FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8397, 462 aa
1>>>pF1KB8397 462 - 462 aa - 462 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.6381+/-0.0013; mu= 5.7423+/- 0.074
mean_var=277.6737+/-65.641, 0's: 0 Z-trim(106.2): 685 B-trim: 100 in 1/50
Lambda= 0.076967
statistics sampled from 8049 (8861) to 8049 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.634), E-opt: 0.2 (0.272), width: 16
Scan time: 2.920
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31076.1 AKT3 gene_id:10000|Hs108|chr1 ( 465) 3131 362.2 6.3e-100
CCDS31077.1 AKT3 gene_id:10000|Hs108|chr1 ( 479) 3049 353.2 3.5e-97
CCDS9994.1 AKT1 gene_id:207|Hs108|chr14 ( 480) 2574 300.4 2.7e-81
CCDS12552.1 AKT2 gene_id:208|Hs108|chr19 ( 481) 2474 289.3 5.9e-78
CCDS5170.1 SGK1 gene_id:6446|Hs108|chr6 ( 431) 1161 143.4 4.3e-34
CCDS47478.1 SGK1 gene_id:6446|Hs108|chr6 ( 445) 1161 143.5 4.3e-34
CCDS47477.1 SGK1 gene_id:6446|Hs108|chr6 ( 459) 1161 143.5 4.4e-34
CCDS47476.1 SGK1 gene_id:6446|Hs108|chr6 ( 526) 1161 143.6 4.8e-34
CCDS13320.1 SGK2 gene_id:10110|Hs108|chr20 ( 427) 1140 141.1 2.1e-33
CCDS13321.1 SGK2 gene_id:10110|Hs108|chr20 ( 367) 1134 140.4 3.1e-33
CCDS1824.1 PRKCE gene_id:5581|Hs108|chr2 ( 737) 1117 138.9 1.7e-32
CCDS10618.1 PRKCB gene_id:5579|Hs108|chr16 ( 671) 1104 137.4 4.4e-32
CCDS6195.1 SGK3 gene_id:23678|Hs108|chr8 ( 496) 1095 136.2 7.4e-32
CCDS9752.1 PRKCH gene_id:5583|Hs108|chr14 ( 683) 1086 135.4 1.8e-31
CCDS81350.1 PKN2 gene_id:5586|Hs108|chr1 ( 936) 1087 135.7 2e-31
CCDS714.1 PKN2 gene_id:5586|Hs108|chr1 ( 984) 1087 135.7 2.1e-31
CCDS10619.1 PRKCB gene_id:5579|Hs108|chr16 ( 673) 1067 133.3 7.7e-31
CCDS11664.1 PRKCA gene_id:5578|Hs108|chr17 ( 672) 1059 132.4 1.4e-30
CCDS42513.1 PKN1 gene_id:5585|Hs108|chr19 ( 942) 1042 130.7 6.4e-30
CCDS42514.1 PKN1 gene_id:5585|Hs108|chr19 ( 948) 1042 130.7 6.4e-30
CCDS12867.1 PRKCG gene_id:5582|Hs108|chr19 ( 697) 1014 127.4 4.6e-29
CCDS60482.1 PRKCQ gene_id:5588|Hs108|chr10 ( 581) 1008 126.6 6.6e-29
CCDS41229.1 PRKCZ gene_id:5590|Hs108|chr1 ( 409) 1005 126.1 6.8e-29
CCDS7079.1 PRKCQ gene_id:5588|Hs108|chr10 ( 706) 1008 126.8 7.4e-29
CCDS55563.1 PRKCZ gene_id:5590|Hs108|chr1 ( 488) 1005 126.2 7.5e-29
CCDS37.1 PRKCZ gene_id:5590|Hs108|chr1 ( 592) 1005 126.3 8.4e-29
CCDS81286.1 RPS6KA1 gene_id:6195|Hs108|chr1 ( 719) 997 125.5 1.7e-28
CCDS284.1 RPS6KA1 gene_id:6195|Hs108|chr1 ( 735) 993 125.1 2.4e-28
CCDS30649.1 RPS6KA1 gene_id:6195|Hs108|chr1 ( 744) 993 125.1 2.4e-28
CCDS62271.1 RPS6KB1 gene_id:6198|Hs108|chr17 ( 451) 988 124.3 2.7e-28
CCDS62273.1 RPS6KB1 gene_id:6198|Hs108|chr17 ( 472) 988 124.3 2.7e-28
CCDS11621.1 RPS6KB1 gene_id:6198|Hs108|chr17 ( 525) 988 124.4 2.9e-28
CCDS41677.1 RPS6KB2 gene_id:6199|Hs108|chr11 ( 482) 987 124.2 3e-28
CCDS14197.1 RPS6KA3 gene_id:6197|Hs108|chrX ( 740) 989 124.7 3.3e-28
CCDS6908.1 PKN3 gene_id:29941|Hs108|chr9 ( 889) 990 124.9 3.4e-28
