Result of FASTA (ccds) for
pF1KB8422
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8422, 744 aa
1>>>pF1KB8422 744 - 744 aa - 744 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.5227+/-0.00101; mu= 6.9366+/- 0.060
mean_var=283.5713+/-59.990, 0's: 0 Z-trim(112.9): 874 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.076163
statistics sampled from 12631 (13609) to 12631 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.748), E-opt: 0.2 (0.418), width: 16
Scan time: 3.650
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS4015.1 ZNF366 gene_id:167465|Hs108|chr5 ( 744) 5306 597.2 2.9e-170
CCDS10358.1 ZNF710 gene_id:374655|Hs108|chr15 ( 664) 2036 237.9 4e-62
CCDS46102.1 ZNF226 gene_id:7769|Hs108|chr19 ( 803) 917 115.0 4.6e-25
CCDS46162.1 ZNF836 gene_id:162962|Hs108|chr19 ( 936) 910 114.3 8.7e-25
CCDS12498.1 ZNF420 gene_id:147923|Hs108|chr19 ( 688) 906 113.7 9.7e-25
CCDS31940.1 ZNF84 gene_id:7637|Hs108|chr12 ( 738) 903 113.4 1.3e-24
CCDS56092.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19 ( 580) 892 112.1 2.5e-24
CCDS42558.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19 ( 644) 892 112.2 2.7e-24
CCDS59369.1 ZNF99 gene_id:7652|Hs108|chr19 ( 864) 889 112.0 4.1e-24
CCDS46101.1 ZNF234 gene_id:10780|Hs108|chr19 ( 700) 884 111.3 5.2e-24
CCDS12637.1 ZNF112 gene_id:7771|Hs108|chr19 ( 907) 885 111.6 5.7e-24
CCDS54276.1 ZNF112 gene_id:7771|Hs108|chr19 ( 913) 885 111.6 5.8e-24
CCDS46031.1 ZNF98 gene_id:148198|Hs108|chr19 ( 572) 881 110.9 5.8e-24
CCDS56105.1 ZNF835 gene_id:90485|Hs108|chr19 ( 537) 880 110.7 6e-24
CCDS12099.1 ZNF77 gene_id:58492|Hs108|chr19 ( 545) 878 110.5 7e-24
CCDS4624.1 ZNF184 gene_id:7738|Hs108|chr6 ( 751) 880 110.9 7.4e-24
CCDS55282.1 ZNF250 gene_id:58500|Hs108|chr8 ( 555) 877 110.4 7.7e-24
CCDS34972.1 ZNF250 gene_id:58500|Hs108|chr8 ( 560) 877 110.4 7.7e-24
CCDS12947.1 ZNF71 gene_id:58491|Hs108|chr19 ( 489) 873 109.9 9.6e-24
CCDS54258.1 ZNF540 gene_id:163255|Hs108|chr19 ( 628) 873 110.1 1.1e-23
CCDS5951.2 ZNF596 gene_id:169270|Hs108|chr8 ( 504) 871 109.7 1.1e-23
CCDS12506.1 ZNF540 gene_id:163255|Hs108|chr19 ( 660) 873 110.1 1.2e-23
CCDS54239.1 ZNF714 gene_id:148206|Hs108|chr19 ( 555) 871 109.8 1.2e-23
CCDS46208.1 ZNF805 gene_id:390980|Hs108|chr19 ( 494) 870 109.6 1.2e-23
CCDS33130.1 ZNF543 gene_id:125919|Hs108|chr19 ( 600) 871 109.8 1.3e-23
CCDS46207.1 ZNF805 gene_id:390980|Hs108|chr19 ( 627) 870 109.7 1.4e-23
CCDS46169.1 ZNF665 gene_id:79788|Hs108|chr19 ( 678) 869 109.7 1.6e-23
CCDS32977.1 ZNF85 gene_id:7639|Hs108|chr19 ( 595) 867 109.4 1.7e-23
CCDS46032.1 ZNF492 gene_id:57615|Hs108|chr19 ( 531) 865 109.1 1.9e-23
CCDS46164.1 ZNF880 gene_id:400713|Hs108|chr19 ( 577) 863 108.9 2.3e-23
