Result of FASTA (ccds) for
pF1KB8472
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8472, 840 aa
1>>>pF1KB8472 840 - 840 aa - 840 aa
Library: human.CCDS.faa
18921897 residues in 33420 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.8982+/-0.0012; mu= 4.4874+/- 0.072
mean_var=187.1314+/-37.492, 0's: 0 Z-trim(107.9): 41 B-trim: 89 in 1/51
Lambda= 0.093756
statistics sampled from 9944 (9969) to 9944 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.639), E-opt: 0.2 (0.298), width: 16
Scan time: 2.080
The best scores are: opt bits E(33420)
CCDS4166.1 HSPA4 gene_id:3308|Hs109|chr5 ( 840) 5476 754.0 2.5e-217
CCDS3734.1 HSPA4L gene_id:22824|Hs109|chr4 ( 839) 3627 503.9 4.9e-142
CCDS82953.1 HSPA4L gene_id:22824|Hs109|chr4 ( 813) 3405 473.9 5.2e-133
CCDS9340.1 HSPH1 gene_id:10808|Hs109|chr13 ( 858) 2545 357.5 5.6e-98
CCDS66525.1 HSPH1 gene_id:10808|Hs109|chr13 ( 814) 2504 352.0 2.5e-96
CCDS66526.1 HSPH1 gene_id:10808|Hs109|chr13 ( 860) 2328 328.2 3.9e-89
CCDS73559.1 HSPH1 gene_id:10808|Hs109|chr13 ( 782) 1424 205.9 2.3e-52
CCDS1231.1 HSPA6 gene_id:3310|Hs109|chr1 ( 643) 1037 153.5 1.1e-36
CCDS34413.1 HSPA1L gene_id:3305|Hs109|chr6 ( 641) 1027 152.1 2.9e-36
CCDS34415.1 HSPA1B gene_id:3304|Hs109|chr6 ( 641) 1021 151.3 5e-36
CCDS34414.1 HSPA1A gene_id:3303|Hs109|chr6 ( 641) 1021 151.3 5e-36
CCDS8440.1 HSPA8 gene_id:3312|Hs109|chr11 ( 646) 1000 148.5 3.6e-35
CCDS9766.1 HSPA2 gene_id:3306|Hs109|chr14 ( 639) 944 140.9 6.8e-33
CCDS44754.1 HSPA8 gene_id:3312|Hs109|chr11 ( 493) 913 136.7 1e-31
CCDS6863.1 HSPA5 gene_id:3309|Hs109|chr9 ( 654) 911 136.5 1.5e-31
CCDS4208.1 HSPA9 gene_id:3313|Hs109|chr5 ( 679) 717 110.2 1.3e-23
CCDS7103.1 HSPA14 gene_id:51182|Hs109|chr10 ( 509) 655 101.8 3.3e-21
CCDS13567.1 HSPA13 gene_id:6782|Hs109|chr21 ( 471) 422 70.2 9.5e-12
>>CCDS4166.1 HSPA4 gene_id:3308|Hs109|chr5 (840 aa)
initn: 5476 init1: 5476 opt: 5476 Z-score: 4015.4 bits: 754.0 E(33420): 2.5e-217
Smith-Waterman score: 5476; 100.0% identity (100.0% similar) in 840 aa overlap (1-840:1-840)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MSVVGIDLGFQSCYVAVARAGGIETIANEYSDRCTPACISFGPKNRSIGAAAKSQVISNA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 MSVVGIDLGFQSCYVAVARAGGIETIANEYSDRCTPACISFGPKNRSIGAAAKSQVISNA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 KNTVQGFKRFHGRAFSDPFVEAEKSNLAYDIVQLPTGLTGIKVTYMEEERNFTTEQVTAM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 KNTVQGFKRFHGRAFSDPFVEAEKSNLAYDIVQLPTGLTGIKVTYMEEERNFTTEQVTAM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 LLSKLKETAESVLKKPVVDCVVSVPCFYTDAERRSVMDATQIAGLNCLRLMNETTAVALA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 