Result of FASTA (omim) for
pF1KB8383
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8383, 579 aa
1>>>pF1KB8383 579 - 579 aa - 579 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.6812+/-0.00084; mu= 13.9449+/- 0.052
mean_var=321.5117+/-65.867, 0's: 0 Z-trim(111.1): 2085 B-trim: 72 in 1/50
Lambda= 0.071528
statistics sampled from 17259 (19614) to 17259 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.541), E-opt: 0.2 (0.23), width: 16
Scan time: 8.650
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_008886 (OMIM: 194522) zinc finger protein 33B i ( 778) 1892 210.9 1.2e-53
NP_001291962 (OMIM: 194522) zinc finger protein 33 ( 785) 1892 211.0 1.2e-53
XP_011517952 (OMIM: 194521) PREDICTED: zinc finger ( 811) 1883 210.0 2.4e-53
NP_008885 (OMIM: 194521) zinc finger protein 33A i ( 811) 1883 210.0 2.4e-53
XP_016872106 (OMIM: 194521) PREDICTED: zinc finger ( 818) 1883 210.1 2.4e-53
NP_001311107 (OMIM: 194521) zinc finger protein 33 ( 818) 1883 210.1 2.4e-53
NP_001265102 (OMIM: 194521) zinc finger protein 33 ( 829) 1883 210.1 2.4e-53
NP_001265106 (OMIM: 194521) zinc finger protein 33 ( 832) 1883 210.1 2.4e-53
XP_011517953 (OMIM: 194521) PREDICTED: zinc finger ( 810) 1875 209.2 4.2e-53
NP_008905 (OMIM: 194521) zinc finger protein 33A i ( 810) 1875 209.2 4.2e-53
NP_001265099 (OMIM: 194521) zinc finger protein 33 ( 817) 1875 209.2 4.2e-53
XP_011542245 (OMIM: 300573) PREDICTED: zinc finger ( 580) 1561 176.6 2e-43
XP_011542243 (OMIM: 300573) PREDICTED: zinc finger ( 581) 1559 176.4 2.3e-43
NP_001034980 (OMIM: 300573) zinc finger protein 67 ( 581) 1559 176.4 2.3e-43
NP_001177346 (OMIM: 300573) zinc finger protein 67 ( 576) 1557 176.2 2.7e-43
NP_001139763 (OMIM: 300573) zinc finger protein 67 ( 575) 1551 175.5 4.1e-43
NP_443092 (OMIM: 612429) zinc finger protein 300 i ( 604) 1547 175.2 5.6e-43
NP_001166302 (OMIM: 612429) zinc finger protein 30 ( 620) 1547 175.2 5.7e-43
XP_011536004 (OMIM: 612429) PREDICTED: zinc finger ( 609) 1531 173.5 1.8e-42
XP_011517956 (OMIM: 194521) PREDICTED: zinc finger ( 732) 1495 169.9 2.5e-41
NP_001265105 (OMIM: 194521) zinc finger protein 33 ( 768) 1494 169.9 2.8e-41
XP_011517955 (OMIM: 194521) PREDICTED: zinc finger ( 733) 1492 169.6 3.1e-41
NP_001265104 (OMIM: 194521) zinc finger protein 33 ( 733) 1492 169.6 3.1e-41
NP_001291968 (OMIM: 194522) zinc finger protein 33 ( 666) 1411 161.2 9.8e-39
NP_001291964 (OMIM: 194522) zinc finger protein 33 ( 666) 1411 161.2 9.8e-39
NP_001291969 (OMIM: 194522) zinc finger protein 33 ( 666) 1411 161.2 9.8e-39
NP_001291967 (OMIM: 194522) zinc finger protein 33 ( 666) 1411 161.2 9.8e-39
NP_001291965 (OMIM: 194522) zinc finger protein 33 ( 666) 1411 161.2 9.8e-39
NP_001291966 (OMIM: 194522) zinc finger protein 33 ( 666) 1411 161.2 9.8e-39
XP_011542246 (OMIM: 300573) PREDICTED: zinc finger ( 545) 1401 160.0 1.8e-38
NP_001265100 (OMIM: 194521) zinc finger protein 33 ( 699) 1390 159.1 4.5e-38
