Result of FASTA (omim) for
pF1KB8398
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8398, 628 aa
1>>>pF1KB8398 628 - 628 aa - 628 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.0415+/-0.000484; mu= 3.6137+/- 0.030
mean_var=430.0848+/-98.629, 0's: 0 Z-trim(119.8): 2127 B-trim: 2180 in 2/56
Lambda= 0.061844
statistics sampled from 31529 (34292) to 31529 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.741), E-opt: 0.2 (0.402), width: 16
Scan time: 11.240
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_112214 (OMIM: 608131) NUAK family SNF1-like kin ( 672) 4245 394.0 8.9e-109
XP_005245572 (OMIM: 608131) PREDICTED: NUAK family ( 381) 2616 248.3 3.7e-65
NP_055655 (OMIM: 608130) NUAK family SNF1-like kin ( 661) 1598 157.8 1.1e-37
NP_113605 (OMIM: 606495) MAP/microtubule affinity- ( 688) 914 96.8 2.6e-19
NP_001186796 (OMIM: 606495) MAP/microtubule affini ( 752) 914 96.9 2.8e-19
XP_016876782 (OMIM: 602678) PREDICTED: MAP/microtu ( 708) 877 93.5 2.6e-18
NP_001122392 (OMIM: 602678) MAP/microtubule affini ( 713) 877 93.5 2.6e-18
XP_016876781 (OMIM: 602678) PREDICTED: MAP/microtu ( 722) 877 93.6 2.7e-18
XP_016876780 (OMIM: 602678) PREDICTED: MAP/microtu ( 728) 877 93.6 2.7e-18
XP_005267699 (OMIM: 602678) PREDICTED: MAP/microtu ( 737) 877 93.6 2.7e-18
XP_005267700 (OMIM: 602678) PREDICTED: MAP/microtu ( 643) 864 92.3 5.6e-18
NP_002367 (OMIM: 602678) MAP/microtubule affinity- ( 729) 864 92.4 6e-18
XP_005267698 (OMIM: 602678) PREDICTED: MAP/microtu ( 738) 864 92.4 6e-18
XP_006720209 (OMIM: 602678) PREDICTED: MAP/microtu ( 739) 864 92.4 6e-18
XP_011543099 (OMIM: 600526) PREDICTED: serine/thre ( 739) 864 92.4 6e-18
NP_001122391 (OMIM: 602678) MAP/microtubule affini ( 744) 864 92.4 6e-18
XP_011543097 (OMIM: 600526) PREDICTED: serine/thre ( 745) 864 92.4 6.1e-18
NP_001122390 (OMIM: 602678) MAP/microtubule affini ( 753) 864 92.4 6.1e-18
XP_011543095 (OMIM: 600526) PREDICTED: serine/thre ( 784) 864 92.4 6.2e-18
XP_011543094 (OMIM: 600526) PREDICTED: serine/thre ( 793) 864 92.5 6.3e-18
XP_011543092 (OMIM: 600526) PREDICTED: serine/thre ( 799) 864 92.5 6.3e-18
XP_011543091 (OMIM: 600526) PREDICTED: serine/thre ( 808) 864 92.5 6.3e-18
NP_001156768 (OMIM: 600526) serine/threonine-prote ( 719) 861 92.1 7.1e-18
XP_011543100 (OMIM: 600526) PREDICTED: serine/thre ( 729) 861 92.1 7.2e-18
XP_016872800 (OMIM: 600526) PREDICTED: serine/thre ( 738) 861 92.1 7.2e-18
XP_011543098 (OMIM: 600526) PREDICTED: serine/thre ( 744) 861 92.1 7.3e-18
XP_011543096 (OMIM: 600526) PREDICTED: serine/thre ( 753) 861 92.2 7.3e-18
NP_001034558 (OMIM: 600526) serine/threonine-prote ( 788) 861 92.2 7.5e-18
