Result of FASTA (ccds) for
pF1KB8437
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8437, 526 aa
1>>>pF1KB8437 526 - 526 aa - 526 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.7851+/-0.000892; mu= 10.9246+/- 0.053
mean_var=88.1670+/-17.865, 0's: 0 Z-trim(108.1): 107 B-trim: 212 in 1/51
Lambda= 0.136591
statistics sampled from 9899 (10016) to 9899 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.679), E-opt: 0.2 (0.308), width: 16
Scan time: 3.530
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS2878.1 ARHGEF3 gene_id:50650|Hs108|chr3 ( 526) 3503 700.4 1.3e-201
CCDS74948.1 ARHGEF3 gene_id:50650|Hs108|chr3 ( 532) 3295 659.4 2.9e-189
CCDS46854.1 ARHGEF3 gene_id:50650|Hs108|chr3 ( 558) 3295 659.4 3e-189
CCDS46855.1 ARHGEF3 gene_id:50650|Hs108|chr3 ( 532) 3292 658.8 4.4e-189
CCDS7067.1 NET1 gene_id:10276|Hs108|chr10 ( 542) 1882 380.9 2e-105
CCDS41483.1 NET1 gene_id:10276|Hs108|chr10 ( 596) 1873 379.2 7.3e-105
CCDS82664.1 ITSN1 gene_id:6453|Hs108|chr21 (1716) 389 86.9 2.1e-16
CCDS33545.1 ITSN1 gene_id:6453|Hs108|chr21 (1721) 389 86.9 2.1e-16
CCDS1711.2 ITSN2 gene_id:50618|Hs108|chr2 (1670) 342 77.6 1.3e-13
CCDS1710.2 ITSN2 gene_id:50618|Hs108|chr2 (1697) 342 77.6 1.3e-13
CCDS55430.1 ARHGEF9 gene_id:23229|Hs108|chrX ( 463) 285 66.2 9.2e-11
CCDS83477.1 ARHGEF9 gene_id:23229|Hs108|chrX ( 495) 285 66.2 9.7e-11
>>CCDS2878.1 ARHGEF3 gene_id:50650|Hs108|chr3 (526 aa)
initn: 3503 init1: 3503 opt: 3503 Z-score: 3733.0 bits: 700.4 E(32554): 1.3e-201
Smith-Waterman score: 3503; 100.0% identity (100.0% similar) in 526 aa overlap (1-526:1-526)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MVAKDYPFYLTVKRANCSLELPPASGPAKDAEEPSNKRVKPLSRVTSLANLIPPVKATPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS28 MVAKDYPFYLTVKRANCSLELPPASGPAKDAEEPSNKRVKPLSRVTSLANLIPPVKATPL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 KRFSQTLQRSISFRSESRPDILAPRPWSRNAAPSSTKRRDSKLWSETFDVCVNQMLTSKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS28 KRFSQTLQRSISFRSESRPDILAPRPWSRNAAPSSTKRRDSKLWSETFDVCVNQMLTSKE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 IKRQEAIFELSQGEEDLIEDLKLAKKAYHDPMLKLSIMTEQELNQIFGTLDSLIPLHEEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS28 IKRQEAIFELSQGEEDLIEDLKLAKKAYHDPMLKLSIMTEQELNQIFGTLDSLIPLHEEL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 LSQLRDVRKPDGSTEHVGPILVGWLPCLSSYDSYCSNQVAAKALLDHKKQDHRVQDFLQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS28 LSQLRDVRKPDGSTEHVGPILVGWLPCLSSYDSYCSNQVAAKALLDHKKQDHRVQDFLQR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 CLESPFSRKLDLWNFLDIPRSRLVKYPLLLREILRHTPNDNPDQQHLEEAINIIQGIVAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS28 CLESPFSRKLDLWNFLDIPRSRLVKYPLLLREILRHTPNDNPDQQHLEEAINIIQGIVAE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 INTKTGESECRYYKERLLYLEEGQKDSLIDSSRVLCCHGELKNNRGVKLHVFLFQEVLVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS28 INTKTGESECRYYKERLLYLEEGQKDSLIDSSRVLCCHGELKNNRGVKLHVFLFQEVLVI