NP_001311105 (OMIM: 194521) zinc finger protein 33 ( 699) 1390 159.1 4.5e-38
NP_001311104 (OMIM: 194521) zinc finger protein 33 ( 699) 1390 159.1 4.5e-38
NP_001265103 (OMIM: 194521) zinc finger protein 33 ( 699) 1390 159.1 4.5e-38
NP_001311106 (OMIM: 194521) zinc finger protein 33 ( 699) 1390 159.1 4.5e-38
NP_001265107 (OMIM: 194521) zinc finger protein 33 ( 699) 1390 159.1 4.5e-38
NP_001265108 (OMIM: 194521) zinc finger protein 33 ( 699) 1390 159.1 4.5e-38
NP_001166303 (OMIM: 612429) zinc finger protein 30 ( 568) 1370 156.8 1.7e-37
XP_005259333 (OMIM: 613905) PREDICTED: zinc finger ( 792) 1359 156.0 4.4e-37
NP_079303 (OMIM: 613905) zinc finger protein 606 [ ( 792) 1359 156.0 4.4e-37
NP_001269925 (OMIM: 604075) zinc finger protein 13 ( 671) 1327 152.5 4e-36
XP_011543981 (OMIM: 616290) PREDICTED: zinc finger (1059) 1318 151.9 9.5e-36
XP_016870103 (OMIM: 616290) PREDICTED: zinc finger (1059) 1318 151.9 9.5e-36
NP_001304845 (OMIM: 616290) zinc finger protein 65 (1059) 1318 151.9 9.5e-36
XP_005272572 (OMIM: 616290) PREDICTED: zinc finger (1059) 1318 151.9 9.5e-36
NP_149350 (OMIM: 616290) zinc finger protein 658 [ (1059) 1318 151.9 9.5e-36
NP_940937 (OMIM: 609571) zinc finger protein 699 [ ( 642) 1287 148.4 6.9e-35
XP_016881871 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 527) 1285 148.0 7.2e-35
XP_016881868 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 527) 1285 148.0 7.2e-35
NP_001317411 (OMIM: 613904) zinc finger protein 56 ( 527) 1285 148.0 7.2e-35
>>NP_008886 (OMIM: 194522) zinc finger protein 33B isofo (778 aa)
initn: 2363 init1: 1246 opt: 1892 Z-score: 1084.0 bits: 210.9 E(85289): 1.2e-53
Smith-Waterman score: 1946; 50.2% identity (71.3% similar) in 603 aa overlap (3-571:7-604)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MNKSQEQVSFKDVCVDFTQEEWYLLDPAQKILYRDVILENYSNLVSVGYCITKPEV
: : .:::::: : :::::: :::.:. :::::.::::::::::::: ::::
NP_008 MNKVDQKFQGSVSFKDVTVGFTQEEWQHLDPSQRALYRDVMLENYSNLVSVGYCAHKPEV
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 IFKIEQGEEPWILEKGFPSQCHPERKWKVDDVLESSQENEDDHFWELLFHNNKTVSVENG
::..::::::: ::. :::: :: : .: . : ::::.. :.::..: ::. .. :.:
NP_008 IFRLEQGEEPWRLEEEFPSQSFPEV-WTADHLKERSQENQSKHLWEVVFINNEMLTKEQG
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 DRGSKTFNLGTDPVSLRNYPYKIC--DSCEMNLKNISGLIISKKNCSRKKPDEFNVCEKL
. . ::. .. :.. .: :: :.....: :.::: : :: ::::.: ::
NP_008 NVIGIPFNMDVSSFPSRKM---FCQYDSRGMSFNTVSELVISKINYLGKKSDEFNACGKL
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 LLDIRHEKIPIGEKSYKYDQKRNAINYHQDLSQ----PSFGQSFEYSKNGQGFHDEAAFF
::.:.:.. ::. . ..::....... : .. ..:::: . . ..:.:
NP_008 LLNIKHDETHTREKN-EVLKNRNTLSHRENTLQHEKIQTLDHNFEYSICQETLLEKAVFN
180 190 200 210 220 230
240 250 260
pF1KB8 TNKRSQIGETVCKYNECGRTFIESLKLNISQRP-----HLE-------------------
: :: . :. : ::: :::: .: .: . : : : :
NP_008 TRKRENAEENNCDYNEFGRTFCDSSSLLFHQIPPSKDSHYEFSDCEKFLCVKSTLSKHDG
240 250 260 270 280 290
270 280 290 300 310 320
pF1KB8 --MEPYGCSICGKSFCMNLRFGH-QRALTKDNPYEYNEYGEIFCDNSAFIIHQGAYT-RK
