Result of FASTA (ccds) for
pF1KB8471
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8471, 912 aa
1>>>pF1KB8471 912 - 912 aa - 912 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.4737+/-0.000861; mu= 14.2169+/- 0.052
mean_var=184.6280+/-36.629, 0's: 0 Z-trim(113.8): 27 B-trim: 159 in 1/52
Lambda= 0.094390
statistics sampled from 14368 (14392) to 14368 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.759), E-opt: 0.2 (0.442), width: 16
Scan time: 5.020
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS33157.1 DNMT3A gene_id:1788|Hs108|chr2 ( 912) 6390 883.0 0
CCDS1718.2 DNMT3A gene_id:1788|Hs108|chr2 ( 723) 4928 683.8 3.1e-196
CCDS13205.1 DNMT3B gene_id:1789|Hs108|chr20 ( 853) 2711 381.9 2.7e-105
CCDS13206.1 DNMT3B gene_id:1789|Hs108|chr20 ( 833) 2391 338.4 3.4e-92
CCDS13204.1 DNMT3B gene_id:1789|Hs108|chr20 ( 845) 2391 338.4 3.5e-92
CCDS56184.1 DNMT3B gene_id:1789|Hs108|chr20 ( 694) 1788 256.2 1.6e-67
CCDS56183.1 DNMT3B gene_id:1789|Hs108|chr20 ( 728) 1788 256.2 1.6e-67
CCDS13207.1 DNMT3B gene_id:1789|Hs108|chr20 ( 770) 1788 256.2 1.7e-67
CCDS46232.1 DNMT3A gene_id:1788|Hs108|chr2 ( 166) 1023 151.4 1.3e-36
CCDS46650.1 DNMT3L gene_id:29947|Hs108|chr21 ( 386) 650 101.0 4.7e-21
CCDS13705.1 DNMT3L gene_id:29947|Hs108|chr21 ( 387) 650 101.0 4.7e-21
>>CCDS33157.1 DNMT3A gene_id:1788|Hs108|chr2 (912 aa)
initn: 6390 init1: 6390 opt: 6390 Z-score: 4711.2 bits: 883.0 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6390; 100.0% identity (100.0% similar) in 912 aa overlap (1-912:1-912)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MPAMPSSGPGDTSSSAAEREEDRKDGEEQEEPRGKEERQEPSTTARKVGRPGRKRKHPPV
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CCDS33 MPAMPSSGPGDTSSSAAEREEDRKDGEEQEEPRGKEERQEPSTTARKVGRPGRKRKHPPV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 ESGDTPKDPAVISKSPSMAQDSGASELLPNGDLEKRSEPQPEEGSPAGGQKGGAPAEGEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 ESGDTPKDPAVISKSPSMAQDSGASELLPNGDLEKRSEPQPEEGSPAGGQKGGAPAEGEG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 AAETLPEASRAVENGCCTPKEGRGAPAEAGKEQKETNIESMKMEGSRGRLRGGLGWESSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 AAETLPEASRAVENGCCTPKEGRGAPAEAGKEQKETNIESMKMEGSRGRLRGGLGWESSL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 RQRPMPRLTFQAGDPYYISKRKRDEWLARWKREAEKKAKVIAGMNAVEENQGPGESQKVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 RQRPMPRLTFQAGDPYYISKRKRDEWLARWKREAEKKAKVIAGMNAVEENQGPGESQKVE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 EASPPAVQQPTDPASPTVATTPEPVGSDAGDKNATKAGDDEPEYEDGRGFGIGELVWGKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 EASPPAVQQPTDPASPTVATTPEPVGSDAGDKNATKAGDDEPEYEDGRGFGIGELVWGKL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 RGFSWWPGRIVSWWMTGRSRAAEGTRWVMWFGDGKFSVVCVEKLMPLSSFCSAFHQATYN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 RGFSWWPGRIVSWWMTGRSRAAEGTRWVMWFGDGKFSVVCVEKLMPLSSFCSAFHQATYN
