FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB8398, 628 aa 1>>>pF1KB8398 628 - 628 aa - 628 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.9338+/- 0.001; mu= 2.9642+/- 0.059 mean_var=270.7057+/-58.843, 0's: 0 Z-trim(112.3): 702 B-trim: 0 in 0/51 Lambda= 0.077952 statistics sampled from 12301 (13105) to 12301 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.744), E-opt: 0.2 (0.403), width: 16 Scan time: 3.120 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS1453.2 NUAK2 gene_id:81788|Hs108|chr1 ( 672) 4245 491.4 1.7e-138 CCDS31892.1 NUAK1 gene_id:9891|Hs108|chr12 ( 661) 1598 193.7 6.8e-49 CCDS12658.1 MARK4 gene_id:57787|Hs108|chr19 ( 688) 914 116.8 1e-25 CCDS56097.1 MARK4 gene_id:57787|Hs108|chr19 ( 752) 914 116.8 1.1e-25 CCDS55947.1 MARK3 gene_id:4140|Hs108|chr14 ( 713) 877 112.6 1.8e-24 CCDS41993.1 MARK3 gene_id:4140|Hs108|chr14 ( 729) 864 111.2 5.1e-24 CCDS45166.1 MARK3 gene_id:4140|Hs108|chr14 ( 744) 864 111.2 5.2e-24 CCDS45165.1 MARK3 gene_id:4140|Hs108|chr14 ( 753) 864 111.2 5.3e-24 CCDS53650.1 MARK2 gene_id:2011|Hs108|chr11 ( 719) 861 110.8 6.4e-24 CCDS53649.1 MARK2 gene_id:2011|Hs108|chr11 ( 788) 861 110.9 6.9e-24 CCDS53651.1 MARK2 gene_id:2011|Hs108|chr11 ( 709) 858 110.5 8e-24 CCDS8051.2 MARK2 gene_id:2011|Hs108|chr11 ( 724) 858 110.5 8.2e-24 CCDS41665.1 MARK2 gene_id:2011|Hs108|chr11 ( 745) 853 109.9 1.2e-23 CCDS73034.1 MARK1 gene_id:4139|Hs108|chr1 ( 780) 850 109.6 1.6e-23 CCDS31029.2 MARK1 gene_id:4139|Hs108|chr1 ( 795) 850 109.6 1.6e-23 CCDS73033.1 MARK1 gene_id:4139|Hs108|chr1 ( 796) 850 109.6 1.6e-23 CCDS3932.2 PRKAA1 gene_id:5562|Hs108|chr5 ( 559) 814 105.4 2.1e-22 CCDS60974.1 SIK3 gene_id:23387|Hs108|chr11 (1261) 820 106.5 2.3e-22 CCDS8379.2 SIK3 gene_id:23387|Hs108|chr11 (1321) 820 106.5 2.4e-22 CCDS82645.1 LOC102724428 gene_id:102724428|Hs108|c ( 783) 803 104.3 6.3e-22 CCDS33575.1 SIK1 gene_id:150094|Hs108|chr21 ( 783) 803 104.3 6.3e-22 CCDS8347.1 SIK2 gene_id:23235|Hs108|chr11 ( 926) 790 102.9 1.9e-21 CCDS605.1 PRKAA2 gene_id:5563|Hs108|chr1 ( 552) 784 102.0 2.2e-21 CCDS12921.1 BRSK1 gene_id:84446|Hs108|chr19 ( 778) 745 97.8 5.7e-20 CCDS41590.1 BRSK2 gene_id:9024|Hs108|chr11 ( 668) 736 96.7 1e-19 CCDS58106.1 BRSK2 gene_id:9024|Hs108|chr11 ( 674) 736 96.7 1e-19 CCDS58107.1 BRSK2 gene_id:9024|Hs108|chr11 ( 736) 736 96.8 1.1e-19 CCDS58108.1 BRSK2 gene_id:9024|Hs108|chr11 ( 766) 706 93.4 1.2e-18 CCDS60696.1 BRSK2 gene_id:9024|Hs108|chr11 ( 614) 677 90.1 9.8e-18 CCDS59123.1 MELK gene_id:9833|Hs108|chr9 ( 610) 666 88.8 2.3e-17 CCDS6606.1 MELK gene_id:9833|Hs108|chr9 ( 651) 666 88.8 2.4e-17 CCDS65789.1 MARK1 gene_id:4139|Hs108|chr1 ( 758) 654 87.6 6.8e-17 CCDS3943.1 NIM1K gene_id:167359|Hs108|chr5 ( 436) 649 86.8 6.8e-17 CCDS43075.1 SNRK gene_id:54861|Hs108|chr3 ( 765) 638 85.8 2.4e-16 CCDS59126.1 MELK gene_id:9833|Hs108|chr9 ( 619) 605 82.0 2.7e-15 CCDS13755.1 TSSK2 gene_id:23617|Hs108|chr22 ( 358) 599 81.0 2.9e-15 CCDS4112.1 TSSK1B gene_id:83942|Hs108|chr5 ( 367) 592 80.3 5.1e-15 CCDS12116.1 DAPK3 gene_id:1613|Hs108|chr19 ( 454) 592 80.4 6e-15 CCDS7092.1 CAMK1D gene_id:57118|Hs108|chr10 ( 357) 586 79.6 8.1e-15 CCDS7091.1 CAMK1D gene_id:57118|Hs108|chr10 ( 385) 586 79.6 8.5e-15 CCDS31076.1 AKT3 gene_id:10000|Hs108|chr1 ( 465) 584 79.5 1.1e-14 CCDS31077.1 AKT3 gene_id:10000|Hs108|chr1 ( 479) 584 79.5 1.2e-14 CCDS43842.1 DAPK1 gene_id:1612|Hs108|chr9 (1430) 589 80.5 1.7e-14 CCDS3933.2 PRKAA1 