Result of FASTA (ccds) for
pF1KB8451
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8451, 364 aa
1>>>pF1KB8451 364 - 364 aa - 364 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.0678+/-0.00092; mu= 3.2736+/- 0.054
mean_var=237.5426+/-52.793, 0's: 0 Z-trim(111.7): 633 B-trim: 0 in 0/53
Lambda= 0.083215
statistics sampled from 11794 (12567) to 11794 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.73), E-opt: 0.2 (0.386), width: 16
Scan time: 2.500
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS14090.1 MAPK11 gene_id:5600|Hs108|chr22 ( 364) 2425 304.2 1.1e-82
CCDS4816.1 MAPK14 gene_id:1432|Hs108|chr6 ( 360) 1857 236.1 3.7e-62
CCDS4815.1 MAPK14 gene_id:1432|Hs108|chr6 ( 360) 1821 231.7 7.5e-61
CCDS14089.1 MAPK12 gene_id:6300|Hs108|chr22 ( 367) 1592 204.2 1.4e-52
CCDS4818.1 MAPK13 gene_id:5603|Hs108|chr6 ( 365) 1485 191.4 1e-48
CCDS4817.1 MAPK14 gene_id:1432|Hs108|chr6 ( 307) 1406 181.8 6.7e-46
CCDS10672.1 MAPK3 gene_id:5595|Hs108|chr16 ( 379) 1065 141.0 1.6e-33
CCDS11206.1 MAPK7 gene_id:5598|Hs108|chr17 ( 816) 1062 141.0 3.5e-33
CCDS13795.1 MAPK1 gene_id:5594|Hs108|chr22 ( 360) 1051 139.3 5e-33
CCDS42149.1 MAPK3 gene_id:5595|Hs108|chr16 ( 357) 998 132.9 4.1e-31
CCDS77688.1 MAPK12 gene_id:6300|Hs108|chr22 ( 357) 955 127.8 1.5e-29
CCDS7226.1 MAPK8 gene_id:5599|Hs108|chr10 ( 384) 954 127.7 1.7e-29
CCDS7223.1 MAPK8 gene_id:5599|Hs108|chr10 ( 427) 954 127.7 1.8e-29
CCDS7225.1 MAPK8 gene_id:5599|Hs108|chr10 ( 384) 945 126.6 3.5e-29
CCDS7224.1 MAPK8 gene_id:5599|Hs108|chr10 ( 427) 945 126.6 3.8e-29
CCDS43247.1 MAPK10 gene_id:5602|Hs108|chr4 ( 422) 935 125.4 8.7e-29
CCDS3612.1 MAPK10 gene_id:5602|Hs108|chr4 ( 426) 935 125.4 8.7e-29
CCDS34026.1 MAPK10 gene_id:5602|Hs108|chr4 ( 464) 935 125.5 9.3e-29
CCDS43410.1 MAPK9 gene_id:5601|Hs108|chr5 ( 382) 923 123.9 2.2e-28
CCDS4454.1 MAPK9 gene_id:5601|Hs108|chr5 ( 424) 923 124.0 2.4e-28
CCDS43409.1 MAPK9 gene_id:5601|Hs108|chr5 ( 382) 908 122.1 7.7e-28
CCDS4453.1 MAPK9 gene_id:5601|Hs108|chr5 ( 424) 908 122.2 8.2e-28
CCDS11207.1 MAPK7 gene_id:5598|Hs108|chr17 ( 677) 830 113.1 7.4e-25
CCDS11224.2 NLK gene_id:51701|Hs108|chr17 ( 527) 821 111.9 1.3e-24
CCDS47356.1 MAPK9 gene_id:5601|Hs108|chr5 ( 242) 810 110.2 2e-24
CCDS42148.1 MAPK3 gene_id:5595|Hs108|chr16 ( 335) 773 105.9 5.3e-23
CCDS6409.2 MAPK15 gene_id:225689|Hs108|chr8 ( 544) 750 103.3 5e-22
CCDS60527.1 MAPK8 gene_id:5599|Hs108|chr10 ( 308) 726 100.2 2.5e-21
CCDS78103.1 MAPK9 gene_id:5601|Hs108|chr5 ( 214) 697 96.5 2.2e-20
CCDS10147.1 MAPK6 gene_id:5597|Hs108|chr15 ( 721) 704 98.0 2.8e-20
