FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8165, 496 aa
1>>>pF1KB8165 496 - 496 aa - 496 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.8433+/-0.00118; mu= 1.3246+/- 0.069
mean_var=245.1891+/-55.061, 0's: 0 Z-trim(109.6): 656 B-trim: 111 in 1/50
Lambda= 0.081908
statistics sampled from 10265 (11031) to 10265 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.686), E-opt: 0.2 (0.339), width: 16
Scan time: 3.050
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS14276.1 CDK16 gene_id:5127|Hs108|chrX ( 496) 3262 399.1 5.7e-111
CCDS48101.1 CDK16 gene_id:5127|Hs108|chrX ( 502) 3262 399.1 5.7e-111
CCDS55408.1 CDK16 gene_id:5127|Hs108|chrX ( 570) 3262 399.2 6.3e-111
CCDS53819.1 CDK17 gene_id:5128|Hs108|chr12 ( 523) 2318 287.6 2.3e-77
CCDS9061.1 CDK17 gene_id:5128|Hs108|chr12 ( 523) 2318 287.6 2.3e-77
CCDS44300.1 CDK18 gene_id:5129|Hs108|chr1 ( 474) 1982 247.9 1.9e-65
CCDS1454.1 CDK18 gene_id:5129|Hs108|chr1 ( 504) 1958 245.0 1.4e-64
CCDS75627.1 CDK14 gene_id:5218|Hs108|chr7 ( 423) 1237 159.8 5.5e-39
CCDS5619.1 CDK14 gene_id:5218|Hs108|chr7 ( 451) 1237 159.8 5.7e-39
CCDS75626.1 CDK14 gene_id:5218|Hs108|chr7 ( 469) 1237 159.8 5.9e-39
CCDS2350.1 CDK15 gene_id:65061|Hs108|chr2 ( 384) 1174 152.3 8.9e-37
CCDS58747.1 CDK15 gene_id:65061|Hs108|chr2 ( 429) 1149 149.4 7.5e-36
CCDS58746.1 CDK15 gene_id:65061|Hs108|chr2 ( 400) 1141 148.4 1.4e-35
CCDS47748.1 CDK5 gene_id:1020|Hs108|chr7 ( 292) 1133 147.3 2.1e-35
CCDS75628.1 CDK14 gene_id:5218|Hs108|chr7 ( 340) 1104 144.0 2.5e-34
CCDS11736.1 CDK3 gene_id:1018|Hs108|chr17 ( 305) 1082 141.3 1.4e-33
CCDS8898.1 CDK2 gene_id:1017|Hs108|chr12 ( 298) 1062 139.0 7.1e-33
CCDS44408.1 CDK1 gene_id:983|Hs108|chr10 ( 297) 1056 138.2 1.2e-32
CCDS72682.1 CDK11B gene_id:984|Hs108|chr1 ( 748) 800 108.4 2.9e-23
CCDS72684.1 CDK11B gene_id:984|Hs108|chr1 ( 782) 800 108.4 3e-23
CCDS72683.1 CDK11B gene_id:984|Hs108|chr1 ( 795) 800 108.4 3e-23
CCDS44043.1 CDK11A gene_id:728642|Hs108|chr1 ( 770) 785 106.6 1e-22
CCDS81254.1 CDK11A gene_id:728642|Hs108|chr1 ( 779) 785 106.6 1e-22
CCDS44042.1 CDK11A gene_id:728642|Hs108|chr1 ( 780) 785 106.6 1e-22
CCDS81253.1 CDK11A gene_id:728642|Hs108|chr1 ( 783) 785 106.6 1e-22
CCDS10984.2 CDK10 gene_id:8558|Hs108|chr16 ( 360) 767 104.2 2.6e-22
CCDS3999.1 CDK7 gene_id:1022|Hs108|chr5 ( 346) 765 103.9 2.9e-22
CCDS4949.1 ICK gene_id:22858|Hs108|chr6 ( 632) 695 95.9 1.4e-19
CCDS35060.1 CDK20 gene_id:23552|Hs108|chr9 ( 346) 681 94.0 2.8e-19
CCDS75398.1 MAK gene_id:4117|Hs108|chr6 ( 583) 679 94.0 4.9e-19
CCDS4516.1 MAK gene_id:4117|Hs108|chr6 ( 623) 679 94.0 5.1e-19
CCDS75399.1 MAK gene_id:4117|Hs108|chr6 ( 648) 679 94.0 5.3e-19
CCDS32514.2 CDK10 gene_id:8558|Hs108|chr16 ( 272) 656 90.9 1.9e-18
CCDS9699.1 CDKL1 gene_id:8814|Hs108|chr14 ( 358) 654 90.8 2.7e-18
CCDS8899.1 CDK2 gene_id:1017|Hs108|chr12 ( 264) 633 88.2 1.2e-17
CCDS3570.1 CDKL2 gene_id:8999|Hs108|chr4 ( 493) 635 88.7 1.6e-17
