FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB8433, 283 aa 1>>>pF1KB8433 283 - 283 aa - 283 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.2148+/-0.00127; mu= -10.7994+/- 0.071 mean_var=332.6817+/-79.050, 0's: 0 Z-trim(108.3): 491 B-trim: 340 in 2/49 Lambda= 0.070317 statistics sampled from 9478 (10145) to 9478 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.692), E-opt: 0.2 (0.312), width: 16 Scan time: 2.480 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS10984.2 CDK10 gene_id:8558|Hs108|chr16 ( 360) 1893 206.2 2.8e-53 CCDS32514.2 CDK10 gene_id:8558|Hs108|chr16 ( 272) 1653 181.7 5e-46 CCDS72682.1 CDK11B gene_id:984|Hs108|chr1 ( 748) 984 114.3 2.8e-25 CCDS72684.1 CDK11B gene_id:984|Hs108|chr1 ( 782) 984 114.3 2.8e-25 CCDS72683.1 CDK11B gene_id:984|Hs108|chr1 ( 795) 984 114.3 2.9e-25 CCDS44043.1 CDK11A gene_id:728642|Hs108|chr1 ( 770) 982 114.1 3.2e-25 CCDS81254.1 CDK11A gene_id:728642|Hs108|chr1 ( 779) 982 114.1 3.3e-25 CCDS44042.1 CDK11A gene_id:728642|Hs108|chr1 ( 780) 982 114.1 3.3e-25 CCDS81253.1 CDK11A gene_id:728642|Hs108|chr1 ( 783) 982 114.1 3.3e-25 CCDS11736.1 CDK3 gene_id:1018|Hs108|chr17 ( 305) 677 82.8 3.4e-16 CCDS8898.1 CDK2 gene_id:1017|Hs108|chr12 ( 298) 672 82.2 4.8e-16 CCDS3999.1 CDK7 gene_id:1022|Hs108|chr5 ( 346) 659 81.0 1.3e-15 CCDS47748.1 CDK5 gene_id:1020|Hs108|chr7 ( 292) 632 78.2 7.9e-15 CCDS9061.1 CDK17 gene_id:5128|Hs108|chr12 ( 523) 633 78.5 1.1e-14 CCDS53819.1 CDK17 gene_id:5128|Hs108|chr12 ( 523) 633 78.5 1.1e-14 CCDS44408.1 CDK1 gene_id:983|Hs108|chr10 ( 297) 617 76.7 2.3e-14 CCDS44300.1 CDK18 gene_id:5129|Hs108|chr1 ( 474) 619 77.1 2.8e-14 CCDS1454.1 CDK18 gene_id:5129|Hs108|chr1 ( 504) 619 77.1 2.9e-14 CCDS14276.1 CDK16 gene_id:5127|Hs108|chrX ( 496) 617 76.9 3.3e-14 CCDS48101.1 CDK16 gene_id:5127|Hs108|chrX ( 502) 617 76.9 3.3e-14 CCDS55408.1 CDK16 gene_id:5127|Hs108|chrX ( 570) 617 76.9 3.7e-14 CCDS6879.1 CDK9 gene_id:1025|Hs108|chr9 ( 372) 604 75.4 6.7e-14 CCDS75628.1 CDK14 gene_id:5218|Hs108|chr7 ( 340) 595 74.5 1.2e-13 CCDS75627.1 CDK14 gene_id:5218|Hs108|chr7 ( 423) 595 74.6 1.4e-13 CCDS5619.1 CDK14 gene_id:5218|Hs108|chr7 ( 451) 595 74.6 1.5e-13 CCDS75626.1 CDK14 gene_id:5218|Hs108|chr7 ( 469) 595 74.6 1.5e-13 CCDS8953.1 CDK4 