CCDS42437.1 MAPK4 gene_id:5596|Hs108|chr18 ( 587) 683 95.3 1.4e-19
CCDS11736.1 CDK3 gene_id:1018|Hs108|chr17 ( 305) 651 91.2 1.3e-18
CCDS8898.1 CDK2 gene_id:1017|Hs108|chr12 ( 298) 614 86.7 2.7e-17
CCDS3999.1 CDK7 gene_id:1022|Hs108|chr5 ( 346) 612 86.6 3.6e-17
CCDS4949.1 ICK gene_id:22858|Hs108|chr6 ( 632) 590 84.2 3.3e-16
CCDS35060.1 CDK20 gene_id:23552|Hs108|chr9 ( 346) 582 83.0 4.3e-16
CCDS47748.1 CDK5 gene_id:1020|Hs108|chr7 ( 292) 579 82.5 5e-16
CCDS44408.1 CDK1 gene_id:983|Hs108|chr10 ( 297) 571 81.6 9.8e-16
CCDS82937.1 MAPK10 gene_id:5602|Hs108|chr4 ( 319) 567 81.1 1.4e-15
CCDS77188.1 MAPK4 gene_id:5596|Hs108|chr18 ( 233) 559 80.0 2.3e-15
CCDS75398.1 MAK gene_id:4117|Hs108|chr6 ( 583) 566 81.3 2.3e-15
CCDS4516.1 MAK gene_id:4117|Hs108|chr6 ( 623) 566 81.3 2.4e-15
CCDS75399.1 MAK gene_id:4117|Hs108|chr6 ( 648) 566 81.3 2.5e-15
CCDS54628.1 GSK3B gene_id:2932|Hs108|chr3 ( 420) 554 79.7 5.1e-15
CCDS12599.1 GSK3A gene_id:2931|Hs108|chr19 ( 483) 551 79.4 7.2e-15
CCDS5628.1 CDK6 gene_id:1021|Hs108|chr7 ( 326) 547 78.7 7.7e-15
CCDS9061.1 CDK17 gene_id:5128|Hs108|chr12 ( 523) 549 79.2 8.9e-15
CCDS53819.1 CDK17 gene_id:5128|Hs108|chr12 ( 523) 549 79.2 8.9e-15
CCDS44300.1 CDK18 gene_id:5129|Hs108|chr1 ( 474) 540 78.1 1.8e-14
CCDS1454.1 CDK18 gene_id:5129|Hs108|chr1 ( 504) 540 78.1 1.8e-14
>>CCDS14090.1 MAPK11 gene_id:5600|Hs108|chr22 (364 aa)
initn: 2425 init1: 2425 opt: 2425 Z-score: 1597.8 bits: 304.2 E(32554): 1.1e-82
Smith-Waterman score: 2425; 100.0% identity (100.0% similar) in 364 aa overlap (1-364:1-364)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MSGPRAGFYRQELNKTVWEVPQRLQGLRPVGSGAYGSVCSAYDARLRQKVAVKKLSRPFQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 MSGPRAGFYRQELNKTVWEVPQRLQGLRPVGSGAYGSVCSAYDARLRQKVAVKKLSRPFQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 SLIHARRTYRELRLLKHLKHENVIGLLDVFTPATSIEDFSEVYLVTTLMGADLNNIVKCQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 SLIHARRTYRELRLLKHLKHENVIGLLDVFTPATSIEDFSEVYLVTTLMGADLNNIVKCQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 ALSDEHVQFLVYQLLRGLKYIHSAGIIHRDLKPSNVAVNEDCELRILDFGLARQADEEMT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 ALSDEHVQFLVYQLLRGLKYIHSAGIIHRDLKPSNVAVNEDCELRILDFGLARQADEEMT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 GYVATRWYRAPEIMLNWMHYNQTVDIWSVGCIMAELLQGKALFPGSDYIDQLKRIMEVVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 GYVATRWYRAPEIMLNWMHYNQTVDIWSVGCIMAELLQGKALFPGSDYIDQLKRIMEVVG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 