CCDS82933.1 CDKL2 gene_id:8999|Hs108|chr4 ( 570) 635 88.8 1.8e-17
CCDS5628.1 CDK6 gene_id:1021|Hs108|chr7 ( 326) 627 87.6 2.3e-17
CCDS47265.1 CDKL3 gene_id:51265|Hs108|chr5 ( 455) 627 87.7 2.9e-17
CCDS47264.1 CDKL3 gene_id:51265|Hs108|chr5 ( 592) 627 87.8 3.5e-17
CCDS33184.1 CDKL4 gene_id:344387|Hs108|chr2 ( 315) 620 86.7 3.9e-17
CCDS8953.1 CDK4 gene_id:1019|Hs108|chr12 ( 303) 619 86.6 4.1e-17
CCDS10672.1 MAPK3 gene_id:5595|Hs108|chr16 ( 379) 619 86.7 4.9e-17
CCDS42149.1 MAPK3 gene_id:5595|Hs108|chr16 ( 357) 618 86.6 5.1e-17
CCDS83458.1 CDKL5 gene_id:6792|Hs108|chrX ( 960) 622 87.4 7.5e-17
CCDS14186.1 CDKL5 gene_id:6792|Hs108|chrX (1030) 622 87.5 7.9e-17
CCDS55184.1 CDK5 gene_id:1020|Hs108|chr7 ( 260) 606 85.0 1.1e-16
CCDS13795.1 MAPK1 gene_id:5594|Hs108|chr22 ( 360) 606 85.1 1.4e-16
CCDS73637.1 CDKL1 gene_id:8814|Hs108|chr14 ( 276) 603 84.7 1.4e-16
CCDS6409.2 MAPK15 gene_id:225689|Hs108|chr8 ( 544) 599 84.5 3.3e-16
>>CCDS14276.1 CDK16 gene_id:5127|Hs108|chrX (496 aa)
initn: 3262 init1: 3262 opt: 3262 Z-score: 2105.8 bits: 399.1 E(32554): 5.7e-111
Smith-Waterman score: 3262; 100.0% identity (100.0% similar) in 496 aa overlap (1-496:1-496)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MDRMKKIKRQLSMTLRGGRGIDKTNGAPEQIGLDESGGGGGSDPGEAPTRAAPGELRSAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 MDRMKKIKRQLSMTLRGGRGIDKTNGAPEQIGLDESGGGGGSDPGEAPTRAAPGELRSAR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 GPLSSAPEIVHEDLKMGSDGESDQASATSSDEVQSPVRVRMRNHPPRKISTEDINKRLSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 GPLSSAPEIVHEDLKMGSDGESDQASATSSDEVQSPVRVRMRNHPPRKISTEDINKRLSL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 PADIRLPEGYLEKLTLNSPIFDKPLSRRLRRVSLSEIGFGKLETYIKLDKLGEGTYATVY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 PADIRLPEGYLEKLTLNSPIFDKPLSRRLRRVSLSEIGFGKLETYIKLDKLGEGTYATVY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 KGKSKLTDNLVALKEIRLEHEEGAPCTAIREVSLLKDLKHANIVTLHDIIHTEKSLTLVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 KGKSKLTDNLVALKEIRLEHEEGAPCTAIREVSLLKDLKHANIVTLHDIIHTEKSLTLVF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 EYLDKDLKQYLDDCGNIINMHNVKLFLFQLLRGLAYCHRQKVLHRDLKPQNLLINERGEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 EYLDKDLKQYLDDCGNIINMHNVKLFLFQLLRGLAYCHRQKVLHRDLKPQNLLINERGEL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 KLADFGLARAKSIPTKTYSNEVVTLWYRPPDILLGSTDYSTQIDMWGVGCIFYEMATGRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 KLADFGLARAKSIPTKTYSNEVVTLWYRPPDILLGSTDYSTQIDMWGVGCIFYEMATGRP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 LFPGSTVEEQLHFIFRILGTPTEETWPGILSNEEFKTYNYPKYRAEALLSHAPRLDSDGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LFPGSTVEEQLHFIFRILGTPTEETWPGILSNEEFKTYNYPKYRAEALLSHAPRLDSDGA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 DLLTKLLQFEGRNRISAEDAMKHPFFLSLGERIHKLPDTTSIFALKEIQLQKEASLRSSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 DLLTKLLQFEGRNRISAEDAMKHPFFLSLGERIHKLPDTTSIFALKEIQLQKEASLRSSS
