Result of FASTA (omim) for
pF1KB8432
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8432, 933 aa
1>>>pF1KB8432 933 - 933 aa - 933 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2352+/-0.000372; mu= 21.7877+/- 0.023
mean_var=65.7297+/-13.445, 0's: 0 Z-trim(113.6): 31 B-trim: 729 in 1/49
Lambda= 0.158195
statistics sampled from 23070 (23087) to 23070 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.631), E-opt: 0.2 (0.271), width: 16
Scan time: 13.200
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_002654 (OMIM: 602384) phospholipase D2 isoform ( 933) 6328 1453.5 0
NP_001230037 (OMIM: 602384) phospholipase D2 isofo ( 922) 5486 1261.4 0
XP_005256753 (OMIM: 602384) PREDICTED: phospholipa ( 548) 3701 853.8 0
XP_016880253 (OMIM: 602384) PREDICTED: phospholipa ( 537) 2859 661.7 2.8e-189
XP_016862113 (OMIM: 602382) PREDICTED: phospholipa ( 657) 1846 430.5 1.3e-119
XP_011511201 (OMIM: 602382) PREDICTED: phospholipa ( 657) 1846 430.5 1.3e-119
XP_005247590 (OMIM: 602382) PREDICTED: phospholipa (1074) 1846 430.6 2e-119
NP_002653 (OMIM: 602382) phospholipase D1 isoform (1074) 1846 430.6 2e-119
NP_001123553 (OMIM: 602382) phospholipase D1 isofo (1036) 1842 429.7 3.6e-119
XP_005247591 (OMIM: 602382) PREDICTED: phospholipa (1036) 1842 429.7 3.6e-119
XP_011511200 (OMIM: 602382) PREDICTED: phospholipa ( 969) 1493 350.1 3.2e-95
XP_011511199 (OMIM: 602382) PREDICTED: phospholipa ( 971) 1493 350.1 3.2e-95
XP_016862112 (OMIM: 602382) PREDICTED: phospholipa ( 933) 1489 349.1 5.9e-95
>>NP_002654 (OMIM: 602384) phospholipase D2 isoform PLD2 (933 aa)
initn: 6328 init1: 6328 opt: 6328 Z-score: 7794.4 bits: 1453.5 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 6328; 99.8% identity (99.8% similar) in 933 aa overlap (1-933:1-933)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MTATPESLFPTGDELDSSQLQMESDEVDTLKEGEDPADRMHPFLAIYELQSLKVHPLVFA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 MTATPESLFPTGDELDSSQLQMESDEVDTLKEGEDPADRMHPFLAIYELQSLKVHPLVFA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 PGVPVTAQVVGTERYTSGSKVGTCTLYSVRLTHGDFSWTTKKKYRHFQELHRDLLRHKVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 PGVPVTAQVVGTERYTSGSKVGTCTLYSVRLTHGDFSWTTKKKYRHFQELHRDLLRHKVL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 MSLLPLARFAVAYSPARDAGNREMPSLPRAGPEGSTRHAASKQKYLENYLNCLLTMSFYR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::
NP_002 MSLLPLARFAVAYSPARDAGNREMPSLPRAGPEGSTRHAASKQKYLENYLNRLLTMSFYR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 NYHAMTEFLEVSQLSFIPDLGRKGLEGMIRKRSGGHRVPGLTCCGRDQVCYRWSKRWLVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 NYHAMTEFLEVSQLSFIPDLGRKGLEGMIRKRSGGHRVPGLTCCGRDQVCYRWSKRWLVV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 KDSFLLYMCLETGAISFVQLFDPGFEVQVGKRSTEARHGVRIDTSHRSLILKCSSYRQAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 KDSFLLYMCLETGAISFVQLFDPGFEVQVGKRSTEARHGVRIDTSHRSLILKCSSYRQAR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 WWAQEITELAQGPGRDFLQLHRHDSYAPPRPGTLARWFVNGAGYFAAVADAILRAQEEIF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 WWAQEITELAQGPGRDFLQLHRHDSYAPPRPGTLARWFVNGAGYFAAVADAILRAQEEIF
