FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB8419, 529 aa 1>>>pF1KB8419 529 - 529 aa - 529 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.7948+/-0.00151; mu= 12.9506+/- 0.089 mean_var=226.4865+/-45.015, 0's: 0 Z-trim(106.2): 956 B-trim: 0 in 0/50 Lambda= 0.085222 statistics sampled from 7850 (8872) to 7850 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.59), E-opt: 0.2 (0.273), width: 16 Scan time: 2.970 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS6354.1 ZNF572 gene_id:137209|Hs108|chr8 ( 529) 3833 485.2 7.7e-137 CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 616) 1676 220.1 5.8e-57 CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 658) 1676 220.2 6e-57 CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 670) 1676 220.2 6.1e-57 CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 682) 1676 220.2 6.1e-57 CCDS45463.1 ZNF629 gene_id:23361|Hs108|chr16 ( 869) 1662 218.6 2.3e-56 CCDS6437.1 ZNF16 gene_id:7564|Hs108|chr8 ( 682) 1633 214.9 2.4e-55 CCDS2715.1 ZKSCAN7 gene_id:55888|Hs108|chr3 ( 754) 1633 215.0 2.5e-55 CCDS10329.2 ZSCAN2 gene_id:54993|Hs108|chr15 ( 614) 1629 214.3 3.2e-55 CCDS2719.1 ZNF502 gene_id:91392|Hs108|chr3 ( 544) 1621 213.3 5.8e-55 CCDS62707.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 665) 1616 212.8 1e-54 CCDS62708.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 667) 1616 212.8 1e-54 CCDS12639.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 692) 1616 212.8 1e-54 CCDS11180.1 ZNF624 gene_id:57547|Hs108|chr17 ( 865) 1614 212.7 1.4e-54 CCDS74350.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1058) 1609 212.2 2.4e-54 CCDS59379.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1090) 1609 212.2 2.4e-54 CCDS6755.1 ZNF189 gene_id:7743|Hs108|chr9 ( 584) 1604 211.2 2.6e-54 CCDS65096.1 ZNF189 gene_id:7743|Hs108|chr9 ( 612) 1604 211.3 2.7e-54 CCDS6754.1 ZNF189 gene_id:7743|Hs108|chr9 ( 626) 1604 211.3 2.7e-54 CCDS31940.1 ZNF84 gene_id:7637|Hs108|chr12 ( 738) 1602 211.1 3.5e-54 CCDS76895.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16 ( 585) 1595 210.1 5.6e-54 CCDS12498.1 ZNF420 gene_id:147923|Hs108|chr19 ( 688) 1596 210.4 5.6e-54 CCDS10900.