CCDS46211.1 ZNF419 gene_id:79744|Hs108|chr19 ( 464) 860 108.5 2.5e-23
CCDS34357.1 ZNF311 gene_id:282890|Hs108|chr6 ( 666) 863 109.0 2.5e-23
CCDS42637.1 ZNF419 gene_id:79744|Hs108|chr19 ( 478) 860 108.5 2.5e-23
CCDS82391.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19 ( 782) 864 109.2 2.6e-23
CCDS54328.1 ZNF419 gene_id:79744|Hs108|chr19 ( 497) 860 108.5 2.6e-23
CCDS54327.1 ZNF419 gene_id:79744|Hs108|chr19 ( 498) 860 108.5 2.6e-23
CCDS54326.1 ZNF419 gene_id:79744|Hs108|chr19 ( 510) 860 108.5 2.7e-23
CCDS54325.1 ZNF419 gene_id:79744|Hs108|chr19 ( 511) 860 108.5 2.7e-23
CCDS12859.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19 ( 818) 864 109.2 2.7e-23
CCDS76895.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16 ( 585) 861 108.7 2.7e-23
CCDS33127.1 ZNF264 gene_id:9422|Hs108|chr19 ( 627) 861 108.7 2.8e-23
CCDS10900.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16 ( 643) 861 108.7 2.9e-23
CCDS74437.1 ZNF480 gene_id:147657|Hs108|chr19 ( 458) 858 108.2 2.9e-23
CCDS33048.1 ZNF235 gene_id:9310|Hs108|chr19 ( 738) 862 108.9 2.9e-23
CCDS77346.1 ZNF480 gene_id:147657|Hs108|chr19 ( 492) 858 108.3 3e-23
CCDS12959.2 ZNF551 gene_id:90233|Hs108|chr19 ( 670) 860 108.7 3.2e-23
CCDS12850.2 ZNF480 gene_id:147657|Hs108|chr19 ( 535) 858 108.3 3.2e-23
CCDS59367.1 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 ( 803) 861 108.9 3.3e-23
CCDS12413.2 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 ( 809) 861 108.9 3.3e-23
CCDS77297.1 ZNF546 gene_id:339327|Hs108|chr19 ( 810) 861 108.9 3.3e-23
>>CCDS4015.1 ZNF366 gene_id:167465|Hs108|chr5 (744 aa)
initn: 5306 init1: 5306 opt: 5306 Z-score: 3170.1 bits: 597.2 E(32554): 2.9e-170
Smith-Waterman score: 5306; 100.0% identity (100.0% similar) in 744 aa overlap (1-744:1-744)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MQKEMKMIKDEDVHFDLAVKKTPSFPHCLQPVASRGKAPQRHPFPEALRGPFSQFRYEPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 MQKEMKMIKDEDVHFDLAVKKTPSFPHCLQPVASRGKAPQRHPFPEALRGPFSQFRYEPP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 PGDLDGFPGVFEGAGSRKRKSMPTKMPYNHPAEEVTLALHSEENKNHGLPNLPLLFPQPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 PGDLDGFPGVFEGAGSRKRKSMPTKMPYNHPAEEVTLALHSEENKNHGLPNLPLLFPQPP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 RPKYDSQMIDLCNVGFQFYRSLEHFGGKPVKQEPIKPSAVWPQPTPTPFLPTPYPYYPKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 RPKYDSQMIDLCNVGFQFYRSLEHFGGKPVKQEPIKPSAVWPQPTPTPFLPTPYPYYPKV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 HPGLMFPFFVPSSSPFPFSRHTFLPKQPPEPLLPRKAEPQESEETKQKVERVDVNVQIDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 HPGLMFPFFVPSSSPFPFSRHTFLPKQPPEPLLPRKAEPQESEETKQKVERVDVNVQIDD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 SYYVDVGGSQKRWQCPTCEKSYTSKYNLVTHILGHSGIKPHACTHCGKLFKQLSHLHTHM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 SYYVDVGGSQKRWQCPTCEKSYTSKYNLVTHILGHSGIKPHACTHCGKLFKQLSHLHTHM