TPSPEVLAKISSEHARTYIQSLPPMPQKDLSSIFRGANPLAIDLLGRMLVLDSDQRVSAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 TPSPEVLAKISSEHARTYIQSLPPMPQKDLSSIFRGANPLAIDLLGRMLVLDSDQRVSAA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 EALAHAYFSQYHDPEDEPEAEPYDESVEAKERTLEEWKELTYQEVLSFKPPEPPKPPGSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 EALAHAYFSQYHDPEDEPEAEPYDESVEAKERTLEEWKELTYQEVLSFKPPEPPKPPGSL
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 EIEQ
::::
CCDS14 EIEQ
>>CCDS4816.1 MAPK14 gene_id:1432|Hs108|chr6 (360 aa)
initn: 1857 init1: 1857 opt: 1857 Z-score: 1229.4 bits: 236.1 E(32554): 3.7e-62
Smith-Waterman score: 1857; 75.5% identity (91.7% similar) in 351 aa overlap (1-351:1-351)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MSGPRAGFYRQELNKTVWEVPQRLQGLRPVGSGAYGSVCSAYDARLRQKVAVKKLSRPFQ
:: : :::::::::.::::.: :.: :::::::::::.:.:.. .:::::::::::
CCDS48 MSQERPTFYRQELNKTIWEVPERYQNLSPVGSGAYGSVCAAFDTKTGLRVAVKKLSRPFQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 SLIHARRTYRELRLLKHLKHENVIGLLDVFTPATSIEDFSEVYLVTTLMGADLNNIVKCQ
:.:::.:::::::::::.::::::::::::::: :.:.:..::::: :::::::::::::
CCDS48 SIIHAKRTYRELRLLKHMKHENVIGLLDVFTPARSLEEFNDVYLVTHLMGADLNNIVKCQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 ALSDEHVQFLVYQLLRGLKYIHSAGIIHRDLKPSNVAVNEDCELRILDFGLARQADEEMT
:.:.:::::.::.:::::::::: ::::::::::.::::::::.::::::::..:.:::
CCDS48 KLTDDHVQFLIYQILRGLKYIHSADIIHRDLKPSNLAVNEDCELKILDFGLARHTDDEMT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 GYVATRWYRAPEIMLNWMHYNQTVDIWSVGCIMAELLQGKALFPGSDYIDQLKRIMEVVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :..::::.:.::::: :...::
CCDS48 GYVATRWYRAPEIMLNWMHYNQTVDIWSVGCIMAELLTGRTLFPGTDHIDQLKLILRLVG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 TPSPEVLAKISSEHARTYIQSLPPMPQKDLSSIFRGANPLAIDLLGRMLVLDSDQRVSAA
::. :.: ::::: ::.::::: ::. .....: ::::::.::: .:::::::.:..::
CCDS48 TPGAELLKKISSESARNYIQSLTQMPKMNFANVFIGANPLAVDLLEKMLVLDSDKRITAA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 EALAHAYFSQYHDPEDEPEAEPYDESVEAKERTLEEWKELTYQEVLSFKPPEPPKPPGSL
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CCDS48 QALAHAYFAQYHDPDDEPVADPYDQSFESRDLLIDEWKSLTYDEVISFVPPPLDQEEMES
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 EIEQ
>>CCDS4815.1 MAPK14 gene_id:1432|Hs108|chr6 (360 aa)
initn: 1821 init1: 1821 opt: 1821 Z-score: 1206.0 bits: 231.7 E(32554): 7.5e-61
Smith-Waterman score: 1821; 73.2% identity (91.5% similar) in 351 aa overlap (1-351:1-351)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MSGPRAGFYRQELNKTVWEVPQRLQGLRPVGSGAYGSVCSAYDARLRQKVAVKKLSRPFQ
