FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB8345, 628 aa 1>>>pF1KB8345 628 - 628 aa - 628 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2398+/-0.00089; mu= 23.7248+/- 0.055 mean_var=357.6818+/-71.072, 0's: 0 Z-trim(110.1): 2051 B-trim: 120 in 2/50 Lambda= 0.067815 statistics sampled from 16102 (18446) to 16102 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.52), E-opt: 0.2 (0.216), width: 16 Scan time: 7.470 The best scores are: opt bits E(85289) NP_940937 (OMIM: 609571) zinc finger protein 699 [ ( 642) 2027 214.3 1e-54 NP_066358 (OMIM: 194556) zinc finger protein 14 [H ( 642) 1970 208.8 4.9e-53 NP_112495 (OMIM: 603975) zinc finger protein 93 [H ( 620) 1956 207.4 1.3e-52 XP_016882730 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 628) 1848 196.8 1.9e-49 NP_003427 (OMIM: 604077) zinc finger protein 135 i ( 670) 1848 196.9 2e-49 XP_006723425 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 1848 196.9 2e-49 XP_006723426 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 1848 196.9 2e-49 NP_009065 (OMIM: 604077) zinc finger protein 135 i ( 682) 1848 196.9 2e-49 XP_016881640 (OMIM: 604750) PREDICTED: zinc finger ( 669) 1847 196.8 2.1e-49 XP_016881871 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 527) 1839 195.8 3.3e-49 XP_016881868 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 527) 1839 195.8 3.3e-49 XP_016881869 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 527) 1839 195.8 3.3e-49 NP_001317411 (OMIM: 613904) zinc finger protein 56 ( 527) 1839 195.8 3.3e-49 XP_016881867 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 650) 1839 196.0 3.6e-49 XP_016881866 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 686) 1839 196.0 3.6e-49 XP_011524841 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 686) 1839 196.0 3.6e-49 NP_689697 (OMIM: 613904) zinc finger protein 569 i ( 686) 1839 196.0 3.6e-49 XP_016881865 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 686) 1839 196.0 3.6e-49 XP_006723111 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 710) 1839 196.0 3.7e-49 XP_006723109 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 710) 1839 196.0 3.7e-49 XP_006723110 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 710) 1839 196.0 3.7e-49 XP_011524840 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 710) 1839 196.0 3.7e-49 NP_003420 (OMIM: 603899) zinc finger protein 85 is ( 595) 1836 195.6 4.2e-49 NP_001276331 (OMIM: 604077) zinc finger protein 13 ( 616) 1828 194.8 7.4e-49 NP_001276330 (OMIM: 604077) zinc finger protein 13 ( 658) 1828 194.9 7.5e-49 XP_016882729 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 658) 1828 194.9 7.5e-49 XP_005259268 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 1828 194.9 7.6e-49 XP_016882731 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 621) 1825 194.5 9.1e-49 NP_001073878 (OMIM: 603981) zinc finger protein 99 ( 864) 1803 192.7 4.5e-48 NP_149350 (OMIM: 616290) zinc finger protein 658 [ (1059) 1800 192.6 6e-48 XP_005272572 (OMIM: 