Result of FASTA (omim) for
pF1KB8278
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8278, 326 aa
1>>>pF1KB8278 326 - 326 aa - 326 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.5039+/-0.000343; mu= 7.9110+/- 0.022
mean_var=159.4018+/-32.618, 0's: 0 Z-trim(119.9): 63 B-trim: 1736 in 1/53
Lambda= 0.101585
statistics sampled from 34310 (34375) to 34310 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.75), E-opt: 0.2 (0.403), width: 16
Scan time: 8.150
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_005171 (OMIM: 164831) polycomb complex protein ( 326) 2210 335.2 1.1e-91
XP_005257699 (OMIM: 600346) PREDICTED: polycomb gr ( 344) 1376 213.0 7.3e-55
XP_005257697 (OMIM: 600346) PREDICTED: polycomb gr ( 344) 1376 213.0 7.3e-55
XP_005257698 (OMIM: 600346) PREDICTED: polycomb gr ( 344) 1376 213.0 7.3e-55
NP_009075 (OMIM: 600346) polycomb group RING finge ( 344) 1376 213.0 7.3e-55
XP_016880505 (OMIM: 600346) PREDICTED: polycomb gr ( 344) 1376 213.0 7.3e-55
NP_116062 (OMIM: 610231) polycomb group RING finge ( 259) 571 94.9 1.9e-19
NP_001011663 (OMIM: 607816) polycomb group RING fi ( 350) 482 82.0 2e-15
NP_115530 (OMIM: 607816) polycomb group RING finge ( 275) 296 54.6 2.7e-07
>>NP_005171 (OMIM: 164831) polycomb complex protein BMI- (326 aa)
initn: 2210 init1: 2210 opt: 2210 Z-score: 1766.9 bits: 335.2 E(85289): 1.1e-91
Smith-Waterman score: 2210; 100.0% identity (100.0% similar) in 326 aa overlap (1-326:1-326)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MHRTTRIKITELNPHLMCVLCGGYFIDATTIIECLHSFCKTCIVRYLETSKYCPICDVQV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 MHRTTRIKITELNPHLMCVLCGGYFIDATTIIECLHSFCKTCIVRYLETSKYCPICDVQV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 HKTRPLLNIRSDKTLQDIVYKLVPGLFKNEMKRRRDFYAAHPSADAANGSNEDRGEVADE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 HKTRPLLNIRSDKTLQDIVYKLVPGLFKNEMKRRRDFYAAHPSADAANGSNEDRGEVADE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 DKRIITDDEIISLSIEFFDQNRLDRKVNKDKEKSKEEVNDKRYLRCPAAMTVMHLRKFLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 DKRIITDDEIISLSIEFFDQNRLDRKVNKDKEKSKEEVNDKRYLRCPAAMTVMHLRKFLR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 SKMDIPNTFQIDVMYEEEPLKDYYTLMDIAYIYTWRRNGPLPLKYRVRPTCKRMKISHQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 SKMDIPNTFQIDVMYEEEPLKDYYTLMDIAYIYTWRRNGPLPLKYRVRPTCKRMKISHQR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 DGLTNAGELESDSGSDKANSPAGGIPSTSSCLPSPSTPVQSPHPQFPHISSTMNGTSNSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 DGLTNAGELESDSGSDKANSPAGGIPSTSSCLPSPSTPVQSPHPQFPHISSTMNGTSNSP
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KB8 SGNHQSSFANRPRKSSVNGSSATSSG
::::::::::::::::::::::::::
NP_005 SGNHQSSFANRPRKSSVNGSSATSSG
310 320
>>XP_005257699 (OMIM: 600346) PREDICTED: polycomb group (344 aa)
initn: 1403 init1: 829 opt: 1376 Z-score: 1106.0 bits: 213.0 E(85289): 7.3e-55
Smith-Waterman score: 1400; 63.2% identity (80.7% similar) in 342 aa overlap (1-320:1-338)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MHRTTRIKITELNPHLMCVLCGGYFIDATTIIECLHSFCKTCIVRYLETSKYCPICDVQV
::::::::::::::::::.::::::::::::.:::::::::::::::::.::::.:::::
XP_005 MHRTTRIKITELNPHLMCALCGGYFIDATTIVECLHSFCKTCIVRYLETNKYCPMCDVQV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 HKTRPLLNIRSDKTLQDIVYKLVPGLFKNEMKRRRDFYAAHPSADAANGSNEDRGEVADE
:::::::.::::::::::::::::::::.:::::::::::.: ... :::::::::: ..
