Result of FASTA (ccds) for
pF1KB8448
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8448, 445 aa
1>>>pF1KB8448 445 - 445 aa - 445 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0883+/-0.000628; mu= 15.3199+/- 0.038
mean_var=85.9633+/-17.283, 0's: 0 Z-trim(112.9): 21 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.138330
statistics sampled from 13607 (13628) to 13607 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.743), E-opt: 0.2 (0.419), width: 16
Scan time: 3.310
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS13971.1 KCNJ4 gene_id:3761|Hs108|chr22 ( 445) 2987 605.3 3.9e-173
CCDS11219.1 KCNJ12 gene_id:3768|Hs108|chr17 ( 433) 1454 299.4 4.7e-81
CCDS74015.1 KCNJ18 gene_id:100134444|Hs108|chr17 ( 433) 1441 296.8 2.9e-80
CCDS11688.1 KCNJ2 gene_id:3759|Hs108|chr17 ( 427) 1388 286.2 4.3e-77
CCDS12721.1 KCNJ14 gene_id:3770|Hs108|chr19 ( 436) 1304 269.5 4.9e-72
CCDS8479.1 KCNJ5 gene_id:3762|Hs108|chr11 ( 419) 1087 226.1 5.1e-59
CCDS8692.1 KCNJ8 gene_id:3764|Hs108|chr12 ( 424) 1061 220.9 1.9e-57
CCDS42927.1 KCNJ6 gene_id:3763|Hs108|chr21 ( 423) 1046 218.0 1.5e-56
CCDS1194.1 KCNJ9 gene_id:3765|Hs108|chr1 ( 393) 1024 213.5 3e-55
CCDS2200.1 KCNJ3 gene_id:3760|Hs108|chr2 ( 501) 951 199.0 8.8e-51
CCDS31436.1 KCNJ11 gene_id:3767|Hs108|chr11 ( 390) 885 185.8 6.6e-47
CCDS53606.1 KCNJ11 gene_id:3767|Hs108|chr11 ( 303) 869 182.6 4.9e-46
CCDS8477.1 KCNJ1 gene_id:3758|Hs108|chr11 ( 372) 850 178.8 8e-45
CCDS8476.1 KCNJ1 gene_id:3758|Hs108|chr11 ( 391) 850 178.8 8.4e-45
CCDS11687.1 KCNJ16 gene_id:3773|Hs108|chr17 ( 418) 824 173.6 3.2e-43
CCDS74141.1 KCNJ16 gene_id:3773|Hs108|chr17 ( 453) 824 173.7 3.5e-43
CCDS1193.1 KCNJ10 gene_id:3766|Hs108|chr1 ( 379) 716 152.1 9.1e-37
CCDS13656.1 KCNJ15 gene_id:3772|Hs108|chr21 ( 375) 694 147.7 1.9e-35
CCDS58733.1 KCNJ3 gene_id:3760|Hs108|chr2 ( 235) 468 102.5 4.8e-22
CCDS2498.1 KCNJ13 gene_id:3769|Hs108|chr2 ( 360) 448 98.6 1.1e-20
>>CCDS13971.1 KCNJ4 gene_id:3761|Hs108|chr22 (445 aa)
initn: 2987 init1: 2987 opt: 2987 Z-score: 3221.9 bits: 605.3 E(32554): 3.9e-173
Smith-Waterman score: 2987; 100.0% identity (100.0% similar) in 445 aa overlap (1-445:1-445)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MHGHSRNGQAHVPRRKRRNRFVKKNGQCNVYFANLSNKSQRYMADIFTTCVDTRWRYMLM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 MHGHSRNGQAHVPRRKRRNRFVKKNGQCNVYFANLSNKSQRYMADIFTTCVDTRWRYMLM
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 IFSAAFLVSWLFFGLLFWCIAFFHGDLEASPGVPAAGGPAAGGGGAAPVAPKPCIMHVNG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 IFSAAFLVSWLFFGLLFWCIAFFHGDLEASPGVPAAGGPAAGGGGAAPVAPKPCIMHVNG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 FLGAFLFSVETQTTIGYGFRCVTEECPLAVIAVVVQSIVGCVIDSFMIGTIMAKMARPKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 