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 ITDWWLSPEVYLKRPAHSDDWRLDIMLKRKAEEGVRVSILLFKEVELALGINSGYSKRAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 ITDWWLSPEVYLKRPAHSDDWRLDIMLKRKAEEGVRVSILLFKEVELALGINSGYSKRAL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 MLLHPNIKVMRHPDQVTLWAHHEKLLVVDQVVAFLGGLDLAYGRWDDLHYRLTDLGDSSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 MLLHPNIKVMRHPDQVTLWAHHEKLLVVDQVVAFLGGLDLAYGRWDDLHYRLTDLGDSSE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB8 SAASQPPTPRPDSPATPDLSHNQFFWLGKDYSNLITKDWVQLDRPFEDFIDRETTPRMPW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 SAASQPPTPRPDSPATPDLSHNQFFWLGKDYSNLITKDWVQLDRPFEDFIDRETTPRMPW
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB8 RDVGVVVHGLPARDLARHFIQRWNFTKTTKAKYKTPIYPYLLPKSTSTANQLPFTLPGGQ
:::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::
NP_002 RDVGVVVHGLPARDLARHFIQRWNFTKTTKAKYKTPTYPYLLPKSTSTANQLPFTLPGGQ
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB8 CTTVQVLRSVDRWSAGTLENSILNAYLHTIRESQHFLYIENQFFISCSDGRTVLNKVGDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 CTTVQVLRSVDRWSAGTLENSILNAYLHTIRESQHFLYIENQFFISCSDGRTVLNKVGDE
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB8 IVDRILKAHKQGWCYRVYVLLPLLPGFEGDISTGGGNSIQAILHFTYRTLCRGEYSILHR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 IVDRILKAHKQGWCYRVYVLLPLLPGFEGDISTGGGNSIQAILHFTYRTLCRGEYSILHR
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB8 LKAAMGTAWRDYISICGLRTHGELGGHPVSELIYIHSKVLIADDRTVIIGSANINDRSLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 LKAAMGTAWRDYISICGLRTHGELGGHPVSELIYIHSKVLIADDRTVIIGSANINDRSLL
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB8 GKRDSELAVLIEDTETEPSLMNGAEYQAGRFALSLRKHCFGVILGANTRPDLDLRDPICD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 GKRDSELAVLIEDTETEPSLMNGAEYQAGRFALSLRKHCFGVILGANTRPDLDLRDPICD
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB8 DFFQLWQDMAESNANIYEQIFRCLPSNATRSLRTLREYVAVEPLATVSPPLARSELTQVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 DFFQLWQDMAESNANIYEQIFRCLPSNATRSLRTLREYVAVEPLATVSPPLARSELTQVQ
850 860 870 880 890 900
910 920 930
pF1KB8 GHLVHFPLKFLEDESLLPPLGSKEGMIPLEVWT
:::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 GHLVHFPLKFLEDESLLPPLGSKEGMIPLEVWT
910 920 930
>>NP_001230037 (OMIM: 602384) phospholipase D2 isoform P (922 aa)
initn: 5486 init1: 5486 opt: 5486 Z-score: 6755.9 bits: 1261.4 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 6209; 98.5% identity (98.6% similar) in 933 aa overlap (1-933:1-922)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MTATPESLFPTGDELDSSQLQMESDEVDTLKEGEDPADRMHPFLAIYELQSLKVHPLVFA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MTATPESLFPTGDELDSSQLQMESDEVDTLKEGEDPADRMHPFLAIYELQSLKVHPLVFA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 PGVPVTAQVVGTERYTSGSKVGTCTLYSVRLTHGDFSWTTKKKYRHFQELHRDLLRHKVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PGVPVTAQVVGTERYTSGSKVGTCTLYSVRLTHGDFSWTTKKKYRHFQELHRDLLRHKVL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 MSLLPLARFAVAYSPARDAGNREMPSLPRAGPEGSTRHAASKQKYLENYLNCLLTMSFYR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::
