Result of FASTA (ccds) for
pF1KB8180
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8180, 425 aa
1>>>pF1KB8180 425 - 425 aa - 425 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3975+/-0.000736; mu= 17.8851+/- 0.045
mean_var=109.2182+/-34.309, 0's: 0 Z-trim(110.9): 314 B-trim: 1329 in 2/50
Lambda= 0.122723
statistics sampled from 11306 (11948) to 11306 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.708), E-opt: 0.2 (0.367), width: 16
Scan time: 2.600
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS344.1 HCRTR1 gene_id:3061|Hs108|chr1 ( 425) 2860 517.2 1.2e-146
CCDS4956.1 HCRTR2 gene_id:3062|Hs108|chr6 ( 444) 1892 345.8 4.9e-95
CCDS53539.1 NPFFR1 gene_id:64106|Hs108|chr10 ( 430) 500 99.3 7.5e-21
CCDS3552.1 NPFFR2 gene_id:10886|Hs108|chr4 ( 420) 490 97.5 2.5e-20
CCDS47072.1 NPFFR2 gene_id:10886|Hs108|chr4 ( 423) 490 97.5 2.5e-20
CCDS3551.1 NPFFR2 gene_id:10886|Hs108|chr4 ( 522) 490 97.6 2.9e-20
CCDS3719.1 QRFPR gene_id:84109|Hs108|chr4 ( 431) 447 89.9 5e-18
CCDS3791.1 NPY2R gene_id:4887|Hs108|chr4 ( 381) 430 86.9 3.7e-17
CCDS7606.1 PRLHR gene_id:2834|Hs108|chr10 ( 370) 427 86.3 5.3e-17
CCDS4393.1 DRD1 gene_id:1812|Hs108|chr5 ( 446) 413 83.9 3.3e-16
CCDS5196.1 NMBR gene_id:4829|Hs108|chr6 ( 390) 411 83.5 3.9e-16
CCDS1889.1 PROKR1 gene_id:10887|Hs108|chr2 ( 393) 403 82.1 1e-15
CCDS7586.1 ADRB1 gene_id:153|Hs108|chr10 ( 477) 404 82.4 1.1e-15
CCDS13079.1 ADRA1D gene_id:146|Hs108|chr20 ( 572) 403 82.3 1.3e-15
CCDS3438.1 CCKAR gene_id:886|Hs108|chr4 ( 428) 399 81.4 1.8e-15
CCDS8297.1 GPR83 gene_id:10888|Hs108|chr11 ( 423) 388 79.5 6.9e-15
CCDS13089.1 PROKR2 gene_id:128674|Hs108|chr20 ( 384) 386 79.1 8.3e-15
CCDS46345.1 TACR1 gene_id:6869|Hs108|chr2 ( 311) 379 77.7 1.7e-14
CCDS1958.1 TACR1 gene_id:6869|Hs108|chr2 ( 407) 379 77.9 2e-14
CCDS34089.1 NPY1R gene_id:4886|Hs108|chr4 ( 384) 378 77.7 2.2e-14
CCDS7761.1 CCKBR gene_id:887|Hs108|chr11 ( 447) 368 76.0 8.4e-14
CCDS3664.1 TACR3 gene_id:6870|Hs108|chr4 ( 465) 368 76.0 8.6e-14
CCDS7293.1 TACR2 gene_id:6865|Hs108|chr10 ( 398) 366 75.6 9.9e-14
CCDS3804.1 NPY5R gene_id:4889|Hs108|chr4 ( 445) 366 75.6 1.1e-13
CCDS4986.1 HTR1B gene_id:3351|Hs108|chr6 ( 390) 360 74.5 2e-13
CCDS12012.1 GALR1 gene_id:2587|Hs108|chr18 ( 349) 358 74.1 2.4e-13
CCDS6152.1 OPRK1 gene_id:4986|Hs108|chr8 ( 380) 356 73.8 3.3e-13
CCDS6099.1 ADRB3 gene_id:155|Hs108|chr8 ( 408) 356 73.8 3.4e-13
CCDS81459.1 1 gene_id:100996758|Hs108|chr10 ( 375) 351 72.9 6e-13
CCDS14174.1 GRPR gene_id:2925|Hs108|chrX ( 384) 351 72.9 6.1e-13
CCDS73100.1 NPY4R gene_id:5540|Hs108|chr10 ( 375) 345 71.8 1.3e-12
CCDS9405.1 HTR2A gene_id:3356|Hs108|chr13 ( 471) 346 72.1 1.3e-12
CCDS13556.1 OPRL1 gene_id:4987|Hs108|chr20 ( 370) 340 70.9 2.3e-12
CCDS11739.1 GALR2 gene_id:8811|Hs108|chr17 ( 387) 340 70.9 2.4e-12
CCDS12049.1 KISS1R gene_id:84634|Hs108|chr19 ( 398) 338 70.6 3.1e-12
