Result of FASTA (ccds) for
pF1KB8262
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8262, 191 aa
1>>>pF1KB8262 191 - 191 aa - 191 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7617+/-0.000909; mu= 11.1566+/- 0.055
mean_var=84.1915+/-16.740, 0's: 0 Z-trim(107.6): 70 B-trim: 35 in 1/50
Lambda= 0.139778
statistics sampled from 9607 (9677) to 9607 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.695), E-opt: 0.2 (0.297), width: 16
Scan time: 1.860
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS10360.1 CIB1 gene_id:10519|Hs108|chr15 ( 191) 1230 257.4 3.8e-69
CCDS73781.1 CIB1 gene_id:10519|Hs108|chr15 ( 231) 1063 223.8 6.1e-59
CCDS33160.1 CIB4 gene_id:130106|Hs108|chr2 ( 185) 489 108.0 3.6e-24
CCDS12340.1 CIB3 gene_id:117286|Hs108|chr19 ( 187) 458 101.7 2.7e-22
CCDS10296.1 CIB2 gene_id:10518|Hs108|chr15 ( 187) 447 99.5 1.3e-21
CCDS61722.1 CIB2 gene_id:10518|Hs108|chr15 ( 144) 357 81.3 3e-16
CCDS74305.1 CIB3 gene_id:117286|Hs108|chr19 ( 138) 323 74.4 3.4e-14
CCDS61723.1 CIB2 gene_id:10518|Hs108|chr15 ( 138) 315 72.8 1e-13
>>CCDS10360.1 CIB1 gene_id:10519|Hs108|chr15 (191 aa)
initn: 1230 init1: 1230 opt: 1230 Z-score: 1354.8 bits: 257.4 E(32554): 3.8e-69
Smith-Waterman score: 1230; 100.0% identity (100.0% similar) in 191 aa overlap (1-191:1-191)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MGGSGSRLSKELLAEYQDLTFLTKQEILLAHRRFCELLPQEQRSVESSLRAQVPFEQILS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MGGSGSRLSKELLAEYQDLTFLTKQEILLAHRRFCELLPQEQRSVESSLRAQVPFEQILS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 LPELKANPFKERICRVFSTSPAKDSLSFEDFLDLLSVFSDTATPDIKSHYAFRIFDFDDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LPELKANPFKERICRVFSTSPAKDSLSFEDFLDLLSVFSDTATPDIKSHYAFRIFDFDDD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 GTLNREDLSRLVNCLTGEGEDTRLSASEMKQLIDNILEESDIDRDGTINLSEFQHVISRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 GTLNREDLSRLVNCLTGEGEDTRLSASEMKQLIDNILEESDIDRDGTINLSEFQHVISRS
130 140 150 160 170 180
190
pF1KB8 PDFASSFKIVL
:::::::::::
CCDS10 PDFASSFKIVL
190
>>CCDS73781.1 CIB1 gene_id:10519|Hs108|chr15 (231 aa)
initn: 1217 init1: 1054 opt: 1063 Z-score: 1171.6 bits: 223.8 E(32554): 6.1e-59
Smith-Waterman score: 1087; 82.1% identity (82.1% similar) in 223 aa overlap (9-191:9-231)
10 20
pF1KB8 MGGSGSRLSKELLAEYQDLTFLTKQEILL-------------------------------
:::::::::::::::::::::
CCDS73 MGGSGSRLSKELLAEYQDLTFLTKQEILLSVYVVLAPHLVDNEQQARSGNEHTGRPIAEN
10 20 30 40 50 60
30 40 50 60 70 80
pF1KB8 ---------AHRRFCELLPQEQRSVESSLRAQVPFEQILSLPELKANPFKERICRVFSTS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 TDSSPLSTRAHRRFCELLPQEQRSVESSLRAQVPFEQILSLPELKANPFKERICRVFSTS
70 80 90 100 110 120
90 100 110 120 130 140
pF1KB8 PAKDSLSFEDFLDLLSVFSDTATPDIKSHYAFRIFDFDDDGTLNREDLSRLVNCLTGEGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 PAKDSLSFEDFLDLLSVFSDTATPDIKSHYAFRIFDFDDDGTLNREDLSRLVNCLTGEGE
130 140 150 160 170 180
150 160 170 180 190
pF1KB8 DTRLSASEMKQLIDNILEESDIDRDGTINLSEFQHVISRSPDFASSFKIVL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 DTRLSASEMKQLIDNILEESDIDRDGTINLSEFQHVISRSPDFASSFKIVL
190 200 210 220 230
>>CCDS33160.1 CIB4 gene_id:130106|Hs108|chr2 (185 aa)
initn: 489 init1: 175 opt: 489 Z-score: 547.5 bits: 108.0 E(32554): 3.6e-24
Smith-Waterman score: 489; 44.7% identity (73.2% similar) in 179 aa overlap (11-189:12-180)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MGGSGSRLSKELLAEYQDLTFLTKQEILLAHRRFCELLPQEQRSVESSLRAQVPFEQIL
: : ::: :::::..::: : : .: : . :..: ..:.