gene_id:1019|Hs108|chr12 ( 303) 584 73.3 2.4e-13 CCDS35060.1 CDK20 gene_id:23552|Hs108|chr9 ( 346) 585 73.5 2.4e-13 CCDS2350.1 CDK15 gene_id:65061|Hs108|chr2 ( 384) 583 73.3 3e-13 CCDS58746.1 CDK15 gene_id:65061|Hs108|chr2 ( 400) 583 73.3 3.1e-13 CCDS58747.1 CDK15 gene_id:65061|Hs108|chr2 ( 429) 583 73.4 3.3e-13 CCDS83002.1 CDK7 gene_id:1022|Hs108|chr5 ( 253) 559 70.7 1.2e-12 CCDS5628.1 CDK6 gene_id:1021|Hs108|chr7 ( 326) 551 70.0 2.5e-12 CCDS45666.1 CDK12 gene_id:51755|Hs108|chr17 (1481) 562 71.7 3.5e-12 CCDS11337.1 CDK12 gene_id:51755|Hs108|chr17 (1490) 562 71.7 3.5e-12 CCDS5462.1 CDK13 gene_id:8621|Hs108|chr7 (1452) 551 70.6 7.4e-12 CCDS5461.1 CDK13 gene_id:8621|Hs108|chr7 (1512) 551 70.6 7.6e-12 CCDS4949.1 ICK gene_id:22858|Hs108|chr6 ( 632) 532 68.3 1.6e-11 CCDS75398.1 MAK gene_id:4117|Hs108|chr6 ( 583) 515 66.6 4.8e-11 CCDS4516.1 MAK gene_id:4117|Hs108|chr6 ( 623) 515 66.6 5.1e-11 CCDS75399.1 MAK gene_id:4117|Hs108|chr6 ( 648) 515 66.6 5.2e-11 >>CCDS10984.2 CDK10 gene_id:8558|Hs108|chr16 (360 aa) initn: 1901 init1: 1561 opt: 1893 Z-score: 1069.9 bits: 206.2 E(32554): 2.8e-53 Smith-Waterman score: 1893; 97.9% identity (97.9% similar) in 289 aa overlap (1-283:72-360) 10 20 30 pF1KB8 MDKEKDGIPISSLREITLLLRLRHPNIVEL :::::::::::::::::::::::::::::: CCDS10 LNRIGEGTYGIVYRARDTQTDEIVALKKVRMDKEKDGIPISSLREITLLLRLRHPNIVEL 50 60 70 80 90 100 40 50 60 70 80 90 pF1KB8 KEVVVGNHLESIFLVMGYCEQDLASLLENMPTPFSEAQVKCIVLQVLRGLQYLHRNFIIH :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS10 KEVVVGNHLESIFLVMGYCEQDLASLLENMPTPFSEAQVKCIVLQVLRGLQYLHRNFIIH 110 120 130 140 150 160 100 110 120 130 140 150 pF1KB8 RDLKVSNLLMTDKGCVKTADFGLARAYGVPVKPMTPKVVTLWYRAPELLLGTTTQTTSID :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS10 RDLKVSNLLMTDKGCVKTADFGLARAYGVPVKPMTPKVVTLWYRAPELLLGTTTQTTSID 170 180 190 200 210 220 160 170 180 190 200 210 pF1KB8 MWAVGCILAELLAHRPLLPGTSEIHQIDLIVQLLGTPSENIWPGFSKLPLVGQYSLRKQP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS10 MWAVGCILAELLAHRPLLPGTSEIHQIDLIVQLLGTPSENIWPGFSKLPLVGQYSLRKQP 230 240 250 260 270 280 220 230 240 250 260 pF1KB8 YNNLKHKFPWLSEAGLRLLHFLFM------ATAGDCLESSYFKEKPLPCEPELMPTFPHH :::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::: CCDS10 YNNLKHKFPWLSEAGLRLLHFLFMYDPKKRATAGDCLESSYFKEKPLPCEPELMPTFPHH 