.. : :. :..: .: ... :.. .. .: :: :. : ..: . :: ..: .:
NP_008 VPVKHYDCGESGNNFRRKLCLSQLQKGDKGEKHFECNECGKAFWEKSHLTRHQRVHTGEK
300 310 320 330 340 350
330 340 350 360 370 380
pF1KB8 ILREYKVSDKTWEKSALLKHQIVHMGGKSYDYNENGSNFSKKSHLTQLRRAHTGEKTFEC
.. . . :::: : ::: : : : .. :: :. ::.:: :: .:.::::: ..:
NP_008 HFQCNQCGKTFWEKSNLTKHQRSHTGEKPFECNECGKAFSHKSALTLHQRTHTGEKPYQC
360 370 380 390 400 410
390 400 410 420 430 440
pF1KB8 GECGKTFWEKSNLTQHQRTHTGEKPYECTECGKAFCQKPHLTNHQRTHTGEKPYECKQCG
. :::::..::.::.:::::::.::::: ::::.::.. ::: ::::::::::.:: .::
NP_008 NACGKTFYQKSDLTKHQRTHTGQKPYECYECGKSFCMNSHLTVHQRTHTGEKPFECLECG
420 430 440 450 460 470
450 460 470 480 490 500
pF1KB8 KTFCVKSNLTEHQRTHTGEKPYECNACGKSFCHRSALTVHQRTHTGEKPFICNECGKSFC
:.:: ::.::.::::: :.::::::::::.: :.:.:: :: ::: ::. : ::::.::
NP_008 KSFCQKSHLTQHQRTHIGDKPYECNACGKTFYHKSVLTRHQIIHTGLKPYECYECGKTFC
480 490 500 510 520 530
510 520 530 540 550 560
pF1KB8 VKSNLIVHQRTHTGEKPYKCNECGKTFCEKSALTKHQRTHTGEKPYECNACGKTFSQRSV
.::.: .::::::::::. : :::: : .::.:..: :::::::::::. ::: : ..:
NP_008 LKSDLTIHQRTHTGEKPFACPECGKFFSHKSTLSQHYRTHTGEKPYECHECGKIFYNKSY
540 550 560 570 580 590
570
pF1KB8 LTKHQRIHTRVKALSTS
::::.: ::
NP_008 LTKHNRTHTGEKPYECNECGKTFCQKSQLTQHQRIHIGEKPYECNECGKAFCHKSALIVH
600 610 620 630 640 650
>--
initn: 1425 init1: 925 opt: 925 Z-score: 544.8 bits: 111.2 E(85289): 1.3e-23
Smith-Waterman score: 925; 71.8% identity (83.3% similar) in 174 aa overlap (376-549:605-778)
350 360 370 380 390 400
pF1KB8 HMGGKSYDYNENGSNFSKKSHLTQLRRAHTGEKTFECGECGKTFWEKSNLTQHQRTHTGE
::: .::.:::::: .::.:::::: : ::
NP_008 HTGEKPYECHECGKIFYNKSYLTKHNRTHTGEKPYECNECGKTFCQKSQLTQHQRIHIGE
580 590 600 610 620 630
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pF1KB8 KPYECTECGKAFCQKPHLTNHQRTHTGEKPYECKQCGKTFCVKSNLTEHQRTHTGEKPYE
:::::.:::::::.: : :::::: ::::.:..:::.:::::.: :.: ::::::::
NP_008 KPYECNECGKAFCHKSALIVHQRTHTQEKPYKCNECGKSFCVKSGLILHERKHTGEKPYE
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pF1KB8 CNACGKSFCHRSALTVHQRTHTGEKPFICNECGKSFCVKSNLIVHQRTHTGEKPYKCNEC
:: ::::: :.:.::::.:.::::: :::::: : ::.: :::.:::::::.:: :
NP_008 CNECGKSFSHKSSLTVHHRAHTGEKSCQCNECGKIFYRKSDLAKHQRSHTGEKPYECNTC
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pF1KB8 GKTFCEKSALTKHQRTHTGEKPYECNACGKTFSQRSVLTKHQRIHTRVKALSTS
::: .:: : ::::: ::::::
NP_008 RKTFSQKSNLIVHQRTHIGEKPYE
760 770
>>NP_001291962 (OMIM: 194522) zinc finger protein 33B is (785 aa)
initn: 2363 init1: 1246 opt: 1892 Z-score: 1084.0 bits: 211.0 E(85289): 1.2e-53
Smith-Waterman score: 1946; 50.2% identity (71.3% similar) in 603 aa overlap (3-571:14-611)
10 20 30 40
pF1KB8 MNKSQEQVSFKDVCVDFTQEEWYLLDPAQKILYRDVILENYSNLVSVGY
: : .:::::: : :::::: :::.:. :::::.::::::::::::
NP_001 MANATRRESEVDQKFQGSVSFKDVTVGFTQEEWQHLDPSQRALYRDVMLENYSNLVSVGY
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB8 CITKPEVIFKIEQGEEPWILEKGFPSQCHPERKWKVDDVLESSQENEDDHFWELLFHNNK
: ::::::..::::::: ::. :::: :: : .: . : ::::.. :.::..: ::.