FLGAFLFSVETQTTIGYGFRCVTEECPLAVIAVVVQSIVGCVIDSFMIGTIMAKMARPKK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 RAQTLLFSHHAVISVRDGKLCLMWRVGNLRKSHIVEAHVRAQLIKPYMTQEGEYLPLDQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 RAQTLLFSHHAVISVRDGKLCLMWRVGNLRKSHIVEAHVRAQLIKPYMTQEGEYLPLDQR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 DLNVGYDIGLDRIFLVSPIIIVHEIDEDSPLYGMGKEELESEDFEIVVILEGMVEATAMT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 DLNVGYDIGLDRIFLVSPIIIVHEIDEDSPLYGMGKEELESEDFEIVVILEGMVEATAMT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 TQARSSYLASEILWGHRFEPVVFEEKSHYKVDYSRFHKTYEVAGTPCCSARELQESKITV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 TQARSSYLASEILWGHRFEPVVFEEKSHYKVDYSRFHKTYEVAGTPCCSARELQESKITV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 LPAPPPPPSAFCYENELALMSQEEEEMEEEAAAAAAVAAGLGLEAGSKEEAGIIRMLEFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 LPAPPPPPSAFCYENELALMSQEEEEMEEEAAAAAAVAAGLGLEAGSKEEAGIIRMLEFG
370 380 390 400 410 420
430 440
pF1KB8 SHLDLERMQASLPLDNISYRRESAI
:::::::::::::::::::::::::
CCDS13 SHLDLERMQASLPLDNISYRRESAI
430 440
>>CCDS11219.1 KCNJ12 gene_id:3768|Hs108|chr17 (433 aa)
initn: 1893 init1: 1359 opt: 1454 Z-score: 1568.6 bits: 299.4 E(32554): 4.7e-81
Smith-Waterman score: 1846; 65.0% identity (82.5% similar) in 440 aa overlap (7-445:33-433)
10 20 30
pF1KB8 MHGHSRNGQAHVPRRKRRNRFVKKNGQCNVYFANLS
::..:. ::. ::::::::::::. :::..
CCDS11 AASRANPYSIVSSEEDGLHLVTMSGANGFGNGKVHT-RRRCRNRFVKKNGQCNIEFANMD
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KB8 NKSQRYMADIFTTCVDTRWRYMLMIFSAAFLVSWLFFGLLFWCIAFFHGDLEASPGVPAA
.:::::.::.:::::: ::::::.::: :::.:::.::..:: :: :::::
CCDS11 EKSQRYLADMFTTCVDIRWRYMLLIFSLAFLASWLLFGIIFWVIAVAHGDLE--------
70 80 90 100 110
100 110 120 130 140 150
pF1KB8 GGPAAGGGGAAPVAPKPCIMHVNGFLGAFLFSVETQTTIGYGFRCVTEECPLAVIAVVVQ
:: : : . ::.:.:.::..:::::.:::::::::.::::::::.::. ::.:
CCDS11 --PAEGRGRT------PCVMQVHGFMAAFLFSIETQTTIGYGLRCVTEECPVAVFMVVAQ
120 130 140 150 160
160 170 180 190 200 210
pF1KB8 SIVGCVIDSFMIGTIMAKMARPKKRAQTLLFSHHAVISVRDGKLCLMWRVGNLRKSHIVE
:::::.:::::::.:::::::::::::::::::.::...:::::::::::::::::::::
CCDS11 SIVGCIIDSFMIGAIMAKMARPKKRAQTLLFSHNAVVALRDGKLCLMWRVGNLRKSHIVE
170 180 190 200 210 220
220 230 240 250 260 270
pF1KB8 AHVRAQLIKPYMTQEGEYLPLDQRDLNVGYDIGLDRIFLVSPIIIVHEIDEDSPLYGMGK
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CCDS11 AHVRAQLIKPRVTEEGEYIPLDQIDIDVGFDKGLDRIFLVSPITILHEIDEASPLFGISR
230 240 250 260 270 280
280 290 300 310 320 330
pF1KB8 EELESEDFEIVVILEGMVEATAMTTQARSSYLASEILWGHRFEPVVFEEKSHYKVDYSRF
..::..:::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::.::::..::.:::.:
CCDS11 QDLETDDFEIVVILEGMVEATAMTTQARSSYLANEILWGHRFEPVLFEEKNQYKIDYSHF
290 300 310 320 330 340
340 350 360 370 380 390
pF1KB8 HKTYEVAGTPCCSARELQESKITVLPAPPPPPSAFCYENELALMSQEEEEMEEEAAAAAA
:::::: .:: :::..: :.:. . : ..::::::::..:..::. : .. .
