Result of FASTA (ccds) for
pF1KB8466
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8466, 418 aa
1>>>pF1KB8466 418 - 418 aa - 418 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.1057+/-0.000796; mu= 9.8456+/- 0.048
mean_var=144.4634+/-31.379, 0's: 0 Z-trim(113.0): 300 B-trim: 1544 in 2/49
Lambda= 0.106708
statistics sampled from 13283 (13687) to 13283 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.75), E-opt: 0.2 (0.42), width: 16
Scan time: 3.550
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS13944.1 SSTR3 gene_id:6753|Hs108|chr22 ( 418) 2787 440.4 1.5e-123
CCDS10429.1 SSTR5 gene_id:6755|Hs108|chr16 ( 364) 1322 214.8 1e-55
CCDS11691.1 SSTR2 gene_id:6752|Hs108|chr17 ( 369) 1192 194.8 1.1e-49
CCDS42856.1 SSTR4 gene_id:6754|Hs108|chr20 ( 388) 1051 173.2 4e-43
CCDS9666.1 SSTR1 gene_id:6751|Hs108|chr14 ( 391) 1049 172.8 4.9e-43
CCDS6151.1 NPBWR1 gene_id:2831|Hs108|chr8 ( 328) 812 136.3 4.2e-32
CCDS329.1 OPRD1 gene_id:4985|Hs108|chr1 ( 372) 800 134.5 1.6e-31
CCDS13557.1 NPBWR2 gene_id:2832|Hs108|chr20 ( 333) 791 133.1 4e-31
CCDS13556.1 OPRL1 gene_id:4987|Hs108|chr20 ( 370) 787 132.5 6.6e-31
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CCDS47508.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 392) 776 130.8 2.2e-30
CCDS47505.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 397) 776 130.8 2.2e-30
CCDS55070.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 400) 776 130.8 2.3e-30
CCDS47506.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 403) 776 130.8 2.3e-30
CCDS47504.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 406) 776 130.8 2.3e-30
CCDS43517.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 418) 776 130.8 2.3e-30
CCDS47507.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 420) 776 130.8 2.3e-30
CCDS43518.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 446) 776 130.9 2.4e-30
CCDS47503.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 493) 776 130.9 2.6e-30
CCDS6152.1 OPRK1 gene_id:4986|Hs108|chr8 ( 380) 769 129.7 4.6e-30
CCDS55068.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 319) 664 113.5 2.9e-25
CCDS14004.1 MCHR1 gene_id:2847|Hs108|chr22 ( 422) 659 112.8 6.2e-25
CCDS55071.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 300) 654 111.9 8.2e-25
CCDS64895.1 OPRK1 gene_id:4986|Hs108|chr8 ( 291) 630 108.2 1e-23
CCDS5044.1 MCHR2 gene_id:84539|Hs108|chr6 ( 340) 599 103.5 3.2e-22
CCDS12012.1 GALR1 gene_id:2587|Hs108|chr18 ( 349) 583 101.1 1.8e-21
CCDS11739.1 GALR2 gene_id:8811|Hs108|chr17 ( 387) 577 100.2 3.7e-21
CCDS3137.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 359) 565 98.3 1.2e-20
CCDS82855.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 388) 565 98.3 1.3e-20
CCDS82854.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 394) 565 98.3 1.3e-20
CCDS14569.1 AGTR2 gene_id:186|Hs108|chrX ( 363) 561 97.7 1.9e-20
CCDS13958.1 GALR3 gene_id:8484|Hs108|chr22 ( 368) 552 96.3 5.1e-20
CCDS12049.1 KISS1R gene_id:84634|Hs108|chr19 ( 398) 522 91.7 1.3e-18
CCDS11810.1 UTS2R gene_id:2837|Hs108|chr17 ( 389) 515 90.6 2.7e-18
CCDS8402.1 CXCR5 gene_id:643|Hs108|chr11 ( 372) 507 89.4 6.2e-18
CCDS7606.1 PRLHR gene_id:2834|Hs108|chr10 ( 370) 499 88.2 1.5e-17