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 TRAVTHNEQLCYQLYRQPIPVKDLLLEDLQDGEVRLGGSLRGAFSNNERIKNFFRVSFKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS28 TRAVTHNEQLCYQLYRQPIPVKDLLLEDLQDGEVRLGGSLRGAFSNNERIKNFFRVSFKN
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 GSQSQTHSLQANDTFNKQQWLNCIRQAKETVLCAAGQAGVLDSEGSFLNPTTGSRELQGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS28 GSQSQTHSLQANDTFNKQQWLNCIRQAKETVLCAAGQAGVLDSEGSFLNPTTGSRELQGE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520
pF1KB8 TKLEQMDQSDSESDCSMDTSEVSLDCERMEQTDSSCGNSRHGESNV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS28 TKLEQMDQSDSESDCSMDTSEVSLDCERMEQTDSSCGNSRHGESNV
490 500 510 520
>>CCDS74948.1 ARHGEF3 gene_id:50650|Hs108|chr3 (532 aa)
initn: 3295 init1: 3295 opt: 3295 Z-score: 3511.4 bits: 659.4 E(32554): 2.9e-189
Smith-Waterman score: 3295; 96.9% identity (97.9% similar) in 514 aa overlap (13-526:19-532)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MVAKDYPFYLTVKRANCSLELPPASGPAKDAEEPSNKRVKPLSRVTSLANLIPP
:: . . . .: . : ::::::::::::::::::::::
CCDS74 MRSERPMVWCCLFVRSQRKRKQSTQDEDAVSLCSLDISEPSNKRVKPLSRVTSLANLIPP
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 VKATPLKRFSQTLQRSISFRSESRPDILAPRPWSRNAAPSSTKRRDSKLWSETFDVCVNQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 VKATPLKRFSQTLQRSISFRSESRPDILAPRPWSRNAAPSSTKRRDSKLWSETFDVCVNQ
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 MLTSKEIKRQEAIFELSQGEEDLIEDLKLAKKAYHDPMLKLSIMTEQELNQIFGTLDSLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 MLTSKEIKRQEAIFELSQGEEDLIEDLKLAKKAYHDPMLKLSIMTEQELNQIFGTLDSLI
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 PLHEELLSQLRDVRKPDGSTEHVGPILVGWLPCLSSYDSYCSNQVAAKALLDHKKQDHRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 PLHEELLSQLRDVRKPDGSTEHVGPILVGWLPCLSSYDSYCSNQVAAKALLDHKKQDHRV
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 QDFLQRCLESPFSRKLDLWNFLDIPRSRLVKYPLLLREILRHTPNDNPDQQHLEEAINII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 QDFLQRCLESPFSRKLDLWNFLDIPRSRLVKYPLLLREILRHTPNDNPDQQHLEEAINII
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 QGIVAEINTKTGESECRYYKERLLYLEEGQKDSLIDSSRVLCCHGELKNNRGVKLHVFLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 QGIVAEINTKTGESECRYYKERLLYLEEGQKDSLIDSSRVLCCHGELKNNRGVKLHVFLF
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KB8 QEVLVITRAVTHNEQLCYQLYRQPIPVKDLLLEDLQDGEVRLGGSLRGAFSNNERIKNFF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 QEVLVITRAVTHNEQLCYQLYRQPIPVKDLLLEDLQDGEVRLGGSLRGAFSNNERIKNFF
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KB8 RVSFKNGSQSQTHSLQANDTFNKQQWLNCIRQAKETVLCAAGQAGVLDSEGSFLNPTTGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 RVSFKNGSQSQTHSLQANDTFNKQQWLNCIRQAKETVLCAAGQAGVLDSEGSFLNPTTGS