290 300 310 320 330 340 270 280 pF1KB8 RNKRAAPATSEGQSKRCKP ::::::::::::::::::: CCDS10 RNKRAAPATSEGQSKRCKP 350 360 >>CCDS32514.2 CDK10 gene_id:8558|Hs108|chr16 (272 aa) initn: 1661 init1: 1561 opt: 1653 Z-score: 939.9 bits: 181.7 E(32554): 5e-46 Smith-Waterman score: 1653; 97.7% identity (97.7% similar) in 257 aa overlap (1-251:1-257) 10 20 30 40 50 60 pF1KB8 MDKEKDGIPISSLREITLLLRLRHPNIVELKEVVVGNHLESIFLVMGYCEQDLASLLENM :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 MDKEKDGIPISSLREITLLLRLRHPNIVELKEVVVGNHLESIFLVMGYCEQDLASLLENM 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KB8 PTPFSEAQVKCIVLQVLRGLQYLHRNFIIHRDLKVSNLLMTDKGCVKTADFGLARAYGVP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 PTPFSEAQVKCIVLQVLRGLQYLHRNFIIHRDLKVSNLLMTDKGCVKTADFGLARAYGVP 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KB8 VKPMTPKVVTLWYRAPELLLGTTTQTTSIDMWAVGCILAELLAHRPLLPGTSEIHQIDLI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 VKPMTPKVVTLWYRAPELLLGTTTQTTSIDMWAVGCILAELLAHRPLLPGTSEIHQIDLI 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KB8 VQLLGTPSENIWPGFSKLPLVGQYSLRKQPYNNLKHKFPWLSEAGLRLLHFLFM------ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 VQLLGTPSENIWPGFSKLPLVGQYSLRKQPYNNLKHKFPWLSEAGLRLLHFLFMYDPKKR 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 pF1KB8 ATAGDCLESSYFKEKPLPCEPELMPTFPHHRNKRAAPATSEGQSKRCKP ::::::::::::::::: CCDS32 ATAGDCLESSYFKEKPLRLPISGVCEGCREPG 250 260 270 >>CCDS72682.1 CDK11B gene_id:984|Hs108|chr1 (748 aa) initn: 956 init1: 883 opt: 984 Z-score: 567.4 bits: 114.3 E(32554): 2.8e-25 Smith-Waterman score: 992; 51.0% identity (79.9% similar) in 288 aa overlap (1-276:424-711) 10 20 30 pF1KB8 MDKEKDGIPISSLREITLLLRLRHPNIVEL :.:::.:.::.:::::. .:. .::::: . CCDS72 LNRIEEGTYGVVYRAKDKKTDEIVALKRLKMEKEKEGFPITSLREINTILKAQHPNIVTV 400 410 420 430 440 450 40 50 60 70 80 90 pF1KB8 KEVVVGNHLESIFLVMGYCEQDLASLLENMPTPFSEAQVKCIVLQVLRGLQYLHRNFIIH .:.:::.....:..::.: :.:: ::.:.: :: ..:: ...:.:::...:: :.:.: CCDS72 REIVVGSNMDKIYIVMNYVEHDLKSLMETMKQPFLPGEVKTLMIQLLRGVKHLHDNWILH 460 470 480 490 500 510 100 110 120 130 140 150 pF1KB8 RDLKVSNLLMTDKGCVKTADFGLARAYGVPVKPMTPKVVTLWYRAPELLLGTTTQTTSID ::::.::::.. : .:..:::::: :: :.: .:: ::::::::::::::. .:..: CCDS72 