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 KQPMYRKAIYEVLQVASSRAGKLFPVCHDSDESDTAKAVEVQNKPMIEWALGGFQPSGPK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 KQPMYRKAIYEVLQVASSRAGKLFPVCHDSDESDTAKAVEVQNKPMIEWALGGFQPSGPK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 GLEPPEEEKNPYKEVYTDMWVEPEAAAYAPPPPAKKPRKSTAEKPKVKEIIDERTRERLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 GLEPPEEEKNPYKEVYTDMWVEPEAAAYAPPPPAKKPRKSTAEKPKVKEIIDERTRERLV
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB8 YEVRQKCRNIEDICISCGSLNVTLEHPLFVGGMCQNCKNCFLECAYQYDDDGYQSYCTIC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 YEVRQKCRNIEDICISCGSLNVTLEHPLFVGGMCQNCKNCFLECAYQYDDDGYQSYCTIC
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB8 CGGREVLMCGNNNCCRCFCVECVDLLVGPGAAQAAIKEDPWNCYMCGHKGTYGLLRRRED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 CGGREVLMCGNNNCCRCFCVECVDLLVGPGAAQAAIKEDPWNCYMCGHKGTYGLLRRRED
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB8 WPSRLQMFFANNHDQEFDPPKVYPPVPAEKRKPIRVLSLFDGIATGLLVLKDLGIQVDRY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 WPSRLQMFFANNHDQEFDPPKVYPPVPAEKRKPIRVLSLFDGIATGLLVLKDLGIQVDRY
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB8 IASEVCEDSITVGMVRHQGKIMYVGDVRSVTQKHIQEWGPFDLVIGGSPCNDLSIVNPAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 IASEVCEDSITVGMVRHQGKIMYVGDVRSVTQKHIQEWGPFDLVIGGSPCNDLSIVNPAR
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB8 KGLYEGTGRLFFEFYRLLHDARPKEGDDRPFFWLFENVVAMGVSDKRDISRFLESNPVMI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 KGLYEGTGRLFFEFYRLLHDARPKEGDDRPFFWLFENVVAMGVSDKRDISRFLESNPVMI
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB8 DAKEVSAAHRARYFWGNLPGMNRPLASTVNDKLELQECLEHGRIAKFSKVRTITTRSNSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 DAKEVSAAHRARYFWGNLPGMNRPLASTVNDKLELQECLEHGRIAKFSKVRTITTRSNSI
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB8 KQGKDQHFPVFMNEKEDILWCTEMERVFGFPVHYTDVSNMSRLARQRLLGRSWSVPVIRH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 KQGKDQHFPVFMNEKEDILWCTEMERVFGFPVHYTDVSNMSRLARQRLLGRSWSVPVIRH
850 860 870 880 890 900
910
pF1KB8 LFAPLKEYFACV
::::::::::::
CCDS33 LFAPLKEYFACV
910
>>CCDS1718.2 DNMT3A gene_id:1788|Hs108|chr2 (723 aa)
initn: 4928 init1: 4928 opt: 4928 Z-score: 3636.5 bits: 683.8 E(32554): 3.1e-196
Smith-Waterman score: 4928; 100.0% identity (100.0% similar) in 699 aa overlap (214-912:25-723)
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 PMPRLTFQAGDPYYISKRKRDEWLARWKREAEKKAKVIAGMNAVEENQGPGESQKVEEAS
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 MGILERVVRRNGRVDRSLKDECDTAEKKAKVIAGMNAVEENQGPGESQKVEEAS
10 20 30 40 50
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 PPAVQQPTDPASPTVATTPEPVGSDAGDKNATKAGDDEPEYEDGRGFGIGELVWGKLRGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 PPAVQQPTDPASPTVATTPEPVGSDAGDKNATKAGDDEPEYEDGRGFGIGELVWGKLRGF