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520
pF1KB8 RELQGETKLEQMDQSDSESDCSMDTSEVSLDCERMEQTDSSCGNSRHGESNV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 RELQGETKLEQMDQSDSESDCSMDTSEVSLDCERMEQTDSSCGNSRHGESNV
490 500 510 520 530
>>CCDS46854.1 ARHGEF3 gene_id:50650|Hs108|chr3 (558 aa)
initn: 3295 init1: 3295 opt: 3295 Z-score: 3511.0 bits: 659.4 E(32554): 3e-189
Smith-Waterman score: 3295; 96.9% identity (97.9% similar) in 514 aa overlap (13-526:45-558)
10 20 30 40
pF1KB8 MVAKDYPFYLTVKRANCSLELPPASGPAKDAEEPSNKRVKPL
:: . . . .: . : ::::::::::
CCDS46 MEENKERPKRQRQNNFPMFPSPKAWNFRGRKRKQSTQDEDAVSLCSLDISEPSNKRVKPL
20 30 40 50 60 70
50 60 70 80 90 100
pF1KB8 SRVTSLANLIPPVKATPLKRFSQTLQRSISFRSESRPDILAPRPWSRNAAPSSTKRRDSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 SRVTSLANLIPPVKATPLKRFSQTLQRSISFRSESRPDILAPRPWSRNAAPSSTKRRDSK
80 90 100 110 120 130
110 120 130 140 150 160
pF1KB8 LWSETFDVCVNQMLTSKEIKRQEAIFELSQGEEDLIEDLKLAKKAYHDPMLKLSIMTEQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LWSETFDVCVNQMLTSKEIKRQEAIFELSQGEEDLIEDLKLAKKAYHDPMLKLSIMTEQE
140 150 160 170 180 190
170 180 190 200 210 220
pF1KB8 LNQIFGTLDSLIPLHEELLSQLRDVRKPDGSTEHVGPILVGWLPCLSSYDSYCSNQVAAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LNQIFGTLDSLIPLHEELLSQLRDVRKPDGSTEHVGPILVGWLPCLSSYDSYCSNQVAAK
200 210 220 230 240 250
230 240 250 260 270 280
pF1KB8 ALLDHKKQDHRVQDFLQRCLESPFSRKLDLWNFLDIPRSRLVKYPLLLREILRHTPNDNP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 ALLDHKKQDHRVQDFLQRCLESPFSRKLDLWNFLDIPRSRLVKYPLLLREILRHTPNDNP
260 270 280 290 300 310
290 300 310 320 330 340
pF1KB8 DQQHLEEAINIIQGIVAEINTKTGESECRYYKERLLYLEEGQKDSLIDSSRVLCCHGELK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 DQQHLEEAINIIQGIVAEINTKTGESECRYYKERLLYLEEGQKDSLIDSSRVLCCHGELK
320 330 340 350 360 370
350 360 370 380 390 400
pF1KB8 NNRGVKLHVFLFQEVLVITRAVTHNEQLCYQLYRQPIPVKDLLLEDLQDGEVRLGGSLRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 NNRGVKLHVFLFQEVLVITRAVTHNEQLCYQLYRQPIPVKDLLLEDLQDGEVRLGGSLRG
380 390 400 410 420 430
410 420 430 440 450 460
pF1KB8 AFSNNERIKNFFRVSFKNGSQSQTHSLQANDTFNKQQWLNCIRQAKETVLCAAGQAGVLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 AFSNNERIKNFFRVSFKNGSQSQTHSLQANDTFNKQQWLNCIRQAKETVLCAAGQAGVLD
440 450 460 470 480 490
470 480 490 500 510 520
pF1KB8 SEGSFLNPTTGSRELQGETKLEQMDQSDSESDCSMDTSEVSLDCERMEQTDSSCGNSRHG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 SEGSFLNPTTGSRELQGETKLEQMDQSDSESDCSMDTSEVSLDCERMEQTDSSCGNSRHG
500 510 520 530 540 550
pF1KB8 ESNV
::::
CCDS46 ESNV
>>CCDS46855.1 ARHGEF3 gene_id:50650|Hs108|chr3 (532 aa)
initn: 3287 init1: 3287 opt: 3292 Z-score: 3508.2 bits: 658.8 E(32554): 4.4e-189
Smith-Waterman score: 3292; 97.3% identity (98.2% similar) in 510 aa overlap (17-526:23-532)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MVAKDYPFYLTVKRANCSLELPPASGPAKDAEEPSNKRVKPLSRVTSLANLIPP