RDLKTSNLLLSHAGILKVGDFGLAREYGSPLKAYTPVVVTLWYRAPELLLGAKEYSTAVD 520 530 540 550 560 570 160 170 180 190 200 210 pF1KB8 MWAVGCILAELLAHRPLLPGTSEIHQIDLIVQLLGTPSENIWPGFSKLPLVGQYSLRKQP ::.::::..:::...::.:: ::: ::. . . ::::::.::::.:.:: : .... ..: CCDS72 MWSVGCIFGELLTQKPLFPGKSEIDQINKVFKDLGTPSEKIWPGYSELPAVKKMTFSEHP 580 590 600 610 620 630 220 230 240 250 260 pF1KB8 YNNLKHKF-PWLSEAGLRLLH-FLFM-----ATAGDCLESSYFKEKPLPCEPELMPTFP- ::::...: ::. :. :.. :: . .: : :. ::.: ::: .: ..::.: CCDS72 YNNLRKRFGALLSDQGFDLMNKFLTYFPGRRISAEDGLKHEYFRETPLPIDPSMFPTWPA 640 650 660 670 680 690 270 280 pF1KB8 ---HHRNKRA-APATSEGQSKRCKP ..: ::. .: :: CCDS72 KSEQQRVKRGTSPRPPEGGLGYSQLGDDDLKETGFHLTTTNQGASAAGPGFSLKF 700 710 720 730 740 >>CCDS72684.1 CDK11B gene_id:984|Hs108|chr1 (782 aa) initn: 956 init1: 883 opt: 984 Z-score: 567.2 bits: 114.3 E(32554): 2.8e-25 Smith-Waterman score: 992; 51.0% identity (79.9% similar) in 288 aa overlap (1-276:458-745) 10 20 30 pF1KB8 MDKEKDGIPISSLREITLLLRLRHPNIVEL :.:::.:.::.:::::. .:. .::::: . CCDS72 LNRIEEGTYGVVYRAKDKKTDEIVALKRLKMEKEKEGFPITSLREINTILKAQHPNIVTV 430 440 450 460 470 480 40 50 60 70 80 90 pF1KB8 KEVVVGNHLESIFLVMGYCEQDLASLLENMPTPFSEAQVKCIVLQVLRGLQYLHRNFIIH .:.:::.....:..::.: :.:: ::.:.: :: ..:: ...:.:::...:: :.:.: CCDS72 REIVVGSNMDKIYIVMNYVEHDLKSLMETMKQPFLPGEVKTLMIQLLRGVKHLHDNWILH 490 500 510 520 530 540 100 110 120 130 140 150 pF1KB8 RDLKVSNLLMTDKGCVKTADFGLARAYGVPVKPMTPKVVTLWYRAPELLLGTTTQTTSID ::::.::::.. : .:..:::::: :: :.: .:: ::::::::::::::. .:..: CCDS72 RDLKTSNLLLSHAGILKVGDFGLAREYGSPLKAYTPVVVTLWYRAPELLLGAKEYSTAVD 550 560 570 580 590 600 160 170 180 190 200 210 pF1KB8 MWAVGCILAELLAHRPLLPGTSEIHQIDLIVQLLGTPSENIWPGFSKLPLVGQYSLRKQP ::.::::..:::...::.:: ::: ::. . . ::::::.::::.:.:: : .... ..: CCDS72 MWSVGCIFGELLTQKPLFPGKSEIDQINKVFKDLGTPSEKIWPGYSELPAVKKMTFSEHP 610 620 630 640 650 660 220 230 240 250 260 pF1KB8 YNNLKHKF-PWLSEAGLRLLH-FLFM-----ATAGDCLESSYFKEKPLPCEPELMPTFP- ::::...: ::. :. :.. :: . .: : :. ::.: ::: .: ..::.: CCDS72 YNNLRKRFGALLSDQGFDLMNKFLTYFPGRRISAEDGLKHEYFRETPLPIDPSMFPTWPA 670 680 690 700 710 720 270 280 pF1KB8 ---HHRNKRA-APATSEGQSKRCKP ..: ::. .: :: CCDS72 KSEQQRVKRGTSPRPPEGGLGYSQLGDDDLKETGFHLTTTNQGASAAGPGFSLKF 730 740 750 760 770 780 >>CCDS72683.1 CDK11B gene_id:984|Hs108|chr1 (795 aa) initn: 