60 70 80 90 100 110
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 SWWPGRIVSWWMTGRSRAAEGTRWVMWFGDGKFSVVCVEKLMPLSSFCSAFHQATYNKQP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 SWWPGRIVSWWMTGRSRAAEGTRWVMWFGDGKFSVVCVEKLMPLSSFCSAFHQATYNKQP
120 130 140 150 160 170
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 MYRKAIYEVLQVASSRAGKLFPVCHDSDESDTAKAVEVQNKPMIEWALGGFQPSGPKGLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 MYRKAIYEVLQVASSRAGKLFPVCHDSDESDTAKAVEVQNKPMIEWALGGFQPSGPKGLE
180 190 200 210 220 230
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 PPEEEKNPYKEVYTDMWVEPEAAAYAPPPPAKKPRKSTAEKPKVKEIIDERTRERLVYEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 PPEEEKNPYKEVYTDMWVEPEAAAYAPPPPAKKPRKSTAEKPKVKEIIDERTRERLVYEV
240 250 260 270 280 290
490 500 510 520 530 540
pF1KB8 RQKCRNIEDICISCGSLNVTLEHPLFVGGMCQNCKNCFLECAYQYDDDGYQSYCTICCGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 RQKCRNIEDICISCGSLNVTLEHPLFVGGMCQNCKNCFLECAYQYDDDGYQSYCTICCGG
300 310 320 330 340 350
550 560 570 580 590 600
pF1KB8 REVLMCGNNNCCRCFCVECVDLLVGPGAAQAAIKEDPWNCYMCGHKGTYGLLRRREDWPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 REVLMCGNNNCCRCFCVECVDLLVGPGAAQAAIKEDPWNCYMCGHKGTYGLLRRREDWPS
360 370 380 390 400 410
610 620 630 640 650 660
pF1KB8 RLQMFFANNHDQEFDPPKVYPPVPAEKRKPIRVLSLFDGIATGLLVLKDLGIQVDRYIAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 RLQMFFANNHDQEFDPPKVYPPVPAEKRKPIRVLSLFDGIATGLLVLKDLGIQVDRYIAS
420 430 440 450 460 470
670 680 690 700 710 720
pF1KB8 EVCEDSITVGMVRHQGKIMYVGDVRSVTQKHIQEWGPFDLVIGGSPCNDLSIVNPARKGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 EVCEDSITVGMVRHQGKIMYVGDVRSVTQKHIQEWGPFDLVIGGSPCNDLSIVNPARKGL
480 490 500 510 520 530
730 740 750 760 770 780
pF1KB8 YEGTGRLFFEFYRLLHDARPKEGDDRPFFWLFENVVAMGVSDKRDISRFLESNPVMIDAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 YEGTGRLFFEFYRLLHDARPKEGDDRPFFWLFENVVAMGVSDKRDISRFLESNPVMIDAK
540 550 560 570 580 590
790 800 810 820 830 840
pF1KB8 EVSAAHRARYFWGNLPGMNRPLASTVNDKLELQECLEHGRIAKFSKVRTITTRSNSIKQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 EVSAAHRARYFWGNLPGMNRPLASTVNDKLELQECLEHGRIAKFSKVRTITTRSNSIKQG
600 610 620 630 640 650
850 860 870 880 890 900
pF1KB8 KDQHFPVFMNEKEDILWCTEMERVFGFPVHYTDVSNMSRLARQRLLGRSWSVPVIRHLFA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 KDQHFPVFMNEKEDILWCTEMERVFGFPVHYTDVSNMSRLARQRLLGRSWSVPVIRHLFA
660 670 680 690 700 710
910
pF1KB8 PLKEYFACV
:::::::::
CCDS17 PLKEYFACV
720
>>CCDS13205.1 DNMT3B gene_id:1789|Hs108|chr20 (853 aa)
initn: 2812 init1: 2281 opt: 2711 Z-score: 2004.0 bits: 381.9 E(32554): 2.7e-105
Smith-Waterman score: 2802; 51.0% identity (71.9% similar) in 861 aa overlap (80-911:12-852)
50 60 70 80 90 100
pF1KB8 RPGRKRKHPPVESGDTPKDPAVISKSPSMAQDSGASE--LLPNGDLEKRSEPQPE--EG-
.:.:. : .: :: .: .: :.