CCDS33 MGQCLRYQMHWEDLEEYQALTFLTRNEILCIHDTFLKLCPPGKYYKEATLT----MDQVS
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 SLPELKANPFKERICRVFSTSPAKDSLSFEDFLDLLSVFSDTATPDIKSHYAFRIFDFDD
::: :..:::..::::::: : .:::: : . ::::. : :..: .:::::.::..
CCDS33 SLPALRVNPFRDRICRVFS---HKGMFSFEDVLGMASVFSEQACPSLKIEYAFRIYDFNE
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 DGTLNREDLSRLVNCLTGEGEDTRLSASEMKQLIDNILEESDIDRDGTINLSEFQHVISR
.: ...:::.:.. : . ..: .: . . .: ...: :::.: :. ...:::.:....
CCDS33 NGFIDEEDLQRIILRLLN-SDD--MSEDLLMDLTNHVLSESDLDNDNMLSFSEFEHAMAK
120 130 140 150 160 170
180 190
pF1KB8 SPDFASSFKIVL
:::: .::.:
CCDS33 SPDFMNSFRIHFWGC
180
>>CCDS12340.1 CIB3 gene_id:117286|Hs108|chr19 (187 aa)
initn: 314 init1: 183 opt: 458 Z-score: 513.6 bits: 101.7 E(32554): 2.7e-22
Smith-Waterman score: 458; 40.0% identity (71.1% similar) in 190 aa overlap (1-189:1-185)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MGGSGSRLSKELLAEYQDLTFLTKQEILLAHRRFCELLPQE-QRSVESSLRAQVPFEQIL
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CCDS12 MGNKQTVFTHEQLEAYQDCTFFTRKEIMRLFYRYQDLAPQLVPLDYTTCPDVKVPYELIG
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 SLPELKANPFKERICRVFSTSPAKDSLSFEDFLDLLSVFSDTATPDIKSHYAFRIFDFDD
:.:::: :::..:: .::: . . .....:::..::.:. : :.:..:::.:.::..
CCDS12 SMPELKDNPFRQRIAQVFSED-GDGHMTLDNFLDMFSVMSEMAPRDLKAYYAFKIYDFNN
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 DGTLNREDLSRLVNCLTGEGEDTRLSASEMKQLIDNILEESDIDRDGTINLSEFQHVISR
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CCDS12 DDYICAWDLEQTVTKLTRGG----LSAEEVSLVCEKVLDEADGDHDGRLSLEDFQNMILR
120 130 140 150 160 170
180 190
pF1KB8 SPDFASSFKIVL
.::: :.:.:
CCDS12 APDFLSTFHIRI
180
>>CCDS10296.1 CIB2 gene_id:10518|Hs108|chr15 (187 aa)
initn: 284 init1: 185 opt: 447 Z-score: 501.6 bits: 99.5 E(32554): 1.3e-21
Smith-Waterman score: 447; 37.9% identity (73.7% similar) in 190 aa overlap (1-189:1-185)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MGGSGSRLSKELLAEYQDLTFLTKQEILLAHRRFCELLPQE-QRSVESSLRAQVPFEQIL
::.. . ...: : .::: ::..:..:: : :: :: :. . ..: ..::. :.
CCDS10 MGNKQTIFTEEQLDNYQDCTFFNKKDILKLHSRFYELAPNLVPMDYRKSPIVHVPMSLII
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 SLPELKANPFKERICRVFSTSPAKDSLSFEDFLDLLSVFSDTATPDIKSHYAFRIFDFDD
..:::. ::::::: .:: . .. .:.:.::.:..::. ..: ..:..:::.:.::.
CCDS10 QMPELRENPFKERIVAAFSED-GEGNLTFNDFVDMFSVLCESAPRELKANYAFKIYDFNT
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 DGTLNREDLSRLVNCLTGEGEDTRLSASEMKQLIDNILEESDIDRDGTINLSEFQHVISR
:. . .::: . :: ..:. :. . :...::.:.: :: .....:. .:..