956 init1: 883 opt: 984 Z-score: 567.1 bits: 114.3 E(32554): 2.9e-25 Smith-Waterman score: 992; 51.0% identity (79.9% similar) in 288 aa overlap (1-276:471-758) 10 20 30 pF1KB8 MDKEKDGIPISSLREITLLLRLRHPNIVEL :.:::.:.::.:::::. .:. .::::: . CCDS72 LNRIEEGTYGVVYRAKDKKTDEIVALKRLKMEKEKEGFPITSLREINTILKAQHPNIVTV 450 460 470 480 490 500 40 50 60 70 80 90 pF1KB8 KEVVVGNHLESIFLVMGYCEQDLASLLENMPTPFSEAQVKCIVLQVLRGLQYLHRNFIIH .:.:::.....:..::.: :.:: ::.:.: :: ..:: ...:.:::...:: :.:.: CCDS72 REIVVGSNMDKIYIVMNYVEHDLKSLMETMKQPFLPGEVKTLMIQLLRGVKHLHDNWILH 510 520 530 540 550 560 100 110 120 130 140 150 pF1KB8 RDLKVSNLLMTDKGCVKTADFGLARAYGVPVKPMTPKVVTLWYRAPELLLGTTTQTTSID ::::.::::.. : .:..:::::: :: :.: .:: ::::::::::::::. .:..: CCDS72 RDLKTSNLLLSHAGILKVGDFGLAREYGSPLKAYTPVVVTLWYRAPELLLGAKEYSTAVD 570 580 590 600 610 620 160 170 180 190 200 210 pF1KB8 MWAVGCILAELLAHRPLLPGTSEIHQIDLIVQLLGTPSENIWPGFSKLPLVGQYSLRKQP ::.::::..:::...::.:: ::: ::. . . ::::::.::::.:.:: : .... ..: CCDS72 MWSVGCIFGELLTQKPLFPGKSEIDQINKVFKDLGTPSEKIWPGYSELPAVKKMTFSEHP 630 640 650 660 670 680 220 230 240 250 260 pF1KB8 YNNLKHKF-PWLSEAGLRLLH-FLFM-----ATAGDCLESSYFKEKPLPCEPELMPTFP- ::::...: ::. :. :.. :: . .: : :. ::.: ::: .: ..::.: CCDS72 YNNLRKRFGALLSDQGFDLMNKFLTYFPGRRISAEDGLKHEYFRETPLPIDPSMFPTWPA 690 700 710 720 730 740 270 280 pF1KB8 ---HHRNKRA-APATSEGQSKRCKP ..: ::. .: :: CCDS72 KSEQQRVKRGTSPRPPEGGLGYSQLGDDDLKETGFHLTTTNQGASAAGPGFSLKF 750 760 770 780 790 >>CCDS44043.1 CDK11A gene_id:728642|Hs108|chr1 (770 aa) initn: 981 init1: 881 opt: 982 Z-score: 566.2 bits: 114.1 E(32554): 3.2e-25 Smith-Waterman score: 990; 50.7% identity (80.2% similar) in 288 aa overlap (1-276:446-733) 10 20 30 pF1KB8 MDKEKDGIPISSLREITLLLRLRHPNIVEL :.:::.:.::.:::::. .:. .::::: . CCDS44 LNRIEEGTYGVVYRAKDKKTDEIVALKRLKMEKEKEGFPITSLREINTILKAQHPNIVTV 420 430 440 450 460 470 40 50 60 70 80 90 pF1KB8 KEVVVGNHLESIFLVMGYCEQDLASLLENMPTPFSEAQVKCIVLQVLRGLQYLHRNFIIH .:.:::.....:..::.: :.:: ::.:.: :: ..:: ...:.:::...:: :.:.: CCDS44 REIVVGSNMDKIYIVMNYVEHDLKSLMETMKQPFLPGEVKTLMIQLLRGVKHLHDNWILH 480 490 500 510 520 530 100 110 120 130 140 150 pF1KB8 RDLKVSNLLMTDKGCVKTADFGLARAYGVPVKPMTPKVVTLWYRAPELLLGTTTQTTSID ::::.::::.. : .:..:::::: :: :.: .:: ::: ::::::::::. .:..: CCDS44 