CCDS13 MKGDTRHLNGEEDAGGREDSILVNGACSDQSSDSPPILEAI
10 20 30 40
110 120 130 140 150 160
pF1KB8 -SPA-GGQKGGAPAEGEGAAETLPEASRAVENGCCTPKEGRGAPAEAGKEQKETNIESMK
.: :..... . .. : .. . .: .: .:. : .:: .:
CCDS13 RTPEIRGRRSSSRLSKREVSSLLSYTQDLTGDGDGEDGDGSDTPV-MPKLFRETRTRS--
50 60 70 80 90
170 180 190 200 210 220
pF1KB8 MEGSRGRLRGGLGWESSLRQRPMPRLTFQAGDPYYISKRKRDEWLARWKREAEKKAKVIA
:. : :.. . : :.:: :: : .... :. : : ...: . :
CCDS13 -ESPAVRTRNNNSVSSRERHRPSPRSTRGRQGRNHVDESPV-EFPAT--RSLRRRATASA
100 110 120 130 140 150
230 240 250 260 270
pF1KB8 GMNAVEENQGPGESQKVE--EASPPAVQQPTDPASP--TVATTPEPVGSDAGDKNATKAG
: . . :. .. . . . : . ..: .: . : .. . .: ..
CCDS13 G---TPWPSPPSSYLTIDLTDDTEDTHGTPQSSSTPYARLAQDSQQGGMESPQVEADSGD
160 170 180 190 200 210
280 290 300 310 320 330
pF1KB8 DDEPEYEDGRGFGIGELVWGKLRGFSWWPGRIVSWWMTGRSRAAEGTRWVMWFGDGKFSV
: ::.::. ::::.:::::..::::::. .::: :.. .: : :::.::::::::
CCDS13 GDSSEYQDGKEFGIGDLVWGKIKGFSWWPAMVVSWKATSKRQAMSGMRWVQWFGDGKFSE
220 230 240 250 260 270
340 350 360 370 380 390
pF1KB8 VCVEKLMPLSSFCSAFHQATYNKQPMYRKAIYEVLQVASSRAGKLFPVCHDSDESDTAKA
: ..::. :. : . :. ::.:: ::::.:..:. : :::: :: :. .:.
CCDS13 VSADKLVALGLFSQHFNLATFNKLVSYRKAMYHALEKARVRAGKTFP----SSPGDS---
280 290 300 310 320
400 410 420 430 440
pF1KB8 VEVQNKPMIEWALGGFQPSGPKGLEP----PEEEKNPYK------------EVYTDMWVE
.: : :::.::: :::.:.: .::.: : .:. . : : .
CCDS13 LEDQLKPMLEWAHGGFKPTGIEGLKPNNTQPVVNKSKVRRAGSRKLESRKYENKTRRRTA
330 340 350 360 370 380
450 460 470 480 490 500
pF1KB8 PEAAA--YAPPPPAKKPRKSTAEKPKVKEIIDERTRERLVYEVRQKCRNIEDICISCGSL
..:. : : : : . : . : ...::... .: .. ..:: :.:::
CCDS13 DDSATSDYCPAPKRLKTNCYNNGKDRGDE---DQSREQMASDVANNKSSLEDGCLSCGRK
390 400 410 420 430 440
510 520 530 540 550 560
pF1KB8 NVTLEHPLFVGGMCQNCKNCFLECAYQYDDDGYQSYCTICCGGREVLMCGNNNCCRCFCV
: . :::: ::.::.:.. ::: :.:::::::::::.:: :::.:.:.:..:::::::
CCDS13 NPVSFHPLFEGGLCQTCRDRFLELFYMYDDDGYQSYCTVCCEGRELLLCSNTSCCRCFCV
450 460 470 480 490 500
570 580 590 600 610 620
pF1KB8 ECVDLLVGPGAAQAAIKEDPWNCYMCGHKGTYGLLRRREDWPSRLQMFFANNHDQEFDPP
::...::: :.: : ..::.:::: . .:.::::.:: ::: ::... :.. :
CCDS13 ECLEVLVGTGTAAEAKLQEPWSCYMCLPQRCHGVLRRRKDWNVRLQAFFTSDTGLEYEAP
510 520 530 540 550 560
630 640 650 660 670 680
pF1KB8 KVYPPVPAEKRKPIRVLSLFDGIATGLLVLKDLGIQVDRYIASEVCEDSITVGMVRHQGK
:.:: .:: .:.:::::::::::::: ::::.:::.: .:.::::::.::.:: :.:.:.