CCDS11 HKTYEVPSTPRCSAKDLVENKFLL-----PSANSFCYENELAFLSRDEED-EADGDQDGR
350 360 370 380 390
400 410 420 430 440
pF1KB8 VAAGLGLEAGSKEEAGIIRMLEFGSHLDLERMQASLP-LDNISYRRESAI
::. .: : :..:.::. :.. ::::: :
CCDS11 SRDGLSPQA---------------RH-DFDRLQAGGGVLEQRPYRRESEI
400 410 420 430
>>CCDS74015.1 KCNJ18 gene_id:100134444|Hs108|chr17 (433 aa)
initn: 1882 init1: 1345 opt: 1441 Z-score: 1554.6 bits: 296.8 E(32554): 2.9e-80
Smith-Waterman score: 1823; 70.8% identity (88.2% similar) in 380 aa overlap (7-386:33-390)
10 20 30
pF1KB8 MHGHSRNGQAHVPRRKRRNRFVKKNGQCNVYFANLS
::..:. ::. ::::::::::::. :::..
CCDS74 AASRANPYSIVSLEEDGLHLVTMSGANGFGNGKVHT-RRRCRNRFVKKNGQCNIAFANMD
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KB8 NKSQRYMADIFTTCVDTRWRYMLMIFSAAFLVSWLFFGLLFWCIAFFHGDLEASPGVPAA
.:::::.::.:::::: ::::::.::: :::.:::.::..:: :: :::::
CCDS74 EKSQRYLADMFTTCVDIRWRYMLLIFSLAFLASWLLFGVIFWVIAVAHGDLE--------
70 80 90 100 110
100 110 120 130 140 150
pF1KB8 GGPAAGGGGAAPVAPKPCIMHVNGFLGAFLFSVETQTTIGYGFRCVTEECPLAVIAVVVQ
:: : : . ::.:.:.::..:::::.:::::::::.::::::: .::. ::.:
CCDS74 --PAEGHGRT------PCVMQVHGFMAAFLFSIETQTTIGYGLRCVTEECLVAVFMVVAQ
120 130 140 150 160
160 170 180 190 200 210
pF1KB8 SIVGCVIDSFMIGTIMAKMARPKKRAQTLLFSHHAVISVRDGKLCLMWRVGNLRKSHIVE
:::::.:::::::.:::::::::::::::::::.::...:::::::::::::::::::::
CCDS74 SIVGCIIDSFMIGAIMAKMARPKKRAQTLLFSHNAVVALRDGKLCLMWRVGNLRKSHIVE
170 180 190 200 210 220
220 230 240 250 260 270
pF1KB8 AHVRAQLIKPYMTQEGEYLPLDQRDLNVGYDIGLDRIFLVSPIIIVHEIDEDSPLYGMGK
:::::::::: .:.::::.:::: :..::.: ::::::::::: :.::::: :::.:...
CCDS74 AHVRAQLIKPRVTEEGEYIPLDQIDIDVGFDKGLDRIFLVSPITILHEIDEASPLFGISR
230 240 250 260 270 280
280 290 300 310 320 330
pF1KB8 EELESEDFEIVVILEGMVEATAMTTQARSSYLASEILWGHRFEPVVFEEKSHYKVDYSRF
..::..:::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::.::::..::.:::.:
CCDS74 QDLETDDFEIVVILEGMVEATAMTTQARSSYLANEILWGHRFEPVLFEEKNQYKIDYSHF
290 300 310 320 330 340
340 350 360 370 380 390
pF1KB8 HKTYEVAGTPCCSARELQESKITVLPAPPPPPSAFCYENELALMSQEEEEMEEEAAAAAA
:::::: .:: :::..: :.:. . : ..::::::::..:..::.