NP_001 MSLLPLARFAVAYSPARDAGNREMPSLPRAGPEGSTRHAASKQKYLENYLNRLLTMSFYR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 NYHAMTEFLEVSQLSFIPDLGRKGLEGMIRKRSGGHRVPGLTCCGRDQVCYRWSKRWLVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NYHAMTEFLEVSQLSFIPDLGRKGLEGMIRKRSGGHRVPGLTCCGRDQVCYRWSKRWLVV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 KDSFLLYMCLETGAISFVQLFDPGFEVQVGKRSTEARHGVRIDTSHRSLILKCSSYRQAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KDSFLLYMCLETGAISFVQLFDPGFEVQVGKRSTEARHGVRIDTSHRSLILKCSSYRQAR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 WWAQEITELAQGPGRDFLQLHRHDSYAPPRPGTLARWFVNGAGYFAAVADAILRAQEEIF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 WWAQEITELAQGPGRDFLQLHRHDSYAPPRPGTLARWFVNGAGYFAAVADAILRAQEEIF
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 ITDWWLSPEVYLKRPAHSDDWRLDIMLKRKAEEGVRVSILLFKEVELALGINSGYSKRAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ITDWWLSPEVYLKRPAHSDDWRLDIMLKRKAEEGVRVSILLFKEVELALGINSGYSKRAL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 MLLHPNIKVMRHPDQVTLWAHHEKLLVVDQVVAFLGGLDLAYGRWDDLHYRLTDLGDSSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MLLHPNIKVMRHPDQVTLWAHHEKLLVVDQVVAFLGGLDLAYGRWDDLHYRLTDLGDSSE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB8 SAASQPPTPRPDSPATPDLSHNQFFWLGKDYSNLITKDWVQLDRPFEDFIDRETTPRMPW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SAASQPPTPRPDSPATPDLSHNQFFWLGKDYSNLITKDWVQLDRPFEDFIDRETTPRMPW
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB8 RDVGVVVHGLPARDLARHFIQRWNFTKTTKAKYKTPIYPYLLPKSTSTANQLPFTLPGGQ
:::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::
NP_001 RDVGVVVHGLPARDLARHFIQRWNFTKTTKAKYKTPTYPYLLPKSTSTANQLPFTLPGGQ
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB8 CTTVQVLRSVDRWSAGTLENSILNAYLHTIRESQHFLYIENQFFISCSDGRTVLNKVGDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 CTTVQVLRSVDRWSAGTLENSILNAYLHTIRESQHFLYIENQFFISCSDGRTVLNKVGDE
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB8 IVDRILKAHKQGWCYRVYVLLPLLPGFEGDISTGGGNSIQAILHFTYRTLCRGEYSILHR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IVDRILKAHKQGWCYRVYVLLPLLPGFEGDISTGGGNSIQAILHFTYRTLCRGEYSILHR
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB8 LKAAMGTAWRDYISICGLRTHGELGGHPVSELIYIHSKVLIADDRTVIIGSANINDRSLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LKAAMGTAWRDYISICGLRTHGELGGHPVSELIYIHSKVLIADDRTVIIGSANINDRSLL
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB8 GKRDSELAVLIEDTETEPSLMNGAEYQAGRFALSLRKHCFGVILGANTRPDLDLRDPICD
::::::::::::::::::::::::::::: .:::::::::::::::::::
NP_001 GKRDSELAVLIEDTETEPSLMNGAEYQAG-----------SVILGANTRPDLDLRDPICD
790 800 810 820
850 860 870 880 890 900
pF1KB8 DFFQLWQDMAESNANIYEQIFRCLPSNATRSLRTLREYVAVEPLATVSPPLARSELTQVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DFFQLWQDMAESNANIYEQIFRCLPSNATRSLRTLREYVAVEPLATVSPPLARSELTQVQ
830 840 850 860 870 880
910 920 930
pF1KB8 GHLVHFPLKFLEDESLLPPLGSKEGMIPLEVWT
:::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GHLVHFPLKFLEDESLLPPLGSKEGMIPLEVWT
890 900 910 920
>>XP_005256753 (OMIM: 602384) PREDICTED: phospholipase D (548 aa)
initn: 3701 init1: 3701 opt: 3701 Z-score: 4557.6 bits: 853.8 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 3701; 99.8% identity (99.8% similar) in 548 aa overlap (386-933:1-548)
360 370 380 390 400 410
pF1KB8 QEEIFITDWWLSPEVYLKRPAHSDDWRLDIMLKRKAEEGVRVSILLFKEVELALGINSGY
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MLKRKAEEGVRVSILLFKEVELALGINSGY
10 20 30
420 430 440 450 460 470
pF1KB8 SKRALMLLHPNIKVMRHPDQVTLWAHHEKLLVVDQVVAFLGGLDLAYGRWDDLHYRLTDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 SKRALMLLHPNIKVMRHPDQVTLWAHHEKLLVVDQVVAFLGGLDLAYGRWDDLHYRLTDL
