Result of FASTA (ccds) for
pF1KB8290
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8290, 561 aa
1>>>pF1KB8290 561 - 561 aa - 561 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 13.2437+/-0.00115; mu= -18.1779+/- 0.069
mean_var=417.4418+/-85.111, 0's: 0 Z-trim(114.5): 22 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.062773
statistics sampled from 15085 (15103) to 15085 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.775), E-opt: 0.2 (0.464), width: 16
Scan time: 3.750
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS55291.1 NFIB gene_id:4781|Hs108|chr9 ( 494) 3372 319.6 5.5e-87
CCDS6474.1 NFIB gene_id:4781|Hs108|chr9 ( 420) 2876 274.6 1.6e-73
CCDS55292.1 NFIB gene_id:4781|Hs108|chr9 ( 446) 2810 268.7 1.1e-71
CCDS65007.1 NFIB gene_id:4781|Hs108|chr9 ( 309) 2146 208.5 1e-53
CCDS44156.1 NFIA gene_id:4774|Hs108|chr1 ( 509) 1857 182.4 1.1e-45
CCDS53322.1 NFIA gene_id:4774|Hs108|chr1 ( 554) 1858 182.5 1.1e-45
CCDS615.1 NFIA gene_id:4774|Hs108|chr1 ( 498) 1852 182.0 1.5e-45
CCDS53321.1 NFIA gene_id:4774|Hs108|chr1 ( 501) 1795 176.8 5.5e-44
CCDS59330.1 NFIC gene_id:4782|Hs108|chr19 ( 508) 1630 161.9 1.8e-39
CCDS45996.1 NFIX gene_id:4784|Hs108|chr19 ( 441) 1611 160.1 5.2e-39
CCDS45914.1 NFIC gene_id:4782|Hs108|chr19 ( 499) 1578 157.1 4.5e-38
CCDS59359.1 NFIX gene_id:4784|Hs108|chr19 ( 433) 1552 154.7 2.1e-37
CCDS59331.1 NFIC gene_id:4782|Hs108|chr19 ( 439) 1549 154.5 2.5e-37
CCDS12107.1 NFIC gene_id:4782|Hs108|chr19 ( 428) 1541 153.8 4.1e-37
CCDS58640.1 NFIC gene_id:4782|Hs108|chr19 ( 430) 1497 149.8 6.5e-36
>>CCDS55291.1 NFIB gene_id:4781|Hs108|chr9 (494 aa)
initn: 3372 init1: 3372 opt: 3372 Z-score: 1675.1 bits: 319.6 E(32554): 5.5e-87
Smith-Waterman score: 3372; 100.0% identity (100.0% similar) in 489 aa overlap (1-489:1-489)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MMYSPICLTQDEFHPFIEALLPHVRAIAYTWFNLQARKRKYFKKHEKRMSKDEERAVKDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 MMYSPICLTQDEFHPFIEALLPHVRAIAYTWFNLQARKRKYFKKHEKRMSKDEERAVKDE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 LLSEKPEIKQKWASRLLAKLRKDIRQEYREDFVLTVTGKKHPCCVLSNPDQKGKIRRIDC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LLSEKPEIKQKWASRLLAKLRKDIRQEYREDFVLTVTGKKHPCCVLSNPDQKGKIRRIDC
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 LRQADKVWRLDLVMVILFKGIPLESTDGERLMKSPHCTNPALCVQPHHITVSVKELDLFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LRQADKVWRLDLVMVILFKGIPLESTDGERLMKSPHCTNPALCVQPHHITVSVKELDLFL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 AYYVQEQDSGQSGSPSHNDPAKNPPGYLEDSFVKSGVFNVSELVRVSRTPITQGTGVNFP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 AYYVQEQDSGQSGSPSHNDPAKNPPGYLEDSFVKSGVFNVSELVRVSRTPITQGTGVNFP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 IGEIPSQPYYHDMNSGVNLQRSLSSPPSSKRPKTISIDENMEPSPTGDFYPSPSSPAAGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 