) E3 ubiquitin-protein liga ( 632) 1650 179.3 3.9e-44
XP_016864265 (OMIM: 609732) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 728) 640 79.0 7e-14
XP_005265842 (OMIM: 609732) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 728) 640 79.0 7e-14
NP_001119800 (OMIM: 609732) E3 ubiquitin-protein l ( 728) 640 79.0 7e-14
XP_005270398 (OMIM: 603199) PREDICTED: inaD-like p (1882) 632 78.8 2.1e-13
XP_011538768 (OMIM: 603199) PREDICTED: inaD-like p (1907) 632 78.8 2.1e-13
XP_016870741 (OMIM: 603785,615219) PREDICTED: mult (2042) 625 78.1 3.6e-13
XP_005251680 (OMIM: 603785,615219) PREDICTED: mult (2000) 617 77.3 6.2e-13
XP_016870744 (OMIM: 603785,615219) PREDICTED: mult (2000) 617 77.3 6.2e-13
XP_016870743 (OMIM: 603785,615219) PREDICTED: mult (2000) 617 77.3 6.2e-13
XP_006716952 (OMIM: 603785,615219) PREDICTED: mult (2037) 617 77.3 6.2e-13
NP_001248335 (OMIM: 603785,615219) multiple PDZ do (2037) 617 77.3 6.2e-13
NP_001317566 (OMIM: 603785,615219) multiple PDZ do (2070) 617 77.4 6.3e-13
XP_006716949 (OMIM: 603785,615219) PREDICTED: mult (2070) 617 77.4 6.3e-13
XP_006716948 (OMIM: 603785,615219) PREDICTED: mult (2070) 617 77.4 6.3e-13
XP_006716950 (OMIM: 603785,615219) PREDICTED: mult (2070) 617 77.4 6.3e-13
XP_011538767 (OMIM: 603199) PREDICTED: inaD-like p (1912) 551 70.7 5.7e-11
XP_016855490 (OMIM: 603199) PREDICTED: inaD-like p ( 992) 545 69.8 5.9e-11
XP_016855489 (OMIM: 603199) PREDICTED: inaD-like p (1634) 545 70.1 7.8e-11
XP_011538764 (OMIM: 603199) PREDICTED: inaD-like p (1937) 545 70.2 8.6e-11
XP_011538765 (OMIM: 603199) PREDICTED: inaD-like p (1937) 545 70.2 8.6e-11
XP_011538766 (OMIM: 603199) PREDICTED: inaD-like p (1921) 543 70.0 9.9e-11
NP_795352 (OMIM: 603199) inaD-like protein [Homo s (1801) 445 60.2 8.1e-08
XP_016855488 (OMIM: 603199) PREDICTED: inaD-like p (1854) 423 58.0 3.8e-07
XP_016855487 (OMIM: 603199) PREDICTED: inaD-like p (1879) 423 58.0 3.8e-07
XP_016870745 (OMIM: 603785,615219) PREDICTED: mult (1971) 421 57.8 4.5e-07
XP_016870746 (OMIM: 603785,615219) PREDICTED: mult (1971) 421 57.8 4.5e-07
NP_001248336 (OMIM: 603785,615219) multiple PDZ do (2008) 421 57.9 4.5e-07
XP_006716954 (OMIM: 603785,615219) PREDICTED: mult (2008) 421 57.9 4.5e-07
XP_016870742 (OMIM: 603785,615219) PREDICTED: mult (2008) 421 57.9 4.5e-07
NP_003820 (OMIM: 603785,615219) multiple PDZ domai (2041) 421 57.9 4.6e-07
XP_006716951 (OMIM: 603785,615219) PREDICTED: mult (2041) 421 57.9 4.6e-07
XP_011538772 (OMIM: 603199) PREDICTED: inaD-like p ( 954) 342 49.6 6.8e-05
XP_006710341 (OMIM: 603199) PREDICTED: inaD-like p (1296) 342 49.7 8.1e-05
XP_005270404 (OMIM: 603199) PREDICTED: inaD-like p (1300) 342 49.7 8.1e-05
XP_011538771 (OMIM: 603199) PREDICTED: inaD-like p (1344) 342 49.8 8.3e-05
XP_011538770 (OMIM: 603199) PREDICTED: inaD-like p (1515) 342 49.8 8.9e-05
XP_011538769 (OMIM: 603199) PREDICTED: inaD-like p (1856) 336 49.4 0.00015
XP_005252593 (OMIM: 606745) PREDICTED: partitionin ( 741) 297 44.9 0.0013
XP_011517886 (OMIM: 606745) PREDICTED: partitionin ( 744) 297 44.9 0.0013
NP_001171722 (OMIM: 606745) partitioning defective (1000) 297 45.1 0.0016