CCDS5298.1 CCR6 gene_id:1235|Hs108|chr6 ( 374) 492 87.1 3.1e-17
CCDS2516.1 ACKR3 gene_id:57007|Hs108|chr2 ( 362) 488 86.5 4.6e-17
CCDS2733.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3 ( 357) 481 85.4 9.7e-17
CCDS2732.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3 ( 369) 481 85.4 9.9e-17
CCDS9943.1 BDKRB1 gene_id:623|Hs108|chr14 ( 353) 478 84.9 1.3e-16
CCDS8219.1 P2RY2 gene_id:5029|Hs108|chr11 ( 377) 477 84.8 1.5e-16
CCDS2684.1 CCR8 gene_id:1237|Hs108|chr3 ( 355) 474 84.3 2e-16
CCDS41829.1 CMKLR1 gene_id:1240|Hs108|chr12 ( 371) 472 84.0 2.6e-16
CCDS44965.1 CMKLR1 gene_id:1240|Hs108|chr12 ( 373) 472 84.0 2.6e-16
CCDS2737.1 CCR1 gene_id:1230|Hs108|chr3 ( 355) 471 83.8 2.8e-16
CCDS3664.1 TACR3 gene_id:6870|Hs108|chr4 ( 465) 470 83.8 3.8e-16
CCDS2408.1 CXCR2 gene_id:3579|Hs108|chr2 ( 360) 468 83.4 3.9e-16
CCDS7950.1 APLNR gene_id:187|Hs108|chr11 ( 380) 468 83.4 4.1e-16
CCDS2706.1 ACKR2 gene_id:1238|Hs108|chr3 ( 384) 466 83.1 5.1e-16
>>CCDS13944.1 SSTR3 gene_id:6753|Hs108|chr22 (418 aa)
initn: 2787 init1: 2787 opt: 2787 Z-score: 2331.7 bits: 440.4 E(32554): 1.5e-123
Smith-Waterman score: 2787; 100.0% identity (100.0% similar) in 418 aa overlap (1-418:1-418)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MDMLHPSSVSTTSEPENASSAWPPDATLGNVSAGPSPAGLAVSGVLIPLVYLVVCVVGLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 MDMLHPSSVSTTSEPENASSAWPPDATLGNVSAGPSPAGLAVSGVLIPLVYLVVCVVGLL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 GNSLVIYVVLRHTASPSVTNVYILNLALADELFMLGLPFLAAQNALSYWPFGSLMCRLVM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 GNSLVIYVVLRHTASPSVTNVYILNLALADELFMLGLPFLAAQNALSYWPFGSLMCRLVM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 AVDGINQFTSIFCLTVMSVDRYLAVVHPTRSARWRTAPVARTVSAAVWVASAVVVLPVVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 AVDGINQFTSIFCLTVMSVDRYLAVVHPTRSARWRTAPVARTVSAAVWVASAVVVLPVVV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 FSGVPRGMSTCHMQWPEPAAAWRAGFIIYTAALGFFGPLLVICLCYLLIVVKVRSAGRRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 FSGVPRGMSTCHMQWPEPAAAWRAGFIIYTAALGFFGPLLVICLCYLLIVVKVRSAGRRV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 WAPSCQRRRRSERRVTRMVVAVVALFVLCWMPFYVLNIVNVVCPLPEEPAFFGLYFLVVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 WAPSCQRRRRSERRVTRMVVAVVALFVLCWMPFYVLNIVNVVCPLPEEPAFFGLYFLVVA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 LPYANSCANPILYGFLSYRFKQGFRRVLLRPSRRVRSQEPTVGPPEKTEEEDEEEEDGEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 LPYANSCANPILYGFLSYRFKQGFRRVLLRPSRRVRSQEPTVGPPEKTEEEDEEEEDGEE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410
pF1KB8 SREGGKGKEMNGRVSQITQPGTSGQERPPSRVASKEQQLLPQEASTGEKSSTMRISYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 SREGGKGKEMNGRVSQITQPGTSGQERPPSRVASKEQQLLPQEASTGEKSSTMRISYL
370 380 390 400 410
>>CCDS10429.1 SSTR5 gene_id:6755|Hs108|chr16 (364 aa)
initn: 1018 init1: 656 opt: 1322 Z-score: 1113.6 bits: 214.8 E(32554): 1e-55
Smith-Waterman score: 1322; 56.6% identity (79.1% similar) in 369 aa overlap (1-365:1-357)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MDMLHPSSVSTTSEPENASSAWPPDATLGNVS---AGPSPAGLAVSGVLIPLVYLVVCVV
:. : :.:. . :::: : :. :. . .::.:.. : .::.:..::.::..