XP_011543093 (OMIM: 600526) PREDICTED: serine/thre ( 798) 861 92.2 7.6e-18
NP_001156769 (OMIM: 600526) serine/threonine-prote ( 709) 858 91.8 8.5e-18
NP_004945 (OMIM: 600526) serine/threonine-protein ( 724) 858 91.9 8.6e-18
XP_016872799 (OMIM: 600526) PREDICTED: serine/thre ( 763) 858 91.9 8.9e-18
NP_059672 (OMIM: 600526) serine/threonine-protein ( 745) 853 91.4 1.2e-17
NP_001273055 (OMIM: 606511) serine/threonine-prote ( 780) 850 91.2 1.5e-17
XP_005273191 (OMIM: 606511) PREDICTED: serine/thre ( 781) 850 91.2 1.5e-17
XP_011507863 (OMIM: 606511) PREDICTED: serine/thre ( 788) 850 91.2 1.5e-17
NP_061120 (OMIM: 606511) serine/threonine-protein ( 795) 850 91.2 1.5e-17
NP_001273053 (OMIM: 606511) serine/threonine-prote ( 796) 850 91.2 1.5e-17
XP_006723370 (OMIM: 606495) PREDICTED: MAP/microtu ( 685) 842 90.4 2.3e-17
XP_011541028 (OMIM: 614776) PREDICTED: serine/thre ( 660) 820 88.4 8.6e-17
NP_006242 (OMIM: 602739) 5'-AMP-activated protein ( 559) 814 87.8 1.1e-16
XP_016872913 (OMIM: 614776) PREDICTED: serine/thre (1213) 820 88.8 1.2e-16
XP_005271541 (OMIM: 614776) PREDICTED: serine/thre (1261) 820 88.8 1.2e-16
NP_001268678 (OMIM: 614776) serine/threonine-prote (1261) 820 88.8 1.2e-16
XP_011541024 (OMIM: 614776) PREDICTED: serine/thre (1309) 820 88.8 1.3e-16
XP_005271539 (OMIM: 614776) PREDICTED: serine/thre (1321) 820 88.9 1.3e-16
NP_079440 (OMIM: 614776) serine/threonine-protein (1321) 820 88.9 1.3e-16
XP_011541023 (OMIM: 614776) PREDICTED: serine/thre (1369) 820 88.9 1.3e-16
XP_005271538 (OMIM: 614776) PREDICTED: serine/thre (1369) 820 88.9 1.3e-16
XP_016876788 (OMIM: 602678) PREDICTED: MAP/microtu ( 664) 804 87.0 2.3e-16
>>NP_112214 (OMIM: 608131) NUAK family SNF1-like kinase (672 aa)
initn: 4245 init1: 4245 opt: 4245 Z-score: 2073.9 bits: 394.0 E(85289): 8.9e-109
Smith-Waterman score: 4245; 100.0% identity (100.0% similar) in 628 aa overlap (1-628:45-672)
10 20 30
pF1KB8 MESLVFARRSGPTPSAAELARPLAEGLIKS
::::::::::::::::::::::::::::::
NP_112 RPGAGPVPRASALPAQPTDSPAALAHLLLAMESLVFARRSGPTPSAAELARPLAEGLIKS
20 30 40 50 60 70
40 50 60 70 80 90
pF1KB8 PKPLMKKQAVKRHHHKHNLRHRYEFLETLGKGTYGKVKKARESSGRLVAIKSIRKDKIKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_112 PKPLMKKQAVKRHHHKHNLRHRYEFLETLGKGTYGKVKKARESSGRLVAIKSIRKDKIKD
80 90 100 110 120 130
100 110 120 130 140 150
pF1KB8 EQDLMHIRREIEIMSSLNHPHIIAIHEVFENSSKIVIVMEYASRGDLYDYISERQQLSER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_112 EQDLMHIRREIEIMSSLNHPHIIAIHEVFENSSKIVIVMEYASRGDLYDYISERQQLSER
140 150 160 170 180 190
160 170 180 190 200 210
pF1KB8 EARHFFRQIVSAVHYCHQNRVVHRDLKLENILLDANGNIKIADFGLSNLYHQGKFLQTFC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_112 EARHFFRQIVSAVHYCHQNRVVHRDLKLENILLDANGNIKIADFGLSNLYHQGKFLQTFC