XP_005 HKTRPLLSIRSDKTLQDIVYKLVPGLFKDEMKRRRDFYAAYPLTEVPNGSNEDRGEVLEQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KB8 DKRIITDDEIISLSIEFFD--QNRLDRK---VNKDKEKSKEEVNDKRYLRCPAAMTVMHL
.: ..::::.::::::.. ..: ..: : : .: : : :.::::::::::::
XP_005 EKGALSDDEIVSLSIEFYEGARDRDEKKGPLENGDGDKEKTGV---RFLRCPAAMTVMHL
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 RKFLRSKMDIPNTFQIDVMYEEEPLKDYYTLMDIAYIYTWRRNGPLPLKYRVRPTCKRMK
::::.:::.:. ....:.::.::::.::::::::::: :::::::::::::.:.:::.
XP_005 AKFLRNKMDVPSKYKVEVLYEDEPLKEYYTLMDIAYIYPWRRNGPLPLKYRVQPACKRLT
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280
pF1KB8 ISH---QRDGLTNAGELESDSGSDKANSPAGGIPSTSSCLPSPSTPVQ-SP--------H
.. .: ...: : .: :::: ::: .:.::: ::::.:: . :: :
XP_005 LATVPTPSEGTNTSGASECESVSDKAPSPAT-LPATSSSLPSPATPSHGSPSSHGPPATH
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320
pF1KB8 PQFPHISSTMNGTSNSPSGN-----HQSSFANRPRKSSVNGSSATSSG
: : :: .:.... .:. . : ..: :: .:::.
XP_005 PTSPTPPSTASGATTAANGGSLNCLQTPSSTSRGRKMTVNGAPVPPLT
300 310 320 330 340
>>XP_005257697 (OMIM: 600346) PREDICTED: polycomb group (344 aa)
initn: 1403 init1: 829 opt: 1376 Z-score: 1106.0 bits: 213.0 E(85289): 7.3e-55
Smith-Waterman score: 1400; 63.2% identity (80.7% similar) in 342 aa overlap (1-320:1-338)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MHRTTRIKITELNPHLMCVLCGGYFIDATTIIECLHSFCKTCIVRYLETSKYCPICDVQV
::::::::::::::::::.::::::::::::.:::::::::::::::::.::::.:::::
XP_005 MHRTTRIKITELNPHLMCALCGGYFIDATTIVECLHSFCKTCIVRYLETNKYCPMCDVQV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 HKTRPLLNIRSDKTLQDIVYKLVPGLFKNEMKRRRDFYAAHPSADAANGSNEDRGEVADE
:::::::.::::::::::::::::::::.:::::::::::.: ... :::::::::: ..
XP_005 HKTRPLLSIRSDKTLQDIVYKLVPGLFKDEMKRRRDFYAAYPLTEVPNGSNEDRGEVLEQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KB8 DKRIITDDEIISLSIEFFD--QNRLDRK---VNKDKEKSKEEVNDKRYLRCPAAMTVMHL
.: ..::::.::::::.. ..: ..: : : .: : : :.::::::::::::
XP_005 EKGALSDDEIVSLSIEFYEGARDRDEKKGPLENGDGDKEKTGV---RFLRCPAAMTVMHL
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 RKFLRSKMDIPNTFQIDVMYEEEPLKDYYTLMDIAYIYTWRRNGPLPLKYRVRPTCKRMK
::::.:::.:. ....:.::.::::.::::::::::: :::::::::::::.:.:::.
XP_005 AKFLRNKMDVPSKYKVEVLYEDEPLKEYYTLMDIAYIYPWRRNGPLPLKYRVQPACKRLT
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280
pF1KB8 ISH---QRDGLTNAGELESDSGSDKANSPAGGIPSTSSCLPSPSTPVQ-SP--------H
.. .: ...: : .: :::: ::: .:.::: ::::.:: . :: :
XP_005 LATVPTPSEGTNTSGASECESVSDKAPSPAT-LPATSSSLPSPATPSHGSPSSHGPPATH
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320
pF1KB8 PQFPHISSTMNGTSNSPSGN-----HQSSFANRPRKSSVNGSSATSSG
: : :: .:.... .:. . : ..: :: .:::.