CCDS13 KLYPAIPAARRRPIRVLSLFDGIATGYLVLKELGIKVGKYVASEVCEESIAVGTVKHEGN
570 580 590 600 610 620
690 700 710 720 730 740
pF1KB8 IMYVGDVRSVTQKHIQEWGPFDLVIGGSPCNDLSIVNPARKGLYEGTGRLFFEFYRLLHD
: ::.:::..:.:.:.:::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::.::.
CCDS13 IKYVNDVRNITKKNIEEWGPFDLVIGGSPCNDLSNVNPARKGLYEGTGRLFFEFYHLLNY
630 640 650 660 670 680
750 760 770 780 790 800
pF1KB8 ARPKEGDDRPFFWLFENVVAMGVSDKRDISRFLESNPVMIDAKEVSAAHRARYFWGNLPG
.::::::::::::.::::::: :.:::::::::: ::::::: .::::::::::::::::
CCDS13 SRPKEGDDRPFFWMFENVVAMKVGDKRDISRFLECNPVMIDAIKVSAAHRARYFWGNLPG
690 700 710 720 730 740
810 820 830 840 850 860
pF1KB8 MNRPLASTVNDKLELQECLEHGRIAKFSKVRTITTRSNSIKQGKDQHFPVFMNEKEDILW
::::. .. :::::::.:::..::::..::.::::.::::::::.: ::: :: :::.::
CCDS13 MNRPVIASKNDKLELQDCLEYNRIAKLKKVQTITTKSNSIKQGKNQLFPVVMNGKEDVLW
750 760 770 780 790 800
870 880 890 900 910
pF1KB8 CTEMERVFGFPVHYTDVSNMSRLARQRLLGRSWSVPVIRHLFAPLKEYFACV
:::.::.:::::::::::::.: :::.:::::::::::::::::::.::::
CCDS13 CTELERIFGFPVHYTDVSNMGRGARQKLLGRSWSVPVIRHLFAPLKDYFACE
810 820 830 840 850
>>CCDS13206.1 DNMT3B gene_id:1789|Hs108|chr20 (833 aa)
initn: 2711 init1: 2281 opt: 2391 Z-score: 1768.6 bits: 338.4 E(32554): 3.4e-92
Smith-Waterman score: 2832; 51.6% identity (73.2% similar) in 843 aa overlap (80-911:12-832)
50 60 70 80 90 100
pF1KB8 RPGRKRKHPPVESGDTPKDPAVISKSPSMAQDSGASE--LLPNGDLEKRSEPQPE--EG-
.:.:. : .: :: .: .: :.
CCDS13 MKGDTRHLNGEEDAGGREDSILVNGACSDQSSDSPPILEAI
10 20 30 40
110 120 130 140 150 160
pF1KB8 -SPA-GGQKGGAPAEGEGAAETLPEASRAVENGCCTPKEGRGAPAEAGKEQKETNIESMK
.: :..... . .. : .. . .: .: .:. : .:: .:
CCDS13 RTPEIRGRRSSSRLSKREVSSLLSYTQDLTGDGDGEDGDGSDTPV-MPKLFRETRTRS--
50 60 70 80 90
170 180 190 200 210 220
pF1KB8 MEGSRGRLRGGLGWESSLRQRPMPRLTFQAGDPYYISKRKRDEWLARWKREAEKKAKVIA
:. : :.. . : :.:: :: : .... :. : : ...: . :
CCDS13 -ESPAVRTRNNNSVSSRERHRPSPRSTRGRQGRNHVDESPV-EFPAT--RSLRRRATASA
100 110 120 130 140 150
230 240 250 260 270
pF1KB8 GMNAVEENQGPGESQKVE--EASPPAVQQPTDPASP--TVATTPEPVGSDAGDKNATKAG
: . . :. .. . . . : . ..: .: . : .. . .: ..