LLSKLKETAESVLKKPVVDCVVSVPCFYTDAERRSVMDATQIAGLNCLRLMNETTAVALA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 YGIYKQDLPALEEKPRNVVFVDMGHSAYQVSVCAFNRGKLKVLATAFDTTLGGRKFDEVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 YGIYKQDLPALEEKPRNVVFVDMGHSAYQVSVCAFNRGKLKVLATAFDTTLGGRKFDEVL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 VNHFCEEFGKKYKLDIKSKIRALLRLSQECEKLKKLMSANASDLPLSIECFMNDVDVSGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 VNHFCEEFGKKYKLDIKSKIRALLRLSQECEKLKKLMSANASDLPLSIECFMNDVDVSGT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 MNRGKFLEMCNDLLARVEPPLRSVLEQTKLKKEDIYAVEIVGGATRIPAVKEKISKFFGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 MNRGKFLEMCNDLLARVEPPLRSVLEQTKLKKEDIYAVEIVGGATRIPAVKEKISKFFGK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 ELSTTLNADEAVTRGCALQCAILSPAFKVREFSITDVVPYPISLRWNSPAEEGSSDCEVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 ELSTTLNADEAVTRGCALQCAILSPAFKVREFSITDVVPYPISLRWNSPAEEGSSDCEVF
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 SKNHAAPFSKVLTFYRKEPFTLEAYYSSPQDLPYPDPAIAQFSVQKVTPQSDGSSSKVKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 SKNHAAPFSKVLTFYRKEPFTLEAYYSSPQDLPYPDPAIAQFSVQKVTPQSDGSSSKVKV
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB8 KVRVNVHGIFSVSSASLVEVHKSEENEEPMETDQNAKEEEKMQVDQEEPHVEEQQQQTPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 KVRVNVHGIFSVSSASLVEVHKSEENEEPMETDQNAKEEEKMQVDQEEPHVEEQQQQTPA
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB8 ENKAESEEMETSQAGSKDKKMDQPPQAKKAKVKTSTVDLPIENQLLWQIDREMLNLYIEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 ENKAESEEMETSQAGSKDKKMDQPPQAKKAKVKTSTVDLPIENQLLWQIDREMLNLYIEN
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB8 EGKMIMQDKLEKERNDAKNAVEEYVYEMRDKLSGEYEKFVSEDDRNSFTLKLEDTENWLY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 EGKMIMQDKLEKERNDAKNAVEEYVYEMRDKLSGEYEKFVSEDDRNSFTLKLEDTENWLY
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB8 EDGEDQPKQVYVDKLAELKNLGQPIKIRFQESEERPKLFEELGKQIQQYMKIISSFKNKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 EDGEDQPKQVYVDKLAELKNLGQPIKIRFQESEERPKLFEELGKQIQQYMKIISSFKNKE
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB8 DQYDHLDAADMTKVEKSTNEAMEWMNNKLNLQNKQSLTMDPVVKSKEIEAKIKELTSTCS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 DQYDHLDAADMTKVEKSTNEAMEWMNNKLNLQNKQSLTMDPVVKSKEIEAKIKELTSTCS
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB8 PIISKPKPKVEPPKEEQKNAEQNGPVDGQGDNPGPQAAEQGTDTAVPSDSDKKLPEMDID
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 PIISKPKPKVEPPKEEQKNAEQNGPVDGQGDNPGPQAAEQGTDTAVPSDSDKKLPEMDID