XP_005 PTSPTPPSTASGATTAANGGSLNCLQTPSSTSRGRKMTVNGAPVPPLT
300 310 320 330 340
>>XP_005257698 (OMIM: 600346) PREDICTED: polycomb group (344 aa)
initn: 1403 init1: 829 opt: 1376 Z-score: 1106.0 bits: 213.0 E(85289): 7.3e-55
Smith-Waterman score: 1400; 63.2% identity (80.7% similar) in 342 aa overlap (1-320:1-338)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MHRTTRIKITELNPHLMCVLCGGYFIDATTIIECLHSFCKTCIVRYLETSKYCPICDVQV
::::::::::::::::::.::::::::::::.:::::::::::::::::.::::.:::::
XP_005 MHRTTRIKITELNPHLMCALCGGYFIDATTIVECLHSFCKTCIVRYLETNKYCPMCDVQV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 HKTRPLLNIRSDKTLQDIVYKLVPGLFKNEMKRRRDFYAAHPSADAANGSNEDRGEVADE
:::::::.::::::::::::::::::::.:::::::::::.: ... :::::::::: ..
XP_005 HKTRPLLSIRSDKTLQDIVYKLVPGLFKDEMKRRRDFYAAYPLTEVPNGSNEDRGEVLEQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KB8 DKRIITDDEIISLSIEFFD--QNRLDRK---VNKDKEKSKEEVNDKRYLRCPAAMTVMHL
.: ..::::.::::::.. ..: ..: : : .: : : :.::::::::::::
XP_005 EKGALSDDEIVSLSIEFYEGARDRDEKKGPLENGDGDKEKTGV---RFLRCPAAMTVMHL
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 RKFLRSKMDIPNTFQIDVMYEEEPLKDYYTLMDIAYIYTWRRNGPLPLKYRVRPTCKRMK
::::.:::.:. ....:.::.::::.::::::::::: :::::::::::::.:.:::.
XP_005 AKFLRNKMDVPSKYKVEVLYEDEPLKEYYTLMDIAYIYPWRRNGPLPLKYRVQPACKRLT
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280
pF1KB8 ISH---QRDGLTNAGELESDSGSDKANSPAGGIPSTSSCLPSPSTPVQ-SP--------H
.. .: ...: : .: :::: ::: .:.::: ::::.:: . :: :
XP_005 LATVPTPSEGTNTSGASECESVSDKAPSPAT-LPATSSSLPSPATPSHGSPSSHGPPATH
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320
pF1KB8 PQFPHISSTMNGTSNSPSGN-----HQSSFANRPRKSSVNGSSATSSG
: : :: .:.... .:. . : ..: :: .:::.
XP_005 PTSPTPPSTASGATTAANGGSLNCLQTPSSTSRGRKMTVNGAPVPPLT
300 310 320 330 340
>>NP_009075 (OMIM: 600346) polycomb group RING finger pr (344 aa)
initn: 1403 init1: 829 opt: 1376 Z-score: 1106.0 bits: 213.0 E(85289): 7.3e-55
Smith-Waterman score: 1400; 63.2% identity (80.7% similar) in 342 aa overlap (1-320:1-338)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MHRTTRIKITELNPHLMCVLCGGYFIDATTIIECLHSFCKTCIVRYLETSKYCPICDVQV
::::::::::::::::::.::::::::::::.:::::::::::::::::.::::.:::::
NP_009 MHRTTRIKITELNPHLMCALCGGYFIDATTIVECLHSFCKTCIVRYLETNKYCPMCDVQV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 HKTRPLLNIRSDKTLQDIVYKLVPGLFKNEMKRRRDFYAAHPSADAANGSNEDRGEVADE
:::::::.::::::::::::::::::::.:::::::::::.: ... :::::::::: ..
NP_009 HKTRPLLSIRSDKTLQDIVYKLVPGLFKDEMKRRRDFYAAYPLTEVPNGSNEDRGEVLEQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KB8 DKRIITDDEIISLSIEFFD--QNRLDRK---VNKDKEKSKEEVNDKRYLRCPAAMTVMHL
.: ..::::.::::::.. ..: ..: : : .: : : :.::::::::::::
NP_009 EKGALSDDEIVSLSIEFYEGARDRDEKKGPLENGDGDKEKTGV---RFLRCPAAMTVMHL
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 RKFLRSKMDIPNTFQIDVMYEEEPLKDYYTLMDIAYIYTWRRNGPLPLKYRVRPTCKRMK
::::.:::.:. ....:.::.::::.::::::::::: :::::::::::::.:.:::.
NP_009 AKFLRNKMDVPSKYKVEVLYEDEPLKEYYTLMDIAYIYPWRRNGPLPLKYRVQPACKRLT
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280
pF1KB8 ISH---QRDGLTNAGELESDSGSDKANSPAGGIPSTSSCLPSPSTPVQ-SP--------H
.. .: ...: : .: :::: ::: .:.::: ::::.:: . :: :
NP_009 LATVPTPSEGTNTSGASECESVSDKAPSPAT-LPATSSSLPSPATPSHGSPSSHGPPATH
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320
pF1KB8 PQFPHISSTMNGTSNSPSGN-----HQSSFANRPRKSSVNGSSATSSG
: : :: .:.... .:. . : ..: :: .:::.