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16 ( 643) 1595 210.2 5.9e-54 CCDS4440.1 ZFP2 gene_id:80108|Hs108|chr5 ( 461) 1583 208.5 1.3e-53 CCDS12966.1 ZNF256 gene_id:10172|Hs108|chr19 ( 627) 1585 208.9 1.4e-53 CCDS4624.1 ZNF184 gene_id:7738|Hs108|chr6 ( 751) 1585 209.1 1.5e-53 CCDS75846.1 ZNF658 gene_id:26149|Hs108|chr9 (1059) 1585 209.3 1.8e-53 CCDS82413.1 ZNF544 gene_id:27300|Hs108|chr19 ( 687) 1581 208.5 2e-53 CCDS12973.1 ZNF544 gene_id:27300|Hs108|chr19 ( 715) 1581 208.5 2.1e-53 CCDS11067.1 ZFP3 gene_id:124961|Hs108|chr17 ( 502) 1577 207.8 2.4e-53 CCDS12959.2 ZNF551 gene_id:90233|Hs108|chr19 ( 670) 1577 208.0 2.8e-53 CCDS233.1 ZNF436 gene_id:80818|Hs108|chr1 ( 470) 1573 207.3 3.2e-53 CCDS31938.1 ZNF605 gene_id:100289635|Hs108|chr12 ( 641) 1575 207.7 3.2e-53 CCDS53850.1 ZNF605 gene_id:100289635|Hs108|chr12 ( 672) 1575 207.8 3.3e-53 CCDS47539.1 ZNF12 gene_id:7559|Hs108|chr7 ( 659) 1574 207.6 3.6e-53 CCDS11179.2 ZNF287 gene_id:57336|Hs108|chr17 ( 761) 1572 207.5 4.6e-53 CCDS46169.1 ZNF665 gene_id:79788|Hs108|chr19 ( 678) 1568 206.9 6.1e-53 CCDS47538.1 ZNF12 gene_id:7559|Hs108|chr7 ( 697) 1568 206.9 6.2e-53 CCDS35235.1 ZNF182 gene_id:7569|Hs108|chrX ( 620) 1567 206.7 6.3e-53 CCDS35236.1 ZNF182 gene_id:7569|Hs108|chrX ( 639) 1567 206.7 6.4e-53 CCDS33048.1 ZNF235 gene_id:9310|Hs108|chr19 ( 738) 1567 206.8 6.9e-53 CCDS12968.1 ZNF606 gene_id:80095|Hs108|chr19 ( 792) 1565 206.6 8.6e-53 CCDS12854.1 ZNF83 gene_id:55769|Hs108|chr19 ( 516) 1559 205.6 1.1e-52 CCDS82341.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19 ( 527) 1559 205.6 1.1e-52 CCDS12497.1 ZNF345 gene_id:25850|Hs108|chr19 ( 488) 1558 205.5 1.2e-52 CCDS12955.1 ZNF530 gene_id:348327|Hs108|chr19 ( 599) 1559 205.7 1.2e-52 CCDS12503.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19 ( 686) 1559 205.8 1.3e-52 CCDS7198.1 ZNF33B gene_id:7582|Hs108|chr10 ( 778) 1554 205.3 2.2e-52 CCDS55282.1 ZNF250 gene_id:58500|Hs108|chr8 ( 555) 1550 204.6 2.5e-52 CCDS34972.1 ZNF250 gene_id:58500|Hs108|chr8 ( 560) 1550 204.6 2.5e-52 >>CCDS6354.1 ZNF572 gene_id:137209|Hs108|chr8 (529 aa) initn: 3833 init1: 3833 opt: 3833 Z-score: 2570.2 bits: 485.2 E(32554): 7.7e-137 Smith-Waterman score: 3833; 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CCDS74 AFSQLAPLIQHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKPYGCNECGKSFSH 530 540 550 560 570 580 430 440 450 460 470 480 pF1KB8 SSTLVIHQRTHTGEKPYKCPDCGESFSQSFNLIRHRRTHIGEKPYKCTSCEKCFSRSAYL ::.: :.:::::::::.: :::.:: :: .: .::: : ::::: : .: : :..:. : CCDS74 SSSLSQHERTHTGEKPYECHDCGKSFRQSTHLTQHRRIHTGEKPYACRDCGKAFTHSSSL 590 600 610 620 630 640 490 500 510 520 pF1KB8 SQHRKIHVEKPFESPDVGDFPHEWTWKNCSGEMPFISSFSVSNSSS ..:.. : CCDS74 TKHQRTHTG 650 >>CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 (670 aa) initn: 3281 init1: 1669 opt: 1676 Z-score: 1135.8 bits: 220.2 E(32554): 6.1e-57 Smith-Waterman score: 