IGEIPSQPYYHDMNSGVNLQRSLSSPPSSKRPKTISIDENMEPSPTGDFYPSPSSPAAGS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 RTWHERDQDMSSPTTMKKPEKPLFSSASPQDSSPRLSTFPQHHHPGIPGVAHSVISTRTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 RTWHERDQDMSSPTTMKKPEKPLFSSASPQDSSPRLSTFPQHHHPGIPGVAHSVISTRTP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 PPPSPLPFPTQAILPPAPSSYFSHPTIRYPPHLNPQDTLKNYVPSYDPSSPQTSQPNGSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 PPPSPLPFPTQAILPPAPSSYFSHPTIRYPPHLNPQDTLKNYVPSYDPSSPQTSQPNGSG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 QVVGKVPGHFTPVLAPSPHPSAVRPVTLSMTDTKPITTSTEAYTASGTSQANRYVGLSPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 QVVGKVPGHFTPVLAPSPHPSAVRPVTLSMTDTKPITTSTEAYTASGTSQANRYVGLSPR
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB8 DPSFLHQQQLRICDWTMNQNGRHLYPSTSEDTLGITWQSPGTWASLVPFQVSNRTPILPA
:::::::::
CCDS55 DPSFLHQQQSWYLG
490
>>CCDS6474.1 NFIB gene_id:4781|Hs108|chr9 (420 aa)
initn: 2902 init1: 2876 opt: 2876 Z-score: 1433.4 bits: 274.6 E(32554): 1.6e-73
Smith-Waterman score: 2876; 100.0% identity (100.0% similar) in 415 aa overlap (1-415:1-415)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MMYSPICLTQDEFHPFIEALLPHVRAIAYTWFNLQARKRKYFKKHEKRMSKDEERAVKDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 MMYSPICLTQDEFHPFIEALLPHVRAIAYTWFNLQARKRKYFKKHEKRMSKDEERAVKDE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 LLSEKPEIKQKWASRLLAKLRKDIRQEYREDFVLTVTGKKHPCCVLSNPDQKGKIRRIDC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 LLSEKPEIKQKWASRLLAKLRKDIRQEYREDFVLTVTGKKHPCCVLSNPDQKGKIRRIDC
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 LRQADKVWRLDLVMVILFKGIPLESTDGERLMKSPHCTNPALCVQPHHITVSVKELDLFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 LRQADKVWRLDLVMVILFKGIPLESTDGERLMKSPHCTNPALCVQPHHITVSVKELDLFL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 AYYVQEQDSGQSGSPSHNDPAKNPPGYLEDSFVKSGVFNVSELVRVSRTPITQGTGVNFP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 AYYVQEQDSGQSGSPSHNDPAKNPPGYLEDSFVKSGVFNVSELVRVSRTPITQGTGVNFP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 IGEIPSQPYYHDMNSGVNLQRSLSSPPSSKRPKTISIDENMEPSPTGDFYPSPSSPAAGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 IGEIPSQPYYHDMNSGVNLQRSLSSPPSSKRPKTISIDENMEPSPTGDFYPSPSSPAAGS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 RTWHERDQDMSSPTTMKKPEKPLFSSASPQDSSPRLSTFPQHHHPGIPGVAHSVISTRTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 RTWHERDQDMSSPTTMKKPEKPLFSSASPQDSSPRLSTFPQHHHPGIPGVAHSVISTRTP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 PPPSPLPFPTQAILPPAPSSYFSHPTIRYPPHLNPQDTLKNYVPSYDPSSPQTSQPNGSG
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 PPPSPLPFPTQAILPPAPSSYFSHPTIRYPPHLNPQDTLKNYVPSYDPSSPQTSQSWYLG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 QVVGKVPGHFTPVLAPSPHPSAVRPVTLSMTDTKPITTSTEAYTASGTSQANRYVGLSPR