gene_id:5562|Hs108|chr5 ( 574) 580 79.1 1.8e-14 CCDS2582.1 CAMK1 gene_id:8536|Hs108|chr3 ( 370) 575 78.4 1.9e-14 CCDS13610.1 HUNK gene_id:30811|Hs108|chr21 ( 714) 580 79.2 2.1e-14 CCDS12552.1 AKT2 gene_id:208|Hs108|chr19 ( 481) 571 78.0 3.2e-14 CCDS362.1 TSSK3 gene_id:81629|Hs108|chr1 ( 268) 562 76.8 4.3e-14 CCDS35503.2 PNCK gene_id:139728|Hs108|chrX ( 426) 561 76.8 6.4e-14 CCDS9994.1 AKT1 gene_id:207|Hs108|chr14 ( 480) 562 77.0 6.4e-14 >>CCDS1453.2 NUAK2 gene_id:81788|Hs108|chr1 (672 aa) initn: 4245 init1: 4245 opt: 4245 Z-score: 2600.0 bits: 491.4 E(32554): 1.7e-138 Smith-Waterman score: 4245; 100.0% identity (100.0% similar) in 628 aa overlap (1-628:45-672) 10 20 30 pF1KB8 MESLVFARRSGPTPSAAELARPLAEGLIKS :::::::::::::::::::::::::::::: CCDS14 RPGAGPVPRASALPAQPTDSPAALAHLLLAMESLVFARRSGPTPSAAELARPLAEGLIKS 20 30 40 50 60 70 40 50 60 70 80 90 pF1KB8 PKPLMKKQAVKRHHHKHNLRHRYEFLETLGKGTYGKVKKARESSGRLVAIKSIRKDKIKD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS14 PKPLMKKQAVKRHHHKHNLRHRYEFLETLGKGTYGKVKKARESSGRLVAIKSIRKDKIKD 80 90 100 110 120 130 100 110 120 130 140 150 pF1KB8 EQDLMHIRREIEIMSSLNHPHIIAIHEVFENSSKIVIVMEYASRGDLYDYISERQQLSER :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS14 EQDLMHIRREIEIMSSLNHPHIIAIHEVFENSSKIVIVMEYASRGDLYDYISERQQLSER 140 150 160 170 180 190 160 170 180 190 200 210 pF1KB8 EARHFFRQIVSAVHYCHQNRVVHRDLKLENILLDANGNIKIADFGLSNLYHQGKFLQTFC :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS14 EARHFFRQIVSAVHYCHQNRVVHRDLKLENILLDANGNIKIADFGLSNLYHQGKFLQTFC 200 210 220 230 240 250 220 230 240 250 260 270 pF1KB8 GSPLYASPEIVNGKPYTGPEVDSWSLGVLLYILVHGTMPFDGHDHKILVKQISNGAYREP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS14 GSPLYASPEIVNGKPYTGPEVDSWSLGVLLYILVHGTMPFDGHDHKILVKQISNGAYREP 260 270 280 290 300 310 280 290 300 310 320 330 pF1KB8 PKPSDACGLIRWLLMVNPTRRATLEDVASHWWVNWGYATRVGEQEAPHEGGHPGSDSARA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS14 PKPSDACGLIRWLLMVNPTRRATLEDVASHWWVNWGYATRVGEQEAPHEGGHPGSDSARA 320 330 340 350 360 370 340 350 360 370 380 390 pF1KB8 SMADWLRRSSRPLLENGAKVCSFFKQHAPGGGSTTPGLERQHSLKKSRKENDMAQSLHSD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS14 SMADWLRRSSRPLLENGAKVCSFFKQHAPGGGSTTPGLERQHSLKKSRKENDMAQSLHSD 380 390 400 410 420 430 400 410 420 430 440 450 pF1KB8 TADDTAHRPGKSNLKLPKGILKKKVSASAEGVQEDPPELSPIPASPGQAAPLLPKKGILK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS14 TADDTAHRPGKSNLKLPKGILKKKVSASAEGVQEDPPELSPIPASPGQAAPLLPKKGILK 440 450 460 470 480 490 460 470 480 490 500 510 pF1KB8 KPRQRESGYYSSPEPSESGELLDAGDVFVSGDPKEQKPPQASGLLLHRKGILKLNGKFSQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS14 KPRQRESGYYSSPEPSESGELLDAGDVFVSGDPKEQKPPQASGLLLHRKGILKLNGKFSQ 500 510 520 530 540 550 520 530 540 550 560 570 pF1KB8 TALELAAPTTFGSLDELAPPRPLARASRPSGAVSEDSILSSESFDQLDLPERLPEPPLRG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS14 TALELAAPTTFGSLDELAPPRPLARASRPSGAVSEDSILSSESFDQLDLPERLPEPPLRG 560 570 580 590 600 610 580 590 600 610 620 pF1KB8 CVSVDNLTGLEEPPSEGPGSCLRRWRQDPLGDSCFSLTDCQEVTATYRQALRVCSKLT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS14 CVSVDNLTGLEEPPSEGPGSCLRRWRQDPLGDSCFSLTDCQEVTATYRQALRVCSKLT 620 630 640 650 660 670 >>CCDS31892.1 NUAK1 gene_id:9891|Hs108|chr12 (661 aa) initn: 2061 init1: 1389 opt: 1598 Z-score: 991.3 bits: 193.7 E(32554): 6.8e-49 Smith-Waterman score: 2149; 57.4% identity (75.2% similar) in 657 aa overlap (21-627:24-660) 10 20 30 40 50 pF1KB8 