CCDS14564.1 HTR2C gene_id:3358|Hs108|chrX ( 458) 334 70.0 5.5e-12
CCDS6311.1 TRHR gene_id:7201|Hs108|chr8 ( 398) 328 68.8 1e-11
CCDS329.1 OPRD1 gene_id:4985|Hs108|chr1 ( 372) 320 67.4 2.7e-11
CCDS10051.1 GPR176 gene_id:11245|Hs108|chr15 ( 515) 321 67.7 2.9e-11
CCDS73015.1 AVPR1B gene_id:553|Hs108|chr1 ( 424) 319 67.3 3.3e-11
CCDS3405.1 DRD5 gene_id:1816|Hs108|chr4 ( 477) 318 67.2 4e-11
CCDS9666.1 SSTR1 gene_id:6751|Hs108|chr14 ( 391) 316 66.7 4.5e-11
CCDS9414.1 MLNR gene_id:2862|Hs108|chr13 ( 412) 313 66.2 6.8e-11
>>CCDS344.1 HCRTR1 gene_id:3061|Hs108|chr1 (425 aa)
initn: 2860 init1: 2860 opt: 2860 Z-score: 2746.1 bits: 517.2 E(32554): 1.2e-146
Smith-Waterman score: 2860; 100.0% identity (100.0% similar) in 425 aa overlap (1-425:1-425)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MEPSATPGAQMGVPPGSREPSPVPPDYEDEFLRYLWRDYLYPKQYEWVLIAAYVAVFVVA
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CCDS34 MEPSATPGAQMGVPPGSREPSPVPPDYEDEFLRYLWRDYLYPKQYEWVLIAAYVAVFVVA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 LVGNTLVCLAVWRNHHMRTVTNYFIVNLSLADVLVTAICLPASLLVDITESWLFGHALCK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LVGNTLVCLAVWRNHHMRTVTNYFIVNLSLADVLVTAICLPASLLVDITESWLFGHALCK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 VIPYLQAVSVSVAVLTLSFIALDRWYAICHPLLFKSTARRARGSILGIWAVSLAIMVPQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 VIPYLQAVSVSVAVLTLSFIALDRWYAICHPLLFKSTARRARGSILGIWAVSLAIMVPQA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 AVMECSSVLPELANRTRLFSVCDERWADDLYPKIYHSCFFIVTYLAPLGLMAMAYFQIFR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 AVMECSSVLPELANRTRLFSVCDERWADDLYPKIYHSCFFIVTYLAPLGLMAMAYFQIFR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 KLWGRQIPGTTSALVRNWKRPSDQLGDLEQGLSGEPQPRARAFLAEVKQMRARRKTAKML
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 KLWGRQIPGTTSALVRNWKRPSDQLGDLEQGLSGEPQPRARAFLAEVKQMRARRKTAKML
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 MVVLLVFALCYLPISVLNVLKRVFGMFRQASDREAVYACFTFSHWLVYANSAANPIIYNF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MVVLLVFALCYLPISVLNVLKRVFGMFRQASDREAVYACFTFSHWLVYANSAANPIIYNF
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 LSGKFREQFKAAFSCCLPGLGPCGSLKAPSPRSSASHKSLSLQSRCSISKISEHVVLTSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LSGKFREQFKAAFSCCLPGLGPCGSLKAPSPRSSASHKSLSLQSRCSISKISEHVVLTSV
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 TTVLP
:::::
CCDS34 TTVLP
>>CCDS4956.1 HCRTR2 gene_id:3062|Hs108|chr6 (444 aa)
initn: 1853 init1: 1261 opt: 1892 Z-score: 1819.6 bits: 345.8 E(32554): 4.9e-95
Smith-Waterman score: 1892; 69.2% identity (85.6% similar) in 416 aa overlap (17-425:24-433)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MEPSATPGAQMGVPPGSREPSPVPPDYEDE-FLRYLWRDYLYPKQYEWVLIAA
..:: : ::.:: :::::::.::.::.:::::::.
