FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB8326, 366 aa 1>>>pF1KB8326 366 - 366 aa - 366 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.8273+/-0.00107; mu= -9.5760+/- 0.064 mean_var=492.0249+/-103.748, 0's: 0 Z-trim(117.1): 38 B-trim: 656 in 2/53 Lambda= 0.057820 statistics sampled from 17765 (17803) to 17765 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.818), E-opt: 0.2 (0.547), width: 16 Scan time: 2.820 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS11546.1 ABI3 gene_id:51225|Hs108|chr17 ( 366) 2489 221.3 1e-57 CCDS45725.1 ABI3 gene_id:51225|Hs108|chr17 ( 360) 2432 216.6 2.7e-56 CCDS31169.1 ABI1 gene_id:10006|Hs108|chr10 ( 476) 686 71.1 2.3e-12 CCDS53498.1 ABI1 gene_id:10006|Hs108|chr10 ( 446) 684 70.9 2.5e-12 CCDS73077.1 ABI1 gene_id:10006|Hs108|chr10 ( 393) 661 68.9 8.6e-12 CCDS63094.1 ABI2 gene_id:10152|Hs108|chr2 ( 507) 661 69.0 1e-11 CCDS2358.1 ABI2 gene_id:10152|Hs108|chr2 ( 475) 647 67.8 2.2e-11 CCDS7150.1 ABI1 gene_id:10006|Hs108|chr10 ( 508) 628 66.2 6.9e-11 >>CCDS11546.1 ABI3 gene_id:51225|Hs108|chr17 (366 aa) initn: 2489 init1: 2489 opt: 2489 Z-score: 1149.6 bits: 221.3 E(32554): 1e-57 Smith-Waterman score: 2489; 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CCDS53 VAYQINALANNVLQLLDIQASQLRRMESSINHISQTVDIHKEKVARREIGILTTNKNTSR 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KB8 GQKVIAPENLPPLTPYCRRPLNFGCLDDIGHGIKDLSTQLSRTGTLSRK---SIKAPATP .:.::: :. . : :.:... :::.:::.: ..: .::::::: . : :. : CCDS53 THKIIAPANMERPVRYIRKPIDYTVLDDVGHGVKHGNNQPARTGTLSRTNPPTQKPPSPP 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 pF1KB8 ASA--TLGR--PPRIPEPVHLPVVPD------GRLSAASSASSLAS--------AGSAEG :. :::: : . :::. :.::. .::.. : . :: .::. : CCDS53 MSGRGTLGRNTPYKTLEPVKPPTVPNDYMTSPARLGSQHSPGRTASLNQRPRTHSGSSGG 190 200 210 220 230 240 220 230 240 250 pF1KB8 VGGAPTPKGQAA--PPAPPLPS--SLDPPPPPA--------AVEV--------------F :. . ... : : : :: .. : : : . .. . 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