>>CCDS55292.1 NFIB gene_id:4781|Hs108|chr9 (446 aa)
initn: 2830 init1: 2804 opt: 2810 Z-score: 1400.7 bits: 268.7 E(32554): 1.1e-71
Smith-Waterman score: 2810; 98.5% identity (99.3% similar) in 413 aa overlap (4-415:29-441)
10 20 30
pF1KB8 MMYSPICLT-QDEFHPFIEALLPHVRAIAYTWFNL
: .:. .::::::::::::::::::::::::
CCDS55 MERIPVSVDFWVVCCAVLKCNPGIPKRMSTLCFGFSDEFHPFIEALLPHVRAIAYTWFNL
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KB8 QARKRKYFKKHEKRMSKDEERAVKDELLSEKPEIKQKWASRLLAKLRKDIRQEYREDFVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 QARKRKYFKKHEKRMSKDEERAVKDELLSEKPEIKQKWASRLLAKLRKDIRQEYREDFVL
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KB8 TVTGKKHPCCVLSNPDQKGKIRRIDCLRQADKVWRLDLVMVILFKGIPLESTDGERLMKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 TVTGKKHPCCVLSNPDQKGKIRRIDCLRQADKVWRLDLVMVILFKGIPLESTDGERLMKS
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KB8 PHCTNPALCVQPHHITVSVKELDLFLAYYVQEQDSGQSGSPSHNDPAKNPPGYLEDSFVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 PHCTNPALCVQPHHITVSVKELDLFLAYYVQEQDSGQSGSPSHNDPAKNPPGYLEDSFVK
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KB8 SGVFNVSELVRVSRTPITQGTGVNFPIGEIPSQPYYHDMNSGVNLQRSLSSPPSSKRPKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 SGVFNVSELVRVSRTPITQGTGVNFPIGEIPSQPYYHDMNSGVNLQRSLSSPPSSKRPKT
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KB8 ISIDENMEPSPTGDFYPSPSSPAAGSRTWHERDQDMSSPTTMKKPEKPLFSSASPQDSSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 ISIDENMEPSPTGDFYPSPSSPAAGSRTWHERDQDMSSPTTMKKPEKPLFSSASPQDSSP
310 320 330 340 350 360
340 350 360 370 380 390
pF1KB8 RLSTFPQHHHPGIPGVAHSVISTRTPPPPSPLPFPTQAILPPAPSSYFSHPTIRYPPHLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 RLSTFPQHHHPGIPGVAHSVISTRTPPPPSPLPFPTQAILPPAPSSYFSHPTIRYPPHLN
370 380 390 400 410 420
400 410 420 430 440 450
pF1KB8 PQDTLKNYVPSYDPSSPQTSQPNGSGQVVGKVPGHFTPVLAPSPHPSAVRPVTLSMTDTK
:::::::::::::::::::::
CCDS55 PQDTLKNYVPSYDPSSPQTSQSWYLG
430 440
>>CCDS65007.1 NFIB gene_id:4781|Hs108|chr9 (309 aa)
initn: 2146 init1: 2146 opt: 2146 Z-score: 1078.1 bits: 208.5 E(32554): 1e-53
Smith-Waterman score: 2146; 100.0% identity (100.0% similar) in 309 aa overlap (253-561:1-309)
230 240 250 260 270 280
pF1KB8 LVRVSRTPITQGTGVNFPIGEIPSQPYYHDMNSGVNLQRSLSSPPSSKRPKTISIDENME
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 MNSGVNLQRSLSSPPSSKRPKTISIDENME
10 20 30
290 300 310 320 330 340
pF1KB8 PSPTGDFYPSPSSPAAGSRTWHERDQDMSSPTTMKKPEKPLFSSASPQDSSPRLSTFPQH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 PSPTGDFYPSPSSPAAGSRTWHERDQDMSSPTTMKKPEKPLFSSASPQDSSPRLSTFPQH
40 50 60 70 80 90
350 360 370 380 390 400
pF1KB8 HHPGIPGVAHSVISTRTPPPPSPLPFPTQAILPPAPSSYFSHPTIRYPPHLNPQDTLKNY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 HHPGIPGVAHSVISTRTPPPPSPLPFPTQAILPPAPSSYFSHPTIRYPPHLNPQDTLKNY
100 110 120 130 140 150
410 420 430 440 450 460