CCDS13 G---TPWPSPPSSYLTIDLTDDTEDTHGTPQSSSTPYARLAQDSQQGGMESPQVEADSGD
160 170 180 190 200 210
280 290 300 310 320 330
pF1KB8 DDEPEYEDGRGFGIGELVWGKLRGFSWWPGRIVSWWMTGRSRAAEGTRWVMWFGDGKFSV
: ::.::. ::::.:::::..::::::. .::: :.. .: : :::.::::::::
CCDS13 GDSSEYQDGKEFGIGDLVWGKIKGFSWWPAMVVSWKATSKRQAMSGMRWVQWFGDGKFSE
220 230 240 250 260 270
340 350 360 370 380 390
pF1KB8 VCVEKLMPLSSFCSAFHQATYNKQPMYRKAIYEVLQVASSRAGKLFPVCHDSDESDTAKA
: ..::. :. : . :. ::.:: ::::.:..:. : :::: :: :. .:.
CCDS13 VSADKLVALGLFSQHFNLATFNKLVSYRKAMYHALEKARVRAGKTFP----SSPGDS---
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.: : :::.::: :::.:.: .::.: .. .: ... . .. : : : :
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. : . : ...::... .: .. ..:: :.::: : . :::: ::.::.:.
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. ::: :.:::::::::::.:: :::.:.:.:..:::::::::...::: :.: : .
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.::.:::: . .:.::::.:: ::: ::... :.. ::.:: .:: .:.::::::
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:::::::: ::::.:::.: .:.::::::.::.:: :.:.:.: ::.:::..:.:.:.::
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:::::::::::::::: ::::::::::::::::::::.::. .::::::::::::.::::
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::: :.:::::::::: ::::::: .::::::::::::::::::::. .. :::::::.:
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::..::::..::.::::.::::::::.: ::: :: :::.:::::.::.:::::::::::
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.: :..... . .. : .. . .: .: .:. : .:: .:
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: . . :. .. . . . : . ..: .: . : .. . .: ..
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.: : :::.::: :::.:.: .::.: .. .: ... . .. : : : :
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pF1KB8 KSTAEKPKVKEIIDERTRERLVYEVRQKCRNIEDICISCGSLNVTLEHPLFVGGMCQNCK
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CCDS13 CYNNGKDRGDE---DQSREQMASDVANNKSSLEDGCLSCGRKNPVSFHPLFEGGLCQTCR
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.::.:::: . .:.::::.:: ::: ::... :.. ::.:: .:: .:.::::::
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:::::::: ::::.:::.: .:.::::::.::.:: :.:.:.: ::.:::..:.:.:.::
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:::::::::::::::: ::::::::::::::::::::.::. .::::::::::::.::::
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::: :.:::::::::: ::::::: .::::::::::::::::::::. .. :::::::.:
CCDS13 VAMKVGDKRDISRFLECNPVMIDAIKVSAAHRARYFWGNLPGMNRPVIASKNDKLELQDC
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CCDS13 LEYNRIAKLKKVQTITTKSNSIKQGKNQLFPVVMNGKEDVLWCTELERIFGFPVHYTDVS
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CCDS13 NMGRGARQKLLGRSWSVPVIRHLFAPLKDYFACE
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CCDS56 LVALGLFSQHFNLATFNKLVSYRKAMYHALEKARVRAGKTFP-------SSPGDSLEDQL
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:::.::: :::.:.: .::.: .. .: ... . .. : : : : .
