Result of FASTA (ccds) for
pF1KB8378
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8378, 558 aa
1>>>pF1KB8378 558 - 558 aa - 558 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1046+/-0.000856; mu= 14.0380+/- 0.051
mean_var=71.7800+/-14.317, 0's: 0 Z-trim(106.6): 75 B-trim: 65 in 1/52
Lambda= 0.151381
statistics sampled from 8985 (9060) to 8985 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.647), E-opt: 0.2 (0.278), width: 16
Scan time: 3.250
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS10981.1 CPNE7 gene_id:27132|Hs108|chr16 ( 558) 3761 830.8 0
CCDS10980.1 CPNE7 gene_id:27132|Hs108|chr16 ( 633) 2953 654.4 1.2e-187
CCDS3072.1 CPNE4 gene_id:131034|Hs108|chr3 ( 557) 2625 582.7 3.9e-166
CCDS75010.1 CPNE4 gene_id:131034|Hs108|chr3 ( 575) 2625 582.7 4e-166
CCDS9607.1 CPNE6 gene_id:9362|Hs108|chr14 ( 557) 2432 540.6 1.9e-153
CCDS61413.1 CPNE6 gene_id:9362|Hs108|chr14 ( 612) 2432 540.6 2.1e-153
CCDS6243.1 CPNE3 gene_id:8895|Hs108|chr8 ( 537) 2027 452.1 7.7e-127
CCDS10774.1 CPNE2 gene_id:221184|Hs108|chr16 ( 548) 2015 449.5 4.9e-126
CCDS13260.1 CPNE1 gene_id:8904|Hs108|chr20 ( 537) 1860 415.6 7.4e-116
CCDS46595.1 CPNE1 gene_id:8904|Hs108|chr20 ( 542) 1860 415.6 7.4e-116
CCDS8733.1 CPNE8 gene_id:144402|Hs108|chr12 ( 564) 1721 385.3 1.1e-106
CCDS2574.2 CPNE9 gene_id:151835|Hs108|chr3 ( 553) 1635 366.5 4.7e-101
CCDS77695.1 CPNE9 gene_id:151835|Hs108|chr3 ( 503) 1521 341.6 1.3e-93
CCDS4825.1 CPNE5 gene_id:57699|Hs108|chr6 ( 593) 1375 309.7 6.2e-84
CCDS83078.1 CPNE5 gene_id:57699|Hs108|chr6 ( 301) 975 222.3 6.6e-58
>>CCDS10981.1 CPNE7 gene_id:27132|Hs108|chr16 (558 aa)
initn: 3761 init1: 3761 opt: 3761 Z-score: 4437.0 bits: 830.8 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3761; 100.0% identity (100.0% similar) in 558 aa overlap (1-558:1-558)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MSAGSERGAAATPGGLPAPCASKVELRLSCRHLLDRDPLTKSDPSVALLQQAQGQWVQVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MSAGSERGAAATPGGLPAPCASKVELRLSCRHLLDRDPLTKSDPSVALLQQAQGQWVQVG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 RTEVVRSSLHPVFSKVFTVDYYFEEVQRLRFEVYDTHGPSGFSCQEDDFLGGMECTLGQI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 RTEVVRSSLHPVFSKVFTVDYYFEEVQRLRFEVYDTHGPSGFSCQEDDFLGGMECTLGQI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 VAQKKVTRPLLLKFGRNAGKSTITVIAEDISGNNGYVELSFRARKLDDKDLFSKSDPFLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 VAQKKVTRPLLLKFGRNAGKSTITVIAEDISGNNGYVELSFRARKLDDKDLFSKSDPFLE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 LYRVNDDQGLQLVYRTEVVKNNLNPVWEAFKVSLSSLCSCEETRPLKCLVWDYDSRGKHD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LYRVNDDQGLQLVYRTEVVKNNLNPVWEAFKVSLSSLCSCEETRPLKCLVWDYDSRGKHD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 FIGEFSTTFEEMQKAFEEGQAQWDCVNPKYKQKRRSYKNSGVVVLADLKFHRVYSFLDYI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 FIGEFSTTFEEMQKAFEEGQAQWDCVNPKYKQKRRSYKNSGVVVLADLKFHRVYSFLDYI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 MGGCQIHFTVAIDFTASNGDPRNSCSLHYINPYQPNEYLKALVSVGEICQDYDSDKRFSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MGGCQIHFTVAIDFTASNGDPRNSCSLHYINPYQPNEYLKALVSVGEICQDYDSDKRFSA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 LGFGARIPPKYEVSHDFAINFNPEDDECEGIQGVVEAYQNCLPRVQLYGPTNVAPIISKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LGFGARIPPKYEVSHDFAINFNPEDDECEGIQGVVEAYQNCLPRVQLYGPTNVAPIISKV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 ARVAAAEESTGKASQYYILLILTDGVVTDMADTREAIVRASRLPMSIIIVGVGNADFTDM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 ARVAAAEESTGKASQYYILLILTDGVVTDMADTREAIVRASRLPMSIIIVGVGNADFTDM
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB8 QVLDGDDGVLRSPRGEPALRDIVQFVPFRELKNASPAALAKCVLAEVPKQVVEYYSHRGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 QVLDGDDGVLRSPRGEPALRDIVQFVPFRELKNASPAALAKCVLAEVPKQVVEYYSHRGL