:: : :::::::::.::::.: :.: :::::::::::.:.:.. .:::::::::::
CCDS48 MSQERPTFYRQELNKTIWEVPERYQNLSPVGSGAYGSVCAAFDTKTGLRVAVKKLSRPFQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 SLIHARRTYRELRLLKHLKHENVIGLLDVFTPATSIEDFSEVYLVTTLMGADLNNIVKCQ
:.:::.:::::::::::.::::::::::::::: :.:.:..::::: :::::::::::::
CCDS48 SIIHAKRTYRELRLLKHMKHENVIGLLDVFTPARSLEEFNDVYLVTHLMGADLNNIVKCQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 ALSDEHVQFLVYQLLRGLKYIHSAGIIHRDLKPSNVAVNEDCELRILDFGLARQADEEMT
:.:.:::::.::.:::::::::: ::::::::::.::::::::.::::::::..:.:::
CCDS48 KLTDDHVQFLIYQILRGLKYIHSADIIHRDLKPSNLAVNEDCELKILDFGLARHTDDEMT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 GYVATRWYRAPEIMLNWMHYNQTVDIWSVGCIMAELLQGKALFPGSDYIDQLKRIMEVVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :..::::.:.:.::..::...:
CCDS48 GYVATRWYRAPEIMLNWMHYNQTVDIWSVGCIMAELLTGRTLFPGTDHINQLQQIMRLTG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 TPSPEVLAKISSEHARTYIQSLPPMPQKDLSSIFRGANPLAIDLLGRMLVLDSDQRVSAA
:: .. .. :..::.::::: ::. .....: ::::::.::: .:::::::.:..::
CCDS48 TPPAYLINRMPSHEARNYIQSLTQMPKMNFANVFIGANPLAVDLLEKMLVLDSDKRITAA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 EALAHAYFSQYHDPEDEPEAEPYDESVEAKERTLEEWKELTYQEVLSFKPPEPPKPPGSL
.:::::::.:::::.::: :.:::.: :... ..::: :::.::.:: ::
CCDS48 QALAHAYFAQYHDPDDEPVADPYDQSFESRDLLIDEWKSLTYDEVISFVPPPLDQEEMES
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 EIEQ
>>CCDS14089.1 MAPK12 gene_id:6300|Hs108|chr22 (367 aa)
initn: 1586 init1: 1586 opt: 1592 Z-score: 1057.3 bits: 204.2 E(32554): 1.4e-52
Smith-Waterman score: 1592; 63.6% identity (88.4% similar) in 354 aa overlap (1-351:1-354)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MSGP---RAGFYRQELNKTVWEVPQRLQGLRPVGSGAYGSVCSAYDARLRQKVAVKKLSR
::.: :.::::::..::.::: . :.::::::::.:::: :.: :::.::: :
CCDS14 MSSPPPARSGFYRQEVTKTAWEVRAVYRDLQPVGSGAYGAVCSAVDGRTGAKVAIKKLYR
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 PFQSLIHARRTYRELRLLKHLKHENVIGLLDVFTPATSIEDFSEVYLVTTLMGADLNNIV
:::: . :.:.:::::::::..::::::::::::: ...::.. ::: .::.::....
CCDS14 PFQSELFAKRAYRELRLLKHMRHENVIGLLDVFTPDETLDDFTDFYLVMPFMGTDLGKLM
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 KCQALSDEHVQFLVYQLLRGLKYIHSAGIIHRDLKPSNVAVNEDCELRILDFGLARQADE
: . :.....::::::.:.::.:::.::::::::::.:.::::::::.:::::::::::
CCDS14 KHEKLGEDRIQFLVYQMLKGLRYIHAAGIIHRDLKPGNLAVNEDCELKILDFGLARQADS
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 EMTGYVATRWYRAPEIMLNWMHYNQTVDIWSVGCIMAELLQGKALFPGSDYIDQLKRIME
::::::.::::::::..::::.:.::::::::::::::.. ::.:: :::..::::.::.
