Result of FASTA (ccds) for
pF1KB8113
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8113, 380 aa
1>>>pF1KB8113 380 - 380 aa - 380 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.9705+/-0.000882; mu= 19.0249+/- 0.053
mean_var=71.0456+/-14.888, 0's: 0 Z-trim(105.7): 37 B-trim: 3 in 1/48
Lambda= 0.152162
statistics sampled from 8561 (8586) to 8561 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.627), E-opt: 0.2 (0.264), width: 16
Scan time: 1.510
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS973.1 CERS2 gene_id:29956|Hs108|chr1 ( 380) 2573 574.1 7.2e-164
CCDS10384.1 CERS3 gene_id:204219|Hs108|chr15 ( 383) 1438 324.9 7.4e-89
CCDS12197.1 CERS4 gene_id:79603|Hs108|chr19 ( 394) 1296 293.8 1.8e-79
CCDS8801.1 CERS5 gene_id:91012|Hs108|chr12 ( 392) 1095 249.6 3.5e-66
CCDS2228.1 CERS6 gene_id:253782|Hs108|chr2 ( 384) 1088 248.1 9.9e-66
CCDS58734.1 CERS6 gene_id:253782|Hs108|chr2 ( 392) 1063 242.6 4.5e-64
CCDS61120.1 CERS5 gene_id:91012|Hs108|chr12 ( 334) 940 215.5 5.4e-56
>>CCDS973.1 CERS2 gene_id:29956|Hs108|chr1 (380 aa)
initn: 2573 init1: 2573 opt: 2573 Z-score: 3055.4 bits: 574.1 E(32554): 7.2e-164
Smith-Waterman score: 2573; 100.0% identity (100.0% similar) in 380 aa overlap (1-380:1-380)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MLQTLYDYFWWERLWLPVNLTWADLEDRDGRVYAKASDLYITLPLALLFLIVRYFFELYV
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CCDS97 MLQTLYDYFWWERLWLPVNLTWADLEDRDGRVYAKASDLYITLPLALLFLIVRYFFELYV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 ATPLAALLNIKEKTRLRAPPNATLEHFYLTSGKQPKQVEVELLSRQSGLSGRQVERWFRR
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CCDS97 ATPLAALLNIKEKTRLRAPPNATLEHFYLTSGKQPKQVEVELLSRQSGLSGRQVERWFRR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 RRNQDRPSLLKKFREASWRFTFYLIAFIAGMAVIVDKPWFYDMKKVWEGYPIQSTIPSQY
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CCDS97 RRNQDRPSLLKKFREASWRFTFYLIAFIAGMAVIVDKPWFYDMKKVWEGYPIQSTIPSQY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 WYYMIELSFYWSLLFSIASDVKRKDFKEQIIHHVATIILISFSWFANYIRAGTLIMALHD
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CCDS97 WYYMIELSFYWSLLFSIASDVKRKDFKEQIIHHVATIILISFSWFANYIRAGTLIMALHD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
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CCDS97 SSDYLLESAKMFNYAGWKNTCNNIFIVFAIVFIITRLVILPFWILHCTLVYPLELYPAFF
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 GYYFFNSMMGVLQLLHIFWAYLILRMAHKFITGKLVEDERSDREETESSEGEEAAAGGGA
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CCDS97 GYYFFNSMMGVLQLLHIFWAYLILRMAHKFITGKLVEDERSDREETESSEGEEAAAGGGA
310 320 330 340 350 360
370 380
pF1KB8 KSRPLANGHPILNNNHRKND
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CCDS97 KSRPLANGHPILNNNHRKND
370 380
>>CCDS10384.1 CERS3 gene_id:204219|Hs108|chr15 (383 aa)
initn: 1198 init1: 1156 opt: 1438 Z-score: 1708.8 bits: 324.9 E(32554): 7.4e-89
Smith-Waterman score: 1438; 52.6% identity (77.5% similar) in 382 aa overlap (1-376:1-381)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MLQTLYDYFWWERLWLPVNLTWADLEDRDGRVYAKASDLYITLPLALLFLIVRYFFELYV
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CCDS10 MFWTFKEWFWLERFWLPPTIKWSDLEDHDGLVFVKPSHLYVTIPYAFLLLIIRRVFEKFV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 ATPLAALLNIKEKTRLRAPPNATLEHFYLTSGKQPKQVEVELLSRQSGLSGRQVERWFRR
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CCDS10 ASPLAKSFGIKETVR-KVTPNTVLENFFKHSTRQPLQTDIYGLAKKCNLTERQVERWFRS
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 RRNQDRPSLLKKFREASWRFTFYLIAFIAGMAVIVDKPWFYDMKKVWEGYPIQSTIPSQY