490 500 510 520 530 540
550
pF1KB8 PPRSLGVPAGEASPGCTP
::::::::::::::::::
CCDS10 PPRSLGVPAGEASPGCTP
550
>>CCDS10980.1 CPNE7 gene_id:27132|Hs108|chr16 (633 aa)
initn: 2953 init1: 2953 opt: 2953 Z-score: 3482.4 bits: 654.4 E(32554): 1.2e-187
Smith-Waterman score: 3310; 87.3% identity (87.3% similar) in 590 aa overlap (44-558:44-633)
20 30 40 50 60 70
pF1KB8 GGLPAPCASKVELRLSCRHLLDRDPLTKSDPSVALLQQAQGQWVQVGRTEVVRSSLHPVF
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 GGLPAPCASKVELRLSCRHLLDRDPLTKSDPSVALLQQAQGQWVQVGRTEVVRSSLHPVF
20 30 40 50 60 70
80 90 100 110
pF1KB8 SKVFTVDYYFEEVQRLRFEVYDTHGPSGFSCQEDDFLGGMECTLGQ--------------
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 SKVFTVDYYFEEVQRLRFEVYDTHGPSGFSCQEDDFLGGMECTLGQPAQKWLLQVVMRVS
80 90 100 110 120 130
pF1KB8 ------------------------------------------------------------
CCDS10 VDVLGPAGHCAKHFLCCTESSHLARTGPSFLLRYDDLCLPWATAGAVRWWTCRGGHTQGW
140 150 160 170 180 190
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 -IVAQKKVTRPLLLKFGRNAGKSTITVIAEDISGNNGYVELSFRARKLDDKDLFSKSDPF
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 QIVAQKKVTRPLLLKFGRNAGKSTITVIAEDISGNNGYVELSFRARKLDDKDLFSKSDPF
200 210 220 230 240 250
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 LELYRVNDDQGLQLVYRTEVVKNNLNPVWEAFKVSLSSLCSCEETRPLKCLVWDYDSRGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LELYRVNDDQGLQLVYRTEVVKNNLNPVWEAFKVSLSSLCSCEETRPLKCLVWDYDSRGK
260 270 280 290 300 310
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 HDFIGEFSTTFEEMQKAFEEGQAQWDCVNPKYKQKRRSYKNSGVVVLADLKFHRVYSFLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 HDFIGEFSTTFEEMQKAFEEGQAQWDCVNPKYKQKRRSYKNSGVVVLADLKFHRVYSFLD
320 330 340 350 360 370
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 YIMGGCQIHFTVAIDFTASNGDPRNSCSLHYINPYQPNEYLKALVSVGEICQDYDSDKRF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 YIMGGCQIHFTVAIDFTASNGDPRNSCSLHYINPYQPNEYLKALVSVGEICQDYDSDKRF
380 390 400 410 420 430
360 370 380 390 400 410
pF1KB8 SALGFGARIPPKYEVSHDFAINFNPEDDECEGIQGVVEAYQNCLPRVQLYGPTNVAPIIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 SALGFGARIPPKYEVSHDFAINFNPEDDECEGIQGVVEAYQNCLPRVQLYGPTNVAPIIS
440 450 460 470 480 490
420 430 440 450 460 470
pF1KB8 KVARVAAAEESTGKASQYYILLILTDGVVTDMADTREAIVRASRLPMSIIIVGVGNADFT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 KVARVAAAEESTGKASQYYILLILTDGVVTDMADTREAIVRASRLPMSIIIVGVGNADFT
500 510 520 530 540 550
480 490 500 510 520 530
pF1KB8 DMQVLDGDDGVLRSPRGEPALRDIVQFVPFRELKNASPAALAKCVLAEVPKQVVEYYSHR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 DMQVLDGDDGVLRSPRGEPALRDIVQFVPFRELKNASPAALAKCVLAEVPKQVVEYYSHR
560 570 580 590 600 610
540 550
pF1KB8 GLPPRSLGVPAGEASPGCTP
::::::::::::::::::::
CCDS10 GLPPRSLGVPAGEASPGCTP
620 630
>--
initn: 291 init1: 291 opt: 291 Z-score: 340.4 bits: 73.0 E(32554): 1.2e-12
Smith-Waterman score: 291; 100.0% identity (100.0% similar) in 43 aa overlap (1-43:1-43)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MSAGSERGAAATPGGLPAPCASKVELRLSCRHLLDRDPLTKSDPSVALLQQAQGQWVQVG
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MSAGSERGAAATPGGLPAPCASKVELRLSCRHLLDRDPLTKSDPSVALLQQAQGQWVQVG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 RTEVVRSSLHPVFSKVFTVDYYFEEVQRLRFEVYDTHGPSGFSCQEDDFLGGMECTLGQI
CCDS10 RTEVVRSSLHPVFSKVFTVDYYFEEVQRLRFEVYDTHGPSGFSCQEDDFLGGMECTLGQP
70 80 90 100 110 120
>>CCDS3072.1 CPNE4 gene_id:131034|Hs108|chr3 (557 aa)
initn: 2636 init1: 2159 opt: 2625 Z-score: 3096.2 bits: 582.7 E(32554): 3.9e-166
Smith-Waterman score: 2625; 70.5% identity (89.6% similar) in 536 aa overlap (9-543:11-543)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MSAGSERGAAATPGGLPAPCASKVELRLSCRHLLDRDPLTKSDPSVALLQQAQGQWVQ
:: : : . .:: .:::::..:. . ::: :.: :: : : .:..::: .