MESLVFARRSGPTPSAAELARPLAEGLIKSPKPLMKKQAVKRHHHKHNLRHRYEFLE : . : . .: : ..::::::::::.::::. : CCDS31 MEGAAAPVAGDRPDLGLGAPGSPREAVAGATAALEP-RKPHGVKRHHHKHNLKHRYELQE 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KB8 TLGKGTYGKVKKARES-SGRLVAIKSIRKDKIKDEQDLMHIRREIEIMSSLNHPHIIAIH :::::::::::.: : :::.::::::::::::::::..::::::::::::::::::.:. CCDS31 TLGKGTYGKVKRATERFSGRVVAIKSIRKDKIKDEQDMVHIRREIEIMSSLNHPHIISIY 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KB8 EVFENSSKIVIVMEYASRGDLYDYISERQQLSEREARHFFRQIVSAVHYCHQNRVVHRDL :::::..::::.:::::.:.::::::::..:::::.:::::::::::::::.: :::::: CCDS31 EVFENKDKIVIIMEYASKGELYDYISERRRLSERETRHFFRQIVSAVHYCHKNGVVHRDL 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KB8 KLENILLDANGNIKIADFGLSNLYHQGKFLQTFCGSPLYASPEIVNGKPYTGPEVDSWSL :::::::: : :::::::::::::.. ::::::::::::::::::::.:: :::::::.: CCDS31 KLENILLDDNCNIKIADFGLSNLYQKDKFLQTFCGSPLYASPEIVNGRPYRGPEVDSWAL 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KB8 GVLLYILVHGTMPFDGHDHKILVKQISNGAYREPPKPSDACGLIRWLLMVNPTRRATLED ::::: ::.::::::: ::: :..:::.: :::: .:::: :::::.::::: ::::.:: CCDS31 GVLLYTLVYGTMPFDGFDHKNLIRQISSGEYREPTQPSDARGLIRWMLMVNPDRRATIED 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KB8 VASHWWVNWGYATRVGEQEAPHEGGHPGSDSARASMADWLRRSSRPLLENGAKVCSFFKQ .:.:::::::: . : . .: :.. : : . :: .::. .. ::. .. : CCDS31 IANHWWVNWGYKSSVCDCDALHDSESP----LLARIIDWHHRSTGLQADTEAKMKGLAK- 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KB8 HAPGGGSTTPGLERQHSLKKSRKENDMAQSLHSDTADDTAHRPGKSNLKLPKGILKKKVS : .. ::::.:::::.::::.::: . : . . :.: . : :::::::. . CCDS31 --P--TTSEVMLERQRSLKKSKKENDFAQSGQ----DAVPESPSKLSSKRPKGILKKRSN 360 370 380 390 400 420 430 440 pF1KB8 AS--------AEGV-----------QED--------P--PELSPIPA--SPGQAAPLLPK . ::: ..: : :: . .:. :: :.: . :: CCDS31 SEHRSHSTGFIEGVVGPALPSTFKMEQDLCRTGVLLPSSPE-AEVPGKLSPKQSATM-PK 410 420 430 440 450 460 450 460 470 480 490 500 pF1KB8 KGILKKPRQRESGYYSSPEPSESGELLDAGDVFVSGDPKEQKPPQAS----GLLLHRKGI :::::: .::::::::::: :::.::::..::. :. :. . : : .: .:::: CCDS31 KGILKKTQQRESGYYSSPERSESSELLDSNDVMGSSIPSPSPPDPARVTSHSLSCRRKGI 470 480 490 500 510 520 510 520 530 540 550 pF1KB8 LKLNGKFSQTALE--LAAPT--TFGSLDELA-PPRPLARA-SRPSGAVSEDSILSSESFD :: ..:.: ... :..: :. ::.: . : . :.:. ::::...:.::.:::.::: CCDS31 LKHSSKYSAGTMDPALVSPEMPTLESLSEPGVPAEGLSRSYSRPSSVISDDSVLSSDSFD 530 540 550 560 570 580 560 570 580 590 600 pF1KB8 QLDLPERLP-EPPLRGCVSVDNLT------GLEEPPSEGPGSCLRRWRQDPLGDSCFSL- ::: : : . .:.:::..:. ::.. : : . :.:.: . :.:: ::: CCDS31 LLDLQENRPARQRIRSCVSAENFLQIQDFEGLQNRPR--P-QYLKRYR-NRLADSSFSLL 590 600 610 620 630 640 610 620 pF1KB8 TDCQEVTATYRQALRVCSKLT :: ..:: .:.:::..:::: CCDS31 TDMDDVTQVYKQALEICSKLN 650 660 >>CCDS12658.1 MARK4 gene_id:57787|Hs108|chr19 (688 aa) initn: 759 init1: 759 opt: 914 Z-score: 575.3 bits: 116.8 E(32554): 1e-25 Smith-Waterman score: 921; 36.7% identity (61.8% similar) in 521 aa overlap (53-537:59-563) 30 40 50 60 70 80 pF1KB8 LAEGLIKSPKPLMKKQAVKRHHHKHNLRHRYEFLETLGKGTYGKVKKARES-SGRLVAIK :..:.:.:::...::: ::. .:: :::: CCDS12 KGPSWSSRSLGARCRNSIASCPEEQPHVGNYRLLRTIGKGNFAKVKLARHILTGREVAIK 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 pF1KB8 SIRKDKIKDEQDLMHIRREIEIMSSLNHPHIIAIHEVFENSSKIVIVMEYASRGDLYDYI : : .. . ..:... ::..::..::::.:. . ::.:. . . .:::::: :...::. CCDS12 IIDKTQL-NPSSLQKLFREVRIMKGLNHPNIVKLFEVIETEKTLYLVMEYASAGEVFDYL 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 pF1KB8 SERQQLSEREARHFFRQIVSAVHYCHQNRVVHRDLKLENILLDANGNIKIADFGLSNLYH . ...:.::: :::::::::::::. .:::::: ::.::::..::::::::.:: . CCDS12 VSHGRMKEKEARAKFRQIVSAVHYCHQKNIVHRDLKAENLLLDAEANIKIADFGFSNEFT 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 pF1KB8 QGKFLQTFCGSPLYASPEIVNGKPYTGPEVDSWSLGVLLYILVHGTMPFDGHDHKILVKQ :. :.:::::: ::.::. .:: : ::::: :::::.:: :: :..:::::. : : .. CCDS12 LGSKLDTFCGSPPYAAPELFQGKKYDGPEVDIWSLGVILYTLVSGSLPFDGHNLKELRER 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 310 pF1KB8 ISNGAYREPPKPSDAC-GLIRWLLMVNPTRRATLEDVASHWWVNWGYATRVGEQEAPH-E . : :: : : : ...: .:..::..: :::.. . :.: :: ::. :. : CCDS12 VLRGKYRVPFYMSTDCESILRRFLVLNPAKRCTLEQIMKDKWINIGYE---GEELKPYTE 270 280 290 300 310 320 320 330 340 350 360 370 pF1KB8 GGHPGSDSARASMA-------DWLRRS--SRPLLENGAKVCSFFKQHAPGGGSTTPGLER . .:. : . . ...: :. : : . .. :: .::: CCDS12 PEEDFGDTKRIEVMVGMGYTREEIKESLTSQKYNEVTATYLLLGRKTEEGGDRGAPGL-- 330 340 350 360 370 380 380 390 400 410 420 430 pF1KB8 QHSLKKSRKENDMAQSLHSDTADDTAHRPGKSNLKLPKGILKKKVSASAEGVQEDPPELS .: . : .: ... .... :.: :. . . . ... .. : .: : CCDS12 --ALARVRAPSDTTNG--TSSSKGTSHSKGQRSSS--STYHRQRRHSDFCG--PSPAPLH 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KB8 PI--PASPGQAAPLLPKKGILKKPRQRESGYYSSPEPSESGELLDAGDVFVSGDPKEQK- : :.: :.: : .. .: .: : : : . .: . . :...: CCDS12 PKRSPTSTGEAE-LKEERLPGRKASCSTAGSGSRGLPPSSPMVSSAHNPNKAEIPERRKD 440 450 460 470 480 490 490 500 510 520 530 pF1KB8 --------PP-----QASGLLLHRKGI----LKLNGKFSQTALELAAPTTFGSLDELAPP :: . . . .: : : ::: .... . :.. .: :::: CCDS12 STSTPNNLPPSMMTRRNTYVCTERPGAERPSLLPNGKENSSGTPRVPPASPSS-HSLAPP 500 510 520 530 540 550 540 550 560 570 580 pF1KB8 RP----LARASRPSGAVSEDSILSSESFDQLDLPERLPEPPLRGCVSVDNLTGLEEPPSE :::.: CCDS12 SGERSRLARGSTIRSTFHGGQVRDRRAGGGGGGGVQNGPPASPTLAHEAAPLPAGRPRPT 560 570 580 590 600 610 >>CCDS56097.1 MARK4 gene_id:57787|Hs108|chr19 (752 aa) initn: 759 init1: 759 opt: 914 Z-score: 574.8 bits: 116.8 E(32554): 1.1e-25 Smith-Waterman score: 929; 35.0% identity (58.8% similar) in 588 aa overlap (53-571:59-642) 30 40 50 60 70 80 pF1KB8 LAEGLIKSPKPLMKKQAVKRHHHKHNLRHRYEFLETLGKGTYGKVKKARES-SGRLVAIK :..:.:.:::...::: ::. .:: :::: CCDS56 KGPSWSSRSLGARCRNSIASCPEEQPHVGNYRLLRTIGKGNFAKVKLARHILTGREVAIK 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 pF1KB8 SIRKDKIKDEQDLMHIRREIEIMSSLNHPHIIAIHEVFENSSKIVIVMEYASRGDLYDYI : : .. . ..:... ::..::..::::.:. . ::.:. . . .:::::: :...::. CCDS56 IIDKTQL-NPSSLQKLFREVRIMKGLNHPNIVKLFEVIETEKTLYLVMEYASAGEVFDYL 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 pF1KB8 SERQQLSEREARHFFRQIVSAVHYCHQNRVVHRDLKLENILLDANGNIKIADFGLSNLYH . ...:.::: :::::::::::::. .:::::: ::.::::..::::::::.:: . CCDS56 VSHGRMKEKEARAKFRQIVSAVHYCHQKNIVHRDLKAENLLLDAEANIKIADFGFSNEFT 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 pF1KB8 QGKFLQTFCGSPLYASPEIVNGKPYTGPEVDSWSLGVLLYILVHGTMPFDGHDHKILVKQ :. :.:::::: ::.::. .:: : ::::: :::::.:: :: :..:::::. : : .. CCDS56 LGSKLDTFCGSPPYAAPELFQGKKYDGPEVDIWSLGVILYTLVSGSLPFDGHNLKELRER 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 310 pF1KB8 ISNGAYREPPKPSDAC-GLIRWLLMVNPTRRATLEDVASHWWVNWGYATRVGEQEAPH-E . : :: : : : ...: .:..::..: :::.. . :.: :: ::. :. : CCDS56 VLRGKYRVPFYMSTDCESILRRFLVLNPAKRCTLEQIMKDKWINIGYE---GEELKPYTE 270 280 290 300 310 320 320 330 340 350 360 370 pF1KB8 GGHPGSDSARASMA---DWLRR------SSRPLLENGAKVCSFFKQHAPGGGSTTPGLER . .:. : . . :. .:. : : . .. :: .::: CCDS56 PEEDFGDTKRIEVMVGMGYTREEIKESLTSQKYNEVTATYLLLGRKTEEGGDRGAPGLAL 330 340 350 360 370 380 