XP_016871919 (OMIM: 606745) PREDICTED: partitionin (1015) 297 45.1 0.0016
XP_005252591 (OMIM: 606745) PREDICTED: partitionin (1030) 297 45.1 0.0016
NP_001171721 (OMIM: 606745) partitioning defective (1031) 297 45.1 0.0016
XP_011517885 (OMIM: 606745) PREDICTED: partitionin (1034) 297 45.1 0.0016
XP_011517883 (OMIM: 606745) PREDICTED: partitionin (1144) 297 45.2 0.0017
XP_011517881 (OMIM: 606745) PREDICTED: partitionin (1278) 297 45.3 0.0018
>>NP_699202 (OMIM: 609733) ligand of Numb protein X 2 [H (690 aa)
initn: 4657 init1: 4657 opt: 4657 Z-score: 2528.5 bits: 478.3 E(85289): 4.2e-134
Smith-Waterman score: 4657; 99.9% identity (99.9% similar) in 690 aa overlap (1-690:1-690)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MGTTSDEMVSVEQTSSSSLNPLCFECGQQHWTRENHLYNYQNEVDDDLVCHICLQPLLQP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_699 MGTTSDEMVSVEQTSSSSLNPLCFECGQQHWTRENHLYNYQNEVDDDLVCHICLQPLLQP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 LDTPCGHTFCYKCLRNFLQEKDFCPLDRKRLHFKLCKKSSILVHKLLDKLLVLCPFSSVC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_699 LDTPCGHTFCYKCLRNFLQEKDFCPLDRKRLHFKLCKKSSILVHKLLDKLLVLCPFSSVC
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 KDVMQRCDLEAHLKNRCPGASHRRVALERRKTSRTQAEIENENGPTLLDPAGTLSPEADC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_699 KDVMQRCDLEAHLKNRCPGASHRRVALERRKTSRTQAEIENENGPTLLDPAGTLSPEADC
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 LGTGAVPVERHLTSASLPTWSEEPGLDNPAFEESAGADTTQQPLSLPEGEITTIEIHRSN
::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_699 LGTGAVPVERHLTSASLSTWSEEPGLDNPAFEESAGADTTQQPLSLPEGEITTIEIHRSN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 PYIQLGISIVGGNETPLINIVIQEVYRDGVIARDGRLLAGDQILQVNNYNISNVSHNYAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_699 PYIQLGISIVGGNETPLINIVIQEVYRDGVIARDGRLLAGDQILQVNNYNISNVSHNYAR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 AVLSQPCNTLHLTVLRERRFGNRAHNHSDSNSPREEIFQVALHKRDSGEQLGIKLVRRTD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_699 AVLSQPCNTLHLTVLRERRFGNRAHNHSDSNSPREEIFQVALHKRDSGEQLGIKLVRRTD
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 EPGVFILDLLEGGLAAQDGRLSSNDRVLAINGHDLKYGTPELAAQIIQASGERVNLTIAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_699 EPGVFILDLLEGGLAAQDGRLSSNDRVLAINGHDLKYGTPELAAQIIQASGERVNLTIAR
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 PGKPQPGNTIREAGNHSSSSQHHTPPPYYSRPSSHKDLTQCVTCQEKHITVKKEPHESLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_699 PGKPQPGNTIREAGNHSSSSQHHTPPPYYSRPSSHKDLTQCVTCQEKHITVKKEPHESLG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB8 MTVAGGRGSKSGELPIFVTSVPPHGCLARDGRIKRGDVLLNINGIDLTNLSHSEAVAMLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_699 MTVAGGRGSKSGELPIFVTSVPPHGCLARDGRIKRGDVLLNINGIDLTNLSHSEAVAMLK
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB8 ASAASPAVALKALEVQIVEEATQNAEEQPSTFSENEYDASWSPSWVMWLGLPSTLHSCHD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_699 ASAASPAVALKALEVQIVEEATQNAEEQPSTFSENEYDASWSPSWVMWLGLPSTLHSCHD