CCDS5294.1 RPS6KA2 gene_id:6196|Hs108|chr6 ( 733) 980 123.7 6.5e-28
CCDS83148.1 RPS6KA2 gene_id:6196|Hs108|chr6 ( 758) 979 123.6 7.2e-28
CCDS2870.1 PRKCD gene_id:5580|Hs108|chr3 ( 676) 978 123.4 7.3e-28
CCDS34570.1 RPS6KA2 gene_id:6196|Hs108|chr6 ( 741) 973 122.9 1.1e-27
CCDS45149.1 RPS6KA5 gene_id:9252|Hs108|chr14 ( 549) 967 122.1 1.5e-27
CCDS9893.1 RPS6KA5 gene_id:9252|Hs108|chr14 ( 802) 967 122.3 1.9e-27
CCDS83480.1 RPS6KA6 gene_id:27330|Hs108|chrX ( 745) 918 116.8 7.8e-26
CCDS14451.1 RPS6KA6 gene_id:27330|Hs108|chrX ( 745) 918 116.8 7.8e-26
CCDS12304.1 PRKACA gene_id:5566|Hs108|chr19 ( 351) 909 115.3 1e-25
CCDS12305.1 PRKACA gene_id:5566|Hs108|chr19 ( 343) 907 115.1 1.2e-25
CCDS73313.1 RPS6KA4 gene_id:8986|Hs108|chr11 ( 765) 913 116.3 1.2e-25
CCDS8073.1 RPS6KA4 gene_id:8986|Hs108|chr11 ( 772) 913 116.3 1.2e-25
CCDS72816.1 PRKACB gene_id:5567|Hs108|chr1 ( 338) 905 114.9 1.3e-25
CCDS72813.1 PRKACB gene_id:5567|Hs108|chr1 ( 339) 905 114.9 1.3e-25
CCDS691.1 PRKACB gene_id:5567|Hs108|chr1 ( 351) 905 114.9 1.4e-25
>>CCDS31076.1 AKT3 gene_id:10000|Hs108|chr1 (465 aa)
initn: 3131 init1: 3131 opt: 3131 Z-score: 1907.5 bits: 362.2 E(32554): 6.3e-100
Smith-Waterman score: 3131; 100.0% identity (100.0% similar) in 462 aa overlap (1-462:1-462)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MSDVTIVKEGWVQKRGEYIKNWRPRYFLLKTDGSFIGYKEKPQDVDLPYPLNNFSVAKCQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MSDVTIVKEGWVQKRGEYIKNWRPRYFLLKTDGSFIGYKEKPQDVDLPYPLNNFSVAKCQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 LMKTERPKPNTFIIRCLQWTTVIERTFHVDTPEEREEWTEAIQAVADRLQRQEEERMNCS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LMKTERPKPNTFIIRCLQWTTVIERTFHVDTPEEREEWTEAIQAVADRLQRQEEERMNCS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 PTSQIDNIGEEEMDASTTHHKRKTMNDFDYLKLLGKGTFGKVILVREKASGKYYAMKILK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 PTSQIDNIGEEEMDASTTHHKRKTMNDFDYLKLLGKGTFGKVILVREKASGKYYAMKILK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 KEVIIAKDEVAHTLTESRVLKNTRHPFLTSLKYSFQTKDRLCFVMEYVNGGELFFHLSRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 KEVIIAKDEVAHTLTESRVLKNTRHPFLTSLKYSFQTKDRLCFVMEYVNGGELFFHLSRE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 RVFSEDRTRFYGAEIVSALDYLHSGKIVYRDLKLENLMLDKDGHIKITDFGLCKEGITDA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 RVFSEDRTRFYGAEIVSALDYLHSGKIVYRDLKLENLMLDKDGHIKITDFGLCKEGITDA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 ATMKTFCGTPEYLAPEVLEDNDYGRAVDWWGLGVVMYEMMCGRLPFYNQDHEKLFELILM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 ATMKTFCGTPEYLAPEVLEDNDYGRAVDWWGLGVVMYEMMCGRLPFYNQDHEKLFELILM
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 EDIKFPRTLSSDAKSLLSGLLIKDPNKRLGGGPDDAKEIMRHSFFSGVNWQDVYDKKLVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 EDIKFPRTLSSDAKSLLSGLLIKDPNKRLGGGPDDAKEIMRHSFFSGVNWQDVYDKKLVP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460