CCDS14 EMTGYVVTRWYRAPEVILNWMRYTQTVDIWSVGCIMAEMITGKTLFKGSDHLDQLKEIMK
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 VVGTPSPEVLAKISSEHARTYIQSLPPMPQKDLSSIFRGANPLAIDLLGRMLVLDSDQRV
:.::: : . ...:..:..:...:: . .::..::. .:.:::..:: .:::::..:::
CCDS14 VTGTPPAEFVQRLQSDEAKNYMKGLPELEKKDFASILTNASPLAVNLLEKMLVLDAEQRV
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 SAAEALAHAYFSQYHDPEDEPEAEPYDESVEAKERTLEEWKELTYQEVLSFKPPEPPKPP
.:.::::: :: . :: ::::... ::.: . .:::.:::..::.::::::::
CCDS14 TAGEALAHPYFESLHDTEDEPQVQKYDDSFDDVDRTLDEWKRVTYKEVLSFKPPRQLGAR
310 320 330 340 350 360
360
pF1KB8 GSLEIEQ
CCDS14 VSKETPL
>>CCDS4818.1 MAPK13 gene_id:5603|Hs108|chr6 (365 aa)
initn: 1362 init1: 908 opt: 1485 Z-score: 987.9 bits: 191.4 E(32554): 1e-48
Smith-Waterman score: 1485; 60.5% identity (86.2% similar) in 347 aa overlap (5-350:6-351)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MSGPRAGFYRQELNKTVWEVPQRLQGLRPVGSGAYGSVCSAYDARLRQKVAVKKLSRPF
. :::.:..:::.::.:. . :::::::::::: : : .:::.:::::::
CCDS48 MSLIRKKGFYKQDVNKTAWELPKTYVSPTHVGSGAYGSVCSAIDKRSGEKVAIKKLSRPF
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 QSLIHARRTYRELRLLKHLKHENVIGLLDVFTPATSIEDFSEVYLVTTLMGADLNNIVKC
:: : :.:.:::: ::::..::::::::::::::.:...: . ::: .: .::..:.
CCDS48 QSEIFAKRAYRELLLLKHMQHENVIGLLDVFTPASSLRNFYDFYLVMPFMQTDLQKIMGM
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 QALSDEHVQFLVYQLLRGLKYIHSAGIIHRDLKPSNVAVNEDCELRILDFGLARQADEEM
. .:.:..:.::::.:.:::::::::..::::::.:.::::::::.::::::::.:: ::
CCDS48 E-FSEEKIQYLVYQMLKGLKYIHSAGVVHRDLKPGNLAVNEDCELKILDFGLARHADAEM
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 TGYVATRWYRAPEIMLNWMHYNQTVDIWSVGCIMAELLQGKALFPGSDYIDQLKRIMEVV
::::.::::::::..:.:::::::::::::::::::.: ::.:: :.::.::: .:..:.
CCDS48 TGYVVTRWYRAPEVILSWMHYNQTVDIWSVGCIMAEMLTGKTLFKGKDYLDQLTQILKVT
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 GTPSPEVLAKISSEHARTYIQSLPPMPQKDLSSIFRGANPLAIDLLGRMLVLDSDQRVSA
:.:. : . :.... :..:::::: :.::....: :.: : ::: .:: :: :.:..:
CCDS48 GVPGTEFVQKLNDKAAKSYIQSLPQTPRKDFTQLFPRASPQAADLLEKMLELDVDKRLTA
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 AEALAHAYFSQYHDPEDEPEAE-PYDESVEAKERTLEEWKELTYQEVLSFKPPEPPKPPG
:.::.: .: ..:::.: ::. :.:.:.: .. :..:::. :.:...:.:
CCDS48 AQALTHPFFEPFRDPEEETEAQQPFDDSLEHEKLTVDEWKQHIYKEIVNFSPIARKDSRR
300 310 320 330 340 350
360
pF1KB8 SLEIEQ
CCDS48 RSGMKL
360
>>CCDS4817.1 MAPK14 gene_id:1432|Hs108|chr6 (307 aa)
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Smith-Waterman score: 1406; 79.4% identity (92.2% similar) in 257 aa overlap (1-257:1-257)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MSGPRAGFYRQELNKTVWEVPQRLQGLRPVGSGAYGSVCSAYDARLRQKVAVKKLSRPFQ