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB8 IVLRRSYLGSWGFSIVGGYEENHTNQPFFIKTIVLGTPAYYDGRLKCGDMIVAVNGLSTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_699 IVLRRSYLGSWGFSIVGGYEENHTNQPFFIKTIVLGTPAYYDGRLKCGDMIVAVNGLSTV
610 620 630 640 650 660
670 680 690
pF1KB8 GMSHSALVPMLKEQRNKVTLTVICWPGSLV
::::::::::::::::::::::::::::::
NP_699 GMSHSALVPMLKEQRNKVTLTVICWPGSLV
670 680 690
>>XP_016875923 (OMIM: 609733) PREDICTED: ligand of Numb (690 aa)
initn: 4657 init1: 4657 opt: 4657 Z-score: 2528.5 bits: 478.3 E(85289): 4.2e-134
Smith-Waterman score: 4657; 99.9% identity (99.9% similar) in 690 aa overlap (1-690:1-690)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MGTTSDEMVSVEQTSSSSLNPLCFECGQQHWTRENHLYNYQNEVDDDLVCHICLQPLLQP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MGTTSDEMVSVEQTSSSSLNPLCFECGQQHWTRENHLYNYQNEVDDDLVCHICLQPLLQP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 LDTPCGHTFCYKCLRNFLQEKDFCPLDRKRLHFKLCKKSSILVHKLLDKLLVLCPFSSVC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LDTPCGHTFCYKCLRNFLQEKDFCPLDRKRLHFKLCKKSSILVHKLLDKLLVLCPFSSVC
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 KDVMQRCDLEAHLKNRCPGASHRRVALERRKTSRTQAEIENENGPTLLDPAGTLSPEADC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KDVMQRCDLEAHLKNRCPGASHRRVALERRKTSRTQAEIENENGPTLLDPAGTLSPEADC
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 LGTGAVPVERHLTSASLPTWSEEPGLDNPAFEESAGADTTQQPLSLPEGEITTIEIHRSN
::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LGTGAVPVERHLTSASLSTWSEEPGLDNPAFEESAGADTTQQPLSLPEGEITTIEIHRSN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 PYIQLGISIVGGNETPLINIVIQEVYRDGVIARDGRLLAGDQILQVNNYNISNVSHNYAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PYIQLGISIVGGNETPLINIVIQEVYRDGVIARDGRLLAGDQILQVNNYNISNVSHNYAR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 AVLSQPCNTLHLTVLRERRFGNRAHNHSDSNSPREEIFQVALHKRDSGEQLGIKLVRRTD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 AVLSQPCNTLHLTVLRERRFGNRAHNHSDSNSPREEIFQVALHKRDSGEQLGIKLVRRTD
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 EPGVFILDLLEGGLAAQDGRLSSNDRVLAINGHDLKYGTPELAAQIIQASGERVNLTIAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EPGVFILDLLEGGLAAQDGRLSSNDRVLAINGHDLKYGTPELAAQIIQASGERVNLTIAR
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 PGKPQPGNTIREAGNHSSSSQHHTPPPYYSRPSSHKDLTQCVTCQEKHITVKKEPHESLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PGKPQPGNTIREAGNHSSSSQHHTPPPYYSRPSSHKDLTQCVTCQEKHITVKKEPHESLG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB8 MTVAGGRGSKSGELPIFVTSVPPHGCLARDGRIKRGDVLLNINGIDLTNLSHSEAVAMLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MTVAGGRGSKSGELPIFVTSVPPHGCLARDGRIKRGDVLLNINGIDLTNLSHSEAVAMLK
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB8 ASAASPAVALKALEVQIVEEATQNAEEQPSTFSENEYDASWSPSWVMWLGLPSTLHSCHD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ASAASPAVALKALEVQIVEEATQNAEEQPSTFSENEYDASWSPSWVMWLGLPSTLHSCHD
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB8 IVLRRSYLGSWGFSIVGGYEENHTNQPFFIKTIVLGTPAYYDGRLKCGDMIVAVNGLSTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 IVLRRSYLGSWGFSIVGGYEENHTNQPFFIKTIVLGTPAYYDGRLKCGDMIVAVNGLSTV