pF1KB8 PFKPQVTSETDTRYFDEEFTAQTITITPPEKCQQSDCGMLGN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 PFKPQVTSETDTRYFDEEFTAQTITITPPEKCQQSDCGMLGNWKK
430 440 450 460
>>CCDS31077.1 AKT3 gene_id:10000|Hs108|chr1 (479 aa)
initn: 3043 init1: 3043 opt: 3049 Z-score: 1858.2 bits: 353.2 E(32554): 3.5e-97
Smith-Waterman score: 3049; 98.7% identity (99.3% similar) in 459 aa overlap (1-457:1-459)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MSDVTIVKEGWVQKRGEYIKNWRPRYFLLKTDGSFIGYKEKPQDVDLPYPLNNFSVAKCQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MSDVTIVKEGWVQKRGEYIKNWRPRYFLLKTDGSFIGYKEKPQDVDLPYPLNNFSVAKCQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 LMKTERPKPNTFIIRCLQWTTVIERTFHVDTPEEREEWTEAIQAVADRLQRQEEERMNCS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LMKTERPKPNTFIIRCLQWTTVIERTFHVDTPEEREEWTEAIQAVADRLQRQEEERMNCS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 PTSQIDNIGEEEMDASTTHHKRKTMNDFDYLKLLGKGTFGKVILVREKASGKYYAMKILK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 PTSQIDNIGEEEMDASTTHHKRKTMNDFDYLKLLGKGTFGKVILVREKASGKYYAMKILK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 KEVIIAKDEVAHTLTESRVLKNTRHPFLTSLKYSFQTKDRLCFVMEYVNGGELFFHLSRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 KEVIIAKDEVAHTLTESRVLKNTRHPFLTSLKYSFQTKDRLCFVMEYVNGGELFFHLSRE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 RVFSEDRTRFYGAEIVSALDYLHSGKIVYRDLKLENLMLDKDGHIKITDFGLCKEGITDA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 RVFSEDRTRFYGAEIVSALDYLHSGKIVYRDLKLENLMLDKDGHIKITDFGLCKEGITDA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 ATMKTFCGTPEYLAPEVLEDNDYGRAVDWWGLGVVMYEMMCGRLPFYNQDHEKLFELILM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 ATMKTFCGTPEYLAPEVLEDNDYGRAVDWWGLGVVMYEMMCGRLPFYNQDHEKLFELILM
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 EDIKFPRTLSSDAKSLLSGLLIKDPNKRLGGGPDDAKEIMRHSFFSGVNWQDVYDKKLVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 EDIKFPRTLSSDAKSLLSGLLIKDPNKRLGGGPDDAKEIMRHSFFSGVNWQDVYDKKLVP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460
pF1KB8 PFKPQVTSETDTRYFDEEFTAQTITITPPEKCQQS--DCGMLGN
::::::::::::::::::::::::::::::: ... ::
CCDS31 PFKPQVTSETDTRYFDEEFTAQTITITPPEKYDEDGMDCMDNERRPHFPQFSYSASGRE
430 440 450 460 470
>>CCDS9994.1 AKT1 gene_id:207|Hs108|chr14 (480 aa)
initn: 2126 init1: 1127 opt: 2574 Z-score: 1573.1 bits: 300.4 E(32554): 2.7e-81
Smith-Waterman score: 2574; 82.4% identity (93.3% similar) in 460 aa overlap (1-457:1-460)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MSDVTIVKEGWVQKRGEYIKNWRPRYFLLKTDGSFIGYKEKPQDVDL-PYPLNNFSVAKC
::::.::::::..:::::::.:::::::::.::.::::::.::::: ::::::::.:
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pF1KB8 QLMKTERPKPNTFIIRCLQWTTVIERTFHVDTPEEREEWTEAIQAVADRLQRQEEERMNC
::::::::.:::::::::::::::::::::.::::::::: :::.::: :..::::.:.