200 210 220 230 240 250
220 230 240 250 260 270
pF1KB8 GSPLYASPEIVNGKPYTGPEVDSWSLGVLLYILVHGTMPFDGHDHKILVKQISNGAYREP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_112 GSPLYASPEIVNGKPYTGPEVDSWSLGVLLYILVHGTMPFDGHDHKILVKQISNGAYREP
260 270 280 290 300 310
280 290 300 310 320 330
pF1KB8 PKPSDACGLIRWLLMVNPTRRATLEDVASHWWVNWGYATRVGEQEAPHEGGHPGSDSARA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_112 PKPSDACGLIRWLLMVNPTRRATLEDVASHWWVNWGYATRVGEQEAPHEGGHPGSDSARA
320 330 340 350 360 370
340 350 360 370 380 390
pF1KB8 SMADWLRRSSRPLLENGAKVCSFFKQHAPGGGSTTPGLERQHSLKKSRKENDMAQSLHSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_112 SMADWLRRSSRPLLENGAKVCSFFKQHAPGGGSTTPGLERQHSLKKSRKENDMAQSLHSD
380 390 400 410 420 430
400 410 420 430 440 450
pF1KB8 TADDTAHRPGKSNLKLPKGILKKKVSASAEGVQEDPPELSPIPASPGQAAPLLPKKGILK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_112 TADDTAHRPGKSNLKLPKGILKKKVSASAEGVQEDPPELSPIPASPGQAAPLLPKKGILK
440 450 460 470 480 490
460 470 480 490 500 510
pF1KB8 KPRQRESGYYSSPEPSESGELLDAGDVFVSGDPKEQKPPQASGLLLHRKGILKLNGKFSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_112 KPRQRESGYYSSPEPSESGELLDAGDVFVSGDPKEQKPPQASGLLLHRKGILKLNGKFSQ
500 510 520 530 540 550
520 530 540 550 560 570
pF1KB8 TALELAAPTTFGSLDELAPPRPLARASRPSGAVSEDSILSSESFDQLDLPERLPEPPLRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_112 TALELAAPTTFGSLDELAPPRPLARASRPSGAVSEDSILSSESFDQLDLPERLPEPPLRG
560 570 580 590 600 610
580 590 600 610 620
pF1KB8 CVSVDNLTGLEEPPSEGPGSCLRRWRQDPLGDSCFSLTDCQEVTATYRQALRVCSKLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_112 CVSVDNLTGLEEPPSEGPGSCLRRWRQDPLGDSCFSLTDCQEVTATYRQALRVCSKLT
620 630 640 650 660 670
>>XP_005245572 (OMIM: 608131) PREDICTED: NUAK family SNF (381 aa)
initn: 2616 init1: 2616 opt: 2616 Z-score: 1290.9 bits: 248.3 E(85289): 3.7e-65
Smith-Waterman score: 2616; 100.0% identity (100.0% similar) in 381 aa overlap (248-628:1-381)
220 230 240 250 260 270
pF1KB8 PEIVNGKPYTGPEVDSWSLGVLLYILVHGTMPFDGHDHKILVKQISNGAYREPPKPSDAC
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MPFDGHDHKILVKQISNGAYREPPKPSDAC
10 20 30
280 290 300 310 320 330
pF1KB8 GLIRWLLMVNPTRRATLEDVASHWWVNWGYATRVGEQEAPHEGGHPGSDSARASMADWLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 GLIRWLLMVNPTRRATLEDVASHWWVNWGYATRVGEQEAPHEGGHPGSDSARASMADWLR
40 50 60 70 80 90
340 350 360 370 380 390
pF1KB8 RSSRPLLENGAKVCSFFKQHAPGGGSTTPGLERQHSLKKSRKENDMAQSLHSDTADDTAH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 RSSRPLLENGAKVCSFFKQHAPGGGSTTPGLERQHSLKKSRKENDMAQSLHSDTADDTAH
100 110 120 130 140 150
400 410 420 430 440 450