CCDS56 KPMLEWAHGGFKPTGIEGLKP--NNTQPENKTRRRTADDSATSDYCPAPKRLKTNCYNNG
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: . : ...::... .: .. ..:: :.::: : . :::: ::.::.:.. :::
CCDS56 KDRGDE---DQSREQMASDVANNKSSLEDGCLSCGRKNPVSFHPLFEGGLCQTCRDRFLE
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:.:::::::::::.:: :::.:.:.:..:::::::::...::: :.: : ..::.:
CCDS56 LFYMYDDDGYQSYCTVCCEGRELLLCSNTSCCRCFCVECLEVLVGTGTAAEAKLQEPWSC
370 380 390 400 410 420
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::: . .:.::::.:: ::: ::... :.. ::.:: .:: .:.:::::::::::
CCDS56 YMCLPQRCHGVLRRRKDWNVRLQAFFTSDTGLEYEAPKLYPAIPAARRRPIRVLSLFDGI
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pF1KB8 ATGLLVLKDLGIQVDRYIASEVCEDSITVGMVRHQGKIMYVGDVRSVTQKHIQEWGPFDL
::: ::::.:::.: .:.::::::.::.:: :.:.:.: ::.:::..:.:.:.:::::::
CCDS56 ATGYLVLKELGIKVGKYVASEVCEESIAVGTVKHEGNIKYVNDVRNITKKNIEEWGPFDL
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pF1KB8 VIGGSPCNDLSIVNPARKGLYEGTGRLFFEFYRLLHDARPKEGDDRPFFWLFENVVAMGV
::::::::::: ::::::::::::::::::::.::. .::::::::::::.::::::: :
CCDS56 VIGGSPCNDLSNVNPARKGLYEGTGRLFFEFYHLLNYSRPKEGDDRPFFWMFENVVAMKV
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.:::::::::: ::::::: .:::::::::::::::::::
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pF1KB8 IAKFSKVRTITTRSNSIKQGKDQHFPVFMNEKEDILWCTEMERVFGFPVHYTDVSNMSRL
.:::::::::::::.:
CCDS56 -------------------------------------------IFGFPVHYTDVSNMGRG
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pF1KB8 ARQRLLGRSWSVPVIRHLFAPLKEYFACV
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CCDS56 TASAGTPWPSPPSSYLTIDLTDDTEDTHGTPQSSSTPYARLAQDSQQGGMESPQVEADSG
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pF1KB8 GDDEPEYEDGRGFGIGELVWGKLRGFSWWPGRIVSWWMTGRSRAAEGTRWVMWFGDGKFS
: ::.::. ::::.:::::..::::::. .::: :.. .: : :::.::::::::
CCDS56 DGDSSEYQDGKEFGIGDLVWGKIKGFSWWPAMVVSWKATSKRQAMSGMRWVQWFGDGKFS
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pF1KB8 VVCVEKLMPLSSFCSAFHQATYNKQPMYRKAIYEVLQVASSRAGKLFPVCHDSDESDTAK
: ..::. :. : . :. ::.:: ::::.:..:. : :::: :: :. .
CCDS56 EVSADKLVALGLFSQHFNLATFNKLVSYRKAMYHALEKARVRAGKTFP-------SSPGD
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..: : :::.::: :::.:.: .::.: .. .: ... . .. : : : :
CCDS56 SLEDQLKPMLEWAHGGFKPTGIEGLKP--NNTQPENKTRRRTADDSATSDYCPAPKRLKT
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pF1KB8 RKSTAEKPKVKEIIDERTRERLVYEVRQKCRNIEDICISCGSLNVTLEHPLFVGGMCQNC
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CCDS56 NCYNNGKDRGDE---DQSREQMASDVANNKSSLEDGCLSCGRKNPVSFHPLFEGGLCQTC
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pF1KB8 KNCFLECAYQYDDDGYQSYCTICCGGREVLMCGNNNCCRCFCVECVDLLVGPGAAQAAIK
.. ::: :.:::::::::::.:: :::.:.:.:..:::::::::...::: :.: :
CCDS56 RDRFLELFYMYDDDGYQSYCTVCCEGRELLLCSNTSCCRCFCVECLEVLVGTGTAAEAKL
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pF1KB8 EDPWNCYMCGHKGTYGLLRRREDWPSRLQMFFANNHDQEFDPPKVYPPVPAEKRKPIRVL
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CCDS56 QEPWSCYMCLPQRCHGVLRRRKDWNVRLQAFFTSDTGLEYEAPKLYPAIPAARRRPIRVL
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pF1KB8 SLFDGIATGLLVLKDLGIQVDRYIASEVCEDSITVGMVRHQGKIMYVGDVRSVTQKHIQE
::::::::: ::::.:::.: .:.::::::.::.:: :.:.:.: ::.:::..:.:.:.:
CCDS56 SLFDGIATGYLVLKELGIKVGKYVASEVCEESIAVGTVKHEGNIKYVNDVRNITKKNIEE
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pF1KB8 WGPFDLVIGGSPCNDLSIVNPARKGLYEGTGRLFFEFYRLLHDARPKEGDDRPFFWLFEN
::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::.::. .::::::::::::.:::
CCDS56 WGPFDLVIGGSPCNDLSNVNPARKGLYEGTGRLFFEFYHLLNYSRPKEGDDRPFFWMFEN
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pF1KB8 VVAMGVSDKRDISRFLESNPVMIDAKEVSAAHRARYFWGNLPGMNRPLASTVNDKLELQE
:::: :.:::::::::: ::::::: .:::::::::::::::::::
CCDS56 VVAMKVGDKRDISRFLECNPVMIDAIKVSAAHRARYFWGNLPGMNR--------------
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.::::::::::
CCDS56 -------------------------------------------------IFGFPVHYTDV
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pF1KB8 SNMSRLARQRLLGRSWSVPVIRHLFAPLKEYFACV
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CCDS56 SNMGRGARQKLLGRSWSVPVIRHLFAPLKDYFACE
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pF1KB8 RPGRKRKHPPVESGDTPKDPAVISKSPSMAQDSGASE--LLPNGDLEKRSEPQPE--EG-
.:.:. : .: :: .: .: :.