RDLKTSNLLLSHAGILKVGDFGLAREYGSPLKAYTPVVVTQWYRAPELLLGAKEYSTAVD 540 550 560 570 580 590 160 170 180 190 200 210 pF1KB8 MWAVGCILAELLAHRPLLPGTSEIHQIDLIVQLLGTPSENIWPGFSKLPLVGQYSLRKQP ::.::::..:::...::.::.::: ::. . . ::::::.::::.:.::.: .... ..: CCDS44 MWSVGCIFGELLTQKPLFPGNSEIDQINKVFKELGTPSEKIWPGYSELPVVKKMTFSEHP 600 610 620 630 640 650 220 230 240 250 260 pF1KB8 YNNLKHKF-PWLSEAGLRLLH-FLFM-----ATAGDCLESSYFKEKPLPCEPELMPTFP- ::::...: ::. :. :.. :: . .: : :. ::.: ::: .: ..::.: CCDS44 YNNLRKRFGALLSDQGFDLMNKFLTYFPGRRISAEDGLKHEYFRETPLPIDPSMFPTWPA 660 670 680 690 700 710 270 280 pF1KB8 ---HHRNKRA-APATSEGQSKRCKP ..: ::. .: :: CCDS44 KSEQQRVKRGTSPRPPEGGLGYSQLGDDDLKETGFHLTTTNQGASAAGPGFSLKF 720 730 740 750 760 770 >>CCDS81254.1 CDK11A gene_id:728642|Hs108|chr1 (779 aa) initn: 981 init1: 881 opt: 982 Z-score: 566.1 bits: 114.1 E(32554): 3.3e-25 Smith-Waterman score: 990; 50.7% identity (80.2% similar) in 288 aa overlap (1-276:455-742) 10 20 30 pF1KB8 MDKEKDGIPISSLREITLLLRLRHPNIVEL :.:::.:.::.:::::. .:. .::::: . CCDS81 LNRIEEGTYGVVYRAKDKKTDEIVALKRLKMEKEKEGFPITSLREINTILKAQHPNIVTV 430 440 450 460 470 480 40 50 60 70 80 90 pF1KB8 KEVVVGNHLESIFLVMGYCEQDLASLLENMPTPFSEAQVKCIVLQVLRGLQYLHRNFIIH .:.:::.....:..::.: :.:: ::.:.: :: ..:: ...:.:::...:: :.:.: CCDS81 REIVVGSNMDKIYIVMNYVEHDLKSLMETMKQPFLPGEVKTLMIQLLRGVKHLHDNWILH 490 500 510 520 530 540 100 110 120 130 140 150 pF1KB8 RDLKVSNLLMTDKGCVKTADFGLARAYGVPVKPMTPKVVTLWYRAPELLLGTTTQTTSID ::::.::::.. : .:..:::::: :: :.: .:: ::: ::::::::::. .:..: CCDS81 RDLKTSNLLLSHAGILKVGDFGLAREYGSPLKAYTPVVVTQWYRAPELLLGAKEYSTAVD 550 560 570 580 590 600 160 170 180 190 200 210 pF1KB8 MWAVGCILAELLAHRPLLPGTSEIHQIDLIVQLLGTPSENIWPGFSKLPLVGQYSLRKQP ::.::::..:::...::.::.::: ::. . . ::::::.::::.:.::.: .... ..: CCDS81 MWSVGCIFGELLTQKPLFPGNSEIDQINKVFKELGTPSEKIWPGYSELPVVKKMTFSEHP 610 620 630 640 650 660 220 230 240 250 260 pF1KB8 YNNLKHKF-PWLSEAGLRLLH-FLFM-----ATAGDCLESSYFKEKPLPCEPELMPTFP- ::::...: ::. :. :.. :: . .: : :. ::.: ::: .: ..::.: CCDS81 YNNLRKRFGALLSDQGFDLMNKFLTYFPGRRISAEDGLKHEYFRETPLPIDPSMFPTWPA 670 680 690 700 710 720 270 280 pF1KB8 ---HHRNKRA-APATSEGQSKRCKP ..: ::. .: :: CCDS81 KSEQQRVKRGTSPRPPEGGLGYSQLGDDDLKETGFHLTTTNQGASAAGPGFSLKF 730 740 750 760 770 >>CCDS44042.1 CDK11A gene_id:728642|Hs108|chr1 (780 aa) initn: 954 init1: 