pF1KB8 RPGKSNLKLPKGILKKKVSASAEGVQEDPPELSPIPASPGQAAPLLPKKGILKKPRQRES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 RPGKSNLKLPKGILKKKVSASAEGVQEDPPELSPIPASPGQAAPLLPKKGILKKPRQRES
160 170 180 190 200 210
460 470 480 490 500 510
pF1KB8 GYYSSPEPSESGELLDAGDVFVSGDPKEQKPPQASGLLLHRKGILKLNGKFSQTALELAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 GYYSSPEPSESGELLDAGDVFVSGDPKEQKPPQASGLLLHRKGILKLNGKFSQTALELAA
220 230 240 250 260 270
520 530 540 550 560 570
pF1KB8 PTTFGSLDELAPPRPLARASRPSGAVSEDSILSSESFDQLDLPERLPEPPLRGCVSVDNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 PTTFGSLDELAPPRPLARASRPSGAVSEDSILSSESFDQLDLPERLPEPPLRGCVSVDNL
280 290 300 310 320 330
580 590 600 610 620
pF1KB8 TGLEEPPSEGPGSCLRRWRQDPLGDSCFSLTDCQEVTATYRQALRVCSKLT
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 TGLEEPPSEGPGSCLRRWRQDPLGDSCFSLTDCQEVTATYRQALRVCSKLT
340 350 360 370 380
>>NP_055655 (OMIM: 608130) NUAK family SNF1-like kinase (661 aa)
initn: 2061 init1: 1389 opt: 1598 Z-score: 797.6 bits: 157.8 E(85289): 1.1e-37
Smith-Waterman score: 2149; 57.4% identity (75.2% similar) in 657 aa overlap (21-627:24-660)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MESLVFARRSGPTPSAAELARPLAEGLIKSPKPLMKKQAVKRHHHKHNLRHRYEFLE
: . : . .: : ..::::::::::.::::. :
NP_055 MEGAAAPVAGDRPDLGLGAPGSPREAVAGATAALEP-RKPHGVKRHHHKHNLKHRYELQE
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 TLGKGTYGKVKKARES-SGRLVAIKSIRKDKIKDEQDLMHIRREIEIMSSLNHPHIIAIH
:::::::::::.: : :::.::::::::::::::::..::::::::::::::::::.:.
NP_055 TLGKGTYGKVKRATERFSGRVVAIKSIRKDKIKDEQDMVHIRREIEIMSSLNHPHIISIY
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 EVFENSSKIVIVMEYASRGDLYDYISERQQLSEREARHFFRQIVSAVHYCHQNRVVHRDL
:::::..::::.:::::.:.::::::::..:::::.:::::::::::::::.: ::::::
NP_055 EVFENKDKIVIIMEYASKGELYDYISERRRLSERETRHFFRQIVSAVHYCHKNGVVHRDL
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 KLENILLDANGNIKIADFGLSNLYHQGKFLQTFCGSPLYASPEIVNGKPYTGPEVDSWSL
:::::::: : :::::::::::::.. ::::::::::::::::::::.:: :::::::.:
NP_055 KLENILLDDNCNIKIADFGLSNLYQKDKFLQTFCGSPLYASPEIVNGRPYRGPEVDSWAL
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 GVLLYILVHGTMPFDGHDHKILVKQISNGAYREPPKPSDACGLIRWLLMVNPTRRATLED
::::: ::.::::::: ::: :..:::.: :::: .:::: :::::.::::: ::::.::
NP_055 GVLLYTLVYGTMPFDGFDHKNLIRQISSGEYREPTQPSDARGLIRWMLMVNPDRRATIED
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 VASHWWVNWGYATRVGEQEAPHEGGHPGSDSARASMADWLRRSSRPLLENGAKVCSFFKQ
.:.:::::::: . : . .: :.. : : . :: .::. .. ::. .. :
NP_055 IANHWWVNWGYKSSVCDCDALHDSESP----LLARIIDWHHRSTGLQADTEAKMKGLAK-
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB8 HAPGGGSTTPGLERQHSLKKSRKENDMAQSLHSDTADDTAHRPGKSNLKLPKGILKKKVS
: .. ::::.:::::.::::.::: . : . . :.: . : :::::::. .