NP_001 CAHKPEVIFRLEQGEEPWRLEEEFPSQSFPEV-WTADHLKERSQENQSKHLWEVVFINNE
70 80 90 100 110
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pF1KB8 TVSVENGDRGSKTFNLGTDPVSLRNYPYKIC--DSCEMNLKNISGLIISKKNCSRKKPDE
.. :.:. . ::. .. :.. .: :: :.....: :.::: : :: ::
NP_001 MLTKEQGNVIGIPFNMDVSSFPSRKM---FCQYDSRGMSFNTVSELVISKINYLGKKSDE
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KB8 FNVCEKLLLDIRHEKIPIGEKSYKYDQKRNAINYHQDLSQ----PSFGQSFEYSKNGQGF
::.: ::::.:.:.. ::. . ..::....... : .. ..:::: . .
NP_001 FNACGKLLLNIKHDETHTREKN-EVLKNRNTLSHRENTLQHEKIQTLDHNFEYSICQETL
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260
pF1KB8 HDEAAFFTNKRSQIGETVCKYNECGRTFIESLKLNISQRP-----HLE------------
..:.: : :: . :. : ::: :::: .: .: . : : : :
NP_001 LEKAVFNTRKRENAEENNCDYNEFGRTFCDSSSLLFHQIPPSKDSHYEFSDCEKFLCVKS
240 250 260 270 280 290
270 280 290 300 310
pF1KB8 ---------MEPYGCSICGKSFCMNLRFGH-QRALTKDNPYEYNEYGEIFCDNSAFIIHQ
.. : :. :..: .: ... :.. .. .: :: :. : ..: . ::
NP_001 TLSKHDGVPVKHYDCGESGNNFRRKLCLSQLQKGDKGEKHFECNECGKAFWEKSHLTRHQ
300 310 320 330 340 350
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pF1KB8 GAYT-RKILREYKVSDKTWEKSALLKHQIVHMGGKSYDYNENGSNFSKKSHLTQLRRAHT
..: .: .. . . :::: : ::: : : : .. :: :. ::.:: :: .:.::
NP_001 RVHTGEKHFQCNQCGKTFWEKSNLTKHQRSHTGEKPFECNECGKAFSHKSALTLHQRTHT
360 370 380 390 400 410
380 390 400 410 420 430
pF1KB8 GEKTFECGECGKTFWEKSNLTQHQRTHTGEKPYECTECGKAFCQKPHLTNHQRTHTGEKP
::: ..:. :::::..::.::.:::::::.::::: ::::.::.. ::: ::::::::::
NP_001 GEKPYQCNACGKTFYQKSDLTKHQRTHTGQKPYECYECGKSFCMNSHLTVHQRTHTGEKP
420 430 440 450 460 470
440 450 460 470 480 490
pF1KB8 YECKQCGKTFCVKSNLTEHQRTHTGEKPYECNACGKSFCHRSALTVHQRTHTGEKPFICN
.:: .:::.:: ::.::.::::: :.::::::::::.: :.:.:: :: ::: ::. :
NP_001 FECLECGKSFCQKSHLTQHQRTHIGDKPYECNACGKTFYHKSVLTRHQIIHTGLKPYECY
480 490 500 510 520 530
500 510 520 530 540 550
pF1KB8 ECGKSFCVKSNLIVHQRTHTGEKPYKCNECGKTFCEKSALTKHQRTHTGEKPYECNACGK
::::.::.::.: .::::::::::. : :::: : .::.:..: :::::::::::. :::
NP_001 ECGKTFCLKSDLTIHQRTHTGEKPFACPECGKFFSHKSTLSQHYRTHTGEKPYECHECGK
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560 570
pF1KB8 TFSQRSVLTKHQRIHTRVKALSTS
: ..: ::::.: ::
NP_001 IFYNKSYLTKHNRTHTGEKPYECNECGKTFCQKSQLTQHQRIHIGEKPYECNECGKAFCH
600 610 620 630 640 650
>--
initn: 1425 init1: 925 opt: 925 Z-score: 544.7 bits: 111.2 E(85289): 1.3e-23
Smith-Waterman score: 925; 71.8% identity (83.3% similar) in 174 aa overlap (376-549:612-785)
350 360 370 380 390 400
pF1KB8 HMGGKSYDYNENGSNFSKKSHLTQLRRAHTGEKTFECGECGKTFWEKSNLTQHQRTHTGE
::: .::.:::::: .::.:::::: : ::
NP_001 HTGEKPYECHECGKIFYNKSYLTKHNRTHTGEKPYECNECGKTFCQKSQLTQHQRIHIGE
590 600 610 620 630 640
410 420 430 440 450 460
pF1KB8 KPYECTECGKAFCQKPHLTNHQRTHTGEKPYECKQCGKTFCVKSNLTEHQRTHTGEKPYE
:::::.:::::::.: : :::::: ::::.:..:::.:::::.: :.: ::::::::
NP_001 KPYECNECGKAFCHKSALIVHQRTHTQEKPYKCNECGKSFCVKSGLILHERKHTGEKPYE
650 660 670 680 690 700
470 480 490 500 510 520
pF1KB8 CNACGKSFCHRSALTVHQRTHTGEKPFICNECGKSFCVKSNLIVHQRTHTGEKPYKCNEC