CCDS30 MKKMSNIYESAANTLGIFNSPCLTKVELRVACKGISDRDALSKPDPCVILKMQSHGQWFE
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 VGRTEVVRSSLHPVFSKVFTVDYYFEEVQRLRFEVYD-THGPSGFSCQEDDFLGGMECTL
: ::::.:. ..::.::.::::.::::::::::::.: . . .:. .: ::::::::::
CCDS30 VDRTEVIRTCINPVYSKLFTVDFYFEEVQRLRFEVHDISSNHNGL--KEADFLGGMECTL
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 GQIVAQKKVTRPLLLKFGRNAGKSTITVIAEDISGNNGYVELSFRARKLDDKDLFSKSDP
::::.:.:... :: : : .::::.::::::..:::. ::::.: ::::::::.::::::
CCDS30 GQIVSQRKLSKSLL-KHGNTAGKSSITVIAEELSGNDDYVELAFNARKLDDKDFFSKSDP
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 FLELYRVNDDQGLQLVYRTEVVKNNLNPVWEAFKVSLSSLCSCEETRPLKCLVWDYDSRG
:::..:.::: :::.::::: :::.:.:..::::..:::: . : :::.:::.:: :
CCDS30 FLEIFRMNDDATQQLVHRTEVVMNNLSPAWKSFKVSVNSLCSGDPDRRLKCIVWDWDSNG
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 KHDFIGEFSTTFEEMQKAFEEGQAQWDCVNPKYKQKRRSYKNSGVVVLADLKFHRVYSFL
::::::::..::.::. :.: :.::.:.::::: :...:::::.:.: :.:...:::
CCDS30 KHDFIGEFTSTFKEMRGAMEGKQVQWECINPKYKAKKKNYKNSGTVILNLCKIHKMHSFL
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 DYIMGGCQIHFTVAIDFTASNGDPRNSCSLHYINPYQPNEYLKALVSVGEICQDYDSDKR
:::::::::.:::::::::::::::::::::::.::::::::::::.::::::::::::
CCDS30 DYIMGGCQIQFTVAIDFTASNGDPRNSCSLHYIHPYQPNEYLKALVAVGEICQDYDSDKM
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB8 FSALGFGARIPPKYEVSHDFAINFNPEDDECEGIQGVVEAYQNCLPRVQLYGPTNVAPII
: :.::::::::.: :::::::::: .. :: ::::::::::.:::..:::::::.::::
CCDS30 FPAFGFGARIPPEYTVSHDFAINFNEDNPECAGIQGVVEAYQSCLPKLQLYGPTNIAPII
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB8 SKVARVAAAEESTGKASQYYILLILTDGVVTDMADTREAIVRASRLPMSIIIVGVGNADF
.:::. :. : .: .::::.:::::::::.:::::::::::.::.::::.::::::::::
CCDS30 QKVAKSASEETNTKEASQYFILLILTDGVITDMADTREAIVHASHLPMSVIIVGVGNADF
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KB8 TDMQVLDGDDGVLRSPRGEPALRDIVQFVPFRELKNASPAALAKCVLAEVPKQVVEYYSH
.:::.::::::.::::.:::.:::::::::::..:.:::::::: ::::::.:::.::.
CCDS30 SDMQMLDGDDGILRSPKGEPVLRDIVQFVPFRNFKHASPAALAKSVLAEVPNQVVDYYNG
480 490 500 510 520 530
540 550
pF1KB8 RGLPPRSLGVPAGEASPGCTP
.:. :.
CCDS30 KGIKPKCSSEMYESSRTLAP
540 550
>>CCDS75010.1 CPNE4 gene_id:131034|Hs108|chr3 (575 aa)
initn: 2636 init1: 2159 opt: 2625 Z-score: 3095.9 bits: 582.7 E(32554): 4e-166
Smith-Waterman score: 2625; 70.5% identity (89.6% similar) in 536 aa overlap (9-543:29-561)
10 20 30 40
pF1KB8 MSAGSERGAAATPGGLPAPCASKVELRLSCRHLLDRDPLT
:: : : . .:: .:::::..:. . ::: :.
CCDS75 MAVEPSSSESIKRRAGRRMKKMSNIYESAANTLGIFNSPCLTKVELRVACKGISDRDALS
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90
pF1KB8 KSDPSVALLQQAQGQWVQVGRTEVVRSSLHPVFSKVFTVDYYFEEVQRLRFEVYD-THGP
: :: : : .:..::: .: ::::.:. ..::.::.::::.::::::::::::.: . .