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 LTHQGTRPHKCQVCHKAFTQTSHLKRHMMQHSEVKPHNCRVCGRGFAYPSELKAHEAKHA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 LTHQGTRPHKCQVCHKAFTQTSHLKRHMMQHSEVKPHNCRVCGRGFAYPSELKAHEAKHA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 SGRENICVECGLDFPTLAQLKRHLTTHRGPIQYNCSECDKTFQYPSQLQNHMMKHKDIRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 SGRENICVECGLDFPTLAQLKRHLTTHRGPIQYNCSECDKTFQYPSQLQNHMMKHKDIRP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 YICSECGMEFVQPHHLKQHSLTHKGVKEHKCGICGREFTLLANMKRHVLIHTNIRAYQCH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 YICSECGMEFVQPHHLKQHSLTHKGVKEHKCGICGREFTLLANMKRHVLIHTNIRAYQCH
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB8 LCYKSFVQKQTLKAHMIVHSDVKPFKCKLCGKEFNRMHNLMGHMHLHSDSKPFKCLYCPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 LCYKSFVQKQTLKAHMIVHSDVKPFKCKLCGKEFNRMHNLMGHMHLHSDSKPFKCLYCPS
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550 560 570 580 590 600
pF1KB8 KFTLKGNLTRHMKVKHGVMERGLHSQGLGRGRIALAQTAGVLRSLEQEEPFDLSQKRRAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 KFTLKGNLTRHMKVKHGVMERGLHSQGLGRGRIALAQTAGVLRSLEQEEPFDLSQKRRAK
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610 620 630 640 650 660
pF1KB8 VPVFQSDGESAQGSHCHEEEEEDNCYEVEPYSPGLAPQSQQLCTPEDLSTKSEHAPEVLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 VPVFQSDGESAQGSHCHEEEEEDNCYEVEPYSPGLAPQSQQLCTPEDLSTKSEHAPEVLE
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB8 EACKEEKEDASKGEWEKRSKGDLGAEGGQERDCAGRDECLSLRAFQSTRRGPSFSDYLYF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 EACKEEKEDASKGEWEKRSKGDLGAEGGQERDCAGRDECLSLRAFQSTRRGPSFSDYLYF
670 680 690 700 710 720
730 740
pF1KB8 KHRDESLKELLERKMEKQAVLLGI
::::::::::::::::::::::::
CCDS40 KHRDESLKELLERKMEKQAVLLGI
730 740
>>CCDS10358.1 ZNF710 gene_id:374655|Hs108|chr15 (664 aa)
initn: 2001 init1: 2001 opt: 2036 Z-score: 1228.8 bits: 237.9 E(32554): 4e-62
Smith-Waterman score: 2064; 63.6% identity (80.6% similar) in 453 aa overlap (127-566:157-608)
100 110 120 130 140 150
pF1KB8 LALHSEENKNHGLPNLPLLFPQPPRPKYDSQMIDLCNVGFQFYRSLEHFGGKPVKQEPIK
.:::: . . :.:.:. : . .
CCDS10 PGDDKDAGPAEAPAEAASGGCDALVQSSAVKMIDLSAFSRK-PRTLRHLPRTPRPELNVA
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KB8 P-SAVWPQPT----PTPFLPTPYPYYPKVHPGLMFPFFVPSSSPFPFSRHTFLPKQPPEP
: . .: :. : : . : : .. :. : ..: :.: : .. : .: .