40 50 60 70 80 90
480 490 500 510 520 530
pF1KB8 GDSSESAASQPPTPRPDSPATPDLSHNQFFWLGKDYSNLITKDWVQLDRPFEDFIDRETT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 GDSSESAASQPPTPRPDSPATPDLSHNQFFWLGKDYSNLITKDWVQLDRPFEDFIDRETT
100 110 120 130 140 150
540 550 560 570 580 590
pF1KB8 PRMPWRDVGVVVHGLPARDLARHFIQRWNFTKTTKAKYKTPIYPYLLPKSTSTANQLPFT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::
XP_005 PRMPWRDVGVVVHGLPARDLARHFIQRWNFTKTTKAKYKTPTYPYLLPKSTSTANQLPFT
160 170 180 190 200 210
600 610 620 630 640 650
pF1KB8 LPGGQCTTVQVLRSVDRWSAGTLENSILNAYLHTIRESQHFLYIENQFFISCSDGRTVLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LPGGQCTTVQVLRSVDRWSAGTLENSILNAYLHTIRESQHFLYIENQFFISCSDGRTVLN
220 230 240 250 260 270
660 670 680 690 700 710
pF1KB8 KVGDEIVDRILKAHKQGWCYRVYVLLPLLPGFEGDISTGGGNSIQAILHFTYRTLCRGEY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 KVGDEIVDRILKAHKQGWCYRVYVLLPLLPGFEGDISTGGGNSIQAILHFTYRTLCRGEY
280 290 300 310 320 330
720 730 740 750 760 770
pF1KB8 SILHRLKAAMGTAWRDYISICGLRTHGELGGHPVSELIYIHSKVLIADDRTVIIGSANIN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 SILHRLKAAMGTAWRDYISICGLRTHGELGGHPVSELIYIHSKVLIADDRTVIIGSANIN
340 350 360 370 380 390
780 790 800 810 820 830
pF1KB8 DRSLLGKRDSELAVLIEDTETEPSLMNGAEYQAGRFALSLRKHCFGVILGANTRPDLDLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 DRSLLGKRDSELAVLIEDTETEPSLMNGAEYQAGRFALSLRKHCFGVILGANTRPDLDLR
400 410 420 430 440 450
840 850 860 870 880 890
pF1KB8 DPICDDFFQLWQDMAESNANIYEQIFRCLPSNATRSLRTLREYVAVEPLATVSPPLARSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 DPICDDFFQLWQDMAESNANIYEQIFRCLPSNATRSLRTLREYVAVEPLATVSPPLARSE
460 470 480 490 500 510
900 910 920 930
pF1KB8 LTQVQGHLVHFPLKFLEDESLLPPLGSKEGMIPLEVWT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LTQVQGHLVHFPLKFLEDESLLPPLGSKEGMIPLEVWT
520 530 540
>>XP_016880253 (OMIM: 602384) PREDICTED: phospholipase D (537 aa)
initn: 2859 init1: 2859 opt: 2859 Z-score: 3519.1 bits: 661.7 E(85289): 2.8e-189
Smith-Waterman score: 3582; 97.6% identity (97.8% similar) in 548 aa overlap (386-933:1-537)
360 370 380 390 400 410
pF1KB8 QEEIFITDWWLSPEVYLKRPAHSDDWRLDIMLKRKAEEGVRVSILLFKEVELALGINSGY
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MLKRKAEEGVRVSILLFKEVELALGINSGY
10 20 30
420 430 440 450 460 470
pF1KB8 SKRALMLLHPNIKVMRHPDQVTLWAHHEKLLVVDQVVAFLGGLDLAYGRWDDLHYRLTDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SKRALMLLHPNIKVMRHPDQVTLWAHHEKLLVVDQVVAFLGGLDLAYGRWDDLHYRLTDL
40 50 60 70 80 90
480 490 500 510 520 530
pF1KB8 GDSSESAASQPPTPRPDSPATPDLSHNQFFWLGKDYSNLITKDWVQLDRPFEDFIDRETT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GDSSESAASQPPTPRPDSPATPDLSHNQFFWLGKDYSNLITKDWVQLDRPFEDFIDRETT
100 110 120 130 140 150
540 550 560 570 580 590
pF1KB8 PRMPWRDVGVVVHGLPARDLARHFIQRWNFTKTTKAKYKTPIYPYLLPKSTSTANQLPFT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::
XP_016 PRMPWRDVGVVVHGLPARDLARHFIQRWNFTKTTKAKYKTPTYPYLLPKSTSTANQLPFT
160 170 180 190 200 210
600 610 620 630 640 650
pF1KB8 LPGGQCTTVQVLRSVDRWSAGTLENSILNAYLHTIRESQHFLYIENQFFISCSDGRTVLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LPGGQCTTVQVLRSVDRWSAGTLENSILNAYLHTIRESQHFLYIENQFFISCSDGRTVLN
220 230 240 250 260 270
660 670 680 690 700 710