380 390 400 pF1KB8 QHSLKKSRKENDMAQSL---HSD---TADDTAHR----------------PGKSNLKLPK . : : ..: :: ....: :: : .: . . CCDS56 ARVRAPSDTTNGTSSSKGTSHSKGQRSSSSTYHRQRRHSDFCGPSPAPLHPKRSPTSTGE 390 400 410 420 430 440 410 420 430 440 450 pF1KB8 GILK------KKVSASAEGV-QEDPPELSPIPAS---PGQAAPLLPKKGILKKPRQ---- . :: .:.: :. : .. : ::. .: :..: .: . : . CCDS56 AELKEERLPGRKASCSTAGSGSRGLPPSSPMVSSAHNPNKAEIPERRKDSTSTPNNLPPS 450 460 470 480 490 500 460 470 480 490 500 pF1KB8 ---RESGYYSSPEP-SESGELLDAGDVFVSGDPK---------EQKPPQASGLLLHRKGI :.. : . .: .: :: : :: :. ::.. : : . CCDS56 MMTRRNTYVCTERPGAERPSLLPNGKENSSGTPRVPPASPSSHSLAPPSGERSRLARGST 510 520 530 540 550 560 510 520 530 540 550 pF1KB8 LKLNGKFSQTALELAAPTTFGSLDELAPPRP-LAR------ASRPSGAVSEDSILSSESF .. . . .:. . :. :.... : : ::. :.:: ... . :.:. CCDS56 IRSTFHGGQVRDRRAGGGGGGGVQNGPPASPTLAHEAAPLPAGRPRPTTNLFTKLTSKLT 570 580 590 600 610 620 560 570 580 590 600 610 pF1KB8 DQL-DLPERLPEPPLRGCVSVDNLTGLEEPPSEGPGSCLRRWRQDPLGDSCFSLTDCQEV .. : :::. : . .: CCDS56 RRVADEPERIGGPEVTSCHLPWDQTETAPRLLRFPWSVKLTSSRPPEALMAALRQATAAA 630 640 650 660 670 680 >>CCDS55947.1 MARK3 gene_id:4140|Hs108|chr14 (713 aa) initn: 773 init1: 741 opt: 877 Z-score: 552.7 bits: 112.6 E(32554): 1.8e-24 Smith-Waterman score: 877; 34.7% identity (63.7% similar) in 510 aa overlap (53-547:56-548) 30 40 50 60 70 80 pF1KB8 LAEGLIKSPKPLMKKQAVKRHHHKHNLRHRYEFLETLGKGTYGKVKKARES-SGRLVAIK :..:.:.:::...::: ::. .:: :::: CCDS55 QEVTSRTSRSGARCRNSIASCADEQPHIGNYRLLKTIGKGNFAKVKLARHILTGREVAIK 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 pF1KB8 SIRKDKIKDEQDLMHIRREIEIMSSLNHPHIIAIHEVFENSSKIVIVMEYASRGDLYDYI : : .. . .:... ::..::. ::::.:. . ::.:. . . ..::::: :...::. CCDS55 IIDKTQL-NPTSLQKLFREVRIMKILNHPNIVKLFEVIETEKTLYLIMEYASGGEVFDYL 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 pF1KB8 SERQQLSEREARHFFRQIVSAVHYCHQNRVVHRDLKLENILLDANGNIKIADFGLSNLYH . ...:.::: ::::::::.::::.:.:::::: ::.::::. ::::::::.:: . CCDS55 VAHGRMKEKEARSKFRQIVSAVQYCHQKRIVHRDLKAENLLLDADMNIKIADFGFSNEFT 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 pF1KB8 QGKFLQTFCGSPLYASPEIVNGKPYTGPEVDSWSLGVLLYILVHGTMPFDGHDHKILVKQ : :.:::::: ::.::. .:: : ::::: :::::.:: :: :..::::.. : : .. CCDS55 VGGKLDTFCGSPPYAAPELFQGKKYDGPEVDVWSLGVILYTLVSGSLPFDGQNLKELRER 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 310 pF1KB8 ISNGAYREPPKPSDAC-GLIRWLLMVNPTRRATLEDVASHWWVNWGYATRVGEQEAPH-E . : :: : : : .:.. .:..:: .:.:::.. . :.: :. .. : : CCDS55 VLRGKYRIPFYMSTDCENLLKRFLVLNPIKRGTLEQIMKDRWINAGHEE---DELKPFVE 270 280 290 300 310 320 320 330 340 350 360 370 pF1KB8 GGHPGSDSARASMADWLRRSSRPLLENGAK-----VCSFFKQHAPGGGSTTPGLERQHSL ::. : .. . :.. . :. .: . . . . .. . :. . ..: CCDS55 PELDISDQKRIDIMVGMGYSQEEIQESLSKMKYDEITATYLLLGRKSSEVRPSSDLNNST 330 340 350 360 370 380 380 390 400 410 420 pF1KB8 KKS---RKENDMAQSLHSDTADDTAHRPGKSNLKLPKGILKKKVSASAEGVQED--PPEL .: . . ....: .. .: : : . :: ....:.. ..:: . CCDS55 GQSPHHKVQRSVSSSQKQRRYSDHAGPAIPSVVAYPK---RSQTSTADSDLKEDGISSRK 390 400 410 420 430 430 440 450 460 470 480 pF1KB8 SPIPASPGQA-APLLPKKGILKKPRQRESGYYSSPEPSESGELLDAGDVFVSGDPKEQKP : : :.. :: : : ..: . . :: ..:. . .... .: ... CCDS55 SSGSAVGGKGIAPASPMLGNASNPNKAD-----IPERKKSSTV-PSSNTASGGMTRRNTY 440 450 460 470 480 490 490 500 510 520 530 540 pF1KB8 PQASGLLLHRKGILKLNGKFSQTALELAAPT-TFGSLDELAPPRPLARASRPSGAVSEDS . :..... ::: ..: . .:. . :.. : : : : :..:... CCDS55 VCSERTTADRHSVIQ-NGKENSTIPDQRTPVASTHSISSAATPD---RIRFPRGTASRST 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 