430 440 450 460 470 480
490
pF1KB8 MPDSGRPAFRVVDTEF
::::::::::::::::
CCDS14 MPDSGRPAFRVVDTEF
490
>>CCDS48101.1 CDK16 gene_id:5127|Hs108|chrX (502 aa)
initn: 3262 init1: 3262 opt: 3262 Z-score: 2105.7 bits: 399.1 E(32554): 5.7e-111
Smith-Waterman score: 3262; 100.0% identity (100.0% similar) in 496 aa overlap (1-496:7-502)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MDRMKKIKRQLSMTLRGGRGIDKTNGAPEQIGLDESGGGGGSDPGEAPTRAAPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 MQSEIAMDRMKKIKRQLSMTLRGGRGIDKTNGAPEQIGLDESGGGGGSDPGEAPTRAAPG
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 ELRSARGPLSSAPEIVHEDLKMGSDGESDQASATSSDEVQSPVRVRMRNHPPRKISTEDI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 ELRSARGPLSSAPEIVHEDLKMGSDGESDQASATSSDEVQSPVRVRMRNHPPRKISTEDI
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 NKRLSLPADIRLPEGYLEKLTLNSPIFDKPLSRRLRRVSLSEIGFGKLETYIKLDKLGEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 NKRLSLPADIRLPEGYLEKLTLNSPIFDKPLSRRLRRVSLSEIGFGKLETYIKLDKLGEG
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 TYATVYKGKSKLTDNLVALKEIRLEHEEGAPCTAIREVSLLKDLKHANIVTLHDIIHTEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 TYATVYKGKSKLTDNLVALKEIRLEHEEGAPCTAIREVSLLKDLKHANIVTLHDIIHTEK
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 SLTLVFEYLDKDLKQYLDDCGNIINMHNVKLFLFQLLRGLAYCHRQKVLHRDLKPQNLLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 SLTLVFEYLDKDLKQYLDDCGNIINMHNVKLFLFQLLRGLAYCHRQKVLHRDLKPQNLLI
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 NERGELKLADFGLARAKSIPTKTYSNEVVTLWYRPPDILLGSTDYSTQIDMWGVGCIFYE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 NERGELKLADFGLARAKSIPTKTYSNEVVTLWYRPPDILLGSTDYSTQIDMWGVGCIFYE
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KB8 MATGRPLFPGSTVEEQLHFIFRILGTPTEETWPGILSNEEFKTYNYPKYRAEALLSHAPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 MATGRPLFPGSTVEEQLHFIFRILGTPTEETWPGILSNEEFKTYNYPKYRAEALLSHAPR
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KB8 LDSDGADLLTKLLQFEGRNRISAEDAMKHPFFLSLGERIHKLPDTTSIFALKEIQLQKEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 LDSDGADLLTKLLQFEGRNRISAEDAMKHPFFLSLGERIHKLPDTTSIFALKEIQLQKEA
430 440 450 460 470 480
480 490
pF1KB8 SLRSSSMPDSGRPAFRVVDTEF
::::::::::::::::::::::
CCDS48 SLRSSSMPDSGRPAFRVVDTEF
490 500
>>CCDS55408.1 CDK16 gene_id:5127|Hs108|chrX (570 aa)
initn: 3262 init1: 3262 opt: 3262 Z-score: 2105.0 bits: 399.2 E(32554): 6.3e-111
Smith-Waterman score: 3262; 100.0% identity (100.0% similar) in 496 aa overlap (1-496:75-570)
10 20 30
pF1KB8 MDRMKKIKRQLSMTLRGGRGIDKTNGAPEQ
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 CSGAFPLDPNNPSLGPLPSISHLNLRTQIAMDRMKKIKRQLSMTLRGGRGIDKTNGAPEQ
50 60 70 80 90 100
40 50 60 70 80 90
pF1KB8 IGLDESGGGGGSDPGEAPTRAAPGELRSARGPLSSAPEIVHEDLKMGSDGESDQASATSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 IGLDESGGGGGSDPGEAPTRAAPGELRSARGPLSSAPEIVHEDLKMGSDGESDQASATSS