CCDS75 KPDPCVILKMQSHGQWFEVDRTEVIRTCINPVYSKLFTVDFYFEEVQRLRFEVHDISSNH
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KB8 SGFSCQEDDFLGGMECTLGQIVAQKKVTRPLLLKFGRNAGKSTITVIAEDISGNNGYVEL
.:. .: ::::::::::::::.:.:... :: : : .::::.::::::..:::. ::::
CCDS75 NGL--KEADFLGGMECTLGQIVSQRKLSKSLL-KHGNTAGKSSITVIAEELSGNDDYVEL
130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KB8 SFRARKLDDKDLFSKSDPFLELYRVNDDQGLQLVYRTEVVKNNLNPVWEAFKVSLSSLCS
.: ::::::::.:::::::::..:.::: :::.::::: :::.:.:..::::..::::
CCDS75 AFNARKLDDKDFFSKSDPFLEIFRMNDDATQQLVHRTEVVMNNLSPAWKSFKVSVNSLCS
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KB8 CEETRPLKCLVWDYDSRGKHDFIGEFSTTFEEMQKAFEEGQAQWDCVNPKYKQKRRSYKN
. : :::.:::.:: :::::::::..::.::. :.: :.::.:.::::: :...:::
CCDS75 GDPDRRLKCIVWDWDSNGKHDFIGEFTSTFKEMRGAMEGKQVQWECINPKYKAKKKNYKN
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KB8 SGVVVLADLKFHRVYSFLDYIMGGCQIHFTVAIDFTASNGDPRNSCSLHYINPYQPNEYL
::.:.: :.:...::::::::::::.:::::::::::::::::::::::.::::::::
CCDS75 SGTVILNLCKIHKMHSFLDYIMGGCQIQFTVAIDFTASNGDPRNSCSLHYIHPYQPNEYL
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KB8 KALVSVGEICQDYDSDKRFSALGFGARIPPKYEVSHDFAINFNPEDDECEGIQGVVEAYQ
::::.:::::::::::: : :.::::::::.: :::::::::: .. :: ::::::::::
CCDS75 KALVAVGEICQDYDSDKMFPAFGFGARIPPEYTVSHDFAINFNEDNPECAGIQGVVEAYQ
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430 440 450
pF1KB8 NCLPRVQLYGPTNVAPIISKVARVAAAEESTGKASQYYILLILTDGVVTDMADTREAIVR
.:::..:::::::.::::.:::. :. : .: .::::.:::::::::.:::::::::::.
CCDS75 SCLPKLQLYGPTNIAPIIQKVAKSASEETNTKEASQYFILLILTDGVITDMADTREAIVH
420 430 440 450 460 470
460 470 480 490 500 510
pF1KB8 ASRLPMSIIIVGVGNADFTDMQVLDGDDGVLRSPRGEPALRDIVQFVPFRELKNASPAAL
::.::::.::::::::::.:::.::::::.::::.:::.:::::::::::..:.::::::
CCDS75 ASHLPMSVIIVGVGNADFSDMQMLDGDDGILRSPKGEPVLRDIVQFVPFRNFKHASPAAL
480 490 500 510 520 530
520 530 540 550
pF1KB8 AKCVLAEVPKQVVEYYSHRGLPPRSLGVPAGEASPGCTP
:: ::::::.:::.::. .:. :.
CCDS75 AKSVLAEVPNQVVDYYNGKGIKPKCSSEMYESSRTLAP
540 550 560 570
>>CCDS9607.1 CPNE6 gene_id:9362|Hs108|chr14 (557 aa)
initn: 2428 init1: 1440 opt: 2432 Z-score: 2868.4 bits: 540.6 E(32554): 1.9e-153
Smith-Waterman score: 2432; 66.4% identity (86.2% similar) in 542 aa overlap (14-548:7-544)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MSAGSERGAAATPGGLPAP-----CASKVELRLSCRHLLDRDPLTKSDPSVALLQQAQGQ
: .: : ::.::::.::. ::::: ::: : : : .. :
CCDS96 MSDPEMGWVPEPPTMTLGASRVELRVSCHGLLDRDTLTKPHPCVLLKLYSDEQ
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 WVQVGRTEVVRSSLHPVFSKVFTVDYYFEEVQRLRFEVYDTHGPSGFSCQEDDFLGGMEC
::.: ::::.:: ::::.:....:.::: : :.:.:.:.. .. : ..: :::. ::
CCDS96 WVEVERTEVLRSCSSPVFSRVLALEYFFEEKQPLQFHVFDAED-GATSPRNDTFLGSTEC
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 TLGQIVAQKKVTRPLLLKFGRNAGKSTITVIAEDISGNNGYVELSFRARKLDDKDLFSKS
::::::.: :::.::::: :..:::::::..::..::.: ::.:.::: :::.:::::::
CCDS96 TLGQIVSQTKVTKPLLLKNGKTAGKSTITIVAEEVSGTNDYVQLTFRAYKLDNKDLFSKS
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 DPFLELYRVNDDQGLQLVYRTEVVKNNLNPVWEAFKVSLSSLCSCEETRPLKCLVWDYDS
:::.:.:..:.::. :::.::::::::::: :: :..:: :::::. :::: ::.::::