NP_009 PTSPTPPSTASGATTAANGGSLNCLQTPSSTSRGRKMTVNGAPVPPLT
300 310 320 330 340
>>XP_016880505 (OMIM: 600346) PREDICTED: polycomb group (344 aa)
initn: 1403 init1: 829 opt: 1376 Z-score: 1106.0 bits: 213.0 E(85289): 7.3e-55
Smith-Waterman score: 1400; 63.2% identity (80.7% similar) in 342 aa overlap (1-320:1-338)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MHRTTRIKITELNPHLMCVLCGGYFIDATTIIECLHSFCKTCIVRYLETSKYCPICDVQV
::::::::::::::::::.::::::::::::.:::::::::::::::::.::::.:::::
XP_016 MHRTTRIKITELNPHLMCALCGGYFIDATTIVECLHSFCKTCIVRYLETNKYCPMCDVQV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 HKTRPLLNIRSDKTLQDIVYKLVPGLFKNEMKRRRDFYAAHPSADAANGSNEDRGEVADE
:::::::.::::::::::::::::::::.:::::::::::.: ... :::::::::: ..
XP_016 HKTRPLLSIRSDKTLQDIVYKLVPGLFKDEMKRRRDFYAAYPLTEVPNGSNEDRGEVLEQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KB8 DKRIITDDEIISLSIEFFD--QNRLDRK---VNKDKEKSKEEVNDKRYLRCPAAMTVMHL
.: ..::::.::::::.. ..: ..: : : .: : : :.::::::::::::
XP_016 EKGALSDDEIVSLSIEFYEGARDRDEKKGPLENGDGDKEKTGV---RFLRCPAAMTVMHL
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 RKFLRSKMDIPNTFQIDVMYEEEPLKDYYTLMDIAYIYTWRRNGPLPLKYRVRPTCKRMK
::::.:::.:. ....:.::.::::.::::::::::: :::::::::::::.:.:::.
XP_016 AKFLRNKMDVPSKYKVEVLYEDEPLKEYYTLMDIAYIYPWRRNGPLPLKYRVQPACKRLT
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280
pF1KB8 ISH---QRDGLTNAGELESDSGSDKANSPAGGIPSTSSCLPSPSTPVQ-SP--------H
.. .: ...: : .: :::: ::: .:.::: ::::.:: . :: :
XP_016 LATVPTPSEGTNTSGASECESVSDKAPSPAT-LPATSSSLPSPATPSHGSPSSHGPPATH
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320
pF1KB8 PQFPHISSTMNGTSNSPSGN-----HQSSFANRPRKSSVNGSSATSSG
: : :: .:.... .:. . : ..: :: .:::.
XP_016 PTSPTPPSTASGATTAANGGSLNCLQTPSSTSRGRKMTVNGAPVPPLT
300 310 320 330 340
>>NP_116062 (OMIM: 610231) polycomb group RING finger pr (259 aa)
initn: 511 init1: 478 opt: 571 Z-score: 470.1 bits: 94.9 E(85289): 1.9e-19
Smith-Waterman score: 578; 41.6% identity (70.0% similar) in 233 aa overlap (6-228:35-255)
10 20 30
pF1KB8 MHRTTRIKITELNPHLMCVLCGGYFIDATTIIECL
:.:: .:: :..: ::.:::.::::: :::
NP_116 QGGQIAIAMRLRNQLQSVYKMDPLRNEEEVRVKIKDLNEHIVCCLCAGYFVDATTITECL
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KB8 HSFCKTCIVRYLETSKYCPICDVQVHKTRPLLNIRSDKTLQDIVYKLVPGLFKNEMKRRR
:.:::.:::.::.::::::.:....:.:.::::.. :...::::::::::: .: :: :
NP_116 HTFCKSCIVKYLQTSKYCPMCNIKIHETQPLLNLKLDRVMQDIVYKLVPGLQDSEEKRIR
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140
pF1KB8 DFYAA-------HPSADAANGSNEDRGEVA-DEDK-RIITDDEIISLSIEFFDQNRLDRK
.:: . .:... :: . :..: . :: ..: .: ::.
NP_116 EFYQSRGLDRVTQPTGEEPALSNLGLPFSSFDHSKAHYYRYDEQLNLCLE-----RLSS-
130 140 150 160 170
150 160 170 180 190 200
pF1KB8 VNKDKEKSKEEVNDKRYLRCPAAMTVMHLRKFLRSKMDIPNTFQIDVMYEEEPLKDYYTL
.:::.:: : ...:.:: . : :::. : .. . : ........: : :..:.