CCDS13 MKGDTRHLNGEEDAGGREDSILVNGACSDQSSDSPPILEAI
10 20 30 40
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pF1KB8 -SPA-GGQKGGAPAEGEGAAETLPEASRAVENGCCTPKEGRGAPAEAGKEQKETNIESMK
.: :..... . .. : .. . .: .: .:. : .:: .:
CCDS13 RTPEIRGRRSSSRLSKREVSSLLSYTQDLTGDGDGEDGDGSDTPV-MPKLFRETRTRS--
50 60 70 80 90
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pF1KB8 MEGSRGRLRGGLGWESSLRQRPMPRLTFQAGDPYYISKRKRDEWLARWKREAEKKAKVIA
:. : :.. . : :.:: :: : .... :. : : ...: . :
CCDS13 -ESPAVRTRNNNSVSSRERHRPSPRSTRGRQGRNHVDESPV-EFPAT--RSLRRRATASA
100 110 120 130 140 150
230 240 250 260 270
pF1KB8 GMNAVEENQGPGESQKVE--EASPPAVQQPTDPASP--TVATTPEPVGSDAGDKNATKAG
: . . :. .. . . . : . ..: .: . : .. . .: ..
CCDS13 G---TPWPSPPSSYLTIDLTDDTEDTHGTPQSSSTPYARLAQDSQQGGMESPQVEADSGD
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CCDS13 VSADKLVALGLFSQHFNLATFNKLVSYRKAMYHALEKARVRAGKTFP----SSPGDS---
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CCDS13 LEDQLKPMLEWAHGGFKPTGIEGLKP--NNTQPENKTRRRTADDSATSDYCPAPKRLKTN
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CCDS13 CYNNGKDRGDE---DQSREQMASDVANNKSSLEDGCLSCGRKNPVSFHPLFEGGLCQTCR
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CCDS13 DRFLELFYMYDDDGYQSYCTVCCEGRELLLCSNTSCCRCFCVECLEVLVGTGTAAEAKLQ
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CCDS13 LFDGIATGYLVLKELGIKVGKYVASEVCEESIAVGTVKHEGNIKYVNDVRNITKKNIEEW
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CCDS13 VAMKVGDKRDISRFLECNPVMIDAIKVSAAHRARYFWGNLPGMNR---------------
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.:::::::::::
CCDS13 ------------------------------------------------IFGFPVHYTDVS
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CCDS13 NMGRGARQKLLGRSWSVPVIRHLFAPLKDYFACE
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CCDS46 ESGDTPKDPAVISKSPSMAQDSGASELLPNGDLEKRSEPQPEEGSPAGGQKGGAPAEGEG
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CCDS46 AAETLPEASRAVENGCCTPKEGRGAPAEAGESSAPGAASSGPTSIP
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CCDS46 LVGPGTSGKVHAMSNWVCYLCLPSSRSGLLQRRRKWRSQLKAFY--DRESE-NPLEMFET
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]