881 opt: 982 Z-score: 566.1 bits: 114.1 E(32554): 3.3e-25 Smith-Waterman score: 990; 50.7% identity (80.2% similar) in 288 aa overlap (1-276:456-743) 10 20 30 pF1KB8 MDKEKDGIPISSLREITLLLRLRHPNIVEL :.:::.:.::.:::::. .:. .::::: . CCDS44 LNRIEEGTYGVVYRAKDKKTDEIVALKRLKMEKEKEGFPITSLREINTILKAQHPNIVTV 430 440 450 460 470 480 40 50 60 70 80 90 pF1KB8 KEVVVGNHLESIFLVMGYCEQDLASLLENMPTPFSEAQVKCIVLQVLRGLQYLHRNFIIH .:.:::.....:..::.: :.:: ::.:.: :: ..:: ...:.:::...:: :.:.: CCDS44 REIVVGSNMDKIYIVMNYVEHDLKSLMETMKQPFLPGEVKTLMIQLLRGVKHLHDNWILH 490 500 510 520 530 540 100 110 120 130 140 150 pF1KB8 RDLKVSNLLMTDKGCVKTADFGLARAYGVPVKPMTPKVVTLWYRAPELLLGTTTQTTSID ::::.::::.. : .:..:::::: :: :.: .:: ::: ::::::::::. .:..: CCDS44 RDLKTSNLLLSHAGILKVGDFGLAREYGSPLKAYTPVVVTQWYRAPELLLGAKEYSTAVD 550 560 570 580 590 600 160 170 180 190 200 210 pF1KB8 MWAVGCILAELLAHRPLLPGTSEIHQIDLIVQLLGTPSENIWPGFSKLPLVGQYSLRKQP ::.::::..:::...::.::.::: ::. . . ::::::.::::.:.::.: .... ..: CCDS44 MWSVGCIFGELLTQKPLFPGNSEIDQINKVFKELGTPSEKIWPGYSELPVVKKMTFSEHP 610 620 630 640 650 660 220 230 240 250 260 pF1KB8 YNNLKHKF-PWLSEAGLRLLH-FLFM-----ATAGDCLESSYFKEKPLPCEPELMPTFP- ::::...: ::. :. :.. :: . .: : :. ::.: ::: .: ..::.: CCDS44 YNNLRKRFGALLSDQGFDLMNKFLTYFPGRRISAEDGLKHEYFRETPLPIDPSMFPTWPA 670 680 690 700 710 720 270 280 pF1KB8 ---HHRNKRA-APATSEGQSKRCKP ..: ::. .: :: CCDS44 KSEQQRVKRGTSPRPPEGGLGYSQLGDDDLKETGFHLTTTNQGASAAGPGFSLKF 730 740 750 760 770 780 >>CCDS81253.1 CDK11A gene_id:728642|Hs108|chr1 (783 aa) initn: 954 init1: 881 opt: 982 Z-score: 566.1 bits: 114.1 E(32554): 3.3e-25 Smith-Waterman score: 990; 50.7% identity (80.2% similar) in 288 aa overlap (1-276:459-746) 10 20 30 pF1KB8 MDKEKDGIPISSLREITLLLRLRHPNIVEL :.:::.:.::.:::::. .:. .::::: . CCDS81 LNRIEEGTYGVVYRAKDKKTDEIVALKRLKMEKEKEGFPITSLREINTILKAQHPNIVTV 430 440 450 460 470 480 40 50 60 70 80 90 pF1KB8 KEVVVGNHLESIFLVMGYCEQDLASLLENMPTPFSEAQVKCIVLQVLRGLQYLHRNFIIH .:.:::.....:..::.: :.:: ::.:.: :: ..:: ...:.:::...:: :.:.: CCDS81 REIVVGSNMDKIYIVMNYVEHDLKSLMETMKQPFLPGEVKTLMIQLLRGVKHLHDNWILH 490 500 510 520 530 540 100 110 120 130 140 150 pF1KB8 RDLKVSNLLMTDKGCVKTADFGLARAYGVPVKPMTPKVVTLWYRAPELLLGTTTQTTSID ::::.::::.. : .:..:::::: :: :.: .:: ::: ::::::::::. .:..: CCDS81 RDLKTSNLLLSHAGILKVGDFGLAREYGSPLKAYTPVVVTQWYRAPELLLGAKEYSTAVD 