610 620 630 640 650 660
670 680 690
pF1KB8 GMSHSALVPMLKEQRNKVTLTVICWPGSLV
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GMSHSALVPMLKEQRNKVTLTVICWPGSLV
670 680 690
>>XP_011533297 (OMIM: 609733) PREDICTED: ligand of Numb (567 aa)
initn: 2115 init1: 1952 opt: 1965 Z-score: 1083.1 bits: 210.6 E(85289): 1.4e-53
Smith-Waterman score: 3596; 82.0% identity (82.0% similar) in 690 aa overlap (1-690:1-567)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MGTTSDEMVSVEQTSSSSLNPLCFECGQQHWTRENHLYNYQNEVDDDLVCHICLQPLLQP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MGTTSDEMVSVEQTSSSSLNPLCFECGQQHWTRENHLYNYQNEVDDDLVCHICLQPLLQP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 LDTPCGHTFCYKCLRNFLQEKDFCPLDRKRLHFKLCKKSSILVHKLLDKLLVLCPFSSVC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LDTPCGHTFCYKCLRNFLQEKDFCPLDRKRLHFKLCKKSSILVHKLLDKLLVLCPFSSVC
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 KDVMQRCDLEAHLKNRCPGASHRRVALERRKTSRTQAEIENENGPTLLDPAGTLSPEADC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KDVMQRCDLEAHLKNRCPGASHRRVALERRKTSRTQAEIENENGPTLLDPAGTLSPEADC
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 LGTGAVPVERHLTSASLPTWSEEPGLDNPAFEESAGADTTQQPLSLPEGEITTIEIHRSN
::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LGTGAVPVERHLTSASLSTWSEEPGLDNPAFEESAGADTTQQPLSLPEGEITTIEIHRSN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 PYIQLGISIVGGNETPLINIVIQEVYRDGVIARDGRLLAGDQILQVNNYNISNVSHNYAR
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PYIQLGISIVGGNETPLINIVIQEVYRDGVIARDGRLLAGDQILQ---------------
250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 AVLSQPCNTLHLTVLRERRFGNRAHNHSDSNSPREEIFQVALHKRDSGEQLGIKLVRRTD
XP_011 ------------------------------------------------------------
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 EPGVFILDLLEGGLAAQDGRLSSNDRVLAINGHDLKYGTPELAAQIIQASGERVNLTIAR
::::::::::::
XP_011 ------------------------------------------------ASGERVNLTIAR
290
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 PGKPQPGNTIREAGNHSSSSQHHTPPPYYSRPSSHKDLTQCVTCQEKHITVKKEPHESLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PGKPQPGNTIREAGNHSSSSQHHTPPPYYSRPSSHKDLTQCVTCQEKHITVKKEPHESLG
300 310 320 330 340 350
490 500 510 520 530 540
pF1KB8 MTVAGGRGSKSGELPIFVTSVPPHGCLARDGRIKRGDVLLNINGIDLTNLSHSEAVAMLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MTVAGGRGSKSGELPIFVTSVPPHGCLARDGRIKRGDVLLNINGIDLTNLSHSEAVAMLK
360 370 380 390 400 410
550 560 570 580 590 600
pF1KB8 ASAASPAVALKALEVQIVEEATQNAEEQPSTFSENEYDASWSPSWVMWLGLPSTLHSCHD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ASAASPAVALKALEVQIVEEATQNAEEQPSTFSENEYDASWSPSWVMWLGLPSTLHSCHD
420 430 440 450 460 470
610 620 630 640 650 660
pF1KB8 IVLRRSYLGSWGFSIVGGYEENHTNQPFFIKTIVLGTPAYYDGRLKCGDMIVAVNGLSTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 IVLRRSYLGSWGFSIVGGYEENHTNQPFFIKTIVLGTPAYYDGRLKCGDMIVAVNGLSTV
480 490 500 510 520 530
670 680 690
pF1KB8 GMSHSALVPMLKEQRNKVTLTVICWPGSLV
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GMSHSALVPMLKEQRNKVTLTVICWPGSLV
540 550 560
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:. : :. :.: . . : .: :..