CCDS10 MEPLFPASTPSW----NASS--PGAASGGGDNRTLVGPAPSAGA-RAVLVPVLYLLVCAA
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 GLLGNSLVIYVVLRHTASPSVTNVYILNLALADELFMLGLPFLAAQNALSYWPFGSLMCR
:: ::.:::::::: . .:::.::::::.:: :.::::::::.::: :.:::: ..::
CCDS10 GLGGNTLVIYVVLRFAKMKTVTNIYILNLAVADVLYMLGLPFLATQNAASFWPFGPVLCR
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 LVMAVDGINQFTSIFCLTVMSVDRYLAVVHPTRSARWRTAPVARTVSAAVWVASAVVVLP
:::..::.:::::.::::::::::::::::: ::::: ::. .:::.:: : . ::
CCDS10 LVMTLDGVNQFTSVFCLTVMSVDRYLAVVHPLSSARWRRPRVAKLASAAAWVLSLCMSLP
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 VVVFSGVPRGMSTCHMQWPEPAAAWRAGFIIYTAALGFFGPLLVICLCYLLIVVKVRSAG
..::. : .: .::. .::::.. : : ::::::.::::.:::::::::::::::::.::
CCDS10 LLVFADVQEG-GTCNASWPEPVGLWGAVFIIYTAVLGFFAPLLVICLCYLLIVVKVRAAG
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 RRVWAPSCQRRRRSERRVTRMVVAVVALFVLCWMPFYVLNIVNVVCPLPEEPAFFGLYFL
:: .: ::: :::.:::::..:: .:. ::.::...::::.. ::.::: ::::.
CCDS10 VRV---GCVRRR-SERKVTRMVLVVVLVFAGCWLPFFTVNIVNLAVALPQEPASAGLYFF
240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 VVALPYANSCANPILYGFLSYRFKQGFRRVL-LRPSRRVRSQEPTVGPPEKTEEEDEEEE
:: : ::::::::.:::::: :.:.:..:: :: . ... . : :.. ....:
CCDS10 VVILSYANSCANPVLYGFLSDNFRQSFQKVLCLRKGSGAKDADATEPRPDRIRQQQEATP
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KB8 DGEESREGGKGKEMNGRVSQITQPGTSGQERPPSRVASKEQQLLPQEASTGEKSSTMRIS
.... .:
CCDS10 PAHRAAANGLMQTSKL
350 360
>>CCDS11691.1 SSTR2 gene_id:6752|Hs108|chr17 (369 aa)
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Smith-Waterman score: 1192; 53.2% identity (78.8% similar) in 325 aa overlap (14-328:6-327)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MDMLHPSSVSTTSEPENASSAW---PPDATLGNVSAGPS----PAGLAVSGVLIPLVYLV
:: :.: .: : : . . ::.. : : .:.... ..:.:
CCDS11 MDMADEPLNGSHTWLSIPFDLNGSVVSTNTSNQTEPYYDLTSNAVLTFIYFV
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 VCVVGLLGNSLVIYVVLRHTASPSVTNVYILNLALADELFMLGLPFLAAQNALSYWPFGS
::..:: ::.:::::.::.. ..::.::::::.::::::::::::: : :: .::::.