CCDS74 HKTYEVPSTPRCSAKDLVENKFLL-----PSANSFCYENELAFLSRDEEDEADGDQDGRS
350 360 370 380 390 400
400 410 420 430 440
pF1KB8 VAAGLGLEAGSKEEAGIIRMLEFGSHLDLERMQASLPLDNISYRRESAI
CCDS74 RDGLSPQARHDFDRLQAGGGVLEQRPYRRGSEI
410 420 430
>>CCDS11688.1 KCNJ2 gene_id:3759|Hs108|chr17 (427 aa)
initn: 1763 init1: 1283 opt: 1388 Z-score: 1497.5 bits: 286.2 E(32554): 4.3e-77
Smith-Waterman score: 1716; 60.9% identity (79.1% similar) in 440 aa overlap (7-445:32-427)
10 20 30
pF1KB8 MHGHSRNGQAHVPRRKR-RNRFVKKNGQCNVYFANL
::...: :.. :.:::::.:.::: : :.
CCDS11 GSVRTNRYSIVSSEEDGMKLATMAVANGFGNGKSKVHTRQQCRSRFVKKDGHCNVQFINV
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KB8 SNKSQRYMADIFTTCVDTRWRYMLMIFSAAFLVSWLFFGLLFWCIAFFHGDLEASPGVPA
..:.:::.::::::::: :::.::.:: ::..:::::: .:: ::..::::.::
CCDS11 GEKGQRYLADIFTTCVDIRWRWMLVIFCLAFVLSWLFFGCVFWLIALLHGDLDASK----
70 80 90 100 110
100 110 120 130 140 150
pF1KB8 AGGPAAGGGGAAPVAPKPCIMHVNGFLGAFLFSVETQTTIGYGFRCVTEECPLAVIAVVV
: : :. .::.: .:::::.::::::::::::::.:::.::. ::
CCDS11 -----EG---------KACVSEVNSFTAAFLFSIETQTTIGYGFRCVTDECPIAVFMVVF
120 130 140 150 160
160 170 180 190 200 210
pF1KB8 QSIVGCVIDSFMIGTIMAKMARPKKRAQTLLFSHHAVISVRDGKLCLMWRVGNLRKSHIV
::::::.::.:.::..:::::.:::: .::.:::.:::..::::::::::::::::::.:
CCDS11 QSIVGCIIDAFIIGAVMAKMAKPKKRNETLVFSHNAVIAMRDGKLCLMWRVGNLRKSHLV
170 180 190 200 210 220
220 230 240 250 260 270
pF1KB8 EAHVRAQLIKPYMTQEGEYLPLDQRDLNVGYDIGLDRIFLVSPIIIVHEIDEDSPLYGMG
::::::::.: .:.::::.:::: :.:::.: :.::::::::: :::::::::::: ..
CCDS11 EAHVRAQLLKSRITSEGEYIPLDQIDINVGFDSGIDRIFLVSPITIVHEIDEDSPLYDLS
230 240 250 260 270 280
280 290 300 310 320 330
pF1KB8 KEELESEDFEIVVILEGMVEATAMTTQARSSYLASEILWGHRFEPVVFEEKSHYKVDYSR
:..... :::::::::::::::::::: ::::::.:::::::.:::.:::: .:::::::
CCDS11 KQDIDNADFEIVVILEGMVEATAMTTQCRSSYLANEILWGHRYEPVLFEEKHYYKVDYSR
290 300 310 320 330 340
340 350 360 370 380 390
pF1KB8 FHKTYEVAGTPCCSARELQESKITVLPAPPPPPSAFCYENELALMSQEEEEMEEEAAAAA
::::::: .:: ::::.: :.: . : ..::::::.:: :.::.. :.