CCDS49 MSGTKLEDSPPCRNWSSASELNETQEPFLNPTDYDDEEFLRYLWREYLHPKEYEWVLIAG
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 YVAVFVVALVGNTLVCLAVWRNHHMRTVTNYFIVNLSLADVLVTAICLPASLLVDITESW
:. ::::::.::.:::.:::.::::::::::::::::::::::: ::::.:.:::::.:
CCDS49 YIIVFVVALIGNVLVCVAVWKNHHMRTVTNYFIVNLSLADVLVTITCLPATLVVDITETW
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 LFGHALCKVIPYLQAVSVSVAVLTLSFIALDRWYAICHPLLFKSTARRARGSILGIWAVS
.::..:::::::::.:::::.::::: :::::::::::::.:::::.:::.::. :: ::
CCDS49 FFGQSLCKVIPYLQTVSVSVSVLTLSCIALDRWYAICHPLMFKSTAKRARNSIVIIWIVS
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 LAIMVPQAAVMECSSVLPELANRTRLFSVCDERWADDLYPKIYHSCFFIVTYLAPLGLMA
::.::: :::::.:.: :::.: ::.::::::. ..:::.:: :::.:::.::: ::.
CCDS49 CIIMIPQAIVMECSTVFPGLANKTTLFTVCDERWGGEIYPKMYHICFFLVTYMAPLCLMV
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280
pF1KB8 MAYFQIFRKLWGRQIPGTTSALVRNWK--RPSDQLGDLEQGLSGEP-QPRARAFLAEVKQ
.::.::::::: ::::::.:.. :.:: .: .: .: :.: . : : ::.::
CCDS49 LAYLQIFRKLWCRQIPGTSSVVQRKWKPLQPVSQ----PRG-PGQPTKSRMSAVAAEIKQ
250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB8 MRARRKTAKMLMVVLLVFALCYLPISVLNVLKRVFGMFRQASDREAVYACFTFSHWLVYA
.:::::::.:::.::::::.::::::.::::::::::: .. :::.::: ::::::::::
CCDS49 IRARRKTARMLMIVLLVFAICYLPISILNVLKRVFGMFAHTEDRETVYAWFTFSHWLVYA
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KB8 NSAANPIIYNFLSGKFREQFKAAFSCCLPGLGPCGSLKAPSPRSSA-SHKSLSLQSRC--
::::::::::::::::::.:::::::: :. . :.:. :.:::. :
CCDS49 NSAANPIIYNFLSGKFREEFKAAFSCCCLGVHHRQEDRLTRGRTSTESRKSLTTQISNFD
360 370 380 390 400 410
410 420
pF1KB8 SISKISEHVVLTSVTTVLP
.:::.::.:::::..: ::
CCDS49 NISKLSEQVVLTSIST-LPAANGAGPLQNW
420 430 440
>>CCDS53539.1 NPFFR1 gene_id:64106|Hs108|chr10 (430 aa)
initn: 707 init1: 396 opt: 500 Z-score: 487.8 bits: 99.3 E(32554): 7.5e-21
Smith-Waterman score: 650; 33.9% identity (60.3% similar) in 401 aa overlap (2-398:4-357)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MEPSATPGAQMGVPPGSREPSPVPPDYEDEFLRYLWRDYLYPKQYEWVLIAAYVAVFV
::: :... . .. . . . : . : : : . . ..:.::. .:.