790 800 810 820 830 840
>>CCDS3734.1 HSPA4L gene_id:22824|Hs109|chr4 (839 aa)
initn: 3455 init1: 2513 opt: 3627 Z-score: 2663.8 bits: 503.9 E(33420): 4.9e-142
Smith-Waterman score: 3627; 63.7% identity (86.3% similar) in 848 aa overlap (1-840:1-839)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MSVVGIDLGFQSCYVAVARAGGIETIANEYSDRCTPACISFGPKNRSIGAAAKSQVISNA
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CCDS37 MSVVGIDLGFLNCYIAVARSGGIETIANEYSDRCTPACISLGSRTRAIGNAAKSQIVTNV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 KNTVQGFKRFHGRAFSDPFVEAEKSNLAYDIVQLPTGLTGIKVTYMEEERNFTTEQVTAM
.::..:::..:::.:.::.:..:. : :.. ..:.: .:.:: :.:::: :. ::::.:
CCDS37 RNTIHGFKKLHGRSFDDPIVQTERIRLPYELQKMPNGSAGVKVRYLEEERPFAIEQVTGM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 LLSKLKETAESVLKKPVVDCVVSVPCFYTDAERRSVMDATQIAGLNCLRLMNETTAVALA
::.:::::.:..:::::.:::.:.: :.::::::::: :.:.::::::::::::::::::
CCDS37 LLAKLKETSENALKKPVADCVISIPSFFTDAERRSVMAAAQVAGLNCLRLMNETTAVALA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 YGIYKQDLPALEEKPRNVVFVDMGHSAYQVSVCAFNRGKLKVLATAFDTTLGGRKFDEVL
::::::::: :.::::::::.::::::::: :::::.::::::::.:: ::::.:::.:
CCDS37 YGIYKQDLPPLDEKPRNVVFIDMGHSAYQVLVCAFNKGKLKVLATTFDPYLGGRNFDEAL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 VNHFCEEFGKKYKLDIKSKIRALLRLSQECEKLKKLMSANASDLPLSIECFMNDVDVSGT
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CCDS37 VDYFCDEFKTKYKINVKENSRALLRLYQECEKLKKLMSANASDLPLNIECFMNDLDVSSK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 MNRGKFLEMCNDLLARVEPPLRSVLEQTKLKKEDIYAVEIVGGATRIPAVKEKISKFFGK
:::..: ..: .:::::::::..:.::..:..::: ..::::::::::::::.:.::: :
CCDS37 MNRAQFEQLCASLLARVEPPLKAVMEQANLQREDISSIEIVGGATRIPAVKEQITKFFLK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 ELSTTLNADEAVTRGCALQCAILSPAFKVREFSITDVVPYPISLRWNSPAEEGSSDCEVF
..::::::::::.:::::::::::::::::::::::.::: :.:::.. :.::..::::
CCDS37 DISTTLNADEAVARGCALQCAILSPAFKVREFSITDLVPYSITLRWKTSFEDGSGECEVF
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 SKNHAAPFSKVLTFYRKEPFTLEAYYSSPQDLPYPDPAIAQFSVQKVTPQSDGSSSKVKV
::: ::::::.::..:::: :::.:.. ...:::: :..:..:.: :::::.::::::
CCDS37 CKNHPAPFSKVITFHKKEPFELEAFYTNLHEVPYPDARIGSFTIQNVFPQSDGDSSKVKV
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530
pF1KB8 KVRVNVHGIFSVSSASLVEVHKSE--ENEEPMETDQNAKEE-----EKMQVDQEEPHVEE
:::::.::::::.:::..: .. : ... ::::. . :.: .:::::::: : .
CCDS37 KVRVNIHGIFSVASASVIEKQNLEGDHSDAPMETETSFKNENKDNMDKMQVDQEEGHQKC
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570 580 590
pF1KB8 QQQQTPAENKAESEEMETSQAGSKDKKMDQPPQAKKAKVKTSTVDLPIENQLLWQIDREM
. ..:: :. .. : ...:. ...: ::.::: ..::::...: :. ...