NP_116 -GKDKNKS---VLQNKYVRCSVRAEVRHLRRVLCHRL-MLNPQHVQLLFDNEVLPDHMTM
180 190 200 210 220 230
210 220 230 240 250 260
pF1KB8 MDIAYIYTWR-RNGPLPLKYRVRPTCKRMKISHQRDGLTNAGELESDSGSDKANSPAGGI
.: .. : . .:: :.: :.
NP_116 KQI-WLSRWFGKPSPLLLQYSVKEKRR
240 250
>>NP_001011663 (OMIM: 607816) polycomb group RING finger (350 aa)
initn: 494 init1: 393 opt: 482 Z-score: 397.8 bits: 82.0 E(85289): 2e-15
Smith-Waterman score: 482; 39.2% identity (66.5% similar) in 209 aa overlap (7-209:123-322)
10 20 30
pF1KB8 MHRTTRIKITELNPHLMCVLCGGYFIDATTIIECLH
:...::.:...: .: ::.:::::: ::::
NP_001 EEEEEEEDMSHFSLRLEGGRQDSEDEEERLINLSELTPYILCSICKGYLIDATTITECLH
100 110 120 130 140 150
40 50 60 70 80 90
pF1KB8 SFCKTCIVRYLETSKYCPICDVQVHKTRPLLNIRSDKTLQDIVYKLVPGLFKNEMKRRRD
.:::.::::.. :. :: :.. ::.:.:: ::: :. ::::::::: .: . : :. .:
NP_001 TFCKSCIVRHFYYSNRCPKCNIVVHQTQPLYNIRLDRQLQDIVYKLVINLEEREKKQMHD
160 170 180 190 200 210
100 110 120 130 140 150
pF1KB8 FY------AAHPSADAANGSNEDRGEVADEDKRIITDDEIISLSIEFFDQNRLDRKVNKD
:: . .:.. :.. :.. . :. : . .:: .::. :. .
NP_001 FYKERGLEVPKPAVPQPVPSSKGRSKKVLESVFRIPPELDMSLLLEFIGANE-----GTG
220 230 240 250 260
160 170 180 190 200 210
pF1KB8 KEKSKEEVNDKRYLRCPAAMTVMHLRKFLRSKMDIPNTFQIDVMYEEEPLKDYYTLMDIA
. : : :...: . :. :..:::: :: . . :.:.. .. :..: :: .:
NP_001 HFKPLE----KKFVRVSGEATIGHVEKFLRRKMGLDPACQVDIICGDHLLEQYQTLREIR
270 280 290 300 310 320
220 230 240 250 260 270
pF1KB8 YIYTWRRNGPLPLKYRVRPTCKRMKISHQRDGLTNAGELESDSGSDKANSPAGGIPSTSS
NP_001 RAIGDAAMQDGLLVLHYGLVVSPLKIT
330 340 350
>>NP_115530 (OMIM: 607816) polycomb group RING finger pr (275 aa)
initn: 388 init1: 287 opt: 296 Z-score: 251.9 bits: 54.6 E(85289): 2.7e-07
Smith-Waterman score: 296; 53.7% identity (85.1% similar) in 67 aa overlap (7-73:123-189)
10 20 30
pF1KB8 MHRTTRIKITELNPHLMCVLCGGYFIDATTIIECLH
:...::.:...: .: ::.:::::: ::::
NP_115 EEEEEEEDMSHFSLRLEGGRQDSEDEEERLINLSELTPYILCSICKGYLIDATTITECLH
100 110 120 130 140 150
40 50 60 70 80 90
pF1KB8 SFCKTCIVRYLETSKYCPICDVQVHKTRPLLNIRSDKTLQDIVYKLVPGLFKNEMKRRRD
.:::.::::.. :. :: :.. ::.:.:: :: ...
NP_115 TFCKSCIVRHFYYSNRCPKCNIVVHQTQPLYNISANEGTGHFKPLEKKFVRVSGEATIGH
160 170 180 190 200 210
100 110 120 130 140 150
pF1KB8 FYAAHPSADAANGSNEDRGEVADEDKRIITDDEIISLSIEFFDQNRLDRKVNKDKEKSKE
NP_115 VEKFLRRKMGLDPACQVDIICGDHLLEQYQTLREIRRAIGDAAMQDGLLVLHYGLVVSPL
220 230 240 250 260 270
326 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 22:02:56 2016 done: Fri Nov 4 22:02:57 2016
Total Scan time: 8.150 Total Display time: 0.000
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]