CCDS11 VCIIGLCGNTLVIYVILRYAKMKTITNIYILNLAIADELFMLGLPFLAMQVALVHWPFGK
60 70 80 90 100 110
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pF1KB8 LMCRLVMAVDGINQFTSIFCLTVMSVDRYLAVVHPTRSARWRTAPVARTVSAAVWVASAV
.::.::.:::::::::::::::::.::::::::: .::.:: .:. .. ::: .: .
CCDS11 AICRVVMTVDGINQFTSIFCLTVMSIDRYLAVVHPIKSAKWRRPRTAKMITMAVWGVSLL
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180 190 200 210 220 230
pF1KB8 VVLPVVVFSGVPR---GMSTCHMQWPEPAAAWRAGFIIYTAALGFFGPLLVICLCYLLIV
:.::.....:. : :.: ..:: ..:: .:::::: :::. :: .::::::.:.
CCDS11 VILPIMIYAGLRSNQWGRSSCTINWPGESGAWYTGFIIYTFILGFLVPLTIICLCYLFII
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 VKVRSAGRRVWAPSCQRRRRSERRVTRMVVAVVALFVLCWMPFYVLNIVNVVCPLPEEPA
.::.:.: :: . ..:..::..::::: :::.:..::.:::..:. .: . ::
CCDS11 IKVKSSGIRV---GSSKRKKSEKKVTRMVSIVVAVFIFCWLPFYIFNVSSVSMAISPTPA
240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 FFGLYFLVVALPYANSCANPILYGFLSYRFKQGFRRVLLRPSRRVRSQEPTVGPPEKTEE
. :.. .::.: :::::::::::.::: ::..:. ::
CCDS11 LKGMFDFVVVLTYANSCANPILYAFLSDNFKKSFQNVLCLVKVSGTDDGERSDSKQDKSR
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KB8 EDEEEEDGEESREGGKGKEMNGRVSQITQPGTSGQERPPSRVASKEQQLLPQEASTGEKS
CCDS11 LNETTETQRTLLNGDLQTSI
350 360
>>CCDS42856.1 SSTR4 gene_id:6754|Hs108|chr20 (388 aa)
initn: 940 init1: 577 opt: 1051 Z-score: 887.8 bits: 173.2 E(32554): 4e-43
Smith-Waterman score: 1060; 50.1% identity (75.4% similar) in 341 aa overlap (3-328:1-326)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MDMLHPSSVSTTSEPENASSAWPPDATLGNVSAGPSPAGLAVSG---------VLIPLVY
: ::.. .: :. ..::: : :.:..:. : ::.: : : .:
CCDS42 MSAPSTLPPGGE-EGLGTAWPSAA---NASSAPAEAEEAVAGPGDARAAGMVAIQCIY
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 LVVCVVGLLGNSLVIYVVLRHTASPSVTNVYILNLALADELFMLGLPFLAAQNALSYWPF
.::.:::.::.:::.:.::.. ..::.:.::::.:::::::..::.:.. :: .:::
CCDS42 ALVCLVGLVGNALVIFVILRYAKMKTATNIYLLNLAVADELFMLSVPFVASSAALRHWPF
60 70 80 90 100 110
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pF1KB8 GSLMCRLVMAVDGINQFTSIFCLTVMSVDRYLAVVHPTRSARWRTAPVARTVSAAVWVAS
::..:: :..:::.:.:::.:::::.:::::.::::: :.: .: ::. .. .::.::
CCDS42 GSVLCRAVLSVDGLNMFTSVFCLTVLSVDRYVAVVHPLRAATYRRPSVAKLINLGVWLAS
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220
pF1KB8 AVVVLPVVVFSGV-P-RGMST--CHMQWPEPAAAWRAGFIIYTAALGFFGPLLVICLCYL
.:.::...:. . : :: .. :..:::.: :: : :..:: :::. :.:.: ::::
CCDS42 LLVTLPIAIFADTRPARGGQAVACNLQWPHP--AWSAVFVVYTFLLGFLLPVLAIGLCYL