pF1KB8 VPSYDPSSPQTSQPNGSGQVVGKVPGHFTPVLAPSPHPSAVRPVTLSMTDTKPITTSTEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 VPSYDPSSPQTSQPNGSGQVVGKVPGHFTPVLAPSPHPSAVRPVTLSMTDTKPITTSTEA
160 170 180 190 200 210
470 480 490 500 510 520
pF1KB8 YTASGTSQANRYVGLSPRDPSFLHQQQLRICDWTMNQNGRHLYPSTSEDTLGITWQSPGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 YTASGTSQANRYVGLSPRDPSFLHQQQLRICDWTMNQNGRHLYPSTSEDTLGITWQSPGT
220 230 240 250 260 270
530 540 550 560
pF1KB8 WASLVPFQVSNRTPILPANVQNYGLNIIGEPFLQAETSN
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 WASLVPFQVSNRTPILPANVQNYGLNIIGEPFLQAETSN
280 290 300
>>CCDS44156.1 NFIA gene_id:4774|Hs108|chr1 (509 aa)
initn: 1626 init1: 1219 opt: 1857 Z-score: 933.4 bits: 182.4 E(32554): 1.1e-45
Smith-Waterman score: 1910; 60.6% identity (76.9% similar) in 523 aa overlap (2-497:1-508)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MMYSPICLTQDEFHPFIEALLPHVRAIAYTWFNLQARKRKYFKKHEKRMSKDEERAVKDE
::::.::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::.::::::::
CCDS44 MYSPLCLTQDEFHPFIEALLPHVRAFAYTWFNLQARKRKYFKKHEKRMSKEEERAVKDE
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 LLSEKPEIKQKWASRLLAKLRKDIRQEYREDFVLTVTGKKHPCCVLSNPDQKGKIRRIDC
:::::::.::::::::::::::::: :::::::::::::: :::::::::::::.:::::
CCDS44 LLSEKPEVKQKWASRLLAKLRKDIRPEYREDFVLTVTGKKPPCCVLSNPDQKGKMRRIDC
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 LRQADKVWRLDLVMVILFKGIPLESTDGERLMKSPHCTNPALCVQPHHITVSVKELDLFL
:::::::::::::::::::::::::::::::.:::.:.::.:::::::: ::::::::.:
CCDS44 LRQADKVWRLDLVMVILFKGIPLESTDGERLVKSPQCSNPGLCVQPHHIGVSVKELDLYL
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
pF1KB8 AYYVQEQDSGQSGSPSHNDPA--KNPP--GYL--EDSFVKSGVFNVSELVRVSRTPITQG
::.:. ::.:: :::. . : :. : :.: .:::: ::::.:.::::::.:::. :
CCDS44 AYFVHAADSSQSESPSQPSDADIKDQPENGHLGFQDSFVTSGVFSVTELVRVSQTPIAAG
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 TGVNFPIGEIPSQPYYHDMNSGVNLQRSLSSPPSSKRPKTI-SIDENMEPSPTGDFYPSP
:: :: .... :. :: .:. :. ..::: : :.. : . :....:. :: .
CCDS44 TGPNFSLSDLESSSYY-SMSPGA-MRRSLPSTSSTSSTKRLKSVEDEMDSPGEEPFYTGQ
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 S-SPAAGSRT--WHERDQDMSSPTTMKKPEKPLFSSASPQDSSPRLSTFPQHHHPGIPGV
. ::..::.. ::: . : ::::.:: :: ::: ::...: ..: :::.: : :
CCDS44 GRSPGSGSQSSGWHEVEPGMPSPTTLKKSEKSGFSSPSPSQTSSLGTAFTQHHRPVITGP
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB8 AHSVISTRTPPPPSPLPFPTQAILPPAPSSYFSHPTIRYPPHLNPQDTLKNYVPSYDPSS
: .: :: : :::. :. :. :::::.::: .::.:::..: :..
CCDS44 RASPHAT-----PSTLHFPTSPIIQQ-PGPYFSHPAIRY----HPQETLKEFVQLVCPDA
360 370 380 390 400
420 430 440 450 460
pF1KB8 PQTS------QPNGSGQVVGKVPGHF--TPVLAPSPHPSAVRPVTLSMTDTKPITTSTEA
: . .::::.: ::: . : ::.: : : : .::: : . :::: :::::.
CCDS44 GQQAGQVGFLNPNGSSQ--GKVHNPFLPTPMLPPPPPPPMARPVPLPVPDTKPPTTSTEG
410 420 430 440 450 460
470 480 490 500 510
pF1KB8 ---------YTASGTSQANRYVGLSPRDPSFLHQQQLRICDWTMNQNGRHLYPSTSEDTL
:.. .:: :::.:...::::::.. : . .: .