CCDS10 PYDPHFPAPARDGFPEPSMALPGPEALPTECGFEPPHLAPLSDPEAPSMESPEPVKPEQG
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pF1KB8 LLPRKAEPQESEET--------KQKVERVDVNVQIDDSYYVDVGGSQKRWQCPTCEKSYT
.. ..: :.. . : ...:.:.:::::::: :..: :::::: ::::::
CCDS10 FVWQEASEFEADTAGSTVERHKKAQLDRLDINVQIDDSYLVEAGDRQKRWQCRMCEKSYT
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270 280 290 300 310 320
pF1KB8 SKYNLVTHILGHSGIKPHACTHCGKLFKQLSHLHTHMLTHQGTRPHKCQVCHKAFTQTSH
::::::::::::.:::::.: ::.::::: :::.::.:::::::::::::::::::::::
CCDS10 SKYNLVTHILGHNGIKPHSCPHCSKLFKQPSHLQTHLLTHQGTRPHKCQVCHKAFTQTSH
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330 340 350 360 370 380
pF1KB8 LKRHMMQHSEVKPHNCRVCGRGFAYPSELKAHEAKHASGRENICVECGLDFPTLAQLKRH
:::::. ::::::..:. :::::::::::::::.:: ::: ..:::::::: ::.:::::
CCDS10 LKRHMLLHSEVKPYSCHFCGRGFAYPSELKAHEVKHESGRCHVCVECGLDFSTLTQLKRH
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390 400 410 420 430 440
pF1KB8 LTTHRGPIQYNCSECDKTFQYPSQLQNHMMKHKDIRPYICSECGMEFVQPHHLKQHSLTH
:..:.:: :.: ::::.:.: :::::::.::...::..:.:::::: : ::::::::::
CCDS10 LASHQGPTLYQCLECDKSFHYRSQLQNHMLKHQNVRPFVCTECGMEFSQIHHLKQHSLTH
430 440 450 460 470 480
450 460 470 480 490 500
pF1KB8 KGVKEHKCGICGREFTLLANMKRHVLIHTNIRAYQCHLCYKSFVQKQTLKAHMIVHSDVK
::::: :: .::::::: ::::::.::::..: ::::.:.:.::::::::.:::::: ::
CCDS10 KGVKEFKCEVCGREFTLQANMKRHMLIHTSVRPYQCHICFKTFVQKQTLKTHMIVHSPVK
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510 520 530 540 550 560
pF1KB8 PFKCKLCGKEFNRMHNLMGHMHLHSDSKPFKCLYCPSKFTLKGNLTRHMKVKHGVMERGL
:::::.::: ::::.::.::::::. :::::: :: :::.:::::.::::::::::. ::
CCDS10 PFKCKVCGKSFNRMYNLLGHMHLHAGSKPFKCPYCSSKFNLKGNLSRHMKVKHGVMDIGL
550 560 570 580 590 600
570 580 590 600 610 620
pF1KB8 HSQGLGRGRIALAQTAGVLRSLEQEEPFDLSQKRRAKVPVFQSDGESAQGSHCHEEEEED
::
CCDS10 DSQDPMMELTGTDPSELDGQQEMEDFEENAYSYASVDSSAEASVLTEQAMKEMAYYNVL
610 620 630 640 650 660
>>CCDS46102.1 ZNF226 gene_id:7769|Hs108|chr19 (803 aa)
initn: 2446 init1: 878 opt: 917 Z-score: 563.4 bits: 115.0 E(32554): 4.6e-25
Smith-Waterman score: 917; 39.1% identity (65.1% similar) in 312 aa overlap (246-557:468-779)
220 230 240 250 260 270
pF1KB8 KAEPQESEETKQKVERVDVNVQIDDSYYVDVGGSQKRWQCPTCEKSYTSKYNLVTHILGH
: ..: . : .: :..: . :: .: :
CCDS46 QRVHTGEKPYKCEECGKGFSRPSSLQAHQGVHTGEKSYICTVCGKGFTLSSNLQAHQRVH
440 450 460 470 480 490
280 290 300 310 320 330
pF1KB8 SGIKPHACTHCGKLFKQLSHLHTHMLTHQGTRPHKCQVCHKAFTQTSHLKRHMMQHSEVK
.: ::. :..::: :.. :: ..:...: : .:.::..: :.:.:.:.:. :. :: :
CCDS46 TGEKPYKCNECGKSFRRNSHYQVHLVVHTGEKPYKCEICGKGFSQSSYLQIHQKAHSIEK
500 510 520 530 540 550
340 350 360 370 380 390
pF1KB8 PHNCRVCGRGFAYPSELKAHEAKHASGRENICVECGLDFPTLAQLKRHLTTHRGPIQYNC
: .:. ::.:: :.:. :. :.. . : ::: : :.:: : : : :::
CCDS46 PFKCEECGQGFNQSSRLQIHQLIHTGEKPYKCEECGKGFSRRADLKIHCRIHTGEKPYNC
560 570 580 590 600 610
400 410 420 430 440 450
pF1KB8 SECDKTFQYPSQLQNHMMKHKDIRPYICSECGMEFVQPHHLKQHSLTHKGVKEHKCGICG
:: :.:. :.: :. :. .:. : ::: : . ::. :. .: : : .:: ::
CCDS46 EECGKVFRQASNLLAHQRVHSGEKPFKCEECGKSFGRSAHLQAHQKVHTGDKPYKCDECG
620 630 640 650 660 670
460 470 480 490 500 510
pF1KB8 REFTLLANMKRHVLIHTNIRAYQCHLCYKSFVQKQTLKAHMIVHSDVKPFKCKLCGKEFN
. : :. : .::. . :.: : : : : ..:. :. ::. ::.:: .::: :.