616290) PREDICTED: zinc finger (1059) 1800 192.6 6e-48 XP_011543981 (OMIM: 616290) PREDICTED: zinc finger (1059) 1800 192.6 6e-48 XP_016870103 (OMIM: 616290) PREDICTED: zinc finger (1059) 1800 192.6 6e-48 NP_001304845 (OMIM: 616290) zinc finger protein 65 (1059) 1800 192.6 6e-48 XP_006722943 (OMIM: 603971) PREDICTED: zinc finger (1092) 1787 191.4 1.5e-47 XP_011526568 (OMIM: 603971) PREDICTED: zinc finger (1092) 1787 191.4 1.5e-47 XP_016882725 (OMIM: 603971) PREDICTED: zinc finger (1118) 1787 191.4 1.5e-47 XP_016882724 (OMIM: 603971) PREDICTED: zinc finger (1150) 1787 191.4 1.5e-47 XP_011526567 (OMIM: 603971) PREDICTED: zinc finger (1150) 1787 191.4 1.5e-47 NP_001287880 (OMIM: 603971) zinc finger protein 91 (1159) 1787 191.4 1.5e-47 NP_003421 (OMIM: 603971) zinc finger protein 91 is (1191) 1787 191.4 1.5e-47 NP_001309067 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 782) 1775 189.9 2.9e-47 NP_001309068 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 782) 1775 189.9 2.9e-47 NP_001309066 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 782) 1775 189.9 2.9e-47 XP_016882935 (OMIM: 600398) PREDICTED: zinc finger ( 818) 1775 189.9 3e-47 NP_001096073 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 1775 189.9 3e-47 NP_001309062 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 1775 189.9 3e-47 NP_001309061 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 1775 189.9 3e-47 NP_001309063 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 1775 189.9 3e-47 NP_001309059 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 1775 189.9 3e-47 >>NP_940937 (OMIM: 609571) zinc finger protein 699 [Homo (642 aa) initn: 6320 init1: 1799 opt: 2027 Z-score: 1103.3 bits: 214.3 E(85289): 1e-54 Smith-Waterman score: 2157; 52.6% identity (71.5% similar) in 624 aa overlap (5-589:20-640) 10 20 30 40 pF1KB8 MDSVVFEDVAVDFTLEEWALLDSAQRDLYRDVMLETFQNLASV-- :::::::::: ::::::: :::.::::::::.::::::. 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NP_066 ISLRLHERTHTGEKPYECKQCHKTFSFSSSLREHETTHTGEKPYECKQCGKTFSFSSSLQ 380 390 400 410 420 430 450 460 470 480 490 500 pF1KB8 KHMRTHTREKPYECKQCGKAFSLSACFREHVRMHPEDKSYECKLCGKAFYCHISLQKHMR .: :::. ::::::::::::: :. :: : : : .: :::: :::.: :.. : : NP_066 RHERTHNAEKPYECKQCGKAFRCSSYFRIHERSHTGEKPYECKQCGKVFIRSSSFRLHER 440 450 460 470 480 490 510 520 530 540 550 560 pF1KB8 RHTAEKLYKCKQCGKAFSWPELLQQHVRTHTVEKPYECKECGKVFKWPSSLPIHMRLHTG ::.:: :.:: :::.::. :..: . :: .::.:::.:::.: :.. .: : ::: NP_066 THTGEKPYECKLCGKTFSFSSSLREHEKIHTGNKPFECKQCGKAFLRSSQIRLHERTHTG 500 510 520 530 540 550 570 580 590 600 610 620 pF1KB8 EKPYQCKHCGKAFNCSSSLRRHVRIHTTEKQYKCNVGHPPANEFMCSASEKSHQERDLIK :::::::.::::: ::..: : : :: :: :.:. .. : :.: . :. 