110 120 130 140 150 160
100 110 120 130 140 150
pF1KB8 DEVQSPVRVRMRNHPPRKISTEDINKRLSLPADIRLPEGYLEKLTLNSPIFDKPLSRRLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 DEVQSPVRVRMRNHPPRKISTEDINKRLSLPADIRLPEGYLEKLTLNSPIFDKPLSRRLR
170 180 190 200 210 220
160 170 180 190 200 210
pF1KB8 RVSLSEIGFGKLETYIKLDKLGEGTYATVYKGKSKLTDNLVALKEIRLEHEEGAPCTAIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 RVSLSEIGFGKLETYIKLDKLGEGTYATVYKGKSKLTDNLVALKEIRLEHEEGAPCTAIR
230 240 250 260 270 280
220 230 240 250 260 270
pF1KB8 EVSLLKDLKHANIVTLHDIIHTEKSLTLVFEYLDKDLKQYLDDCGNIINMHNVKLFLFQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 EVSLLKDLKHANIVTLHDIIHTEKSLTLVFEYLDKDLKQYLDDCGNIINMHNVKLFLFQL
290 300 310 320 330 340
280 290 300 310 320 330
pF1KB8 LRGLAYCHRQKVLHRDLKPQNLLINERGELKLADFGLARAKSIPTKTYSNEVVTLWYRPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LRGLAYCHRQKVLHRDLKPQNLLINERGELKLADFGLARAKSIPTKTYSNEVVTLWYRPP
350 360 370 380 390 400
340 350 360 370 380 390
pF1KB8 DILLGSTDYSTQIDMWGVGCIFYEMATGRPLFPGSTVEEQLHFIFRILGTPTEETWPGIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 DILLGSTDYSTQIDMWGVGCIFYEMATGRPLFPGSTVEEQLHFIFRILGTPTEETWPGIL
410 420 430 440 450 460
400 410 420 430 440 450
pF1KB8 SNEEFKTYNYPKYRAEALLSHAPRLDSDGADLLTKLLQFEGRNRISAEDAMKHPFFLSLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 SNEEFKTYNYPKYRAEALLSHAPRLDSDGADLLTKLLQFEGRNRISAEDAMKHPFFLSLG
470 480 490 500 510 520
460 470 480 490
pF1KB8 ERIHKLPDTTSIFALKEIQLQKEASLRSSSMPDSGRPAFRVVDTEF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 ERIHKLPDTTSIFALKEIQLQKEASLRSSSMPDSGRPAFRVVDTEF
530 540 550 560 570
>>CCDS53819.1 CDK17 gene_id:5128|Hs108|chr12 (523 aa)
initn: 2384 init1: 2312 opt: 2318 Z-score: 1502.6 bits: 287.6 E(32554): 2.3e-77
Smith-Waterman score: 2352; 69.5% identity (86.9% similar) in 512 aa overlap (4-485:1-512)
10 20 30 40
pF1KB8 MDRMKKIKRQLSMTLRGGRGIDKT-NGAPEQIGLDESGGG-------GGSDPG-------
:::.::.::.::::.. ::.. . ::. ..:... .: :
CCDS53 MKKFKRRLSLTLRGSQTIDESLSELAEQMTIEENSSKDNEPIVKNGRPPTSHSMHSF
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90
pF1KB8 ---------EAPTRAAPGELRSARGPLSSAP------EIVHEDLKMGSDGESDQASATSS
. : : . . .. : . . : .::::.:::::::::::::.:::
CCDS53 LHQYTGSFKKPPLRRPHSVIGGSLGSFMAMPRNGSRLDIVHENLKMGSDGESDQASGTSS
60 70 80 90 100 110
100 110 120 130 140 150
pF1KB8 DEVQSPVRVRMRNHPPRKISTEDINKRLSLPADIRLPEGYLEKLTLNSPIFDKPLSRRLR
::::::. : .::. :.:: ::.:::::::::::.:.:::::: .::: ::.:.::: :
CCDS53 DEVQSPTGVCLRNRIHRRISMEDLNKRLSLPADIRIPDGYLEKLQINSPPFDQPMSRRSR
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KB8 RVSLSEIGFGKLETYIKLDKLGEGTYATVYKGKSKLTDNLVALKEIRLEHEEGAPCTAIR
:.:::::::::.::::::.:::::::::::::.::::.::::::::::::::::::::::
CCDS53 RASLSEIGFGKMETYIKLEKLGEGTYATVYKGRSKLTENLVALKEIRLEHEEGAPCTAIR
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KB8 EVSLLKDLKHANIVTLHDIIHTEKSLTLVFEYLDKDLKQYLDDCGNIINMHNVKLFLFQL
:::::::::::::::::::.::.:::::::::::::::::.::::::..::::::::.:.