CCDS96 DPFMEIYKTNEDQSDQLVWRTEVVKNNLNPSWEPFRLSLHSLCSCDVHRPLKFLVYDYDS
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 RGKHDFIGEFSTTFEEMQKAFEE-GQA-QWDCVNPKYKQKRRSYKNSGVVVLADLKFHRV
:::::::::..::.:::.. . :: ::::.::::..:...::.::.::::. ..:
CCDS96 SGKHDFIGEFTSTFQEMQEGTANPGQEMQWDCINPKYRDKKKNYKSSGTVVLAQCTVEKV
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 YSFLDYIMGGCQIHFTVAIDFTASNGDPRNSCSLHYINPYQPNEYLKALVSVGEICQDYD
..::::::::::: :::::::::::::::.: ::: ..: :::.::.:: .:: ::::::
CCDS96 HTFLDYIMGGCQISFTVAIDFTASNGDPRSSQSLHCLSPRQPNHYLQALRAVGGICQDYD
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB8 SDKRFSALGFGARIPPKYEVSHDFAINFNPEDDECEGIQGVVEAYQNCLPRVQLYGPTNV
::::: :.::::::::..::::::::::.::. ::: :.::. .:. :::..::::::::
CCDS96 SDKRFPAFGFGARIPPNFEVSHDFAINFDPENPECEEISGVIASYRRCLPQIQLYGPTNV
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB8 APIISKVARVAAAEESTGKASQYYILLILTDGVVTDMADTREAIVRASRLPMSIIIVGVG
::::..::. : :.:::.:..: .::.::::::.:::.:: ::::::::::::::::::
CCDS96 APIINRVAEPAQREQSTGQATKYSVLLVLTDGVVSDMAETRTAIVRASRLPMSIIIVGVG
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KB8 NADFTDMQVLDGDDGVLRSPRGEPALRDIVQFVPFRELKNASPAALAKCVLAEVPKQVVE
::::.::..:::::: :: ::: :: ::::::::::..:.:.:.:::::::::::.::::
CCDS96 NADFSDMRLLDGDDGPLRCPRGVPAARDIVQFVPFRDFKDAAPSALAKCVLAEVPRQVVE
480 490 500 510 520 530
540 550
pF1KB8 YYSHRGLPPRSLGVPAGEASPGCTP
::. .:. : :.:
CCDS96 YYASQGISP---GAPRPCTLATTPSPSP
540 550
>>CCDS61413.1 CPNE6 gene_id:9362|Hs108|chr14 (612 aa)
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Smith-Waterman score: 2432; 66.4% identity (86.2% similar) in 542 aa overlap (14-548:62-599)
10 20 30
pF1KB8 MSAGSERGAAATPGGLPAP-----CASKVELRLSCRHLLDRDP
: .: : ::.::::.::. :::::
CCDS61 WSSKGVRARAREPERGAPDREPSDMSDPEMGWVPEPPTMTLGASRVELRVSCHGLLDRDT
40 50 60 70 80 90
40 50 60 70 80 90
pF1KB8 LTKSDPSVALLQQAQGQWVQVGRTEVVRSSLHPVFSKVFTVDYYFEEVQRLRFEVYDTHG
::: : : : .. :::.: ::::.:: ::::.:....:.::: : :.:.:.:..
CCDS61 LTKPHPCVLLKLYSDEQWVEVERTEVLRSCSSPVFSRVLALEYFFEEKQPLQFHVFDAED
100 110 120 130 140 150
100 110 120 130 140 150
pF1KB8 PSGFSCQEDDFLGGMECTLGQIVAQKKVTRPLLLKFGRNAGKSTITVIAEDISGNNGYVE
.. : ..: :::. ::::::::.: :::.::::: :..:::::::..::..::.: ::.
CCDS61 -GATSPRNDTFLGSTECTLGQIVSQTKVTKPLLLKNGKTAGKSTITIVAEEVSGTNDYVQ
160 170 180 190 200 210
160 170 180 190 200 210
pF1KB8 LSFRARKLDDKDLFSKSDPFLELYRVNDDQGLQLVYRTEVVKNNLNPVWEAFKVSLSSLC
:.::: :::.::::::::::.:.:..:.::. :::.::::::::::: :: :..:: :::
CCDS61 LTFRAYKLDNKDLFSKSDPFMEIYKTNEDQSDQLVWRTEVVKNNLNPSWEPFRLSLHSLC
220 230 240 250 260 270
220 230 240 250 260 270
pF1KB8 SCEETRPLKCLVWDYDSRGKHDFIGEFSTTFEEMQKAFEE-GQA-QWDCVNPKYKQKRRS
::. :::: ::.:::: :::::::::..::.:::.. . :: ::::.::::..:...
CCDS61 SCDVHRPLKFLVYDYDSSGKHDFIGEFTSTFQEMQEGTANPGQEMQWDCINPKYRDKKKN
280 290 300 310 320 330
280 290 300 310 320 330
pF1KB8 YKNSGVVVLADLKFHRVYSFLDYIMGGCQIHFTVAIDFTASNGDPRNSCSLHYINPYQPN
::.::.::::. ..:..::::::::::: :::::::::::::::.: ::: ..: :::
CCDS61 YKSSGTVVLAQCTVEKVHTFLDYIMGGCQISFTVAIDFTASNGDPRSSQSLHCLSPRQPN
340 350 360 370 380 390
340 350 360 370 380 390
pF1KB8 EYLKALVSVGEICQDYDSDKRFSALGFGARIPPKYEVSHDFAINFNPEDDECEGIQGVVE
.::.:: .:: ::::::::::: :.::::::::..::::::::::.::. ::: :.::.