CCDS37 HAEHTPEEEIDHTGAKTKSAVSDKQDRLNQT--LKKGKVK--SIDLPIQSSLCRQLGQDL
550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KB8 LNLYIENEGKMIMQDKLEKERNDAKNAVEEYVYEMRDKLSGEYEKFVSEDDRNSFTLKLE
:: ::::::::::::::::::::::::::::::..::.:. ::::.. .: .... ::
CCDS37 LNSYIENEGKMIMQDKLEKERNDAKNAVEEYVYDFRDRLGTVYEKFITPEDLSKLSAVLE
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690 700 710
pF1KB8 DTENWLYEDGEDQPKQVYVDKLAELKNLGQPIKIRFQESEERPKLFEELGKQIQQYMKII
:::::::::::::::::::::: :::. ::::.....: ::::: ...:::.:: ::.:
CCDS37 DTENWLYEDGEDQPKQVYVDKLQELKKYGQPIQMKYMEHEERPKALNDLGKKIQLVMKVI
660 670 680 690 700 710
720 730 740 750 760 770
pF1KB8 SSFKNKEDQYDHLDAADMTKVEKSTNEAMEWMNNKLNLQNKQSLTMDPVVKSKEIEAKIK
...::...::::: ..: :::: ..:: :.:.:.: ::: :::.::::: .:: :: :
CCDS37 EAYRNKDERYDHLDPTEMEKVEKCISDAMSWLNSKMNAQNKLSLTQDPVVKVSEIVAKSK
720 730 740 750 760 770
780 790 800 810 820 830
pF1KB8 ELTSTCSPIISKPKPKVEPPKEEQK-NAEQNGPVDGQGDNPGPQAAEQGTDTAVPSDSDK
:: . :.::: :::::.: :... : :.:.:::.:::. : .. ..: . :. :
CCDS37 ELDNFCNPIIYKPKPKAEVPEDKPKANSEHNGPMDGQS---GTETKSDSTKDS--SQHTK
780 790 800 810 820 830
840
pF1KB8 KLPEMDID
. ::..:
CCDS37 SSGEMEVD
>>CCDS82953.1 HSPA4L gene_id:22824|Hs109|chr4 (813 aa)
initn: 3233 init1: 2291 opt: 3405 Z-score: 2501.7 bits: 473.9 E(33420): 5.2e-133
Smith-Waterman score: 3405; 62.6% identity (85.8% similar) in 812 aa overlap (37-840:11-813)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 DLGFQSCYVAVARAGGIETIANEYSDRCTPACISFGPKNRSIGAAAKSQVISNAKNTVQG
::::.: ..:.:: :::::...:..::..:
CCDS82 MKPILLFMERACISLGSRTRAIGNAAKSQIVTNVRNTIHG
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 FKRFHGRAFSDPFVEAEKSNLAYDIVQLPTGLTGIKVTYMEEERNFTTEQVTAMLLSKLK
::..:::.:.::.:..:. : :.. ..:.: .:.:: :.:::: :. ::::.:::.:::
CCDS82 FKKLHGRSFDDPIVQTERIRLPYELQKMPNGSAGVKVRYLEEERPFAIEQVTGMLLAKLK
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 ETAESVLKKPVVDCVVSVPCFYTDAERRSVMDATQIAGLNCLRLMNETTAVALAYGIYKQ
::.:..:::::.:::.:.: :.::::::::: :.:.::::::::::::::::::::::::
CCDS82 ETSENALKKPVADCVISIPSFFTDAERRSVMAAAQVAGLNCLRLMNETTAVALAYGIYKQ
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 DLPALEEKPRNVVFVDMGHSAYQVSVCAFNRGKLKVLATAFDTTLGGRKFDEVLVNHFCE
::: :.::::::::.::::::::: :::::.::::::::.:: ::::.:::.::..::.
CCDS82 DLPPLDEKPRNVVFIDMGHSAYQVLVCAFNKGKLKVLATTFDPYLGGRNFDEALVDYFCD
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 EFGKKYKLDIKSKIRALLRLSQECEKLKKLMSANASDLPLSIECFMNDVDVSGTMNRGKF
:: :::...: . :::::: :::::::::::::::::::.:::::::.:::. :::..:
CCDS82 EFKTKYKINVKENSRALLRLYQECEKLKKLMSANASDLPLNIECFMNDLDVSSKMNRAQF
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 LEMCNDLLARVEPPLRSVLEQTKLKKEDIYAVEIVGGATRIPAVKEKISKFFGKELSTTL
..: .:::::::::..:.::..:..::: ..::::::::::::::.:.::: :..::::
CCDS82 EQLCASLLARVEPPLKAVMEQANLQREDISSIEIVGGATRIPAVKEQITKFFLKDISTTL
290 300 310 320 330 340
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 NADEAVTRGCALQCAILSPAFKVREFSITDVVPYPISLRWNSPAEEGSSDCEVFSKNHAA
::::::.:::::::::::::::::::::::.::: :.:::.. :.::..:::: ::: :
CCDS82 NADEAVARGCALQCAILSPAFKVREFSITDLVPYSITLRWKTSFEDGSGECEVFCKNHPA
350 360 370 380 390 400
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 PFSKVLTFYRKEPFTLEAYYSSPQDLPYPDPAIAQFSVQKVTPQSDGSSSKVKVKVRVNV
:::::.::..:::: :::.:.. ...:::: :..:..:.: :::::.:::::::::::.