CCDS53 MEGEPSQPPNSSWPLSQNGTN-TEATPATNLTFSSY----YQHTSPVAAMFIVAYALIFL
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 VALVGNTLVCLAVWRNHHMRTVTNYFIVNLSLADVLVTAICLPASLLVDITESWLFGHAL
. .:::::::. : .:.::.::::.::.::...:.:: .:.:..:. .. .: : .:
CCDS53 LCMVGNTLVCFIVLKNRHMHTVTNMFILNLAVSDLLVGIFCMPTTLVDNLITGWPFDNAT
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 CKVIPYLQAVSVSVAVLTLSFIALDRWYAICHPLLFKSTARRARGSILGIWAVSLAIMVP
::. .:..:::..:.:: ::..:. : ::. : : :.: .: :::..: :: :
CCDS53 CKMSGLVQGMSVSASVFTLVAIAVERFRCIVHPFREKLTLRKALVTIAVIWALALLIMCP
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 QAAVM----ECSSVLPELANRTRLFSVCDERWADDLYPKIYHSCFFIVTYLAPLGLMAMA
.:... : . . ::. . : : : . . ..: . .: :::::.:...
CCDS53 SAVTLTVTREEHHFMVDARNRSYPLYSCWEAWPEKGMRRVYTTVLFSHIYLAPLALIVVM
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 YFQIFRKLWGRQIPGTTSALVRNWKRPSDQLGDLEQGLSGEPQPRARAFLAEVKQMRARR
: .: ::: : :: :. : : . .::: : :
CCDS53 YARIARKL--CQAPG-----------PAP--GGEEAA-----DPRAS---------RRRA
240 250 260
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 KTAKMLMVVLLVFALCYLPISVLNVLKRVFGMFRQASDREAVYACFTFSHWLVYANSAAN
....::..: : :.: .::. .: .: .:.. . . .. : :.:::.. ::.::
CCDS53 RVVHMLVMVALFFTLSWLPLWALLLLID-YGQLSAPQLHLVTVYAFPFAHWLAFFNSSAN
270 280 290 300 310 320
360 370 380 390 400 410
pF1KB8 PIIYNFLSGKFREQFKAAFSCCLPGLGPCGSLKAPSPRSSASHKSLSLQSRCSISKISEH
::::.... .::. :.::: : : :: :.:::
CCDS53 PIIYGYFNENFRRGFQAAFRARL-----C-------PRPSGSHKEAYSERPGGLLHRRVF
330 340 350 360 370
420
pF1KB8 VVLTSVTTVLP
CCDS53 VVVRPSDSGLPSESGPSSGAPRPGRLPLRNGRVAHHGLPREGPGCSHLPLTIPAWDI
380 390 400 410 420 430
>>CCDS3552.1 NPFFR2 gene_id:10886|Hs108|chr4 (420 aa)
initn: 638 init1: 402 opt: 490 Z-score: 478.4 bits: 97.5 E(32554): 2.5e-20
Smith-Waterman score: 618; 33.2% identity (60.3% similar) in 355 aa overlap (27-373:27-348)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MEPSATPGAQMGVPPGSREPSPVPPDYEDEFLRYLWRDYLYPKQYEWVLIAAYVAVFVVA
: : . :. ::. : ..: .: .: .