:: : :::::::::.::::.: :.: :::::::::::.:.:.. .:::::::::::
CCDS48 MSQERPTFYRQELNKTIWEVPERYQNLSPVGSGAYGSVCAAFDTKTGLRVAVKKLSRPFQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 SLIHARRTYRELRLLKHLKHENVIGLLDVFTPATSIEDFSEVYLVTTLMGADLNNIVKCQ
:.:::.:::::::::::.::::::::::::::: :.:.:..::::: :::::::::::::
CCDS48 SIIHAKRTYRELRLLKHMKHENVIGLLDVFTPARSLEEFNDVYLVTHLMGADLNNIVKCQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 ALSDEHVQFLVYQLLRGLKYIHSAGIIHRDLKPSNVAVNEDCELRILDFGLARQADEEMT
:.:.:::::.::.:::::::::: ::::::::::.::::::::.::::::::..:.:::
CCDS48 KLTDDHVQFLIYQILRGLKYIHSADIIHRDLKPSNLAVNEDCELKILDFGLARHTDDEMT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 GYVATRWYRAPEIMLNWMHYNQTVDIWSVGCIMAELLQGKALFPGSDYIDQLKRIMEVVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :..::::.:.::::: :...::
CCDS48 GYVATRWYRAPEIMLNWMHYNQTVDIWSVGCIMAELLTGRTLFPGTDHIDQLKLILRLVG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 TPSPEVLAKISSEHARTYIQSLPPMPQKDLSSIFRGANPLAIDLLGRMLVLDSDQRVSAA
::. :.: ::::: :
CCDS48 TPGAELLKKISSESLSTCWRRCLYWTQIRELQRPKPLHMPTLLSTTILMMNQWPILMISP
250 260 270 280 290 300
>>CCDS10672.1 MAPK3 gene_id:5595|Hs108|chr16 (379 aa)
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Smith-Waterman score: 1065; 47.6% identity (74.7% similar) in 340 aa overlap (18-350:36-373)
10 20 30 40
pF1KB8 MSGPRAGFYRQELNKTVWEVPQRLQGLRPVGSGAYGSVCSAYDARLR
..: : :. .: :::: : :::: .
CCDS10 AQGGGGGEPRRTEGVGPGVPGEVEMVKGQPFDVGPRYTQLQYIGEGAYGMVSSAYDHVRK
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB8 QKVAVKKLSRPFQSLIHARRTYRELRLLKHLKHENVIGLLDVFTPATSIEDFSEVYLVTT
.::.::.: ::. . .:: ::...: ...::::::. :.. :...: . .::.:
CCDS10 TRVAIKKIS-PFEHQTYCQRTLREIQILLRFRHENVIGIRDILR-ASTLEAMRDVYIVQD
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB8 LMGADLNNIVKCQALSDEHVQFLVYQLLRGLKYIHSAGIIHRDLKPSNVAVNEDCELRIL
:: .:: ...: : ::..:. ...::.::::::::::...::::::::. .: :.:.:
CCDS10 LMETDLYKLLKSQQLSNDHICYFLYQILRGLKYIHSANVLHRDLKPSNLLINTTCDLKIC
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KB8 DFGLARQADEE------MTGYVATRWYRAPEIMLNWMHYNQTVDIWSVGCIMAELLQGKA
:::::: :: : .: ::::::::::::::: :....::::::::.::.:...
CCDS10 DFGLARIADPEHDHTGFLTEYVATRWYRAPEIMLNSKGYTKSIDIWSVGCILAEMLSNRP
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KB8 LFPGSDYIDQLKRIMEVVGTPSPEVLAKISSEHARTYIQSLPPMPQKDLSSIFRGANPLA
.:::. :.:::..:. ..:.:: : : : . .::.:.:::: . ...: .. :
CCDS10 IFPGKHYLDQLNHILGILGSPSQEDLNCIINMKARNYLQSLPSKTKVAWAKLFPKSDSKA
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KB8 IDLLGRMLVLDSDQRVSAAEALAHAYFSQYHDPEDEPEAE-PYDESVEAKERTLEEWKEL
.::: :::... ..:... ::::: :. ::.:: ::: :: :. ..: . :. :::
CCDS10 LDLLDRMLTFNPNKRITVEEALAHPYLEQYYDPTDEPVAEEPFTFAMELDDLPKERLKEL
310 320 330 340 350 360