CCDS53 EVSLLKDLKHANIVTLHDIVHTDKSLTLVFEYLDKDLKQYMDDCGNIMSMHNVKLFLYQI
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KB8 LRGLAYCHRQKVLHRDLKPQNLLINERGELKLADFGLARAKSIPTKTYSNEVVTLWYRPP
:::::::::.::::::::::::::::.:::::::::::::::.:::::::::::::::::
CCDS53 LRGLAYCHRRKVLHRDLKPQNLLINEKGELKLADFGLARAKSVPTKTYSNEVVTLWYRPP
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KB8 DILLGSTDYSTQIDMWGVGCIFYEMATGRPLFPGSTVEEQLHFIFRILGTPTEETWPGIL
:.::::..::::::::::::::.:::.:::::::::::..::.:::.::::..::::::
CCDS53 DVLLGSSEYSTQIDMWGVGCIFFEMASGRPLFPGSTVEDELHLIFRLLGTPSQETWPGIS
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430 440 450
pF1KB8 SNEEFKTYNYPKYRAEALLSHAPRLDSDGADLLTKLLQFEGRNRISAEDAMKHPFFLSLG
::::::.::.:::. . :..:::::::.: .:.::.::.:...:.:::.:::: .: :::
CCDS53 SNEEFKNYNFPKYKPQPLINHAPRLDSEGIELITKFLQYESKKRVSAEEAMKHVYFRSLG
420 430 440 450 460 470
460 470 480 490
pF1KB8 ERIHKLPDTTSIFALKEIQLQKEASLRSSSMPDSGRPAFRVVDTEF
::: ::...:::.::::::::. ..:.::.:..:
CCDS53 PRIHALPESVSIFSLKEIQLQKDPGFRNSSYPETGVFVINHFTCRS
480 490 500 510 520
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10 20 30 40
pF1KB8 MDRMKKIKRQLSMTLRGGRGIDKT-NGAPEQIGLDESGGG-------GGSDPG-------
:::.::.::.::::.. ::.. . ::. ..:... .: :
CCDS90 MKKFKRRLSLTLRGSQTIDESLSELAEQMTIEENSSKDNEPIVKNGRPPTSHSMHSF
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90
pF1KB8 ---------EAPTRAAPGELRSARGPLSSAP------EIVHEDLKMGSDGESDQASATSS
. : : . . .. : . . : .::::.:::::::::::::.:::
CCDS90 LHQYTGSFKKPPLRRPHSVIGGSLGSFMAMPRNGSRLDIVHENLKMGSDGESDQASGTSS
60 70 80 90 100 110
100 110 120 130 140 150
pF1KB8 DEVQSPVRVRMRNHPPRKISTEDINKRLSLPADIRLPEGYLEKLTLNSPIFDKPLSRRLR
::::::. : .::. :.:: ::.:::::::::::.:.:::::: .::: ::.:.::: :
CCDS90 DEVQSPTGVCLRNRIHRRISMEDLNKRLSLPADIRIPDGYLEKLQINSPPFDQPMSRRSR
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
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:.:::::::::.::::::.:::::::::::::.::::.::::::::::::::::::::::
CCDS90 RASLSEIGFGKMETYIKLEKLGEGTYATVYKGRSKLTENLVALKEIRLEHEEGAPCTAIR
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KB8 EVSLLKDLKHANIVTLHDIIHTEKSLTLVFEYLDKDLKQYLDDCGNIINMHNVKLFLFQL
:::::::::::::::::::.::.:::::::::::::::::.::::::..::::::::.:.
CCDS90 EVSLLKDLKHANIVTLHDIVHTDKSLTLVFEYLDKDLKQYMDDCGNIMSMHNVKLFLYQI
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
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:::::::::.::::::::::::::::.:::::::::::::::.:::::::::::::::::
CCDS90 LRGLAYCHRRKVLHRDLKPQNLLINEKGELKLADFGLARAKSVPTKTYSNEVVTLWYRPP
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KB8 DILLGSTDYSTQIDMWGVGCIFYEMATGRPLFPGSTVEEQLHFIFRILGTPTEETWPGIL
:.::::..::::::::::::::.:::.:::::::::::..::.:::.::::..::::::
CCDS90 DVLLGSSEYSTQIDMWGVGCIFFEMASGRPLFPGSTVEDELHLIFRLLGTPSQETWPGIS
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430 440 450
pF1KB8 SNEEFKTYNYPKYRAEALLSHAPRLDSDGADLLTKLLQFEGRNRISAEDAMKHPFFLSLG
::::::.::.:::. . :..:::::::.: .:.::.::.:...:.:::.:::: .: :::
CCDS90 SNEEFKNYNFPKYKPQPLINHAPRLDSEGIELITKFLQYESKKRVSAEEAMKHVYFRSLG
420 430 440 450 460 470
460 470 480 490
pF1KB8 ERIHKLPDTTSIFALKEIQLQKEASLRSSSMPDSGRPAFRVVDTEF
::: ::...:::.::::::::. ..:.::.:..:
CCDS90 PRIHALPESVSIFSLKEIQLQKDPGFRNSSYPETGHGKNRRQSMLF
480 490 500 510 520
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50 60 70 80 90
pF1KB8 GSDPGEAPTRAAPGELRSARGPLSSAPEIVHEDLKMGSDG-----ESDQASATSSDEVQ-
.:.:..: : : . : :.: :
CCDS44 RFSLSVPRTETIEESLAEFTEQFNQLHNRRNENLQLGPLGRDPPQECSTFSPTDSGEEPG
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pF1KB8 --SPVRVRMRNHPPRKISTEDINKRLSLPADIRLPEGYLEKLTLNSPIFDKPLSRRLRRV
:: .: . :..: ::..:::::: :::::. .:.:: ..:: . ::::: ::.