CCDS61 HYLQALRAVGGICQDYDSDKRFPAFGFGARIPPNFEVSHDFAINFDPENPECEEISGVIA
400 410 420 430 440 450
400 410 420 430 440 450
pF1KB8 AYQNCLPRVQLYGPTNVAPIISKVARVAAAEESTGKASQYYILLILTDGVVTDMADTREA
.:. :::..::::::::::::..::. : :.:::.:..: .::.::::::.:::.:: :
CCDS61 SYRRCLPQIQLYGPTNVAPIINRVAEPAQREQSTGQATKYSVLLVLTDGVVSDMAETRTA
460 470 480 490 500 510
460 470 480 490 500 510
pF1KB8 IVRASRLPMSIIIVGVGNADFTDMQVLDGDDGVLRSPRGEPALRDIVQFVPFRELKNASP
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CCDS61 IVRASRLPMSIIIVGVGNADFSDMRLLDGDDGPLRCPRGVPAARDIVQFVPFRDFKDAAP
520 530 540 550 560 570
520 530 540 550
pF1KB8 AALAKCVLAEVPKQVVEYYSHRGLPPRSLGVPAGEASPGCTP
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CCDS61 SALAKCVLAEVPRQVVEYYASQGISP---GAPRPCTLATTPSPSP
580 590 600 610
>>CCDS6243.1 CPNE3 gene_id:8895|Hs108|chr8 (537 aa)
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Smith-Waterman score: 2027; 56.1% identity (81.4% similar) in 531 aa overlap (16-544:1-529)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MSAGSERGAAATPGGLPAPCASKVELRLSCRHLLDRDPLTKSDPSVALLQQAQGQ-WVQV
. : :..:: : .:: .:::.: .:::: .:. ...:: : .:
CCDS62 MAAQCVTKVALNVSCANLLDKDIGSKSDPLCVLFLNTSGQQWYEV
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 GRTEVVRSSLHPVFSKVFTVDYYFEEVQRLRFEVYDTHGPSGFSCQEDDFLGGMECTLGQ
::: ... :.: :::.: .::::: ::.:.: ::: . . . ..::::: ::::::
CCDS62 ERTERIKNCLNPQFSKTFIIDYYFEVVQKLKFGVYDIDNKT-IELSDDDFLGECECTLGQ
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 IVAQKKVTRPLLLKFGRNAGKSTITVIAEDISGNNGYVELSFRARKLDDKDLFSKSDPFL
::..::.::::..: :: :::..::. ::.:. .: : . ..:::::.::::.::::.:
CCDS62 IVSSKKLTRPLVMKTGRPAGKGSITISAEEIK-DNRVVLFEMEARKLDNKDLFGKSDPYL
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 ELYRVNDDQGLQLVYRTEVVKNNLNPVWEAFKVSLSSLCSCEETRPLKCLVWDYDSRGKH
:... ..: . .:.:::::::::::::. ::.::.::: . . .: .:::. :.:
CCDS62 EFHKQTSDGNWLMVHRTEVVKNNLNPVWRPFKISLNSLCYGDMDKTIKVECYDYDNDGSH
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 DFIGEFSTTFEEMQKAFEEGQAQWDCVNPKYKQKRRSYKNSGVVVLADLKFHRVYSFLDY
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CCDS62 DLIGTFQTTMTKLKEASRSSPVEFECINEKKRQKKKSYKNSGVISVKQCEITVECTFLDY
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 IMGGCQIHFTVAIDFTASNGDPRNSCSLHYINPYQPNEYLKALVSVGEICQDYDSDKRFS
::::::..:::..:::.::::::. :::::.: :::: :: ::: . ::::.:: :
CCDS62 IMGGCQLNFTVGVDFTGSNGDPRSPDSLHYISPNGVNEYLTALWSVGLVIQDYDADKMFP
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KB8 ALGFGARIPPKYEVSHDFAINFNPEDDECEGIQGVVEAYQNCLPRVQLYGPTNVAPIISK
:.::::.:::...:::.: .:::: . :.::::.::::..:::...:::::: .:::..
CCDS62 AFGFGAQIPPQWQVSHEFPMNFNPSNPYCNGIQGIVEAYRSCLPQIKLYGPTNFSPIINH
350 360 370 380 390 400
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pF1KB8 VARVAAAEESTGKASQYYILLILTDGVVTDMADTREAIVRASRLPMSIIIVGVGNADFTD
::: ::: . ::::..:::.::::.::. .::.::: ::::::::::::::.:::.
CCDS62 VARFAAAATQQQTASQYFVLLIITDGVITDLDETRQAIVNASRLPMSIIIVGVGGADFSA
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480 490 500 510 520 530
pF1KB8 MQVLDGDDGVLRSPRGEPALRDIVQFVPFRELKNASPAALAKCVLAEVPKQVVEYY-SHR
:. :::: : :::: :: :.::::::::::...:: :::.:::::.:.::: :. ...
CCDS62 MEFLDGDGGSLRSPLGEVAIRDIVQFVPFRQFQNAPKEALAQCVLAEIPQQVVGYFNTYK
470 480 490 500 510 520
540 550
pF1KB8 GLPPRSLGVPAGEASPGCTP
:::..