CCDS10 DNFICKEDLELTLARLT----KSELDEEEVVLVCDKVIEEADLDGDGKLGFADFEDMIAK
120 130 140 150 160 170
180 190
pF1KB8 SPDFASSFKIVL
.::: :.:.:
CCDS10 APDFLSTFHIRI
180
>>CCDS61722.1 CIB2 gene_id:10518|Hs108|chr15 (144 aa)
initn: 341 init1: 151 opt: 357 Z-score: 405.2 bits: 81.3 E(32554): 3e-16
Smith-Waterman score: 357; 38.4% identity (76.1% similar) in 138 aa overlap (52-189:10-142)
30 40 50 60 70 80
pF1KB8 LTKQEILLAHRRFCELLPQEQRSVESSLRAQVPFEQILSLPELKANPFKERICRVFSTSP
.::. :...:::. ::::::: .:: .
CCDS61 MDYRKSPIVHVPMSLIIQMPELRENPFKERIVAAFSED-
10 20 30
90 100 110 120 130 140
pF1KB8 AKDSLSFEDFLDLLSVFSDTATPDIKSHYAFRIFDFDDDGTLNREDLSRLVNCLTGEGED
.. .:.:.::.:..::. ..: ..:..:::.:.::. :. . .::: . ::
CCDS61 GEGNLTFNDFVDMFSVLCESAPRELKANYAFKIYDFNTDNFICKEDLELTLARLT----K
40 50 60 70 80 90
150 160 170 180 190
pF1KB8 TRLSASEMKQLIDNILEESDIDRDGTINLSEFQHVISRSPDFASSFKIVL
..:. :. . :...::.:.: :: .....:. .:...::: :.:.:
CCDS61 SELDEEEVVLVCDKVIEEADLDGDGKLGFADFEDMIAKAPDFLSTFHIRI
100 110 120 130 140
>>CCDS74305.1 CIB3 gene_id:117286|Hs108|chr19 (138 aa)
initn: 327 init1: 148 opt: 323 Z-score: 368.4 bits: 74.4 E(32554): 3.4e-14
Smith-Waterman score: 323; 40.3% identity (72.9% similar) in 129 aa overlap (61-189:13-136)
40 50 60 70 80 90
pF1KB8 HRRFCELLPQEQRSVESSLRAQVPFEQILSLPELKANPFKERICRVFSTSPAKDSLSFED
: . :::..:: .::: . . .....
CCDS74 MGNKQTVFTHEQLEAYQDNPFRQRIAQVFSED-GDGHMTLDN
10 20 30 40
100 110 120 130 140 150
pF1KB8 FLDLLSVFSDTATPDIKSHYAFRIFDFDDDGTLNREDLSRLVNCLTGEGEDTRLSASEMK
:::..::.:. : :.:..:::.:.::..: . :: . :. :: : ::: :..
CCDS74 FLDMFSVMSEMAPRDLKAYYAFKIYDFNNDDYICAWDLEQTVTKLTRGG----LSAEEVS
50 60 70 80 90
160 170 180 190
pF1KB8 QLIDNILEESDIDRDGTINLSEFQHVISRSPDFASSFKIVL
. ...:.:.: :.:: ..: .::..: :.::: :.:.:
CCDS74 LVCEKVLDEADGDHDGRLSLEDFQNMILRAPDFLSTFHIRI
100 110 120 130
>>CCDS61723.1 CIB2 gene_id:10518|Hs108|chr15 (138 aa)
initn: 299 init1: 151 opt: 315 Z-score: 359.7 bits: 72.8 E(32554): 1e-13
Smith-Waterman score: 315; 37.2% identity (74.4% similar) in 129 aa overlap (61-189:13-136)
40 50 60 70 80 90
pF1KB8 HRRFCELLPQEQRSVESSLRAQVPFEQILSLPELKANPFKERICRVFSTSPAKDSLSFED
: . . ::::::: .:: . .. .:.:.:
CCDS61 MGNKQTIFTEEQLDNYQENPFKERIVAAFSED-GEGNLTFND
10 20 30 40
100 110 120 130 140 150
pF1KB8 FLDLLSVFSDTATPDIKSHYAFRIFDFDDDGTLNREDLSRLVNCLTGEGEDTRLSASEMK
:.:..::. ..: ..:..:::.:.::. :. . .::: . :: ..:. :.
CCDS61 FVDMFSVLCESAPRELKANYAFKIYDFNTDNFICKEDLELTLARLT----KSELDEEEVV
50 60 70 80 90
160 170 180 190
pF1KB8 QLIDNILEESDIDRDGTINLSEFQHVISRSPDFASSFKIVL
. :...::.:.: :: .....:. .:...::: :.:.:
CCDS61 LVCDKVIEEADLDGDGKLGFADFEDMIAKAPDFLSTFHIRI
100 110 120 130
191 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 11:07:46 2016 done: Fri Nov 4 11:07:47 2016
Total Scan time: 1.860 Total Display time: -0.020
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]