550 560 570 580 590 600 160 170 180 190 200 210 pF1KB8 MWAVGCILAELLAHRPLLPGTSEIHQIDLIVQLLGTPSENIWPGFSKLPLVGQYSLRKQP ::.::::..:::...::.::.::: ::. . . ::::::.::::.:.::.: .... ..: CCDS81 MWSVGCIFGELLTQKPLFPGNSEIDQINKVFKELGTPSEKIWPGYSELPVVKKMTFSEHP 610 620 630 640 650 660 220 230 240 250 260 pF1KB8 YNNLKHKF-PWLSEAGLRLLH-FLFM-----ATAGDCLESSYFKEKPLPCEPELMPTFP- ::::...: ::. :. :.. :: . .: : :. ::.: ::: .: ..::.: CCDS81 YNNLRKRFGALLSDQGFDLMNKFLTYFPGRRISAEDGLKHEYFRETPLPIDPSMFPTWPA 670 680 690 700 710 720 270 280 pF1KB8 ---HHRNKRA-APATSEGQSKRCKP ..: ::. .: :: CCDS81 KSEQQRVKRGTSPRPPEGGLGYSQLGDDDLKETGFHLTTTNQGASAAGPGFSLKF 730 740 750 760 770 780 >>CCDS11736.1 CDK3 gene_id:1018|Hs108|chr17 (305 aa) initn: 656 init1: 519 opt: 677 Z-score: 404.1 bits: 82.8 E(32554): 3.4e-16 Smith-Waterman score: 677; 40.8% identity (71.2% similar) in 260 aa overlap (1-259:37-293) 10 20 30 pF1KB8 MDKEKDGIPISSLREITLLLRLRHPNIVEL .: : .:.: ...:::.:: .:.:::::.: CCDS11 VEKIGEGTYGVVYKAKNRETGQLVALKKIRLDLEMEGVPSTAIREISLLKELKHPNIVRL 10 20 30 40 50 60 40 50 60 70 80 pF1KB8 KEVVVGNHLESIFLVMGYCEQDLASLLENMP-TPFSEAQVKCIVLQVLRGLQYLHRNFII .:: .. ....::. . ::: . ... : . . .: ..:.:.:... : . .: CCDS11 LDVV--HNERKLYLVFEFLSQDLKKYMDSTPGSELPLHLIKSYLFQLLQGVSFCHSHRVI 70 80 90 100 110 120 90 100 110 120 130 140 pF1KB8 HRDLKVSNLLMTDKGCVKTADFGLARAYGVPVKPMTPKVVTLWYRAPELLLGTTTQTTSI ::::: .:::... : .: ::::::::.:::.. .: .::::::::::.:::. ::.. CCDS11 HRDLKPQNLLINELGAIKLADFGLARAFGVPLRTYTHEVVTLWYRAPEILLGSKFYTTAV 130 140 150 160 170 180 150 160 170 180 190 200 pF1KB8 DMWAVGCILAELLAHRPLLPGTSEIHQIDLIVQLLGTPSENIWPGFSKLPLVGQYSLRKQ :.:..:::.::..... :.:: ::: :. : ..::::::. ::: ..:: . :. : CCDS11 DIWSIGCIFAEMVTRKALFPGDSEIDQLFRIFRMLGTPSEDTWPGVTQLPDY-KGSFPKW 190 200 210 220 230 240 210 220 230 240 250 260 pF1KB8 PYNNLKHKFPWLSEAGLRLLHFLFMATAGDCLESSYFKEKPLPCEPELMPTFPHHRNKRA ..:.. : : : :: :.. .. . .. .: :: : CCDS11 TRKGLEEIVPNLEPEGRDLLMQLLQYDPSQRITAKTALAHPYFSSPEPSPAARQYVLQRF 250 260 270 280 290 300 270 280 pF1KB8 APATSEGQSKRCKP CCDS11 RH 283 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Fri Nov 4 12:52:45 2016 done: Fri Nov 4 12:52:46 2016 Total Scan time: 2.480 Total Display time: 0.010 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]