pF1KB8 KVGDEIVDRILKAHKQGWCYRVYVLLPLLPGFEGDISTGGGNSIQAILHFTYRTLCRGEY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KVGDEIVDRILKAHKQGWCYRVYVLLPLLPGFEGDISTGGGNSIQAILHFTYRTLCRGEY
280 290 300 310 320 330
720 730 740 750 760 770
pF1KB8 SILHRLKAAMGTAWRDYISICGLRTHGELGGHPVSELIYIHSKVLIADDRTVIIGSANIN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SILHRLKAAMGTAWRDYISICGLRTHGELGGHPVSELIYIHSKVLIADDRTVIIGSANIN
340 350 360 370 380 390
780 790 800 810 820 830
pF1KB8 DRSLLGKRDSELAVLIEDTETEPSLMNGAEYQAGRFALSLRKHCFGVILGANTRPDLDLR
:::::::::::::::::::::::::::::::::: .::::::::::::::
XP_016 DRSLLGKRDSELAVLIEDTETEPSLMNGAEYQAG-----------SVILGANTRPDLDLR
400 410 420 430
840 850 860 870 880 890
pF1KB8 DPICDDFFQLWQDMAESNANIYEQIFRCLPSNATRSLRTLREYVAVEPLATVSPPLARSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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XP_016 LTQVQGHLVHFPLKFLEDESLLPPLGSKEGMIPLEVWT
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370 380 390 400 410 420
pF1KB8 VYLKRPAHSDDWRLDIMLKRKAEEGVRVSILLFKEVELALGINSGYSKRALMLLHPNIKV
.:.::::::::::: :.::.:: :::::::
XP_011 MLYKEVELALGINSEYTKRTLMRLHPNIKV
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: .: ::. ::
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pF1KB8 QDMAESNANIYEQIFRCLPSNATRSLRTLREYVAVEPLATVSPPLARSELTQVQGHLVHF
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pF1KB8 PLKFLEDESLLPPLGSKEGMIPLEVWT
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XP_011 PFYFLSEESLLPSVGTKEAIVPMEVWT
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. ..::.:::. :::: :.:: ::.:.:..:.:..::::::::::.: ..:.::
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pF1KB8 VPVTAQVVGTERYTSGSKVGTCTLYSVRLTHGDFSWTTKKKYRHFQELHRDLLRHKVLMS
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pF1KB8 L-LPLARFAVAYSPARDAGNREMPSLPRAGPEGSTRHAA--SKQKYLENYLNCLLTMSFY
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NP_002 IPIPTRRHTFRRQNVREEP-REMPSLPRSS-ENMIREEQFLGRRKQLEDYLTKILKMPMY
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NP_002 RNYHATTEFLDISQLSFIHDLGPKGIEGMIMKRSGGHRIPGLNCCGQGRACYRWSKRWLI
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pF1KB8 VKDSFLLYMCLETGAISFVQLFDPGFEVQVGKRSTEARHGVRIDTSHRSLILKCSSYRQA
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NP_002 VKDSFLLYMKPDSGAIAFVLLVDKEFKIKVGKKETETKYGIRIDNLSRTLILKCNSYRHA
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pF1KB8 RWWAQEITELAQGPGRDFLQLHRHDSYAPPRPGTLARWFVNGAGYFAAVADAILRAQEEI
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NP_002 RWWGGAIEEFIQKHGTNFLKDHRFGSYAAIQENALAKWYVNAKGYFEDVANAMEEANEEI
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pF1KB8 LGD-----SSESAASQPPT--------------------------------------PRP
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pF1KB8 ------------------DSPATPDLSHNQF-----------------------------
:: .. : . . :
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:: :::: :.. :::::::.:: ::::: .::::
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:: .::: .:. : .:::.::::::.:: :. :.::::.:::.::::: :::::::::::
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pF1KB8 TVQVLRSVDRWSAGTL--ENSILNAYLHTIRESQHFLYIENQFFISCSDGRTVLNKVGDE
.::.:::. :::: :.:: ::.:.:..:.:..::::::::::.: ..:.::.::
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:..::::::... :::::..::::::::::::::::..:::.::.:::.:::: ::: .