CCDS44 QLSPGVQFQRRQNQRRFSMEDVSKRLSLPMDIRLPQEFLQKLQMESPDLPKPLSRMSRRA
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:::.:::::::::.:::::::::::::.::.::::.::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SLSDIGFGKLETYVKLDKLGEGTYATVFKGRSKLTENLVALKEIRLEHEEGAPCTAIREV
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220 230 240 250 260 270
pF1KB8 SLLKDLKHANIVTLHDIIHTEKSLTLVFEYLDKDLKQYLDDCGNIINMHNVKLFLFQLLR
::::.:::::::::::.:::..::::::::::.::::::: :::...:::::.:.:::::
CCDS44 SLLKNLKHANIVTLHDLIHTDRSLTLVFEYLDSDLKQYLDHCGNLMSMHNVKIFMFQLLR
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280 290 300 310 320 330
pF1KB8 GLAYCHRQKVLHRDLKPQNLLINERGELKLADFGLARAKSIPTKTYSNEVVTLWYRPPDI
::::::..:.::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::.
CCDS44 GLAYCHHRKILHRDLKPQNLLINERGELKLADFGLARAKSVPTKTYSNEVVTLWYRPPDV
260 270 280 290 300 310
340 350 360 370 380 390
pF1KB8 LLGSTDYSTQIDMWGVGCIFYEMATGRPLFPGSTVEEQLHFIFRILGTPTEETWPGILSN
:::::.::: ::::::::: :::::::::::::::.:.::.:::.:::::::::::. .
CCDS44 LLGSTEYSTPIDMWGVGCIHYEMATGRPLFPGSTVKEELHLIFRLLGTPTEETWPGVTAF
320 330 340 350 360 370
400 410 420 430 440 450
pF1KB8 EEFKTYNYPKYRAEALLSHAPRLDSDGADLLTKLLQFEGRNRISAEDAMKHPFFLSLGER
::.::..: : . :..::::::.:: ::..:: .:...:.::: :..: .: :::::
CCDS44 SEFRTYSFPCYLPQPLINHAPRLDTDGIHLLSSLLLYESKSRMSAEAALSHSYFRSLGER
380 390 400 410 420 430
460 470 480 490
pF1KB8 IHKLPDTTSIFALKEIQLQKEASLRSSSMPDSGRPAFRVVDTEF
.:.: ::.:::.::::::::. . :. .. . ::
CCDS44 VHQLEDTASIFSLKEIQLQKDPGYRGLAFQQPGRGKNRRQSIF
440 450 460 470
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10 20 30 40 50
pF1KB8 MDRMKKIKRQLSMTLRGGRGIDKTNGA-PEQIGL-----DESGGGG--GSDPGEAPTR
:..::..::..:... . :... . ::.. .:. : : :: . .
CCDS14 MIMNKMKNFKRRFSLSVPRTETIEESLAEFTEQFNQLHNRRNENLQLGPLGRDPPQECST
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 AAPGELRSARGPLSSAPEIVHEDLKMGSDGESDQASATSSDEVQSPVRVRMRNHPPRKIS
.: . : :: . .. ... . . : .::.. .: . .. .. .
CCDS14 FSPTDSGEEPGQLSPGVQFQRRQNQRRFSMEV-RASGALPRQVAGCTHKGVHRRAAALQP
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 TEDINKRLSLPADIRLPEGYLEKLTLNSPIFDKPLSRRLRRVSLSEIGFGKLETYIKLDK
:..:::::: :::::. .:.:: ..:: . ::::: ::.:::.:::::::::.::::
CCDS14 DFDVSKRLSLPMDIRLPQEFLQKLQMESPDLPKPLSRMSRRASLSDIGFGKLETYVKLDK
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 LGEGTYATVYKGKSKLTDNLVALKEIRLEHEEGAPCTAIREVSLLKDLKHANIVTLHDII
:::::::::.::.::::.::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::.:
CCDS14 LGEGTYATVFKGRSKLTENLVALKEIRLEHEEGAPCTAIREVSLLKNLKHANIVTLHDLI
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 HTEKSLTLVFEYLDKDLKQYLDDCGNIINMHNVKLFLFQLLRGLAYCHRQKVLHRDLKPQ
::..::::::::::.::::::: :::...:::::.:.:::::::::::..:.::::::::
CCDS14 HTDRSLTLVFEYLDSDLKQYLDHCGNLMSMHNVKIFMFQLLRGLAYCHHRKILHRDLKPQ
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 NLLINERGELKLADFGLARAKSIPTKTYSNEVVTLWYRPPDILLGSTDYSTQIDMWGVGC
::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::.:::::.::: ::::::::
CCDS14 NLLINERGELKLADFGLARAKSVPTKTYSNEVVTLWYRPPDVLLGSTEYSTPIDMWGVGC
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB8 IFYEMATGRPLFPGSTVEEQLHFIFRILGTPTEETWPGILSNEEFKTYNYPKYRAEALLS
: :::::::::::::::.:.::.:::.:::::::::::. . ::.::..: : . :..