: : .. . ..::::::::::::::::::::::
CCDS46 MIEVCHHNWLLWLCPSKFGIFMCCLASTTGQMELRRTREPSNKRVKPLSRVTSLANLIPP
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 VKATPLKRFSQTLQRSISFRSESRPDILAPRPWSRNAAPSSTKRRDSKLWSETFDVCVNQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 VKATPLKRFSQTLQRSISFRSESRPDILAPRPWSRNAAPSSTKRRDSKLWSETFDVCVNQ
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 MLTSKEIKRQEAIFELSQGEEDLIEDLKLAKKAYHDPMLKLSIMTEQELNQIFGTLDSLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MLTSKEIKRQEAIFELSQGEEDLIEDLKLAKKAYHDPMLKLSIMTEQELNQIFGTLDSLI
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 PLHEELLSQLRDVRKPDGSTEHVGPILVGWLPCLSSYDSYCSNQVAAKALLDHKKQDHRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 PLHEELLSQLRDVRKPDGSTEHVGPILVGWLPCLSSYDSYCSNQVAAKALLDHKKQDHRV
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 QDFLQRCLESPFSRKLDLWNFLDIPRSRLVKYPLLLREILRHTPNDNPDQQHLEEAINII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 QDFLQRCLESPFSRKLDLWNFLDIPRSRLVKYPLLLREILRHTPNDNPDQQHLEEAINII
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 QGIVAEINTKTGESECRYYKERLLYLEEGQKDSLIDSSRVLCCHGELKNNRGVKLHVFLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 QGIVAEINTKTGESECRYYKERLLYLEEGQKDSLIDSSRVLCCHGELKNNRGVKLHVFLF
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KB8 QEVLVITRAVTHNEQLCYQLYRQPIPVKDLLLEDLQDGEVRLGGSLRGAFSNNERIKNFF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 QEVLVITRAVTHNEQLCYQLYRQPIPVKDLLLEDLQDGEVRLGGSLRGAFSNNERIKNFF
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KB8 RVSFKNGSQSQTHSLQANDTFNKQQWLNCIRQAKETVLCAAGQAGVLDSEGSFLNPTTGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 RVSFKNGSQSQTHSLQANDTFNKQQWLNCIRQAKETVLCAAGQAGVLDSEGSFLNPTTGS
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520
pF1KB8 RELQGETKLEQMDQSDSESDCSMDTSEVSLDCERMEQTDSSCGNSRHGESNV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 RELQGETKLEQMDQSDSESDCSMDTSEVSLDCERMEQTDSSCGNSRHGESNV
490 500 510 520 530
>>CCDS7067.1 NET1 gene_id:10276|Hs108|chr10 (542 aa)
initn: 1856 init1: 1693 opt: 1882 Z-score: 2006.4 bits: 380.9 E(32554): 2e-105
Smith-Waterman score: 1882; 62.1% identity (85.9% similar) in 448 aa overlap (1-447:1-445)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MVAKDYPF-YLTVKRANCSLELPPASGPAKDAEEPSNKRVKPLSRVTSLANLIPPVKATP
:::.: : .::. :.. : .. ::::::::.::.::::::::: ::.
CCDS70 MVAHDETGGLLPIKRTIRVLDVNNQS--FREQEEPSNKRVRPLARVTSLANLISPVRNGA
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 LKRFSQTLQRSISFRSESRPDILAPRPWSRNAAPSSTKRRDSKLWSETFDVCVNQMLTSK
..::.::.: :...:.. : : . ::...:. .:::.: :::: .:. ... ::..
CCDS70 VRRFGQTIQ-SFTLRGDHRSPASAQKFSSRSTVPTPAKRRSSALWSEMLDITMKESLTTR
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 EIKRQEAIFELSQGEEDLIEDLKLAKKAYHDPMLKLSIMTEQELNQIFGTLDSLIPLHEE
::.:::::.:.:.::.:::::::::.:::::::::::::.:.::..::: ::: :::::.