350 360
pF1KB8 TYQEVLSFKPPEPPKPPGSLEIEQ
.::. :.:
CCDS10 IFQETARFQPGVLEAP
370
>>CCDS11206.1 MAPK7 gene_id:5598|Hs108|chr17 (816 aa)
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Smith-Waterman score: 1062; 47.4% identity (75.3% similar) in 340 aa overlap (18-348:49-388)
10 20 30 40
pF1KB8 MSGPRAGFYRQELNKTVWEVPQRLQGLRPVGSGAYGSVCSAYDARLR
..: .. . .. .:.:::: : ::
CCDS11 GPVKAEPAHTAASVAAKNLALLKARSFDVTFDVGDEYEIIETIGNGAYGVVSSARRRLTG
20 30 40 50 60 70
50 60 70 80 90 100
pF1KB8 QKVAVKKLSRPFQSLIHARRTYRELRLLKHLKHENVIGLLDVFTPATSIEDFSEVYLVTT
:.::.::. :. . .:.:: :::..:::.::.:.:.. :.. :.. .:. ::.:
CCDS11 QQVAIKKIPNAFDVVTNAKRTLRELKILKHFKHDNIIAIKDILRPTVPYGEFKSVYVVLD
80 90 100 110 120 130
110 120 130 140 150 160
pF1KB8 LMGADLNNIVKC-QALSDEHVQFLVYQLLRGLKYIHSAGIIHRDLKPSNVAVNEDCELRI
:: .::..:.. : :. :::....:::::::::.::: .:::::::::. :::.:::.:
CCDS11 LMESDLHQIIHSSQPLTLEHVRYFLYQLLRGLKYMHSAQVIHRDLKPSNLLVNENCELKI
140 150 160 170 180 190
170 180 190 200 210
pF1KB8 LDFGLAR-----QADEE--MTGYVATRWYRAPEIMLNWMHYNQTVDIWSVGCIMAELLQG
:::.:: :... :: :::::::::::.::. .:.:..:.::::::..:.:
CCDS11 GDFGMARGLCTSPAEHQYFMTEYVATRWYRAPELMLSLHEYTQAIDLWSVGCIFGEMLAR
200 210 220 230 240 250
220 230 240 250 260 270
pF1KB8 KALFPGSDYIDQLKRIMEVVGTPSPEVLAKISSEHARTYIQSLPPMPQKDLSSIFRGANP
. ::::..:. ::. :: :.::::: :. ...:..:.::::::: ... ::.
CCDS11 RQLFPGKNYVHQLQLIMMVLGTPSPAVIQAVGAERVRAYIQSLPPRQPVPWETVYPGADR
260 270 280 290 300 310
280 290 300 310 320 330
pF1KB8 LAIDLLGRMLVLDSDQRVSAAEALAHAYFSQYHDPEDEPE-AEPYDESVEAKERTLEEWK
:..:::::: .. . :.::: :: : ....::::.:::. : :.: . . . : :. :
CCDS11 QALSLLGRMLRFEPSARISAAAALRHPFLAKYHDPDDEPDCAPPFDFAFDREALTRERIK
320 330 340 350 360 370
340 350 360
pF1KB8 ELTYQEVLSFKPPEPPKPPGSLEIEQ
: :. .:
CCDS11 EAIVAEIEDFHARREGIRQQIRFQPSLQPVASEPGCPDVEMPSPWAPSGDCAMESPPPAP
380 390 400 410 420 430
>>CCDS13795.1 MAPK1 gene_id:5594|Hs108|chr22 (360 aa)
initn: 918 init1: 490 opt: 1051 Z-score: 706.4 bits: 139.3 E(32554): 5e-33
Smith-Waterman score: 1051; 46.0% identity (73.3% similar) in 352 aa overlap (6-350:7-356)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MSGPRAGFYRQELNKTVWEVPQRLQGLRPVGSGAYGSVCSAYDARLRQKVAVKKLSRPF
:: . . :..: : .: .: :::: :::::: . .::.::.: ::
CCDS13 MAAAAAAGAGPEMVRGQVFDVGPRYTNLSYIGEGAYGMVCSAYDNVNKVRVAIKKIS-PF
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 QSLIHARRTYRELRLLKHLKHENVIGLLDVFTPATSIEDFSEVYLVTTLMGADLNNIVKC
. . .:: ::...: ...:::.::. :.. : .::....::.: :: .:: ...:
CCDS13 EHQTYCQRTLREIKILLRFRHENIIGINDIIR-APTIEQMKDVYIVQDLMETDLYKLLKT
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 QALSDEHVQFLVYQLLRGLKYIHSAGIIHRDLKPSNVAVNEDCELRILDFGLARQADEE-
: ::..:. ...::.::::::::::...::::::::. .: :.:.: :::::: :: .