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NP_116 TAPEVFPRLYHLIPDGEITSIKINRVDPSESLSIRLVGGSETPLVHIIIQHIYRDGVIAR
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.. : : .::.:: ....:.: :::::::::: . . .:::.: :: : : ..::::
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::.:: ::::: :::..:::...:::: :: :: :. :. .::: ....:::.. :::..
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690
pF1KB8 V
.
NP_116 L
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. .: : :. .. : .: . . .: : : :: . : :. ..
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210 220 230 240 250
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370 380 390 400 410 420
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430 440 450 460 470 480
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pF1KB8 LKALEVQIVEEATQNAEEQPSTFSENEYDA---SWSPSWVMWLGLPSTLHSCHDIVLRRS
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XP_016 LKALEVK--EYEPQEDCSSPAALDSNHNMAPPSDWSPSWVMWLELPRCLYNCKDIVLRRN
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670 680 690
pF1KB8 LVPMLKEQRNKVTLTVICWPGSLV
:. .::: .
XP_016 LARLLKELKGRITLTIVSWPGTFL
710 720
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pF1KB8 MGTTSDEMVSVEQTSSSSLNPLCFECGQQHWTRENHLYNYQNEVDDDLVCHICLQPLLQP
:... .::: ::: : .:::.:.: .::::::.:::::: ::.:
XP_005 MNQPESANDPEPLCAVCGQAHSLEENHFYSYPEEVDDDLICHICLQALLDP
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160 170 180 190 200
pF1KB8 EIENENG---PTLLDPAGTLSPEADCLGTG------AVPVERH-LTSASLPTWSE-----
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XP_005 LMTDEPGLDNPAYVSSAEDGQPAISPVDSGRSNRTRARPFERSTIRSRSFKKINRALSVL
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:.::.: . :.: ::::::::::::.::.:: ::..:::: .::.:...: . . .
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pF1KB8 IREAGNHSSSSQHHTPPPYYSRPSSHKDLTQCVTCQEKHITVKKEPHESLGMTVAGGRGS
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pF1KB8 LKALEVQIVEEATQNAEEQPSTFSENEYDA---SWSPSWVMWLGLPSTLHSCHDIVLRRS
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XP_005 TAGSLGFCIVGGYEEYNGNKPFFIKSIVEGTPAYNDGRIRCGDILLAVNGRSTSGMIHAC
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670 680 690
pF1KB8 LVPMLKEQRNKVTLTVICWPGSLV
:. .::: .