CCDS44 GAASPTSPTYSTPSTSPANRFVSVGPRDPSFVNIPQ-QTQSWYLG
470 480 490 500
520 530 540 550 560
pF1KB8 GITWQSPGTWASLVPFQVSNRTPILPANVQNYGLNIIGEPFLQAETSN
>>CCDS53322.1 NFIA gene_id:4774|Hs108|chr1 (554 aa)
initn: 1627 init1: 1220 opt: 1858 Z-score: 933.3 bits: 182.5 E(32554): 1.1e-45
Smith-Waterman score: 1911; 60.5% identity (76.9% similar) in 524 aa overlap (1-497:45-553)
10 20 30
pF1KB8 MMYSPICLTQDEFHPFIEALLPHVRAIAYT
.::::.::::::::::::::::::::.:::
CCDS53 PTRWPGGCGATWQSCPSPPPRRTRIPQRPAVMYSPLCLTQDEFHPFIEALLPHVRAFAYT
20 30 40 50 60 70
40 50 60 70 80 90
pF1KB8 WFNLQARKRKYFKKHEKRMSKDEERAVKDELLSEKPEIKQKWASRLLAKLRKDIRQEYRE
:::::::::::::::::::::.:::::::::::::::.::::::::::::::::: ::::
CCDS53 WFNLQARKRKYFKKHEKRMSKEEERAVKDELLSEKPEVKQKWASRLLAKLRKDIRPEYRE
80 90 100 110 120 130
100 110 120 130 140 150
pF1KB8 DFVLTVTGKKHPCCVLSNPDQKGKIRRIDCLRQADKVWRLDLVMVILFKGIPLESTDGER
:::::::::: :::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 DFVLTVTGKKPPCCVLSNPDQKGKMRRIDCLRQADKVWRLDLVMVILFKGIPLESTDGER
140 150 160 170 180 190
160 170 180 190 200
pF1KB8 LMKSPHCTNPALCVQPHHITVSVKELDLFLAYYVQEQDSGQSGSPSHNDPA--KNPP--G
:.:::.:.::.:::::::: ::::::::.:::.:. ::.:: :::. . : :. : :
CCDS53 LVKSPQCSNPGLCVQPHHIGVSVKELDLYLAYFVHAADSSQSESPSQPSDADIKDQPENG
200 210 220 230 240 250
210 220 230 240 250 260
pF1KB8 YL--EDSFVKSGVFNVSELVRVSRTPITQGTGVNFPIGEIPSQPYYHDMNSGVNLQRSLS
.: .:::: ::::.:.::::::.:::. ::: :: .... :. :: .:. :. ..:::
CCDS53 HLGFQDSFVTSGVFSVTELVRVSQTPIAAGTGPNFSLSDLESSSYY-SMSPGA-MRRSLP
260 270 280 290 300 310
270 280 290 300 310 320
pF1KB8 SPPSSKRPKTI-SIDENMEPSPTGDFYPSPS-SPAAGSRT--WHERDQDMSSPTTMKKPE
: :.. : . :....:. :: . . ::..::.. ::: . : ::::.:: :
CCDS53 STSSTSSTKRLKSVEDEMDSPGEEPFYTGQGRSPGSGSQSSGWHEVEPGMPSPTTLKKSE
320 330 340 350 360 370
330 340 350 360 370 380
pF1KB8 KPLFSSASPQDSSPRLSTFPQHHHPGIPGVAHSVISTRTPPPPSPLPFPTQAILPPAPSS
: ::: ::...: ..: :::.: : : : .: :: : :::. :. :.
CCDS53 KSGFSSPSPSQTSSLGTAFTQHHRPVITGPRASPHAT-----PSTLHFPTSPIIQQ-PGP
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550
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CCDS61 GAASPTSPILVPGIKVAASHHPPDRPPDPFSTL
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CCDS53 RASPHAT-----PSTLHFPTSPIIQQ-PGPYFSHPAIRY----HPQETLKEFVQLVCPDA
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CCDS45 AYFVHTPESGQSDSSNQQGDADIKPLPNGHLSFQDCFVTSGVWNVTELVRVSQTPVATAS
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CCDS45 GTGRSPAAGSSQSSGW-PNDVD-AGPASLKKSGKLDFCSALSSQGSSPRMA-FTHHPLPV
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CCDS45 LAGVRPG--SPRATA--SALHFPSTSIIQQS-SPYFTHPTIRYHHH-HGQDSLKEFV---
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CCDS45 -----QFVCSDGSGQATGQHSQRQAPPLPTGLSASDPGTATF
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18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]