CCDS14 IHYEMATGRPLFPGSTVKEELHLIFRLLGTPTEETWPGVTAFSEFRTYSFPCYLPQPLIN
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB8 HAPRLDSDGADLLTKLLQFEGRNRISAEDAMKHPFFLSLGERIHKLPDTTSIFALKEIQL
::::::.:: ::..:: .:...:.::: :..: .: :::::.:.: ::.:::.::::::
CCDS14 HAPRLDTDGIHLLSSLLLYESKSRMSAEAALSHSYFRSLGERVHQLEDTASIFSLKEIQL
420 430 440 450 460 470
480 490
pF1KB8 QKEASLRSSSMPDSGRPAFRVVDTEF
::. . :. .. . ::
CCDS14 QKDPGYRGLAFQQPGRGKNRRQSIF
480 490 500
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130 140 150 160 170 180
pF1KB8 GYLEKLTLNSPIFDKPLSRRLRRVSLSEIGFGKLETYIKLDKLGEGTYATVYKGKSKLTD
::: ..: ::.:::::.::::::::::..
CCDS75 ACINFKTSSTGKESPKVRRHSSPSSPTSPKFGKADSYEKLEKLGEGSYATVYKGKSKVNG
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pF1KB8 NLVALKEIRLEHEEGAPCTAIREVSLLKDLKHANIVTLHDIIHTEKSLTLVFEYLDKDLK
.::::: :::..:::.: :::::.:::: ::::::: :::::::...:::::::. ::
CCDS75 KLVALKVIRLQEEEGTPFTAIREASLLKGLKHANIVLLHDIIHTKETLTLVFEYVHTDLC
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pF1KB8 QYLDDCGNIINMHNVKLFLFQLLRGLAYCHRQKVLHRDLKPQNLLINERGELKLADFGLA
::.: . .. :::::::::::::.: :.. .::::::::::::.. :::::::::::
CCDS75 QYMDKHPGGLHPDNVKLFLFQLLRGLSYIHQRYILHRDLKPQNLLISDTGELKLADFGLA
180 190 200 210 220 230
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 RAKSIPTKTYSNEVVTLWYRPPDILLGSTDYSTQIDMWGVGCIFYEMATGRPLFPG-STV
::::.:..:::::::::::::::.:::::.::: .::::::::: :: : ::: . .
CCDS75 RAKSVPSHTYSNEVVTLWYRPPDVLLGSTEYSTCLDMWGVGCIFVEMIQGVAAFPGMKDI
240 250 260 270 280 290
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 EEQLHFIFRILGTPTEETWPGILSNEEFKTYNYPKYRAEALLSHAPRLD--SDGADLLTK
..::. :: .::::.:.::::. : .:: . : .. : . .:. . . :: .:
CCDS75 QDQLERIFLVLGTPNEDTWPGVHSLPHFKPERFTLYSSKNLRQAWNKLSYVNHAEDLASK
300 310 320 330 340 350
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 LLQFEGRNRISAEDAMKHPFFLSLGERIHKLPDTTSIFALKEIQLQKEA--SLRSSSMPD
::: .::.::. :..: .: .: :. .: : .:::.. ...:: :: :.:.
CCDS75 LLQCSPKNRLSAQAALSHEYFSDLPPRLWELTDMSSIFTVPNVRLQPEAGESMRAFGKNN
360 370 380 390 400 410
490
pF1KB8 SGRPAFRVVDTEF
CCDS75 SYGKSLSNSKH
420
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130 140 150 160 170 180
pF1KB8 GYLEKLTLNSPIFDKPLSRRLRRVSLSEIGFGKLETYIKLDKLGEGTYATVYKGKSKLTD
::: ..: ::.:::::.::::::::::..