CCDS11 FHKTYEVPNTPLCSARDLAEKKYILSNA-----NSFCYENEVALTSKEEDDSEN------
350 360 370 380 390
400 410 420 430 440
pF1KB8 AVAAGLGLEAGSKEEAGIIRMLEFGSHLDLERMQASLPLDNISYRRESAI
:. ... .. .::. :::.::. :::: :
CCDS11 ------GVPESTSTDTP--------PDIDLHN-QASVPLEPRPLRRESEI
400 410 420
>>CCDS12721.1 KCNJ14 gene_id:3770|Hs108|chr19 (436 aa)
initn: 1283 init1: 1209 opt: 1304 Z-score: 1406.8 bits: 269.5 E(32554): 4.9e-72
Smith-Waterman score: 1599; 59.1% identity (79.7% similar) in 403 aa overlap (3-397:30-414)
10 20
pF1KB8 MHGHSRNGQAHVPRR----KRRNRFVKKNGQCN
: ::: : .: . .::.:::::.:.::
CCDS12 MGLARALRRLSGALDSGDSRAGDEEEAGPGLCRNGWAPAPVQSPVGRRRGRFVKKDGHCN
10 20 30 40 50 60
30 40 50 60 70 80
pF1KB8 VYFANLSNKSQRYMADIFTTCVDTRWRYMLMIFSAAFLVSWLFFGLLFWCIAFFHGDLEA
: :.::.... ::..:.::::::.:::.: ..:: .::.:::.::: :: :: .::::
CCDS12 VRFVNLGGQGARYLSDLFTTCVDVRWRWMCLLFSCSFLASWLLFGLAFWLIASLHGDL--
70 80 90 100 110
90 100 110 120 130 140
pF1KB8 SPGVPAAGGPAAGGGGAAPVAPKPCIMHVNGFLGAFLFSVETQTTIGYGFRCVTEECPLA
::: : ::. :: .::.::::..::::.:::: : :::::: :
CCDS12 ----------------AAPPPPAPCFSHVASFLAAFLFALETQTSIGYGVRSVTEECPAA
120 130 140 150 160
150 160 170 180 190 200
pF1KB8 VIAVVVQSIVGCVIDSFMIGTIMAKMARPKKRAQTLLFSHHAVISVRDGKLCLMWRVGNL
: :::.: :.:::.:.:..:..:::::.:::: .::.::..::...:: .::::::::::
CCDS12 VAAVVLQCIAGCVLDAFVVGAVMAKMAKPKKRNETLVFSENAVVALRDHRLCLMWRVGNL
170 180 190 200 210 220
210 220 230 240 250 260
pF1KB8 RKSHIVEAHVRAQLIKPYMTQEGEYLPLDQRDLNVGYDIGLDRIFLVSPIIIVHEIDEDS
:.::.:::::::::..: .: ::::.:::..:..::.: : ::::::::: :::::: :
CCDS12 RRSHLVEAHVRAQLLQPRVTPEGEYIPLDHQDVDVGFDGGTDRIFLVSPITIVHEIDSAS
230 240 250 260 270 280
270 280 290 300 310 320
pF1KB8 PLYGMGKEELESEDFEIVVILEGMVEATAMTTQARSSYLASEILWGHRFEPVVFEEKSHY
::: .:. :: :::.:::::::::::::::: ::::: .:.:::::::::.:.. :.:
CCDS12 PLYELGRAELARADFELVVILEGMVEATAMTTQCRSSYLPGELLWGHRFEPVLFQRGSQY
290 300 310 320 330 340
330 340 350 360 370 380
pF1KB8 KVDYSRFHKTYEVAGTPCCSARELQE----SKITVLPAPPPPPSAFCYENELALMSQEEE
.::: .::.:::: ::: :::.::.: .. .. . : .:::::::::: .::
CCDS12 EVDYRHFHRTYEVPGTPVCSAKELDERAEQASHSLKSSFPGSLTAFCYENELALSCCQEE
350 360 370 380 390 400
390 400 410 420 430 440
pF1KB8 EMEEEAAAAAAVAAGLGLEAGSKEEAGIIRMLEFGSHLDLERMQASLPLDNISYRRESAI
. ..:. . .:
CCDS12 DEDDETEEGNGVETEDGAASPRVLTPTLALTLPP
410 420 430
>>CCDS8479.1 KCNJ5 gene_id:3762|Hs108|chr11 (419 aa)
initn: 1248 init1: 1027 opt: 1087 Z-score: 1173.0 bits: 226.1 E(32554): 5.1e-59
Smith-Waterman score: 1305; 49.1% identity (76.0% similar) in 405 aa overlap (15-414:47-419)
10 20 30 40
pF1KB8 MHGHSRNGQAHVPRRKRRNRFVKKNGQCNVYFANLSNKSQRYMA
.: :.:...:.:.:::. .:.. .. ::..