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pF1KB8 LKAAMGTAWRDYISICGLRTHGELGGHPVSELIYIHSKVLIADDRTVIIGSANINDRSLL
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NP_001 LKAELGNQWINYISFCGLRTHAELEGNLVTELIYVHSKLLIADDNTVIIGSANINDRSML
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pF1KB8 GKRDSELAVLIEDTETEPSLMNGAEYQAGRFALSLRKHCFGVILGANTRPDLDLRDPICD
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pF1KB8 DFFQ-LWQDMAESNANIYEQIFRCLPSNATRSLRTLREYVAVEPLATVSPPLARSELTQV
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30 40 50 60 70 80
pF1KB8 TLKEGEDPADRMHPFLAIYELQSLKVHPLVFAPGVPVTAQVVGTERYTSGSKVGTCTLYS
. : :. :::. .::.:: ..: . .::.
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pF1KB8 VRLTHGDFSWTTKKKYRHFQELHRDLLRHKVLMSL-LPLARFAVAYSPARDAGNREMPSL
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150 160 170 180 190 200
pF1KB8 PRAGPEGSTRHAA--SKQKYLENYLNCLLTMSFYRNYHAMTEFLEVSQLSFIPDLGRKGL
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XP_005 PRSS-ENMIREEQFLGRRKQLEDYLTKILKMPMYRNYHATTEFLDISQLSFIHDLGPKGI
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pF1KB8 EGMIRKRSGGHRVPGLTCCGRDQVCYRWSKRWLVVKDSFLLYMCLETGAISFVQLFDPGF
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pF1KB8 YAPPRPGTLARWFVNGAGYFAAVADAILRAQEEIFITDWWLSPEVYLKRPA-HSDDWRLD
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490
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XP_005 IAQRILKAHRENQKYRVYVVIPLLPGFEGDISTGGGNALQAIMHFNYRTMCRGENSILGQ
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730 740 750 760 770 780
pF1KB8 LKAAMGTAWRDYISICGLRTHGELGGHPVSELIYIHSKVLIADDRTVIIGSANINDRSLL
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XP_005 LKAELGNQWINYISFCGLRTHAELEGNLVTELIYVHSKLLIADDNTVIIGSANINDRSML
830 840 850 860 870 880
790 800 810 820 830 840
pF1KB8 GKRDSELAVLIEDTETEPSLMNGAEYQAGRFALSLRKHCFGVILGANTRPDLDLRDPICD
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XP_005 GKRDSEMAVIVQDTETVPSVMDGKEYQAGRFARGLRLQCFRVVLGYLDDPSEDIQDPVSD
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850 860 870 880 890
pF1KB8 DFFQ-LWQDMAESNANIYEQIFRCLPSNATRSLRTLREYVAVEPLATVSPPLARSELTQV
::. .: . : ::.::...:::::.. ...: ::... :: .: :. :: ..
XP_005 KFFKEVWVSTAARNATIYDKVFRCLPNDEVHNLIQLRDFINKPVLAKEDPIRAEEELKKI
950 960 970 980 990 1000
900 910 920 930
pF1KB8 QGHLVHFPLKFLEDESLLPPLGSKEGMIPLEVWT
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XP_005 RGFLVQFPFYFLSEESLLPSVGTKEAIVPMEVWT
1010 1020 1030
933 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 12:52:10 2016 done: Fri Nov 4 12:52:12 2016
Total Scan time: 13.200 Total Display time: 0.290
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]