CCDS46 KGFKWSLNLDMHQRVHTGEKPYKCGECGKYFSQASSLQLHQSVHTGEKPYKCDVCGKVFS
680 690 700 710 720 730
520 530 540 550 560 570
pF1KB8 RMHNLMGHMHLHSDSKPFKCLYCPSKFTLKGNLTRHMKVKHGVMERGLHSQGLGRGRIAL
: .:..:...:. ::.:: : ..:. ..::: : ... :
CCDS46 RSSQLQSHQRVHTGEKPYKCEICGKSFSWRSNLTVHHRIHVGDKSYKSNRGGKNIRESTQ
740 750 760 770 780 790
580 590 600 610 620 630
pF1KB8 AQTAGVLRSLEQEEPFDLSQKRRAKVPVFQSDGESAQGSHCHEEEEEDNCYEVEPYSPGL
CCDS46 EKKSIK
800
>--
initn: 1232 init1: 431 opt: 565 Z-score: 354.3 bits: 76.3 E(32554): 2e-13
Smith-Waterman score: 565; 35.6% identity (60.5% similar) in 233 aa overlap (291-523:235-465)
270 280 290 300 310 320
pF1KB8 SYTSKYNLVTHILGHSGIKPHACTHCGKLFKQLSHLHTHMLTHQGTRPHKCQVCHKAFTQ
: :. :. :. : : . ..:. :.: :..
CCDS46 PIGWISHHDGHRVHKSEKSYRPNDYEKDNMKILTFDHNSMI-HTGQKSYQCNECKKPFSD
210 220 230 240 250 260
330 340 350 360 370 380
pF1KB8 TSHLKRHMMQHSEVKPHNCRVCGRGFAYPSELKAHEAKHASGRENICVECGLDFPTLAQL
: . :.. .: : .: :.:: : : .:. :. :.. : ::: .: :.:
CCDS46 LSSFDLHQQLQSGEKSLTCVERGKGFCYSPVLPVHQKVHV-GEKLKCDECGKEFSQGAHL
270 280 290 300 310 320
390 400 410 420 430 440
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CCDS46 K
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CCDS12 ECRECRKAFTQSSHLSRHQRIHTGEKPYQCKECGKAFTRGSQLTQHQRIHISEKSFEYKE
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CCDS56 FKCNECGKAFSRISSLTLHVRSHTGEKPYECNKCGKAFSQCSLLIIHMRSHTGEKPFECN
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CCDS56 ECGKAFSQRASLSIHKRGHTGERHQVY
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CCDS42 REKQSNEFGKPFYHCASYVVTPFKCNQCGQDFSHKFDLIRHERIHAGEKPYECKECGKAF
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pF1KB8 TSKYNLVTHILGHSGIKPHACTHCGKLFKQLSHLHTHMLTHQGTRPHKCQVCHKAFTQTS
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CCDS42 SRKENLITHQKIHTGEKPYKCNECGKAFIQMSNLIRHHRIHTGEKPYACKDCWKAFSQKS
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CCDS42 HTAEKPYECKECGKAFSRKENLITHQKIHTGEKPYECSECGKAFIQMSNLIRHQRIHTGE
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CCDS42 FKCNECGKAFSRISSLTLHVRSHTGEKPYECNKCGKAFSQCSLLIIHMRSHTGEKPFECN
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CCDS46 TR
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]