CCDS84 VTPWDPKKIPKQARDYVPIATDRTRLLAEGKKPRQRYMEKSGKCNVHHGNVQ-ETYRYLS
20 30 40 50 60 70
50 60 70 80 90 100
pF1KB8 DIFTTCVDTRWRYMLMIFSAAFLVSWLFFGLLFWCIAFFHGDLEASPGVPAAGGPAAGGG
:.::: :: .::. :..:. .. :.:::::...: ::...:::. :
CCDS84 DLFTTLVDLKWRFNLLVFTMVYTVTWLFFGFIWWLIAYIRGDLDHV-------------G
80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB8 GAAPVAPKPCIMHVNGFLGAFLFSVETQTTIGYGFRCVTEECPLAVIAVVVQSIVGCVID
. ::. ...::..:::::.::.:::::::: .::.:: ..: ..::.:.: ...
CCDS84 DQEWI---PCVENLSGFVSAFLFSIETETTIGYGFRVITEKCPEGIILLLVQAILGSIVN
130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KB8 SFMIGTIMAKMARPKKRAQTLLFSHHAVISVRDGKLCLMWRVGNLRKSHIVEAHVRAQLI
.::.: ...:...:::::.::.::..::::.:: :::::.:::.::.:::::: .::.::
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230 240 250 260 270 280
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CCDS84 KSRQTKEGEFIPLNQTDINVGFDTGDDRLFLVSPLIISHEINQKSPFWEMSQAQLHQEEF
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CCDS84 EVVVILEGMVEATGMTCQARSSYMDTEVLWGHRFTPVLTLEKGFYEVDYNTFHDTYET-N
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350 360 370 380 390
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CCDS84 TPSCCAKELAEMKREGRLLQYLPSPPLLGG--CAE---AGLDAEAEQNEEDEPK------
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CCDS84 GLG---GSREARGSV
410
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CCDS86 IFTTLVDLKWRHTLVIFTMSFLCSWLLFAIMWWLVAFAHGDIYAY--MEKSGMEKSG---
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CCDS86 KTTTPEGEVVPIHQLDIPVDNPIESNNIFLVAPLIICHVIDKRSPLYDISATDLANQDLE
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CCDS86 VIVILEGVVETTGITTQARTSYIAEEIQWGHRFVSIVTEEEGVYSVDYSKFGNTVKVAA-
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CCDS86 PRCSARELDE-KPSILIQTLQKSELSHQNSLRKRNSMRRNNSMRRNNSIRRNNSSLMVPK
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CCDS42 ---------TPCVTNLNGFVSAFLFSIETETTIGYGYRVITDKCPEGIILLLIQSVLGSI
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CCDS42 LIKSKQTSEGEFIPLNQTDINVGYYTGDDRLFLVSPLIISHEINQQSPFWEISKAQLPKE
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CCDS42 ELEIVVILEGMVEATGMTCQARSSYITSEILWGYRFTPVLTLEDGFYEVDYNSFHETYET
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CCDS42 S-TPSLSAKELAELASRAELPLSWSVSSKLNQHAELET-EEEEKNLEEQTERNGDVA---
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pF1KB8 GLEAGSKEEAGIIRMLEFGSHLDLERMQASLPLDNISYRRESAI
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CCDS42 NLENESKV
420
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CCDS11 PESESKV
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CCDS22 MSALRRKFGDDYQVVTTSSSGSGLQPQGPGQDPQQQLVPKKKRQRFVDKNGRCNVQHGNL
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CCDS22 GSETSRYLSDLFTTLVDLKWRWNLFIFILTYTVAWLFMASMWWVIAYTRGDLNK------
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CCDS22 QSILGSIVDAFLIGCMFIKMSQPKKRAETLMFSEHAVISMRDGKLTLMFRVGNLRNSHMV
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CCDS22 QRSMQTEQFEIVVILEGIVETTGMTCQARTSYTEDEVLWGHRFFPVISLEEGFFKVDYSQ
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pF1KB8 FHKTYEVAGTPCCSARELQESKITVLPAPPPPPSAFCYENELALMSQEEEEMEEEAAAAA
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CCDS22 FHATFEVP-TPPYSVKEQEEMLLMSSPLIAPAITNSKERHNSVECLDGLDDITTKLPSKL
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CCDS22 QKITGREDFPKKLLRMSSTTSEKAYSLGDLPMKLQRISSVPGNSEEKLVSKTTKMLSDPM
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18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 12:58:44 2016 done: Fri Nov 4 12:58:45 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]