CCDS99 QLMKTERPRPNTFIIRCLQWTTVIERTFHVETPEEREEWTTAIQTVADGLKKQEEEEMDF
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pF1KB8 SPTSQIDNIGEEEMDASTTHHK-RKTMNDFDYLKLLGKGTFGKVILVREKASGKYYAMKI
: :: : :::..: .. : : :::.:.::::::::::::::::.:::.:.::::::
CCDS99 RSGSPSDNSGAEEMEVSLAKPKHRVTMNEFEYLKLLGKGTFGKVILVKEKATGRYYAMKI
130 140 150 160 170 180
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pF1KB8 LKKEVIIAKDEVAHTLTESRVLKNTRHPFLTSLKYSFQTKDRLCFVMEYVNGGELFFHLS
::::::.:::::::::::.:::.:.::::::.:::::::.:::::::::.::::::::::
CCDS99 LKKEVIVAKDEVAHTLTENRVLQNSRHPFLTALKYSFQTHDRLCFVMEYANGGELFFHLS
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 RERVFSEDRTRFYGAEIVSALDYLHSGK-IVYRDLKLENLMLDKDGHIKITDFGLCKEGI
:::::::::.:::::::::::::::: : .::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 RERVFSEDRARFYGAEIVSALDYLHSEKNVVYRDLKLENLMLDKDGHIKITDFGLCKEGI
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 TDAATMKTFCGTPEYLAPEVLEDNDYGRAVDWWGLGVVMYEMMCGRLPFYNQDHEKLFEL
:.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 KDGATMKTFCGTPEYLAPEVLEDNDYGRAVDWWGLGVVMYEMMCGRLPFYNQDHEKLFEL
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KB8 ILMEDIKFPRTLSSDAKSLLSGLLIKDPNKRLGGGPDDAKEIMRHSFFSGVNWQDVYDKK
::::.:.:::::. .::::::::: :::..::::: .::::::.: ::.:. :: ::.::
CCDS99 ILMEEIRFPRTLGPEAKSLLSGLLKKDPKQRLGGGSEDAKEIMQHRFFAGIVWQHVYEKK
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460
pF1KB8 LVPPFKPQVTSETDTRYFDEEFTAQTITITPPEKCQQSDCGMLGN
: ::::::::::::::::::::::: ::::::.. .. .:
CCDS99 LSPPFKPQVTSETDTRYFDEEFTAQMITITPPDQDDSMECVDSERRPHFPQFSYSASGTA
430 440 450 460 470 480
>>CCDS12552.1 AKT2 gene_id:208|Hs108|chr19 (481 aa)
initn: 2456 init1: 1851 opt: 2474 Z-score: 1513.1 bits: 289.3 E(32554): 5.9e-78
Smith-Waterman score: 2474; 78.5% identity (93.4% similar) in 456 aa overlap (1-451:1-455)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MSDVTIVKEGWVQKRGEYIKNWRPRYFLLKTDGSFIGYKEKPQ--DVDLPYPLNNFSVAK
:..:...::::..:::::::.:::::::::.:::::::::.:. : :: ::::::::.
CCDS12 MNEVSVIKEGWLHKRGEYIKTWRPRYFLLKSDGSFIGYKERPEAPDQTLP-PLNNFSVAE
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 CQLMKTERPKPNTFIIRCLQWTTVIERTFHVDTPEEREEWTEAIQAVADRLQRQE--EER
:::::::::.::::.:::::::::::::::::.:.::::: .::: ::. :... :.