CCDS70 EIRRQEAIYEMSRGEQDLIEDLKLARKAYHDPMLKLSIMSEEELTHIFGDLDSYIPLHED
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 LLSQLRDVRKPDGSTEHVGPILVGWLPCLSSYDSYCSNQVAAKALLDHKKQDHRVQDFLQ
::... .. ::::..:..: :::.::: :..: .:::::.:::::::.:::: :::::::
CCDS70 LLTRIGEATKPDGTVEQIGHILVSWLPRLNAYRGYCSNQLAAKALLDQKKQDPRVQDFLQ
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 RCLESPFSRKLDLWNFLDIPRSRLVKYPLLLREILRHTPNDNPDQQHLEEAINIIQGIVA
::::::::::::::.::::::::::::::::.:::.:::...:: : ::.:: ::::...
CCDS70 RCLESPFSRKLDLWSFLDIPRSRLVKYPLLLKEILKHTPKEHPDVQLLEDAILIIQGVLS
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 EINTKTGESECRYYKERLLYLEEGQKDSLIDSSRVLCCHGELKNNRGVKLHVFLFQEVLV
.:: : :::::.:: ..: ::.: :.: :..:.:: :::::... : ::..::::..::
CCDS70 DINLKKGESECQYYIDKLEYLDEKQRDPRIEASKVLLCHGELRSKSGHKLYIFLFQDILV
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB8 ITRAVTHNEQLCYQLYRQPIPVKDLLLEDLQDGEVRLGGSLRGAFSNNERIKNFFRVSFK
.:: ::.::. ::.:::::::..:.:::::::.::.:::.::::::.:. ::.::. :.
CCDS70 LTRPVTRNERHSYQVYRQPIPVQELVLEDLQDGDVRMGGSFRGAFSNSEKAKNIFRIRFH
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB8 NGSQSQTHSLQANDTFNKQQWLNCIRQAKETVLCAAGQAGVLDSEGSFLNPTTGSRELQG
. : .:.:.:::::.:.::::.:::: :
CCDS70 DPSPAQSHTLQANDVFHKQQWFNCIRAAIAPFQSAGSPPELQGLPELHEECEGNHPSARK
420 430 440 450 460 470
>>CCDS41483.1 NET1 gene_id:10276|Hs108|chr10 (596 aa)
initn: 1853 init1: 1693 opt: 1873 Z-score: 1996.1 bits: 379.2 E(32554): 7.3e-105
Smith-Waterman score: 1873; 62.3% identity (86.5% similar) in 438 aa overlap (10-447:63-499)
10 20 30
pF1KB8 MVAKDYPFYLTVKRANCSLELPPASGPAKDAEEPSNKRV
.:.:: . .: . : .:::::::
CCDS41 ADTSGSELDGRCSLRRGSSFTFLTPGPNWDFTLKRKRREKDDDVVSLSSLDLKEPSNKRV
40 50 60 70 80 90
40 50 60 70 80 90
pF1KB8 KPLSRVTSLANLIPPVKATPLKRFSQTLQRSISFRSESRPDILAPRPWSRNAAPSSTKRR
.::.::::::::: ::. ..::.::.: :...:.. : : . ::...:. .:::
CCDS41 RPLARVTSLANLISPVRNGAVRRFGQTIQ-SFTLRGDHRSPASAQKFSSRSTVPTPAKRR
100 110 120 130 140 150
100 110 120 130 140 150
pF1KB8 DSKLWSETFDVCVNQMLTSKEIKRQEAIFELSQGEEDLIEDLKLAKKAYHDPMLKLSIMT
.: :::: .:. ... ::..::.:::::.:.:.::.:::::::::.:::::::::::::.
