FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB8417, 785 aa 1>>>pF1KB8417 785 - 785 aa - 785 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.6343+/-0.000932; mu= 13.2652+/- 0.056 mean_var=82.3551+/-17.020, 0's: 0 Z-trim(106.3): 15 B-trim: 3 in 1/48 Lambda= 0.141328 statistics sampled from 8906 (8913) to 8906 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.633), E-opt: 0.2 (0.274), width: 16 Scan time: 3.940 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS47621.1 PHTF2 gene_id:57157|Hs108|chr7 ( 751) 4879 1005.0 0 CCDS47622.1 PHTF2 gene_id:57157|Hs108|chr7 ( 747) 4837 996.4 0 CCDS47623.1 PHTF2 gene_id:57157|Hs108|chr7 ( 356) 2176 453.8 2.2e-127 CCDS47624.1 PHTF2 gene_id:57157|Hs108|chr7 ( 352) 2134 445.3 8.3e-125 CCDS861.1 PHTF1 gene_id:10745|Hs108|chr1 ( 762) 1779 372.9 1.1e-102 CCDS81359.1 PHTF1 gene_id:10745|Hs108|chr1 ( 637) 1101 234.7 3.7e-61 >>CCDS47621.1 PHTF2 gene_id:57157|Hs108|chr7 (751 aa) initn: 4952 init1: 4874 opt: 4879 Z-score: 5373.4 bits: 1005.0 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 4888; 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