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NP_112 MGPLQFRDVAIEFSLEEWHCLDTAQRNLYRNVMLENYSNLVFL--------GIVVSKPDL 10 20 30 40 50 70 80 90 100 pF1KB8 YGEKIPKESKIATFTRN--VSWASVLGK-----IWDSLSIED--QTTNQGRNLSRNHG-- .. . . .: :. :. :. ::. . .: .:.: : . : .:.:: NP_112 IAH-LEQGKKPLTMKRHEMVANPSVICSHFAQDLWPEQNIKDSFQKVILRRYEKRGHGNL 60 70 80 90 100 110 110 120 130 140 150 160 pF1KB8 -LERLCESNDQCGEALSQIPHLNLYKKIPPGVKQYEYNTYGKVFMHRRTSLKSPITVHTG : . ::: :.: . :: . . : .. . ::::: :. .. . :: NP_112 QLIKRCESVDECKVHTGGYNGLNQCSTTTQS-KVFQCDKYGKVF-HKFSNSNRHNIRHTE 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 pF1KB8 HKPYQCQECGQAYSCRSHLRMHVRTHNGERPYVCKLCGKTFPRTSSLNRHVRIHTAEKTY .::..: :::.:.. : : : . :.::.::.:. :::.: .:.:: : ::::.:: : NP_112 KKPFKCIECGKAFNQFSTLITHKKIHTGEKPYICEECGKAFKYSSALNTHKRIHTGEKPY 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 pF1KB8 ECKQCGKAFIDFSSLTSHLRSHTGEKPYKCKECGKAFSYSSTFRRHTITHTGEKPYKCKE .: .: :::: :.:..: :::.:::::.::::::. :::. .: :::::::::.: NP_112 KCDKCDKAFIASSTLSKHEIIHTGKKPYKCEECGKAFNQSSTLTKHKKIHTGEKPYKCEE 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 pF1KB8 CAEAFSYSSTFRRHMISHTGEKPHKCKECGEAFSYSSAFRRHMITHTGEKPYECKQCGKT :..::. :::. .: ::::::. :.:::.::.:: . : :::::::.:..:::. NP_112 CGKAFNQSSTLTKHKKIHTGEKPYVCEECGKAFKYSRILTTHKRIHTGEKPYKCNKCGKA 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 pF1KB8 FIYLQSFRRHERIHTGEKPYECKQCGKTFIYPQSFRRHERTHGGEKPYECNQCGKAFSHP :: ... ::: :: :.: :.:..:::.::. . . ::.:.: :::::.:..:::::.. NP_112 FIASSTLSRHEFIHMGKKHYKCEECGKAFIWSSVLTRHKRVHTGEKPYKCEECGKAFKYS 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 pF1KB8 SSFRGHMRVHTGEKPYECKQCGKTFNWPISLRKHMRTHTREKPYECKQCGKAFSLSACFR :.. .: : :::::::.:..:::.: .: :: :: .:::.:..:::::. :. . NP_112 STLSSHKRSHTGEKPYKCEECGKAFVASSTLSKHEIIHTGKKPYKCEECGKAFNQSSSLT 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 pF1KB8 EHVRMHPEDKSYECKLCGKAFYCHISLQKHMRRHTAEKLYKCKQCGKAFSWPELLQQHVR .: ..: .: :.:. ::::: :: :: . ::.:: :::..:::::. : .: . NP_112 KHKKIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSSLTKHKKIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSTLIKHKK 470 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 pF1KB8 THTVEKPYECKECGKVFKWPSSLPIHMRLHTGEKPYQCKHCGKAFNCSSSLRRHVRIHTT :: ::::.:.::::.:. . : : ::::::::.:..:::::: :..: : .::. NP_112 IHTREKPYKCEECGKAFHLSTHLTTHKILHTGEKPYRCRECGKAFNHSATLSSHKKIHSG 530 540 550 560 570 580 590 600 610 620 pF1KB8 EKQYKCNVGHPPANEFMCSASEKSHQERDLIKVVNMVLPL :: :.:. NP_112 EKPYECDKCGKAFISPSSLSRHEIIHTGEKP 590 600 610 620 >>XP_016882730 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger pro (628 aa) initn: 3429 init1: 1801 opt: 1848 Z-score: 1008.7 bits: 196.8 E(85289): 1.9e-49 Smith-Waterman score: 1848; 46.4% identity (67.6% similar) in 605 aa overlap (16-614:29-623) 10 20 30 40 pF1KB8 MDSVVFEDVAVDFTLEEWALLDSAQRDLYRDVMLETFQNLASVDDET : ::. . . .: .. . :: : : :: XP_016 MLDTFRLLVSVGHWLPKPNVISLLEQEAELWAVESRLPQGVYPEIKGH-FQFLLLSDLET 10 20 30 40 50 50 60 70 80 90 100 pF1KB8 QFKASGSVSQQDIYGEKIPKESKIATFTRNVSW----ASVLGKI-WDSLSIEDQTTNQGR . :.. :: .: : : . . : . : .. :. :. :.:. .. . XP_016 RPKVKLSVLKQGISEEISNSVILVERFLWDGLWYCRGEDTEGHWEWSCESLESLAVPVAF 60 70 80 90 100 110 110 120 130 140 150 160 pF1KB8 NLSRNHGLERLCESNDQCGEALSQIPHLNLYKKIPPGVKQYEYNTYGKVFMHRRTSLKSP . .. ::. . . :: .: : : : . . ..: :: ... .:. 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