1684; 57.7% identity (78.1% similar) in 397 aa overlap (108-490:272-668) 80 90 100 110 120 pF1KB8 DEIWCHDSYESDGKSENWGNFIAKEEEKPNHQEWDSGEHTNACVQQNSSFV--------- ::. .::. :.: . .: CCDS12 IEHHRTHTGERPYECHECLKGFRNSSALTKHQRIHTGEKPYKCTQCGRTFNQIAPLIQHQ 250 260 270 280 290 300 130 140 150 160 170 180 pF1KB8 -----DRPYKCSECWKSFSNSSHLRTHQRTHSGEKPYKCSECAKCFCNSSHLIQHLRMHT ..::.:::: :::: : . :.:::.:::::.::::.: : .: :: ::::.:: CCDS12 RTHTGEKPYECSECGKSFSFRSSFSQHERTHTGEKPYECSECGKAFRQSIHLTQHLRIHT 310 320 330 340 350 360 190 200 210 220 230 240 pF1KB8 GEKPYQCGECGKSFSNTSHLIIHERTHTGEKPYKCPECGKRFSSSSHLIQHHRSHTGEKP ::::::::::::.::..: : :.: :::::::.: :::: :.. . ::::.:.:::::: CCDS12 GEKPYQCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECHECGKAFTQITPLIQHQRTHTGEKP 370 380 390 400 410 420 250 260 270 280 290 300 pF1KB8 YECSVCGKGFSHSYVLIEHQRTHTGEKPYKCPDCGKSFSQSSSLIRHQRTHTGEKPYKCL :::. :::.::.: .: ::.: ::::::: : .:::.::.:::: .:.:::::::::.: CCDS12 YECGECGKAFSQSTLLTEHRRIHTGEKPYGCNECGKTFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECS 430 440 450 460 470 480 310 320 330 340 350 360 pF1KB8 ECEKSFGCNSTLIKHQRIHTGEKPYQCPECGKNFSRSSNLITHQKMHTGEKSYESSEYEE .: :.: .. : .:::::::::::.: .::: ::.::.: ::..::::: :: .. . CCDS12 QCGKAFRQSTHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECNQCGR 490 500 510 520 530 540 370 380 390 400 410 420 pF1KB8 SLGQNCNVIEECRIQLGEKPYRCCECGKSFGLSSHLIRHQRTHTGEKPYRCSECWKTFSQ ...: .:.. ::. :::::.: .::..:. :: ::.::: :: :::: :.:: :.::. CCDS12 AFSQLAPLIQHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKPYGCNECGKSFSH 550 560 570 580 590 600 430 440 450 460 470 480 pF1KB8 SSTLVIHQRTHTGEKPYKCPDCGESFSQSFNLIRHRRTHIGEKPYKCTSCEKCFSRSAYL ::.: :.:::::::::.: :::.:: :: .: .::: : ::::: : .: : :..:. : CCDS12 SSSLSQHERTHTGEKPYECHDCGKSFRQSTHLTQHRRIHTGEKPYACRDCGKAFTHSSSL 610 620 630 640 650 660 490 500 510 520 pF1KB8 SQHRKIHVEKPFESPDVGDFPHEWTWKNCSGEMPFISSFSVSNSSS ..:.. : CCDS12 TKHQRTHTG 670 >>CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 (682 aa) initn: 3281 init1: 1669 opt: 1676 Z-score: 1135.7 bits: 220.2 E(32554): 6.1e-57 Smith-Waterman score: 1684; 57.7% identity (78.1% similar) in 397 aa overlap (108-490:284-680) 80 90 100 110 120 pF1KB8 DEIWCHDSYESDGKSENWGNFIAKEEEKPNHQEWDSGEHTNACVQQNSSFV--------- ::. .::. :.: . .: CCDS54 IEHHRTHTGERPYECHECLKGFRNSSALTKHQRIHTGEKPYKCTQCGRTFNQIAPLIQHQ 260 270 280 290 300 310 130 140 150 160 170 180 pF1KB8 -----DRPYKCSECWKSFSNSSHLRTHQRTHSGEKPYKCSECAKCFCNSSHLIQHLRMHT ..::.:::: :::: : . :.:::.:::::.::::.: : .: :: ::::.:: CCDS54 