XP_005 LARLLKELKGRITLTIVSWPGTFL
710 720
>>NP_001119800 (OMIM: 609732) E3 ubiquitin-protein ligas (728 aa)
initn: 2302 init1: 640 opt: 640 Z-score: 370.2 bits: 79.0 E(85289): 7e-14
Smith-Waterman score: 2135; 48.8% identity (71.9% similar) in 715 aa overlap (15-675:6-713)
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pF1KB8 MGTTSDEMVSVEQTSSSSLNPLCFECGQQHWTRENHLYNYQNEVDDDLVCHICLQPLLQP
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NP_001 MNQPESANDPEPLCAVCGQAHSLEENHFYSYPEEVDDDLICHICLQALLDP
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NP_001 LDTPCGHTYCTLCLTNFLVEKDFCPMDRKPLVLQHCKKSSILVNKLLNKLLVTCPFREHC
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pF1KB8 KDVMQRCDLEAHLKNRCPGASHRRVALERRKTSR-----------------------TQA
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NP_001 TQVLQRCDLEHHFQTSCKGASHYGLTKDRKRRSQDGCPDGCASLTATAPSPEVSAAATIS
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160 170 180 190 200
pF1KB8 EIENENG---PTLLDPAGTLSPEADCLGTG------AVPVERH-LTSASLPTWSE-----
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NP_001 RRTKSGSAVANHADQGRENSENTTAPEVFPRLYHLIPDGEITSIKINRVDPSESLSIRLV
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pF1KB8 GGNETPLINIVIQEVYRDGVIARDGRLLAGDQILQVNNYNISNVSHNYARAVLSQPCNTL
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NP_001 GGSETPLVHIIIQHIYRDGVIARDGRLLPGDIILKVNGMDISNVPHNYAVRLLRQPCQVL
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pF1KB8 HLTVLRERRFGNRAHNHS-DSNSPREEIFQVALHKRDSGEQLGIKLVRRTDEPGVFILDL
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NP_001 WLTVMREQKFRSRNNGQAPDAYRPRDDSFHVILNKSSPEEQLGIKLVRKVDEPGVFIFNV
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pF1KB8 LEGGLAAQDGRLSSNDRVLAINGHDLKYGTPELAAQIIQASGERVNLTIARPGKPQPGNT
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NP_001 LDGGVAYRHGQLEENDRVLAINGHDLRYGSPESAAHLIQASERRVHLVVSRQVRQRSPDI
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430 440 450 460 470 480
pF1KB8 IREAGNHSSSSQHHTPPPYYSRPSSHKDLTQCVTCQEKHITVKKEPHESLGMTVAGGRGS
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NP_001 FQEAGWNSNGSW--SPGPG-ERSNTPKPLHPTITCHEKVVNIQKDPGESLGMTVAGGASH
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pF1KB8 KSGELPIFVTSVPPHGCLARDGRIKRGDVLLNINGIDLTNLSHSEAVAMLKASAASPAVA
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NP_001 REWDLPIYVISVEPGGVISRDGRIKTGDILLNVDGVELTEVSRSEAVALLKRTSSS--IV
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pF1KB8 LKALEVQIVEEATQNAEEQPSTFSENEYDA---SWSPSWVMWLGLPSTLHSCHDIVLRRS
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NP_001 LKALEVK--EYEPQEDCSSPAALDSNHNMAPPSDWSPSWVMWLELPRCLYNCKDIVLRRN
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pF1KB8 YLGSWGFSIVGGYEENHTNQPFFIKTIVLGTPAYYDGRLKCGDMIVAVNGLSTVGMSHSA
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NP_001 TAGSLGFCIVGGYEEYNGNKPFFIKSIVEGTPAYNDGRIRCGDILLAVNGRSTSGMIHAC
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670 680 690
pF1KB8 LVPMLKEQRNKVTLTVICWPGSLV
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NP_001 LARLLKELKGRITLTIVSWPGTFL
710 720
>>XP_005270398 (OMIM: 603199) PREDICTED: inaD-like prote (1882 aa)
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pF1KB8 VMQRCDLEAHLKNRCPGASHRRVALERRKTSRTQAEIENENG--PTLLDPAGTLS-----
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XP_005 IKTAPSKVKLVFIRNEDAVNQMAVTPFPVPSSSPSSIEDQSGTEPISSEEDGSVEVGIKQ
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pF1KB8 -PEADCLGTGAVPVERHLTSASLPTWSEEPGLDNPAFEESAGADTT-----QQPLSL-PE
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XP_005 LPESESFKLAVSQMKQQKYPTKVSFSSQEIPLAPASSYHSTDADFTGYGGFQAPLSVDPA
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XP_005 ILEVNGVDLRNSSHEEAITALRQTPQKVRLVVYRDE-----AHYRDEENL---EIFPVDL
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