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CCDS10 RRNQERPSRLKKFQEACWRFAFYLMITVAGIAFLYDKPWLYDLWEVWNGYPKQPLLPSQY
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 WYYMIELSFYWSLLFSIASDVKRKDFKEQIIHHVATIILISFSWFANYIRAGTLIMALHD
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CCDS10 WYYILEMSFYWSLLFRLGFDVKRKDFLAHIIHHLAAISLMSFSWCANYIRSGTLVMIVHD
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 SSDYLLESAKMFNYAGWKNTCNNIFIVFAIVFIITRLVILPFWILHCTLVYPLELYPAFF
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CCDS10 VADIWLESAKMFSYAGWTQTCNTLFFIFSTIFFISRLIVFPFWILYCTLILPMYHLEPFF
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350
pF1KB8 GYYFFNSMMGVLQLLHIFWAYLILRMAHKFITGKLVEDERSDREE-TESSEGEEAAAGGG
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CCDS10 SYIFLNLQLMILQVLHLYWGYYILKMLNRCIFMKSIQDVRSDDEDYEEEEEEEEEEATKG
300 310 320 330 340 350
360 370 380
pF1KB8 AKSRPLANG-----HPILNNNHRKND
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CCDS10 KEMDCLKNGLRAERHLIPNGQHGH
360 370 380
>>CCDS12197.1 CERS4 gene_id:79603|Hs108|chr19 (394 aa)
initn: 1246 init1: 1246 opt: 1296 Z-score: 1540.2 bits: 293.8 E(32554): 1.8e-79
Smith-Waterman score: 1296; 49.9% identity (76.8% similar) in 371 aa overlap (1-370:1-370)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MLQTLYDYFWWERLWLPVNLTWADLEDRDGRVYAKASDLYITLPLALLFLIVRYFFELYV
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CCDS12 MLSSFNEWFWQDRFWLPPNVTWTELEDRDGRVYPHPQDLLAALPLALVLLAMRLAFERFI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 ATPLAALLNIKEKTRLRAPPNATLEHFYLTSGKQPKQVEVELLSRQSGLSGRQVERWFRR
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CCDS12 GLPLSRWLGVRDQTRRQVKPNATLEKHFLTEGHRPKEPQLSLLAAQCGLTLQQTQRWFRR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 RRNQDRPSLLKKFREASWRFTFYLIAFIAGMAVIVDKPWFYDMKKVWEGYPIQSTIPSQY
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CCDS12 RRNQDRPQLTKKFCEASWRFLFYLSSFVGGLSVLYHESWLWAPVMCWDRYPNQTLKPSLY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 WYYMIELSFYWSLLFSIASDVKRKDFKEQIIHHVATIILISFSWFANYIRAGTLIMALHD
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CCDS12 WWYLLELGFYLSLLIRLPFDVKRKDFKEQVIHHFVAVILMTFSYSANLLRIGSLVLLLHD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 SSDYLLESAKMFNYAGWKNTCNNIFIVFAIVFIITRLVILPFWILHCTLVYPLELYPAFF
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CCDS12 SSDYLLEACKMVNYMQYQQVCDALFLIFSFVFFYTRLVLFPTQILYTTYYESISNRGPFF
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350
pF1KB8 GYYFFNSMMGVLQLLHIFWAYLILRMAHKFIT-GKLVEDERSDREETESSEGEEAAAGGG
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CCDS12 GYYFFNGLLMLLQLLHVFWSCLILRMLYSFMKKGQMEKDIRSDVEESDSSE-EAAAAQEP
310 320 330 340 350
360 370 380
pF1KB8 AKSRPLANGHPILNNNHRKND
. . : : :
CCDS12 LQLKNGAAGGPRPAPTDGPRSRVAGRLTNRHTTAT
360 370 380 390
>>CCDS8801.1 CERS5 gene_id:91012|Hs108|chr12 (392 aa)
initn: 1054 init1: 954 opt: 1095 Z-score: 1301.7 bits: 249.6 E(32554): 3.5e-66
Smith-Waterman score: 1095; 45.2% identity (73.7% similar) in 354 aa overlap (2-353:9-360)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MLQTLYDYFWWERLWLPVNLTWADLED-RDGRVYAKASDLYITLPLALLFLIV
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CCDS88 MATAAQGPLSLLWGWLWSERFWLPENVSWADLEGPADGYGYPRGRHILSVFPLAAGIFFV
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 RYFFELYVATPLAALLNIKEKTRLRAPPNATLEHFYLTSGKQPKQVEVELLSRQSGLSGR
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CCDS88 RLLFERFIAKPCALCIGIEDSGPYQAQPNAILEKVFISITKYPDKKRLEGLSKQLDWNVR
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 QVERWFRRRRNQDRPSLLKKFREASWRFTFYLIAFIAGMAVIVDKPWFYDMKKVWEGYPI
... :::.:::::.: : :: :. ::::::: : :. . ..:::.:... :..::.