pF1KB8 ILSSESFDQLDLPERLPEPPLRGCVSVDNLTGLEEPPSEGPGSCLRRWRQDPLGDSCFSL CCDS55 FHGQPRERRTATYNGPPASPSLSHEATPLSQTRSRGSTNLFSKLTSKLTRSRNVSAEQKD 550 560 570 580 590 600 >>CCDS41993.1 MARK3 gene_id:4140|Hs108|chr14 (729 aa) initn: 773 init1: 741 opt: 864 Z-score: 544.6 bits: 111.2 E(32554): 5.1e-24 Smith-Waterman score: 864; 51.4% identity (78.2% similar) in 257 aa overlap (53-307:56-311) 30 40 50 60 70 80 pF1KB8 LAEGLIKSPKPLMKKQAVKRHHHKHNLRHRYEFLETLGKGTYGKVKKARES-SGRLVAIK :..:.:.:::...::: ::. .:: :::: CCDS41 QEVTSRTSRSGARCRNSIASCADEQPHIGNYRLLKTIGKGNFAKVKLARHILTGREVAIK 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 pF1KB8 SIRKDKIKDEQDLMHIRREIEIMSSLNHPHIIAIHEVFENSSKIVIVMEYASRGDLYDYI : : .. . .:... ::..::. ::::.:. . ::.:. . . ..::::: :...::. CCDS41 IIDKTQL-NPTSLQKLFREVRIMKILNHPNIVKLFEVIETEKTLYLIMEYASGGEVFDYL 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 pF1KB8 SERQQLSEREARHFFRQIVSAVHYCHQNRVVHRDLKLENILLDANGNIKIADFGLSNLYH . ...:.::: ::::::::.::::.:.:::::: ::.::::. ::::::::.:: . CCDS41 VAHGRMKEKEARSKFRQIVSAVQYCHQKRIVHRDLKAENLLLDADMNIKIADFGFSNEFT 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 pF1KB8 QGKFLQTFCGSPLYASPEIVNGKPYTGPEVDSWSLGVLLYILVHGTMPFDGHDHKILVKQ : :.:::::: ::.::. .:: : ::::: :::::.:: :: :..::::.. : : .. CCDS41 VGGKLDTFCGSPPYAAPELFQGKKYDGPEVDVWSLGVILYTLVSGSLPFDGQNLKELRER 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 pF1KB8 ISNGAYREPPKPSDAC-GLIRWLLMVNPTRRATLEDVASHWWVNWGYATRVGEQEAPHEG . : :: : : : .:.. .:..:: .:.:::.. . :.: :. CCDS41 VLRGKYRIPFYMSTDCENLLKRFLVLNPIKRGTLEQIMKDRWINAGHEEDELKPFVEPEL 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 pF1KB8 GHPGSDSARASMADWLRRSSRPLLENGAKVCSFFKQHAPGGGSTTPGLERQHSLKKSRKE CCDS41 DISDQKRIDIMVGMGYSQEEIQESLSKMKYDEITATYLLLGRKSSELDASDSSSSSNLSL 330 340 350 360 370 380 >>CCDS45166.1 MARK3 gene_id:4140|Hs108|chr14 (744 aa) initn: 773 init1: 741 opt: 864 Z-score: 544.5 bits: 111.2 E(32554): 5.2e-24 Smith-Waterman score: 864; 51.4% identity (78.2% similar) in 257 aa overlap (53-307:56-311) 30 40 50 60 70 80 pF1KB8 LAEGLIKSPKPLMKKQAVKRHHHKHNLRHRYEFLETLGKGTYGKVKKARES-SGRLVAIK :..:.:.:::...::: ::. .:: :::: CCDS45 QEVTSRTSRSGARCRNSIASCADEQPHIGNYRLLKTIGKGNFAKVKLARHILTGREVAIK 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 pF1KB8 SIRKDKIKDEQDLMHIRREIEIMSSLNHPHIIAIHEVFENSSKIVIVMEYASRGDLYDYI : : .. . .:... ::..::. ::::.:. . ::.:. . . ..::::: :...::. CCDS45 IIDKTQL-NPTSLQKLFREVRIMKILNHPNIVKLFEVIETEKTLYLIMEYASGGEVFDYL 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 pF1KB8 SERQQLSEREARHFFRQIVSAVHYCHQNRVVHRDLKLENILLDANGNIKIADFGLSNLYH . ...:.::: ::::::::.::::.:.:::::: ::.::::. ::::::::.:: . CCDS45 VAHGRMKEKEARSKFRQIVSAVQYCHQKRIVHRDLKAENLLLDADMNIKIADFGFSNEFT 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 pF1KB8 QGKFLQTFCGSPLYASPEIVNGKPYTGPEVDSWSLGVLLYILVHGTMPFDGHDHKILVKQ : :.:::::: ::.::. .:: : ::::: :::::.:: :: :..::::.. : : .. CCDS45 VGGKLDTFCGSPPYAAPELFQGKKYDGPEVDVWSLGVILYTLVSGSLPFDGQNLKELRER 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 pF1KB8 ISNGAYREPPKPSDAC-GLIRWLLMVNPTRRATLEDVASHWWVNWGYATRVGEQEAPHEG . : :: : : : .:.. .:..:: .:.:::.. . :.: :. CCDS45 VLRGKYRIPFYMSTDCENLLKRFLVLNPIKRGTLEQIMKDRWINAGHEEDELKPFVEPEL 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 pF1KB8 GHPGSDSARASMADWLRRSSRPLLENGAKVCSFFKQHAPGGGSTTPGLERQHSLKKSRKE CCDS45 DISDQKRIDIMVGMGYSQEEIQESLSKMKYDEITATYLLLGRKSSELDASDSSSSSNLSL 330 340 350 360 370 380 >>CCDS45165.1 