CCDS13 QHLSNDHICYFLYQILRGLKYIHSANVLHRDLKPSNLLLNTTCDLKICDFGLARVADPDH
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 -----MTGYVATRWYRAPEIMLNWMHYNQTVDIWSVGCIMAELLQGKALFPGSDYIDQLK
.: ::::::::::::::: :....::::::::.::.:... .:::. :.:::.
CCDS13 DHTGFLTEYVATRWYRAPEIMLNSKGYTKSIDIWSVGCILAEMLSNRPIFPGKHYLDQLN
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 RIMEVVGTPSPEVLAKISSEHARTYIQSLPPMPQKDLSSIFRGANPLAIDLLGRMLVLDS
.:. ..:.:: : : : . .::.:. ::: . . .: .:. :.::: .::...
CCDS13 HILGILGSPSQEDLNCIINLKARNYLLSLPHKNKVPWNRLFPNADSKALDLLDKMLTFNP
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 DQRVSAAEALAHAYFSQYHDPEDEPEAE-PYDESVEAKERTLEEWKELTYQEVLSFKPPE
.:. . .:::: :. ::.:: ::: :: :. ..: . :. ::: ..:. :.:
CCDS13 HKRIEVEQALAHPYLEQYYDPSDEPIAEAPFKFDMELDDLPKEKLKELIFEETARFQPGY
300 310 320 330 340 350
360
pF1KB8 PPKPPGSLEIEQ
CCDS13 RS
360
>>CCDS42149.1 MAPK3 gene_id:5595|Hs108|chr16 (357 aa)
initn: 908 init1: 493 opt: 998 Z-score: 672.1 bits: 132.9 E(32554): 4.1e-31
Smith-Waterman score: 998; 47.4% identity (74.5% similar) in 321 aa overlap (18-332:36-354)
10 20 30 40
pF1KB8 MSGPRAGFYRQELNKTVWEVPQRLQGLRPVGSGAYGSVCSAYDARLR
..: : :. .: :::: : :::: .
CCDS42 AQGGGGGEPRRTEGVGPGVPGEVEMVKGQPFDVGPRYTQLQYIGEGAYGMVSSAYDHVRK
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB8 QKVAVKKLSRPFQSLIHARRTYRELRLLKHLKHENVIGLLDVFTPATSIEDFSEVYLVTT
.::.::.: ::. . .:: ::...: ...::::::. :.. :...: . .::.:
CCDS42 TRVAIKKIS-PFEHQTYCQRTLREIQILLRFRHENVIGIRDILR-ASTLEAMRDVYIVQD
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB8 LMGADLNNIVKCQALSDEHVQFLVYQLLRGLKYIHSAGIIHRDLKPSNVAVNEDCELRIL
:: .:: ...: : ::..:. ...::.::::::::::...::::::::. .: :.:.:
CCDS42 LMETDLYKLLKSQQLSNDHICYFLYQILRGLKYIHSANVLHRDLKPSNLLINTTCDLKIC
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KB8 DFGLARQADEE------MTGYVATRWYRAPEIMLNWMHYNQTVDIWSVGCIMAELLQGKA
:::::: :: : .: ::::::::::::::: :....::::::::.::.:...
CCDS42 DFGLARIADPEHDHTGFLTEYVATRWYRAPEIMLNSKGYTKSIDIWSVGCILAEMLSNRP
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KB8 LFPGSDYIDQLKRIMEVVGTPSPEVLAKISSEHARTYIQSLPPMPQKDLSSIFRGANPLA
.:::. :.:::..:. ..:.:: : : : . .::.:.:::: . ...: .. :
CCDS42 IFPGKHYLDQLNHILGILGSPSQEDLNCIINMKARNYLQSLPSKTKVAWAKLFPKSDSKA
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KB8 IDLLGRMLVLDSDQRVSAAEALAHAYFSQYHDPEDEPEAEPYDESVEAKERTLEEWKELT
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CCDS42 LDLLDRMLTFNPNKRITVEEALAHPYLEQYYDPTDEVGQSPAAVGLGAGEQGGT
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pF1KB8 YQEVLSFKPPEPPKPPGSLEIEQ
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]