CCDS62 LLPPKNPATKQQKQ
530
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Smith-Waterman score: 2015; 53.9% identity (80.6% similar) in 542 aa overlap (1-542:4-542)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MSAGSERGAAATPGGLPAPCASKVELRLSCRHLLDRDPLTKSDPSVALLQQAQGQWV
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CCDS10 MAHIPSGGAPAAGAAPMG-PQYCVCKVELSVSGQNLLDRDVTSKSDPFCVLFTENNGRWI
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 QVGRTEVVRSSLHPVFSKVFTVDYYFEEVQRLRFEVYDTHGPSGFSCQEDDFLGGMECTL
. :::.. ..:.:.::: :..::.:::::.:.: ..: . :.. .: :::: . :.:
CCDS10 EYDRTETAINNLNPAFSKKFVLDYHFEEVQKLKFALFD-QDKSSMRLDEHDFLGQFSCSL
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 GQIVAQKKVTRPLLLKFGRNAGKSTITVIAEDISGNNGYVELSFRARKLDDKDLFSKSDP
: ::..::.:::::: . :::. ::. :...: .: . ::. .:.:: ::::.::::
CCDS10 GTIVSSKKITRPLLLLNDKPAGKGLITIAAQELS-DNRVITLSLAGRRLDKKDLFGKSDP
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 FLELYRVNDDQGLQLVYRTEVVKNNLNPVWEAFKVSLSSLCSCEETRPLKCLVWDYDSRG
:::.:. .:: .::.::::.: .:.:::. : : : :::. . .:.. . .:::. :
CCDS10 FLEFYKPGDDGKWMLVHRTEVIKYTLDPVWKPFTVPLVSLCDGDMEKPIQVMCYDYDNDG
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 KHDFIGEFSTTFEEMQKAFEEGQAQWDCVNPKYKQKRRSYKNSGVVVLADLKFHRVYSFL
:::::::.:. .: .: . ...:.::: ..:...:::::...: . :..: ::::
CCDS10 GHDFIGEFQTSVSQMCEARDSVPLEFECINPKKQRKKKNYKNSGIIILRSCKINRDYSFL
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 DYIMGGCQIHFTVAIDFTASNGDPRNSCSLHYINPYQPNEYLKALVSVGEICQDYDSDKR
:::.::::. :::.::::::::.: . :::::::. ::::.:. .::.: :::::::
CCDS10 DYILGGCQLMFTVGIDFTASNGNPLDPSSLHYINPMGTNEYLSAIWAVGQIIQDYDSDKM
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB8 FSALGFGARIPPKYEVSHDFAINFNPEDDECEGIQGVVEAYQNCLPRVQLYGPTNVAPII
: ::::::..:: ..:::.::::::: . : :..:...::. :::....::::: .::.
CCDS10 FPALGFGAQLPPDWKVSHEFAINFNPTNPFCSGVDGIAQAYSACLPHIRFYGPTNFSPIV
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB8 SKVARVAAAEESTGKASQYYILLILTDGVVTDMADTREAIVRASRLPMSIIIVGVGNADF
..::: :: . :.::.::::.::::..:: .::.:.:.::.:::::::::::::::
CCDS10 NHVARFAAQATQQRTATQYFILLIITDGVISDMEETRHAVVQASKLPMSIIIVGVGNADF
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KB8 TDMQVLDGDDGVLRSPRGEPALRDIVQFVPFRELKNASPAALAKCVLAEVPKQVVEYYSH
. :. ::::. .::: :: : :::::::::::..::. .::: ::::.:.:::.:..:
CCDS10 AAMEFLDGDSRMLRSHTGEEAARDIVQFVPFREFRNAAKETLAKAVLAELPQQVVQYFKH
480 490 500 510 520 530
540 550
pF1KB8 RGLPPRSLGVPAGEASPGCTP
..:::
CCDS10 KNLPPTNSEPA
540
>>CCDS13260.1 CPNE1 gene_id:8904|Hs108|chr20 (537 aa)
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Smith-Waterman score: 1860; 51.7% identity (76.8% similar) in 542 aa overlap (18-558:2-535)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MSAGSERGAAATPGGLPAPCASKVELRLSCRHLLDRDPLTKSDPSVALLQQAQG-QWVQV
: :.. :.: .:: ::.:.: .:::: .:::.. : .:...
CCDS13 MAHCVTLVQLSISCDHLIDKDIGSKSDPLCVLLQDVGGGSWAEL
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 GRTEVVRSSLHPVFSKVFTVDYYFEEVQRLRFEVYDTHGPSGFSCQEDDFLGGMECTLGQ
:::: ::. : :::.. ..: :: ::.::: .:: . . ..:::::: ::.:::
CCDS13 GRTERVRNCSSPEFSKTLQLEYRFETVQKLRFGIYDIDNKTP-ELRDDDFLGGAECSLGQ
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 IVAQKKVTRPLLLKFGRNAGKSTITVIAEDISGNNGYVELSFRARKLDDKDLFSKSDPFL
::... .: ::.:: :. ::..:::: :.... .: : . .::.:: ::...::::::
CCDS13 IVSSQVLTLPLMLKPGKPAGRGTITVSAQELK-DNRVVTMEVEARNLDKKDFLGKSDPFL
110 120 130 140 150 160
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pF1KB8 ELYRVNDDQGLQLVYRTEVVKNNLNPVWEAFKVSLSSLCSCEETRPLKCLVWDYDSRGKH
:..: .: . .::::.::.::::::.:. :.: .. .:. . . :.. :::: :.:
CCDS13 EFFRQGDGK-WHLVYRSEVIKNNLNPTWKRFSVPVQHFCGGNPSTPIQVQCSDYDSDGSH
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 DFIGEFSTTFEEMQKAFEEGQAQWDCVNPKYKQKRRSYKNSGVVVLADLKFHRVYSFLDY
:.:: : :.. ..: . :...:..:. .::..::::::.. . . . ::::::
CCDS13 DLIGTFHTSLAQLQAV----PAEFECIHPEKQQKKKSYKNSGTIRVKICRVETEYSFLDY
230 240 250 260 270
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pF1KB8 IMGGCQIHFTVAIDFTASNGDPRNSCSLHYINPYQPNEYLKALVSVGEICQDYDSDKRFS
.::::::.:::..:::.::::: . ::::..: :::: :: ::: . ::::::: :
CCDS13 VMGGCQINFTVGVDFTGSNGDPSSPDSLHYLSPTGVNEYLMALWSVGSVVQDYDSDKLFP
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KB8 ALGFGARIPPKYEVSHDFAINFNPEDDECEGIQGVVEAYQNCLPRVQLYGPTNVAPIISK
:.::::..:: ..:::.::.:::: . : ::::.:.::.. ::.:.:::::: ::::..