MARK3 gene_id:4140|Hs108|chr14 (753 aa) initn: 773 init1: 741 opt: 864 Z-score: 544.5 bits: 111.2 E(32554): 5.3e-24 Smith-Waterman score: 864; 51.4% identity (78.2% similar) in 257 aa overlap (53-307:56-311) 30 40 50 60 70 80 pF1KB8 LAEGLIKSPKPLMKKQAVKRHHHKHNLRHRYEFLETLGKGTYGKVKKARES-SGRLVAIK :..:.:.:::...::: ::. .:: :::: CCDS45 QEVTSRTSRSGARCRNSIASCADEQPHIGNYRLLKTIGKGNFAKVKLARHILTGREVAIK 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 pF1KB8 SIRKDKIKDEQDLMHIRREIEIMSSLNHPHIIAIHEVFENSSKIVIVMEYASRGDLYDYI : : .. . .:... ::..::. ::::.:. . ::.:. . . ..::::: :...::. CCDS45 IIDKTQL-NPTSLQKLFREVRIMKILNHPNIVKLFEVIETEKTLYLIMEYASGGEVFDYL 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 pF1KB8 SERQQLSEREARHFFRQIVSAVHYCHQNRVVHRDLKLENILLDANGNIKIADFGLSNLYH . ...:.::: ::::::::.::::.:.:::::: ::.::::. ::::::::.:: . CCDS45 VAHGRMKEKEARSKFRQIVSAVQYCHQKRIVHRDLKAENLLLDADMNIKIADFGFSNEFT 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 pF1KB8 QGKFLQTFCGSPLYASPEIVNGKPYTGPEVDSWSLGVLLYILVHGTMPFDGHDHKILVKQ : :.:::::: ::.::. .:: : ::::: :::::.:: :: :..::::.. : : .. CCDS45 VGGKLDTFCGSPPYAAPELFQGKKYDGPEVDVWSLGVILYTLVSGSLPFDGQNLKELRER 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 pF1KB8 ISNGAYREPPKPSDAC-GLIRWLLMVNPTRRATLEDVASHWWVNWGYATRVGEQEAPHEG . : :: : : : .:.. .:..:: .:.:::.. . :.: :. CCDS45 VLRGKYRIPFYMSTDCENLLKRFLVLNPIKRGTLEQIMKDRWINAGHEEDELKPFVEPEL 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 pF1KB8 GHPGSDSARASMADWLRRSSRPLLENGAKVCSFFKQHAPGGGSTTPGLERQHSLKKSRKE CCDS45 DISDQKRIDIMVGMGYSQEEIQESLSKMKYDEITATYLLLGRKSSELDASDSSSSSNLSL 330 340 350 360 370 380 >>CCDS53650.1 MARK2 gene_id:2011|Hs108|chr11 (719 aa) initn: 795 init1: 734 opt: 861 Z-score: 542.9 bits: 110.8 E(32554): 6.4e-24 Smith-Waterman score: 879; 32.9% identity (60.7% similar) in 590 aa overlap (7-567:4-566) 10 20 30 40 50 pF1KB8 MESLVFARRSGPTPSAAELARPLAEGLIKSPKPLMKKQAVKRHHHKHNLRHR-----YEF :: :: . . .: . : . : :: :.. .. .. . .. :.. CCDS53 MSSARTPLPTLNERDTEQP-TLGHLDS-KPSSKSNMIRGRNSATSADEQPHIGNYRL 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KB8 LETLGKGTYGKVKKARES-SGRLVAIKSIRKDKIKDEQDLMHIRREIEIMSSLNHPHIIA :.:.:::...::: ::. .:. ::.: : : .. . ..:... ::..::. ::::.:. CCDS53 LKTIGKGNFAKVKLARHILTGKEVAVKIIDKTQL-NSSSLQKLFREVRIMKVLNHPNIVK 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KB8 IHEVFENSSKIVIVMEYASRGDLYDYISERQQLSEREARHFFRQIVSAVHYCHQNRVVHR . ::.:. . . .:::::: :...::. . ...:.::: ::::::::.::::. .::: CCDS53 LFEVIETEKTLYLVMEYASGGEVFDYLVAHGRMKEKEARAKFRQIVSAVQYCHQKFIVHR 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KB8 DLKLENILLDANGNIKIADFGLSNLYHQGKFLQTFCGSPLYASPEIVNGKPYTGPEVDSW ::: ::.::::. ::::::::.:: . :. :.:::::: ::.::. .:: : ::::: : CCDS53 DLKAENLLLDADMNIKIADFGFSNEFTFGNKLDTFCGSPPYAAPELFQGKKYDGPEVDVW 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KB8 SLGVLLYILVHGTMPFDGHDHKILVKQISNGAYREPPKPSDAC-GLIRWLLMVNPTRRAT ::::.:: :: :..::::.. : : ... : :: : : : .:.. .:..::..:.: CCDS53 SLGVILYTLVSGSLPFDGQNLKELRERVLRGKYRIPFYMSTDCENLLKKFLILNPSKRGT 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KB8 LEDVASHWWVNWGYATRVGEQEAPHEGGHPG-SDSARASMADWLRRSSRPLLEN--GAKV ::.. . :.: :. .. :. : .: :. . . . . . .. : . CCDS53 LEQIMKDRWMNVGHED---DELKPYVEPLPDYKDPRRTELMVSMGYTREEIQDSLVGQRY 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KB8 CSFFKQHAPGGGSTTPGLERQHSLKKSRKENDMAQSLHSDTADDTAHRPGKSNLKLPKGI . . : ... :: . : : :...: .: . .:. .: :: CCDS53 