RTHTGEKPYECSECGKSFSFRSSFSQHERTHTGEKPYECSECGKAFRQSIHLTQHLRIHT 320 330 340 350 360 370 190 200 210 220 230 240 pF1KB8 GEKPYQCGECGKSFSNTSHLIIHERTHTGEKPYKCPECGKRFSSSSHLIQHHRSHTGEKP ::::::::::::.::..: : :.: :::::::.: :::: :.. . ::::.:.:::::: CCDS54 GEKPYQCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECHECGKAFTQITPLIQHQRTHTGEKP 380 390 400 410 420 430 250 260 270 280 290 300 pF1KB8 YECSVCGKGFSHSYVLIEHQRTHTGEKPYKCPDCGKSFSQSSSLIRHQRTHTGEKPYKCL :::. :::.::.: .: ::.: ::::::: : .:::.::.:::: .:.:::::::::.: CCDS54 YECGECGKAFSQSTLLTEHRRIHTGEKPYGCNECGKTFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECS 440 450 460 470 480 490 310 320 330 340 350 360 pF1KB8 ECEKSFGCNSTLIKHQRIHTGEKPYQCPECGKNFSRSSNLITHQKMHTGEKSYESSEYEE .: :.: .. : .:::::::::::.: .::: ::.::.: ::..::::: :: .. . CCDS54 QCGKAFRQSTHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECNQCGR 500 510 520 530 540 550 370 380 390 400 410 420 pF1KB8 SLGQNCNVIEECRIQLGEKPYRCCECGKSFGLSSHLIRHQRTHTGEKPYRCSECWKTFSQ ...: .:.. ::. :::::.: .::..:. :: ::.::: :: :::: :.:: :.::. CCDS54 AFSQLAPLIQHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKPYGCNECGKSFSH 560 570 580 590 600 610 430 440 450 460 470 480 pF1KB8 SSTLVIHQRTHTGEKPYKCPDCGESFSQSFNLIRHRRTHIGEKPYKCTSCEKCFSRSAYL ::.: :.:::::::::.: :::.:: :: .: .::: : ::::: : .: : :..:. : CCDS54 SSSLSQHERTHTGEKPYECHDCGKSFRQSTHLTQHRRIHTGEKPYACRDCGKAFTHSSSL 620 630 640 650 660 670 490 500 510 520 pF1KB8 SQHRKIHVEKPFESPDVGDFPHEWTWKNCSGEMPFISSFSVSNSSS ..:.. : CCDS54 TKHQRTHTG 680 >>CCDS45463.1 ZNF629 gene_id:23361|Hs108|chr16 (869 aa) initn: 3144 init1: 1662 opt: 1662 Z-score: 1125.3 bits: 218.6 E(32554): 2.3e-56 Smith-Waterman score: 1675; 48.5% identity (70.6% similar) in 513 aa overlap (2-490:31-536) 10 20 30 pF1KB8 MEQEKKLLVSDSNSFMERESLKSPFTGDTSM :.:. :... .. . .:: . :.. 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CCDS45 MSLERSSQDPSVP---QNPPTPLGHSNPLDHQIPLDPPAPEVVPTPSDWTKA---CEASW 70 80 90 100 110 90 100 110 120 pF1KB8 ESDGKSENWGNFIAKEEEKPNHQEWDSGEHTNA-----CVQQNSSFV------------- . : .:.. . ..:. .: .:. ..: : . ..:: CCDS45 QW-GALTTWNSPPVVPANEPSLRELVQGRPAGAEKPYICNECGKSFSQWSKLLRHQRIHT 120 130 140 150 160 170 130 140 150 160 170 180 pF1KB8 -DRPYKCSECWKSFSNSSHLRTHQRTHSGEKPYKCSECAKCFCNSSHLIQHLRMHTGEKP .:: :::: :::..:::: :::::.::::::: .:.::: ::.:.:: : :::::: CCDS45 GERPNTCSECGKSFTQSSHLVQHQRTHTGEKPYKCPDCGKCFSWSSNLVQHQRTHTGEKP 180 190 200 210 220 230 190 200 210 220 230 240 pF1KB8 YQCGECGKSFSNTSHLIIHERTHTGEKPYKCPECGKRFSSSSHLIQHHRSHTGEKPYECS :.: :: :.:.....:: :.:.::::::::: :: . : :: ::::. .:::::::.: CCDS45 YKCTECEKAFTQSTNLIKHQRSHTGEKPYKCGECRRAFYRSSDLIQHQATHTGEKPYKCP 240 250 260 270 280 290 250 260 270 280 290 300 pF1KB8 VCGKGFSHSYVLIEHQRTHTGEKPYKCPDCGKSFSQSSSLIRHQRTHTGEKPYKCLECEK ::: :.... :..::. :.:::::.: .::::: ::: : .:::::::::::.:::: : CCDS45 ECGKRFGQNHNLLKHQKIHAGEKPYRCTECGKSFIQSSELTQHQRTHTGEKPYECLECGK 300 310 320 330 340 350 310 320 330 340 350 360 pF1KB8 SFGCNSTLIKHQRIHTGEKPYQCPECGKNFSRSSNLITHQKMHTGEKSYESSEYEESLGQ ::: .:::::::: : : :..:: :::.:. :..:. ::. ::::. :. : .:.. CCDS45 SFGHSSTLIKHQRTHLREDPFKCPVCGKTFTLSATLLRHQRTHTGERPYKCPECGKSFSV 360 370 380 390 400 410 370 380 390 400 410 420 pF1KB8 NCNVIEECRIQLGEKPYRCCECGKSFGLSSHLIRHQRTHTGEKPYRCSECWKTFSQSSTL . :.:.. ::. ::.:: : .::::: .:: :::::: :::::::.::.: :.: .:: : CCDS45 SSNLINHQRIHRGERPYICADCGKSFIMSSTLIRHQRIHTGEKPYKCSDCGKSFIRSSHL 420 430 440 450 460 470 430 440 450 460 470 480 pF1KB8 VIHQRTHTGEKPYKCPDCGESFSQSFNLIRHRRTHIGEKPYKCTSCEKCFSRSAYLSQHR . :.::::::::::::.::.::::: ::: : :::. :. . :..: : : .. : ::: CCDS45 IQHRRTHTGEKPYKCPECGKSFSQSSNLITHVRTHMDENLFVCSDCGKAFLEAHELEQHR 480 490 500 510 520 530 490 500 510 520 pF1KB8 KIHVEKPFESPDVGDFPHEWTWKNCSGEMPFISSFSVSNSSS :: CCDS45 VIHERGKTPARRAQGDSLLGLGDPSLLTPPPGAKPHKCLVCGKGFNDEGIFMQHQRIHIG 540 550 560 570 580 590 >>CCDS6437.1 ZNF16 gene_id:7564|Hs108|chr8 (682 aa) initn: 3202 init1: 1614 opt: 1633 Z-score: 1107.2 bits: 214.9 E(32554): 2.4e-55 Smith-Waterman score: 1633; 57.1% identity (79.6% similar) in 387 aa overlap (116-501:277-663) 90 100 110 120 130 140 pF1KB8 YESDGKSENWGNFIAKEEEKPNHQEWDSGEHTNACVQQNSSFVDRPYKCSECWKSFSNSS :.. .:. .::: :.:: :.::..: CCDS64 SQNSVLKNRHRSHMSEKAYQCSECGKAFRGHSDFSRHQSHHSSERPYMCNECGKAFSQNS 250 260 270 280 290 300 150 160 170 180 190 200 pF1KB8 HLRTHQRTHSGEKPYKCSECAKCFCNSSHLIQHLRMHTGEKPYQCGECGKSFSNTSHLII :. ::..: .::::.:.::.: : ::.:::: :.:.::::: :.::::.: .:.:: CCDS64 SLKKHQKSHMSEKPYECNECGKAFRRSSNLIQHQRIHSGEKPYVCSECGKAFRRSSNLIK 310 320 330 340 350 360 210 220 230 240 250 260 pF1KB8 HERTHTGEKPYKCPECGKRFSSSSHLIQHHRSHTGEKPYECSVCGKGFSHSYVLIEHQRT :.::::::::..: :::: ::.:.:: .:.: :::::::::. ::: ::. ::.:.:. 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CCDS27 CKECGKAFAHSSSLTEHHRTHTGEKLYKCSECEKTFRKYAHLSEHYRIHTGEKPYECIEC 470 480 490 500 510 520 510 520 pF1KB8 GDFPHEWTWKNCSGEMPFISSFSVSNSSS : : CCDS27 GKFFRHSSVLFRHQKLHSGD 530 540 529 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Fri Nov 4 12:45:28 2016 done: Fri Nov 4 12:45:28 2016 Total Scan time: 2.970 Total Display time: 0.100 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]