CCDS56 ACINFKTSSTGKESPKVRRHSSPSSPTSPKFGKADSYEKLEKLGEGSYATVYKGKSKVNG
90 100 110 120 130 140
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 NLVALKEIRLEHEEGAPCTAIREVSLLKDLKHANIVTLHDIIHTEKSLTLVFEYLDKDLK
.::::: :::..:::.: :::::.:::: ::::::: :::::::...:::::::. ::
CCDS56 KLVALKVIRLQEEEGTPFTAIREASLLKGLKHANIVLLHDIIHTKETLTLVFEYVHTDLC
150 160 170 180 190 200
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pF1KB8 QYLDDCGNIINMHNVKLFLFQLLRGLAYCHRQKVLHRDLKPQNLLINERGELKLADFGLA
::.: . .. :::::::::::::.: :.. .::::::::::::.. :::::::::::
CCDS56 QYMDKHPGGLHPDNVKLFLFQLLRGLSYIHQRYILHRDLKPQNLLISDTGELKLADFGLA
210 220 230 240 250 260
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 RAKSIPTKTYSNEVVTLWYRPPDILLGSTDYSTQIDMWGVGCIFYEMATGRPLFPG-STV
::::.:..:::::::::::::::.:::::.::: .::::::::: :: : ::: . .
CCDS56 RAKSVPSHTYSNEVVTLWYRPPDVLLGSTEYSTCLDMWGVGCIFVEMIQGVAAFPGMKDI
270 280 290 300 310 320
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 EEQLHFIFRILGTPTEETWPGILSNEEFKTYNYPKYRAEALLSHAPRLD--SDGADLLTK
..::. :: .::::.:.::::. : .:: . : .. : . .:. . . :: .:
CCDS56 QDQLERIFLVLGTPNEDTWPGVHSLPHFKPERFTLYSSKNLRQAWNKLSYVNHAEDLASK
330 340 350 360 370 380
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 LLQFEGRNRISAEDAMKHPFFLSLGERIHKLPDTTSIFALKEIQLQKEA--SLRSSSMPD
::: .::.::. :..: .: .: :. .: : .:::.. ...:: :: :.:.
CCDS56 LLQCSPKNRLSAQAALSHEYFSDLPPRLWELTDMSSIFTVPNVRLQPEAGESMRAFGKNN
390 400 410 420 430 440
490
pF1KB8 SGRPAFRVVDTEF
CCDS56 SYGKSLSNSKH
450
>>CCDS75626.1 CDK14 gene_id:5218|Hs108|chr7 (469 aa)
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pF1KB8 GYLEKLTLNSPIFDKPLSRRLRRVSLSEIGFGKLETYIKLDKLGEGTYATVYKGKSKLTD
::: ..: ::.:::::.::::::::::..
CCDS75 ACINFKTSSTGKESPKVRRHSSPSSPTSPKFGKADSYEKLEKLGEGSYATVYKGKSKVNG
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 NLVALKEIRLEHEEGAPCTAIREVSLLKDLKHANIVTLHDIIHTEKSLTLVFEYLDKDLK
.::::: :::..:::.: :::::.:::: ::::::: :::::::...:::::::. ::
CCDS75 KLVALKVIRLQEEEGTPFTAIREASLLKGLKHANIVLLHDIIHTKETLTLVFEYVHTDLC
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 QYLDDCGNIINMHNVKLFLFQLLRGLAYCHRQKVLHRDLKPQNLLINERGELKLADFGLA
::.: . .. :::::::::::::.: :.. .::::::::::::.. :::::::::::
CCDS75 QYMDKHPGGLHPDNVKLFLFQLLRGLSYIHQRYILHRDLKPQNLLISDTGELKLADFGLA
220 230 240 250 260 270
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pF1KB8 RAKSIPTKTYSNEVVTLWYRPPDILLGSTDYSTQIDMWGVGCIFYEMATGRPLFPG-STV
::::.:..:::::::::::::::.:::::.::: .::::::::: :: : ::: . .
CCDS75 RAKSVPSHTYSNEVVTLWYRPPDVLLGSTEYSTCLDMWGVGCIFVEMIQGVAAFPGMKDI
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pF1KB8 EEQLHFIFRILGTPTEETWPGILSNEEFKTYNYPKYRAEALLSHAPRLD--SDGADLLTK
..::. :: .::::.:.::::. : .:: . : .. : . .:. . . :: .:
CCDS75 QDQLERIFLVLGTPNEDTWPGVHSLPHFKPERFTLYSSKNLRQAWNKLSYVNHAEDLASK
340 350 360 370 380 390
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 LLQFEGRNRISAEDAMKHPFFLSLGERIHKLPDTTSIFALKEIQLQKEA--SLRSSSMPD
::: .::.::. :..: .: .: :. .: : .:::.. ...:: :: :.:.
CCDS75 LLQCSPKNRLSAQAALSHEYFSDLPPRLWELTDMSSIFTVPNVRLQPEAGESMRAFGKNN
400 410 420 430 440 450
490
pF1KB8 SGRPAFRVVDTEF
CCDS75 SYGKSLSNSKH
460
496 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 10:09:52 2016 done: Fri Nov 4 10:09:52 2016
Total Scan time: 3.050 Total Display time: 0.070
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]