NEVMATYLLLGYKSSE-LEGDTITLKPRPSADLTNS----SAPSPSHKVQRSVSANPK-- 360 370 380 390 400 420 430 440 450 460 pF1KB8 LKKKVSASAEGVQEDPPELSPIPASPGQAAPLLPKKGILKKPRQ-RESGYYSS------- ... : .: : : ::.: . . ... :.:.. :::: .: CCDS53 -QRRFSDQAAG----P----AIPTSNSYSKKTQSNNAENKRPEEDRESGRKASSTAKVPA 410 420 430 440 450 470 480 490 500 510 pF1KB8 -PEPS----ESGELLDAGDVFVSGDPKEQKPPQASGLLLHRKGILKLNGKFSQTA--LEL : :. .. ....:. .. . .. : : . .: ::: : . . . CCDS53 SPLPGLERKKTTPTPSTNSVLSTSTNRSRNSPLLERASLGQASIQ--NGKDSTAPQRVPV 460 470 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 pF1KB8 AAPTTFGSLDELAPPRPLARASRPSGAVSEDSILSSE---SFDQLDLPERL-PEPPLRGC :.:.. . . . : :.. : :. :.... ... :: .:: . : : CCDS53 ASPSAHNISSSGGAPD---RTNFPRGVSSRSTFHAGQLRQVRDQQNLPYGVTPASPSGHS 520 530 540 550 560 570 580 590 600 610 620 pF1KB8 VSVDNLTGLEEPPSEGPGSCLRRWRQDPLGDSCFSLTDCQEVTATYRQALRVCSKLT CCDS53 QGRRGASGSIFSKFTSKFVRRNLSFRFARRPHVVGSGGNDKEKEEFREAKPRSLRFTWSM 580 590 600 610 620 630 >>CCDS53649.1 MARK2 gene_id:2011|Hs108|chr11 (788 aa) initn: 769 init1: 734 opt: 861 Z-score: 542.4 bits: 110.9 E(32554): 6.9e-24 Smith-Waterman score: 876; 36.6% identity (64.0% similar) in 467 aa overlap (7-462:4-448) 10 20 30 40 50 pF1KB8 MESLVFARRSGPTPSAAELARPLAEGLIKSPKPLMKKQAVKRHHHKHNLRHR-----YEF :: :: . . .: . : . : :: :.. .. .. . .. :.. CCDS53 MSSARTPLPTLNERDTEQP-TLGHLDS-KPSSKSNMIRGRNSATSADEQPHIGNYRL 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KB8 LETLGKGTYGKVKKARES-SGRLVAIKSIRKDKIKDEQDLMHIRREIEIMSSLNHPHIIA :.:.:::...::: ::. .:. ::.: : : .. . ..:... ::..::. ::::.:. CCDS53 LKTIGKGNFAKVKLARHILTGKEVAVKIIDKTQL-NSSSLQKLFREVRIMKVLNHPNIVK 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KB8 IHEVFENSSKIVIVMEYASRGDLYDYISERQQLSEREARHFFRQIVSAVHYCHQNRVVHR . ::.:. . . .:::::: :...::. . ...:.::: ::::::::.::::. .::: CCDS53 LFEVIETEKTLYLVMEYASGGEVFDYLVAHGRMKEKEARAKFRQIVSAVQYCHQKFIVHR 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KB8 DLKLENILLDANGNIKIADFGLSNLYHQGKFLQTFCGSPLYASPEIVNGKPYTGPEVDSW ::: ::.::::. ::::::::.:: . :. :.:::::: ::.::. .:: : ::::: : CCDS53 DLKAENLLLDADMNIKIADFGFSNEFTFGNKLDTFCGSPPYAAPELFQGKKYDGPEVDVW 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KB8 SLGVLLYILVHGTMPFDGHDHKILVKQISNGAYREPPKPSDAC-GLIRWLLMVNPTRRAT ::::.:: :: :..::::.. : : ... : :: : : : .:.. .:..::..:.: CCDS53 SLGVILYTLVSGSLPFDGQNLKELRERVLRGKYRIPFYMSTDCENLLKKFLILNPSKRGT 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KB8 LEDVASHWWVNWGYATRVGEQEAPHEGGHPG-SDSARASMADWLRRSSRPLLEN--GAKV ::.. . :.: :. .. :. : .: :. . . . . . .. : . CCDS53 LEQIMKDRWMNVGHED---DELKPYVEPLPDYKDPRRTELMVSMGYTREEIQDSLVGQRY 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KB8 CSFFKQHAPGGGSTTPGLERQHSLKKSRKENDMAQSLHSDTADDTAHRPGKSNLKLPKGI . . : ... :: . : : :...: .: . .:. .: :: CCDS53 NEVMATYLLLGYKSSE-LEGDTITLKPRPSADLTNS----SAPSPSHKVQRSVSANPK-- 360 370 380 390 400 420 430 440 450 460 pF1KB8 LKKKVSASAEGVQEDPPELSPIPASPGQAAPLLPKKGILKKPRQ-RESGYYSSPEPSESG ... : .: : : ::.: . . ... :.:.. :::: .: CCDS53 -QRRFSDQAAG----PA----IPTSNSYSKKTQSNNAENKRPEEDRESGRKASSTAKVPA 410 420 430 440 450 470 480 490 500 510 520 pF1KB8 ELLDAGDVFVSGDPKEQKPPQASGLLLHRKGILKLNGKFSQTALELAAPTTFGSLDELAP CCDS53 SPLPGLERKKTTPTPSTNSVLSTSTNRSRNSPLLERASLGQASIQNGKDSLTMPGSRAST 460 470 480 490 500 510 628 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Fri Nov 4 12:35:14 2016 done: Fri Nov 4 12:35:15 2016 Total Scan time: 3.120 Total Display time: 0.100 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]