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB8 LIVVKVRSAGRRV-WAPSCQRRRRSERRVTRMVVAVVALFVLCWMPFYVLNIVNV-VCPL
::: :.:... :. : :.:::::...::.:. ::..::::::::::....:. : :
CCDS42 LIVGKMRAVALRAGW----QQRRRSEKKITRLVLMVVVVFVLCWMPFYVVQLLNLFVTSL
240 250 260 270 280
290 300 310 320 330 340
pF1KB8 PEEPAFFGLYFLVVALPYANSCANPILYGFLSYRFKQGFRRVLLRPSRRVRSQEPTVGPP
.: : ::::::::::::::: :.. :.:::
CCDS42 DATVNHVSLI-----LSYANSCANPILYGFLSDNFRRFFQRVLCLRCCLLEGAGGAEEEP
290 300 310 320 330 340
350 360 370 380 390 400
pF1KB8 EKTEEEDEEEEDGEESREGGKGKEMNGRVSQITQPGTSGQERPPSRVASKEQQLLPQEAS
CCDS42 LDYYATALKSKGGAGCMCPPLPCQQEALQPEPGRKRIPLTRTTTF
350 360 370 380
>>CCDS9666.1 SSTR1 gene_id:6751|Hs108|chr14 (391 aa)
initn: 859 init1: 723 opt: 1049 Z-score: 886.0 bits: 172.8 E(32554): 4.9e-43
Smith-Waterman score: 1049; 49.5% identity (76.0% similar) in 329 aa overlap (43-365:57-377)
20 30 40 50 60 70
pF1KB8 SEPENASSAWPPDATLGNVSAGPSPAGLAVSGVLIPLVYLVVCVVGLLGNSLVIYVVLRH
:..:: ..: :::.::: :::.::::.::.
CCDS96 SRGPGAGAADGMEEPGRNASQNGTLSEGQGSAILISFIYSVVCLVGLCGNSMVIYVILRY
30 40 50 60 70 80
80 90 100 110 120 130
pF1KB8 TASPSVTNVYILNLALADELFMLGLPFLAAQNALSYWPFGSLMCRLVMAVDGINQFTSIF
. ..::.::::::.::::.::..:::.... : .::::.:.::::..::..:.::::.
CCDS96 AKMKTATNIYILNLAIADELLMLSVPFLVTSTLLRHWPFGALLCRLVLSVDAVNMFTSIY
90 100 110 120 130 140
140 150 160 170 180
pF1KB8 CLTVMSVDRYLAVVHPTRSARWRTAPVARTVSAAVWVASAVVVLPVVVFSGVPR---GMS
::::.:::::.::::: ..::.: ::..:. .::: : .:.::.:::: . :
CCDS96 CLTVLSVDRYVAVVHPIKAARYRRPTVAKVVNLGVWVLSLLVILPIVVFSRTAANSDGTV
150 160 170 180 190 200
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 TCHMQWPEPAAAWRAGFIIYTAALGFFGPLLVICLCYLLIVVKVRSAGRRV-WAPSCQRR
.:.: :::: : .::..:: .::. :. .:::::.::..:.: .. .. : :.:
CCDS96 ACNMLMPEPAQRWLVGFVLYTFLMGFLLPVGAICLCYVLIIAKMRMVALKAGW----QQR
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CCDS96 FRNGTCTSRITTL
380 390
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.....: ::::: ::.::.::. :....:...
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CCDS32 ERVTACTPSDGPGGGAAA
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CCDS55 SNIEQQNSTRIRQNTRDHPSTANTVDRTNHQS
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418 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 13:11:13 2016 done: Fri Nov 4 13:11:14 2016
Total Scan time: 3.550 Total Display time: 0.040
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]