:: ::::: :.:.::::.:.::::: :::::: : ::.: :::.:::::::.:: :
NP_001 CNECGKSFSHKSSLTVHHRAHTGEKSCQCNECGKIFYRKSDLAKHQRSHTGEKPYECNTC
710 720 730 740 750 760
530 540 550 560 570
pF1KB8 GKTFCEKSALTKHQRTHTGEKPYECNACGKTFSQRSVLTKHQRIHTRVKALSTS
::: .:: : ::::: ::::::
NP_001 RKTFSQKSNLIVHQRTHIGEKPYE
770 780
>>XP_011517952 (OMIM: 194521) PREDICTED: zinc finger pro (811 aa)
initn: 2249 init1: 1176 opt: 1883 Z-score: 1078.9 bits: 210.0 E(85289): 2.4e-53
Smith-Waterman score: 1942; 50.1% identity (70.5% similar) in 601 aa overlap (3-571:7-604)
10 20 30 40 50
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::::.:::::: : :::::: :::.:. :::::.:::::::::::::. ::::
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::...:::::: :. :::: :: : .: . : ::::.. :.::..: ::. .. :.:
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: . ::. .. :.. . :::: :.....: :.::: : :: ::::.: ::::
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.:.:.. ::. . ..::....:.. : .. ..:::: . . ..:.: :.
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:: . :. : ::: :::. .: .: . : .:: .
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Smith-Waterman score: 1942; 50.1% identity (70.5% similar) in 601 aa overlap (3-571:7-604)
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Smith-Waterman score: 873; 68.8% identity (82.4% similar) in 170 aa overlap (376-545:612-781)
350 360 370 380 390 400
pF1KB8 HMGGKSYDYNENGSNFSKKSHLTQLRRAHTGEKTFECGECGKTFWEKSNLTQHQRTHTGE
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pF1KB8 KPYECTECGKAFCQKPHLTNHQRTHTGEKPYECKQCGKTFCVKSNLTEHQRTHTGEKPYE
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pF1KB8 CNACGKSFCHRSALTVHQRTHTGEKPFICNECGKSFCVKSNLIVHQRTHTGEKPYKCNEC
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XP_016 CNECGKFFRHKSSLTVHHRAHTGEKSCQCNECGKIFYRKSELAQHQRSHTGEKPYECNTC
710 720 730 740 750 760
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pF1KB8 GKTFCEKSALTKHQRTHTGEKPYECNACGKTFSQRSVLTKHQRIHTRVKALSTS
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XP_016 RKTFSQKSNLIVHQRRHIGENLMNEMDIRNFQPQVSLHNASEYSHCGESPDDILNVQ
770 780 790 800 810
>>NP_001311107 (OMIM: 194521) zinc finger protein 33A is (818 aa)
initn: 2249 init1: 1176 opt: 1883 Z-score: 1078.8 bits: 210.1 E(85289): 2.4e-53
Smith-Waterman score: 1942; 50.1% identity (70.5% similar) in 601 aa overlap (3-571:14-611)
10 20 30 40
pF1KB8 MNKSQEQVSFKDVCVDFTQEEWYLLDPAQKILYRDVILENYSNLVSVGY
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NP_001 MANATRRGSGVEQKSQESVSFKDVTVGFTQEEWQHLDPSQRALYRDVMLENYSNLVSVGY
10 20 30 40 50 60
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pF1KB8 CITKPEVIFKIEQGEEPWILEKGFPSQCHPERKWKVDDVLESSQENEDDHFWELLFHNNK
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NP_001 CVHKPEVIFRLQQGEEPWKQEEEFPSQSFPEV-WTADHLKERSQENQSKHLWEVVFINNE
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NP_001 MLTKEQGDVIGIPFNVDVSSFPSRKM-FCQCDSCGMSFNTVSELVISKINYLGKKSDEFN