CCDS35 MNEKWDTNSSENWHPIWNVNDTKHHLYSDINITYV-NYYLHQPQVAAIFIISYFLIFFLC
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 LVGNTLVCLAVWRNHHMRTVTNYFIVNLSLADVLVTAICLPASLLVDITESWLFGHALCK
..:::.::. : ::.::.:::: ::.::...:.:: .:.: .:: .: .: ::...::
CCDS35 MMGNTVVCFIVMRNKHMHTVTNLFILNLAISDLLVGIFCMPITLLDNIIAGWPFGNTMCK
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 VIPYLQAVSVSVAVLTLSFIALDRWYAICHPLLFKSTARRARGSILGIWAVSLAIMVPQA
. .:..::...:.:: ::.::. . .:. : : . : :. ::.....:: :.:
CCDS35 ISGLVQGISVAASVFTLVAIAVDRFQCVVYPFKPKLTIKTAFVIIMIIWVLAITIMSPSA
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
pF1KB8 AVMECSSVLPELANRTRLFSV--------CDERWADDLYPKIYHSCFFIVTYLAPLGLMA
.... : : :.:: : : : : .. . ::: . .: :::::.:..
CCDS35 VMLH---VQEEKYYRVRLNSQNKTSPVYWCREDWPNQEMRKIYTTVLFANIYLAPLSLIV
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 MAYFQIFRKLWGRQIPGTTSALVRNWKRPSDQLGDLEQGLSGEPQPRARAFLAEVKQMRA
. : .: .:. .: : ..:. : :
CCDS35 IMYGRIGISLFRAAVPHTGRKNQEQWHVVS----------------------------RK
240 250 260
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 RRKTAKMLMVVLLVFALCYLPISVLNVLKRVFGMFRQASDREAVYACFTFSHWLVYANSA
..: :::..: :.: : .::. .: .:. . . . .: . :.:::...::.
CCDS35 KQKIIKMLLIVALLFILSWLPLWTLMMLSDYADLSPNELQIINIYI-YPFAHWLAFGNSS
270 280 290 300 310 320
360 370 380 390 400 410
pF1KB8 ANPIIYNFLSGKFREQFKAAFSCCLPGLGPCGSLKAPSPRSSASHKSLSLQSRCSISKIS
.:::::.:.. .::. :. ::
CCDS35 VNPIIYGFFNENFRRGFQEAFQLQLCQKRAKPMEAYALKAKSHVLINTSNQLVQESTFQN
330 340 350 360 370 380
>>CCDS47072.1 NPFFR2 gene_id:10886|Hs108|chr4 (423 aa)
initn: 638 init1: 402 opt: 490 Z-score: 478.3 bits: 97.5 E(32554): 2.5e-20
Smith-Waterman score: 618; 33.2% identity (60.3% similar) in 355 aa overlap (27-373:30-351)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MEPSATPGAQMGVPPGSREPSPVPPDYEDEFLRYLWRDYLYPKQYEWVLIAAYVAVF
: : . :. ::. : ..: .: .:
CCDS47 MFIMNEKWDTNSSENWHPIWNVNDTKHHLYSDINITYV-NYYLHQPQVAAIFIISYFLIF
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 VVALVGNTLVCLAVWRNHHMRTVTNYFIVNLSLADVLVTAICLPASLLVDITESWLFGHA
. ..:::.::. : ::.::.:::: ::.::...:.:: .:.: .:: .: .: ::..
CCDS47 FLCMMGNTVVCFIVMRNKHMHTVTNLFILNLAISDLLVGIFCMPITLLDNIIAGWPFGNT
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 LCKVIPYLQAVSVSVAVLTLSFIALDRWYAICHPLLFKSTARRARGSILGIWAVSLAIMV
.::. .:..::...:.:: ::.::. . .:. : : . : :. ::.....::
CCDS47 MCKISGLVQGISVAASVFTLVAIAVDRFQCVVYPFKPKLTIKTAFVIIMIIWVLAITIMS
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220
pF1KB8 PQAAVMECSSVLPELANRTRLFSV--------CDERWADDLYPKIYHSCFFIVTYLAPLG
:.:.... : : :.:: : : : : .. . ::: . .: :::::.