CCDS88 KIQCWFRHRRNQDKPPTLTKFCESMWRFTFYLCIFCYGIRFLWSSPWFWDIRQCWHNYPF
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 QSTIPSQYWYYMIELSFYWSLLFSIASDVKRKDFKEQIIHHVATIILISFSWFANYIRAG
: . : ::..::.:::::.:: .:.::::: ...::..:: :::::.. :..:.:
CCDS88 QPLSSGLYHYYIMELAFYWSLMFSQFTDIKRKDFLIMFVHHLVTIGLISFSYINNMVRVG
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 TLIMALHDSSDYLLESAKMFNYAGWKNTCNNIFIVFAIVFIITRLVILPFWILHCTLVYP
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CCDS88 TLIMCLHDVSDFLLEAAKLANYAKYQRLCDTLFVIFSAVFMVTRLGIYPFWILNTTLFES
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 LELYPAFFGYYFFNSMMGVLQLLHIFWAYLILRMAHK-FITGKLVEDERSDREETESSEG
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CCDS88 WEIIGPYASWWLLNGLLLTLQLLHVIWSYLIARIALKALIRGKVSKDDRSDVES--SSEE
310 320 330 340 350
360 370 380
pF1KB8 EEAAAGGGAKSRPLANGHPILNNNHRKND
:.
CCDS88 EDVTTCTKSPCDSSSSNGANRVNGHMGGSYWAEE
360 370 380 390
>>CCDS2228.1 CERS6 gene_id:253782|Hs108|chr2 (384 aa)
initn: 1060 init1: 1060 opt: 1088 Z-score: 1293.5 bits: 248.1 E(32554): 9.9e-66
Smith-Waterman score: 1088; 43.1% identity (72.9% similar) in 362 aa overlap (8-368:7-367)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MLQTLYDYFWWERLWLPVNLTWADLEDRDGRVYAKASDLYITLPLALLFLIVRYFFELYV
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CCDS22 MAGILAWFWNERFWLPHNVTWADLKNTEEATFPQAEDLYLAFPLAFCIFMVRLIFERFV
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 ATPLAALLNIKEKTRLRAPPNATLEHFYLTSGKQPKQVEVELLSRQSGLSGRQVERWFRR
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CCDS22 AKPCAIALNIQANGPQIAPPNAILEKVFTAITKHPDEKRLEGLSKQLDWDVRSIQRWFRQ
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 RRNQDRPSLLKKFREASWRFTFYLIAFIAGMAVIVDKPWFYDMKKVWEGYPIQSTIPSQY
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CCDS22 RRNQEKPSTLTRFCESMWRFSFYLYVFTYGVRFLKKTPWLWNTRHCWYNYPYQPLTTDLH
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 WYYMIELSFYWSLLFSIASDVKRKDFKEQIIHHVATIILISFSWFANYIRAGTLIMALHD
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CCDS22 YYYILELSFYWSLMFSQFTDIKRKDFGIMFLHHLVSIFLITFSYVNNMARVGTLVLCLHD
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 SSDYLLESAKMFNYAGWKNTCNNIFIVFAIVFIITRLVILPFWILHCTLVYPLELYPAFF
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CCDS22 SADALLEAAKMANYAKFQKMCDLLFVMFAVVFITTRLGIFPLWVLNTTLFESWEIVGPYP
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350
pF1KB8 GYYFFNSMMGVLQLLHIFWAYLILRMAHKFIT-GKLVEDERSDREETESSEGEEAAAGGG
... :: .. ..: :. ::.:::...: : .. ::. .:.::: : . :.: . : .