CCDS12 CQLMKTERPRPNTFVIRCLQWTTVIERTFHVDSPDEREEWMRAIQMVANSLKQRAPGEDP
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 MNCSPTSQIDNIGEEEMDASTTHHKRK-TMNDFDYLKLLGKGTFGKVILVREKASGKYYA
:. . : :. :::...... . : ::::::::::::::::::::::::::.:.:::
CCDS12 MDYKCGSPSDSSTTEEMEVAVSKARAKVTMNDFDYLKLLGKGTFGKVILVREKATGRYYA
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 MKILKKEVIIAKDEVAHTLTESRVLKNTRHPFLTSLKYSFQTKDRLCFVMEYVNGGELFF
::::.:::::::::::::.::::::.::::::::.:::.:::.:::::::::.:::::::
CCDS12 MKILRKEVIIAKDEVAHTVTESRVLQNTRHPFLTALKYAFQTHDRLCFVMEYANGGELFF
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 HLSRERVFSEDRTRFYGAEIVSALDYLHSGKIVYRDLKLENLMLDKDGHIKITDFGLCKE
::::::::.:.:.:::::::::::.:::: .::::.:::::::::::::::::::::::
CCDS12 HLSRERVFTEERARFYGAEIVSALEYLHSRDVVYRDIKLENLMLDKDGHIKITDFGLCKE
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 GITDAATMKTFCGTPEYLAPEVLEDNDYGRAVDWWGLGVVMYEMMCGRLPFYNQDHEKLF
::.:.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::
CCDS12 GISDGATMKTFCGTPEYLAPEVLEDNDYGRAVDWWGLGVVMYEMMCGRLPFYNQDHERLF
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB8 ELILMEDIKFPRTLSSDAKSLLSGLLIKDPNKRLGGGPDDAKEIMRHSFFSGVNWQDVYD
::::::.:.:::::: .:::::.::: :::..::::::.::::.:.: :: ..::::: .
CCDS12 ELILMEEIRFPRTLSPEAKSLLAGLLKKDPKQRLGGGPSDAKEVMEHRFFLSINWQDVVQ
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460
pF1KB8 KKLVPPFKPQVTSETDTRYFDEEFTAQTITITPPEKCQQSDCGMLGN
:::.::::::::::.::::::.:::::.::::::..
CCDS12 KKLLPPFKPQVTSEVDTRYFDDEFTAQSITITPPDRYDSLGLLELDQRTHFPQFSYSASI
420 430 440 450 460 470
CCDS12 RE
480
>>CCDS5170.1 SGK1 gene_id:6446|Hs108|chr6 (431 aa)
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..:. :: ::: :: .::::. :: :: : ::: .::.:. .::..:::.:.:.. .
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: :.:: ::: . .
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>>CCDS47478.1 SGK1 gene_id:6446|Hs108|chr6 (445 aa)
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:: .::::. :: :: : ::: .::.:. .::..:::.:.:.. .: :.:: :::
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. .
CCDS47 EPVPNSIGKSPDSVLVTASVKEAAEAFLGFSYAPPTDSFL
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>>CCDS47477.1 SGK1 gene_id:6446|Hs108|chr6 (459 aa)
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pF1KB8 FIIRCLQWTTVIERTFHVDTPEEREEWTEAIQAVADRLQRQEEERMNCSPTSQIDNIGEE
.:.. : :: : :: .:. . .
CCDS47 LKAFMKQRRMGLNDFIQKIANNSYACKHPEVQSILKISQPQEPELMNANPSPPPSPSQQI
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.. :.. : . . :: .::..:::.::::.:.:.:: .::.:.:.:..:. : :
CCDS47 NLGPSSNPHAKPS--DFHFLKVIGKGSFGKVLLARHKAEEVFYAVKVLQKKAILKKKEEK
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CCDS47 HIMSERNVLLKNVKHPFLVGLHFSFQTADKLYFVLDYINGGELFYHLQRERCFLEPRARF
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:.:::.::: :::: .::::::: ::..::..::: .::::::::.: .: .::::::
CCDS47 YAAEIASALGYLHSLNIVYRDLKPENILLDSQGHIVLTDFGLCKENIEHNSTTSTFCGTP
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..:. :: ::: :: .::::. :: :: : ::: .::.:. .::..:::.:.:.. .