CCDS41 SSALWSEMLDITMKESLTTREIRRQEAIYEMSRGEQDLIEDLKLARKAYHDPMLKLSIMS
160 170 180 190 200 210
160 170 180 190 200 210
pF1KB8 EQELNQIFGTLDSLIPLHEELLSQLRDVRKPDGSTEHVGPILVGWLPCLSSYDSYCSNQV
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CCDS41 EEELTHIFGDLDSYIPLHEDLLTRIGEATKPDGTVEQIGHILVSWLPRLNAYRGYCSNQL
220 230 240 250 260 270
220 230 240 250 260 270
pF1KB8 AAKALLDHKKQDHRVQDFLQRCLESPFSRKLDLWNFLDIPRSRLVKYPLLLREILRHTPN
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CCDS41 AAKALLDQKKQDPRVQDFLQRCLESPFSRKLDLWSFLDIPRSRLVKYPLLLKEILKHTPK
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280 290 300 310 320 330
pF1KB8 DNPDQQHLEEAINIIQGIVAEINTKTGESECRYYKERLLYLEEGQKDSLIDSSRVLCCHG
..:: : ::.:: ::::....:: : :::::.:: ..: ::.: :.: :..:.:: :::
CCDS41 EHPDVQLLEDAILIIQGVLSDINLKKGESECQYYIDKLEYLDEKQRDPRIEASKVLLCHG
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340 350 360 370 380 390
pF1KB8 ELKNNRGVKLHVFLFQEVLVITRAVTHNEQLCYQLYRQPIPVKDLLLEDLQDGEVRLGGS
::... : ::..::::..::.:: ::.::. ::.:::::::..:.:::::::.::.:::
CCDS41 ELRSKSGHKLYIFLFQDILVLTRPVTRNERHSYQVYRQPIPVQELVLEDLQDGDVRMGGS
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400 410 420 430 440 450
pF1KB8 LRGAFSNNERIKNFFRVSFKNGSQSQTHSLQANDTFNKQQWLNCIRQAKETVLCAAGQAG
.::::::.:. ::.::. :.. : .:.:.:::::.:.::::.:::: :
CCDS41 FRGAFSNSEKAKNIFRIRFHDPSPAQSHTLQANDVFHKQQWFNCIRAAIAPFQSAGSPPE
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460 470 480 490 500 510
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CCDS41 LQGLPELHEECEGNHPSARKLTAQRRASTVSSVTQVEVDENAYRCGSGMQMAEDSKSLKT
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pF1KB8 EIKRQEAIFELSQGEEDLIEDLKLAKKAYHDPMLKLSIMTEQELNQIFGTLDSLIPLHEE
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. ...: . :.: ..:: ... :: ...:. .: . : : :.: .
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: :..: : :..: . ....:.:.. .. :.. :. :.:
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CCDS82 YIETEKKKREKAYLVRSQRATGIGRLMVNVVEGIELKPCRSHGKSNPYCEVTMGSQCHIT
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pF1KB8 EIKRQEAIFELSQGEEDLIEDLKLAKKAYHDPMLKLSIMTEQELNQIFGTLDSLIPLHEE
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CCDS33 ERKRQGYIHELIVTEENYVNDLQLVTEIFQKPLMESELLTEKEVAMIFVNWKELIMCNIK
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CCDS33 LLKALRVRKKMSGEKMPVKMIGDILSAQLPHMQPYIRFCSRQLNGAALIQQKTDEAPDFK
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CCDS33 EFVKRLAMDPRCKGMPLSSFILKPMQRVTRYPLIIKNILENTPENHPDHSHLKHALEKAE
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. ...: . :.: ..:: ... :: ...:. .: . : : :.: .
CCDS33 ELCSQVNEGVREKEN---SDRLEWIQAHVQCEGLSEQLVFNSVTNCLGPRKFLHSGKLYK
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CCDS33 AKSNKELYGFLFNDFLLLTQITKPLGSSGTDKVFSPKSNLQYKMYKTPIFLNEVLVKLPT
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: :..: : :..: . ....:.:.. .. :.. :. :.:
CCDS33 DP------------SGDEPI---FHISHID----RVYTLRAESINERTAWVQKIKAASEL
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CCDS33 YIETEKKKREKAYLVRSQRATGIGRLMVNVVEGIELKPCRSHGKSNPYCEVTMGSQCHIT
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CCDS17 ERKRQGYIHELIQTEERYMADLQLVVEVFQKRMAESGFLTEGEMALIFVNWKELIMSNTK
1180 1190 1200 1210 1220 1230
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pF1KB8 LLSQLRDVRKPDGS----TEHVGPILVGWLPCLSSYDSYCSNQVAAKALLDHKK-QDHRV
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.... : :: :::.. :..: : . .:.: ...:. :: ....:..