NP_055 --P--TTSEVMLERQRSLKKSKKENDFAQSGQ----DAVPESPSKLSSKRPKGILKKRSN
360 370 380 390 400
420 430 440
pF1KB8 AS--------AEGV-----------QED--------P--PELSPIPA--SPGQAAPLLPK
. ::: ..: : :: . .:. :: :.: . ::
NP_055 SEHRSHSTGFIEGVVGPALPSTFKMEQDLCRTGVLLPSSPE-AEVPGKLSPKQSATM-PK
410 420 430 440 450 460
450 460 470 480 490 500
pF1KB8 KGILKKPRQRESGYYSSPEPSESGELLDAGDVFVSGDPKEQKPPQAS----GLLLHRKGI
:::::: .::::::::::: :::.::::..::. :. :. . : : .: .::::
NP_055 KGILKKTQQRESGYYSSPERSESSELLDSNDVMGSSIPSPSPPDPARVTSHSLSCRRKGI
470 480 490 500 510 520
510 520 530 540 550
pF1KB8 LKLNGKFSQTALE--LAAPT--TFGSLDELA-PPRPLARA-SRPSGAVSEDSILSSESFD
:: ..:.: ... :..: :. ::.: . : . :.:. ::::...:.::.:::.:::
NP_055 LKHSSKYSAGTMDPALVSPEMPTLESLSEPGVPAEGLSRSYSRPSSVISDDSVLSSDSFD
530 540 550 560 570 580
560 570 580 590 600
pF1KB8 QLDLPERLP-EPPLRGCVSVDNLT------GLEEPPSEGPGSCLRRWRQDPLGDSCFSL-
::: : : . .:.:::..:. ::.. : : . :.:.: . :.:: :::
NP_055 LLDLQENRPARQRIRSCVSAENFLQIQDFEGLQNRPR--P-QYLKRYR-NRLADSSFSLL
590 600 610 620 630 640
610 620
pF1KB8 TDCQEVTATYRQALRVCSKLT
:: ..:: .:.:::..::::
NP_055 TDMDDVTQVYKQALEICSKLN
650 660
>>NP_113605 (OMIM: 606495) MAP/microtubule affinity-regu (688 aa)
initn: 759 init1: 759 opt: 914 Z-score: 467.6 bits: 96.8 E(85289): 2.6e-19
Smith-Waterman score: 921; 36.7% identity (61.8% similar) in 521 aa overlap (53-537:59-563)
30 40 50 60 70 80
pF1KB8 LAEGLIKSPKPLMKKQAVKRHHHKHNLRHRYEFLETLGKGTYGKVKKARES-SGRLVAIK
:..:.:.:::...::: ::. .:: ::::
NP_113 KGPSWSSRSLGARCRNSIASCPEEQPHVGNYRLLRTIGKGNFAKVKLARHILTGREVAIK
30 40 50 60 70 80
90 100 110 120 130 140
pF1KB8 SIRKDKIKDEQDLMHIRREIEIMSSLNHPHIIAIHEVFENSSKIVIVMEYASRGDLYDYI
: : .. . ..:... ::..::..::::.:. . ::.:. . . .:::::: :...::.
NP_113 IIDKTQL-NPSSLQKLFREVRIMKGLNHPNIVKLFEVIETEKTLYLVMEYASAGEVFDYL
90 100 110 120 130 140
150 160 170 180 190 200
pF1KB8 SERQQLSEREARHFFRQIVSAVHYCHQNRVVHRDLKLENILLDANGNIKIADFGLSNLYH
. ...:.::: :::::::::::::. .:::::: ::.::::..::::::::.:: .
NP_113 VSHGRMKEKEARAKFRQIVSAVHYCHQKNIVHRDLKAENLLLDAEANIKIADFGFSNEFT
150 160 170 180 190 200
210 220 230 240 250 260
pF1KB8 QGKFLQTFCGSPLYASPEIVNGKPYTGPEVDSWSLGVLLYILVHGTMPFDGHDHKILVKQ
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. : :: : : : ...: .:..::..: :::.. . :.: :: ::. :. :
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. .:. : . . ...: :. : : . .. :: .:::
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.: . : .: ... .... :.: :. . . . ... .. : .: :
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: :.: :.: : .. .: .: : : : . .: . . :...:
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:: . . . .: : : ::: .... . :.. .: ::::
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pF1KB8 ISNGAYREPPKPSDAC-GLIRWLLMVNPTRRATLEDVASHWWVNWGYATRVGEQEAPH-E
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