CCDS13 AFGFGAQVPPDWQVSHEFALNFNPSNPYCAGIQGIVDAYRQALPQVRLYGPTNFAPIINH
340 350 360 370 380 390
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pF1KB8 VARVAAAEESTGKASQYYILLILTDGVVTDMADTREAIVRASRLPMSIIIVGVGNADFTD
::: :: : ::::..::.::::.:::. ::::.:::: ::::.::::::.:::
CCDS13 VARFAAQAAHQGTASQYFMLLLLTDGAVTDVEATREAVVRASNLPMSVIIVGVGGADFEA
400 410 420 430 440 450
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pF1KB8 MQVLDGDDGVLRSPRGEPALRDIVQFVPFRELKNASPAALAKCVLAEVPKQVVEYYSHRG
:. ::.: : :.. :. : ::::::::.:...:: :::. :::::: :.: :. .:
CCDS13 MEQLDADGGPLHTRSGQAAARDIVQFVPYRRFQNAPREALAQTVLAEVPTQLVSYFRAQG
460 470 480 490 500 510
540 550
pF1KB8 LPPRSLGVPAGEASPGCTP
: . .: . .:. .:
CCDS13 WAPLK-PLPPSAKDPAQAPQA
520 530
>>CCDS46595.1 CPNE1 gene_id:8904|Hs108|chr20 (542 aa)
initn: 1647 init1: 1143 opt: 1860 Z-score: 2193.4 bits: 415.6 E(32554): 7.4e-116
Smith-Waterman score: 1860; 51.7% identity (76.8% similar) in 542 aa overlap (18-558:7-540)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MSAGSERGAAATPGGLPAPCASKVELRLSCRHLLDRDPLTKSDPSVALLQQAQG-QWVQV
: :.. :.: .:: ::.:.: .:::: .:::.. : .:...
CCDS46 MKMMHMAHCVTLVQLSISCDHLIDKDIGSKSDPLCVLLQDVGGGSWAEL
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 GRTEVVRSSLHPVFSKVFTVDYYFEEVQRLRFEVYDTHGPSGFSCQEDDFLGGMECTLGQ
:::: ::. : :::.. ..: :: ::.::: .:: . . ..:::::: ::.:::
CCDS46 GRTERVRNCSSPEFSKTLQLEYRFETVQKLRFGIYDIDNKTP-ELRDDDFLGGAECSLGQ
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 IVAQKKVTRPLLLKFGRNAGKSTITVIAEDISGNNGYVELSFRARKLDDKDLFSKSDPFL
::... .: ::.:: :. ::..:::: :.... .: : . .::.:: ::...::::::
CCDS46 IVSSQVLTLPLMLKPGKPAGRGTITVSAQELK-DNRVVTMEVEARNLDKKDFLGKSDPFL
110 120 130 140 150 160
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pF1KB8 ELYRVNDDQGLQLVYRTEVVKNNLNPVWEAFKVSLSSLCSCEETRPLKCLVWDYDSRGKH
:..: .: . .::::.::.::::::.:. :.: .. .:. . . :.. :::: :.:
CCDS46 EFFRQGDGK-WHLVYRSEVIKNNLNPTWKRFSVPVQHFCGGNPSTPIQVQCSDYDSDGSH
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 DFIGEFSTTFEEMQKAFEEGQAQWDCVNPKYKQKRRSYKNSGVVVLADLKFHRVYSFLDY
:.:: : :.. ..: . :...:..:. .::..::::::.. . . . ::::::
CCDS46 DLIGTFHTSLAQLQAV----PAEFECIHPEKQQKKKSYKNSGTIRVKICRVETEYSFLDY
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 IMGGCQIHFTVAIDFTASNGDPRNSCSLHYINPYQPNEYLKALVSVGEICQDYDSDKRFS
.::::::.:::..:::.::::: . ::::..: :::: :: ::: . ::::::: :
CCDS46 VMGGCQINFTVGVDFTGSNGDPSSPDSLHYLSPTGVNEYLMALWSVGSVVQDYDSDKLFP
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KB8 ALGFGARIPPKYEVSHDFAINFNPEDDECEGIQGVVEAYQNCLPRVQLYGPTNVAPIISK
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