CCDS22 SWWVFNLLLLLVQGLNCFWSYLIVKIACKAVSRGKVSKDDRSDIE-SSSDEEDSEPPGKN
300 310 320 330 340 350
360 370 380
pF1KB8 AKSRPLANGHPILNNNHRKND
.. .::
CCDS22 PHTATTTNGTSGTNGYLLTGSCSMDD
360 370 380
>>CCDS58734.1 CERS6 gene_id:253782|Hs108|chr2 (392 aa)
initn: 1123 init1: 1039 opt: 1063 Z-score: 1263.8 bits: 242.6 E(32554): 4.5e-64
Smith-Waterman score: 1063; 43.0% identity (72.1% similar) in 358 aa overlap (8-359:7-364)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MLQTLYDYFWWERLWLPVNLTWADLEDRDGRVYAKASDLYITLPLALLFLIVRYFFELYV
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CCDS58 MAGILAWFWNERFWLPHNVTWADLKNTEEATFPQAEDLYLAFPLAFCIFMVRLIFERFV
10 20 30 40 50
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pF1KB8 ATPLAALLNIKEKTRLRAPPNATLEHFYLTSGKQPKQVEVELLSRQSGLSGRQVERWFRR
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CCDS58 AKPCAIALNIQANGPQIAPPNAILEKVFTAITKHPDEKRLEGLSKQLDWDVRSIQRWFRQ
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 RRNQDRPSLLKKFREASWRFTFYLIAFIAGMAVIVDKPWFYDMKKVWEGYPIQSTIPSQY
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CCDS58 RRNQEKPSTLTRFCESMWRFSFYLYVFTYGVRFLKKTPWLWNTRHCWYNYPYQPLTTDLH
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 WYYMIELSFYWSLLFSIASDVKRKDFKEQIIHHVATIILISFSWFANYIRAGTLIMALHD
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CCDS58 YYYILELSFYWSLMFSQFTDIKRKDFGIMFLHHLVSIFLITFSYVNNMARVGTLVLCLHD
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 SSDYLLESAKMFNYAGWKNTCNNIFIVFAIVFIITRLVILPFWILHCTLVYPLELYPAFF
:.: :::.::: ::: ... :. .:..::.::: ::: :.:.:.:. :: :. .
CCDS58 SADALLEAAKMANYAKFQKMCDLLFVMFAVVFITTRLGIFPLWVLNTTLFESWEIVGPYP
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350
pF1KB8 GYYFFNSMMGVLQLLHIFWAYLILRMAHKFIT-GKL-----VEDERSDREETESSEGEEA
... :: .. ..: :. ::.:::...: : .. :: .. ..:: . ::: ::
CCDS58 SWWVFNLLLLLVQGLNCFWSYLIVKIACKAVSRGKAGKWNPLHVSKDDRSDIESSSDEED
300 310 320 330 340 350
360 370 380
pF1KB8 AAGGGAKSRPLANGHPILNNNHRKND
. :
CCDS58 SEPPGKNPHTATTTNGTSGTNGYLLTGSCSMDD
360 370 380 390
>>CCDS61120.1 CERS5 gene_id:91012|Hs108|chr12 (334 aa)
initn: 873 init1: 873 opt: 940 Z-score: 1118.8 bits: 215.5 E(32554): 5.4e-56
Smith-Waterman score: 940; 45.9% identity (74.7% similar) in 296 aa overlap (59-353:9-302)
30 40 50 60 70 80
pF1KB8 DGRVYAKASDLYITLPLALLFLIVRYFFELYVATPLAALLNIKEKTRLRAPPNATLEHFY
..: : : ..:... .: ::: ::. .
CCDS61 MMKPRPKRFIAKPCALCIGIEDSGPYQAQPNAILEKVF
10 20 30
90 100 110 120 130 140
pF1KB8 LTSGKQPKQVEVELLSRQSGLSGRQVERWFRRRRNQDRPSLLKKFREASWRFTFYLIAFI
.. : : . ..: ::.: . :... :::.:::::.: : :: :. ::::::: :
CCDS61 ISITKYPDKKRLEGLSKQLDWNVRKIQCWFRHRRNQDKPPTLTKFCESMWRFTFYLCIFC
40 50 60 70 80 90
150 160 170 180 190 200
pF1KB8 AGMAVIVDKPWFYDMKKVWEGYPIQSTIPSQYWYYMIELSFYWSLLFSIASDVKRKDFKE
:. . ..:::.:... :..::.: . : ::..::.:::::.:: .:.:::::
CCDS61 YGIRFLWSSPWFWDIRQCWHNYPFQPLSSGLYHYYIMELAFYWSLMFSQFTDIKRKDFLI
100 110 120 130 140 150
210 220 230 240 250 260
pF1KB8 QIIHHVATIILISFSWFANYIRAGTLIMALHDSSDYLLESAKMFNYAGWKNTCNNIFIVF
...::..:: :::::.. :..:.::::: ::: ::.:::.::. ::: .. :...:..:
CCDS61 MFVHHLVTIGLISFSYINNMVRVGTLIMCLHDVSDFLLEAAKLANYAKYQRLCDTLFVIF
160 170 180 190 200 210
270 280 290 300 310 320
pF1KB8 AIVFIITRLVILPFWILHCTLVYPLELYPAFFGYYFFNSMMGVLQLLHIFWAYLILRMAH
. ::..::: : :::::. :: :. . .....:... .:::::..:.::: :.:
CCDS61 SAVFMVTRLGIYPFWILNTTLFESWEIIGPYASWWLLNGLLLTLQLLHVIWSYLIARIAL
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330 340 350 360 370 380
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