CCDS47 PSAVMLH---VQEEKYYRVRLNSQNKTSPVYWCREDWPNQEMRKIYTTVLFANIYLAPLS
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB8 LMAMAYFQIFRKLWGRQIPGTTSALVRNWKRPSDQLGDLEQGLSGEPQPRARAFLAEVKQ
:... : .: .:. .: : ..:. :
CCDS47 LIVIMYGRIGISLFRAAVPHTGRKNQEQWHVVS---------------------------
240 250 260
290 300 310 320 330 340
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: ..: :::..: :.: : .::. .: .:. . . . .: . :.:::...
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270 280 290 300 310 320
350 360 370 380 390 400
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::..:::::.:.. .::. :. ::
CCDS47 NSSVNPIIYGFFNENFRRGFQEAFQLQLCQKRAKPMEAYALKAKSHVLINTSNQLVQEST
330 340 350 360 370 380
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: . ..:::.::. : ::.::.:::: ::.::...:.:: .:.: .:: .: .: ::.
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:.:.... : : :.:: : : : : .. . ::: . .: :::::
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CCDS35 --RKKQKIIKMLLIVALLFILSWLPLWTLMMLSDYADLSPNELQIINIYI-YPFAHWLAF
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CCDS35 GNSSVNPIIYGFFNENFRRGFQEAFQLQLCQKRAKPMEAYALKAKSHVLINTSNQLVQES
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. :.. : .. .. : :.:.. .. ::: . .... .: :: .: . : .:
CCDS37 MWHVQQLEIKYDFLYEKEHI--CCLEEWTSPVHQKIYTTFILVILFLLPLMVMLILYSKI
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.:: . :: .: :.. . . :. :.... ..: :
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CCDS37 YAFMNENFKKNVLSAVCYCIVNKTFSPAQRHGNSGITMMRKKAKFSLRENPVEETKGEAF
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: .: .::...:: :...:.:...::. ::::: : . : : ..: :.:.
CCDS37 GEWKMGPVLCHLVPYAQGLAVQVSTITLTVIALDRHRCIVYHLESK-ISKRISFLIIGLA
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CCDS37 WGISALLASPLAIFREYSLIEIIPDFE-----IVACTEKWPGEEKSIYGTVYSLSSLLIL
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CCDS37 -ANDHYHQRRQKTTKMLVCVVVVFAVSWLP---LHAFQLAVDIDSQVLDLKEYKLIFTVF
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CCDS37 HIIAMCSTFANPLLYGWMNSNYRKAFLSAFRCEQRLDAIHSEVSVTFKAKKNLEVRKNSG
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CCDS37 PNDSFTEATNV
380
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CCDS76 VRRLHNVTNFLIGNLALSDVLMCTACVPLTLAYAFEPRGWVFGGGLCHLVFFLQPVTVYV
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CCDS76 SVFTLTTIAVDRYVVLVHPLRRRISLRLSAYAVLAIWALSAVLALPAAVHTYHVELKP--
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. .:: :.: :... . .: ...:::: :: .. ..: .. :: .: .:: .
CCDS76 -HDVRL---CEEFWGSQERQRQLYAWGLLLVTYLLPLLVILLSYVRVSVKLRNRVVPGCV
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CCDS76 TQSQADWDR-------------------AR-----------RRRTFCLLVVIVVVFAVCW
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CCDS76 LLVAWPRKIAPHGQNMTVSVVI
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CCDS43 MRTLNTSAMDGTGLVVERDFSVRILTACFLSLLILSTLLGNTLVCAAVIRFRH
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CCDS43 LRSKVTNFFVISLAVSDLLVAVLVMPWKAVAEIAGFWPFG-SFCNIWVAFDIMCSTASIL
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CCDS43 NLCVISVDRYWAISSPFRYERKMTPKAAFILISVAWTLSVLISFIPVQLSWHKAKPTSPS
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CCDS43 AALERAAVHAKNC-----QTTTGNGKPVECSQPESSFKMSFKRETKVLKTLSVIMGVFVC
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.. ..:
CCDS43 STLLGCYRLCPATNNAIETVSINNNGAAMFSSHHEPRGSISKECNLVYLIPHAVGSSEDL
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425 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]