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NP_001 ACGKLLLNIKHDETHTQEKN-EVLKNRNTLSHHEETLQHEKIQTLEHNFEYSICQETLLE
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pF1KB8 EAAFFTNKRSQIGETVCKYNECGRTFIESLKLNISQ------------------------
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NP_001 KAVFNTQKRENAEENNCDYNEFGRTLCDSSSLLFHQISPSRDNHYEFSDCEKFLCVKSTL
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pF1KB8 -RPH-LEMEPYGCSICGKSFCMNLRFGH-QRALTKDNPYEYNEYGEIFCDNSAFIIHQGA
.:: . :. : :. :..: .: ..: :.. .. .: :: :. : ..: . :: .
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.: .: .. . :.:: : ::: : : : .. :: :. ::.:: :: .:.::::
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: ..:. ::::: .::.::.::::::: ::::: ::::.: :: ::::::::::.:
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: .:::.: :::::.::: : :.: ::::::::.: :.: :: :: ::: ::. : ::
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::.::.::.: ::::::::.::. : :::: : .::.:..: :::::::::::. ::: :
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::: .::.::::.:..::.:::::: : ::
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:::.:.:::::::.: : :::::: ::::.:..:::.:::::.: :.: ::::::::
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..:::: . . ..:.: :.:: . :. : ::: :::. .: .: . :
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pF1KB8 IFCDNSAFIIHQGAYT-RKILREYKVSDKTWEKSALLKHQIVHMGGKSYDYNENGSNFSK
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pF1KB8 HMGGKSYDYNENGSNFSKKSHLTQLRRAHTGEKTFECGECGKTFWEKSNLTQHQRTHTGE
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NP_001 HTGEKPYECHECGKIFYNKSYLTKHNRTHTGEKPYECNECGKAFYQKSQLTQHQRIHIGE
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NP_001 KPYKCNECGKAFCHKSALIVHQRTHTQEKPYKCNECGKSFCVKSGLIFHERKHTGEKPYE
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pF1KB8 CNACGKSFCHRSALTVHQRTHTGEKPFICNECGKSFCVKSNLIVHQRTHTGEKPYKCNEC
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NP_001 CNECGKFFRHKSSLTVHHRAHTGEKSCQCNECGKIFYRKSELAQHQRSHTGEKPYECNTC
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NP_001 RKTFSQKSNLIVHQRRHIGENLMNEMDIRNFQPQVSLHNASEYSHCGESPDDILNVQ
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XP_011 IFRLQQGEEPWKQEEEFPSQSFP--VWTADHLKERSQENQSKHLWEVVFINNEMLTKEQG
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pF1KB8 DIRHEKIPIGEKSYKYDQKRNAINYHQDLSQ----PSFGQSFEYSKNGQGFHDEAAFFTN
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pF1KB8 MEPYGCSICGKSFCMNLRFGH-QRALTKDNPYEYNEYGEIFCDNSAFIIHQGAYT-RKIL
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XP_011 SDLTVHQRTHTGQKPFACPECGKFFSHKSTLSQHYRTHTGEKPYECHECGKIFYNKSYLT
540 550 560 570 580 590
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pF1KB8 KHQRIHTRVKALSTS
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XP_011 KHNRTHTGEKPYECNECGKAFYQKSQLTQHQRIHIGEKPYKCNECGKAFCHKSALIVHQR
600 610 620 630 640 650
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]