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: :.:: ::: . .
CCDS47 DLRHFDPEFTEEPVPNSIGKSPDSVLVTASVKEAAEAFLGFSYAPPTDSFL
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>>CCDS47476.1 SGK1 gene_id:6446|Hs108|chr6 (526 aa)
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20 30 40 50 60 70
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CCDS47 LPQENESCSWETQSGCEVREPCNHANILTKPDPRTFWTNDDPAFMKQRRMGLNDFIQK--
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pF1KB8 QWTTVIERTFHVDTPEEREEWTEAIQAVADRLQRQEEERMNCSPTSQIDNIGEEEMDAST
. . .. :: .:.. : :: : :: .:. . . .. :.
CCDS47 ----IANNSYACKHPE--------VQSILKISQPQEPELMNANPSPPPSPSQQINLGPSS
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140 150 160 170 180 190
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. : . . :: .::..:::.::::.:.:.:: .::.:.:.:..:. : : : ..:
CCDS47 NPHAKPS--DFHFLKVIGKGSFGKVLLARHKAEEVFYAVKVLQKKAILKKKEEKHIMSER
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CCDS47 NVLLKNVKHPFLVGLHFSFQTADKLYFVLDYINGGELFYHLQRERCFLEPRARFYAAEIA
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::: :::: .::::::: ::..::..::: .::::::::.: .: .::::::::::::
CCDS47 SALGYLHSLNIVYRDLKPENILLDSQGHIVLTDFGLCKENIEHNSTTSTFCGTPEYLAPE
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::. . : :.:::: ::.:.:::. : :::... .... :: . ... .....:. :
CCDS47 VLHKQPYDRTVDWWCLGAVLYEMLYGLPPFYSRNTAEMYDNILNKPLQLKPNITNSARHL
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CCDS47 LEGLLQKDRTKRLGA-KDDFMEIKSHVFFSLINWDDLINKKITPPFNPNVSGPNDLRHFD
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CCDS47 PEFTEEPVPNSIGKSPDSVLVTASVKEAAEAFLGFSYAPPTDSFL
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CCDS13 KPWMGGADPPTPTLSCLLLPVPPELPDHCYRMNSSPAGTPSPQPSRANGNINLGPSANPN
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pF1KB8 QTITITPPEKCQQSDCGMLGN
....
CCDS13 EAVSKSIGCTPDTVASSSGASSAFLGFSYAPEDDDILDC
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CCDS13 MNSSPAGTPSPQPSRANGNINLGPSANPNAQPT--DF
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CCDS13 DFLKVIGKGNYGKVLLAKRKSDGAFYAVKVLQKKSILKKKEQSHIMAERSVLLKNVRHPF
40 50 60 70 80 90
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CCDS13 LVGLRYSFQTPEKLYFVLDYVNGGELFFHLQRERRFLEPRARFYAAEVASAIGYLHSLNI
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.::::: ::..:: .::. .:::::::::. : .::::::::::::::. . : :::
CCDS13 IYRDLKPENILLDCQGHVVLTDFGLCKEGVEPEDTTSTFCGTPEYLAPEVLRKEPYDRAV
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CCDS13 DWWCLGAVLYEMLHGLPPFYSQDVSQMYENILHQPLQIPGGRTVAACDLLQSLLHKDQRQ
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pF1KB8 RLGGGPDDAKEIMRHSFFSGVNWQDVYDKKLVPPFKPQVTSETDTRYFDEEFTAQTITIT
:::. : :: : ::: .::.:.: :.:.:::.:.::. .: ..:: ::: ....
CCDS13 RLGSKAD-FLEIKNHVFFSPINWDDLYHKRLTPPFNPNVTGPADLKHFDPEFTQEAVSKS
280 290 300 310 320 330
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pF1KB8 PPEKCQQSDCGMLGN
CCDS13 IGCTPDTVASSSGASSAFLGFSYAPEDDDILDC
340 350 360
462 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 12:33:50 2016 done: Fri Nov 4 12:33:50 2016
Total Scan time: 2.920 Total Display time: 0.060
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]