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pF1KB8 LQDGEVRLGGSLRGAFSNNERIKNFFRVSFKNGSQSQTHSLQANDTFNKQQWLNCIRQAK
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pF1KB8 ETVLCAAGQAGVLDSEGSFLNPTTGSRELQGETKLEQMDQSDSESDCSMDTSEVSLDCER
:
CCDS17 EQYIDTEKKKREKAYQARSQKTSGIGRLMVHVIEATELKACKPNGKSNPYCEISMGSQSY
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60 70 80 90 100 110
pF1KB8 LKRFSQTLQRSISFRSESRPDILAPRPWSRNAAPSSTKRRDSKLWSETFDVCVNQMLTSK
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CCDS17 SKGQLINVMNKDDPDWWQGEINGVTGLFPSNYVKMTTDSDPSQQWCA--DLQTLDTMQPI
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120 130 140 150 160 170
pF1KB8 EIKRQEAIFELSQGEEDLIEDLKLAKKAYHDPMLKLSIMTEQELNQIFGTLDSLIPLHEE
: ::: : :: : :: . ::.:. .... : . ...:: :. :: . :: . .
CCDS17 ERKRQGYIHELIQTEERYMADLQLVVEVFQKRMAESGFLTEGEMALIFVNWKELIMSNTK
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180 190 200 210 220 230
pF1KB8 LLSQLRDVRKPDGS----TEHVGPILVGWLPCLSSYDSYCSNQVAAKALLDHKK-QDHRV
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CCDS17 LLKALR-VRKKTGGEKMPVQMIGDILAAELSHMQAYIRFCSCQLNGAALLQQKTDEDTDF
1270 1280 1290 1300 1310 1320
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 QDFLQRCLESPFSRKLDLWNFLDIPRSRLVKYPLLLREILRHTPNDNPDQQHLEEAINII
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CCDS17 KEFLKKLASDPRCKGMPLSSFLLKPMQRITRYPLLIRSILENTPESHADHSSLKLALERA
1330 1340 1350 1360 1370 1380
300 310 320 330 340
pF1KB8 QGIVAEINTKTGESECRYYKERLLYLE-----EGQKDSLIDSSRVLCC------H-GELK
. . ...: . :.: ..:: ... :: ..:: .: . : : :.:
CCDS17 EELCSQVNEGVREKEN---SDRLEWIQAHVQCEGLAEQLIFNSLTNCLGPRKLLHSGKLY
1390 1400 1410 1420 1430 1440
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pF1KB8 NNRGVK-LHVFLFQEVLVITRAVTH------NEQLC-------YQLYRQPIPVKDLLLED
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CCDS17 KTKSNKELHGFLFNDFLLLTYMVKQFAVSSGSEKLFSSKSNAQFKMYKTPIFLNEVLVKL
1450 1460 1470 1480 1490 1500
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pF1KB8 LQDGEVRLGGSLRGAFSNNERIKNFFRVSFKNGSQSQTHSLQANDTFNKQQWLNCIRQAK
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CCDS17 PTDP------------SSDEPV---FHISHID----RVYTLRTDNINERTAWVQKIKAAS
1510 1520 1530 1540
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pF1KB8 ETVLCAAGQAGVLDSEGSFLNPTTGSRELQGETKLEQMDQSDSESDCSMDTSEVSLDCER
:
CCDS17 EQYIDTEKKKREKAYQARSQKTSGIGRLMVHVIEATELKACKPNGKSNPYCEISMGSQSY
1550 1560 1570 1580 1590 1600
526 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 12:54:36 2016 done: Fri Nov 4 12:54:37 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]