CCDS82 PFSKVITFHKKEPFELEAFYTNLHEVPYPDARIGSFTIQNVFPQSDGDSSKVKVKVRVNI
410 420 430 440 450 460
490 500 510 520 530
pF1KB8 HGIFSVSSASLVEVHKSE--ENEEPMETDQNAKEE-----EKMQVDQEEPHVEEQQQQTP
::::::.:::..: .. : ... ::::. . :.: .:::::::: : . . ..::
CCDS82 HGIFSVASASVIEKQNLEGDHSDAPMETETSFKNENKDNMDKMQVDQEEGHQKCHAEHTP
470 480 490 500 510 520
540 550 560 570 580 590
pF1KB8 AENKAESEEMETSQAGSKDKKMDQPPQAKKAKVKTSTVDLPIENQLLWQIDREMLNLYIE
:. .. : ...:. ...: ::.::: ..::::...: :. ...:: :::
CCDS82 EEEIDHTGAKTKSAVSDKQDRLNQT--LKKGKVK--SIDLPIQSSLCRQLGQDLLNSYIE
530 540 550 560 570
600 610 620 630 640 650
pF1KB8 NEGKMIMQDKLEKERNDAKNAVEEYVYEMRDKLSGEYEKFVSEDDRNSFTLKLEDTENWL
:::::::::::::::::::::::::::..::.:. ::::.. .: .... ::::::::
CCDS82 NEGKMIMQDKLEKERNDAKNAVEEYVYDFRDRLGTVYEKFITPEDLSKLSAVLEDTENWL
580 590 600 610 620 630
660 670 680 690 700 710
pF1KB8 YEDGEDQPKQVYVDKLAELKNLGQPIKIRFQESEERPKLFEELGKQIQQYMKIISSFKNK
:::::::::::::::: :::. ::::.....: ::::: ...:::.:: ::.: ...::
CCDS82 YEDGEDQPKQVYVDKLQELKKYGQPIQMKYMEHEERPKALNDLGKKIQLVMKVIEAYRNK
640 650 660 670 680 690
720 730 740 750 760 770
pF1KB8 EDQYDHLDAADMTKVEKSTNEAMEWMNNKLNLQNKQSLTMDPVVKSKEIEAKIKELTSTC
...::::: ..: :::: ..:: :.:.:.: ::: :::.::::: .:: :: ::: . :
CCDS82 DERYDHLDPTEMEKVEKCISDAMSWLNSKMNAQNKLSLTQDPVVKVSEIVAKSKELDNFC
700 710 720 730 740 750
780 790 800 810 820 830
pF1KB8 SPIISKPKPKVEPPKEEQK-NAEQNGPVDGQGDNPGPQAAEQGTDTAVPSDSDKKLPEMD
.::: :::::.: :... : :.:.:::.:::. : .. ..: . :. :. ::.
CCDS82 NPIIYKPKPKAEVPEDKPKANSEHNGPMDGQS---GTETKSDSTKDS--SQHTKSSGEME
760 770 780 790 800 810
840
pF1KB8 ID
.:
CCDS82 VD
>>CCDS9340.1 HSPH1 gene_id:10808|Hs109|chr13 (858 aa)
initn: 3595 init1: 2514 opt: 2545 Z-score: 1872.6 bits: 357.5 E(33420): 5.6e-98
Smith-Waterman score: 3605; 63.4% identity (83.7% similar) in 864 aa overlap (1-840:1-858)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MSVVGIDLGFQSCYVAVARAGGIETIANEYSDRCTPACISFGPKNRSIGAAAKSQVISNA
:::::.:.: ::::.::::::::::::::.::::::. :::: :::.::.:::.: :..:
CCDS93 MSVVGLDVGSQSCYIAVARAGGIETIANEFSDRCTPSVISFGSKNRTIGVAAKNQQITHA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
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pF1KB8 IISSFKNKEDQYDHLDAADMTKVEKSTNEAMEWMNNKLNLQNKQSLTMDPVVKSKEIEAK
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CCDS66 IKELNNTCEPVVTQPKPKIESPKLERT---PNGPNIDKKEEDLEDKNNFGAEPPHQNGEC
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770 780
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